焦玉潔,高智星,張曉誼
烏魯木齊市中醫(yī)醫(yī)院呼吸與危重癥醫(yī)學(xué)科,烏魯木齊 830000
慢性阻塞性肺疾?。–OPD)是目前老年患者中較為常見(jiàn)的慢性疾病,通過(guò)針對(duì)性制定治療方案能有效控制病情,而中西醫(yī)結(jié)合治療COPD已經(jīng)被證實(shí)能更好地控制患者病情發(fā)展,降低COPD急性發(fā)作的可能[1-2]。中醫(yī)認(rèn)為,陽(yáng)虛痰瘀是COPD的病機(jī),發(fā)病根本在于脾陽(yáng)、肺陽(yáng)兩虛,二者互為影響,而補(bǔ)肺湯是治療肺脾兩虛證的經(jīng)典方劑。國(guó)內(nèi)已經(jīng)有研究顯示,補(bǔ)肺湯對(duì)于COPD具有較好的輔助治療效果[3-4]。但目前關(guān)于補(bǔ)肺湯治療COPD的有效成分及具體作用機(jī)制鮮見(jiàn)報(bào)道。2022年11月—2023年1月,本研究采用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法分析補(bǔ)肺湯治療COPD的有效成分及作用靶點(diǎn),為探討其具體的作用機(jī)制提供依據(jù)?,F(xiàn)報(bào)告如下。
1.1 補(bǔ)肺湯的有效成分及作用靶點(diǎn)篩選 在中藥系統(tǒng)藥理學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)與分析平臺(tái)(TCMSP)以及中國(guó)天然產(chǎn)物化學(xué)成分庫(kù)中,以補(bǔ)肺湯的組成中藥“人參、黃芪、熟地黃、五味子、紫菀、桑白皮”為關(guān)鍵詞,通過(guò)關(guān)鍵詞檢索法對(duì)有效成分進(jìn)行初步篩選。同時(shí)基于TCMSP,在全網(wǎng)數(shù)據(jù)庫(kù)中對(duì)補(bǔ)肺湯作用靶點(diǎn)的相關(guān)文獻(xiàn)進(jìn)行分析?;赨niprot數(shù)據(jù)庫(kù),將藥物有效成分經(jīng)過(guò)口服利用度和類(lèi)藥性轉(zhuǎn)化后的對(duì)應(yīng)作用靶點(diǎn)與TCMSP數(shù)據(jù)庫(kù)搜索的補(bǔ)肺湯作用靶點(diǎn)合并以后刪除重復(fù)值,得到有效成分作用靶點(diǎn)。
1.2 補(bǔ)肺湯治療COPD的潛在基因篩選 在Gene Expression Omnibus(GEO)、Drugbank及Genecards數(shù)據(jù)庫(kù)中篩選COPD相關(guān)表達(dá)譜芯片數(shù)據(jù)集,時(shí)間截點(diǎn)為2022年5月,篩選條件為“Chronic obstructive pulmonary disease”,物種選擇“human”。利用R語(yǔ)言將GEO數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)COPD患者與健康人的基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)的表達(dá)強(qiáng)度歸一化。利用R語(yǔ)言limma包篩選出COPD相關(guān)靶點(diǎn),篩選條件:Log Fold Change>2且P<0.05。將COPD相關(guān)靶點(diǎn)與“1.1”得到的有效成分作用靶點(diǎn)取交集,得到補(bǔ)肺湯治療COPD的潛在基因。
1.3 補(bǔ)肺湯治療COPD的主要活性成分篩選 采用拓?fù)浞治龇?,篩選補(bǔ)肺湯治療COPD的主要活性成分,基于Cytoscape 3.6. 0(http: //www. cytoscape.org/)軟件,建立補(bǔ)肺湯治療COPD的藥物、有效成分及靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)相關(guān)圖,即疾病—藥物—主要活性成分—靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)圖。
1.4 補(bǔ)肺湯治療COPD潛在基因的功能及相關(guān)信號(hào)通路分析 ①GO功能分析:對(duì)“1.2”中得到的補(bǔ)肺湯治療COPD的潛在基因進(jìn)行GO功能富集分析,從生物學(xué)過(guò)程、細(xì)胞組分以及分子功能三個(gè)層面分析其功能,取P<0.05且P值最小排序的前10個(gè)結(jié)果。②KEGG信號(hào)通路分析:將“1.2”中得到的補(bǔ)肺湯治療COPD的潛在基因輸入DAVID 6.8在線(xiàn)分析網(wǎng)站,而后對(duì)其進(jìn)行KEGG信號(hào)通路分析,分析結(jié)果輸入R語(yǔ)言中,采用ggplot2包篩選出P<0.05且相關(guān)性較高的信號(hào)通路。
1.5 作用靶點(diǎn)篩選 將補(bǔ)肺湯作用靶點(diǎn)以及COPD相關(guān)靶點(diǎn)輸入STRING數(shù)據(jù)庫(kù),構(gòu)建蛋白互作網(wǎng)絡(luò)(PPI)圖,剔除無(wú)相互作用的孤立蛋白,篩選標(biāo)準(zhǔn):蛋白間相互作用得分>0.4,篩選作用靶點(diǎn)。構(gòu)建最終的PPI圖,并進(jìn)行可視化處理,建立最終能反映補(bǔ)肺湯治療COPD的PPI圖。
2.1 補(bǔ)肺湯的有效成分及作用靶點(diǎn)篩選結(jié)果 補(bǔ)肺湯的有效成分初步篩選出738種,其中人參210種、黃芪185種、熟地75種、五味子97種、紫菀63種、桑白皮108種;經(jīng)過(guò)口服利用度和類(lèi)藥性篩選后獲得人參的有效成分40種、黃芪27種、熟地9種、五味子19種、紫菀22種、桑白皮36種;其中,槲皮素、黃芪異黃烷苷、山奈酚、異鼠李素、刺芒柄花素、β-谷甾醇、谷甾醇、原阿片堿、3,9 -二甲氧基紫檀烷、7-甲基醚—青榆烯C為重要性排名前10位的有效成分,見(jiàn)表1。篩選得到有效成分的作用靶點(diǎn)141個(gè)。
表1 補(bǔ)肺湯重要性排名前10位的有效成分
2.2 補(bǔ)肺湯治療COPD的潛在基因篩選結(jié)果 在GEO、Drugbank及Genecards檢索后共收集到1 730個(gè)COPD相關(guān)靶點(diǎn),與2.1篩選得到的141個(gè)有效成分作用靶點(diǎn)取交集,共得到補(bǔ)肺湯治療COPD的潛在基因80個(gè)。韋恩圖見(jiàn)OSID碼圖1。
2.3 補(bǔ)肺湯治療COPD的主要活性成分篩選結(jié)果 槲皮素、黃芪異黃烷苷及山奈酚等成分可能是補(bǔ)肺湯治療COPD的主要活性成分。疾病—藥物—主要活性成分—靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)圖見(jiàn)OSID碼圖2。
2.4 補(bǔ)肺湯治療COPD潛在基因的GO功能分析結(jié)果 從生物學(xué)過(guò)程、細(xì)胞組分以及分子功能三個(gè)層面,共計(jì)篩選出30個(gè)排名靠前的差異顯著富集條目,主要涉及炎癥反應(yīng)、細(xì)胞凋亡、細(xì)胞增殖、氧化還原等。見(jiàn)OSID碼圖3。
2.5 補(bǔ)肺湯治療COPD潛在基因的KEGG信號(hào)通路富集分析結(jié)果 共富集得到20條差異顯著的信號(hào)通路(P均<0.05),其中排名前10位的分別是細(xì)胞衰老途徑、絲裂原活化蛋白激酶(MAPK)信號(hào)通路、細(xì)胞周期循環(huán)途徑、神經(jīng)營(yíng)養(yǎng)蛋白信號(hào)通路、細(xì)胞凋亡途徑、Th17細(xì)胞分化途徑、FoxO信號(hào)通路、PI3K/AKT信號(hào)通路、Rap1信號(hào)通路、Ras信號(hào)通路。見(jiàn)OSID碼圖4。
2.6 補(bǔ)肺湯治療COPD的作用靶點(diǎn)篩選結(jié)果 篩選后作用靶點(diǎn)包括絲裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)、熱休克蛋白90α家族A類(lèi)成員1(HSP90AA1)、禽肉瘤病毒17的轉(zhuǎn)化基因(JUN)、表皮生長(zhǎng)因子受體(EGFR)、腫瘤壞死因子(TNF)、cAMP依賴(lài)性蛋白激酶α催化亞基(PRKACA)、腫瘤蛋白53(TP53)、雌激素受體1(ESR1)、絲裂原活化蛋白激酶(MAPK14)、絲裂原活化蛋白激酶8(MAPK8)。PPI圖見(jiàn)OSID碼圖5。
COPD屬于中醫(yī)“喘癥”“肺脹”范疇,對(duì)于其穩(wěn)定期患者常見(jiàn)證型是肺腎兩虛證,其臨床表現(xiàn)為氣喘憋氣、動(dòng)則加重、氣不得續(xù)、腰膝酸軟、咳嗽咳痰。臨床上多選用補(bǔ)肺湯主治肺腎兩虛證COPD,該方出自《永類(lèi)靈方》,主要功效是補(bǔ)肺益氣、納腎平喘、止咳化痰。方中人參為君藥,可益氣、補(bǔ)五臟之氣;黃芪歸脾經(jīng),補(bǔ)氣健脾生氣;熟地歸腎經(jīng),可補(bǔ)腎氣;五味子歸肝經(jīng),可酸溫?cái)扛?、疏肝氣;紫菀歸肺經(jīng),為肺經(jīng)引經(jīng)藥物,可斂肺止咳;桑白皮歸肺經(jīng),瀉肺平喘,利水消腫。六味藥物協(xié)同,可達(dá)到補(bǔ)肺納腎、益氣止咳平喘之功,有助于提升COPD患者的肺功能,改善臨床癥狀,提高生活質(zhì)量。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)是從系統(tǒng)水平角度出發(fā),基于網(wǎng)絡(luò)觀點(diǎn)分析藥物種類(lèi)、具體化學(xué)成分、作用靶點(diǎn)之間關(guān)系的研究策略,該方法與中醫(yī)的整體觀點(diǎn)類(lèi)似[5-6]。目前國(guó)內(nèi)外有大量研究使用該方法對(duì)單味藥物及藥方進(jìn)行研究,有助于深入地了解中藥治療疾病的具體作用機(jī)制[7-8]。研究顯示,補(bǔ)肺湯能降低氣道炎癥反應(yīng),減少局部氣道痰液分泌,提升免疫功能,增強(qiáng)抵抗力,對(duì)于COPD具有一定的輔助治療作用[9]。但目前關(guān)于補(bǔ)肺湯治療COPD的有效成分及作用靶點(diǎn)尚未可知。
本研究通過(guò)網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的方法,從補(bǔ)肺湯的6味中藥中獲取了141個(gè)有效成分,在建立拓?fù)浞治鼍W(wǎng)絡(luò)后發(fā)現(xiàn),槲皮素、黃芪異黃烷苷及山奈酚等成分可能是本方發(fā)揮作用的主要活性成分,其中槲皮素、黃芪異黃烷苷、山奈酚、異鼠李素、刺芒柄花素均是類(lèi)黃酮化合物。研究顯示,黃酮類(lèi)化合物可以通過(guò)降低NF-κB通路中κB蛋白、IκB激酶及MAPK通路中ERK、p38蛋白表達(dá),從而抑制上述通路參與的腫瘤壞死因子α(TNF-α)、白細(xì)胞介素(IL)-1及IL-6等炎癥因子激活,最終減輕COPD氣道重塑,避免病情進(jìn)展[10-11]。本研究發(fā)現(xiàn),人參的重要成分原阿片堿也是對(duì)COPD作用較顯著的成分之一,但目前臨床上對(duì)于阿片類(lèi)藥物應(yīng)用于COPD的治療尚存在一定爭(zhēng)議,故需要進(jìn)一步研究予以證實(shí)[12]。β-谷甾醇及豆甾醇均屬于醇類(lèi)化合物,可通過(guò)抑制黃酸誘導(dǎo)基因Ⅰ(RIG-Ⅰ)激活,減少STAT信號(hào)表達(dá),進(jìn)而導(dǎo)致干擾素刺激基因因子3(ISGF3)復(fù)合物的轉(zhuǎn)錄活性降低,最終使得干擾素致敏細(xì)胞促炎癥放大作用減弱,發(fā)揮降低COPD氣道局部炎癥的作用[13-14]。
從本研究GO功能富集分析結(jié)果可以推測(cè),補(bǔ)肺湯治療COPD并非單一途徑或單一作用點(diǎn),而其中主要途徑還是控制炎癥反應(yīng)。本研究KEGG分析結(jié)果顯示,細(xì)胞衰老是導(dǎo)致慢性肺部疾病發(fā)生的主要病因。BARNES等[15]研究顯示,COPD等慢性肺部疾病可以激活p53和p16INK4a,從而激活p21CIP1,并導(dǎo)致細(xì)胞周期停滯,是導(dǎo)致細(xì)胞衰老的主要原因。氧化應(yīng)激反應(yīng)也是引發(fā)細(xì)胞衰老的關(guān)鍵因素,會(huì)導(dǎo)致炎癥反應(yīng)進(jìn)一步加劇,而補(bǔ)肺湯中的人參及半夏均被證實(shí)對(duì)于抑制細(xì)胞衰老、改善細(xì)胞周期具有一定作用[16-17]。研究顯示,NF-κB和FoxO在COPD患者血清中高表達(dá),而NF-κB可以促進(jìn)FoxO激活,從而導(dǎo)致肺支氣管壁中的微結(jié)構(gòu)發(fā)生自噬,引起氣管壁細(xì)胞凋亡[18]。補(bǔ)肺湯中的主要成分對(duì)于NF-κB通路具有抑制作用,因此對(duì)于FoxO表達(dá)也有一定的抑制作用。Rap1/Ras/PI3K/AKT通路是誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡的主要途徑,還能促進(jìn)IL、TNF、干擾素等炎癥因子生成,同時(shí)上述傳導(dǎo)通路相互影響,從而構(gòu)建起炎癥反應(yīng)關(guān)系網(wǎng),進(jìn)一步促進(jìn)局部炎癥反應(yīng)增加,最終導(dǎo)致COPD的病程進(jìn)展[19-20]。Th17/Treg平衡是影響體內(nèi)炎癥反應(yīng)的重要因素,而Th17細(xì)胞分化是導(dǎo)致Th17/Treg平衡改變的主要因素之一。研究顯示,補(bǔ)肺湯中人參的主要成分人參皂甙對(duì)于Th17/Treg平衡具有重要影響[21]。本研究結(jié)果顯示,Th17細(xì)胞分化是補(bǔ)肺湯影響COPD的途徑之一,但具體作用機(jī)制尚未可知,可以作為今后的研究重點(diǎn)。
在本研究最終建立的PPI圖中,補(bǔ)肺湯的作用靶點(diǎn)包括MAPK1、HSP90AA1、JUN、EGFR、TNF、PRKACA、TP53、ESR1、MAPK14、MAPK8。正如之前所述,補(bǔ)肺湯中的類(lèi)黃酮物質(zhì)及β-谷甾醇等對(duì)MAPK表達(dá)具有抑制作用,PPI圖顯示MAPK1、MAPK8、MAPK14正是補(bǔ)肺湯的作用靶點(diǎn)。TNF是介導(dǎo)體內(nèi)炎癥反應(yīng)的重要基因,其中TNF-α是導(dǎo)致IL釋放并促使局部炎癥反應(yīng)加重的重要原因。研究顯示,補(bǔ)肺湯能降低COPD患者血清TNF-α水平,說(shuō)明TNF可能是補(bǔ)肺湯的主要作用靶點(diǎn)[22]。HSP90AA1是熱休克蛋白家族成員之一,其在COPD患者體內(nèi)表達(dá)發(fā)生改變,還能影響單核細(xì)胞內(nèi)TNF的釋放,從而影響局部炎癥反應(yīng)[23]。PRKACA、JUN、EGFR、TP53、ESR1是參與影響細(xì)胞增殖過(guò)程的重要基因。研究顯示,在COPD的病理改變過(guò)程中,成纖維細(xì)胞增殖是氣道重塑的重要原因[24]。本研究結(jié)果顯示,補(bǔ)肺湯可能通過(guò)抑制PRKACA、JUN、EGFR、TP53、ESR1表達(dá),來(lái)阻止成纖維細(xì)胞增殖,從而達(dá)到抑制氣道重塑的作用,但其具體機(jī)制仍需要進(jìn)一步明確。
綜上所述,補(bǔ)肺湯治療COPD的有效成分是槲皮素、山奈酚等,可能通過(guò)MAPK1、HSP90AA1、JUN等作用靶點(diǎn)調(diào)控細(xì)胞衰老途徑、MAPK信號(hào)通路、細(xì)胞凋亡途徑等而發(fā)揮作用。本研究通過(guò)網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法對(duì)補(bǔ)肺湯作用于COPD的具體機(jī)制進(jìn)行了較為詳盡的分析,利用有效成分、基因及作用途徑等客觀數(shù)據(jù)對(duì)補(bǔ)肺湯的作用機(jī)制進(jìn)行了闡述,為開(kāi)展實(shí)驗(yàn)室研究提供了有效的參考,便于今后臨床進(jìn)一步對(duì)補(bǔ)肺湯開(kāi)展動(dòng)物或人體實(shí)驗(yàn)。