邱志東,范琳峰,雷長江,繆輝來
(廣東醫(yī)學院附屬醫(yī)院 肝膽外科,廣東 湛江524001)
胰腺癌是一種惡性程度高,進展迅速,手術切除率低,預后極差的惡性腫瘤,本文從表觀遺傳學的角度研究Runx3基因在胰腺癌細胞中失表達的機制,以期為胰腺癌的早期診斷及新的治療方案提供理論依據(jù)。
1.1 材料
(1)細胞株:Panc-1、BxPC-3、AsPC-1三種胰腺癌細胞株(中國科學院上海生命科學研究院細胞資源中心);(2)主要試劑:DMEM 培養(yǎng)基、RPMI 1640培養(yǎng)基(美國Gibco公司),TRIZOL總RNA提取試劑盒、PrimeScript OneStep RT-PCR Kit Ver.2(大連寶生物公司)、One step sybr primescripttmrtpcr kitⅡ(大連寶生物公司),EZ DNA甲基化試劑盒-direct、Zymo Taqtm PreMix(美國 ZYMO RESEARCH公司),引物、內(nèi)參(上海生物工程公司、大連寶生物公司),Western封閉液、一抗稀釋液、二抗稀釋液、一抗二抗去除液、鼠抗人GADPH抗體(碧云天生物技術研究所),小鼠抗人Runx3單克隆抗體(Santa Cruz Biotechnology)。
1.2 方法
(1)細胞培養(yǎng)。(2)RT-PCR檢測 Runx3基因的表達:①癌細胞株及胰腺組織中RNA的抽提;②引物序列及產(chǎn)物長度:Runx3上游引物為5′-AGGCATTGCGCAGCTCAGCGGAGT-3′,Runx3 下游 引 物 為 5′-AGGCATTGCGCAGCTCAGCGGAGTA-3′,擴增長度為152bp,β-actin上游引物為 5′-TGGCACCCAGCACAATGAA-3′,β-actin下游引物 為 5′-CT AAGTCATAG TCCGCCTAGAAGCA-3′,擴增長度為186bp,引物均由上海生工合成,引物離心后用0.1%DEPC處理水稀釋至所需濃度,-20℃保存;③參照TaKaRa公司的onestep RT-PCR Kit使用說明書進行RT-PCR;④瓊脂糖凝膠電泳和圖象分析。(3)Westren blotting:①樣品制備;②蛋白定量;③SDS-PAGE電泳;④轉(zhuǎn)膜;⑤封閉及抗原抗體反應;⑥化學發(fā)光顯影、定影及圖像分析。(4)甲基化特異PCR:①細胞計數(shù);②貼壁細胞DNA提?。虎壅R认俳M織中提取DNA;④引物設計及擴增長度,Runx3基因的甲基化特異性PCR引物用Methprimer軟件設計,甲基化引 物 (M)上 游 為:5′-CGTCGGGTTAGCGAGGTTTC-3′,下游為:5′-GCCGCTACCG CGAAAAACGA-3′,擴增長度120bp;非甲基化引物(U)上游為:5′– GTGGGTGG TTGTTGGGTTAGT-3′,下游 引 物 為:5′-TCCTCAACCACCACTA CCACA-3′,擴增長度為138bp,引物均由上海生工合成。⑤甲基化特異性PCR;⑦瓊脂糖凝膠電泳實驗。
1.3 統(tǒng)計學處理
實驗數(shù)據(jù)用均數(shù)±標準差(±s)表示,所有實驗至少重復3次。
2.1 Runx3基因mRNA表達 RT-PCR檢測結果顯示在Panc-1、BxPC-3、AsPC-1 3種胰腺癌細胞株中Runx3基因的mRNA電泳未見亮條帶,而在正常胰腺組織中Runx3基因的mRNA電泳有亮條帶出現(xiàn)(見圖2.1);用Quantity One軟件測量條帶灰度值,以目的基因與β-actin內(nèi)參條帶的光密度積分值之比進行相對定量分析,結果顯示正常胰腺組織的值為1.3594±0.0059,而Panc-1、BxPC-3、AsPC-1未測得相對定量值,說明在正常胰腺組織中Runx3基因的mRNA有表達,而在3種胰腺癌細胞株中沒有表達。
圖2.1 RT-PCR凝膠電泳
2.2 Runx3基因蛋白表達 Western blotting法未能檢測到 Panc-1、BxPC-3、AsPC-1的 Runx3蛋白表達(圖2.2)
2.3 Runx3基因啟動子區(qū)CpG島的甲基化 利用MSP檢測法顯示在 Panc-1、BxPC-3、AsPC-1胰腺癌細胞株中,Runx3基因甲基化引物均擴增出產(chǎn)物,電泳可見120bp處有亮條帶,非甲基化引物未擴增出產(chǎn)物;而在正常胰腺組織中Runx3基因非甲基化引物擴增出產(chǎn)物,而甲基化引物則未擴增出引物。
圖2.2 Panc-1、BxPC-3、AsPC-1細胞 Runx3蛋白表達水平
圖2.3 正常胰腺組織與各癌細胞株Runx3基因的甲基化情況
胰腺癌的發(fā)生與很多因素有關,包括基因水平上的改變和后生修飾的累積效應,如癌基因的激活或抑癌基因的失活。DNA甲基化在基因沉默、基因組印記、X染色體失活和腫瘤形成過程中發(fā)揮重要作用。近期研究提示許多抑癌基因啟動子區(qū)的高甲基化是腫瘤發(fā)生過程中基因失活的重要原因,在某些情況下甚至是抑癌基因失活的唯一機制[1,2]。最近的研究表明Runx3可能是一新的抑瘤基因,其在宮頸癌、前列腺癌、胃癌、結直腸癌、膽管癌、胰癌和肺癌等多種腫瘤中有不同程度表達缺失或者下調(diào)[3-8]。Wada等用 Northern blotting和 RT-PCR研究顯示75%的胰腺癌細胞株Runx3mRNA及蛋白沒有發(fā)生表達(9/12)[9],但是其原因未明。本研究也未能檢測到 Panc-1、BxPC-3、AsPC-1中 Runx3基因mRNA及蛋白表達,而正常胰腺組織可檢測到Runx3基因mRNA表達;同時我們通過MSP方法檢測了正常胰腺組織和人胰腺癌細胞株,發(fā)現(xiàn)Panc-1、BxPC-3、AsPC-1癌細胞中均檢測到Runx3基因啟動子CpG島發(fā)生甲基化,而正常胰腺組織中Runx3基因啟動子CpG島沒有出現(xiàn)甲基化現(xiàn)象,由此我們大膽推測,Runx3基因在胰腺癌細胞中的失表達可能與Runx3基因啟動子CpG島發(fā)生甲基化有關。
眾所周知,胰腺癌惡性程度高,易轉(zhuǎn)移且預后較差,手術切除是治療胰腺癌的主要手段,但很多胰腺癌患者在確診后就喪失了根治性切除的機會,而作為晚期胰腺癌的一線化療藥物吉西他濱,接受其單藥治療患者的中位生存期僅為6個月左右,并且吉西他濱與其他化療藥物聯(lián)合應用并不能延長患者的生存期[10]。改變基因表觀遺傳學是目前一種新的臨床治療癌癥的方法,本研究發(fā)現(xiàn)Runx3基因在胰腺癌細胞中的失表達可能與Runx3基因啟動子CpG島發(fā)生甲基化有關,那么如果能夠使Runx3基因啟動子CpG島發(fā)生去甲基化,是否就能使Runx3基因重新表達,從而起到治療腫瘤的作用?這是進一步研究的重點。
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