司 璐,吳 彤,甄錦程,于洪佳,劉 瑤,楊 驍,徐利劍
(黑龍江大學(xué)現(xiàn)代農(nóng)業(yè)與生態(tài)環(huán)境學(xué)院,哈爾濱 150080)
真菌是世界上分布最廣泛的物種之一,也是生態(tài)環(huán)境中重要的分解者,森林凋落物中有大量真菌存在。真菌資源已經(jīng)被廣泛應(yīng)用于農(nóng)業(yè)、工業(yè)和醫(yī)藥等與人類生活息息相關(guān)的多個(gè)重要領(lǐng)域[1-3]。真菌物種多樣性豐富,能夠產(chǎn)生活性多樣、結(jié)構(gòu)新穎的次生代謝產(chǎn)物,是天然產(chǎn)物的重要來源[4]。目前已從真菌的代謝產(chǎn)物中提取出多種具有抗菌、抗病毒、抗氧化、抗腫瘤等功能的活性物質(zhì)[5-9]。
森林中大量的林下凋落物,需要微生物降解利用,凋落物真菌在其中發(fā)揮著重要的作用[10]。大興安嶺森林處于高緯度寒區(qū),是中國森林面積最大的森林之一,其中包含許多未被利用的真菌資源[11-15]。例如,劉博洋等[12]在大興安嶺森林凋落物中發(fā)現(xiàn)的未開發(fā)真菌中,2株表現(xiàn)出抗細(xì)菌活性,2株表現(xiàn)出抗氧化活性。張哲棟等[13]在18株未被開發(fā)真菌中,發(fā)現(xiàn)5株真菌對(duì)青枯勞爾氏菌有抗菌活性。邱天藝等[14]在21株未被開發(fā)真菌中,發(fā)現(xiàn)有17株真菌表現(xiàn)出了抗菌活性。孟建宇等[15]分離得到2株具有高纖維素酶活的常溫纖維素降解菌。近年來,在真菌中發(fā)現(xiàn)了許多新的生物堿類、聚酮類、萜類、苯丙素類、甾體類等次生代謝產(chǎn)物,在抗菌、抗蟲、抗氧化、抗癌等方面發(fā)揮著重要作用[16-19]。大興安嶺森林凋落物中真菌資源豐富,有望發(fā)現(xiàn)未被開發(fā)利用的真菌,為真菌次生代謝產(chǎn)物研究提供備選菌株。
本研究以大興安嶺凋落物為材料,從中分離出可培養(yǎng)真菌并對(duì)其進(jìn)行鑒定,對(duì)它們次生代謝物進(jìn)行抗菌、抗氧化活性測試,為進(jìn)一步開發(fā)利用大興安嶺真菌資源提供備選菌株。
1.1.1 樣品采集 凋落物樣品于2019年9月采自大興安嶺地區(qū)。該地區(qū)主要的植物為興安落葉松(Larix gmelinii),白樺(Betula platyphylla)與蒙古櫟(Quercus mongolica)等。凋落物樣品的采集以每層約10 cm的深度共采集三層。將采集好的樣品分別裝在滅菌的信封里,自然風(fēng)干保存。
1.1.2 供試培養(yǎng)基 馬鈴薯葡萄糖培養(yǎng)基(PDA)用于真菌純化及形態(tài)學(xué)觀察,每升配方如下:葡萄糖20 g、馬鈴薯200 g、瓊脂20 g。1/4馬鈴薯葡萄糖培養(yǎng)基(1/4 PDA)用于真菌分離:馬鈴薯50 g、葡萄糖5 g、瓊脂20 g。
以下培養(yǎng)基用于發(fā)酵。馬鈴薯葡萄糖液體培養(yǎng)基(PD):馬鈴薯200 g、葡萄糖20 g。馬鈴薯葡萄糖加煙酰胺培養(yǎng)基(PD+Nic):煙酰胺濃度為100 μg/mL的PD培養(yǎng)基。大米培養(yǎng)基(Rice):甘油2 g,酵母浸粉2 g,酒石酸鈉10 g,磷酸二氫鉀1 g,七水硫酸鎂1 g,七水硫酸亞鐵0.05 g溶解于1 L水中,獲得配方溶液;50 mL三角瓶中需稱取8.4 g大米和14 mL配方溶液。酵母提取物蔗糖培養(yǎng)基(YES):酵母浸粉20 g、蔗糖100 g、硫酸鎂1 g、加入適量蛭石。超級(jí)麥芽培養(yǎng)基(SM):麥芽浸粉50 g、酵母浸粉10 g、七水硫酸亞鐵20 mg、七水硫酸鋅7 mg。
細(xì)菌基礎(chǔ)培養(yǎng)基(LBA)用于抗細(xì)菌活性測定:胰蛋白胨10 g、酵母浸粉5 g、氯化鈉10 g、瓊脂20 g。PDA用于抗真菌活性測定。
1.1.3 供試微生物 丁香假單胞菌(Pseudomonas syringae),青枯勞爾氏菌(Ralstonia solanacearum),立枯絲核菌(Rhizoctonia solani)和大斑病凸臍蠕孢菌(Exserohilum turcicum)用于抗菌活性測試。
1.2.1 真菌的分離 采用顆粒涂布平板法[20]進(jìn)行真菌分離。首先將凋落物研磨至顆粒狀,然后將凋落物顆粒懸浮液涂布于1/4 PDA平板上,放置于恒溫培養(yǎng)箱中培養(yǎng),每12 h觀察一次,在體式顯微鏡下,挑出萌發(fā)的真菌至60 mm的PDA培養(yǎng)基上,進(jìn)行純化培養(yǎng)。
1.2.2 真菌的鑒定 利用CTAB法[21]提取分離得到的真菌總DNA,然后用引物ITS1和ITS4[22]擴(kuò)增其內(nèi)部轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)(Internal Transcribed Spacer,ITS),其中PCR擴(kuò)增的體系和條件參見Liang等[20]的方法。PCR產(chǎn)物經(jīng)測序后,得到的序列與NCBI網(wǎng)站(https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/)提供的BLAST(Basic Local Alignment Search Tool)進(jìn)行序列分析,初步確定該凋落物真菌的分類學(xué)地位。對(duì)活性較好的菌株與其相關(guān)的序列進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)生學(xué)分析,利用MEGA 7測試出其最優(yōu)模型后,利用最大似然法(Maximum Likelihood,ML)構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。形態(tài)學(xué)觀察方面,觀察在不同培養(yǎng)基上的菌落特征,例如菌落顏色、質(zhì)地和分泌物等特征;觀察產(chǎn)孢結(jié)構(gòu)和孢子的形狀、大小等特征。
1.2.3 菌株的發(fā)酵及其粗提物的制備 將菌塊接種于PD培養(yǎng)基中,在180 r/min,25℃條件下振蕩培養(yǎng)3~4天,然后吸取200μL上述菌液,分別接種到20 mL體系的PD、PD+Nic、YES、SM、Rice以及PDA中進(jìn)行發(fā)酵。固體發(fā)酵21天,液體發(fā)酵在180 r/min,25℃條件下培養(yǎng)14天。將發(fā)酵完成后的培養(yǎng)基中放入等量的乙酸乙酯,靜置24 h,獲得有機(jī)相,將其進(jìn)行濃縮后稱重,加入1 mL的10%的二甲基亞砜(Dimethyl sulfoxide,DMSO),配置成真菌提取液。
1.2.4 抗菌活性測定 采用打孔藥劑擴(kuò)散法[23]進(jìn)行抗菌活性的篩選??辜?xì)菌:取10 mL測試細(xì)菌液加入到溫度在50℃的LBA中倒平板,用無菌打孔器均勻的打7個(gè)孔??字屑尤?0 μL真菌提取液或100 mg/L金霉素(陽性對(duì)照),培養(yǎng)24 h后測量抑菌圈??拐婢簩⒔z狀真菌接種至PDA的正中央,在其周圍均勻地打7個(gè)孔,孔中加入10 μL真菌提取液或100 mg/L兩性霉素b(陽性對(duì)照),將其放入培養(yǎng)箱中培養(yǎng)3~5天后,測量抑菌圈。
1.2.5 抗氧化活性測定 采用TLC-DPPH法[24]進(jìn)行抗氧化活性的篩選。稱取0.2 g的1,1-二苯基-2-三硝基苯肼(DPPH),溶解在100 mL的甲醇中。將粗提物配制成5 mg/mL的甲醇溶液。用毛細(xì)管吸取等量的樣品,點(diǎn)樣后噴灑DPPH溶液,觀察褪色圈。將活性較好菌株的粗提物進(jìn)行進(jìn)一步分析。用毛細(xì)管取等量的樣品點(diǎn)樣于層析板下部,利用甲醇二氯甲烷1:10的展開劑展開,然后噴灑DPPH溶液,計(jì)算活性組分的遷移率(Rf)值。
從大興安嶺凋落物中共分離得到65株真菌,通過ITS序列與已鑒定的真菌進(jìn)行比對(duì)分析的結(jié)果詳見表1。這65株真菌隸屬于2個(gè)門,6個(gè)綱,28個(gè)科,47個(gè)屬54個(gè)分類單元,去除重復(fù)分離得到的菌種,其中有16株真菌ITS的相似性≤98%。
表1 疑似新種的ITS序列相似性分析
對(duì)這16株相似性≤98%的菌株的乙酸乙酯粗提物進(jìn)行抗菌活性測定。其中有8株真菌的粗提物具有抗細(xì)菌的活性見表2,其中SL723和SL098的對(duì)青桔勞爾氏菌的活性較好,只有SL098有抗丁香假單胞菌的活性。
表2 真菌提取物的抗細(xì)菌活性
有10株真菌的粗提物有抗病原真菌的活性,測定結(jié)果詳見表3。其中有7株菌有抗立枯絲核菌的活性,有6株菌的粗提物有抗大斑病凸臍蠕孢菌的活性。其中SL098、SL503、SL710和SL723這4株菌的粗提物對(duì)這2種病原真菌都有活性。
表3 真菌提取物的抗真菌活性
通過TLC-DPPH法進(jìn)行了抗氧化活性測定(圖1a)。其中具有抗氧化活性的菌株共有6株,SL098、SL503和SL723的抗氧化活性較強(qiáng),詳細(xì)結(jié)果詳見表4。
表4 真菌提取物的抗氧化活性
將SL098的YES和大米培養(yǎng)基粗提物(圖1b),SL503的PD和PDA粗提物(圖1c),SL723的PD和大米培養(yǎng)基粗提物(圖1d)進(jìn)行了TLC分析。SL098的YES和大米培養(yǎng)基粗提物中有兩條明亮的帶,Rf值分別為0.73與0.80。SL503的PD和PDA粗提物有兩條明亮的帶,Rf值分別為0.71與0.78。SL723的PD和Rice粗提物有一條帶,Rf值為0.84。對(duì)于這3株菌來說,相同菌株不同培養(yǎng)基的抗氧化化合物的數(shù)量與種類基本一致,但不同菌株可以產(chǎn)生不同的抗氧化化合物。
菌株SL098在PDA上培養(yǎng)14天后的生長直徑為46 mm(圖2a);菌落正面中間淺棕色,邊緣灰綠色,菌落背面中間紅棕色,邊緣灰綠色;氣生菌絲短絨毛狀,菌落的表面有橙色分泌物。菌株SL503在PDA上培養(yǎng)14天后的生長直徑為13 mm(圖2b);菌落的正面為白色,背面為乳白色;氣生菌絲不發(fā)達(dá),絨毛狀,表面濕潤。菌株SL723在PDA上培養(yǎng)14天后的生長直徑為14 mm(圖2c);菌落正面白色,有放射狀溝紋,邊緣紅棕色、嚙蝕狀,背面紅棕色;氣生菌絲短絨毛狀。將這3株菌與其相關(guān)菌屬進(jìn)行ITS序列的系統(tǒng)發(fā)育分析(圖3),SL098、SL503和 SL723這 3株菌分別與Phaeosphaeria、Cephalosporium和Ophiobolus這3個(gè)屬最為相近,見圖3。
圖2 3株菌的菌落圖片(a為SL098,b為SL503,c為SL723)
圖3 3株菌的系統(tǒng)發(fā)育分析
本研究從大興安嶺森林凋落物中分離得到65株真菌,共有47個(gè)屬54個(gè)分類單元,其中有16株真菌的相似性≤98%,其中8株真菌有抗細(xì)菌活性,10株真菌有抗真菌活性,6株真菌同時(shí)具有抗細(xì)菌、抗真菌的活性。有6株真菌的粗提物有抗氧化活性。其中SL098、SL503、SL723這3株菌的粗提物對(duì)抗真菌、抗細(xì)菌和抗氧化方面都表現(xiàn)出來良好的活性。李澤宇[25]等曾在凍土中發(fā)現(xiàn)2株凋落物真菌同時(shí)具有抗真菌、細(xì)菌與抗氧化活性,本研究發(fā)現(xiàn)的這3株菌與其分類學(xué)地位不同。劉博洋等[12]在凋落物中分離得到2株抗菌活性較好的菌株,最相近菌屬為Pyrenochaetopsis microspora和Helicoma monilipes和這3株菌隸屬于不同的科,有明顯的差異。分離2株抗氧化活性較好的菌株為LB0012和LB0022,分別隸屬于Helotiaceae和Phaeosphaeriaceae這2個(gè)科,其中LB0022和SL098、SL723為同一個(gè)科的不同屬。
SL098最相近菌為Phaeosphaeria屬真菌,該屬的P.nodorum、P.spartinae、P.rousseliana和P.avenaria等菌曾被報(bào)道過具有抗稻瘟病(Pyricularia oryzae),水稻紋枯病,小麥銹病(Puccinia recondita),黃瓜灰霉病(Botrytis cinerea)和馬鈴薯晚疫病(Phytophthora infestans)的活性,對(duì)金黃色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)等陽性細(xì)菌有較好的活性,分離過聚酮類、異香豆素、苝醌類、萜類等10多種抗菌活性的化合物[26];本研究首次發(fā)現(xiàn)該屬真菌還具有抗大斑病凸臍蠕孢菌及抗革蘭氏陰性菌(丁香假單胞與青枯勞爾氏菌)的活性。SL503最相近菌為頭孢菌(Cephalosporium)屬真菌,該屬真菌曾被報(bào)道過具有抗氧化活性及抗菌活性,可以產(chǎn)生頭孢菌素等抗菌化合物[27-29],不排除SL503也可以產(chǎn)生同類抗菌化合物,但SL503與其最相近菌株的ITS相似性為92.03%,可能為新物種。SL723最相近菌屬為Ophiobolus屬,該屬的O.vermisporis曾被報(bào)道過對(duì)擬桿菌屬(Bacteroides)細(xì)菌有較好的活性,該屬的其他菌也曾報(bào)道過對(duì)胡麻葉斑病(Cochliobolus miyabeanus)的抗菌活性,分離得到過Vermisporin和Ophiobolide等抗菌化合物[30-31],未曾報(bào)道過抗氧化活性。
綜上所述,大興安嶺凋落物真菌中還存在著多種抗菌與抗氧化資源,本研究發(fā)現(xiàn)了3株凋落物真菌同時(shí)具有抗菌及抗氧化活性,為凋落物真菌資源的進(jìn)一步開發(fā)利用提供了參考與備選菌株。