王宇宸 ,陶守超 ,李晨陽(yáng) ,施 雯 ,和秋菊 *,易傳輝
(1.云南省森林災(zāi)害與控制重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,昆明 650224;2.西南林業(yè)大學(xué)生物多樣性保護(hù)學(xué)院,昆明 650224;3.云南生物多樣性研究院,昆明 650224)
目前世界已知胡蜂科昆蟲約6 000種,胡蜂屬23種,其中中國(guó)有胡蜂科昆蟲200余種,胡蜂屬昆蟲17種。黃腳胡蜂(Vespa velutinaLepeletier,1836)屬膜翅目Hymenoptera胡蜂科Vespidae昆蟲,在中國(guó)有4個(gè)亞種,分別為凹紋胡蜂V.v.aurariaSimth、異凹紋胡蜂V.v.varianavan der Vecht、墨胸胡蜂V.v.nigrithoraxBuysson和黃足凹紋胡蜂V.v.flavi?tarsusSonan[1];主要分布于中國(guó)(福建、廣東、廣西、貴州、江西、云南、四川、江蘇等)、印度和東南亞等地[2-3]。黃腳胡蜂具有豐富的營(yíng)養(yǎng)、保健和藥用價(jià)值[4-5]。近年來(lái),在云南等南方各地廣泛進(jìn)行人工養(yǎng)殖,一方面增加了山區(qū)農(nóng)民的收入,但另一方面也因其放養(yǎng)的養(yǎng)殖方式,導(dǎo)致生態(tài)系統(tǒng)中胡蜂種群的爆炸式增長(zhǎng),對(duì)當(dāng)?shù)厣锒鄻有栽斐闪瞬焕绊懀绕涫菍?duì)傳粉昆蟲蜜蜂的種群數(shù)量影響巨大[6-11]。最近幾年黃腳胡蜂作為外來(lái)物種,已入侵韓國(guó)、日本和歐洲大部分地區(qū),給當(dāng)?shù)貍鞣劾ハx特別是蜜蜂的種群數(shù)量造成了嚴(yán)重影響[12-14]。目前主要對(duì)歐洲地區(qū)黃腳胡蜂的生物入侵方面進(jìn)行了研究[15-16],J.S.Kim等[17]對(duì)墨胸胡蜂及R.Takahashi等[18]對(duì)黃腳胡蜂線粒體基因全序列進(jìn)行了研究。由于在演化過程中昆蟲的線粒體基因具有選擇壓力小、突變易穩(wěn)定遺傳、在群體中變異率較高等特點(diǎn),常被用作系統(tǒng)發(fā)育、種群遺傳結(jié)構(gòu)及遺傳分化研究的分子標(biāo)記[19-21],在線粒體基因中COⅠ基因因其具有豐富的變異,在遺傳學(xué)研究中應(yīng)用尤其廣泛[22-23]。本研究基于COⅠ基因序列對(duì)云南地區(qū)主要人工養(yǎng)殖區(qū)的黃腳胡蜂種群遺傳多樣性進(jìn)行研究,以期掌握本區(qū)域養(yǎng)殖種群遺傳多樣性狀況,并通過了解親緣關(guān)系養(yǎng)殖種群的原始來(lái)源,為該物種科學(xué)養(yǎng)殖與利用和入侵種群危害管理提供基礎(chǔ)資料。
供試蟲源:來(lái)自云南省內(nèi)的8個(gè)地級(jí)市(表1),將采集到的黃腳胡蜂放入裝有無(wú)水乙醇的1.5 mL離心管中封存,記錄相關(guān)采集信息并編號(hào),置-40℃冰箱中保存?zhèn)溆谩?/p>
表1 黃腳胡蜂云南不同養(yǎng)殖種群樣品信息Table 1 The data of different breeding populations of V.velutina in Yunnan
選取各種群黃腳胡蜂職蜂1頭,取10 mg胸部肌肉用于DNA提取,采用Magen公司的HiPure Insect DNA Kit試劑盒,參考說明書提取黃腳胡蜂的總DNA。利用1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)提取DNA的完整性。以提取的總DNA為模板,采用DNA條形碼COⅠ基因的通用引物L(fēng)CO1490(5’-GGTC AACAAATCATAAAGATATTG-3’)和HCO2198(5’-TAAACTTCAGGGTGACCAAAAAAT-3’)[24-25]進(jìn) 行PCR擴(kuò)增。PCR擴(kuò)增反應(yīng)體系為30 μL,3 μL模板DNA,正向引物1 μL,反向引物1 μL,Taq PCR Master Mix 15 μL,去離子水10 μL。擴(kuò)增反應(yīng)在GmbH Power Cycler SL 96型PCR儀上完成,PCR反應(yīng)程序?yàn)椋?4℃預(yù)變性3 min;94℃變性30 min,50℃退火30 s,72℃延伸1 min,35個(gè)循環(huán);72℃補(bǔ)償延伸10 min,4℃保存。PCR產(chǎn)物用1%的瓊脂糖凝膠于1×TAE緩沖液中電泳,電壓70 V,電泳時(shí)間約45 min。經(jīng)凝膠成像系統(tǒng)檢測(cè)并拍照保存,將有清晰條帶的擴(kuò)增產(chǎn)物送至北京擎科生物有限公司昆明分公司進(jìn)行雙向測(cè)序。
運(yùn)用BioEdit 7.2.6軟件對(duì)測(cè)序返回的數(shù)據(jù)進(jìn)行序列的雙向?qū)Ρ龋コ笔?、雙峰序列和兩端不穩(wěn)定的序列,翻轉(zhuǎn)反向序列進(jìn)行核對(duì),查看是否存在缺失的位點(diǎn),保存后應(yīng)用在線軟件Mafft(http://mafft.cbrc.jp/alignment/server/)G-INS-1策略進(jìn)行多重序列對(duì)比,使用NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)中Blast功能對(duì)校對(duì)后的序列進(jìn)行同源性比對(duì),確定其為黃腳胡蜂的目的基因序列。將在線比對(duì)的保守區(qū)FASTA文件導(dǎo)入DAMBE軟件進(jìn)行替換飽和檢測(cè),若ISS 利用BioEdit處理軟件校對(duì)檢驗(yàn)序列,進(jìn)行遺傳多樣性分析;利用DNASP 5.1軟件統(tǒng)計(jì)各個(gè)種群的位點(diǎn)和堿基構(gòu)成,并分析各養(yǎng)殖種群核酸平均差異度K、核苷酸多度Pi、單倍型多度Hd,總?cè)后w以及群體間的遺傳多樣性和差異性;利用MEGA 6.05軟件基于Kimura2-Parameters模型,計(jì)算各個(gè)養(yǎng)殖種群之間核苷酸的遺傳距離;利用PopART軟件構(gòu)建COⅠ單倍型網(wǎng)絡(luò)關(guān)系圖;通過DAMBE軟件進(jìn)行核苷酸序列飽和度檢測(cè),并用MEGA 6.05軟件中的雙參數(shù)模型分析[26],分別用最大似然法(ML)和鄰接法(NJ)構(gòu)建分子系統(tǒng)樹;利用Arlequin軟件中的AMOVA進(jìn)行分子方差分析,計(jì)算遺傳變異在種群間和種群內(nèi)的方差貢獻(xiàn)率。 對(duì)黃腳胡蜂云南不同人工養(yǎng)殖種群的175條DNACOⅠ基因序列雙向測(cè)序,獲得大小約700 bp片段。利用Chromas軟件和Bioedit軟件進(jìn)行序列對(duì)比,去除含有雜合子質(zhì)量較低序列后,最終獲得154條序列長(zhǎng)度約為621 bp的COⅠ基因序列。其中保守位點(diǎn)614個(gè),遺傳變異位點(diǎn)7個(gè),5個(gè)簡(jiǎn)約信息位點(diǎn)和2個(gè)單一變異位點(diǎn),序列中無(wú)堿基插入或缺失等情況。COⅠ序列中堿基A、T、C和G的含量分別是34.43%、26.23%、22.95%和16.39%,其中A+T的含量為60.66%,G+C含量為39.34%,結(jié)果表明黃腳胡蜂COⅠ基因序列具有A+T堿基偏向性。在154個(gè)樣本中,共檢測(cè)出7個(gè)單倍型(表2),命名為Hap1~Hap7。KM、CX、HH、WS和PE群體中都檢測(cè)有2個(gè)單倍型;BS、LC和QJ種群中只含有1個(gè)單倍型;Hap1為除臨滄外其余7個(gè)種群的共享單倍型,分布最為廣泛;Hap2為CX獨(dú)享單倍型,Hap3為HH獨(dú)享單倍型,KM有2個(gè)獨(dú)享單倍型Hap4和Hap5,Hap6為L(zhǎng)C獨(dú)享單倍型,Hap7為PE和WS共享。 表2 云南人工養(yǎng)殖黃腳胡蜂COⅠ基因序列單倍型差異Table 2 Haplotypes difference of COⅠgene sequence in V.velutina in Yunnan 各養(yǎng)殖種群的核酸平均差異度(K)、核苷酸多度(Pi)、單倍型多度(Hd)分析結(jié)果顯示(表3):總?cè)后w的Hd為0.608 61,K為0.892 62,Pi為0.001 44。不同養(yǎng)殖種群間Pi在0~0.000 79之間,Hd在0~0.6之間,其中BS、QJ、LC 3個(gè)種群Hd、K、Pi最低,均為0。中性檢測(cè)結(jié)果不顯著(Tajima's D=-0.625 98,P>0.10),說明供試黃腳胡蜂總?cè)后w在過去較近歷史時(shí)期群體大小相對(duì)穩(wěn)定,沒有經(jīng)歷明顯群體擴(kuò)張和持續(xù)增長(zhǎng)。 表3 黃腳胡蜂云南不同養(yǎng)殖種群COⅠ基因單倍型與核苷酸多樣性分析Table 3 COⅠhaplotype and nucleotide diversity in different breeding populations of V.velutina in Yunnan 對(duì)黃腳胡蜂云南不同人工養(yǎng)殖種群間的核苷酸差異數(shù)(Kxy)與核苷酸歧義度(Dxy)比較顯示(表4),各種群核苷酸平均差異數(shù)在0~2.098 25之間,核苷酸歧義度在0.000 00~0.003 98之間,表明各養(yǎng)殖種群間的遺傳差異較小。 遺傳距離分析顯示(表5),各種群間的核苷酸遺傳距離在0.000~0.004之間,其中KM與LC種群間的遺傳距離最大,為0.004,HH與BS、PE與BS、QJ與BS、QJ與HH間遺傳距離為0。結(jié)果表明,各養(yǎng)殖種群之間具有一定的遺傳距離,但總體上未出現(xiàn)種群分化現(xiàn)象。而與OUT種群之間的遺傳距離均為0.176。Mantel相關(guān)性分析顯示(圖1),地理距離與遺傳距離之間沒有顯著的相關(guān)性(r=0.141 1,P=0.24>0.05),表明各養(yǎng)殖種群間遺傳距離不是由地理距離決定的。 圖1 黃腳胡蜂8個(gè)不同人工養(yǎng)殖種群的遺傳距離與地理距離Mantel檢驗(yàn)Figure 1 Mantel test of genetic distance vs.geographical distance among 8 different breeding populations of V.velutina 表5 黃腳胡蜂云南不同養(yǎng)殖種群之間的遺傳距離Table 5 Genetic distance of the different breeding population of V.velutina in Yunnan COⅠ單倍型網(wǎng)絡(luò)關(guān)系圖顯示(圖2),整個(gè)進(jìn)化網(wǎng)絡(luò)呈放射狀,在群體中具有較高遺傳頻率的單倍型Hap1、Hap7位于單倍型進(jìn)化網(wǎng)絡(luò)圖中間,其余遺傳較低的單倍型在外圍與遺傳頻率較高的連接,由于單倍型較少,不能明顯看出該物種的進(jìn)化方向。 圖2 mtDNA COⅠ基因7個(gè)單倍型的進(jìn)化網(wǎng)絡(luò)關(guān)系Figure 2 Median joining network of 7 mtDNA COⅠgene haplotypes 核苷酸序列飽和度檢測(cè)顯示差異顯著(Iss(0.004 9) 圖3 基于COⅠ基因構(gòu)建的黃腳胡蜂云南不同養(yǎng)殖種群ML系統(tǒng)樹Figure 3 ML tree of different breeding populations of V.velutina in Yunnan on COⅠsequences 圖4 基于COⅠ基因構(gòu)建的黃腳胡蜂云南不同養(yǎng)殖種群NJ系統(tǒng)樹Figure 4 NJ tree of different breeding populations of V.velutina in Yunnan on COⅠsequences 分子方差分析顯示(表6),各養(yǎng)殖種群存在著一定程度變異,各養(yǎng)殖種群之間(Va)的方差組分為0.367 35,其方差比為26.38%,而種群內(nèi)(Vb)的方差組分1.025 18,方差比為73.62%,F(xiàn)st為0.031 63,小于0.05,表明遺傳變異主要來(lái)源于種群內(nèi)部,種群之間的變異小,遺傳分化程度較低,符合該蜂群居生活和人工養(yǎng)殖的特點(diǎn)。 線粒體DNA(mtDNA)是常用的分子遺傳標(biāo)記,其中的線粒體細(xì)胞色素氧化酶亞基Ⅰ(COⅠ)基因在昆蟲種類鑒定、種群遺傳多樣性、物種的系統(tǒng)進(jìn)化等研究方面得到廣泛應(yīng)用[27]。本研究基于mtDNA COⅠ基因,對(duì)云南省黃腳胡蜂8個(gè)養(yǎng)殖種群遺傳多樣性進(jìn)行了分析。結(jié)果顯示,黃腳胡蜂mtDNA COⅠ基因A+T含量占60.66%,具有明顯的A+T堿基偏向性,符合昆蟲線粒體的堿基組成特征,但含量較整個(gè)線粒體基因組低[17-18]。單倍型分析發(fā)現(xiàn),7個(gè)單倍型中,Hap1為除臨滄外其余7個(gè)種群的共享單倍型,分布最廣泛,認(rèn)為是群體中適應(yīng)性強(qiáng)的原始單倍型,可能來(lái)源于親緣關(guān)系相近原始種群。單倍型常用于各種群親緣關(guān)系分析,M.Husemann等[28]利用單倍型分析了入侵德國(guó)漢堡的黃腳胡蜂亞種黑胸胡蜂的來(lái)源,分析認(rèn)為其來(lái)源于南歐,而非亞洲;黃腳胡蜂mtDNA COⅠ基因核苷酸多樣性水平偏低,僅為0.001 44,表明不同地區(qū)養(yǎng)殖種群可能來(lái)源于少數(shù)相同原始種群,近似于自然種群經(jīng)歷過“瓶頸效應(yīng)”,之后短時(shí)期內(nèi)的快速擴(kuò)張,核苷酸變異積累不足[29]。各種群遺傳距離較小,地理位置遠(yuǎn)近關(guān)系對(duì)其遺傳差異變化影響不明顯,F(xiàn)st值僅為0.031 63,表明變異主要來(lái)源為種群內(nèi)部,揭示原始養(yǎng)殖種群可能來(lái)源單一,親緣關(guān)系較近。這與最初養(yǎng)殖種群多數(shù)來(lái)源于保山龍陵相符,全國(guó)胡蜂熱的興起始于龍陵人黃國(guó)忠的培訓(xùn)和提供的種源[6],大部分養(yǎng)殖戶原始養(yǎng)殖種源均來(lái)源于保山龍陵或其種群后代[30]。黃腳胡蜂mtDNA COⅠ基因單倍型多樣性偏高,表明養(yǎng)殖過程中引入種群與當(dāng)?shù)胤N群存在基因交流,與作者調(diào)查發(fā)現(xiàn)的當(dāng)前養(yǎng)殖現(xiàn)狀吻合,養(yǎng)殖戶常在養(yǎng)殖過程中引入當(dāng)?shù)胤N源與之雜交(主要是雄蜂)。 胡蜂是傳粉昆蟲的主要天敵,入侵胡蜂常導(dǎo)致關(guān)鍵傳粉昆蟲下降,胡蜂人工養(yǎng)殖的快速興起,已對(duì)當(dāng)?shù)貍鞣劾ハx等造成嚴(yán)重影響[6,12-16]。人工養(yǎng)殖一方面造成當(dāng)?shù)睾浞N群幾何級(jí)的增加;另一方面,大部分種源從外地引入并續(xù)代繁育,大量個(gè)體逃逸野外,與當(dāng)?shù)胤N群雜交,當(dāng)?shù)睾浞N群遺傳多樣性和適應(yīng)性快速增加,勢(shì)必引起當(dāng)?shù)卣麄€(gè)生態(tài)系統(tǒng)的劇烈擾動(dòng),可能造成整個(gè)生態(tài)系統(tǒng)的失衡和破壞?;谘芯拷Y(jié)果,建議黃腳胡蜂人工養(yǎng)殖種群盡量采用本地種源,并不斷從當(dāng)?shù)匾巴獠杉N源加以更新,一方面可以增加養(yǎng)殖種群的遺傳多樣性,防止種群退化;另一方面可以防止外來(lái)種群因養(yǎng)殖逃逸而造成入侵,對(duì)當(dāng)?shù)厝汉蜕锒鄻有栽斐刹涣加绊?。進(jìn)一步加強(qiáng)胡蜂人工養(yǎng)殖的研究,特別是養(yǎng)殖技術(shù),逐步實(shí)現(xiàn)封閉設(shè)施養(yǎng)殖,以減少當(dāng)前環(huán)境中因人工養(yǎng)殖而造成大幅增加的胡蜂種群數(shù)量和蜂王逃逸對(duì)野生種群遺傳多樣性的影響;同時(shí),加強(qiáng)人工養(yǎng)殖地區(qū)胡蜂對(duì)蜜蜂等關(guān)鍵物種的影響研究,提出有效的保護(hù)方案,以減小人工養(yǎng)殖地區(qū)胡蜂對(duì)蜜蜂和其他生物多樣性的嚴(yán)重影響。 四川農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)2022年2期2 結(jié)果與分析
2.1 黃腳胡蜂線粒體COⅠ基因序列特征、變異情況及單倍型分析
2.2 黃腳胡蜂種群遺傳多樣性分析
2.3 黃腳胡蜂種群間遺傳距離
2.4 黃腳胡蜂mt DNA COⅠ單倍型的進(jìn)化網(wǎng)絡(luò)關(guān)系
2.5 分子系統(tǒng)樹及親緣關(guān)系
2.6 基因流與遺傳分化
3 討論與結(jié)論