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基于網(wǎng)絡藥理學探討?zhàn)B血培本健腦膏對治療阿爾茨海默病的作用機制

2021-03-30 11:20王雨王海靜曾楚華易巍王文晟陳龍菊袁德培
中國老年學雜志 2021年7期
關鍵詞:健腦靶點神經(jīng)元

王雨 王海靜 曾楚華 易巍 王文晟 陳龍菊 袁德培,

(1湖北中醫(yī)藥大學基礎醫(yī)學院,湖北 武漢 430065;2青島市中醫(yī)醫(yī)院 青島市海慈醫(yī)院干部保健科;湖北民族大學 3醫(yī)學部;4風濕性疾病發(fā)生與干預湖北省重點實驗室)

阿爾茨海默病(AD)又稱為老年性癡呆,為臨床癡呆的最常見類型。相關風險因素包括性別、年齡、遺傳、腦外傷等,中國AD發(fā)病率為7.4%(2015~2018年),但考慮到人口老齡化情況,中國AD患者人數(shù)為美國的2.5倍,占全球病例數(shù)的25%〔1〕。AD的臨床表現(xiàn)為包括認知、行為異常在內(nèi)的腦神經(jīng)功能損傷,病理改變主要有老年斑、神經(jīng)元纖維纏結及神經(jīng)元丟失、腦萎縮等,主要源于β淀粉樣蛋白(Aβ)、tau蛋白的異常堆積。最新研究發(fā)現(xiàn),AD發(fā)病機制亦包括代謝、免疫及“腦-腸軸”等異常,表現(xiàn)為系統(tǒng)性損傷〔2〕,而AD的治療藥物僅可改善患者臨床癥狀而無法逆轉(zhuǎn)疾病進展。中醫(yī)學對于AD的治療由來已久,屬于“癡呆”“呆病”等范疇,病機為氣血輸布異常,腎虛血瘀,本虛標實,且臨床補腎、活血等治法取得較好療效〔3〕。本文通過網(wǎng)絡藥理學對養(yǎng)血培本健腦膏治療AD的機制進行探討,以挖掘本方潛在的治療靶點,并通過動物實驗進行論證,為中醫(yī)藥治療AD奠定理論基礎。

1 材料與方法

1.1數(shù)據(jù)源 化合物組成、化合物-靶點信息來源于TCMSP數(shù)據(jù)庫(http://tcmspw.com/index.php),疾病-靶點信息來源于OMIM網(wǎng)站(https://omim.org/)、GeneCards網(wǎng)站(https://www.genecards.org/),R語言數(shù)據(jù)包來源于bioconductor網(wǎng)站(http://www.bioconductor.org/),蛋白互作網(wǎng)絡(PPI)來源于STRING網(wǎng)站(https://string-db.org/),KEGG信息來源于KEGG網(wǎng)站(https://www.kegg.jp/)?;衔锶S結構來源于PubChem網(wǎng)站(https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/),蛋白質(zhì)三維結構來源于PDB網(wǎng)站(http://www.rcsb.org/)。

1.2試劑、儀器 Aβ25~35(美國Sigma公司,批號A4559-1M),Bcl-2(武漢博士德公司,批號BAO412),β-淀粉樣蛋白(萬類生物,批號WL01427)。養(yǎng)血培本健腦膏組成藥物(熟地、枸杞子、黃芪、白芍、胡桃肉、當歸、分心木、川芎、郁金、石菖蒲)、鹽酸多哌奈齊片(安理申)購自湖北民族大學附屬民大醫(yī)院。雙臂腦立體定位儀(美國Stoelting公司),組織切片機(德國LEICA 公司),正置光學顯微鏡(日本Nikon 公司)。

1.3動物 實驗動物為40只SPF級SD雄性大鼠〔武漢大學實驗中心提供,許可證號:SCXK(鄂)2015-0018〕,體重(250±20)g,體內(nèi)實驗獲得湖北民族大學倫理委員會批準。

1.4網(wǎng)絡藥理學網(wǎng)絡構建

1.4.1化合物-靶點-疾病網(wǎng)絡構建 利用TCMSP數(shù)據(jù)庫提取養(yǎng)血培本健腦膏的化合物組成、化合物靶點關系(限定參數(shù)OB>30%、DL>0.18),OMIM、GeneCards網(wǎng)站檢索疾病“Alzheimer′s disease”“mild cognitive impairment(MCI)”“dementia”的靶點,以獲得疾病靶點關系;R語言V3.6.3軟件安裝“VennDiagram”包,以繪制化合物靶點、疾病靶點的Venn圖,相關信息導入cytoscape V3.7.2以獲得化合物-靶點-疾病網(wǎng)絡,見圖1。

1.4.2PPI網(wǎng)絡 將交集靶點導入STRING網(wǎng)站,物種為人類(Homo sapiens),得到PPI網(wǎng)絡圖,并將TSV文件錄入R語言V3.6.3軟件統(tǒng)計蛋白質(zhì)PPI數(shù)。

1.4.3GO、KEGG富集分析 R語言V3.6.3軟件安裝“RSQLite”“org.Hs.eg.db”包,將交集靶點名轉(zhuǎn)換為基因ID;安裝“colorspace”“stringi”“DOSE”“clusterProfiler”“pathview”包,基于基因ID分別進行GO(Gene Ontology)、KEGG富集分析并繪制柱狀圖。

1.5分子對接 從PubChem、PDB網(wǎng)站分別獲得化合物、蛋白質(zhì)三維結構,采用Autodock4 進行加氫、加電荷操作,并確定蛋白質(zhì)中心點位置、大小(如APP蛋白:center_x = 17.23,center_y = 15.78,center_z = 44.93,size_x = 44,size_y = 64,size_z = 44),導出pdbqt文件;采用Autodock vina V1.1.2軟件進行分子對接,得到的結果采用LigPlus、pymol軟件進行可視化分析。

1.6體內(nèi)實驗

1.6.1分組、造模、干預 40只SD大鼠適應性喂養(yǎng)1 w,隨機分為4組:正常組、模型組、中藥組、多哌奈齊組。其中,對模型組、中藥組和多哌奈齊組大鼠進行雙側海馬Aβ25~35注射,參照已發(fā)表文獻〔4〕,建立AD動物模型。自動煎藥機熬制養(yǎng)血培本健腦膏中藥濾液,旋蒸儀蒸發(fā)以獲得中藥溶液(0.32 g/ml),采用雙蒸水進行稀釋以給藥;鹽酸多哌奈齊片采用生理鹽水稀釋,獲得混懸液(0.045 mg/ml)。中藥組灌胃養(yǎng)血培本健腦膏(6.17 mg/kg),多哌奈齊組灌胃鹽酸多哌奈齊片(1.67 mg/kg),正常組、模型組灌胃等體積生理鹽水,持續(xù)28 d;第28天時進行心臟灌注取材。

圖1 網(wǎng)絡藥理學研究養(yǎng)血培本健腦膏治療AD機制的路線

1.6.2免疫組織化學染色 大腦組織經(jīng)脫水、包埋后制成蠟塊,切片(4 μm),經(jīng)二甲苯、梯度酒精脫蠟,枸櫞酸鹽進行微波抗原修復,5% BSA抗原封閉;4℃一抗(Aβ、Bcl-2工作濃度均為1∶200)孵育過夜,TBST 清洗5 min×3次;37℃二抗孵育30 min,TBST 清洗5 min×3次;二氨基聯(lián)苯胺(DAB)染色后進行蘇木素復染,經(jīng)梯度酒精、二甲苯脫水,中性樹脂封片后顯微鏡下觀察拍照。每個樣本連續(xù)切片5張,每組選取5個樣本進行統(tǒng)計,采用GraphPad Prism5進行繪圖。蛋白陽性表達面密度=(陽性表達面積/區(qū)域面積)×100%。

1.7統(tǒng)計學方法 采用SPSS17.0 軟件進行單因素方差分析。

2 結 果

2.1化合物-靶點-疾病網(wǎng)絡 養(yǎng)血培本健腦膏含有97種化合物,包括黃酮類、酚類等,對應靶點數(shù)165個,靶點數(shù)較多的化合物包括槲皮素、阿托品、山奈素、β-谷甾醇等;通過與AD、癡呆、輕度認知功能障礙(MCI)疾病靶點交集后,交集靶點數(shù)為149個,化合物為69種,見圖2。

A.Venn圖,B.化合物-靶點-疾病網(wǎng)絡,紅色下劃線為化合物、疾病的交集靶點圖2 化合物-靶點-疾病網(wǎng)絡

2.2PPI網(wǎng)絡 交集靶點導入STRING網(wǎng)站,可觀察到β淀粉樣蛋白前體(APP)、絲裂原活化蛋白激酶(MAPK)1(亦稱為ERK2)、白細胞介素(IL)-6等蛋白質(zhì)可與多種蛋白發(fā)揮作用,如APP蛋白可與毒葷堿型乙酰膽堿能受體(CHR)M1、表皮細胞生長因子(EGF)、乙酰膽堿酯酶(ACHE)、糖原合酶激酶(GSK)-3β等蛋白質(zhì)發(fā)揮作用,見圖3。

2.3GO、KEGG富集分析 通過GO富集分析交集靶點可觀察到,神經(jīng)遞質(zhì)受體通路、G蛋白耦聯(lián)胺受體、G蛋白耦聯(lián)神經(jīng)遞質(zhì)受體等可能為養(yǎng)血培本健腦膏治療AD的機制;KEGG富集分析可觀察到,流體剪切應力與老年性硬化、糖尿病并發(fā)癥AGE-RAGE通路、IL-17通路等可能為養(yǎng)血培本健腦膏治療AD的機制,見圖4。

圖3 PPI網(wǎng)絡及統(tǒng)計

A.GO富集分析,B.KEGG富集分析圖4 GO、KEGG富集分析

2.4分子對接 通過將交集靶點數(shù)最多的10種化合物與PPI數(shù)最高的蛋白質(zhì)(APP、MAPK1、IL-6)進行對接,發(fā)現(xiàn)槲皮素、阿托品、山奈素等均可有效結合上述蛋白,結合能范圍-5.4~-7.9 kCal/mol,可能對蛋白質(zhì)活性具有調(diào)節(jié)作用;以槲皮素為例,其可與APP蛋白的Ser6(A)、Glue7(A)、Ala9(A)等殘基位點結合,與MAPK1蛋白的Met108(A)、Ala52(a)、Val39(A)等殘基結合,與IL-6蛋白的Glue42(A)、Phe105(A)、Lys46(A)等殘基結合,見表1、圖5。

表1 分子對接結合能(kCal/mol)

圖5 槲皮素分子對接可視化

2.5免疫組織化學染色 免疫組織化學染色觀察海馬CA1區(qū)Aβ和Bcl-2蛋白表達,與正常組相比,模型組海馬CA1區(qū)神經(jīng)元Aβ蛋白表達明顯增加(P<0.01);與模型組相比,中藥組、多哌奈齊組神經(jīng)元Aβ蛋白表達下降(P<0.05或P<0.01)。與正常組相比,模型組海馬CA1區(qū)神經(jīng)元Bcl-2蛋白表達明顯下降(P<0.01);與模型組相比,中藥組多哌奈齊組神經(jīng)元Bcl-2表達增加(P<0.05),見圖6、表2。

表2 各組海馬CA1區(qū)免疫組化陽性表達面密度值統(tǒng)計

3 討 論

1990~2016年,全球癡呆患者人數(shù)上升117%,達到4 380萬人,并成為第五大死亡原因〔5〕。目前,本病的治療藥物為膽堿酯酶抑制劑、NMDA受體拮抗劑,僅可改善患者臨床癥狀,且2019年通過臨床Ⅲ期試驗的阿杜卡單抗、甘露特鈉膠囊(“九期一”),亦需進一步論證從而上市〔6,7〕。每年AD的治療需要大量人力、醫(yī)保資金的投入,與之相對應的是疾病的不可治愈性和缺乏特效藥物,均對AD的臨床診療提出巨大挑戰(zhàn)。SD為進行性發(fā)病,全身多系統(tǒng)出現(xiàn)異常改變,而中醫(yī)藥具有多靶點、療效確切的優(yōu)勢,可通過多種途徑進行干預以發(fā)揮療效,相較于單一靶點藥物具有明顯優(yōu)勢〔8〕。

根據(jù)臨床癥狀及發(fā)病機制,AD屬于中醫(yī)學“癡呆”“呆病”疾病范疇?!鹅`樞·營衛(wèi)生會》載:“老者之氣血衰,其肌肉枯,氣道澀?!睔鈾C不暢,脾胃運化能力下降,共同促成氣血輸布異常,精血乏源,“血者,神氣也”,故無以上充于腦而失養(yǎng);氣機推動無力,血停于局部而為瘀,《醫(yī)林改錯》提出:“凡有瘀血,也令人善忘”〔9〕。人之衰老源于腎精漸虧,促進五臟之精衰少,又“腎主骨生髓”,精氣虛少不能充養(yǎng)腦髓而發(fā)病〔10,11〕,故可總結為“老年人精氣虛衰,氣血不足,以至陽化風動”,屬于本虛標實的癥候?;诖瞬C課題組擬方養(yǎng)血培本健腦膏,方中熟地、枸杞子補益腎精,培補先天,黃芪、白芍、當歸補益脾氣以養(yǎng)血,胡桃肉、分心木補益腎精、充腦益智,佐以川芎、郁金、石菖蒲,祛瘀化痰濁、醒腦開竅從而健腦,共奏養(yǎng)血培本健腦之功。

養(yǎng)血培本健腦膏含有多種有效成分,其中的黃酮類化合物存在于蔬果、中藥中,具有抗氧化、調(diào)節(jié)突觸可塑性的功能,并可透過血腦屏障,對于中樞神經(jīng)系統(tǒng)疾病具有潛在的治療作用。槲皮素具有抗炎、抗氧化、神經(jīng)保護等作用,已有研究〔12〕顯示,其可提高體外培養(yǎng)神經(jīng)元活性,改善氧化應激、炎癥反應,抑制AD動物腦內(nèi)毒性片段Aβ1~42聚集、纖維形成,從而治療本??;山奈素具有抗炎、抗菌、心肌保護作用,可通過調(diào)節(jié)炎癥反應、膽堿能系統(tǒng)改善認知功能〔13〕。本研究發(fā)現(xiàn),養(yǎng)血培本健腦膏含有97種化合物、對應靶點數(shù)165個,具有多向調(diào)節(jié)能力。

在病理狀態(tài)下,APP經(jīng)β-分泌酶(BACE)-1和γ-分泌酶過度切割生成Aβ,導致Aβ生成、降解平衡破壞,積聚形成的纖維、斑塊可促進神經(jīng)元凋亡、氧化應激、突觸功能障礙等改變,大量新藥開發(fā)針對Aβ、BACE-1進行設計,其中Aducanumab可明顯降低AD患者大腦老年斑沉積,有望用于臨床〔6〕。在AD模型動物中MAPK通路(包括ERK1/2,p38,JNK)處于活化狀態(tài),其可參與Aβ、tau、突觸病理性損傷,并調(diào)節(jié)膠質(zhì)細胞介導的炎癥反應,通過外源性干預此通路表達可抑制膠質(zhì)細胞活化,從而抑制炎癥反應〔14〕;而部分研究〔15〕發(fā)現(xiàn),ERK抑制劑(U0126、PD98059)可加重Aβ誘導的認知功能損傷,促進神經(jīng)元凋亡、氧化應激,提示MAPK通路參與多種AD發(fā)病機制。Aβ、tau均可引起神經(jīng)炎癥,包括大腦膠質(zhì)細胞、神經(jīng)元,部分基因突變(TREM2,CD33,PILRA等)除了參與突觸活動、脂質(zhì)代謝和囊泡轉(zhuǎn)運,亦可介導促炎細胞內(nèi)信號、細胞因子/IL/細胞轉(zhuǎn)換〔16〕;IL-1β、IL-6、腫瘤壞死因子(TNF)-α為常見的促炎癥因子,且為M1型(促炎癥表型)小膠質(zhì)細胞的標志物〔14〕。本研究結果提示基于網(wǎng)絡藥理學方法可較為準確挖掘潛在靶點,利于基礎研究的機制探討。

信號通路的異常表達可參與AD的病理進程,包括凋亡、自噬、代謝、炎癥反應等通路。神經(jīng)遞質(zhì)受體通路包括膽堿能通路、單胺能通路、氨基酸能通路等,AD病理過程涉及多種神經(jīng)遞質(zhì)受體通路的異常,AlCl3建立的認知損傷動物模型中,腦神經(jīng)多巴胺和5-羥色胺含量下降,而去甲腎上腺素含量上升〔17〕,并且APP可通過神經(jīng)元PAS結構域蛋白4(NPAS)4調(diào)節(jié)抑制性突觸傳遞(GABA)含量〔18〕;“膽堿能假說”為目前AD發(fā)病機制較為認可的假說之一,主要內(nèi)容為AD患者大腦杏仁核、海馬和皮層的膽堿乙酰轉(zhuǎn)移酶活性顯著降低,突觸的乙酰膽堿含量下降,從而確立膽堿酯酶抑制劑的治療作用,相關藥物包括多奈哌齊、利伐他明和加蘭他明〔19〕。2型糖尿病(T2DM)與認知功能損傷相關,提高人群患遲發(fā)型AD的易感性,相應出現(xiàn)的糖代謝異常、氧化應激可促進活性二羰基化合物的非酶切反應,生成晚期糖基化終產(chǎn)物(AGEs);AD患者AGEs受體(RAGE)表達增加,且Aβ自身亦可被糖基化形成AGEs,AGEs、Aβ可與RAGE結合以傳遞信號,介導氧化應激、NF-κB、細胞死亡等機制,而AGEs清除劑具有神經(jīng)保護作用〔20〕,可知AGE-RAGE通路可促進AD的病理進程。本研究GO、KEGG富集分析發(fā)現(xiàn),神經(jīng)遞質(zhì)受體通路、G蛋白耦聯(lián)胺受體、流體剪切應力與老年性硬化、糖尿病并發(fā)癥AGE-RAGE通路等可能為養(yǎng)血培本健腦膏治療AD的機制,而兩種富集方法結果的差異可能來源于數(shù)據(jù)庫、算法的不同。

課題組前期研究〔4〕已證實,養(yǎng)血培本健腦膏可改善模型動物認知功能,抑制海馬神經(jīng)元線粒體凋亡通路及星形膠質(zhì)細胞活化。網(wǎng)絡藥理學方法可較好地預測中藥治療疾病的靶點、通路,提升中藥研究的科學性、精準性。本研究中進一步證實,養(yǎng)血培本健腦膏對治療AD具有多靶點、多途徑和多通路的特點,其治療機制可能與MAPK1、IL-6活性有關,且與其降低海馬CA1區(qū)神經(jīng)元Aβ表達、提高Bcl-2的表達有關。課題組擬進一步采用實驗方法論證本研究挖掘的信號通路,拓展本方的治療機制。

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