劉嘯宇,后夢情,程安琪,胡傳俊,姚 坤,吳 蕭
(宿州學院生物與食品工程學院,安徽宿州 234200)
農桿菌介導法是目前轉化雙子葉植物最為廣泛使用的方法之一,該方法簡單,轉化機制明確、周期短,同時因轉入基因的拷貝數(shù)少,因此大大地降低了因同源抑制而產生基因沉默的可能性[1]。同時,該技術具有轉育周期較短、遺傳性狀較為穩(wěn)定、變異幅度較小、對農藝和經濟性狀干擾較少等特點,已成為我國農作物進行外源基因導入時最常用的技術手段[2-3]。但同時也面臨一些重要的技術問題,如轉化效率低和轉化結果的未知性和不可控性等。為了進一步了解根癌農桿菌T-DNA 轉運的分子機制,探討是否可以通過提高T- 復合物招募蛋白VBP 在農桿菌細胞內的表達量來提高T-DNA 的轉化效率,這在植物轉基因方面的應用具有重要意義。
1.1.1 所用菌株
Agrobacterium tumefaciensC58,E.coliDH5α,實驗室保存,菌液與70%的甘油等體積保存在凍存管中,凍存于-75 ℃冰箱中。
1.1.2 所用質粒
Prset-a,具有T7 啟動子,實驗室保存;pegfp-n1,含有egfp基因的質粒,實驗室保存;prset-agfp1,Atu4856 基因上游495 bp 序列,帶上標記基因gfp,插入啟動子已除去的prset-a 質粒,構建。
1.1.3 所用引物
所使用的引物信息(劃線部分為酶切位點) 見表1。
表1 所使用的引物信息(劃線部分為酶切位點)
1.2.1 用聚合酶鏈式反應擴增帶有標記基因的Atu4856啟動子序列
(1) 擴增495 bp 的啟動子序列。以Pv1、Pv2 為引物,BamHⅠ酶切位點在引物Pv1 上,配制反應體系進行PCR 反應,結束后,進行瓊脂糖凝膠電泳,并回收產物[4-5]。
(2) 聚合酶鏈式反應擴增標記基因——gfp。以Pgfp2,Pg2 為引物,以質粒pegfp-n1 為模板,BamHⅠ酶切位點在引物Pg2 上,待反應結束后,回收PCR產物,步驟同1.2.1 步驟(1)。
(3) 擴增Atu4856 啟動子帶標記基因的全長序列。將1.2.1 中(1) (2) 步驟的產物混合,以Pv1 和Pg2 為引物,配置反應體系進行擴增[6-7],產物回收,步驟同1.2.1 步驟(1)。
重疊延伸PCR 的過程和體系見圖1,PCR 反應的體系見表2。
圖1 重疊延伸PCR 的過程和體系
表2 PCR 反應的體系/μL
1.2.2 提取大腸桿菌prset- a 質粒
構建啟動子探針載體的基本質粒prset-a 見圖2。
1.2.3 PCR 擴增得到不含T7 啟動子的prset- a 質粒
在T7 啟動子基因序列的兩端設計引物P1 和P2,均含有BamHⅠ限制性位點。同時,以prset-a質粒為擴增模板,從prset-a 質粒中去除T7 啟動子,反應體系如表2 所述。PCR 反應結束后,PCR 產物回收步驟同1.2.1 步驟(1)。
1.2.4 DNA 的酶切、連接、轉化及重組子的篩選
(1) 酶切以綠色熒光基因(gfp) 為報告基因的Atu4856 啟動子序列。用BamHⅠ酶切含gfp的Atu4856 啟動子序列。按照酶供應商提供的說明進行消化。按照表3 添加消化反應系統(tǒng)。消化反應體系置于37 ℃恒溫水浴中水浴加熱3 h。以非酶切序列為對照,用0.8%瓊脂糖凝膠電泳鑒定酶產物,用試劑盒回收產物,并將其保存在-20 ℃條件下備用[8]。
酶切體系見表3。
表3 酶切體系/μL
(2) 去磷酸化和空載體酶切。用BamHⅠ酶切無T7 啟動子prset-a 的PCR 產物。消化反應體系按表3混合,37 ℃下保溫3.5 h。電泳后回收1% (m/V)瓊脂糖凝膠,以防出現(xiàn)載體自連的現(xiàn)象[9],將按照表4 中體系進行載體去磷酸化。
載體去磷酸化體系見表4。
表4 載體去磷酸化體系/μL
(3) 連接。按照表5 所示的連接體系,將BamHⅠ酶切后的目的序列用T4 DNA Ligase 連接到BamHⅠ酶切后并去除磷酸化的載體上,于4 ℃下過夜連接,用于轉化。
連接體系見表5。
表5 連接體系/μL
(4) 轉化。將連接產物轉化大腸桿菌DH5α 感受態(tài)細胞。
(5) 重組子的篩選。挑取單菌落,用LB 培養(yǎng)基37 ℃下培養(yǎng),提取質粒,接著用BamHⅠ酶切、鑒定[10]。將與目的條帶大小相同的陽性克隆片段進行測序,命名含有Atu4856 啟動子的重組質粒,即prsetagfp1,并將此菌種進行保存。
(6) 檢測探針載體的轉錄活性。挑取單菌落,用LB 培養(yǎng)基培養(yǎng),在對數(shù)生長期時,對菌液進行離心、沉淀清洗,制片,在放大倍數(shù)為×400 的倒置熒光顯微鏡下觀察是否有熒光。
以pegfp-n1 質粒為模板,經PCR 特異性擴增獲得大小約750 bp 的綠色熒光蛋白基因(gfp) (圖2)。設計搭橋PCR 引物,通過重疊延伸PCR,將gfp基因連接到Atu4856 啟動子序列(圖3),形成大小約1 225 bp 的嵌合基因片段,作為其是否具有啟動子基因轉錄活性的報告基因。
PCR 擴增gfp基因電泳圖見圖2,PCR 擴增帶有gfp的Atu4856 啟動子電泳圖見圖3。
圖2 PCR 擴增gfp 基因電泳圖
圖3 PCR 擴增帶有gfp 的Atu4856 啟動子電泳圖
模板采用質粒prset-a,采用引物P1 和P2,通過PCR 擴增得到不含T7 啟動子的質粒prset-a,大小約2.7 kb(圖4),用于重組表達質粒的構建。
PCR 擴增去除T7 啟動子的prset-a 質粒電泳圖見圖4。
圖4 PCR 擴增去除T7 啟動子的prset-a 質粒電泳
將BamHⅠ酶切后帶有綠色熒光基因(gfp) 的Atu4856 啟動子連接在BamHⅠ酶切后的prset-a 載體上,該載體無T7 啟動子,接著轉化到DH5α 大腸桿菌,培養(yǎng)過夜。經過提質粒、酶切、瓊脂糖凝膠電泳等一系列過程,驗證與PCR 產物一致(圖5),同時將質粒測序,測序結果表明prset-a 質粒上成功插入了標記基因(gfp) 的Atu4856 啟動子序列,載體構建成功。
酶切鑒定prset-agfp1 重組質粒電泳圖見圖5。
圖5 酶切鑒定prset-agfp1 重組質粒電泳圖
取菌液制片,在倒置熒光顯微鏡下觀察。結果顯示,發(fā)射藍光時有熒光,而只帶prset-a 載體的大腸桿菌沒有熒光現(xiàn)象(圖6)。說明與gfp基因融合的載體已被成功構建,帶有熒光基因(gfp) 的Atu4856啟動子序列被證明具有轉錄活性。
未突變的含有495 bp Atu4856 上游序列重組質粒E.coli(prset-agfp1) 的熒光觀察結果見圖6。
圖6 未突變的含有495 bp Atu4856 上游序列重組質粒E.coli(prset-agfp1) 的熒光觀察結果
啟動子是構建基因表達載體的重要因素,對外源基因的表達水平具有著重要的影響。查閱大量文獻、進行理論分析和試驗工作,通過PCR 方法,獲得了編碼VBP3 蛋白Atu4856 基因的全長啟動子序列。將prset-a 載體的T7 啟動子與GFP 基因重組后,用Atu4856 啟動子序列取代,成功構建了能在大腸桿菌中表達的啟動子探針載體,并利用熒光蛋白研究農桿菌Atu4856 基因在大腸桿菌中的表達調控機制。