馮唐鍇,曾文濤
(景德鎮(zhèn)學(xué)院生物與環(huán)境工程學(xué)院,江西景德鎮(zhèn) 333000)
中藥在我國有著悠久的歷史和廣泛的應(yīng)用,按功能可分為19類。其中清熱藥在抗病毒、治療感冒和炎癥等方面應(yīng)用廣泛。此類藥物通常又可分為治濕熱病藥(板藍(lán)根、金銀花、連翹等)、治熱毒瘡瘍藥(蒲公英、魚腥草等)、治熱毒瀉痢藥(馬齒莧等)、治咽喉腫痛藥(穿心蓮等)4種類型。這些清熱藥中,金銀花、板藍(lán)根、連翹、馬齒莧、穿心蓮等為景德鎮(zhèn)學(xué)院教學(xué)和科研常用中草藥,為了了解這些中草藥的化學(xué)成分的特點,本研究查找統(tǒng)計了一大批相關(guān)化學(xué)成分的分子式,并對其結(jié)構(gòu)特征進(jìn)行了統(tǒng)計分析。
本研究所使用到的工具有:美國國家生物技術(shù)信息中心(NCBI)化合物數(shù)據(jù)庫[1]、化學(xué)結(jié)構(gòu)式編輯軟件King Draw和WPS表格處理軟件(表1)。King Draw是一款國產(chǎn)化學(xué)編輯器軟件,具有分子結(jié)構(gòu)繪制與圖像輸出、3D可視化模型建構(gòu)、化合物數(shù)據(jù)信息檢索等功能[2]。并可以進(jìn)行手勢繪制、結(jié)構(gòu)式命名、IUPAC名稱轉(zhuǎn)結(jié)構(gòu)式、查看化學(xué)屬性、3D分子模型轉(zhuǎn)換等多種操作。本研究主要運用NCBI中的Pub Chem搜索工具對部分化合物的結(jié)構(gòu)式進(jìn)行搜索驗證,使用King Draw來查找大量化合物的分子結(jié)構(gòu),借助WPS表格處理軟件輔助統(tǒng)計分析并作圖。
表1 網(wǎng)站及軟件相關(guān)信息
通過閱讀文獻(xiàn),確定金銀花、板藍(lán)根、連翹、馬齒莧、穿心蓮中含有的主要化合物成分。利用文獻(xiàn)和百度搜索引擎,聯(lián)合查詢相關(guān)化合物的CAS號和英文名。King Draw軟件可以利用化合物的CAS號、英文名以及分子式等多種方法來查找化合物分子結(jié)構(gòu)。因此,進(jìn)入KingDraw軟件,點擊工作站并選擇化合物百科,在搜索框中輸入上述英文名和CAS號查找所需化合物結(jié)構(gòu)式,并以king格式進(jìn)行保存。同時,輸入NCBI網(wǎng)址進(jìn)入NCBI首頁,在首頁頂部搜索欄左側(cè)選擇Pub-Chem化合物,在右邊輸入化合物Pub Chem CID、化合物英文名進(jìn)行搜索,將查找的結(jié)果與king Draw查找的結(jié)果進(jìn)行對比,確認(rèn)結(jié)構(gòu)式的正確性。
利用下載到的中草藥所含有機化合物的分子結(jié)構(gòu)式進(jìn)行統(tǒng)計分析。主要分析2個指標(biāo):一是分子含有環(huán)的種類和數(shù)量;二是含有活性基團的種類和數(shù)量。環(huán)結(jié)構(gòu)又分為苯環(huán)和五元雜環(huán)進(jìn)行統(tǒng)計分析;基團則分為羧基、羥基、氨基、甲氧基和酯基進(jìn)行統(tǒng)計分析。使用WPS表格軟件對統(tǒng)計結(jié)果制表作圖。
金銀花(Lonicerae Japonica Thunb.)為忍冬科忍冬屬植物,具有清熱解毒、疏散風(fēng)熱之效,常用于治療溫病發(fā)熱和風(fēng)熱感冒等癥狀,化學(xué)成分構(gòu)成如表2所示[3-4]。
表2 金銀花主要化學(xué)成分分類
板藍(lán)根(Radix Isatidis)屬十字花科植物,用于瘟疫時毒、發(fā)熱咽痛、溫毒發(fā)斑等病癥?;瘜W(xué)成分復(fù)雜,活性指標(biāo)成分不明,主要成分如表3所示[5]。
表3 板藍(lán)根主要化學(xué)成分分類
連翹(Forsythia Suspensa)為木犀科植物,具有明確的抗炎、鎮(zhèn)痛、抗病毒、抗菌功效,主要的化學(xué)成分如表4所示[6]。
馬齒莧(Portulaca oleracea L.)為石竹目馬齒莧科馬齒莧屬一年生肉質(zhì)草本植物,其化學(xué)成分有抗氧化、抗菌、神經(jīng)保護等生物活性,主要化學(xué)成分如表5所示[7-9]。穿心蓮(Andrographispaniculata)為爵床科穿心蓮屬一年生草本植物,可用于治療感冒發(fā)熱、治療痢疾,具有消腫、清熱解毒的效果[10],主要的化合物如表6所示。
表5 馬齒莧主要化學(xué)成分分類
表6 穿心蓮主要化學(xué)成分分類
針對5種清熱解毒中草藥的上述化學(xué)成分,在數(shù)據(jù)庫中搜索查找,確定了51種化合物的結(jié)構(gòu)式。利用所含環(huán)的數(shù)量對51種化合物結(jié)構(gòu)式進(jìn)行分類,可分為1~5個環(huán)5種類別(表7)。其中,含1個環(huán)的化合物13個,占25%;含2個環(huán)的化合物6個,占12%;含3個環(huán)的化合物13個,占25%;含4個環(huán)的化合物9個,占18%;含5個環(huán)的化合物10個,占20%(圖1)。
圖1 51種化合物所含環(huán)數(shù)量的比例圖
表7 51種化合物結(jié)構(gòu)式分別具有不同數(shù)量的環(huán)
對這五類化合物的環(huán)的種類和數(shù)量以及所含基團的種類和數(shù)量進(jìn)一步進(jìn)行統(tǒng)計分析,相關(guān)信息見表8~12。
2.3.1 含1個環(huán)化合物的結(jié)構(gòu)特點統(tǒng)計分析。針對本研究的5種中草藥,在數(shù)據(jù)庫中搜集了13個含1個環(huán)的化合物結(jié)構(gòu)式(表8),它們分別為有機酸類、酚酸類、生物堿類及含硫類成分。其中環(huán)型為苯環(huán)的化合物12個,為五元雜環(huán)的化合物僅1個(表告依春)。在基團情況方面,這些分子中分別含有羧基、羥基、氨基、甲氧基和酯基。上述含1個環(huán)的化合物多為有機酸類。因此,在結(jié)構(gòu)上有8個分子含有1個羧基。除鄰氨基苯甲酸和表告依春外,所有分子都含有羥基,咖啡酸、原兒茶酸、沒食子酸、多巴胺及去甲腎上腺素等化合物中羥基數(shù)量較多。丁香酸和反阿魏酸中含有甲氧基。多巴胺、去甲腎上腺素等生物堿類中含有氨基。2種酯類含有酯基。這些單環(huán)化合物分子結(jié)構(gòu)相對簡單,分子中含有羥基、羧基較多,堿性基團和其他基團較少(圖2)。
圖2 含1個環(huán)化合物的結(jié)構(gòu)特征
表8 含1個環(huán)的化合物的結(jié)構(gòu)特點分析
2.3.2 含2個環(huán)化合物的結(jié)構(gòu)特點統(tǒng)計分析。在數(shù)據(jù)庫中共搜集了5種中草藥的6個含2個環(huán)的化合物結(jié)構(gòu)式(表9),類別分別為有機酸類、黃酮類、生物堿類(吲哚生物堿)及香豆素類。這6個含2個環(huán)的化合物都含有苯環(huán),其中異甘草素含有2個苯環(huán),其他環(huán)型分別還有六元環(huán)、五元雜環(huán)、六元雜環(huán)等。在基團方面,除靛紅外其他5種分子都含有羥基,綠原酸、異甘草素及6,7-二羥基香豆素所含羥基更多一些;6,7-二羥基香豆素、傘形花內(nèi)酯及東莨菪亭這3種香豆素類化合物當(dāng)中,則含有獨特的六元雜環(huán)及酯基。靛紅主要結(jié)構(gòu)含吲哚基,且有酰胺基團;東莨菪亭另含有甲氧基。
表9 含2個環(huán)的化合物的結(jié)構(gòu)特征分析
2.3.3 含3個環(huán)化合物的結(jié)構(gòu)特點統(tǒng)計分析。在數(shù)據(jù)庫中共搜集了5種中草藥的13個含3個環(huán)的化合物結(jié)構(gòu)式(表10),主要為有機酸類、黃酮類、木脂素類及香豆素類。其環(huán)型分別有苯環(huán)、六元環(huán)、五元雜環(huán)、六元雜環(huán)等,除穿心蓮內(nèi)酯外,都含有苯環(huán)結(jié)構(gòu),數(shù)量1~2個不等,但以2個苯環(huán)的化合物居多;除異綠原酸B、穿心蓮內(nèi)酯及落葉松脂醇外,其余10個化合物都含有六元雜環(huán);而穿心蓮內(nèi)酯與異綠原酸B含有1~2個六元環(huán);穿心蓮內(nèi)酯、落葉松脂醇、佛手內(nèi)酯、異茴香內(nèi)酯中各含有1個五元雜環(huán)?;鶊F方面,除佛手內(nèi)酯和異茴香內(nèi)酯外,都含有羥基,且整體數(shù)量較多,其中,又以異綠原酸B和楊梅素最多,各有6個羥基;此外有8個化合物當(dāng)中存在1個羰基(圖4)。
圖3 含2個環(huán)化合物的結(jié)構(gòu)特征
圖4 含3個環(huán)化合物的結(jié)構(gòu)特征
表10 含3個環(huán)的化合物的結(jié)構(gòu)特征分析
2.3.4 含4個環(huán)化合物的結(jié)構(gòu)特點統(tǒng)計分析。在數(shù)據(jù)庫中共搜集了5種中草藥的9個含4個環(huán)的化合物結(jié)構(gòu)式(表11),它們主要為黃酮類、生物堿類(吲哚生物堿和喹啉生物堿)、連翹酯苷類、木脂素類及二萜內(nèi)酯類成分。環(huán)的結(jié)構(gòu)方面,這9個化合物含有的環(huán)型有苯環(huán)、六元環(huán)、五元雜環(huán)、六元雜環(huán)等。除穿心蓮內(nèi)酯苷外,其余化合物都含有苯環(huán),且數(shù)量均為2個;除木犀草苷及連翹酯苷A外,其他7個化合物都有五元雜環(huán);穿心蓮內(nèi)酯苷則含有2個六元環(huán)?;鶊F方面,除色胺酮外其他8個化合物都含有羥基,連翹酯苷A最多,有9個羥基,木犀草苷含7個羥基,穿心蓮內(nèi)酯苷含6個羥基;羰基則主要存在于生物堿類化合物中;板藍(lán)根甲素有2個酰胺基;松脂素和連翹脂素中含有甲氧基;木犀草苷、連翹酯苷以及穿心蓮內(nèi)酯苷含有醚鍵(圖5)。
圖5 含4個環(huán)化合物的結(jié)構(gòu)特征
表11 含4個環(huán)的化合物的結(jié)構(gòu)特征分析
2.3.5 含5個環(huán)化合物的結(jié)構(gòu)特點統(tǒng)計分析。在數(shù)據(jù)庫中共搜集了5種中草藥的10個含5個環(huán)的化合物結(jié)構(gòu)式(表12),它們主要為黃酮類、萜類皂苷化合物、連翹酯苷類、木脂素類、三萜類與萜類及甾醇類。環(huán)的情況方面,其所含環(huán)型有苯環(huán)、五元環(huán)、六元環(huán)、五元雜環(huán)、六元雜環(huán)等。除蘆丁、連翹苷及連翹酯苷B外,其他化合物均含六元環(huán),數(shù)量3~5個?;鶊F方面,除木栓酮外,這組化合物均含有羥基,其中連翹酯苷B有11個羥基、蘆丁有10個羥基;除連翹苷外,這組化合物也均含有甲基,且數(shù)量較多,最多的木栓酮含有8個甲基。另外,蘆丁和木栓酮各有1個酮基;連翹苷含有甲氧基(圖6)。
圖6 含5個環(huán)化合物的結(jié)構(gòu)特征
表12 含5個環(huán)的化合物的結(jié)構(gòu)特征分析
被分析的5種中草藥的51個活性化合物屬類眾多、各具特點,結(jié)構(gòu)上的規(guī)律并不明顯,但是依然可以總結(jié)出一些共性特征。
首先,環(huán)狀結(jié)構(gòu)都出現(xiàn)在了這些化合物中,盡管在數(shù)量上會有不同,在種類上也有苯環(huán)、五元環(huán)、六元環(huán)、五元雜環(huán)、六元雜環(huán)等差異,雜環(huán)中還含有N、O、S等不同原子。無論如何,環(huán)狀結(jié)構(gòu)在所有被分析的51種主要活性化合物中都是存在的。這可能表明,這些分子在執(zhí)行生物功能的時候,環(huán)型結(jié)構(gòu)在適應(yīng)其功能的時候是必不可少的??赡茏鳛槭荏w、酶、糖蛋白等生化大分子識別這些分子的特征性結(jié)構(gòu)。
其次,羥基在上述分子中廣泛存在,明顯多于其他各類基團。環(huán)的數(shù)量越多能容納的羥基數(shù)量也越多。羥基是最簡單的一種基團,也是一種十分重要的極性基團,能夠形成氫鍵、酯鍵,也是羧基、酚等結(jié)構(gòu)的重要組成部分。在上述中草藥中,活性功能較為常用的幾種化合物如金銀花中的綠原酸、木犀草苷、蘆丁、槲皮素,連翹中的連翹酯苷,穿心蓮中的穿心蓮內(nèi)酯苷,馬齒莧中的楊梅素等,都含有較多的羥基。這可能表明其活性功能與羥基有著較為重要的聯(lián)系。但是根據(jù)上述統(tǒng)計,也發(fā)現(xiàn)板藍(lán)根中的一些主要作用成分如:生物堿類化合物靛玉紅、色胺酮、靛紅、靛藍(lán)等化合物中含有的羥基不多。這可能表明板藍(lán)根活性成分的主要作用方式和其他化合物有一定的區(qū)別。
另外,本研究中的51種化合物中,也發(fā)現(xiàn)了一些其他規(guī)律。例如:當(dāng)環(huán)的數(shù)量較少,如1~3個環(huán)時,則分子中苯環(huán)出現(xiàn)的頻率和數(shù)量均較多。但隨著環(huán)數(shù)量的增加,苯環(huán)的重要性似乎逐步減弱,其他類別的環(huán)出現(xiàn)的頻率和數(shù)量隨之增加。而在5個環(huán)的分子中,六元環(huán)已經(jīng)顯著成為分子中主要的環(huán)狀結(jié)構(gòu)。另外,在5個環(huán)的分子中,甲基數(shù)量也突然大量增加。而且六元環(huán)和甲基數(shù)量的增加呈現(xiàn)出正相關(guān)的趨勢。
對本實驗室常用的5種實驗實訓(xùn)中草藥的51種化合物分子進(jìn)行了結(jié)構(gòu)上的比較和統(tǒng)計分析,得出了一些結(jié)論。但是分析中也存在一些不足之處。首先,本研究選取的植物種類和化合物樣本數(shù)量還不夠多,得出結(jié)果的代表性有待于進(jìn)一步完善。中草藥的藥理特點多使用中醫(yī)中藥學(xué)原理方法進(jìn)行解釋,并且由于其成分復(fù)雜,難以對起到關(guān)鍵作用的化合物進(jìn)行確認(rèn)??汞懠驳那噍锼氐挠行褂?,是中藥活性分子開發(fā)利用的里程碑,希望有更多的中藥活性分子像青蒿素那樣被更好地利用。了解常用中草藥中主要活性分子結(jié)構(gòu)特點,是對其進(jìn)行開發(fā)利用的先決條件。今后,還應(yīng)進(jìn)一步加大對此類活性分子結(jié)構(gòu)特點的分析研究力度,尋找某一類相同功效分子的共性特征。其次,分子結(jié)構(gòu)的分析未與功能相結(jié)合。本研究的最終目的,還是要進(jìn)一步了解分子結(jié)構(gòu)和功能之間的關(guān)系。但是本研究著重分析統(tǒng)計了51種化合物的結(jié)構(gòu)特征,未與其功能進(jìn)行關(guān)聯(lián),這是后續(xù)研究應(yīng)該重點關(guān)注的內(nèi)容。另外,還可以進(jìn)一步探討這些化合物分子的空間結(jié)構(gòu)。本研究主要統(tǒng)計了這些分子中環(huán)和基團的種類和數(shù)目,但是這些分子要起作用,還需要有一個適宜的空間結(jié)構(gòu)。因此,在后續(xù)研究中,還可以結(jié)合分子功能和受體,去了解這些分子的空間結(jié)構(gòu)及基團位置對功能的影響。