李玖明,崔凱颯,王 雪,黃朝暉
結(jié)腸癌作為臨床常見(jiàn)的一種惡性腫瘤,近年來(lái)發(fā)病率和死亡率均呈現(xiàn)逐年升高的趨勢(shì)[1]。結(jié)腸癌的發(fā)病機(jī)制復(fù)雜,涉及遺傳學(xué)、表觀遺傳學(xué)以及腫瘤微環(huán)境等多個(gè)因素的調(diào)控。在生物體中,通??筛鶕?jù)其是否具備蛋白編碼功能將RNA分為編碼RNA及非編碼RNA。近年研究已證實(shí),非編碼RNA并非是基因轉(zhuǎn)錄的“噪音”,而是具有重要的生物學(xué)功能[2]。其中長(zhǎng)度>200 bp的長(zhǎng)鏈非編碼RNA(long noncoding RNA,lncRNA)廣泛存在于細(xì)胞核和細(xì)胞質(zhì)中。LncRNA可通過(guò)多種機(jī)制調(diào)控生理、病理過(guò)程,不僅影響細(xì)胞生長(zhǎng)、分化、遷移和凋亡等功能,還在疾病的診斷和治療中具有重要的應(yīng)用價(jià)值。
有研究發(fā)現(xiàn),Linc00355在胃癌中表達(dá)上調(diào),并通過(guò)調(diào)節(jié)Wnt/β-連環(huán)蛋白(β-catenin)通路促進(jìn)細(xì)胞增殖[3]。在頭頸部鱗狀細(xì)胞癌中高表達(dá)的Linc00355可通過(guò)調(diào)控微RNA(microRNA,miR)-195/HOXA10信號(hào)軸促進(jìn)細(xì)胞遷移、侵襲及上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化[4]。但Linc00355在結(jié)腸癌中的功能和機(jī)制目前尚不清楚。
本研究基于腫瘤基因組圖譜(The Cancer Genome Atlas,TCGA)等數(shù)據(jù)庫(kù)結(jié)腸癌轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),發(fā)現(xiàn)Linc00355在腫瘤中表達(dá)顯著上調(diào),并可能是一個(gè)結(jié)腸癌潛在的新預(yù)后指標(biāo)。通過(guò)生物信息學(xué)方法預(yù)測(cè)與Linc00355相關(guān)的靶基因,進(jìn)行基因本體(Gene Ontology,GO)功能富集分析,預(yù)測(cè)Linc00355在結(jié)腸癌中的功能以及分子調(diào)控機(jī)制,并通過(guò)細(xì)胞實(shí)驗(yàn)初步探討Linc00355對(duì)結(jié)腸癌細(xì)胞生物學(xué)功能的影響,以期為結(jié)腸癌的診斷和治療提供新的靶點(diǎn)。
結(jié)腸癌細(xì)胞株HCT116購(gòu)自美國(guó)菌種保藏中心。DMEM購(gòu)自美國(guó)HyClone公司,胰蛋白酶、青霉素/鏈霉素購(gòu)自中國(guó)碧云天生物技術(shù)公司,胎牛血清(fetal bovine serum,F(xiàn)BS)購(gòu)自美國(guó)Gibco公司,LipofectAMINE 2000購(gòu)自美國(guó)Invitrogen公司。CCK-8購(gòu)自日本Dojindo公司,RNAiso和PrimeScript反轉(zhuǎn)錄試劑盒、SYBR PCR Master Mix購(gòu)自南京諾唯贊生物科技公司,Transwell小室購(gòu)自美國(guó)Corning公司。Linc00355小干擾及陰性對(duì)照購(gòu)自中國(guó)吉瑪基因公司。
實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀器(型號(hào):SLAN-96P)為上海宏石醫(yī)療科技有限公司產(chǎn)品,光學(xué)顯微鏡(型號(hào):EVOS M7000)為美國(guó)賽默飛公司產(chǎn)品,全自動(dòng)酶標(biāo)儀(型號(hào):Bio-Tek ELX800)為美國(guó)寶特公司產(chǎn)品。
首先從TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)中下載473例結(jié)腸癌患者(包括473例癌組織及41例配對(duì)的癌旁正常組織)測(cè)序數(shù)據(jù)及患者臨床資料。首先將下載的數(shù)據(jù)整理成基因表達(dá)矩陣文件,利用R語(yǔ)言EdgeR包對(duì)樣本分別進(jìn)行LncRNA在腫瘤中的差異分析,選取差異表達(dá)P<0.05且|Log2Fold Change,Log2FC|>2的基因作為差異表達(dá)LncRNA用于后續(xù)分析。利用基因表達(dá)綜合(Gene Expression Omnibus,GEO)芯片數(shù)據(jù)庫(kù)(GSE23878、GSE41328和GSE39582)中Linc00355的表達(dá)數(shù)據(jù)繪制差異表達(dá)圖,并根據(jù)臨床信息進(jìn)行Kaplan-Meier生存分析并繪制生存曲線。進(jìn)一步采用共表達(dá)方法預(yù)測(cè)Linc00355的靶基因。利用R語(yǔ)言Limma包對(duì)表達(dá)矩陣分析,篩選與Linc00355表達(dá)具有相關(guān)性的mRNA(P<0.05,相關(guān)系數(shù)R>0.3)。利用GEO芯片數(shù)據(jù)庫(kù)(GSE38832)中Linc00355、黑色素瘤抗原A3(melanoma antigen-A3,MAGE-A3)和周期蛋白依賴(lài)性激酶抑制因子CDKN1A的表達(dá)數(shù)據(jù)繪制相關(guān)性散點(diǎn)圖(P<0.05,相關(guān)系數(shù)R>0.3)。最后使用DAVID數(shù)據(jù)庫(kù),對(duì)54個(gè)與Linc00355相關(guān)的mRNA進(jìn)行GO功能富集分析。使用R語(yǔ)言Ggplot2包進(jìn)行可視化作圖。
HCT116細(xì)胞使用含10% FBS、100 mg/L青霉素/鏈霉素的DMEM培養(yǎng)液,置于37 ℃、CO2體積分?jǐn)?shù)為5%的細(xì)胞培養(yǎng)箱中進(jìn)行培養(yǎng)。待細(xì)胞貼壁且占滿(mǎn)培養(yǎng)皿底面積的80%~90%時(shí)傳代。HCT116細(xì)胞用胰蛋白酶消化傳代后,按3×105個(gè)/孔的密度接種于6孔板中。根據(jù)LipofectAMINE 2000轉(zhuǎn)染試劑說(shuō)明書(shū)分別將陰性對(duì)照siRNA(siNC)和2條針對(duì)Linc00355的siRNA(siLinc00355-1和siLinc00355-2)轉(zhuǎn)入HCT116細(xì)胞中。siNC正義鏈序列為5’-UUCUUCGAAGGUGUCACGUTT-3’,反義鏈序列為5’-ACGUGACACGUUCGGAGAATT-3’;siLinc00355-1正義鏈序列為5’-CCACUGACAGCAGAGUCUUTT-3’,反義鏈序列為5’-AAGACUGCUGUCAGUGGTT-3’;siLinc00355-2正義鏈序列為5’-GGGAAACUCUCUACGCUAUTT-3’,反義鏈序列為5’-AUAGCGUAGAGAGUUUCCCTT-3’。
收集HCT116細(xì)胞(5×106個(gè)),用PBS清洗3遍,采用RNAiso試劑盒提取細(xì)胞總RNA,反轉(zhuǎn)錄合成cDNA后,進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè),以β-actin基因作為內(nèi)參照;PCR擴(kuò)增反應(yīng)條件為95 ℃預(yù)變性5 min,95 ℃ 30 s、95 ℃5 s、60 ℃ 30 s,共40個(gè)循環(huán)。以2-ΔΔCt值表述目的基因的相對(duì)表達(dá)水平。β-actin基因上游引物序列為5’-AGTGTGACGTGGACATCCGCAAAG-3’,下游引物序列為5’-ATCCACATCTGCTGGAAGGTGGAC-3’,Linc00355上游引物序列為5’-GCAGACAGTTGTATCACGCC-3’,下游引物序列為5’-TCCGGAAGGTTGAGTGGTTG-3’;MAGE-A3基因上游引物序列為5’-GGCAGGCCTCCTGATAATCG-3’,下游引物序列為5’-GGTGAGCAGCTTCTTGGGAT-3’;CDKN1A(p21)基因上游引物序列為5’-TCTAGGAGGGAGACACTGGC-3’,下游引物序列為5’-TGTCTGACTCCTTGTTCCGC-3’。
HCT116細(xì)胞分別轉(zhuǎn)染siNC、siLinc00355-1和siLinc00355-2 24 h后收集3組細(xì)胞,以2×103個(gè)/孔的密度接種于96孔板中,分別于1、2、3、4和5 d時(shí)加入CCK-8試劑,在酶聯(lián)免疫檢測(cè)儀波長(zhǎng)450 nm處檢測(cè)各孔細(xì)胞的D值,并繪制細(xì)胞增殖曲線,具體檢測(cè)流程參閱試劑盒操作說(shuō)明。
收集上述轉(zhuǎn)染24 h后對(duì)照組和實(shí)驗(yàn)組細(xì)胞,以1×103個(gè)/孔的密度接種于6孔板中,靜置培養(yǎng)7~14 d。用10%甲醛溶液固定細(xì)胞30 min后,加入1%的結(jié)晶紫染色20 min,計(jì)數(shù)每個(gè)孔內(nèi)的克隆數(shù)并拍照記錄(每個(gè)克隆含有50以上的細(xì)胞,直徑為0.3~1.0 mm)。
收集上述轉(zhuǎn)染24 h后的3組細(xì)胞,用無(wú)血清DMEM培養(yǎng)液制成細(xì)胞懸液,以1×105個(gè)/室的密度接種于Transwell小室的上室中,并在Transwell下室中加1 mL完全培養(yǎng)液。培養(yǎng)24 h后除去培養(yǎng)液,用10%甲醛溶液固定細(xì)胞20 min,加入0.1%結(jié)晶紫染色20 min。清水沖洗去除染色液,用棉簽擦去未穿過(guò)小室膜的細(xì)胞。在倒置光學(xué)顯微鏡下(放大倍數(shù)為100倍)計(jì)數(shù)穿過(guò)小室膜的細(xì)胞數(shù),分析細(xì)胞的遷移能力。
Transwell小室侵襲實(shí)驗(yàn),在Transwell小室的上室中預(yù)先鋪設(shè)Matrigel,其余檢測(cè)流程同Transwell小室遷移實(shí)驗(yàn),Transwell小室的上室中接種3組細(xì)胞48 h后,在倒置光學(xué)顯微鏡下(放大倍數(shù)為100倍)計(jì)數(shù)穿過(guò)小室膜的細(xì)胞數(shù),分析細(xì)胞的侵襲能力。
采用GraphPad Prism 7.0統(tǒng)計(jì)學(xué)軟件處理研究數(shù)據(jù),計(jì)量資料以表示,各實(shí)驗(yàn)均獨(dú)立重復(fù)3次。采用Kaplan-Meier法繪制生存曲線,多組間均數(shù)比較采用非參數(shù)檢驗(yàn)(Kruskal-Wallis秩和檢驗(yàn))。組內(nèi)兩兩比較采用Mann-WhitneyU檢驗(yàn),相關(guān)性分析采用Pearson線性相關(guān)分析;采用COX多因素回歸分析結(jié)腸癌患者死亡的影響因素。以P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
在TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)中下載基因表達(dá)矩陣文件并提取結(jié)腸癌患者的臨床信息;lncRNA的數(shù)據(jù)(包括473例癌組織及41例配對(duì)癌旁正常組織),利用R語(yǔ)言edgeR包,根據(jù)差異倍數(shù)|Log2FC|>2和校正P<0.05篩選出差異表達(dá)的lncRNA。熱圖(圖1A)和火山圖(圖1B)分析結(jié)果顯示,與癌旁正常組織相比,在結(jié)腸癌中有871個(gè)lncRNA表達(dá)上調(diào)(圖中紅色標(biāo)注)和259個(gè)lncRNA表達(dá)下調(diào)(圖中綠色標(biāo)注)。
在這些差異表達(dá)的lncRNA中,根據(jù)生存分析篩選后發(fā)現(xiàn),Linc00355表達(dá)與結(jié)腸癌患者不良預(yù)后相關(guān),且在結(jié)腸癌中的功能未知,故選擇Linc00355進(jìn)行后續(xù)研究。
利用TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)和GEO數(shù)據(jù)庫(kù)中的3組芯片(GSE23878、GSE41328和GSE39582)數(shù)據(jù)分析Linc00355在結(jié)腸癌中的表達(dá)和預(yù)后情況。結(jié)果(圖2A、圖2B和圖2C)顯示,Linc00355在結(jié)腸癌組織中高表達(dá)(P<0.01,P<0.01和P<0.05)。
對(duì)TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)檢索獲得的447例結(jié)腸癌(剔除26例信息不全數(shù)據(jù))分析結(jié)果顯示,Linc00355表達(dá)水平與患者的TNM分期成正相關(guān)(P<0.0001)(圖2D),且Linc00355高表達(dá)患者的總生存期(overall survival,OS)(圖2E)和疾病特異性生存期(disease-specific survival,DSS)(圖2F)均明顯縮短(P值均<0.05),GSE39583數(shù)據(jù)庫(kù)來(lái)源的患者同樣顯示(圖2F),Linc00355高表達(dá)者的OS明顯縮短(P<0.05)。
采用Mann-WhitneyU檢驗(yàn)分析TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)中Linc00355表達(dá)水平與臨床病理特征之間的關(guān)系。結(jié)果(表1)顯示,結(jié)直腸癌組織中Linc00355表達(dá)與患者性別、年齡、T分期均無(wú)顯著相關(guān)性(P值均>0.05),但與患者的臨床N、M分期及病理TNM分期有顯明顯的相關(guān)性(P<0.01)。
COX多因素風(fēng)險(xiǎn)回歸模型分析結(jié)果(表2)顯示,Linc00355是結(jié)腸癌患者生存期的獨(dú)立預(yù)測(cè)因子,其表達(dá)水平越高,患者的OS期越短[風(fēng)險(xiǎn)比(hazard ratio,HR)=1.601,95%可信區(qū)間(confidence interval,CI)為1.008~2.542,P=0.046]。此外,年齡和T分期也是結(jié)腸癌患者OS期的影響因素。
為了探究Linc00355影響患者預(yù)后的原因,通過(guò)共表達(dá)分析預(yù)測(cè)與Linc00355相關(guān)的mRNA,共發(fā)現(xiàn)54個(gè)mRNA與Linc00355表達(dá)有相關(guān)性(圖3A),相關(guān)系數(shù)見(jiàn)表3。對(duì)這些基因進(jìn)行功能富集分析,發(fā)現(xiàn)這些基因富集于如p53的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、細(xì)胞蛋白分解代謝過(guò)程,泛素蛋白轉(zhuǎn)移酶活性、蛋白質(zhì)乙?;⒌鞍踪|(zhì)小泛素相關(guān)修飾物(small ubiquitin-related modifier,SUMO)化和細(xì)胞衰老等信號(hào)通路(圖3B)。這一結(jié)果提示,Linc00355在結(jié)腸癌細(xì)胞的增殖、遷移及侵襲等過(guò)程中可能發(fā)揮重要調(diào)控作用。
Fig.1 Differentially expressed long non-coding RNA (lncRNA) in colon cancer based on The Cancer Genome Atlas (TCGA) dataset.A:Heat map of differentially expressed lncRNAs in colon cancer of TCGA database;B:Volcano map of differential lncRNA in colon cancer (red indicates up-regulation,green indicates down-regulation).logFC:Log2Fold change;FDR:False discover rate.圖1 基于TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)獲得結(jié)腸癌中差異表達(dá)的lncRNA(A為熱圖;B為火山圖;紅色代表在癌組織中表達(dá)上調(diào),綠色代表在癌組織中表達(dá)下調(diào))
Fig.2 The correlation between Linc00355 expression and the prognosis of colon cancer patients.A-C:Linc00355 was up-regulated in tumor tissues compared with normal tissues in colon cancer cohorts of The Cancer Genome Atlas (TCGA) database (A) and Gene Expression Omnibus (GEO) database [GSE23878 (B)and GSE41328 (C)];D:Linc00355 expression was related to TNM stage;E-G:Survival analyses based on the expression of Linc00355 in the colon cancer cohorts of TCGA [overall survival (OS) (E) and disease-specific survival (DSS) (F)]and GSE39582 [OS (G)].圖2 采用TCGA及GEO數(shù)據(jù)庫(kù)分析Linc00355表達(dá)與結(jié)腸癌患者預(yù)后的相關(guān)性
實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)結(jié)果(圖4A)顯示,與對(duì)照組比較,siLinc00355-1和siLinc00355-2組HCT116細(xì)胞中Linc00355的表達(dá)水平均明顯下調(diào)(P值均<0.001),提示2條siRNA均可有效沉默Linc00355的表達(dá)。
CCK-8法(圖4B)和克隆形成實(shí)驗(yàn)(圖4C)檢測(cè)結(jié)果顯示,敲低Linc00355表達(dá)后,siLinc00355-1和siLinc00355-2組HCT116細(xì)胞的增殖能力和克隆形成能力均明顯降低,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P值均<0.001)。
Transwell小室法檢測(cè)結(jié)果(圖4D)顯示,敲低Linc00355表達(dá)后,HCT116細(xì)胞的遷移和侵襲能力均明顯降低(P值均<0.001)。
上述結(jié)果提示Linc00355可促進(jìn)結(jié)腸癌細(xì)胞增殖、遷移和侵襲能力。
表1 Linc00355表達(dá)水平與結(jié)直腸癌患者臨床病理特征的相關(guān)性Table 1 Correlation between Linc00355 expression and the clinicopathological characteristics of patients with colon cancer Total=447,n
表2 多因素COX風(fēng)險(xiǎn)模型分析Linc00355表達(dá)與結(jié)腸癌患者OS期的關(guān)系Table 2 Multivariate COX risk model analysis of the relationship between the expression of Linc00355 and the overall survival (OS) of patients with colon cancer
Fig.3 Analysis of mRNA co-expressed network of Linc00355 and Gene Ontology (GO) function enrichment analysis.A:Co-expression network of Linc00355;B:GO enrichment analysis of Linc00355 coexpressed genes.圖3 Linc00355共表達(dá)mRNA網(wǎng)絡(luò)(A)與GO功能富集分析結(jié)果圖(B)
表3 前20條Linc00355相關(guān)的共表達(dá)mRNATable 3 Linc00355 co-expression related mRNAs (TOP20)
Fig.4 Silencing Linc00355 expression inhibits the proliferation,migration and invasion of colon cancer HCT116 cells.A:The expression level of Linc00355 in HCT116 cells transfected with siRNA targeting Linc00355 (siLinc00355-1 and siLinc00355-2) was detected by real-time fluorescent quantitative PCR,the expression level of Linc00355 was significantly reduced;B-C:The cell proliferation was detected by CCK-8 (B) and clone formation method (C),the cell proliferation ability was significantly reduced in Linc00355 knockdown HCT116 cells;D:The cells migration and invasion abilities were detected by Transwell method,the cells migration and invasion abilities were inhibited in Linc00355 knockdown HCT116 cells.HCT116 cells were transfected with negative control (NC)-siRNA (siNC) as the control.***P<0.001 (n=3).圖4 沉默Linc00355表達(dá)抑制結(jié)腸癌HCT116細(xì)胞的增殖、遷移和侵襲能力
為了驗(yàn)證上述共表達(dá)分析結(jié)果,選擇評(píng)分最高的MAGE-A3及其下游靶基因CDKN1A(p53通路關(guān)鍵信號(hào)分子)進(jìn)行了驗(yàn)證?;贕SE38832數(shù)據(jù)集分析發(fā)現(xiàn),Linc00355與MAGE-A3的表達(dá)存在顯著正相關(guān)(R=0.552 3,P<0.000 1)(圖5A),而與CDKN1A的表達(dá)水平則呈顯著負(fù)相關(guān)(R=-0.406 8,P<0.001)(圖5B)。
Fig.5 The relationship between Linc00355,melanoma antigen (MAGE)-A3 and CDKN1A.A:Linc00355 was positively correlated with the expression of MAGE-A3 in colon cancer (R=0.552 3,P<0.000 1);B:Linc00355 was negatively correlated with the expression of CDKN1A (R=-0.406 8,P<0.001);C.Silencing Linc00355 expression could inhibit the expression of MAGE-A3 and promote the expression of CDKN1A.***P<0.001 (n=3).圖5 Linc00355與MAGE-A3和CDKN1A mRNA表達(dá)的相關(guān)性
實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)結(jié)果(圖5C)顯示,與對(duì)照組比較,2個(gè)敲低Linc00355表達(dá)組HCT116細(xì)胞中MAGE-A3 mRNA的表達(dá)水平均明顯下調(diào)(P值均<0.001),而CDKN1A mRNA的表達(dá)水平均明顯上調(diào)(P值均<0.001)。
上述結(jié)果提示,Linc00355可能通過(guò)影響MAGE-A3基因的表達(dá),進(jìn)而調(diào)控抑癌因子p21的表達(dá),從而促進(jìn)結(jié)腸癌的發(fā)生和發(fā)展。
結(jié)腸癌是全球第3大常見(jiàn)的惡性腫瘤,居腫瘤相關(guān)死因第2位。據(jù)2020年統(tǒng)計(jì)結(jié)果顯示,將有超過(guò)190萬(wàn)例新增結(jié)直腸癌病例和935 000例死亡病例,約占癌癥新發(fā)和死亡病例的10%[5]。研究表明。LncRNA的失調(diào)可能與腫瘤的發(fā)生、發(fā)展、轉(zhuǎn)移、耐藥及多種生物學(xué)表型相關(guān)[6]。呂夢(mèng)佳等[7]發(fā)現(xiàn),在非小細(xì)胞肺癌患者血漿中l(wèi)ncRNA MALAT1的表達(dá)水平明顯下調(diào),lncRNA-ATB的表達(dá)明顯上調(diào),血漿MALAT1及ATB可作為非小細(xì)胞肺癌的診斷指標(biāo)。曾明曦等[8]發(fā)現(xiàn),胃癌組織中l(wèi)ncRNA RP11-513G11.1的表達(dá)水平顯著高于癌旁組織及正常胃組織,與胃癌患者的TNM分期、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移、腫瘤分化及生存狀態(tài)顯著相關(guān)。
LncRNA作為結(jié)腸癌生物標(biāo)志物和治療靶點(diǎn)的潛能同樣不容忽視。SVOBODA等[9]發(fā)現(xiàn),結(jié)腸癌患者血液中的lncRNA HOTAIR的表達(dá)水平顯著高于健康對(duì)照,且血液中HOTAIR的表達(dá)水平與患者的TNM分期、組織學(xué)分級(jí)以及OS期均有相關(guān)性。本課題組前期發(fā)現(xiàn),在結(jié)直腸癌中高表達(dá)的lncRNA FEZF1-AS1通過(guò)結(jié)合并促進(jìn)丙酮酸激酶2蛋白的穩(wěn)定性,從而調(diào)控糖酵解和信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)及轉(zhuǎn)錄激活因子3(signal transducer and activator of transcription 3,STAT3)信號(hào)通路,進(jìn)而促進(jìn)腫瘤的發(fā)生和發(fā)展[10]。并發(fā)現(xiàn)lncRNA UCA1和Linc00152分別通過(guò)調(diào)控miR-204-5p和miR-139-5p的表達(dá)促進(jìn)結(jié)直腸癌的增殖和化療耐藥[11]。此外,還發(fā)現(xiàn)lncRNA SNHG6在結(jié)直腸癌中發(fā)揮促癌作用,且SNHG6的表達(dá)可作為一個(gè)新的不良預(yù)后指標(biāo)[12]。
本研究首次發(fā)現(xiàn),Linc00355可能是與結(jié)腸癌預(yù)后相關(guān)的新生物標(biāo)志物。Linc00355在結(jié)腸癌組織呈現(xiàn)高表達(dá),并與患者的不良預(yù)后相關(guān);沉默Linc00355的表達(dá)水平體外可抑制結(jié)腸癌細(xì)胞增殖、遷移及侵襲能力,提示Linc00355在結(jié)腸癌中發(fā)揮癌基因功能。隨后,基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)及信號(hào)通路富集提示,Linc00355可能與細(xì)胞蛋白分解代謝、蛋白質(zhì)泛素化、乙?;⑻K木化,p53信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)及細(xì)胞衰老等多個(gè)生物學(xué)過(guò)程相關(guān)。而蛋白質(zhì)修飾、p53信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)及細(xì)胞衰老與腫瘤的發(fā)生和發(fā)展密切相關(guān)。本研究中進(jìn)一步驗(yàn)證發(fā)現(xiàn),沉默Linc00355表達(dá)可上調(diào)MAGE-A3 mRNA的表達(dá)水平。有研究表明,MAGE-A3可通過(guò)調(diào)控p53抑癌因子,影響p21、細(xì)胞周期蛋白D1(cyclin D1)及Bax的表達(dá)并調(diào)控與細(xì)胞增殖、凋亡相關(guān)的信號(hào)通路[13]。上述結(jié)果提示,Linc00355可能通過(guò)MAGE-A3基因影響p53信號(hào)通路進(jìn)而影響結(jié)腸癌細(xì)胞的增殖。關(guān)于Linc00355調(diào)控結(jié)腸癌發(fā)生和發(fā)展的具體功能及機(jī)制的深入尚需進(jìn)一步研究。
綜上所述,本文結(jié)果提示Linc00355有望成為一種新的結(jié)腸癌患者的預(yù)后標(biāo)志物和治療靶點(diǎn)。