楊 浩,鄭 軍,陳 瑤,金小越
(新疆醫(yī)科大學第六附屬醫(yī)院1藥學部,2重癥醫(yī)學科,烏魯木齊 830002)
咳嗽變異性哮喘(Cough variant asthma,CVA)是一種以氣道炎癥、氣道高反應性和氣道重塑為特征的慢性炎癥性疾病[1],其主要由肥大細胞、嗜酸性粒細胞、T淋巴細胞和與氣道炎癥相關的炎癥細胞所觸發(fā)。CVA與哮喘的治療方式相似,采用支氣管擴張劑或糖皮質激素等藥物,但長期使用會引發(fā)多種不良反應。中醫(yī)藥在治療疾病方面具有多靶點和整體治療優(yōu)勢。阿納其為菊科羅馬除蟲菊[Anacycluspyrethrum(L).DC]的干燥根,主要化學成分有黃酮、生物堿等,具有鎮(zhèn)咳和祛痰的作用。本課題組前期研究[2]發(fā)現(xiàn)阿納其根醇提取物(Ethanol extract of the root ofAnacycluspyrethrum,EEAP)可以明顯降低CVA大鼠咳嗽次數(shù)、肺部炎性反應以及支氣管壁充血、水腫等癥狀,提示EEAP可通過抑制炎癥反應,發(fā)揮改善CVA的作用。此外,本課題組前期研究發(fā)現(xiàn)高劑量(640 mg/kg體重)EEAP在改善CVA大鼠咳嗽次數(shù)及炎性因子水平等方面效果最佳,且存在劑量依賴性[3]。近年來研究發(fā)現(xiàn),哮喘及咳嗽變異性哮喘與腸道菌群結構失衡相關[4]。腸道菌群是哺乳動物機體微生態(tài)系統(tǒng)中最重要的組成部分,對免疫系統(tǒng)的發(fā)育、功能和調節(jié)起著非常重要的作用[5-7]。柳萍飛[8]研究發(fā)現(xiàn),與對照組相比,CVA組患兒腸道中雙歧桿菌、乳桿菌數(shù)量明顯降低,而腸桿菌、酵母菌數(shù)量明顯升高,提示腸道菌群結構與CVA疾病發(fā)展可能存在聯(lián)系。微生物在免疫和炎癥反應中發(fā)揮著重要作用,其中腸道菌群生態(tài)平衡的破壞是誘發(fā)慢性炎性的重要因素之一,可使哮喘病情加劇[9]。根據(jù)上述文獻報道,提示腸道菌群可參與免疫調節(jié),抑制炎癥反應,發(fā)揮改善CVA的作用。本研究采用高通量測序技術分析EEAP對CVA大鼠腸道菌群的影響,現(xiàn)報道如下。
1.1 動物6~8周齡的SPF級雄性SD大鼠,體重(200±20)g,購買于新疆醫(yī)科大學動物實驗中心,動物生產(chǎn)許可證號:SYXK(新)2018-0003。動物飼養(yǎng)、處理和手術過程由新疆醫(yī)科大學第六附屬醫(yī)院動物保護與使用委員會審核批準,動物倫理審查批號:LFYLLSC2017020。
1.2 試藥阿納其根(新疆本草堂藥業(yè)公司,批號:704025),醋酸潑尼松片(天津天藥藥業(yè)股份有限公司,批號:CP170620a2),卵清蛋白、10%完全費氏佐劑(美國Sigma公司批號分別為:1002638271、10025515070),20%氫氧化鋁膠生理鹽水溶液(齊魯動物保健品有限公司,批號:1708002),QIAamp DNA Stool Mini Kit(德國Qiagen公司,批號:148044486)。根據(jù)課題組前期研究[2]進行制備阿納其根醇提取物,按照阿納其根與65%乙醇比例為1∶6(g/mL)在50℃下回流提取2 h后,采用旋轉蒸發(fā)儀濃縮成浸膏,冷凍干燥成粉末,備用。
1.3 儀器BSA224S電子分析天平(北京賽多利斯天平有限公司),微量加樣器(芬蘭Thermo公司),YLS-8B小動物霧化給藥儀(中國濟南益延科技發(fā)展有限公司),DanoDrop1000核酸蛋白檢測儀(美國BIO RAD公司)。
1.4 方法
1.4.1 CVA模型建立及分組 取24只6~8周齡的雄性SD大鼠根據(jù)文獻[2]建立CVA模型:給予大鼠皮下注射1 mg/mL卵清蛋白溶液致敏,1周后重復致敏1次,每日采用1%卵清蛋白溶液進行1次霧化吸入,以激發(fā)哮喘,連續(xù)15 d。將建模成功的大鼠隨機分為3組:CVA模型組(等體積的生理鹽水)、EEAP組(EEAP,640 mg/kg體重)、陽性藥組(醋酸潑尼松,250 mg/kg體重),每組8只,另取8只未造模的6~8周齡雄性SD大鼠作為對照組(等體積的生理鹽水),連續(xù)灌胃30 d。
1.4.2 糞便收集及細菌DNA提取 采用代謝籠收集各組小鼠干預30 d后的糞便,置于無菌免酶凍存管中,液氮冷凍后于-80℃冰箱保存,備用。嚴格按照QIAamp DNA Stool Mini Kit說明書,提取各組大鼠糞便細菌總DNA,并使用核酸蛋白檢測儀分析提取糞便細菌總DNA的濃度和純度。大鼠糞便細菌總DNA在OD260/OD280的比值為1.8~2.0之間,說明樣品DNA的純度好,沒有蛋白質污染,可用于高通量測序,若其比值不在該范圍提示存在蛋白質或RNA污染。將合格的各組大鼠糞便細菌總DNA送往上海百趣生物有限公司完成高通量測序分析。
1.4.3 Alpha和Beta多樣性分析各組大鼠腸道菌群變化 將去噪后的大鼠腸道細菌DNA序列進行聚類后,得到擴增子序列變異(Amplicon sequence variation,ASV),并對四組大鼠糞便細菌進行不同微生物相對豐度分類。基于ASV分析物種注釋,進行Alpha和Beta多樣性分析。通過Alpha多樣性分析各組大鼠腸道菌群的豐富度與均勻度的綜合指標,包括chao1、dominance、goods_coverage、observed_otus和pielou_e指數(shù)及shannon和simpson指數(shù)。β多樣性包含主坐標分析(Principal Coordinates Analysis, PCoA)和非度量多維標度(Nonmetric multidimensional scaling,NMDS)等分析,用來表示不同環(huán)境狀態(tài)下菌群的物種差異性。
2.1 細菌總DNA純度及ASV水平通過提取各組大鼠腸道糞便細菌總DNA后,采用核酸蛋白檢測儀檢測細菌總DNA純度發(fā)現(xiàn),OD260/OD280的比值均在1.8~2.0之間,提示可以用于高通量測序分析。高通量測序分析發(fā)現(xiàn),在32個樣本中,共獲取1 996 591條有效序列,有效序列的堿基數(shù)目為828 164 854 nt,有效序列的平均堿基數(shù)目為415 nt。測序結果按照100%的相似度聚類為ASV,共獲得4 771個ASV。
2.2 腸道菌群Alpha多樣性分析對各組大鼠的腸道菌群進行Alpha多樣性分析,發(fā)現(xiàn)代表豐富度的chao1、dominance、observed_otus、pielou_e指標及代表多樣性的shannon、simpson指標無明顯變化,差異無統(tǒng)計學意義(P>0.05),見表1。
表1 各組大鼠腸道菌群Alpha多樣性指數(shù)比較
2.3 腸道菌群Beta多樣性分析
2.3.1 PCoA及NMDS分析 將各組大鼠腸道細菌聚類得到的ASV進行PCoA,得到主坐標值1(PC1)、主坐標值2(PC2)分別為43.39%和23.95%,其中對照組與模型組大鼠腸道菌群完全分開,提示對照組大鼠腸道菌群結構與CVA大鼠存在較大差異。通過NMDS分析(Stress值為0.13)發(fā)現(xiàn)EEAP和陽性藥組大鼠腸道菌群結構相近而與CVA大鼠分離,提示EEAP和陽性藥可能影響CVA大鼠腸道菌群發(fā)揮改善疾病的作用,見圖1、2。
圖1 PCoA法分析各組大鼠腸道菌群結構的差異圖2 非度量多維標度分析各組大鼠腸道菌群結構的差異
2.3.2 腸道菌群結構中的屬水平相對豐度差異 通過非參數(shù)Kruskal-Wallis H檢驗對各組大鼠腸道中差異菌屬相對豐度進行統(tǒng)計分析,結果顯示,與對照組相比,CVA組大鼠腸道中Anaerostipes、Tuzzerella、Incertae_Sedis、Pygmaiobacter、Defluviitaleaceae_UCG_011、Sellimonas、Prevotellaceae_Ga6A1_group和Family_XIII_UCG_001豐度明顯升高,而Prevotella、Prevotellaceae_NK3B31_group、Cupriavidus、Anaerovibrio、Eubacterium_ruminantium_group、Butyricicoccus、Gastranaerophilales和Prevotellaceae_UCG_001豐度明顯降低,差異具有統(tǒng)計學意義(P<0.05);與CVA組相比,EEAP組大鼠腸道中Prevotellaceae_UCG-001、Prevotella、Prevotellaceae_NK3B31_group、Sellimonas、Pygmaiobacter和Eubacterium_ruminantium_group豐度明顯升高,而Anaerostipes、Incertae_Sedis、Anaerovibrio、Prevotellaceae_Ga6A1_group和Cupriavidus豐度明顯降低,差異具有統(tǒng)計學意義(P<0.05);與CVA組相比,陽性藥組大鼠腸道中Eubacterium_ruminantium_group、Gastranaerophilales、Prevotella和Prevotellaceae_NK3B31_group豐度明顯升高,而Anaerovibrio、Anaerostipes、Family_XIII_UCG-001、Tuzzerella、Cupriavidus和Prevotellaceae_Ga6A1_group豐度明顯降低,差異具有統(tǒng)計學意義(P<0.05),見表2和圖3。
表2 各組大鼠腸道菌群結構中屬水平的相對豐度比較
圖3 各組大鼠腸道菌群結構中屬水平的相對豐度變化
近年來,研究發(fā)現(xiàn)腸道菌群與CVA疾病的發(fā)生發(fā)展關系密切。He等[1]基于“肺與大腸相表里”理論研究枇杷葉水提物治療CVA的作用中發(fā)現(xiàn),與對照組相比,CVA組小鼠腸道Lactobacillus豐度明顯降低,而Methanobrevibacter,PrevotellaceaeUCG-003,RikenellaceaeRC9gutgroup,Escherichia-Shigella,PrevotellaceaeGa6A1group,Clostridiumsensustricto1,OscillibacterandAlloprevotella豐度明顯增加,其中PrevotellaceaeGa6A1group豐度與肺中限制細胞外基質沉積代謝主要限速酶基質金屬肽酶9表達呈現(xiàn)正相關,上述研究說明CVA小鼠腸道菌群結構失衡,并與CVA發(fā)生發(fā)展呈現(xiàn)相關性。王梅芬等[10]發(fā)現(xiàn),Prevotella豐度在哮喘小鼠腸道中明顯降低。Prevotella在哮喘患者肺部微生物群中的豐度明顯降低,該菌屬可介導黏膜炎癥反應,并通過激活TOLL樣受體2和上皮細胞產(chǎn)生細胞因子,從而增強T輔助17型(Th17)免疫反應[11]。腸道中的Prevotellaceae-UCG-001h和Prevotellaceae_NK3B31_group豐度升高可促進短鏈脂肪酸的生產(chǎn),發(fā)揮保護腸道黏膜屏障,改善腸道功能,緩解炎癥反應[12-13]。上述研究提示Prevotella、PrevotellaceaeGa6A1group、Prevotellaceae-UCG-001h和Prevotellaceae_NK3B31_group可能參與炎癥反應影響呼吸系統(tǒng)疾病的進展。此外,Butyricicoccus是腸道中可產(chǎn)生短鏈脂肪酸,尤其是丁酸,具有抑制炎癥因子產(chǎn)生的作用,該菌的豐度可被黃連素和二甲雙胍促進,并發(fā)揮改善高脂誘導糖脂代謝紊亂[14]。
本課題組前期研究發(fā)現(xiàn),EEAP具有抗炎、抗氧化的作用,可降低CVA患者淋巴細胞IL-13、IL-5及TNF-α水平,同時降低CVA大鼠肺泡灌洗液中嗜酸性粒細胞、白細胞計數(shù)和血清TNF-α水平[15]。本研究選取前期研究中改善CVA癥狀及抑制血清炎癥因子水平最佳的EEAP高劑量組進行腸道菌群結構分析,從腸道微環(huán)境挖掘EEAP可能的作用機制。結果發(fā)現(xiàn),與對照組相比,CVA組在腸道菌群結構中Prevotellaceae_Ga6A1_group豐度明顯升高,而Prevotella、Prevotellaceae_NK3B31_group、Prevotellaceae-UCG-001h和Butyricicoccus豐度明顯降低;EEAP和醋酸潑尼松可明顯升高CVA大鼠腸道中Prevotella、Prevotellaceae_NK3B31_group豐度,降低Prevotellaceae_Ga6A1_group豐度;EEAP還可明顯升高CVA大鼠腸道中Prevotellaceae-UCG-001h。PCoA法分析中發(fā)現(xiàn)對照組與CVA組樣本完全分開,NMDS法分析中發(fā)現(xiàn)EEAP和陽性藥組與CVA組樣本分開,且EEAP和陽性藥組樣本較為接近。本研究結果提示,腸道菌群結構失衡與CVA存在相關性,EEAP可能通過調節(jié)腸道菌群,抑制炎癥反應,從而發(fā)揮改善CVA的作用。此外,EEAP在調節(jié)腸道細菌譜方面與醋酸潑尼松存在相似,但差異菌屬在發(fā)揮改善CVA的作用機制還需進一步研究。