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BCHE基因復(fù)合雜合變異致丁酰膽堿酯酶缺乏癥臨床特征和遺傳分析

2022-08-26 23:27戴立英
檢驗醫(yī)學(xué) 2022年7期
關(guān)鍵詞:雜合位點變異

王 娟, 余 靜, 陳 珺, 鄭 洪, 戴立英

(安徽省兒童醫(yī)院新生兒科,安徽 合肥 230051)

丁酰膽堿酯酶(butyrylcholine eterase,BChE)和乙酰膽堿酯酶(acetylcholinesterase,AChE)是人類膽堿酯酶的2種類型,AChE主要分布于神經(jīng)組織,BChE主要由肝臟產(chǎn)生并分布于所有組織[1]。BChE的生理功能尚不明確,但對含酯藥物,包括某些短效神經(jīng)肌肉阻斷劑、普魯卡因、丁卡因及海洛因等分解代謝具有重要的藥理學(xué)意義[2-3]。丁酰膽堿酯酶缺乏癥(butyrylcholinesterase deficiency,BCHED)患者通常沒有生命危險,但由于其對肌肉松弛劑等藥物敏感性較高,可能會在應(yīng)用類似藥物后長期昏迷,甚至死亡[4]。BCHE基因變異導(dǎo)致的BCHED(OMIM#617936)可引起人體血清膽堿酯酶異常降低,多數(shù)情況下無臨床表現(xiàn),但近年來偶有報道BCHED患兒存在智力障礙[4-5]。本研究對2例由BCHE基因復(fù)合雜合變異導(dǎo)致的BCHED患兒進行報道,并分析其遺傳學(xué)特征。

1 材料和方法

1.1 研究對象

患兒1,女,漢族,出生26 d,系其母第2胎第2產(chǎn),孕周39+4周剖宮娩出,Apgar評分為9~10分,患兒于出生20 d起無明顯誘因出現(xiàn)“腹脹伴腹瀉”,就診于當(dāng)?shù)蒯t(yī)院,黃色水樣便,頻次7~8次/d,給予地衣芽孢桿菌活菌膠囊和醒脾養(yǎng)兒顆粒治療后,大便呈綠色伴奶瓣,頻次較前稍減,但仍未能控制,后因“新生兒腹瀉、新生兒肺炎”轉(zhuǎn)院至安徽省兒童醫(yī)院新生兒科。

患兒2,女,漢族,出生23 d,系其母第1胎第1產(chǎn),孕周38+2周順產(chǎn),Apgar評分為9~10分,患兒因皮膚黃染半月就診于安徽省兒童醫(yī)院新生兒科。

2例患兒父母及患兒1的哥哥(3歲)身體健康,否認(rèn)近親結(jié)婚及家族遺傳史。

1.2 方法

1.2.1 基因測序 患兒父母均簽署知情同意書,經(jīng)安徽省兒童醫(yī)院醫(yī)學(xué)倫理委員會批準(zhǔn),對患兒及父母行全外顯子家系檢測(trio-based wholeexome sequencing,trio-WES)。采集核心家系成員外周血各3 mL,乙二胺四乙酸抗凝。根據(jù)基因組提取試劑盒(北京康為世紀(jì)生物科技有限公司)說明書提取白細(xì)胞DNA,構(gòu)建文庫后用Illumina Miseq高通量測序儀(美國Illumina公司)對設(shè)計序列進行捕獲,設(shè)計序列可覆蓋基因全外顯子區(qū)域及部分內(nèi)含子區(qū),參考序列為美國國家生物技術(shù)信息中心數(shù)據(jù)庫人類基因組參考序列19版,利用GATK軟件(美國Broad研究院)分析得出單核苷酸變異及插入、缺失等變異,過濾無效變異后,對可靠變異譜進行危害性預(yù)測分析。參考Ensembl數(shù)據(jù)庫(http://grch37.ensembl.org)設(shè)計可疑變異引物,采用Sanger測序進行驗證,檢測儀器為ABI 3130XL分析儀(美國ThermoFisher Scientific公司)。

1.2.2 變異注釋與蛋白結(jié)構(gòu)模型預(yù)測分析 首先搜索公共數(shù)據(jù)庫(SNP數(shù)據(jù)庫、千人基因組數(shù)據(jù)庫、ExAC數(shù)據(jù)庫),統(tǒng)計變異位點在正常人群中的發(fā)生頻率。在ClinVar數(shù)據(jù)庫(http://www.ncbi.nlh.gov/clinvar/)和HGMD數(shù)據(jù)庫(http://www.hgmd.cf.ac.uk/ac/index.php)中檢索變異位點的報道情況。采用SIFT(http://provean.jcvi.org/index.php)、Polyphen-2(http://genetics.bwh.harvard.edu/pph2/)及Mutation Taster(https://www.mutationtaster.org/)在線平臺分析變異位點的生物危害性,最后根據(jù)美國醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)與基因組學(xué)學(xué)會(American College of Medical Genetics and Genomics,ACMG)指南[6]進行基因致病性分析。另外,本研究通過Uniprot數(shù)據(jù)庫下載多物種BCHE蛋白序列文件,采用Mega軟件(新西蘭Mega公司)對變異位點進行同源性保守分析,采用Deepview軟件(瑞士生物信息研究院)對錯義變異進行模型分析。

2 結(jié)果

2.1 患兒臨床資料

患兒1入院體格檢查:神志清、反應(yīng)可,全身皮膚無黃染?;純?入院體格檢查:面部及全身黃染,神志清、反應(yīng)一般,皮膚彈性可。實驗室檢查提示2例患兒均出現(xiàn)膽堿酯酶異常降低,總膽紅素(total bilirubin,TB)、直接膽紅素(direct bilirubin,DBil)、間接膽紅素(indirect bilirubin,IBil)升高。2例患兒丙氨酸氨基轉(zhuǎn)移酶(alanine aminotransferase,ALT)、天門冬氨酸氨基轉(zhuǎn)移酶(aspartate aminotransferase,AST)均正常,甲型肝炎病毒IgM抗體、丙型肝炎病毒抗體及乙型肝炎5項血清學(xué)指標(biāo)均為陰性,糞便鏡檢未見真菌菌絲、真菌孢子、寄生蟲卵,糞便輪狀病毒及腺病毒檢測均為陰性;入院前期未進行藥物干預(yù),且肝、膽、脾、胰超聲檢查未見明顯占位性病變。因此,臨床排除藥源性膽堿酯酶降低。2例患兒各項指標(biāo)檢測結(jié)果見表1。

表1 2例患兒實驗室檢測數(shù)據(jù)

2.2 BCHE基因檢測結(jié)果

2例患兒BCHE基因均發(fā)生復(fù)合雜合變異。患兒1為c.401_c.402insA/p.Asn134Lysfs*24和c.221delC/p.Pro74Hisfs*4,父親攜帶雜合變異c.401_c.402insA/p.Asn134Lysfs*24,母親攜帶雜合變異c.221delC/p.Pro74Hisfs*4?;純?為c.401_c.402insA/p.Asn134Lysfs*24與c.127G>A/p.Gly43Arg,父親攜帶雜合變異c.401_c.402insA/p.Asn134Lysfs*24,母親攜帶雜合變異c.127G>A/p.Gly43Arg。Sanger測序證實存在變異位點。見圖1。

圖1 BCHE基因檢測結(jié)果

2.3 變異位點分析

對照正常人群變異分布,患兒1攜帶的變異位點c.401_c.402insA在Genome AD數(shù)據(jù)庫中次要等位基因頻率為0.000 9,另一個變異位點c.221delC在SNP數(shù)據(jù)庫、千人基因組數(shù)據(jù)庫及ExAC數(shù)據(jù)庫中均未被收錄,ClinVar及HGMD數(shù)據(jù)庫也未見相關(guān)報道,屬BCHE基因新的變異?;純?攜帶錯義變異c.127G>A,該變異位點經(jīng)SIFT、Polyphen-2及MutationTaster在線分析,結(jié)果分別為0.009(有害的)、1.0(可能有害的)及1(致病的),預(yù)測該變異位點對蛋白功能可能存在危害性。依據(jù)ACMG指南,變異位點c.401_c.402insA/p.Asn134Lysfs*24為“致病性(PVS1+PS3)”、變異位點c.221delC/p.Pro74Hisfs*4為“可能致病性(PVS1+PM2)”,變異位點c.127G>A/p.Gly43Arg為“不確定性(PM1+PM2+PP3)”。

蛋白同源分析結(jié)果顯示,p.Gly43在不同物種間高度保守,且位于BCHE蛋白活性區(qū)域。當(dāng)發(fā)生p.Gly43Arg變異時,可導(dǎo)致其在空間結(jié)構(gòu)上與p.Thr54殘基發(fā)生碰撞,影響局部結(jié)構(gòu)穩(wěn)定性,進而可能產(chǎn)生危害性。見圖2。

圖2 變異蛋白空間結(jié)構(gòu)分析

3 討論

BChE是一種具有復(fù)雜分子結(jié)構(gòu)的代謝酶,可對部分肌肉松弛劑(如琥珀酰膽堿)或普魯卡因等進行高效水解[2,7]。缺乏BChE的患者因?qū)Σ糠炙幬锎x速度減緩,敏感性增強,較少出現(xiàn)疾病表型[5]。導(dǎo)致人體血清BChE降低的主要因素為肝臟疾病、腎臟疾病、營養(yǎng)不良、燒傷、體溫過低和懷孕,次要因素為包括毒品在內(nèi)的化學(xué)品及部分藥物,如單胺氧化酶抑制劑[8-10]。BCHED是由BCHE基因變異導(dǎo)致的,目前至少已報道了70種以上的BCHE基因變異,此類出現(xiàn)遺傳變異的患者通常無臨床表現(xiàn),但若在術(shù)前使用琥珀酰膽堿等藥物,則易導(dǎo)致神經(jīng)肌肉阻滯延長,進而引起呼吸暫停或昏迷[11]。本研究中的2例患兒均出現(xiàn)血清膽堿酯酶異常降低,其中患兒1首發(fā)癥狀為不明原因新生兒腹瀉,而患兒2表現(xiàn)為新生兒黃疸,經(jīng)實驗室檢測確認(rèn)無肝功能損傷,且無藥物中毒可能。BCHED患兒出現(xiàn)腹瀉表現(xiàn)的發(fā)病機制雖尚不明確,但已有的研究結(jié)果或能解釋其關(guān)聯(lián)性。與AChE在調(diào)節(jié)膽堿能信號方面的明確機制不同,BChE生理功能至今仍不清楚[10]。在正常生理環(huán)境下,BChE既可水解乙酰膽堿,也可水解丁酰膽堿,而乙酰膽堿水平降低可阻斷神經(jīng)傳導(dǎo);當(dāng)BChE嚴(yán)重缺乏時,乙酰膽堿水平會異常升高,并激活膽堿能受體,使得肌肉收縮、胃腸道功能紊亂、尿失禁、副交感神經(jīng)張力增大,進而導(dǎo)致腹瀉發(fā)生的風(fēng)險升高[2,12]。

BCHE基因位于3號染色體q26.1-q26.2區(qū)間,由4個外顯子組成,其編碼的BChE呈中心富集脯氨酸的四聚體結(jié)構(gòu),可分布于全身組織,尤其高表達于肝臟、肺、大腦及心臟等器官,其表達量高于AChE,因此肝臟等器官損傷會引起B(yǎng)ChE水平降低[13-15]。本研究2例患兒BCHE基因發(fā)生復(fù)合雜合變異,且均攜帶c.401_c.402insA雜合變異。有研究報道,1例具有輕度智力障礙的14歲中國男孩存在該變異位點,由于BChE與AChE共同調(diào)控神經(jīng)節(jié)、軸突、神經(jīng)末梢及椎體生長等生理過程,因此當(dāng)BChE水平嚴(yán)重缺乏時,可能會下調(diào)相關(guān)神經(jīng)系統(tǒng)功能,進而出現(xiàn)智力障礙的臨床表現(xiàn)[5]。BCHE基因變異導(dǎo)致BCHED的報道較少,因此需更多樣本以確定c.401_c.402insA雜合變異是否為我國人群的熱點變異。另外,患兒1攜帶的c.221delC雜合變異和患兒2攜帶的c.127G>A雜合變異在GlinVar等數(shù)據(jù)庫中尚未查到相關(guān)數(shù)據(jù),屬BCHE基因新變異,這也進一步拓展了BCHE基因變異譜-表型譜。

BCHED發(fā)病率在不同人群中有較大差別。BChE水平在正常水平10%以下的類型稱為沉默型BCHED,在歐美人群中極為罕見,BCHE基因純合變異發(fā)生率約為1/100 000[2];但在印度Vysya社區(qū)高頻發(fā)生,有研究隨機檢測了該地區(qū)221名居民,有9例為BCHE基因純合變異[15-16]。BCHED的另一種類型為K-型,BChE常低于正常水平的30%,該型在歐美人群及日本人群中最常見,約有1/70的患者BCHE蛋白第539號丙氨酸變異為蘇氨酸(p.Ala539Thr),而在K-型純合變異人群中至今尚未見肌肉松弛劑不良反應(yīng)的報道[17]。我國尚無BCHED相關(guān)大規(guī)模隊列研究,因此尚不清楚中國人群特異性變異類型及發(fā)病率。

綜上所述,本研究分析了2例因BCHE基因復(fù)合雜合變異導(dǎo)致的BCHED患兒臨床特征和遺傳信息,發(fā)現(xiàn)2個BCHE基因新變異(c.221delC與c.127G>A)。c.221delC為功能丟失型變異,可能會導(dǎo)致蛋白功能降低;變異位點c.127G>A位于N-聯(lián)糖基化區(qū)域,可能影響局部酶結(jié)合功能。BCHED通常無臨床表型,但應(yīng)用琥珀酰膽堿等肌肉松弛劑時會增加呼吸抑制及昏迷等風(fēng)險,應(yīng)避免對患兒使用這類藥物。本研究患兒1出現(xiàn)新生兒腹瀉癥狀是否與BCHE基因變異相關(guān),仍需更多病例報道來進行綜合分析,因此確定BCHE基因型與表型的關(guān)聯(lián)性非常重要。

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