郭藝迪,梁冬雪,李悅,李校堃,付學(xué)奇,胡鑫,
吉林大學(xué) a.生命科學(xué)學(xué)院;b.白求恩醫(yī)學(xué)院;吉林 長(zhǎng)春 130012
表觀遺傳學(xué)指在基因的DNA序列沒有發(fā)生改變的情況下,基因功能發(fā)生了可遺傳的變化,并最終導(dǎo)致表型的變化,它通過DNA的甲基化、組蛋白修飾、染色質(zhì)重塑和非編碼RNA調(diào)控等4種方式來控制基因表達(dá)。
組蛋白修飾是細(xì)胞內(nèi)基因表達(dá)的重要調(diào)控機(jī)制,真核細(xì)胞中,核小體是染色質(zhì)的基本結(jié)構(gòu),2對(duì)組蛋白H3及H4形成四聚體,兩側(cè)各有一個(gè)組蛋白H2A、H2B緊密結(jié)合形成的二聚體,從而促成核心組蛋白八聚體。核小體是由長(zhǎng)146 bp的DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)纏繞組蛋白八聚體1.75圈形成的。在真核生物中,染色質(zhì)由DNA、組蛋白、非組蛋白及少量RNA組成,其中組蛋白是真核細(xì)胞中特有的成分,富含帶正電荷的精氨酸和賴氨酸,可以與帶負(fù)電荷的DNA分子緊密結(jié)合。
組蛋白修飾包括乙?;?、甲基化、磷酸化和泛素化。甲基化是組蛋白修飾的重要方式,組蛋白甲基化位點(diǎn)多位于H3、H4的賴氨酸和精氨酸殘基上。其中,精氨酸可以被單甲基化和二甲基化,而賴氨酸可以被單甲基化、二甲基化和三甲基化。組蛋白H3和H4中共有5個(gè)精氨酸殘基(H3R2、H3R8、H3R17、H3R26和H4R3)可被PRMT家族組蛋白甲基化轉(zhuǎn)移酶甲基化,組蛋白精氨酸甲基化既參與激活基因轉(zhuǎn)錄又參與抑制基因轉(zhuǎn)錄[1]。組蛋白共有6個(gè)賴氨酸殘基(H3K4、H3K9、H3K27、H3K36、H3K79、H4K20)可被甲基化,其中H3K4、H3K36和H3K79的甲基化通常與基因轉(zhuǎn)錄的激活相關(guān),而H3K9、H3K27和H4K20的甲基化通常和基因轉(zhuǎn)錄的抑制相關(guān)[2]。
自2000年Jenuwein等報(bào)道第一個(gè)組蛋白賴氨酸甲基化轉(zhuǎn)移酶Suv39H1以來,組蛋白甲基化研究受到廣泛關(guān)注[3];而對(duì)于組蛋白甲基化修飾的另一方面,去甲基化的研究始于2004年Shi等[4]對(duì)賴氨酸特異性組蛋白去甲基化酶1(lysine specific demethyl?ase 1,LSD1)的報(bào)道。
很多組蛋白修飾都是可逆的,其中以賴氨酸甲基化尤為重要,它與DNA的甲基化密切相關(guān)。但是在發(fā)現(xiàn)組蛋白賴氨酸甲基化后的幾十年里,人們一直認(rèn)為組蛋白賴氨酸甲基化是不可逆的,是一個(gè)穩(wěn)定的組蛋白標(biāo)記。盡管蛋白精氨酸脫亞氨酶4(pro?tein-arginine deiminase type-4,PADI4)可以將甲基化的精氨酸轉(zhuǎn)換為瓜氨酸,但由于并非移除甲基,故PADI4并不是嚴(yán)格意義上的去甲基化酶[5-6]。直到2004年Shi等發(fā)現(xiàn)了第一個(gè)組蛋白LSD1,才明確了組蛋白的甲基化修飾是一種動(dòng)態(tài)可逆的過程。LSD1又稱KDM1、KIAA060、pl10b、BHC110、NPAO,是組蛋白H3-K4的特異性脫甲基酶[4],穩(wěn)定存在于一些組蛋白去乙酰化酶復(fù)合物中[7-11]。
最近,有研究發(fā)現(xiàn)JmjC蛋白家族具有去甲基化酶活性并具有廣泛的作用,能夠?qū)3K4、H3K9、H3K36等多個(gè)位點(diǎn)進(jìn)行去甲基化。目前研究表明,JmjC蛋白的3個(gè)亞家族JHDM1、JHDM2、JMJD2中的許多成員都具有組蛋白賴氨酸去甲基化酶活性。JmjC結(jié)構(gòu)域?qū)儆诮饘倜钢械腃upin超家族,在功能上高度保守,并且其完整性決定了JmjC蛋白的去甲基化酶活性[12]。但僅有JmjC結(jié)構(gòu)也不能完成一個(gè)去甲基化催化過程,還需要有另外不同的結(jié)構(gòu)域共同作用才能發(fā)揮去甲基化的催化反應(yīng),比如鋅指結(jié)構(gòu)域、Tudor結(jié)構(gòu)域。并且,其中一些蛋白不僅具有組蛋白賴氨酸去甲基化酶活性,還能特異性結(jié)合H3K4三甲基化和H4K20三甲基化位點(diǎn)發(fā)揮作用[7]。
LSD1含有一個(gè)N端SWIRM結(jié)構(gòu)域、一個(gè)Tower結(jié)構(gòu)域和一個(gè)C端胺氧化酶結(jié)構(gòu)域。很多與染色體相互作用的蛋白都含有SWIRM結(jié)構(gòu)域,而Tower結(jié)構(gòu)域是由從C端胺氧化酶結(jié)構(gòu)域向外伸出的2個(gè)平行結(jié)構(gòu)構(gòu)成,因此Tower結(jié)構(gòu)域把胺氧化酶結(jié)構(gòu)域分成2個(gè)部分,即FAD結(jié)合結(jié)構(gòu)域和催化活性中心。在三級(jí)結(jié)構(gòu)中,胺氧化酶結(jié)構(gòu)域的這2個(gè)部分仍然緊密結(jié)合在一起,形成一個(gè)完整的具有催化活性的結(jié)構(gòu)域。這一特殊的結(jié)構(gòu)對(duì)于LSD1的功能有著重要的作用。Tower結(jié)構(gòu)域與CoREST的2個(gè)SANT結(jié)構(gòu)域中間一個(gè)很長(zhǎng)的連接α螺旋相互作用,使LSD1和CoREST形成緊密的復(fù)合物,進(jìn)而使核小體去甲基化,Tower結(jié)構(gòu)域的缺失突變會(huì)導(dǎo)致LSD1喪失活性(圖1)。
結(jié)構(gòu)同源分析顯示,LSD1是核內(nèi)黃素依賴的單胺氧化酶,LSD1只能使H3K4的單甲基化及雙甲基化去甲基化,對(duì)三甲基化的H3K4沒有作用,因?yàn)槿谆蟮腘上沒有多余的質(zhì)子,也就沒有胺氧化酶的作用位點(diǎn),這一方面符合單胺氧化酶的作用機(jī)制,同時(shí)也說明存在其他類型的酶催化三甲基化H3K4的去甲基作用。研究發(fā)現(xiàn),包含JmjC結(jié)構(gòu)域的組蛋白去甲基化酶(JmjC domain-containin his?tone demethylase,JHDM)家族可以催化組蛋白三甲基(me3)的去甲基化修飾。
LSD1與底物反應(yīng)時(shí)FAD從甲基化的組蛋白賴氨酸得到質(zhì)子,生成FADH2,甲基化的賴氨酸失去質(zhì)子生成亞胺中間物,進(jìn)而FADH2被氧化生成FAD和H2O2,亞胺中間物加水后生成胺基和甲醛。LSD1催化氧化反應(yīng)時(shí)胺基底物上必須有一個(gè)質(zhì)子,因此只能催化單甲基化和二甲基化的賴氨酸底物去甲基化。
圖1 LSD1結(jié)構(gòu)域
圖2 組蛋白去甲基化反應(yīng)機(jī)理A:LSD1的催化反應(yīng)機(jī)理;B:含有JmjC催化結(jié)構(gòu)域的組蛋白去甲基化酶的催化反應(yīng)機(jī)理
實(shí)驗(yàn)表明,在體外組蛋白賴氨酸去甲基化酶是有活性的,即僅僅是酶與底物的簡(jiǎn)單結(jié)合就能夠充分完成去甲基化反應(yīng),這就提高了酶在活體內(nèi)的調(diào)控,并且有效避免了可能的不正確的去甲基化反應(yīng)發(fā)生,而其調(diào)控的方法之一正是在去甲基化酶基因表達(dá)水平上進(jìn)行調(diào)控。事實(shí)上,許多去甲基化酶都能夠限制胚胎發(fā)展及其在成人期間表達(dá)模式,以及對(duì)于環(huán)境刺激的應(yīng)對(duì)能力。
一些去甲基化酶似乎在一個(gè)特定的生物過程中對(duì)生物體起著保護(hù)作用。例如,從裂殖酵母到小鼠等廣泛的生物研究試驗(yàn)表明,在減數(shù)分裂中去甲基化酶LSD1在H3K4二甲基化/單甲基化中起著支持作用。哺乳動(dòng)物中,LSD1在小鼠睪丸及相關(guān)組織中有較高水平的表達(dá),而這些組織中H3K4的二甲基化表達(dá)水平相對(duì)較低[13]。果蠅的LSD1同源突變體導(dǎo)致性別特異性胚胎致死及存活者的不育(主要發(fā)生在雌性中),這可能是卵巢發(fā)育缺陷所致[14]。H3K4二甲基化水平在雜合子雌性的原始生殖干細(xì)胞中有較高的表達(dá)水平,而且體外實(shí)驗(yàn)表明果蠅的LSD1蛋白質(zhì)對(duì)于H3K4二甲基化/單甲基化具有去甲基化酶活性[15],并且其在哺乳動(dòng)物和果蠅之間均具有保守的酶特異性。最后,裂殖酵母LSD1同源突變體對(duì)于孢子是單倍不足的??傊@些數(shù)據(jù)表明LSD1在減數(shù)分裂和生殖細(xì)胞中起到支持保護(hù)作用。
生化研究表明,LSD1存在于包含許多已知或假定的DNA結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子的蛋白質(zhì)復(fù)合體中。這些DNA結(jié)合因子包括轉(zhuǎn)錄起始因子TFⅡ-Ⅰ[16]、E-鈣黏著蛋白啟動(dòng)子結(jié)合因子ZEB1/2[8]和ZNF217[17]及雄性激素受體(AR)[18],這表明DNA結(jié)合因子在某些特殊位點(diǎn)上對(duì)于LSD1的富集和穩(wěn)定起重要作用。而有證據(jù)表明,轉(zhuǎn)錄因子還能調(diào)節(jié)去甲基化酶的活性以及改變它們?cè)谵D(zhuǎn)錄調(diào)控中的作用。最近的研究表明,LSD1也存在于包含延伸因子RNA聚合酶ELL、pTEFb、AF4和AFF4的轉(zhuǎn)錄延伸復(fù)合體中[19]。
有研究表明,在體促素和垂體催乳素細(xì)胞的Gh啟動(dòng)子中發(fā)現(xiàn)了2種形式的LSD1復(fù)合體[20]。在體促素細(xì)胞中,積極轉(zhuǎn)錄的Gh被LSD1-WDR5復(fù)合體所占據(jù),在垂體催乳素細(xì)胞中,Gh啟動(dòng)子被LSD1-CoREST-CtBP輔助抑制復(fù)合物所占據(jù),從而導(dǎo)致轉(zhuǎn)錄抑制。由于ZEB1的誘導(dǎo)與Gh的抑制相關(guān),推測(cè)ZEB1直接結(jié)合到CoREST-CtBP與LSD1的復(fù)合體上,復(fù)合物的總體結(jié)構(gòu)轉(zhuǎn)變?yōu)橐种颇P?。在?duì)AR敏感的啟動(dòng)子PSA的研究中也發(fā)現(xiàn)了相似的模型,在PSA上LSD1與KDM4C/JMJD2C相互結(jié)合約束,但是當(dāng)AR結(jié)合時(shí)去甲基化的H3K9二甲基化/單甲基化被釋放出來[18,21-22]。這些研究表明LSD1去甲基化酶活性可以通過DNA結(jié)合因子來調(diào)控。在這些情況下,最初的靶基因以及隨后通過去甲基化酶結(jié)合在靶基因位點(diǎn)上的修飾可能是由于一些未知的DNA結(jié)合因子、RNA因子、局部的染色質(zhì)環(huán)境或一些還不明確的機(jī)制。
圖3 LSD1協(xié)同相關(guān)蛋白質(zhì)輔因子特異性調(diào)控去甲基化
LSD1作為多個(gè)轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)復(fù)合物的組分參與轉(zhuǎn)錄調(diào)控,其去甲基化酶活性也受復(fù)合物中其他分子的調(diào)控。如LSD1能使組蛋白上的H3K4去甲基化,單獨(dú)LSD1作用不能使H3K9去甲基化[4],然而與雄激素受體結(jié)合后LSD1也可催化H3K9去甲基化(圖3A)[18]。但是不能以核小體作為底物,使核小體去甲基化,只有當(dāng)LSD1與CoREST結(jié)合后才能以核小體為底物使之去甲基化[23-24],而BHC80抑制LSD1-CoREST復(fù)合物介導(dǎo)的核小體去甲基化作用,從而調(diào)控基因轉(zhuǎn)錄(圖3B)[23]。在體內(nèi),LSD1存在于組蛋白去乙?;笍?fù)合物中,這一復(fù)合物中還包含其他蛋白如CoREST、BHC80、HDAC1/2、BRAF等,這些蛋白能調(diào)控LSD1的活性[10,24]。CoREST為L(zhǎng)SD1發(fā)揮活性提供了一座橋梁,使LSD1能接觸底物核小體組蛋白,并且還能穩(wěn)定核內(nèi)LSD1[23,25]。一方面組蛋白H3中賴氨酸4的去甲基化與染色質(zhì)的濃縮和轉(zhuǎn)錄抑制相關(guān);另一方面,組蛋白H3的賴氨酸9去甲基化與染色質(zhì)開放構(gòu)象和基因表達(dá)相關(guān)(圖3C)。LSD1與雄激素受體結(jié)合后介導(dǎo)的H3K9與基因轉(zhuǎn)錄激活相關(guān)[18],但雄激素受體元件是如何與配體結(jié)合,通過哪些未知因子共同發(fā)揮作用的詳細(xì)機(jī)制尚不清楚。
LSD1、CoREST和BHC80通常存在于同一個(gè)組蛋白去乙酰化酶復(fù)合物中。LSD1對(duì)低乙酰化組蛋白的去甲基化作用明顯高于高乙?;慕M蛋白,說明轉(zhuǎn)錄抑制復(fù)合物中的組蛋白去乙酰酶有利于LSD1發(fā)揮去甲基酶活性。如在LSD1/CoREST復(fù)合物中,HDAC1/2催化H3K9去乙酰化,使CoREST結(jié)合于去乙?;稽c(diǎn)。在CoREST存在的情況下,LSD1催化H3K4me2去甲基化,而后LSD1另一個(gè)相互作用的蛋白BHC80結(jié)合于H3K4me0位點(diǎn),阻止H3K4的再次甲基化作用(圖4)[26]。然而,BHC80與LSD1相互作用的機(jī)制尚不清楚。
在正常的造血系統(tǒng)生成過程中,各種轉(zhuǎn)錄因子通常以組合的方式對(duì)正常細(xì)胞環(huán)境中的特定靶基因發(fā)揮調(diào)節(jié)作用,造血干細(xì)胞經(jīng)歷了一系列的基因表達(dá)的動(dòng)態(tài)調(diào)控,在促進(jìn)其分化為成熟紅細(xì)胞的同時(shí)也抑制了一些抑分化基因的表達(dá)。轉(zhuǎn)錄因子所形成的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)對(duì)于維持正常的造血細(xì)胞分化起到了至關(guān)重要的作用,當(dāng)這種動(dòng)態(tài)的調(diào)控失衡,正常的造血細(xì)胞分化過程發(fā)生紊亂,就誘發(fā)了白血病的發(fā)生。細(xì)胞分化發(fā)生異常,細(xì)胞表面壓力發(fā)生改變,喪失對(duì)分化刺激因素產(chǎn)生反應(yīng)的能力,分化障礙的未成熟紅細(xì)胞不斷產(chǎn)生,無限增殖,并大量涌入外周血液中,形成白血病。白血病的發(fā)生機(jī)制與基因?qū)用嫔系恼{(diào)控及表觀遺傳學(xué)修飾的異常均具有密不可分的聯(lián)系[27]。
LSD1在惡性造血系統(tǒng)中高表達(dá),對(duì)于造血系統(tǒng)的分化具有重要的調(diào)控作用[28]。在正常的造血系統(tǒng)分化過程中,造血干細(xì)胞分化為早期前祖細(xì)胞進(jìn)而最終分化成成熟紅細(xì)胞,任何時(shí)期所產(chǎn)生的突變均有可能導(dǎo)致惡性增殖的發(fā)生發(fā)展。TAL1是早期造血干細(xì)胞特異性調(diào)控因子之一,它的異常表達(dá)會(huì)導(dǎo)致T細(xì)胞白血病的產(chǎn)生。Hu等[29]于2009年首次在TAL1復(fù)合體中分離出由LSD1、HDAC1/2、Co-REST組成的去甲基化酶復(fù)合體,經(jīng)大量實(shí)驗(yàn)證明LSD1復(fù)合物通過表觀遺傳修飾作用對(duì)紅細(xì)胞分化的相關(guān)基因表達(dá)發(fā)揮動(dòng)態(tài)調(diào)控功能,在造血系統(tǒng)的生成及紅細(xì)胞分化過程中具有重要意義,并在白血病的發(fā)生發(fā)展過程中充當(dāng)重要角色。LSD1蛋白的過量表達(dá)可促進(jìn)紅細(xì)胞增殖,同時(shí)抑制紅細(xì)胞分化。LSD1通過與TAL1結(jié)合調(diào)控TAL1靶基因啟動(dòng)子活性,改變其位點(diǎn)的甲基化修飾水平,從而調(diào)控機(jī)體造血系統(tǒng)的發(fā)生發(fā)展、紅細(xì)胞的增殖分化。LSD1的表達(dá)沉默抑制紅細(xì)胞分化,而過量表達(dá)LSD1蛋白同樣也抑制紅細(xì)胞的分化,這說明LSD1在機(jī)體造血系統(tǒng)中發(fā)揮重要作用,無論是未分化的紅細(xì)胞還是已分化的紅細(xì)胞都需要LSD1蛋白的存在,也許LSD1可通過與紅細(xì)胞特異性轉(zhuǎn)錄因子如TAL1或Gfi1b相結(jié)合調(diào)控紅細(xì)胞的分化[29-30]。
前期工作的另一方面根據(jù)大量的實(shí)驗(yàn)結(jié)果大膽假設(shè)了一個(gè)LSD1和TAL1的分子機(jī)制模型,如圖5所示。當(dāng)TAL1與LSD1、HDAC1蛋白抑制復(fù)合體相結(jié)合時(shí),染色體結(jié)構(gòu)上組蛋白發(fā)生去甲基化修飾,LSD1復(fù)合體可抑制TAL1介導(dǎo)的轉(zhuǎn)錄活性,并調(diào)控紅細(xì)胞分化中特異性蛋白的表達(dá),從而抑制紅細(xì)胞的分化。但隨著紅細(xì)胞的分化,TAL1與LSD1的相互作用減少并發(fā)生轉(zhuǎn)換,又可與其他轉(zhuǎn)錄激活蛋白質(zhì)相互作用,如p300、PCAF、hSET1,并重新修飾組蛋白,導(dǎo)致染色體結(jié)構(gòu)開放,提高轉(zhuǎn)錄水平,促進(jìn)紅細(xì)胞的增殖和分化。所以,LSD1以表觀遺傳修飾的方式調(diào)控TAL1的功能和機(jī)體造血系統(tǒng)。也正是TAL1-LSD1中蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)之間的相互作用,調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄及基因表達(dá),從而在機(jī)體造血系統(tǒng)及紅細(xì)胞分化中發(fā)揮功能。
圖4 LSD1介導(dǎo)的H3K4去甲基化調(diào)控的表觀遺傳機(jī)制
圖5 LSD1調(diào)控紅細(xì)胞分化及白血病發(fā)生的分子模型
Notch1信號(hào)的異常激活會(huì)導(dǎo)致致癌性轉(zhuǎn)化并最終導(dǎo)致T細(xì)胞急性淋巴白血?。═-ALL)的發(fā)生,最近發(fā)現(xiàn)LSD1參與到了Notch1的多功能復(fù)合體中。在T-ALL中,LSD1所介導(dǎo)的表觀遺傳學(xué)修飾作用對(duì)于Notch1靶基因的激活與抑制發(fā)揮著非常重要的動(dòng)態(tài)調(diào)控功能。當(dāng)有Notch1的協(xié)同作用時(shí),LSD1特異性結(jié)合于H3K9me2位點(diǎn)發(fā)揮去甲基化作用進(jìn)而激活靶基因的表達(dá),相反,當(dāng)Notch1缺失后,這種去甲基化酶通過催化H3K4me2的去甲基化達(dá)到抑制轉(zhuǎn)錄的目的。LSD1的這種動(dòng)態(tài)調(diào)控機(jī)制對(duì)于T-ALL的發(fā)生發(fā)展具有重要意義[31]。
LSD1在多種人類急性髓系白血?。ˋML)中列于具有高度表達(dá)的基因中的前5%[32]。Harris等[33]通過建立患白血病的小鼠模型,確定了LSD1在AML生成過程中所發(fā)揮的重要調(diào)控作用,建立了LSD1過表達(dá)和AML白血病之間的聯(lián)系。研究發(fā)現(xiàn),LSD1的敲除會(huì)使AML細(xì)胞顯著喪失白血病細(xì)胞無限增殖分化的潛能,不能形成克隆,在小鼠模型中不會(huì)導(dǎo)致白血病的發(fā)生。由LSD1高表達(dá)介導(dǎo)的表觀遺傳修飾所導(dǎo)致的基因沉默,與疾病的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān),LSD1可能通過直接或間接的方式調(diào)控造血系統(tǒng)中一些重要轉(zhuǎn)錄因子和染色質(zhì)重塑相關(guān)酶的表達(dá),很可能通過調(diào)控一系列基因表達(dá)進(jìn)而激活MLLAF9白血病相關(guān)癌基因。CHIP-Seq實(shí)驗(yàn)顯示,LSD1沉默后,H3K4me2水平的增加是MLL-AF9啟動(dòng)子上可以檢測(cè)到的惟一變化。LSD1抑制劑會(huì)導(dǎo)致被異常沉默的抑癌基因獲得激活從而重新表達(dá)[34]。這些結(jié)果無一不證實(shí)了在AML白血病中,LSD1所發(fā)揮的去甲基化功能和白血病相關(guān)的致癌基因具有密不可分的關(guān)系。鑒于這些重要發(fā)現(xiàn),LSD1在調(diào)控基因表達(dá)及MLL細(xì)胞分化過程中均發(fā)揮著重要作用,但LSD1在靶基因位點(diǎn)作用機(jī)制以及募集的蛋白復(fù)合體還有待更深一步的探究。
綜上所述,LSD1在調(diào)控致癌基因的表達(dá)[33]及造血系統(tǒng)生成、紅細(xì)胞分化過程[29]中發(fā)揮著重要作用,因而這一重要的表觀遺傳學(xué)調(diào)節(jié)因子可能成為白血病治療中的重要靶標(biāo)。
目前對(duì)于LSD1及組蛋白去甲基化酶有比較深入的研究,但仍有許多問題有待解決,今后的研究將主要關(guān)注LSD1與白血病的關(guān)系。TAL1可以結(jié)合一些輔助抑制物,如 mSin3A、HDAC及ETO-2[35-37],從而在造血過程中發(fā)揮轉(zhuǎn)錄抑制作用。LSD1是賴氨酸特異性的去甲基化酶,它可以特異去除單甲基或雙甲基的H3K4。CoREST和HDAC1/2能夠極大地增強(qiáng)LSD1的去甲基化酶活性[10,23-24,38]。
CoREST、HDAC1/2及其他未知蛋白能與LSD1相結(jié)合,這對(duì)于LSD1的酶活力以及轉(zhuǎn)錄抑制是必須的[39-40]。但這些復(fù)合物在正?;虍惓5沫h(huán)境中對(duì)于TAL1和LSD1的調(diào)控有什么不同,目前還不清楚。我們認(rèn)為,在LSD1與其相關(guān)復(fù)合物之間的蛋白與蛋白的相互作用控制著它的酶活性及底物特異性,并且很有可能在TAL1/LSD1復(fù)合體中存在某些未知的成分,而正是這些成分控制著TAL1或LSD1在造血過程中的作用。敲除LSD1會(huì)造成鼠紅白血病細(xì)胞MEL細(xì)胞及鼠類肝細(xì)胞中造血分化的紊亂,這表明廣泛表達(dá)的LSD1可能是通過與組織特異性的轉(zhuǎn)錄因子相互作用控制著組織特異性的造血分化過程。因此,LSD1與造血系統(tǒng)特異性的抑制因子Gfi-1b相互作用,共同影響紅細(xì)胞、巨核細(xì)胞及粒性白細(xì)胞的分化[30]。有研究表明[30]LSD1通過造血特異性轉(zhuǎn)錄因子的誘導(dǎo)來發(fā)揮其抑制活性,并且控制造血限制性基因的表達(dá),例如TAL1和Gfi-1b。一系列證據(jù)表明,TAL1和Gfi-1b能夠相互作用,并且可能共同存在于一條轉(zhuǎn)錄途徑中。另外,輔助抑制物ETO-2能夠影響紅細(xì)胞中TAL1與Gfi-1b之間的相互作用,但目前并不確定ETO-2與TAL1、Gfi-1b及LSD1是否存在于相同的復(fù)合體中。
有報(bào)道表明,在紅細(xì)胞分化過程中TAL1能夠動(dòng)態(tài)地與激活因子或抑制因子相互作用。我們?cè)谖捶只腗EL細(xì)胞中發(fā)現(xiàn)TAL1與LSD1相結(jié)合并具有去甲基酶活性,但在分化后第1天這種活性就消失了,而在分化的后期復(fù)合體的活性又得到恢復(fù)[29]。對(duì)于在紅細(xì)胞分化過程中TAL1/LSD1的動(dòng)態(tài)相互作用,有2種可能的解釋。一是,在祖細(xì)胞中,LSD1擁有限制這些細(xì)胞分化的能力;而細(xì)胞一旦分化,LSD1的功能即轉(zhuǎn)變?yōu)橐种芓AL1的靶基因,這些靶基因能夠促進(jìn)細(xì)胞分化。在這種觀點(diǎn)的支持下,敲除LSD1后,在細(xì)胞分化過程中TAL1啟動(dòng)子p4.2位點(diǎn)上H3K4甲基化及組蛋白乙酰化水平增高。另外一種可能性是,LSD1蛋白復(fù)合體改變了其輔酶的組成,這有可能改變其酶的特異性。例如,當(dāng)雄激素受體與LSD1結(jié)合,其將會(huì)通過去甲基作用抑制單甲基或雙甲基的H3K9的標(biāo)記改變LSD1的底物特異性,這會(huì)促進(jìn)AR依賴的轉(zhuǎn)錄活性。因此,LSD1通過敲除某些特定的表觀遺傳標(biāo)記進(jìn)而產(chǎn)生一種緊湊或?qū)捤傻娜旧|(zhì)環(huán)境,從而能夠抑制或激活轉(zhuǎn)錄。在這種觀點(diǎn)的支持下,LSD1應(yīng)該在造血系統(tǒng)中具有雙重功能,并且我們?cè)贘urkat細(xì)胞中發(fā)現(xiàn)TAL1與LSD1形成的2種復(fù)合體。二是,LSD1與TAL1具有直接相互作用,且結(jié)合結(jié)構(gòu)域?yàn)門AL1的142~185殘基,TAL1的該結(jié)構(gòu)域中含有一個(gè)可以被蛋白質(zhì)激酶A(PKA)磷酸化的氨基酸殘基Ser172,這個(gè)位點(diǎn)的磷酸化作用可以影響TAL的轉(zhuǎn)錄調(diào)控作用。有研究表明TAL1與LSD1之間的動(dòng)態(tài)結(jié)合是通過PKA介導(dǎo)的TAL1 Ser172位點(diǎn)的磷酸化作用完成的,PKA信號(hào)通路可以調(diào)控紅細(xì)胞分化過程和T細(xì)胞白血病生成中TAL1與LSD1的相互作用,TAL1 Ser172位點(diǎn)的磷酸化能夠破壞TAL1與組蛋白LSD1間的結(jié)合,導(dǎo)致紅細(xì)胞分化過程和T細(xì)胞白血病生成中某些TAL1靶基因的激活。TAL1可以被蛋白質(zhì)激酶PKA在體內(nèi)或體外磷酸化,盡管這一磷酸化作用不會(huì)影響TAL1的細(xì)胞內(nèi)定位及其與E2A蛋白質(zhì)形成二聚體的能力,但能夠改變TAL1結(jié)合某些DNA的能力,從而影響其轉(zhuǎn)錄活性。
LSD1在造血過程中發(fā)揮怎樣的生物學(xué)作用呢?LSD1通過調(diào)節(jié)激活或抑制染色質(zhì)結(jié)構(gòu)域來調(diào)控基因表達(dá)。它可能通過干擾正常細(xì)胞生長(zhǎng)分化所需要的正?;虻谋磉_(dá)模式,從而與人類疾病密切相關(guān)。TAL1的激活與許多T-ALL患者密切相關(guān)。在T細(xì)胞白血病中,TAL1抑制E2A/HEB的轉(zhuǎn)錄活性,并且在正常的胸腺細(xì)胞進(jìn)行大量細(xì)胞分裂階段中干擾細(xì)胞周期進(jìn)程。因此,LSD1結(jié)合TAL1從而抑制其轉(zhuǎn)錄活性的機(jī)制可能是,LSD1通過結(jié)合TAL1而抑制E2A/HEB的活性,進(jìn)而導(dǎo)致白血病的發(fā)生。
隨著對(duì)組蛋白修飾研究的逐步深入,幾種組蛋白修飾酶如組蛋白去乙?;敢殉蔀槟[瘤治療的靶蛋白。已有許多研究表明,組蛋白甲基化和去甲基化間的平衡與人類包括白血病在內(nèi)的多種疾病緊密相關(guān)。在前列腺癌[41]、成神經(jīng)細(xì)胞瘤[42]、非小細(xì)胞性肺癌[43]、ER陰性乳腺癌[44]及膀胱癌[45]中均有LSD1的高表達(dá),LSD1的抑制會(huì)導(dǎo)致這些腫瘤細(xì)胞生長(zhǎng)障礙,相反其過表達(dá)會(huì)通過某種表觀遺傳修飾途徑導(dǎo)致腫瘤的發(fā)生。近來研究發(fā)現(xiàn),LSD1在白血病細(xì)胞中同樣過表達(dá)[46]。以反苯環(huán)丙胺衍生物為例的多種LSD1小分子抑制劑被開發(fā)出來,其可以顯著抑制白血病細(xì)胞分化,并具有增強(qiáng)抗白血病藥物療效的作用[47]。LSD1有望成為白血病表觀遺傳修飾治療的新靶點(diǎn),為白血病藥物開發(fā)提供了新的方向,以期為提高患者治愈率,延長(zhǎng)生存期提供依據(jù)。更加深入地探究LSD1與白血病發(fā)生的相關(guān)機(jī)制,具有十分重要的臨床意義。
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