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河南省間日瘧原蟲環(huán)子孢子蛋白基因序列分析*

2014-08-31 06:15周瑞敏趙玉玲趙旭東許汴利張紅衛(wèi)
關(guān)鍵詞:瘧原蟲瘧疾孢子

劉 穎,周瑞敏,趙玉玲,趙旭東,許汴利,張紅衛(wèi)

河南省疾病預(yù)防控制中心寄生蟲病所 鄭州 450016

河南省間日瘧原蟲環(huán)子孢子蛋白基因序列分析*

劉 穎,周瑞敏,趙玉玲,趙旭東,許汴利,張紅衛(wèi)#

河南省疾病預(yù)防控制中心寄生蟲病所 鄭州 450016

#通訊作者,男,1969年9月生,博士,副主任醫(yī)師,研究方向:寄生蟲病防治,E-mail:zhwei69@163.com

河南;間日瘧原蟲;環(huán)子孢子蛋白;基因型

目的:探討河南省間日瘧原蟲環(huán)子孢子蛋白(CSP)的基因型分布。方法收集經(jīng)鏡檢確診的河南省2011年間日瘧患者血標本34份,24例患者為河南籍,發(fā)病前無外出到其他省份或國家的歷史,10例患者有明確外出史。用核酸提取試劑盒提取濾紙血中瘧原蟲DNA,進行巢式PCR擴增,對擴增產(chǎn)物進行序列測定和基因進化特征分析。結(jié)果24份本地病例分離所得的本地株間日瘧原蟲CSP均屬于PV-Ⅰ型,又可分為A和B 2個基因型;氨基酸同源性分析結(jié)果顯示,A型與VK210的同源性達90.6%~94.2%,B型為71.6%。結(jié)論河南省間日瘧原蟲CSP的基因型均屬PV-Ⅰ型,可以進一步分為2個基因型,與其他國家的基因型顯著不同。

瘧疾是以按蚊為傳播媒介的重要蟲媒傳染病。間日瘧原蟲(Plasmodiumvivax,P.vivax)廣泛分布于亞洲、南美洲的多個地區(qū)[1-2],包含許多株、型,不同地理株瘧原蟲的生物學特性、對媒介按蚊的感染力、對人類宿主的免疫原性以及對抗瘧藥物的敏感性都有明顯的差異,并直接影響間日瘧的流行過程,關(guān)系到防治策略和措施的制定[3]。河南省歷史上曾是瘧疾高發(fā)區(qū),20世紀70年代發(fā)病率達到17%[4],經(jīng)過廣大瘧疾防治工作者幾十年的艱苦努力,全省瘧疾發(fā)病已降至較低水平[5],到2012年已無本地病例報告,但是輸入性病例在持續(xù)增加,傳播媒介依然存在,這些輸入性病例不但會成為重要的傳染源而引起間日瘧的再度流行[6],還可能會引起不同地理株瘧原蟲基因的重組,使間日瘧原蟲種群復(fù)雜化[7],也使得河南省的瘧疾防治工作面臨新的挑戰(zhàn)。間日瘧原蟲環(huán)子孢子蛋白(circumsporozoite protein,CSP)中央重復(fù)單元具有種屬特異性,是研究得較深入、應(yīng)用較頻繁的一個基因分型標志[8]。為了解河南省間日瘧原蟲的基因型特點,作者對河南省2011年經(jīng)鏡檢確診的間日瘧患者的瘧原蟲分離株進行了CSP基因序列分析,報道如下。

1 材料與方法

1.1標本來源2011年1月~12月,在河南省全省范圍內(nèi)共收集到34份經(jīng)鏡檢確診為間日瘧患者的血標本,均來自河南省瘧疾參比實驗室。其中24例患者是河南籍,分別來自周口、南陽、商丘、駐馬店,發(fā)病前沒有外出到其他省份或國家的歷史,被視為“本地病例”,其瘧原蟲分離株稱為“本地株”;10例發(fā)病前有明確的外出至柬埔寨、緬甸、騰沖、印度的歷史,被視為“輸入病例”,其瘧原蟲分離株稱為“輸入株”。

1.2試劑及設(shè)備Go Taq Green Master Mix試劑購自Promage公司,瓊脂糖購自TaKaRa公司。核酸提取試劑盒購自Qiagen公司,PCR擴增儀、凝膠成像系統(tǒng)為Bio-RAD公司產(chǎn)品。

1.3CSP基因型的檢測

1.3.1 DNA提取 將血樣制作成濾紙血,常溫干燥后,-4 ℃保存?zhèn)溆?。用核酸提取試劑盒提取濾紙血中瘧原蟲DNA,按照說明書操作,獲得的DNA于-20 ℃保存。

1.3.2 引物 針對間日瘧原蟲CSP基因,參照文獻[9]設(shè)計引物。第一輪引物序列:上游引物(F1)5’-ATGTAGATCTGTCCAAGGCCATAAA-3’,下游引物(R1)5’-TAATTGAATAATGCTAGGACTAACAATATG-3’。第二輪引物序列:上游引物(F2)5’-GCAGAAC CAAAAAATCCACGTGAAAATAAG-3’,下游引物(R2)5’-CCAACGGTAGCTCTAACTTTATCTAGGTAT-3’。引物均由上海生工生物工程有限公司合成。

1.3.3 巢式PCR 擴增反應(yīng)分兩輪進行。第一輪:擴增體系為2×PCR Master Mix 10 μL,模板DNA 1 μL,引物F1、R1(10 mol/L)各1 μL,用ddH2O補至20 μL。擴增條件為95 ℃ 4 min;95 ℃ 1 min,58 ℃ 1 min,72 ℃ 1 min,共25個循環(huán);72 ℃延伸7 min。產(chǎn)物4 ℃保存?zhèn)溆?。第二輪:以第一輪擴增產(chǎn)物為模板。反應(yīng)體系為2×PCR Master Mix 20 μL,第一輪產(chǎn)物2 μL, 引物F2、R2(10 mol/L)各2 μL,用ddH2O補至40 μL。擴增條件為95 ℃ 4 min;95 ℃ 1 min,62 ℃ 1 min,72 ℃ 1 min,共30個循環(huán);72 ℃延伸7 min。產(chǎn)物4 ℃保存?zhèn)溆?。?0 μL第二輪擴增產(chǎn)物進行15 g/L瓊脂糖凝膠電泳,Goldview染色,用凝膠成像系統(tǒng)觀察結(jié)果。

1.3.4 測序分析 將第二輪擴增產(chǎn)物委托上海生工生物工程有限公司進行雙向測序,得到相關(guān)序列,使用ChromasPro軟件對正、反向序列進行拼接,使用Bioedit對核苷酸序列進行整理并轉(zhuǎn)換成氨基酸序列。從GenBank中調(diào)出VK210代表株M28746、VK247代表株M28745[4]、中國株U08977、印度株FJ491128、緬甸株AF316584的序列作為參考,用clustalx軟件對這些參考株與實驗用分離株的序列進行比對,分析其中央重復(fù)單元序列的多態(tài)性,并用Mega4.0構(gòu)建系統(tǒng)進化樹。

2 結(jié)果

2.1PCR產(chǎn)物鑒定結(jié)果34份血樣提取的DNA,經(jīng)二輪PCR擴增后,均按照預(yù)期出現(xiàn)了一條750 bp左右的條帶,見圖1。

圖1 巢式PCR 擴增間日瘧原蟲CSP基因結(jié)果

2.2氨基酸序列一致性分析見圖2。序列比對結(jié)果顯示,34株中共觀察到13個不同的序列,其中有33株的CSP中央重復(fù)單元為GDRA(A/D)GQPA,與VK210一致;有1株為NGAGNQPG,與VK247一致。其中本地株的序列均為VK210型,但序列間又存在不同,可進一步分為7種。輸入株中共觀察到6個序列,1個與VK247一致,5個與VK210一致,且與本地株不同。

2.3同源性分析從所構(gòu)建的進化樹(圖3)可以看出: 24個本地株均屬VK210型,但與VK210代表株M28746存在差異,可以分為基因型A和基因型B?;蛐虯可以進一步劃分為A1、A2和A3 3個亞型。同源性分析結(jié)果(表1)顯示:A1、A2和A3亞型的同源性為93.0%~99.4%,與VK210代表株M28746的同源性為90.6%~94.2%,與中國株U08977(VK210型)的同源性為94.2%~97.7%,與VK247代表株M28745的同源性為16.2%~21.3%?;蛐虰與VK210代表株M28746的同源性為71.6%,與中國株U08977的同源性為72.3%,與VK247代表株M28745的同源性為38.3%。

圖2 序列比對

圖3 系統(tǒng)進化樹

表1 本地株與其他株CSP的同源性 %

3 討論

間日瘧原蟲CSP中央重復(fù)單元氨基酸的組成有兩種:PV-Ⅰ型是全球普遍流行的優(yōu)勢型,其CSP中央重復(fù)單元類似VK210型,已報道的很多分離株都屬于此型;PV-Ⅱ型的CSP中央重復(fù)單元類似VK247型[10]。不同地區(qū)來源的間日瘧原蟲分離株顯現(xiàn)出明顯的多態(tài)性[11],因此,分析CSP的序列可以檢測瘧原蟲的地理來源[1]。

此次研究采用巢式PCR法對河南省2011年的34份間日瘧患者的血樣做了初步分析,結(jié)果顯示: 34株中,只有一株來自騰沖的輸入株CSP中央重復(fù)單元是PV-Ⅱ型;其他33株全是PV-Ⅰ型,但重復(fù)單位的數(shù)目和位置不盡相同,24個本地株由20個及以上(20~22)的重復(fù)單位組成,9個輸入株由20個以下(17~19)的重復(fù)單位組成。24個本地株與10個輸入株的CSP中央重復(fù)單元九肽重復(fù)單位的數(shù)目、類型、位置差異均非常顯著。24個本地株的序列可以分為兩個基因型:基因型A與VK210代表株、中國株的同源性都在90%以上,與VK247代表株的同源性在20%左右;基因型B與VK210代表株、中國株的同源性則在72%左右,與VK247代表株的同源性為38.3%。

通過以上分析,作者認為可以使用CSP作為分子標記來區(qū)分瘧疾病例是本地病例還是輸入病例。該研究選用的中國參考株U08977與河南省的CSP基因型差異很明顯,可能是因為U08977采自廣西北部與貴州邊界[5],該地與河南省在緯度、氣候等方面都存在很大的差異,而河南省與周邊省份的間日瘧原蟲CSP基因型是否存在差異,還有待于進一步的研究。

[1]Choi KM,Choi YK,Kang YA,et al.Study of the genetic discrimination between imported and autochthonous cases of malaria in South Korea[J].J Travel Med,2011,18(1):63

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[4]許汴利,蘇云普,劉穎,等.1970-2010年瘧疾防治效果評價[J].河南預(yù)防醫(yī)學雜志,2011,22(5):321

[5]劉穎,周瑞敏,蘇云普.河南省2011年瘧疾疫情分析[J].現(xiàn)代預(yù)防醫(yī)學,2013,40(15):2900

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(2013-09-05收稿 責任編輯王 曼)

Genetic sequence analysis of circumsporozoite protein ofPlasmodiumvivaxfrom Henan Province

LIUYing,ZHOURuimin,ZHAOYuling,ZHAOXudong,XUBianli,ZHANGHongwei

ParasiteDiseaseInstitute,CenterforDiseaseControlandPreventionofHenanProvince,Zhengzhou450016

Henan;Plasmodiumvivax;circumsporozoite protein;genotype

Aim:To explore circumsporozoite protein(CSP) genotypes structure ofPlasmodiumvivax(P.vivax) in Henan.Methods:Blood samples of 34 malaria patients from Henan Province in 2011 were collected to extract DNA,and amplified using nested PCR technique, and the product was sequenced and analyzed. Results:The results showed that the 24 specimens from Henan indigenous cases all belonged to PV-Ⅰ; amino acid homology analysis showed that the specimens could be divided into two genotypes: A and B, the sequence of type A showed 90.6%-94.2% homology to VK210, while type B showed 71.6%. Conclusion: TheP.vivaxCSP genotype of Henan all belongs to PV-Ⅰ, and it can be further divided into two genotypes, which is significantly different from other countries.

10.13705/j.issn.1671-6825.2014.03.004

*河南省科技攻關(guān)計劃項目 092102310007

R382.3

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