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基于質(zhì)譜技術(shù)的蛋白質(zhì)互作研究進(jìn)展

2022-03-30 06:50孫瑞雪米薇葉子弘
生物技術(shù)進(jìn)展 2022年2期
關(guān)鍵詞:質(zhì)譜法復(fù)合物質(zhì)譜

孫瑞雪,米薇,葉子弘

1.中國(guó)計(jì)量大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,杭州 310018;2.中國(guó)計(jì)量科學(xué)研究院,北京100029

蛋白-蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI)和蛋白-配體相互作用,涉及多種藥物作用機(jī)制[1]。蛋白-蛋白結(jié)合的調(diào)節(jié)也代表了一種新興的治療模式,蛋白質(zhì)界面為藥物開發(fā)提供了一類新的靶點(diǎn)。在PPI 中尋找關(guān)鍵的蛋白、發(fā)現(xiàn)新的藥物靶標(biāo)、診斷標(biāo)記物以及治療靶點(diǎn),可為相關(guān)疾病的治療和靶向藥物的開發(fā)提供參考,并可協(xié)助探尋疾病成因。單克隆抗體(mAbs)具有作用機(jī)制明確、高結(jié)合親和力和對(duì)選定靶點(diǎn)有特異性等優(yōu)勢(shì),已成為蛋白質(zhì)治療的主要類別[2-3]。蛋白質(zhì)的功能主要通過(guò)與其他蛋白質(zhì)相互作用來(lái)實(shí)現(xiàn),因此PPI 網(wǎng)絡(luò)是識(shí)別遺傳變異功能后果的重要工具。與疾病有關(guān)的基因突變被定位到細(xì)胞過(guò)程的重要PPIs,通過(guò)引入攜帶突變的蛋白或病原體蛋白的外源性表達(dá),將疾病狀態(tài)與野生型參考圖進(jìn)行對(duì)比,有望揭示疾病發(fā)病過(guò)程中網(wǎng)絡(luò)的變化。

基于質(zhì)譜技術(shù)(mass spectrometry,MS)的蛋白互作方法正蓬勃發(fā)展,并越來(lái)越廣泛地應(yīng)用于科學(xué)研究中?;谫|(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學(xué)方法的發(fā)展使得通過(guò)測(cè)定動(dòng)態(tài)蛋白質(zhì)復(fù)合物的組成、翻譯后修飾、組裝、結(jié)構(gòu)和PPI來(lái)全面表征蛋白質(zhì)復(fù)合物成為可能[4]。盡管目前的質(zhì)譜分析方法在靈敏度和細(xì)胞通量方面尚存在缺陷,但使用液滴微流體,可以將樣品的檢測(cè)限從μL 精確到nL,這大大提高了分析性能。到目前為止,基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學(xué)和結(jié)構(gòu)生物學(xué)已經(jīng)越來(lái)越廣泛地與基于質(zhì)譜的方法相融合,逐漸被用于補(bǔ)充結(jié)構(gòu)生物學(xué)工具[5]。

1 經(jīng)典的蛋白互作研究方法

研究蛋白質(zhì)間相互作用的經(jīng)典方法較多,主要包括生物物理學(xué)、生物化學(xué)、遺傳學(xué)等方法。熒光共振能量轉(zhuǎn)移(fluorescence resonance energy transfer,F(xiàn)RET)可直接作用于活細(xì)胞,能夠監(jiān)測(cè)實(shí)時(shí)或者瞬時(shí)的PPI,檢測(cè)相互作用位點(diǎn),監(jiān)測(cè)復(fù)雜的相互作用動(dòng)力學(xué)[6]。表面等離子體共振技術(shù)(surface plasmon resonance,SPR)具有實(shí)時(shí)分析、樣品用量少、樣品無(wú)需標(biāo)記、自動(dòng)化和中到高通量篩選能力等優(yōu)勢(shì),這廣泛地促進(jìn)了治療性單克隆抗體的發(fā)現(xiàn)和發(fā)展[7]。此外,SPR 和MS 的結(jié)合為蛋白質(zhì)間相互作用的鑒定和表征提供了一個(gè)非常靈敏的工具[8],該技術(shù)可使用相對(duì)少量的材料測(cè)量膜蛋白與配體分子互作的實(shí)時(shí)定量結(jié)合親和力和動(dòng)力學(xué)參數(shù)[9]。經(jīng)典的蛋白互作方法優(yōu)缺點(diǎn)見(jiàn)表1。

表1 經(jīng)典的蛋白質(zhì)互作方法優(yōu)缺點(diǎn)Table 1 Advantages and disadvantages of classical protein interaction methods

雙分子熒光互補(bǔ)(bimolecular fluorescent complimentary,BiFC)技術(shù)可直接顯示活細(xì)胞中的PPIs,提供關(guān)于PPIs 發(fā)生的亞細(xì)胞位置的空間信息,該技術(shù)靈敏度高,可用于檢測(cè)內(nèi)源性或近內(nèi)源性表達(dá)蛋白互作,以及微弱和短暫互作。但它測(cè)量PPI 的動(dòng)態(tài)或?qū)崟r(shí)變化并不理想,在某些情況下,它可能檢測(cè)到假陽(yáng)性的熒光信號(hào),這與重組片段的熒光強(qiáng)度有關(guān),而與正在研究的兩個(gè)蛋白質(zhì)之間(或非特異性)的相互作用無(wú)關(guān)[10]。

酵母雙雜交技術(shù)(yeast two-hybrid technique,Y2H)可用于全基因組范圍內(nèi)蛋白質(zhì)間相互作用的高通量研究,能夠在真正的細(xì)胞環(huán)境中檢測(cè)體內(nèi)的相互作用[11],有助于避免一些與細(xì)胞裂解相關(guān)的并發(fā)癥和人為因素[12]。它可以篩選目標(biāo)基因的互作蛋白,檢測(cè)瞬時(shí)或弱相互作用,繪制蛋白質(zhì)相互作用圖譜,篩選藥物靶標(biāo),定量檢測(cè)互作強(qiáng)度。但Y2H 需要兩個(gè)互作的蛋白進(jìn)入細(xì)胞核以驅(qū)動(dòng)報(bào)告基因的轉(zhuǎn)錄,所以不適合用于某些細(xì)胞膜受體蛋白和細(xì)胞外蛋白[13]。在某些情況下使用酵母宿主可能無(wú)法檢測(cè)到來(lái)自其他生物體的PPIs,原因是表達(dá)不良、缺乏必要的翻譯后修飾、輔助因子或其他結(jié)合因子[14]。

2 親和純化-質(zhì)譜

親和純化-質(zhì)譜(affinity purification-mass spectrometry,AP-MS)的原理是將目的蛋白固定在固體載體上(最常見(jiàn)的是瓊脂糖或磁珠),利用目的蛋白與互作蛋白的相互作用將互作蛋白固定在載體上,從而實(shí)現(xiàn)從復(fù)雜混合物中的分離,隨后將分離得到的混合物用質(zhì)譜鑒定[15]。

親和純化與定量質(zhì)譜聯(lián)用已成為研究蛋白質(zhì)復(fù)合物以及整個(gè)生物體蛋白質(zhì)組在體內(nèi)相互作用的主要方法,這種組合產(chǎn)生高度可靠的蛋白互作數(shù)據(jù),通過(guò)使用定量蛋白質(zhì)互作信息,可以將特定蛋白質(zhì)相互作用物與非特定背景蛋白質(zhì)區(qū)分開[16-18]。但分析AP-MS 實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)較困難,需要MS專業(yè)知識(shí)和特定的生物信息學(xué)工具。串聯(lián)親和純化(tandem affinity purification,TAP)結(jié)合質(zhì)譜技術(shù)可以識(shí)別互作蛋白并對(duì)蛋白復(fù)合物進(jìn)行純化,TAP-MS 已被用于分析許多不同生物體中的蛋白互作和蛋白質(zhì)復(fù)合物。同時(shí),TAP 還可以分析突變體對(duì)蛋白質(zhì)相互作用和關(guān)聯(lián)的影響,還可能發(fā)現(xiàn)結(jié)合位點(diǎn)[19]。

3 生物素鑒定-質(zhì)譜

生物素鑒定-質(zhì)譜(biotin identification-mass spectrometry,BioID-MS)的原理是原核生物素連接酶分子(BirA)連接目的蛋白,當(dāng)細(xì)胞中融合蛋白表達(dá)后,接近目的蛋白的互作蛋白被生物素化而帶上生物素標(biāo)簽,隨后用帶親和素的固相載體進(jìn)行捕獲,可分離得到生物素化的蛋白,最后使用MS 鑒定可得到目的蛋白的互作蛋白[20]。BioIDMS 的核心優(yōu)勢(shì)是它在天然細(xì)胞環(huán)境中檢測(cè)PPIs時(shí),細(xì)胞的正常生命活動(dòng)基本不會(huì)受到干擾,通過(guò)改變?nèi)诤系鞍字g連接部分的長(zhǎng)度,可以調(diào)控檢測(cè)范圍,該技術(shù)在蛋白質(zhì)組學(xué)研究領(lǐng)域意義重大。

BioID-MS 還適合識(shí)別微弱或瞬時(shí)互作、難溶性蛋白互作、翻譯后修飾介導(dǎo)的蛋白互作等。它在檢測(cè)低豐度蛋白方面可能比AP-MS 更有效[21]。該技術(shù)被用于鑒定冠狀病毒復(fù)制、HIV 病毒蛋白互作網(wǎng)、細(xì)菌宿主識(shí)別、有絲分裂相關(guān)蛋白互作等[22]。但低表達(dá)水平的PPI 伴侶也可能導(dǎo)致假陰性,在某些情況下,生物素化過(guò)程本身可能會(huì)對(duì)蛋白質(zhì)的行為/相互作用造成影響。

4 氫氘交換質(zhì)譜法

4.1 氫氘交換質(zhì)譜法的原理

氫氘交換質(zhì)譜法(hydrogen deuterium exchange mass spectrometry,HDX-MS)的原理是蛋白質(zhì)樣品在不同的時(shí)間點(diǎn)用氘進(jìn)行標(biāo)記,通過(guò)降低pH 至2.5 來(lái)淬滅交換,氘化的樣品保持在0 ℃以避免回交,樣品酶解后,用HPLC 及UPLC 分離多肽,最后用MS 檢測(cè)。因?yàn)殡葰渲?,質(zhì)譜信號(hào)將逐漸向高質(zhì)荷比(m/z)方向移動(dòng)。通過(guò)對(duì)反應(yīng)前后HDX-MS 數(shù)據(jù)的比較,不同HDX-MS 譜的肽段可以突出蛋白與小分子/其他蛋白互作中潛在的相互作用界面[23]。

4.2 氫氘交換質(zhì)譜法的應(yīng)用

20 世紀(jì)90 年代以來(lái),HDX-MS 在學(xué)術(shù)界被廣泛應(yīng)用,其中包括對(duì)蛋白質(zhì)復(fù)合物、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能、配體結(jié)合、構(gòu)象變化和折疊/展開/再折疊的動(dòng)態(tài)特性、由變構(gòu)效應(yīng)引起的構(gòu)象變化等的研究。Puchades 等[24]基于HDX-MS 揭示了溶液中血凝素(hemagglutinin,HA)三聚體的構(gòu)象動(dòng)力學(xué)。該技術(shù)在修飾的氨基酸水平相對(duì)較低或在多個(gè)位點(diǎn)有修飾時(shí)也可用來(lái)評(píng)估蛋白質(zhì)翻譯后修飾(PTMs)在單個(gè)位點(diǎn)的影響。它可以識(shí)別抗體-抗原互作表位,了解抗原-抗體的相互作用和識(shí)別表位對(duì)于設(shè)計(jì)有效的蛋白治療藥物尤為重要。此外,該技術(shù)可進(jìn)一步輔助藥物研發(fā)與表征蛋白質(zhì)治療的高階結(jié)構(gòu)以及動(dòng)態(tài)的微小變化,可以作為一種有效的常規(guī)檢查方法,用于生產(chǎn)過(guò)程各個(gè)階段的質(zhì)量控制。Puchades等[24]應(yīng)用該技術(shù)探索各種藥物分子在血凝素上的主要抗原表位,并在藥物開發(fā)的早期階段確定候選藥物。

HDX-MS 可作為篩選候選藥物庫(kù)、早期和晚期先導(dǎo)物優(yōu)化的工具和蛋白質(zhì)治療藥物生產(chǎn)中的常規(guī)質(zhì)量控制方法[25]。它還可以揭示配體結(jié)合位點(diǎn)和誘導(dǎo)構(gòu)象變化,為理解藥物的定量構(gòu)效關(guān)系(quantitative structure-activity relationship,QSAR)提供依據(jù)。該方法在單克隆抗體治療的發(fā)展中貢獻(xiàn)巨大,可作為一種可靠的方法來(lái)定位抗體-抗原在其固有溶液狀態(tài)下的相互作用構(gòu)象表位[26-28],也被用于詢問(wèn)抗體偶聯(lián)藥物的高階結(jié)構(gòu),以評(píng)估藥物偶聯(lián)過(guò)程如何影響單克隆抗體的構(gòu)象和動(dòng)力學(xué)特性[29]。Pan 等[30]首次將HDX-MS 應(yīng)用于mAb和相應(yīng)的抗體-藥物偶聯(lián)物(antibody-drug conjugate,ADC)直接比較,以了解藥物結(jié)合對(duì)ADC 的構(gòu)象和動(dòng)力學(xué)的影響,研究發(fā)現(xiàn),ADC 和單抗在溶液中具有非常相似的構(gòu)象和動(dòng)力學(xué)參數(shù),且HDX-MS 數(shù)據(jù)表明,藥物偶聯(lián)過(guò)程不會(huì)在蛋白質(zhì)骨架上引起大規(guī)模的構(gòu)象變化。

HDX-MS 有助于新藥物的設(shè)計(jì)和發(fā)現(xiàn),已用于單克隆抗體、抗體-藥物偶聯(lián)物和生物類似抗體的評(píng)估和開發(fā)[31]。

4.3 氫氘交換質(zhì)譜法的優(yōu)勢(shì)

HDX-MS 可用于研究蛋白質(zhì)中氫鍵網(wǎng)絡(luò)和折疊,特別是當(dāng)樣本有限時(shí),優(yōu)勢(shì)明顯。HDX-MS 與其他方法相結(jié)合,如化學(xué)交聯(lián),有助于闡明單個(gè)蛋白質(zhì)和大型蛋白質(zhì)復(fù)合物的結(jié)構(gòu)和構(gòu)象動(dòng)力學(xué)[32]。Yang 等[33]通過(guò)SPR 結(jié)合HDX-MS 技術(shù)對(duì)血清樣本中存在的抗體進(jìn)行了全面的定量和定性評(píng)估,SPR 技術(shù)提供抗體親和力信息和抗原特異性抗體定量信息,MS提供血清抗體與其抗原之間結(jié)構(gòu)相互作用信息,這對(duì)開發(fā)治療性抗體或疫苗至關(guān)重要。Domina等[34]通過(guò)噬菌體結(jié)合HDX-MS技術(shù)確定了NHBA的結(jié)合位點(diǎn)。Rafalik等[35]通過(guò)HDX-MS 結(jié)合酶聯(lián)免疫吸附試驗(yàn)揭示了抗原-抗體的親和力和特異性的信息,以及表位信息。Calvaresi 等[36]通過(guò)尺寸排阻色譜結(jié)合HDX-MS 實(shí)現(xiàn)了從蛋白質(zhì)-脂質(zhì)系統(tǒng)中高效地在線去除脂質(zhì)成分,在抗原表位定位期間耗盡抗原中的抗體,以及在HDX-MS 分析二硫鍵結(jié)合蛋白過(guò)程中消除MS 干擾化合物,如三(2-羧乙基)膦(TCEP)。它與低溫電子顯微鏡(cryogenic electron microscope,Cryo-EM)有互補(bǔ)性,通過(guò)HDX-MS 測(cè)量分離和復(fù)合的蛋白質(zhì),可以揭示分子間相互作用如何影響其動(dòng)力學(xué)和變構(gòu)調(diào)節(jié),低溫電磁可能有助于解釋HDX質(zhì)譜的結(jié)果,尤其是當(dāng)晶體學(xué)信息不可用時(shí)。

表位作圖是識(shí)別參與抗原-抗體相互作用的結(jié)合位點(diǎn)的過(guò)程,表位的鑒定對(duì)于開發(fā)新的基于抗體的治療和疫苗至關(guān)重要。揭示表位也有助于闡明靶蛋白的作用機(jī)制,HDX-MS 在表位定位方面的優(yōu)勢(shì)源于其高靈敏度和對(duì)蛋白質(zhì)大小的極大耐受性,即使是大的蛋白質(zhì)復(fù)合物,如組織相容性復(fù)合物,也可以通過(guò)表位作圖鑒定[37]。Bereszczak等[38]應(yīng)用HDX-MS 對(duì)病毒衣殼進(jìn)行表位分析,并檢測(cè)了兩個(gè)重要的單克隆抗體片段FabE1 和Fab3120 以及乙型肝炎病毒衣殼中的核心抗原。Fernandez 等[39]利用HDX-MS 技術(shù)對(duì)乙型肝炎病毒、輪狀病毒、登革熱病毒和乙型腦炎病毒進(jìn)行了表位作圖,這表明HDX-MS 技術(shù)在病毒組裝領(lǐng)域表位作圖中有巨大的應(yīng)用潛力。

5 化學(xué)交聯(lián)質(zhì)譜法

5.1 化學(xué)交聯(lián)質(zhì)譜法的原理

化學(xué)交聯(lián)質(zhì)譜法(chemical cross-linking mass spectrometry,CX-MS)的原理是對(duì)一個(gè)選定的蛋白質(zhì)或蛋白質(zhì)復(fù)合物在其自然狀態(tài)下加入化學(xué)交聯(lián)劑,交聯(lián)劑可以共價(jià)連接空間上接近的氨基酸殘基,其次交聯(lián)蛋白被水解,生成的肽混合物被分離,并用LC-MS 進(jìn)行分析。隨后對(duì)MS 數(shù)據(jù)進(jìn)行數(shù)據(jù)庫(kù)搜索,以闡明交聯(lián)肽的序列以及交聯(lián)位點(diǎn),交聯(lián)位點(diǎn)可用于確定蛋白質(zhì)單體或復(fù)合物的結(jié)構(gòu)域和氨基酸側(cè)鏈的鄰近程度,識(shí)別蛋白質(zhì)分子內(nèi)或分子間潛在的結(jié)合位點(diǎn)。

5.2 化學(xué)交聯(lián)質(zhì)譜法的應(yīng)用

CX-MS 主要應(yīng)用于解析蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和研究蛋白質(zhì)間互作。解析蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)對(duì)于了解蛋白質(zhì)的功能具有重要作用,蛋白質(zhì)功能的調(diào)控主要取決于其構(gòu)象和相互作用的動(dòng)態(tài)調(diào)節(jié)。有許多用于蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)界面結(jié)構(gòu)表征的技術(shù),如最常見(jiàn)的X 射線結(jié)晶學(xué),該技術(shù)能夠確定抗體與其抗原互作的精確位點(diǎn),但X 射線結(jié)晶學(xué)對(duì)于蛋白質(zhì)樣品的純度、濃度及結(jié)晶性等有嚴(yán)格的要求,不適合解析大分子蛋白質(zhì)復(fù)合體的結(jié)構(gòu),且無(wú)法捕捉相互作用蛋白質(zhì)的動(dòng)力學(xué)[40]。CX-MS 能與蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)軟件相結(jié)合從而確定蛋白質(zhì)空間構(gòu)象,能夠固定弱/瞬時(shí)互作,以及幫助區(qū)分直接互作還是間接互作,確定蛋白質(zhì)互作的界面[41]。

Chavez 等[42]演示了CX-MS 技術(shù)在鑒定組織樣本中蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)特征和相互作用方面的應(yīng)用,為小鼠心臟中存在的蛋白質(zhì)復(fù)合物提供了系統(tǒng)結(jié)構(gòu)生物學(xué)視角,每個(gè)確定交聯(lián)肽對(duì)都提供了一個(gè)有用的分子探針,可用來(lái)量化組織中蛋白質(zhì)構(gòu)象或蛋白互作的變化,并可能幫助識(shí)別分子相互作用,作為線粒體靶向治療心血管或其他疾病的新靶點(diǎn)。Huang 等[43]利用此方法探測(cè)了牛血清白蛋白的三維結(jié)構(gòu)。CX-MS 也被廣泛應(yīng)用于蛋白質(zhì)組的細(xì)胞裂解物、完整的細(xì)胞或細(xì)胞器、同時(shí)監(jiān)測(cè)整個(gè)蛋白質(zhì)組的PPIs 及其空間信息[44-45]。定量CX-MS 方法已被用于研究耐藥癌細(xì)胞相互作用的信息,熱休克蛋白90(Hsp90)和有絲分裂抑制劑誘導(dǎo)的蛋白質(zhì)構(gòu)象和相互作用的變化,以及擬磷酸化突變和核苷酸結(jié)合對(duì)Hsp90 與其輔伴侶Aha1 相互作用的影響[46]。定量CX-MS 將在可視化蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和相互作用動(dòng)力學(xué)中發(fā)揮越來(lái)越重要的作用[47]。

5.3 化學(xué)交聯(lián)質(zhì)譜法的優(yōu)勢(shì)

CX-MS 的日益普及很大程度上歸因于它在結(jié)構(gòu)生物學(xué)中作為一種整合方法,可創(chuàng)建更可靠的目標(biāo)蛋白模型。許多技術(shù)可以與CX-MS 結(jié)合使用,如將不同的低分辨率方法結(jié)合,可以生成更精確的蛋白質(zhì)和蛋白質(zhì)復(fù)合物結(jié)構(gòu)模型,特別是那些傳統(tǒng)技術(shù)難以研究的結(jié)構(gòu)[48]。

當(dāng)CX-MS 與冷凍電鏡和天然質(zhì)譜結(jié)合使用時(shí),這些空間約束數(shù)據(jù)可以指導(dǎo)分子建模,并繪制蛋白質(zhì)復(fù)合物的動(dòng)態(tài)行為圖[49-50]。Courouble 等[51]通過(guò)將HDX-MS 與CX-MS 相結(jié)合,闡明了SARSCoV-2 全長(zhǎng)nsp7:nsp8 復(fù)合物的結(jié)構(gòu)動(dòng)力學(xué)特征。Zhang等[52]成功地利用HDX-MS、CX-MS和分子對(duì)接技術(shù)確定了IL-7/IL-7Rα 結(jié)合界面,并預(yù)測(cè)了蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)復(fù)合物在溶液中的三維四級(jí)結(jié)構(gòu)。此外,交聯(lián)試劑可以共價(jià)連接兩個(gè)或多個(gè)非共價(jià)相互作用的蛋白質(zhì),且與相互作用的時(shí)間和強(qiáng)度無(wú)關(guān),因此即使是短暫的和弱的PPI 也可以被保留下來(lái)[53-54]。CX-MS 有助于確定交聯(lián)氨基酸側(cè)鏈的位置,從而將物理作用位點(diǎn)限制在特定的結(jié)構(gòu)區(qū)域[55]。

6 展望

本文介紹了基于質(zhì)譜的PPI 方法的一般原則及各種方法的優(yōu)缺點(diǎn),如表2 所示。質(zhì)譜具有靈敏度高、可高通量檢測(cè)等優(yōu)點(diǎn),采用質(zhì)譜檢測(cè)蛋白互作可在一定程度上彌補(bǔ)經(jīng)典方法的局限性?;谫|(zhì)譜的方法檢測(cè)的結(jié)構(gòu)特征可以與傳統(tǒng)的技術(shù)互補(bǔ),如X 射線晶體學(xué)、電磁和核磁共振波譜學(xué)等。CX-MS 將會(huì)極大地推動(dòng)生物大分子復(fù)合體結(jié)構(gòu)和蛋白互作的研究。HDX-MS 技術(shù)不僅能夠分析蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu),還能分析結(jié)構(gòu)動(dòng)態(tài)變化,但設(shè)備條件限制了該技術(shù)在國(guó)內(nèi)的應(yīng)用,因此,提高數(shù)據(jù)自動(dòng)解析度是HDX-MS技術(shù)推廣的關(guān)鍵。未來(lái)HDX 質(zhì)譜將繼續(xù)在評(píng)估蛋白質(zhì)治療的高階結(jié)構(gòu)中發(fā)揮重要作用。相信更先進(jìn)的質(zhì)譜檢測(cè)技術(shù)將更廣泛應(yīng)用于蛋白質(zhì)互作領(lǐng)域。蛋白質(zhì)復(fù)合物的組成及其互作表面、化學(xué)計(jì)量學(xué)、動(dòng)力學(xué)等方面的研究將進(jìn)一步提高這些技術(shù)在整合結(jié)構(gòu)生物學(xué)中的應(yīng)用價(jià)值。

表2 基于質(zhì)譜的蛋白互作方法優(yōu)缺點(diǎn)Table 2 Advantages and disadvantages of protein interaction methods based on mass spectrometry

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