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基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析杞菊地黃丸治療高血壓的作用機制

2022-08-02 08:24陳晶晶馬曉昌
關(guān)鍵詞:內(nèi)皮細胞靶點通路

陳晶晶,馬曉昌

高血壓是指以體循環(huán)動脈壓升高為主要特征的最常見的慢性非傳染性疾病。根據(jù)《中國心血管病報告2018》[1],我國高血壓病的患病率持續(xù)上升,而治療率和控制率處于較低水平,成人高血壓粗患病率為27.9%[2],控制率僅為7.2%[3],是我國面臨的重要公共衛(wèi)生問題。中醫(yī)古籍雖無高血壓之名,但可將其歸屬于中醫(yī)“眩暈”“頭痛”等范疇,多因機體陰陽失衡、肝腎虧虛、陰虛陽亢而致,治療多以補益肝腎為法。杞菊地黃丸由枸杞子、菊花、山茱萸、山藥、熟地黃、牡丹皮、澤瀉、茯苓八味藥組成,具有補腎養(yǎng)肝、滋陰潛陽之功效。臨床研究表明,杞菊地黃丸治療高血壓的療效顯著,具有抗炎、抗氧化和改善血管舒縮功能的作用[4-5],但其藥效物質(zhì)基礎(chǔ)和具體作用機制尚不明確。因此,系統(tǒng)研究杞菊地黃丸治療高血壓的作用機制具有積極意義。

網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)是基于藥理學(xué)、生物信息學(xué)和系統(tǒng)生物學(xué)等相關(guān)學(xué)科,運用計算機虛擬計算技術(shù)而發(fā)展出的一門學(xué)科,可深入探索中藥及中藥復(fù)方多成分、多靶點、多通路的作用機制,尤其適用于研究中藥及其復(fù)方[6]。本研究通過網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)從分子水平闡明杞菊地黃丸的藥物活性成分、作用靶點以及與高血壓之間的相互作用關(guān)系,以期為其進一步的藥理作用和臨床應(yīng)用提供理論依據(jù)和研究方向。

1 資料與方法

1.1 藥物活性成分篩選 以“枸杞”“菊花”“地黃”“山藥”“山茱萸”“澤瀉”“茯苓”“牡丹皮”為主題詞,在中藥系統(tǒng)藥理學(xué)數(shù)據(jù)庫和分析平臺(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)中檢索藥物活性成分,以類藥性(drug likeness,DL)≥0.18和口服生物利用度(oral bioavailability,OB)≥30%為篩選條件,篩選出符合條件的活性成分進行分析。

1.2 靶點收集 將在TCMSP數(shù)據(jù)庫中檢索得到的藥物活性成分作用靶點導(dǎo)入UniProt數(shù)據(jù)庫,將所有人源靶點蛋白名稱校正為其官方名稱。在GeneCards數(shù)據(jù)庫中以“hypertension”為關(guān)鍵詞進行檢索,將檢索結(jié)果中相關(guān)度得分≥20分的靶點作為高血壓疾病靶點進行研究,同時摘錄疾病靶點的標準基因名稱。

1.3 構(gòu)建Venn圖 將杞菊地黃丸藥物活性成分的作用靶點與高血壓相關(guān)靶點分別導(dǎo)入Venny在線工具(https://bioinfogp.cnb.csic.es/tools//venny/),生成Venn 圖,獲得疾病與藥物共同作用靶點。

1.4 構(gòu)建蛋白-蛋白相互作用(PPI)網(wǎng)絡(luò) 將獲得的疾病與藥物共同作用靶點導(dǎo)入STRING 11.0,選擇研究物種為人類,置信度為0.400,獲取蛋白相互作用關(guān)系數(shù)據(jù),再將數(shù)據(jù)導(dǎo)入Cytoscape 3.8.0軟件,構(gòu)建PPI網(wǎng)絡(luò)。

1.5 構(gòu)建藥物活性成分-疾病靶點的可視化網(wǎng)絡(luò) 將獲得的疾病與藥物共同作用靶點導(dǎo)入Cytoscape 3.8.0軟件,構(gòu)建藥物活性成分-疾病靶點的可視化網(wǎng)絡(luò)。

1.6 基因本體(GO)和京都基因與基因組百科全書(KEGG)富集分析 利用David數(shù)據(jù)庫將藥物-疾病共同靶點進行GO、KEGG富集分析。

2 結(jié) 果

2.1 藥物活性成分篩選結(jié)果 本研究基于樣本量和數(shù)據(jù)復(fù)雜性考慮,將OB、DL參數(shù)作為化學(xué)成分藥物代謝性質(zhì)(ADME)篩選條件,篩選后得到139個藥物活性成分,包括45個枸杞活性成分、20個菊花活性成分、2個地黃活性成分、16個山藥活性成分、20個山茱萸活性成分、15個茯苓活性成分、10個澤瀉活性成分、11個牡丹皮活性成分。

2.2 靶點收集 在TCMSP數(shù)據(jù)庫中檢索得到1 456個杞菊地黃丸藥物活性成分的作用靶點,刪除重復(fù)項并通過UniProt 數(shù)據(jù)庫校正名稱后得到235個靶點。在GeneCards數(shù)據(jù)庫中檢索到7 814個疾病靶點,相關(guān)度得分≥20分的靶點有174個,其中相關(guān)度較高的靶點是骨形成蛋白Ⅱ型受體(bone morphogenetic protein receptor type 2,BMPR2)、血管緊張素轉(zhuǎn)換酶(angiotensin converting enzyme,ACE)、血管緊張素原(angiotensinogen,AGT),其中BMPR2相關(guān)度得分為124.2分,ACE 為86.26分,AGT 為63.82分。

2.3 藥物與疾病交集靶點的Venn圖 對杞菊地黃丸活性成分作用靶點及高血壓疾病靶點取交集,構(gòu)建Venn圖,共得到29個藥物與疾病交集靶點(見圖1),包括核受體亞家族3 c族成員2(NR3C2)、β2-腎上腺素能受體(ADRB2)、β1-腎上腺素受體(ADRB1)、溶質(zhì)轉(zhuǎn)運家族6成員4(SLC6A4)、過氧化物酶體增殖物激活受體G(PPARG)、誘導(dǎo)型一氧化氮合酶(NOS2)、核受體亞家族3C組成員1(NR3C1)、表皮生長因子受體(EGFR)、血管內(nèi)皮生長因子A(VEGFA)、原癌基因FOS(FOS)、基質(zhì)金屬蛋白酶2(MMP2)、基質(zhì)金屬蛋白酶9(MMP9)、白細胞介素 6(IL6)、血紅素加氧酶1(HMOX1)、小窩蛋白1(CAV1)、凝血因子Ⅲ(F3)、縫隙連接蛋白α1(GJA1)、CC型趨化因子配體2(CCL2)、E選擇素(SELE)、內(nèi)皮型一氧化氮合酶(NOS3)、組織型纖溶酶原激活物(PLAT)、血栓調(diào)節(jié)蛋白(THBD)、絲氨酸蛋白酶抑制蛋白E1(SERPINE1)、溶質(zhì)轉(zhuǎn)運家族2成員4(SLC2A4)、C反應(yīng)蛋白(CRP)、低密度脂蛋白受體(LDLR)、過氧化氫酶(CAT)、載脂蛋白B(APOB)、雷帕霉素靶蛋白(MTOR)。

圖1 疾病與藥物交集靶點Venn圖

2.4 PPI網(wǎng)絡(luò) 構(gòu)建PPI網(wǎng)絡(luò)(見圖2),該網(wǎng)絡(luò)包括29個節(jié)點、224條邊,節(jié)點表示蛋白,節(jié)點大小和顏色深淺代表節(jié)點連接度(Degree)的大小,節(jié)點越大、顏色越深則Degree值越大;邊表示蛋白之間的相互關(guān)系,邊的粗細代表combined score值的大小,邊越粗combined score值越大。由圖中可見連接度較高靶點蛋白是NOS3、IL6、CCL2、VEGFA、MMP9、SERPINE1、PPARG、MMP2、EGFR、CRP、FOS等。

圖2 PPI網(wǎng)絡(luò)圖

2.5 藥物活性成分-疾病靶點可視化網(wǎng)絡(luò) 將獲得的藥物與疾病交集靶點導(dǎo)入Cytoscape 3.8.0軟件構(gòu)建可視化網(wǎng)絡(luò)(見圖3),該網(wǎng)絡(luò)包括89個節(jié)點、158條邊,圖中長方形代表藥物活性成分(見表1),包括15個枸杞活性成分,11個菊花活性成分,7個山藥活性成分,4個山茱萸活性成分,3個茯苓活性成分,5個澤瀉活性成分,1個牡丹皮活性成分以及6個多種藥物共同的活性成分;中央橢圓形代表疾病靶點。藥物活性成分中節(jié)點連接度最高的是MOL000098槲皮素(quercetin),疾病靶點中節(jié)點連接度最高的是NR3C2。

圖3 藥物活性成分-疾病靶點可視化網(wǎng)絡(luò)

表1 杞菊地黃丸藥物活性成分

2.6 GO、KEGG富集分析 GO功能分析結(jié)果顯示,主要與蛋白異源二聚體活性、一氧化氮合酶結(jié)合、絲氨酸水解酶活性等有關(guān)。KEGG富集分析結(jié)果顯示,與高血壓有關(guān)的通路主要為流體剪切應(yīng)力和動脈粥樣硬化通路(fluid shear stress and atherosclerosis)、糖尿病并發(fā)癥的糖基化終末產(chǎn)物(AGE)及其受體(RAGE)信號通路(AGE-RAGE signaling pathway in diabetic complication)、缺氧誘導(dǎo)因子-1(hypoxia-induciblefactor-1,HIF-1)信號通路、松弛素信號通路(relaxin signaling pathway)、腫瘤壞死因子信號通路(TNF signaling pathway)、鈣離子信號通路(calcium signaling pathway)等。將分析結(jié)果以P值降序排列,取排名前20的條目構(gòu)建氣泡圖,圖中節(jié)點的大小表示富集基因數(shù)量多少,節(jié)點的顏色由紅色至綠色表示P值由大到小。詳見圖4、圖5。

圖4 GO富集分析

圖5 KEGG富集分析

3 討 論

滋腎養(yǎng)肝法是治療高血壓病的重要方法之一。杞菊地黃丸出自《醫(yī)級·卷八》,方中枸杞滋補肝腎;菊花清肝熱;熟地黃滋補腎陰;山藥補益脾腎;山萸肉滋補肝腎;澤瀉祛濕降濁;茯苓健脾祛濕;丹皮清熱涼血。諸藥合用,共奏滋腎養(yǎng)肝之功,可有效調(diào)節(jié)機體陰陽,控制血壓。本研究分析顯示,杞菊地黃丸治療高血壓的主要藥理成分包括槲皮素、木犀草素、山奈酚等。槲皮素是具有多種生物活性的黃酮類化合物,具有抗氧化、抗炎和心血管保護作用,能降低內(nèi)皮素-1(endothelin-1,ET-1)水平和自發(fā)性高血壓大鼠的血壓[7-8]。木犀草素能降低自發(fā)性高血壓大鼠血壓,使自發(fā)性高血壓大鼠心肌組織中血管緊張素Ⅱ(angiotensin Ⅱ,Ang Ⅱ)和ET-1表達降低,一氧化氮(nitric oxide,NO)表達升高[9]。

KEGG富集分析結(jié)果顯示,流體剪切應(yīng)力信號通路、AGE-RAGE信號通路、松弛素信號通路、鈣離子信號通路和HIF-1信號通路等與高血壓密切相關(guān)。高血壓的基本病理變化包括血管內(nèi)皮細胞損傷、平滑肌細胞增殖及血管重構(gòu)等[10]。血流剪切力是血液流經(jīng)血管壁面時產(chǎn)生的摩擦力,可通過激活機械感受器、特異性轉(zhuǎn)錄因子、細胞內(nèi)信號通路以及基因和蛋白的表達等途徑調(diào)節(jié)內(nèi)皮細胞功能[11]。高血壓病人血流動力學(xué)改變引起剪切力變化,促使血管內(nèi)皮細胞損傷,引起血管內(nèi)皮功能障礙,NO等血管舒張因子合成減少,ET-1等血管收縮因子合成增加,促進血管收縮,血壓升高。AGE及RAGE與腎素-血管緊張素-醛固酮系統(tǒng)(renin-angiotensin-aldosterone system,RAAS)、氧化應(yīng)激之間形成正反饋,參與高血壓的發(fā)生發(fā)展。AGE與內(nèi)皮細胞表面受體結(jié)合后,促使ET-1合成增加,ET-1是目前已知的收縮血管作用最強的物質(zhì),血管收縮致血壓升高[12]。HIF-1是機體在低氧狀態(tài)時產(chǎn)生的一種核轉(zhuǎn)錄因子,是由調(diào)節(jié)亞基α和構(gòu)造亞基β組成的異二聚體。HIF-1α信號通路的激活可通過影響RAAS系統(tǒng)和交感神經(jīng)系統(tǒng)活性調(diào)節(jié)血壓。長期慢性缺氧可增加活性氧(reactive oxygen species,ROS)的產(chǎn)生,同時清除NO,致血管舒張功能障礙,從而導(dǎo)致血壓升高。ROS可通過增加血管緊張素原的合成,激活腎素-血管緊張素系統(tǒng)(renin-angiotensin system,RAS)[13]。松弛素是一種雙鏈蛋白質(zhì),可抑制ET-1和AngⅡ等縮血管物質(zhì),同時能增加血管內(nèi)皮基質(zhì)金屬蛋白酶(matrix metalloprotein,MMP)活性,通過將內(nèi)皮細胞合成釋放的ET-1降解為內(nèi)皮素,激活內(nèi)皮素B型受體,促使內(nèi)皮釋放NO,產(chǎn)生血管擴張效應(yīng)[14]。鈣離子信號通路可通過調(diào)控血管平滑肌收縮、增殖等過程參與高血壓的病理過程[15]。血管收縮力與收縮蛋白對Ca2+的敏感性和胞漿中Ca2+濃度有關(guān),Ca2+可通過興奮-收縮耦聯(lián)調(diào)控血管平滑肌張力和小動脈阻力來調(diào)節(jié)血壓。PPI網(wǎng)絡(luò)中連接度較高的靶點蛋白是MMP9、MMP2、VEGFA、NOS3、IL6、CRP等。MMP是一組能降解細胞外基質(zhì)(extracellular matrix,ECM)的蛋白酶,可通過影響血管平滑肌細胞(vascular smooth muscle cells,VSMCs)的結(jié)構(gòu)和功能從而引起動脈重構(gòu),通過釋放VEGF參與血管生成。研究表明,原發(fā)性高血壓病人血清MMP9水平明顯高于血壓正常者,且MMP9水平與大動脈硬度呈正相關(guān)[16],與高血壓左心室肥厚呈正相關(guān),也與左心室舒張功能障礙密切相關(guān)[17]。VEGF是一種能促進血管通透性增加、血管內(nèi)皮細胞遷移和增殖的促血管內(nèi)皮細胞生長因子。在高血壓病人中VEGF水平明顯升高,在血壓未控制的病人中其升高水平更明顯,且VEGF水平和收縮壓水平成正比[18]。VEGF與其受體VEGFR-2結(jié)合后,通過磷脂酰肌醇3激酶(PI3K)/蛋白激酶B(Akt)途徑和絲裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)途徑[19]誘導(dǎo)生成內(nèi)皮型一氧化氮合酶(endothelial nitric oxide synthase,eNOS),NO表達上調(diào),血管擴張,從而調(diào)節(jié)血壓。

炎癥在高血壓的發(fā)生發(fā)展中有重要作用。本研究KEGG富集分析中腫瘤壞死因子信號通路和IL-17信號通路,PPI網(wǎng)絡(luò)中IL-6和CRP是與高血壓有關(guān)的重要炎性因子。長期血清炎性因子水平過高可誘導(dǎo)血管微環(huán)境穩(wěn)態(tài)失衡,直接損傷血管內(nèi)皮細胞,促使單核-巨噬細胞浸潤,黏附分子(cell adhesion molecules,CAM)等血管活性物質(zhì)的分泌明顯增加,促進內(nèi)皮細胞增殖、遷徙和分化,致使血管結(jié)構(gòu)和功能改變,同時NO等內(nèi)皮依賴性舒血管物質(zhì)生成和分泌減少,血管阻力增加,血壓升高[20]。Bautista等[21]研究表明,高血壓病人血清腫瘤壞死因子-α(TNF-α)和IL-6水平明顯高于血壓正常者,且TNF-α和IL-6是高血壓的獨立危險因素。TNF-α是由單核-巨噬細胞、內(nèi)皮細胞和平滑肌細胞等生成的一類多肽類炎性細胞因子,可直接或間接損傷血管內(nèi)皮細胞,減少NO的生成,促進平滑肌細胞增殖[22],導(dǎo)致高血壓發(fā)生。IL-6是由單核-巨噬細胞、血管內(nèi)皮細胞及成纖維細胞等分泌的炎性細胞因子,能調(diào)節(jié)CRP的表達,促進血管平滑肌細胞增殖,增加平滑肌細胞內(nèi)Ca2+濃度,促進血管收縮。IL-6基因低甲基化能增加原發(fā)性高血壓的患病風(fēng)險[23]。

本研究基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)對杞菊地黃丸治療高血壓進行化合物、靶點、GO及KEGG通路分析,建立了杞菊地黃丸藥物活性成分-疾病靶點網(wǎng)絡(luò)、PPI網(wǎng)絡(luò),從多個角度探索杞菊地黃丸治療高血壓的分子物質(zhì)基礎(chǔ)和作用機制,體現(xiàn)了中藥“多成分-多靶點-多途徑”的作用特點,以期為藥物的臨床使用和進一步研究提供理論基礎(chǔ)。

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