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仿生樹(shù)葉模型的制作及在瓊脂糖微流控芯片中的應(yīng)用

2022-11-15 09:34王方圓張奮嫻李毅高建華牛顏冰申少斐
關(guān)鍵詞:微流瓊脂糖菌液

王方圓,張奮嫻,李毅,高建華,牛顏冰,申少斐

(山西農(nóng)業(yè)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,中獸醫(yī)藥現(xiàn)代化山西省重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,太谷 030801)

近年來(lái),微流控芯片技術(shù)越來(lái)越成熟[1~5],由于其具有分析速度快、成本低和通量高等特點(diǎn),已成為前沿技術(shù)之一,被廣泛應(yīng)用于各領(lǐng)域.微流控芯片更易模擬體內(nèi)的生理環(huán)境[6~9],在自然環(huán)境中,樹(shù)葉的脈序在尺寸[10,11]、形態(tài)[12~14]和功能[15~17]等方面與人體內(nèi)的血管組織類似,用樹(shù)葉脈序制得的微流控芯片對(duì)研究細(xì)胞或細(xì)菌行為具有重要意義[18].

使用自然環(huán)境中的樹(shù)葉會(huì)受到季節(jié)的限制,若在樹(shù)葉掉落之前沒(méi)有完成實(shí)驗(yàn),則實(shí)驗(yàn)的后續(xù)操作會(huì)受到阻礙.且每片樹(shù)葉脈序的形狀都不一致,制作出來(lái)的微流控芯片通道也會(huì)因樹(shù)葉的不同而改變.因此,制備出仿生樹(shù)葉模型具有重要意義,不僅可以解決上述問(wèn)題,節(jié)約實(shí)驗(yàn)時(shí)間,還為實(shí)驗(yàn)的順利進(jìn)行提供了保障.目前,已有將微流控芯片仿生樹(shù)葉模型用于生物分析方面的研究報(bào)道[12~16].Wu等[12,13]采用聚二甲基硅氧烷(PDMS)構(gòu)建了樹(shù)葉型微流控通道,對(duì)其生物相容性進(jìn)行了研究;Mao等[14,15]利用光刻模具制作出PDMS芯片模擬了血管系統(tǒng).然而,目前仿生樹(shù)葉模型大多集中在PDMS芯片研究,利用仿生模型構(gòu)建簡(jiǎn)單、經(jīng)濟(jì)、易操作的瓊脂糖微流控芯片鮮見(jiàn)報(bào)道.

本文利用仿生樹(shù)葉模板制作的瓊脂糖微流控芯片對(duì)大腸桿菌的趨化性進(jìn)行了研究.建立一級(jí)、二級(jí)、三級(jí)脈序,最大脈序尺寸值可達(dá)1038.02 μm,最小脈序尺寸為36.32 μm,寬度不一的通道構(gòu)建為細(xì)菌趨化性實(shí)驗(yàn)提供了穩(wěn)定可靠的梯度空間.此外,構(gòu)建瓊脂糖微流控芯片具有巨大優(yōu)勢(shì).由于瓊脂糖通道具有毛細(xì)力,瓊脂糖具有親水性,不需要借助外力就可以讓細(xì)菌順利地進(jìn)入瓊脂糖微流控芯片,實(shí)現(xiàn)對(duì)細(xì)菌趨化性的定性檢測(cè),與傳統(tǒng)檢測(cè)方法相比,可以更好地對(duì)細(xì)菌生存的微環(huán)境進(jìn)行控制.瓊脂糖微流控芯片相較于PDMS微流控芯片顯著降低了微流控芯片的制作成本,提高了效率,可以在不傷害動(dòng)物體、對(duì)環(huán)境無(wú)害的前提下,快速準(zhǔn)確地進(jìn)行藥物機(jī)理、藥物作用途徑等方面的研究.

1 實(shí)驗(yàn)部分

1.1 試劑與儀器

新鮮桑樹(shù)葉;75%(體積分?jǐn)?shù))乙醇溶液,河北康濟(jì)藥械有限公司;RTV615型聚二甲基硅氧烷(PDMS,A膠)和RTV615型PDMS固化劑(B膠),美國(guó)Momentive公司;三氯(1H,1H,2H,2H-全氟辛基)硅烷,西格瑪奧德里奇上海貿(mào)易有限公司;瓊脂,B.R.級(jí),北京索萊寶生物科技有限公司;胰蛋白胨和酵母提取物,B.R.級(jí),北京奧博星生物技術(shù)有限責(zé)任公司.

2X2-2 型真空泵和DHG型電熱恒溫鼓風(fēng)干燥箱(上海精宏試驗(yàn)設(shè)備有限公司);SW-CJ-2F型雙人雙面凈化工作臺(tái)(蘇州凈化設(shè)備有限公司);JA2003型電子天平(上海舜宇恒平科學(xué)儀器有限公司);KW-4型勻膠機(jī)(中國(guó)科學(xué)院微電子中心研究部).

1.2 實(shí)驗(yàn)過(guò)程

1.2.1 仿生樹(shù)葉模型陰膜的制作將采摘的新鮮樹(shù)葉置于75%乙醇溶液中煮沸進(jìn)行消毒處理,取出后用濾紙擦干;按m(A膠)∶m(B膠)=10∶1的比例混合制得PDMS聚合物;將樹(shù)葉背面作為陽(yáng)模,首先將雙面膠粘在玻璃板上,然后將樹(shù)葉正面貼在雙面膠帶上,在陽(yáng)模表面覆蓋一層PDMS聚合物[12,13,16],置于真空干燥箱中抽真空完全除氣泡20 min,排出氣泡,確?;旌先芤涸诿荛]環(huán)境下聚合形成水凝膠,之后于恒溫恒濕條件干燥,于80℃固化45 min,最后將已經(jīng)固化的仿生樹(shù)葉模型陰模從樹(shù)葉表面撕掉,得到仿生樹(shù)葉模型陰模結(jié)構(gòu).

1.2.2 仿生樹(shù)葉模型的制作將1.2.1節(jié)制作的仿生樹(shù)葉模型陰模用雙面膠貼在培養(yǎng)皿的內(nèi)部上方,并在陰模的正下方用培養(yǎng)皿承載5滴修飾液體[三氯(1H,1H,2H,2H-全氟辛基)硅烷],密封培養(yǎng)皿,以上操作均在通風(fēng)櫥內(nèi)完成,并在通風(fēng)櫥內(nèi)靜置5 h,待修飾液完全自然蒸發(fā),從而在仿生樹(shù)葉模型陰模的表面形成一層隔離層;打開(kāi)培養(yǎng)皿,取下陰模,再次倒入PDMS聚合物,抽真空完全除氣泡20 min后,放入80℃的恒溫箱內(nèi)12 h.修飾物的存在使得前后兩次加入的PDMS相互隔離,有一道明顯的隔離層,揭下即得到仿生樹(shù)葉模型結(jié)構(gòu)(圖1).

1.2.3 PDMS芯片的制作將按m(A膠)∶m(B膠)=20∶1比例混合的PDMS聚合物倒在玻璃板上,置于勻膠機(jī)中覆蓋均勻,放入80℃烘箱3~5 min后取出,與仿生樹(shù)葉模型陰模結(jié)構(gòu)結(jié)合,使仿生樹(shù)葉模型陰模與玻璃板緊緊鍵合,即得到PDMS芯片.

1.2.4 瓊脂糖芯片的制作圖2為微流體芯片設(shè)計(jì)圖,芯片主要由加工有微流體通道的瓊脂糖薄層和玻璃基底組成.將融化的瓊脂糖倒在PDMS仿生樹(shù)葉模型陽(yáng)模上,待冷卻凝固后,在揭起瓊脂糖芯片前將通道開(kāi)口陣列切開(kāi)[19];將清洗干凈的瓊脂糖芯片和玻璃基底緊密貼合.

Fig.1 Production process of bionic leaf modela.Natural leaves are pasted on double-sided tape;b.PDMS prepolymer is poured into the glass plate;c.PDMS replica is stripped after curing;d.PDMS is decorated;e.PDMS prepolymer is poured into the culture plate;f.PDMS replica is stripped after curing.

Fig.2 Production process of agarose chipa.Agar is poured;b.PDMS replica stripped after curing;c.the channel opening array is cut;d.agar replicates are bonded to the substrate.

1.2.5 菌液樣品的制備在超凈工作臺(tái)中吸取少量菌液加入含液體LB培養(yǎng)基(含氨芐)的EP管中,混合均勻后,再抽取少量菌液均勻地涂布于固體LB培養(yǎng)基(含氨芐)平板上.然后,將接種后的培養(yǎng)基置于37℃恒溫培養(yǎng)箱中過(guò)夜培養(yǎng),在超凈工作臺(tái)中挑選單菌落,將單菌落放入含LB培養(yǎng)基(含氨芐)的EP管中.將挑完單克隆的菌液放入37℃培養(yǎng)箱中振蕩培養(yǎng)3~4 h后,取出放入4℃冰箱中貯存待用.實(shí)驗(yàn)前,在超凈工作臺(tái)中取儲(chǔ)存在EP管中的菌液到含氨芐的LB培養(yǎng)基中,再振蕩培養(yǎng)20 h待用.GFP轉(zhuǎn)導(dǎo)的大腸桿菌(E.coli)由山西農(nóng)業(yè)大學(xué)生命學(xué)院高建華副教授提供.

1.2.6 大腸桿菌趨化性觀察用瓊脂糖微流控芯片培養(yǎng)并觀察大腸桿菌的運(yùn)動(dòng)狀況.將細(xì)菌懸液樣品加樣于瓊脂糖微流控芯片的入口處.由于毛細(xì)現(xiàn)象[19],細(xì)菌懸液樣品會(huì)被動(dòng)地流入微通道內(nèi).為對(duì)大腸桿菌的趨化性進(jìn)行觀察,可在適當(dāng)時(shí)間點(diǎn)在入口處分別滴加PBS緩沖液和含氨芐的LB培養(yǎng)基.

2 結(jié)果與討論

2.1 芯片材質(zhì)的選擇

制作了PDMS微流控芯片和瓊脂糖微流控芯片.通過(guò)對(duì)比2種材質(zhì)芯片的效果,后續(xù)實(shí)驗(yàn)采用瓊脂糖微流控芯片.原因如下:(1)由于用PDMS制作的仿生樹(shù)葉模型尺寸較大,陰模結(jié)構(gòu)靠近中心位置和其它邊緣位置的承重力存在差異,導(dǎo)致陰模結(jié)構(gòu)與玻璃基底上的PDMS聚合物鍵合在一起時(shí),容易出現(xiàn)貼合不均勻的現(xiàn)象,進(jìn)而在自身重力作用下出現(xiàn)管道塌陷,如圖3所示;而瓊脂糖芯片只與玻璃基底結(jié)合,無(wú)其它物質(zhì)堵塞通道結(jié)構(gòu),且通過(guò)后續(xù)用染料和熒光顯微鏡下的觀察驗(yàn)證了各通道結(jié)構(gòu)均正常存在.(2)PDMS的成本遠(yuǎn)高于瓊脂.(3)PDMS微流控芯片的制作時(shí)間要比瓊脂糖微流控芯片長(zhǎng)很多.瓊脂糖微流控芯片可以實(shí)現(xiàn)對(duì)細(xì)菌趨化性的定性檢測(cè),與傳統(tǒng)檢測(cè)方法相比,可以更好地對(duì)細(xì)菌生存的微環(huán)境進(jìn)行控制[20].綜上所述,最終實(shí)驗(yàn)采用瓊脂糖微流控芯片.

Fig.3 PDMS microfluidic chip

2.2 瓊脂糖微流控芯片通道結(jié)構(gòu)的驗(yàn)證

瓊脂糖是親水性物質(zhì),所以樣品中的水分可以透過(guò)瓊脂糖層,利用這一性質(zhì)可以驗(yàn)證用仿生樹(shù)葉模型制作出來(lái)的瓊脂糖微流控芯片各結(jié)構(gòu)通道是否正常存在.將用乙醇制備的藍(lán)色染料滴加在瓊脂糖微流控芯片的入口處,幾秒鐘之內(nèi)藍(lán)色染料分布于整個(gè)結(jié)構(gòu)中,顯現(xiàn)出一個(gè)完整樹(shù)葉形狀,如圖4所示,表明制得的瓊脂糖微流控芯片各結(jié)構(gòu)通道都正常存在.

Fig.4 Dyed agarose microfluidic chip

Fig.5 Schematic diagram of mulberry leaves and their pulse sequence

植物葉脈指的是葉片表面可見(jiàn)的紋絡(luò),主要由貫穿在葉片內(nèi)部的維管組織及其周?chē)谋”诮M織、厚壁組織和厚角組織等組成,葉脈通過(guò)葉柄與莖內(nèi)的維管組織相連,起輸導(dǎo)和支持作用[21].葉脈在葉片上呈現(xiàn)出各種有規(guī)律的脈紋分布,稱為脈序.脈序可分為3類:平行脈、網(wǎng)狀脈和叉狀脈.本文中后續(xù)實(shí)驗(yàn)主要采用桑葉,但對(duì)叉狀脈的銀杏葉,平行脈的車(chē)前子葉、玉蘭葉,網(wǎng)狀脈的桑樹(shù)葉,毛泡桐葉都進(jìn)行了制作,均可做出仿生樹(shù)葉模板.本實(shí)驗(yàn)用到所有葉片主要為網(wǎng)狀脈,網(wǎng)狀脈序作為水分的運(yùn)輸通道,能夠?yàn)槿~肉細(xì)胞提供持續(xù)穩(wěn)定的水分供給[22~25],這是因?yàn)榫W(wǎng)狀結(jié)構(gòu)為水分輸送提供了多條路徑[26,27].脈序又分為一級(jí)脈序、二級(jí)脈序和三級(jí)脈(圖5).實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,本文所構(gòu)建的仿生瓊脂糖微流控芯片具有以上3種脈序.

Fig.6 Distributions of Escherichia coli in various channel structures

此外,將大腸桿菌菌液注入瓊脂糖微流控芯片中,在熒光倒置顯微鏡下觀察了各通道結(jié)構(gòu)(圖6).并對(duì)所構(gòu)建的仿生模型通道尺寸進(jìn)行統(tǒng)計(jì),一級(jí)脈序1條,尺寸最大值為1038.02 μm;二級(jí)脈序8條,尺寸最大值為335.07 μm,尺寸最小值為97.08 μm,大部分二級(jí)脈序的尺寸在200~280 μm之間;三級(jí)脈序76條,尺寸最大值為114.88 μm,尺寸最小值為36.32 μm,大部分三級(jí)脈序的尺寸在50~100 μm之間.所構(gòu)建的仿生模型通道寬度不一,更接近于人體的真實(shí)環(huán)境,大腸桿菌能夠順利進(jìn)入各級(jí)脈序,產(chǎn)生梯度的分布.這些現(xiàn)象證明已構(gòu)建出仿生樹(shù)葉的瓊脂糖微流控芯片,為后續(xù)研究大腸桿菌的趨化性奠定了基礎(chǔ).

2.3 大腸桿菌的趨化性

在自然環(huán)境中,適合細(xì)菌生長(zhǎng)繁殖的場(chǎng)所都有一定的離子濃度和營(yíng)養(yǎng)成分,細(xì)菌能夠感受周?chē)h(huán)境中的化學(xué)物質(zhì),并沿著化學(xué)物質(zhì)的濃度梯度定向運(yùn)動(dòng),這種性質(zhì)稱為趨化性[28].為驗(yàn)證所構(gòu)建的仿生樹(shù)葉模型制作出的瓊脂糖微流控芯片可以用于研究大腸桿菌的趨利性,設(shè)置了蒸餾水和培養(yǎng)液兩種不同生存環(huán)境的對(duì)照組.因芯片中的各結(jié)構(gòu)通道高度、寬度不一,所以當(dāng)把菌液滴在入口處時(shí)會(huì)出現(xiàn)毛細(xì)現(xiàn)象,將菌液吸入.由于毛細(xì)現(xiàn)象,所用大腸桿菌分布于各通道中,會(huì)優(yōu)先向生存空間充足的地方移動(dòng),即菌液會(huì)即刻把一級(jí)脈序、二級(jí)脈序充滿,之后再?gòu)亩?jí)脈序緩慢地移向三級(jí)脈序.芯片的入口只有一級(jí)脈序,細(xì)菌樣品首先接觸到一級(jí)脈序,接著在毛細(xì)現(xiàn)象的作用下逐漸接觸到其它脈序.從視頻S1(見(jiàn)本文支持信息)可以看出,若在入口處滴加幾滴PBS緩沖溶液,毛細(xì)現(xiàn)象會(huì)使PBS緩沖溶液被吸入通道中,PBS緩沖溶液與菌液之間具有一段空結(jié)構(gòu)通道,形成一段壓力柱,大腸桿菌會(huì)加快向原方向移動(dòng)速度,且一段時(shí)間后也并未向入口處移動(dòng)[圖7(A)和(B)].

Fig.7 Movement of bacterial solution away from the inlet every 5 s in the channel structures after adding bacterial solution(A)or PBS solution(B)at the inlet and the movement of bacterial solution near the inlet every 5 s in the structural channel after adding the culture solution at the inlet(C)

圖7(C)所示為相同條件下,把菌液(1.5×108個(gè)/mL)滴在入口處,所用大腸桿菌分布于各通道中,此時(shí)在入口處滴加一滴含氨芐的LB培養(yǎng)液,大腸桿菌則會(huì)向相反方向移動(dòng),即向滴加培養(yǎng)液的入口處方向移動(dòng),視頻S2(見(jiàn)本文支持信息)可以印證這一現(xiàn)象.對(duì)各種溶液進(jìn)入芯片后的移動(dòng)距離進(jìn)行了統(tǒng)計(jì),若規(guī)定遠(yuǎn)離入口處的方向?yàn)檎颍尤刖汉?5 s正向移動(dòng)了6.95×102μm,加入PBS緩沖溶液后15 s正向移動(dòng)了7.03×102μm,加入營(yíng)養(yǎng)液后15 s反向移動(dòng)了1.39×103μm.以上結(jié)果說(shuō)明,在周?chē)瞽h(huán)境所提供營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)相同時(shí),大腸桿菌會(huì)順著所受外界力的方向移動(dòng),但是如果有更好的生活環(huán)境,大腸桿菌受到的外界力會(huì)遠(yuǎn)小于大腸桿菌向更好生活環(huán)境移動(dòng)的力.大腸桿菌的運(yùn)動(dòng)性包括游動(dòng)和群集運(yùn)動(dòng),它們受鞭毛的逆時(shí)針旋轉(zhuǎn)和順時(shí)針旋轉(zhuǎn)調(diào)節(jié),通常使用復(fù)雜的趨化信號(hào)系統(tǒng)來(lái)指導(dǎo)它們的運(yùn)動(dòng).相關(guān)蛋白協(xié)調(diào)合作,相互影響,感知環(huán)境中化學(xué)物質(zhì)濃度的變化,并將這些化學(xué)信號(hào)轉(zhuǎn)化為細(xì)胞內(nèi)信號(hào),控制相關(guān)蛋白的表達(dá),進(jìn)而控制鞭毛運(yùn)動(dòng),促進(jìn)大腸桿菌向更好的生活環(huán)境移動(dòng).

3 結(jié)論

利用PDMS和三氯硅烷的特性制作了仿生樹(shù)葉模板,并進(jìn)一步構(gòu)建了可進(jìn)行細(xì)菌培養(yǎng)和觀察的瓊脂糖微流控芯片.仿生樹(shù)葉模板的制作使實(shí)驗(yàn)的進(jìn)行不受季節(jié)限制,可節(jié)約成本,保護(hù)環(huán)境.最重要的是由于脈序的高度、寬度、長(zhǎng)度不一,為細(xì)菌趨化性實(shí)驗(yàn)提供了穩(wěn)定可靠的梯度空間,對(duì)探索藥物篩選、微生物利害等研究具有重要意義.此外,瓊脂糖微流控芯片平臺(tái)的建立有利于對(duì)細(xì)菌的培養(yǎng)和觀察,植物和動(dòng)物的內(nèi)部運(yùn)輸通道雖然大相徑庭,但是在血管網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)方面非常相似,在一定程度上可以模擬血管的相關(guān)生理學(xué)特性,用于研究多種血細(xì)胞相互作用的機(jī)制和多種藥物對(duì)心肌細(xì)胞影響等.

支持信息見(jiàn)http://www.cjcu.jlu.edu.cn/CN/10.7503/cjcu20220445.

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