魏慧慧 劉艷 殷劍峰 蘇麗紅★ 王玉梅★
游離DNA(cell-free DNA,cfDNA)作為新型的醫(yī)療診斷標(biāo)志物,自發(fā)現(xiàn)即迅速整合進(jìn)入腫瘤液態(tài)活檢、產(chǎn)前遺傳診斷等領(lǐng)域,極大地促進(jìn)了檢測技術(shù)的發(fā)展,成為重要的輔助診斷手段[1-2]。但血液樣品在常溫儲(chǔ)存及運(yùn)輸過程中,有核細(xì)胞極易破裂,導(dǎo)致基因組DNA 釋放、降解,造成血漿中游離DNA 成分污染及豐度降低。為確保游離DNA 的質(zhì)量以及后期檢測的準(zhǔn)確,保存管中必須添加防腐劑、核酸酶抑制劑以及有核細(xì)胞保護(hù)劑等添加劑[3]。其中,甘氨酸作為一種游離DNA 保護(hù)劑,對(duì)細(xì)胞腺嘌呤核苷三磷酸(Adenosine triphosphate,ATP)耗竭性損傷具有保護(hù)作用[4]。但在國家藥品監(jiān)督管理局頒布的現(xiàn)行行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)中,除了涉及系列抗凝劑的檢測[5],目前尚未形成對(duì)甘氨酸等添加劑的標(biāo)準(zhǔn)檢測方法。同時(shí),藥典中僅有針對(duì)藥品中甘氨酸含量的檢測方法,但不適合作為游離DNA保存管中添加劑的質(zhì)量評(píng)價(jià)方法。本研究建立了游離DNA保存管中甘氨酸的定量測定方法,并選用市場上不同廠家的兩種保存管進(jìn)行應(yīng)用驗(yàn)證,用于游離DNA保存管的質(zhì)量控制。
TD5 離心機(jī),購自湖南赫西儀器裝備有限公司;XSE205DU/81G 電子天平,購自梅特勒托利多公司;日立U-3310 紫外可見分光光度計(jì),購自HITECH 公司;SpectraMax M5 酶標(biāo)儀,購自Molecular Devices 公司。甘氨酸國家標(biāo)準(zhǔn)品(批號(hào)140689-201605,100 mg/支),中國食品藥品檢定研究院提供;茚三酮,純度99%,購自Alfa Aesar 公司;丙二醇甲醚,優(yōu)級(jí)純,購自沃凱化學(xué)試劑公司;硼氫化鈉,分析純,購自國藥集團(tuán)化學(xué)試劑有限公司;冰醋酸,分析純,購自國藥集團(tuán)化學(xué)試劑有限公司;三水醋酸鈉,分析純,購自國藥集團(tuán)化學(xué)試劑有限公司。
1.2.1 溶液配制
1.2.1.1 基質(zhì)液 參照采血管中添加劑含量[5]及市場調(diào)研結(jié)果,稱取5.00 g 咪唑烷基脲、2.50 g EDTA·K2·2H2O,置于同一燒杯,加水溶解后,轉(zhuǎn)入25 mL 容量瓶,定容,配制含200.00 mg/mL 咪唑烷基脲、100.00 mg/mL EDTA·K2·2H2O 的基質(zhì)溶液?;|(zhì)液進(jìn)行50 倍稀釋,成稀釋液。
1.2.1.2 甘氨酸標(biāo)準(zhǔn)儲(chǔ)備液和模擬液 稱取甘氨酸標(biāo)準(zhǔn)品75.00 mg,加入25 mL 容量瓶,加水溶解后定容,成甘氨酸標(biāo)準(zhǔn)儲(chǔ)備液(40.00 mmoL/L);稱取甘氨酸標(biāo)準(zhǔn)品187.50 mg,加入5 mL 容量瓶,加基質(zhì)液溶解,并以基質(zhì)液定容,成甘氨酸模擬液(500.00 mmoL/L)。
1.2.1.3 茚三酮反應(yīng)液 稱取4.00 g 茚三酮溶于95 mL 丙二醇甲醚,溶解后,加入8.10 mg 硼氫化鈉(視存放時(shí)間加入),攪拌溶解后過濾,加入丙二醇甲醚定容至100 mL,攪勻備用。
1.2.1.4 緩沖溶液 實(shí)驗(yàn)用水200 mL,丙二醇甲醚401 mL,冰醋酸123 mL,三水醋酸鈉338.40 g,加水定容至1 000 mL。
1.2.2 方法學(xué)建立
1.2.2.1 線性 以超純水對(duì)甘氨酸標(biāo)準(zhǔn)儲(chǔ)備液(40.00 mmoL/L)進(jìn)行稀釋,配制成0.63、1.25、2.50、5.00、10.00、20.00 mmoL/L 系列標(biāo)準(zhǔn)溶液。取上述各標(biāo)準(zhǔn)溶液樣品1 mL 分別置于25 mL 刻度管,各加水補(bǔ)充至容積為8 mL,然后加入茚三酮和緩沖溶液各1 mL,混合均勻,于100℃水浴上加熱15 min,取出迅速冷卻至室溫,加水至標(biāo)線,搖勻。靜置15 min 后,在570 nm 波長下,以水為空白對(duì)照樣品,測定系列標(biāo)準(zhǔn)溶液的吸光度。以標(biāo)準(zhǔn)溶液的甘氨酸濃度對(duì)其吸光度作直線回歸,求得標(biāo)準(zhǔn)曲線的直線回歸方程,相關(guān)系數(shù)(r)應(yīng)不小于0.99,各點(diǎn)回收率應(yīng)在85%~115%范圍內(nèi)。
1.2.2.2 檢出限與定量限 參考NLSI-EP17-A2 文件[6],以稀釋液作為空白進(jìn)行40 孔平行測定,根據(jù)擬合直線的斜率,求得吸光度對(duì)應(yīng)的濃度,計(jì)算結(jié)果的平均值XB和標(biāo)準(zhǔn)偏差SDB,按照公式LOB=XB+ 1.645 SDB計(jì)算,獲得空白限LOB 濃度。根據(jù)計(jì)算結(jié)果,配制接近或高于空白限濃度的低值樣本,即LOB~4LOB 范圍內(nèi)4 個(gè)樣本,分別測定7次,根據(jù)擬合直線的方程分別計(jì)算低值樣本相應(yīng)濃度的均值ˉ和標(biāo)準(zhǔn)偏差SDsn,根據(jù)公式:/(n1+n2+n3+n4),計(jì)算方差的加權(quán)平均,從而得到樣本測量標(biāo)準(zhǔn)偏差的集合估計(jì)SDS。根據(jù)公式LOD=LoB+1.645 SDS計(jì)算檢測限LOD。同時(shí)參考LOQ=XB+10SDB以及常規(guī)使用濃度范圍,獲得設(shè)定的定量限LOQ 濃度和可接受總體誤差目標(biāo)0.75 mmol/L。分別平行不少于25 次測定設(shè)定濃度的檢測限和定量限樣品,并按照Bias+2 SDs 計(jì)算總體誤差,以驗(yàn)證LOD 和LOQ。
1.2.2.3 精密度 取甘氨酸標(biāo)準(zhǔn)儲(chǔ)備液(40.00 mmoL/L),用水稀釋,制備高、中、低濃度精密度樣品供試液(濃度分別為8.00、4.00、2.00 mmoL/L),分別平行6 個(gè)樣品進(jìn)行測定。根據(jù)公式RSD=SD/計(jì)算相對(duì)標(biāo)準(zhǔn)偏差RSD。
1.2.2.4 準(zhǔn)確度和特異性 取模擬液0.18 mL,加入10 mL 刻度管,成理論靶值6.75 mg/支;取0.1 mL,加入5 mL 刻度管,成理論靶值3.75 mg/支。每種模擬樣品按照供試品檢測方法制備供試液,分別測定3 次,進(jìn)行回收率的計(jì)算,目標(biāo)設(shè)定為85%~115%。
1.2.2.5 供試品中甘氨酸添加量測定 隨機(jī)抽取兩種游離DNA 保存管各1 支(規(guī)格均為10 mL。產(chǎn)品技術(shù)要求:供試品1 添加劑濃度為4.00~6.00 mg/支,供試品2 添加劑濃度為8.10~9.90 mg/支,偏差均在15%),4 000 rpm(r=16.7 cm)縱向離心5 min。離心后取出,打開膠塞,加水至標(biāo)稱容量(抽吸體積或公稱液體容量)后,搖勻成供試液(或稀釋至合適的濃度)進(jìn)行檢測,將供試品的吸光度代入直線回歸方程,即得供試液的甘氨酸濃度Ct(mmoL/L)。另取2 支采血管,重復(fù)以上操作。按下式計(jì)算供試品中甘氨酸添加劑的含量。
m=Ct×V×75/1 000
式中:m-采血管中甘氨酸添加劑的含量,單位為毫克(mg);Ct-供試液的甘氨酸測定濃度,單位為毫摩爾/升(mmoL/L);V-采血管的標(biāo)稱容量(抽吸體積或公稱液體容量),或稀釋后定容體積,單位為毫升(mL)。
本方法檢測的線性范圍確定為0.63~10.00 mmoL/L,在此范圍內(nèi),線性相關(guān)性較好,相關(guān)系數(shù)r=0.996 6。見圖1。
在0.63~10.00 mmoL/L 線性范圍內(nèi),經(jīng)計(jì)算空白限LOB 為0.80 mmoL/L,檢測限LOD 為1.00 mmoL/L,定量限LOQ 為2.00 mmoL/L,總體誤差為0.32 mmoL/L。
低、中、高(濃度分別為2.00、4.00、8.00 mmoL/L)各6 個(gè)樣測定結(jié)果見表1。
表1 不同濃度樣本的精密度檢測結(jié)果(n=6)Table 1 Precision test results of samples with different concentrations(n=6)
以甘氨酸國家標(biāo)準(zhǔn)品配制的含有常規(guī)基質(zhì)成份的模擬樣品,經(jīng)檢測并換算到單支含量,與理論靶值比較,回收率結(jié)果均在85%~115%內(nèi),與設(shè)定的預(yù)期目標(biāo)一致;未發(fā)現(xiàn)基質(zhì)中常規(guī)存在的高咪唑烷基脲與EDTA·K2·2H2O 成份對(duì)檢測結(jié)果有明顯干擾,方法具有較好的準(zhǔn)確性和特異性。見表2。
表2 準(zhǔn)確度和特異性檢測結(jié)果Table 2 Accuracy and specificity test results
檢測兩種不同含量(如表3技術(shù)要求所示)的供試品,結(jié)果均在其產(chǎn)品靶值范圍內(nèi),符合技術(shù)要求規(guī)定。見表3。
表3 供試品測定結(jié)果Table 3 The test results of the tested products
循環(huán)血液游離DNA 作為非侵入性疾病的生物標(biāo)志物,可直接應(yīng)用于下游檢測,如數(shù)字PCR 和高通量測序等[7-9],是微創(chuàng)診斷、改善疾病監(jiān)測、臨床決策和患者預(yù)后的關(guān)鍵[10-11],相關(guān)體外診斷試劑盒也一直是申報(bào)的熱點(diǎn),因此,游離DNA 的保存質(zhì)量對(duì)后續(xù)的臨床檢測結(jié)果起重要作用[12-14]。目前上市的一次性真空采血管較多,但未查到獲批的針對(duì)游離DNA 保存的采血管或保存管,意味著目前各醫(yī)療檢測機(jī)構(gòu)在進(jìn)行高通量測序或其他使用游離DNA 樣本時(shí)使用的保存管均處于不被監(jiān)管的狀態(tài),屬于監(jiān)管漏洞。由于沒有可參考的針對(duì)游離DNA 保存管的評(píng)價(jià)方法,筆者在接收的檢驗(yàn)中,也是發(fā)現(xiàn)了企業(yè)在制定技術(shù)要求時(shí),有的故意回避該項(xiàng)檢驗(yàn),只作為常規(guī)采血管進(jìn)行。
本研究建立了一種基于茚三酮反應(yīng)的游離DNA 保存管中甘氨酸的定量檢測方法,優(yōu)化后線性范圍為0.63~10.00 mmoL/L,滿足設(shè)定相關(guān)系數(shù)0.99的要求,且在此范圍內(nèi),各濃度點(diǎn)回收率在85%~115%范圍內(nèi);經(jīng)驗(yàn)證確立該方法的檢測限為1.00 mmoL/L,與使用3SDB計(jì)算檢測限的方法一致。根據(jù)大量專利文獻(xiàn)及生產(chǎn)廠家的調(diào)研,保存液中甘氨酸添加劑濃度為200.00~600.00 mmol/L(15.00~50.00 mg/mL),參考其最佳作用濃度5.00 mmol/L(相當(dāng)于保存液中250.00 mmol/L),因而,可接受總體誤差目標(biāo)0.75 mmol/L 經(jīng)評(píng)估是合理的,而誤差間距-0.32~0.32 mmoL/L 恰好落在誤差目標(biāo)-0.75~0.75 mmoL/L 范圍內(nèi),因而LOQ 獲得驗(yàn)證,確定為2.00 mmoL/L,且能夠滿足該產(chǎn)品的檢測要求。
運(yùn)用低、中、高3 個(gè)濃度驗(yàn)證了方法分析內(nèi)的精密度,在常規(guī)應(yīng)用濃度范圍內(nèi),其標(biāo)準(zhǔn)偏差均不大于10%,檢測結(jié)果重復(fù)性較好。以甘氨酸國家標(biāo)準(zhǔn)品配制模擬樣品,以加標(biāo)回收的方法驗(yàn)證了方法的準(zhǔn)確度與特異性,回收率結(jié)果在85%~115%內(nèi),說明方法具有較好的準(zhǔn)確性;且基質(zhì)溶液的存在下,不受常見添加劑干擾測定,特異性較好。同時(shí),以所建立的方法初步用于游離DNA 保存管檢測,結(jié)果均符合產(chǎn)品技術(shù)要求規(guī)定。
本方法經(jīng)過了山東省醫(yī)療器械檢測中心、江蘇康為世紀(jì)生物科技股份有限公司、廣州陽普醫(yī)療科技股份有限公司等多家驗(yàn)證,其線性、準(zhǔn)確性、精密度、特異性均符合作為該特殊采血管評(píng)價(jià)的要求。在驗(yàn)證工作中,由于接觸到的是真實(shí)的產(chǎn)品,各家添加量的不同,也碰到由于稀釋倍數(shù)過低,在加熱過程出現(xiàn)沉淀析出的現(xiàn)象,影響結(jié)果的準(zhǔn)確性,因此,實(shí)際應(yīng)用時(shí)需要了解產(chǎn)品的添加劑濃度范圍,以設(shè)計(jì)更好的樣本處理方案。通過驗(yàn)證,考慮到實(shí)際的添加量范圍以及使用者設(shè)備的響應(yīng)范圍,最終將標(biāo)準(zhǔn)中的線性范圍修改為2.00~10.00 mmoL/L,大大提高了檢測的準(zhǔn)確性。同時(shí),基于該研究成果,筆者起草并申報(bào)了醫(yī)療器械行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)中“一次性使用人體靜脈血樣采集容器中添加劑量第5 部分-甘氨酸”。本標(biāo)準(zhǔn)的制定將統(tǒng)一檢測方法,規(guī)范行業(yè)要求,便于產(chǎn)品質(zhì)量控制,為采血管的市場監(jiān)管提供有效的技術(shù)支持。