焦鑫艷 ,張 英 ,盛 秋 ,張 妙 ,楊澤健 ,高小倩 ,趙 謙 ,王 博 ,劉培軍
(1. 西安交通大學(xué)第一附屬醫(yī)院轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)中心,陜西西安 710061;2. 陜西省腫瘤精準醫(yī)學(xué)重點實驗室,陜西西安 710061;3. 西安交通大學(xué)第一附屬醫(yī)院消化內(nèi)科,陜西西安 710061;4. 西北工業(yè)大學(xué)醫(yī)院,陜西西安 710072;5. 西安交通大學(xué)第一附屬醫(yī)院耳鼻喉頭頸外科,陜西西安 710061)
細胞內(nèi)的核輸入和核輸出是一個多種蛋白質(zhì)和復(fù)合物在核膜上高度協(xié)調(diào)工作的生物學(xué)過程,維持著細胞生長和死亡的平衡,對保證細胞正常的功能和新陳代謝十分必要。核輸入和核輸出的紊亂則引起如p27、p21、FOXO、p53 和 Rb 等腫瘤抑制因子的定位異常,導(dǎo)致腫瘤的發(fā)生發(fā)展[1]。其中,p27 的編碼基因為CDKN1B,其在細胞中廣泛表達,并高度保守,很少發(fā)生突變或者缺失。p27 蛋白作為周期蛋白依賴性激酶抑制劑家族的重要成員,可通過其保守的N 端結(jié)構(gòu)域結(jié)合并抑制細胞質(zhì)中的周期蛋白和CDK 復(fù)合體的激酶活性,負調(diào)控細胞G1期向S 期轉(zhuǎn)變,抑制細胞周期進程,在細胞增殖中具有重要作用[2]。文獻報道,細胞內(nèi)總p27 表達變化影響細胞增殖,而p27 的細胞核和細胞質(zhì)定位是影響細胞增殖的關(guān)鍵因素[3],胞核p27 蛋白的聚集表現(xiàn)出抗增殖活性[4]。在正常細胞中,p27 大部分位于細胞核;但在許多腫瘤細胞中,p27 定位紊亂,大部分定位于細胞質(zhì)。這可能是由于p27 在細胞核和細胞質(zhì)中具有不同作用,而在腫瘤的發(fā)生過程中,一般伴隨著p27 的核漿移位。因此,進一步了解p27 核漿定位的變化對深入研究腫瘤的惡性發(fā)展很有必要。
本研究擬從人MCF7 細胞的總RNA 中特異性擴增出野生型p27 蛋白(wild-type p27,p27WT)的CDs區(qū)序列,再通過重疊PCR 的方法擴增出核定位信號缺失型 p27 蛋白(lacking nuclear localization signal p27,p27△NLS)序列,將其分別連接至真核表達載體pCMV-Blank。經(jīng)Sanger 測序鑒定后,電穿孔法轉(zhuǎn)染 HEK293T 細胞,驗證 p27WT 和 p27△NLS 在細胞質(zhì)和細胞核中的過表達水平,為今后探討p27核漿定位機制以及腫瘤惡性生物學(xué)行為研究提供細胞基礎(chǔ)。
DMEM 培養(yǎng)基(美國 Corning 公司),胎牛血清(美國 Gibco 公司),RNA FAST200 試劑盒(上海Fastagen 公司),限制性內(nèi)切酶EcoR Ⅰ和BamH Ⅰ(英國 NEB 公司),反轉(zhuǎn)錄 cDNA 試劑盒、T4 DNA 連接酶(美國 Thermo 公司),PrimeSTAR 高保真 PCR酶(日本TaKaRa 公司),DNA 凝膠回收試劑盒、質(zhì)粒小量提取試劑盒和無內(nèi)毒素質(zhì)粒提取試劑盒(北京天根生化科技有限公司),PVDF 膜、免疫印跡發(fā)光液(美國Millipore 公司),兔抗人p27 抗體(美國Santa Cruz 公司),GAPDH 抗體、兔抗人Lamin B1 抗體(武漢三鷹生物技術(shù)有限公司),山羊抗兔二抗(北京博奧森生物技術(shù)有限公司),細胞核漿蛋白分離試劑盒(陜西先鋒生物科技有限公司)。相關(guān)PCR 引物由西安擎科生物公司合成。
真核表達載體pCMV-Blank(上海碧云天生物技術(shù)有限公司);宿主菌E.coliDH5α(北京天根生化科技有限公司);人胚腎細胞HEK293T 為本實驗室保存細胞,使用含50 mL/L 胎牛血清的高糖DMEM 培養(yǎng)基,并置于37 ℃、50 mL/L CO2條件下進行培養(yǎng)。
根據(jù) GenBank 中 人CDKN1B(NM_004064.5)基因的CDs 序列,以及在UniProt 數(shù)據(jù)庫(https://www.uniprot.org/uniprot/)查詢p27 蛋白的核定位信號序列區(qū)域。隨后,應(yīng)用軟件Oligo 7 設(shè)計針對p27全長編碼區(qū)的特異性PCR 引物,并在上游引物加入酶切位點BamHⅠ和保護堿基,p27WT-F:5′-CGCGGATCCATGTCAAACGTGCGAGTGTCT-3′,在下游引物加入酶切位點EcoR Ⅰ和保護堿基,p27WT-R:5′-CGGAATTCTTACGTTTGACGTCTTCTGAGGCC-3′;同時針對核定位信號缺失設(shè) 計 重 疊 PCR 引 物 ,上 游 引 物 p27 △ NLS-F:5′-GAGCAATGCGCAGGAATAAGGACAGAAGAAAATGTTTCAGACGGT-3′,下 游 引 物 p27 △NLS-R: 5′-ACCGTCTGAAACATTTTCTTCTGTCCTTATTCCTGCGCATTGCTC-3′。 收 集MCF7 細胞,依照RNA FAST200 試劑盒說明書,提取細胞總RNA;隨后依照反轉(zhuǎn)錄cDNA 試劑盒說明書,反轉(zhuǎn)錄成cDNA。以該cDNA 為模板,p27WT-F和 p27WT-R 為引物,經(jīng) PCR 獲取 p27WT 全長編碼區(qū)的序列,并對PCR 產(chǎn)物進行切膠純化回收。
再以該膠回收純化產(chǎn)物為模板,以p27WT-F 和p27△NLS-R 為引物,經(jīng) PCR 獲取 p27-FR1 序列;以p27△NLS-F 和 p27WT-R 為引物,經(jīng) PCR 獲取 p27-F1R 序列,分別進行切膠純化回收。
最后以p27WT-F 和p27WT-R 為引物,以p27-FR1 和 p27-F1R 序列為模板,進行重疊 PCR 擴增,獲取p27△NLS 片段的序列,并進行切膠純化回收。PCR 反 應(yīng) 體 系 :cDNA 模 板 1 μL,10 μmol/L 上 游和下游引物各 1 μL,5×PCR Buffer 10 μL,dNTP 4 μL,高 保 真 PCR 酶 1 μL,補 足 ddH2O 至 50 μL。PCR 反 應(yīng) 條 件 :98 ℃ 5 min;98 ℃ 15 s,60 ℃ 20 s,72 ℃ 40 s,39 個循環(huán)。該 PCR 產(chǎn)物通過 12 g/L 瓊脂糖凝膠電泳進行檢測。
將 p27WT 和 p27△NLS 的 PCR 產(chǎn)物分別進行切膠回收純化,隨后與真核表達載體pCMV-Blank分別進行BamHⅠ和EcoRⅠ的37 ℃雙酶切反應(yīng)2 h。將雙酶切產(chǎn)物分別進行瓊脂糖凝膠電泳和切膠回收純化,并檢測濃度。
依照基因片段與載體摩爾比3∶1 的比例,使用T4 DNA 連接酶分別將 p27WT 和 p27△NLS 與真核表達載體pCMV-Blank 于16 ℃進行連接過夜。再將其分別轉(zhuǎn)化E.coliDH5α 感受態(tài)細胞,均勻涂在含有卡那霉素的LB 平板上,37 ℃過夜培養(yǎng)。次日挑取數(shù)個單克隆菌落,接種在含有卡那霉素的LB 培養(yǎng)基中,置于37 ℃搖床,220 r/min 振蕩培養(yǎng)。培養(yǎng)至渾濁后,取 1 μL 菌液,用無菌水稀釋 100 倍,100 ℃煮沸10 min 后,取 1 μL 作為模板,進行菌液 PCR,鑒定p27WT 和p27△NLS 片段是否成功插入真核表達載體中。將菌液PCR 鑒定陽性的單克隆菌液提取質(zhì)粒后,進行雙酶切鑒定。最后將雙酶切鑒定陽性的克隆質(zhì)粒送西安擎科生物公司進行Sanger 測序鑒定。將序列比對正確的陽性克隆載體分別命名為pCMV-p27WT 和 pCMV-p27△NLS。
依照無內(nèi)毒素的質(zhì)粒中量提取試劑盒說明書,提取無內(nèi)毒素的質(zhì)粒pCMV-Blank、pCMV-p27WT 和pCMV-p27 △NLS。 收集處于對數(shù)生長期的HEK293T 細胞,依照轉(zhuǎn)染說明書,將適量質(zhì)粒和細胞混勻后,加入電極杯。設(shè)置程序:脈沖電壓120 V,脈沖時間10 ms,脈沖時間間隔10 ms。分別將pCMVBlank、pCMV-p27WT 和 pCMV-p27△NLS 質(zhì)粒轉(zhuǎn)染 HEK293T 細胞,并置于 37 ℃、50 mL/L CO2條件下進行培養(yǎng),24 h 后更換新鮮的培養(yǎng)基。
經(jīng)電穿孔法將無內(nèi)毒素質(zhì)粒pCMV-Bank、pCMV-p27WT 和 pCMV-p27△NLS 分 別 轉(zhuǎn) 染 HEK293T 細胞 。 48 h 后 ,經(jīng) PBS 清 洗 ,無 EDTA 的 胰 酶 消 化 ,PBS 清洗并收集細胞。依照細胞核質(zhì)蛋白分離試劑盒說明書,分別提取細胞質(zhì)和細胞核蛋白。經(jīng)Bradford法進行蛋白定量,按照每孔100 μg 的上樣量進行100 g/L 聚丙烯酰胺凝膠電泳,經(jīng)轉(zhuǎn)膜,50 g/L 脫脂奶 粉 封 閉 ,一 抗(p27,1∶500;LaminB1,1∶1 000;GAPDH,1∶10 000)孵育,TBST 洗膜,二抗(山羊抗兔,1∶5 000)孵育,TBST 洗膜等步驟后,進行化學(xué)發(fā)光,并使用成像系統(tǒng)進行拍照。
通過UniProt 數(shù)據(jù)庫的在線分析,可知人野生型p27 蛋白包括 N 端的 Cyclin 結(jié)合結(jié)構(gòu)域(28-51aa)和CDK 結(jié)合結(jié)構(gòu)域(51-91aa),以及 C 端的 NLS 結(jié)構(gòu)域(153-169aa)等,均較為保守(圖1)。Cyclin 結(jié)合結(jié)構(gòu)域與Cyclin 亞基結(jié)合,CDK 結(jié)合結(jié)構(gòu)域與CDK 亞基如CDK2 結(jié)合,均為調(diào)控細胞周期抑制的結(jié)構(gòu)域;NLS 結(jié)構(gòu)域則負責(zé)引導(dǎo)p27 蛋白入核。所構(gòu)建包含p27WT 全長片段和p27△NLS 片段的真核表達載體,后者不包含NLS 結(jié)構(gòu)域部分,可阻斷p27 蛋白入核,使p27 蛋白幾乎全部表達在細胞質(zhì)中。
圖1 人p27WT 全長編碼區(qū)和p27△NLS 編碼區(qū)的結(jié)構(gòu)域示意圖Fig.1 Schematic diagram of human p27WT and p27△NLS domains
瓊脂糖凝膠電泳結(jié)果顯示,p27WT 全長編碼區(qū)的PCR 產(chǎn)物為600 bp 左右基因條帶(圖2A),與預(yù)期的p27 全長編碼區(qū)序列594 bp 大小相一致;隨后以該PCR 純化產(chǎn)物為模板,獲取 489 bp 的 p27-FR1 序列(圖2B)和119 bp 的p27-F1R 序列(圖2C);最后進行重疊PCR擴增,獲取543 bp的p27△NLS序列(圖2D),與預(yù)期大小一致。
圖2 人p27WT 全長編碼區(qū)和p27△NLS 編碼區(qū)的PCR 產(chǎn)物電泳圖Fig.2 Electrophoretic diagram of PCR fragment of human p27WT and p27△NLS
菌液PCR 產(chǎn)物電泳結(jié)果顯示,p27WT 的7 號和p27△NLS 的3 號為陽性克隆,PCR 產(chǎn)物電泳分別為594 bp 和543 bp,與理論大小相同(圖3A)。載體雙酶切鑒定的電泳結(jié)果顯示,分別獲得4 300 bp 和594 bp、4 300 bp 和 543 bp 的 基 因 條 帶 ,其 中 4 300 bp 為 線 性載體pCMV-Bank 的產(chǎn)物大小,另一個分別為插入的p27WT 和 p27△NLS 序列產(chǎn)物大?。▓D 3B)。測序后,在NCBI 中序列比對結(jié)果顯示,載體pCMV-p27WT 中插入的人p27 全長編碼區(qū)序列完全正確;載體pCMV-p27△NLS 中插入的人p27 編碼區(qū)序列缺失核定位信號序列,故以上兩種質(zhì)粒均構(gòu)建成功。
圖3 重組質(zhì)粒pCMV-p27WT 和pCMV-p27△NLS 的菌液PCR 產(chǎn)物電泳結(jié)果和雙酶切鑒定結(jié)果Fig. 3 Identification of recombinant plasmids pCMV-p27WT and pCMV-p27△NLS with bacterial PCR and double restriction enzyme digestion
Western blotting 檢測結(jié)果顯示,pCMV-p27WT轉(zhuǎn)染組中p27 蛋白在細胞核中顯著表達,而pCMV-p27△NLS 轉(zhuǎn)染組的p27 蛋白在細胞核中僅有微弱表達(圖4)。這提示構(gòu)建的真核表達載體pCMV-p27WT和pCMV-p27△NLS可以在細胞中成功表達目的基因p27WT及缺失核定位信號的p27△NLS。
圖4 HEK293T 細胞轉(zhuǎn)染重組質(zhì)粒后細胞質(zhì)和細胞核p27 蛋白的表達情況Fig.4 Detection of cytoplasmic and nuclear p27 protein expression after transfection with recombinant plasmids in HEK293T cells
在哺乳動物中,p27 作為細胞周期負調(diào)節(jié)因子,參與增殖、分化、凋亡等決定細胞命運和組織生長的生物學(xué)過程。大量研究證實,許多腫瘤標志物基因可通過p27 蛋白調(diào)控腫瘤的發(fā)生發(fā)展[1,5-6]。在乳腺癌、大腸癌、卵巢癌和前列腺癌等腫瘤中,p27 蛋白表達較低,并且與患者較差的預(yù)后相關(guān)[2]。在腫瘤進程中,p27 主要通過磷酸化調(diào)控自身表達和胞質(zhì)定位。細胞核p27 蛋白表達降低可顯著促進細胞周期進程和細胞增殖[4,7-8]。臨床研究提示,p27 蛋白的細胞核表達是鼻咽癌患者有較好預(yù)后的有利因素[9]。核p27表達在腎細胞癌中經(jīng)常丟失,可作為不良預(yù)后的指示因子,有助于高危腎透明細胞癌患者的診斷[10]。因此,p27 蛋白的抑癌活性,很大部分依賴于細胞核的亞定位水平。
在很多類型的腫瘤中,不僅有細胞核p27 蛋白表達的降低或者丟失,同時也伴隨著細胞質(zhì)的移位。核輸出蛋白染色體區(qū)域維持蛋白CRM1 的下調(diào)通過改變p27 蛋白的亞細胞定位,促進p27 蛋白入核,減少細胞質(zhì)p27 蛋白表達,并且抑制p27 蛋白降解,減緩內(nèi)皮性卵巢癌發(fā)病進程[11]。臨床治療方面,p27 蛋白的細胞核/細胞質(zhì)比率對早期乳腺癌患者輔助綜合化療的效果具有重要的參考意義[12],細胞質(zhì)低p27 表達和細胞核高p27 表達共同預(yù)示著高級別的星形膠質(zhì)瘤患者中較好的預(yù)后情況[13]??梢姡毎撕图毎|(zhì)的p27 蛋白通過協(xié)同作用,共同影響著腫瘤的發(fā)展和預(yù)后。
然而,在部分腫瘤中,細胞核p27 在細胞中發(fā)揮抑癌作用,而細胞質(zhì)p27 在細胞中發(fā)揮促癌作用,p27的細胞質(zhì)定位能夠使該蛋白的抑癌功能失活。細胞質(zhì)p27 蛋白的減少顯著抑制腫瘤細胞運動、細胞存活和致癌進程[14-15]。細胞質(zhì)p27 蛋白與腫瘤患者較差的預(yù)后緊密相關(guān)[16-18]。而且,細胞質(zhì)p27 的表達能通過抑制細胞凋亡增強HER2 陽性乳腺癌細胞的拉帕替尼抗性[19]。總之,與p27 蛋白本身的抑癌作用相反,細胞質(zhì)p27 蛋白可能在細胞的存活、運動、侵襲和細胞間黏附等方面發(fā)揮著促癌作用。
綜上所述,本研究構(gòu)建了重組質(zhì)粒pCMV-p27WT 和 pCMV-p27 △ NLS,并 在 HEK293T 細 胞中成功表達。未來可通過改變工具細胞、正常細胞或是腫瘤細胞中p27 蛋白在細胞質(zhì)和細胞核的表達分布,探討不同病理條件下p27 蛋白功能,為腫瘤惡性機制的深入研究提供了重要的實驗基礎(chǔ)。