田文靜,楊燕,呂占云,孫祖真
作者單位濟(jì)寧醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院神經(jīng)內(nèi)科山東 濟(jì)寧 272000
帕金森?。≒arkinson’s disease,PD)是臨床上較為常見的神經(jīng)系統(tǒng)疾病,相關(guān)研究顯示PD近年來發(fā)病率呈現(xiàn)出一定上升趨勢[1,2]。臨床上PD的長期發(fā)生發(fā)展可以導(dǎo)致患者致殘率和病死率的上升,臨床預(yù)后不佳[3]。基因多態(tài)性可以通過影響到基因轉(zhuǎn)錄或者蛋白翻譯水平的相關(guān)變化,進(jìn)而影響相關(guān)靶物質(zhì)的表達(dá)。RAB7L1基因多態(tài)性可以通過影響到多巴胺類神經(jīng)遞質(zhì)的合成和釋放,進(jìn)而影響到局部腦神經(jīng)元組織中的多巴胺的含量,進(jìn)而導(dǎo)致PD的發(fā)生發(fā)展[4,5]。RAB基因多態(tài)性研究可以為本地區(qū)PD的公共衛(wèi)生領(lǐng)域的預(yù)防或者決策提供參考。本研究選取PD患者200例,探討其RAB7L1基因rs1775143和rs823144位點(diǎn)的基因型分布,進(jìn)而為揭示基因多態(tài)性對于PD發(fā)生的影響提供理論依據(jù)。
選取2015年10月至2016年4月在我院就診的PD患者200例作為觀察組,其中男87例,女113例;年齡41~67歲,平均(51.01±8.32)歲。納入標(biāo)準(zhǔn):①濟(jì)寧地區(qū)漢族人群;②診斷符合英國帕金森協(xié)會腦庫標(biāo)準(zhǔn)[6];③患者及家屬知情同意并且簽署同意書。排除標(biāo)準(zhǔn):①繼發(fā)性PD綜合征;②合并惡性腫瘤等嚴(yán)重疾病。同時選取健康體檢者200例作為對照組,無PD家族史、自身免疫性疾病、腫瘤、感染及其他神經(jīng)系統(tǒng)疾病,其中男90例,女110例;年齡40~70歲,平均(50.92±9.42)歲。2組性別、年齡比較差異無統(tǒng)計學(xué)意義(χ2=0.091,t=0.101,均P>0.05)。
取凍存血清保存液體,10 000 r/min離心分離,每1 mL TRIZOL試劑裂解樣品中加入0.2 mL氯仿,進(jìn)行裂解操作,4℃冰上采用無酶RNA沖洗液洗滌,再次10 000 r/min離心5 min,得到RNA?;旌弦合?0℃干浴3 min,取出后立即冰水浴至管內(nèi)外溫度一致,然后加逆轉(zhuǎn)錄酶 MMLV 0.5 μ L,37℃水浴60 min,室溫放置5 min使其完全溶解,使其逆轉(zhuǎn)錄為cDNA。以β-actin為模版,在反應(yīng)體系中加入SYBR Green 1染料、上游引物、下游引物、dNTP,使總體積達(dá)20 μL ,上機(jī),反應(yīng)條件為:93℃ 2 min、93℃ 1 min、55℃ 2 min,共40個循環(huán)。PCR擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行rs1775143和rs823144基因多態(tài)性檢測:參考multiplexkit試劑盒(南京凱基生物科技有限公司)使用說明,加入各位點(diǎn)對應(yīng)延伸引物進(jìn)行單堿基測序反應(yīng),并且在ABI1310(Life Technologies,美國)進(jìn)行電泳,結(jié)果用GENEMAPPER軟件(Life Technologies,美國)進(jìn)行分析。
采用SPSS19.0分析數(shù)據(jù),采用Hardy-Weinberg平衡檢驗(yàn)樣本群體代表性。計量資料采用(±s)表示,組間比較使用t檢驗(yàn),計數(shù)資料以率表示,組間比較使用χ2檢驗(yàn),P<0.05表示差異有統(tǒng)計學(xué)意義。
RAB7L1基因rs1775143位點(diǎn)的PCR擴(kuò)增片段經(jīng)酶切后顯示3種基因型(TT型、CT型和CC型),rs823144位點(diǎn)顯示3種基因型(AA型、AC型和CC型),見圖1。
觀察組和對照組RAB7L1基因rs1775143和rs823144位點(diǎn)基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡,具有群體代表性,見表1,2。
2組rs1775143基因型和等位基因頻率比較差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05),見表3。2組rs823144基因型和等位基因頻率比較差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05),見表4。
自身免疫性因素、遺傳易感基因或者中樞神經(jīng)系統(tǒng)慢性疾病病史等,均可以導(dǎo)致PD的發(fā)生發(fā)展,特別是在年齡大于55歲的老齡人群中,PD的發(fā)病率更高,可較普通對照人群上升3~4倍[7]。近年來基礎(chǔ)研究顯示,基因水平的改變可以通過影響轉(zhuǎn)錄或者蛋白翻譯等環(huán)節(jié),進(jìn)而影響相關(guān)基因的表達(dá)?;蚨鄳B(tài)性是靶基因的部分位點(diǎn)發(fā)生的基因突變,進(jìn)而導(dǎo)致基因或者基因型的改變,影響到中樞神經(jīng)系統(tǒng)遞質(zhì)的合成和釋放[8,9]。
RAB7L1基因是編碼多巴胺末端修飾蛋白的重要基因,其rs1775143和rs823144位點(diǎn)的多態(tài)性變化可以導(dǎo)致乙酰膽堿能神經(jīng)元的相對亢進(jìn),患者可表現(xiàn)為震顫麻痹、手足徐動等癥狀[10,11]。另外,生物化學(xué)研究也顯示,RAB7L1基因相關(guān)位點(diǎn)的多態(tài)性問題,可以顯著影響神經(jīng)元對于多巴胺的再攝取[12,13]。本研究發(fā)現(xiàn),rs1775143位點(diǎn)的PCR擴(kuò)增片段經(jīng)酶切后顯示3種基因型(TT型、CT型和CC型),缺少G基因及A基因表位,提示rs1775143位點(diǎn)的基因突變主要向C或者T型等位基因轉(zhuǎn)變,而rs823144位點(diǎn)主要向A或者C型等位基因轉(zhuǎn)變。RAB7L1基因相關(guān)多態(tài)性位點(diǎn)的等位基因在向?qū)?yīng)的基因轉(zhuǎn)換或者突變的過程中,白小燕等[14]和Roses等[15]研究通過回顧性分析82例樣本量的臨床資料,發(fā)現(xiàn)rs823144位點(diǎn)的C等位基因的比例可達(dá)35%以上,而A型等位基因的比例可達(dá)55%以上,二者占據(jù)總數(shù)的80%以上,C及A型等位基因共同構(gòu)成rs823144位點(diǎn)的多態(tài)性,這與本研究的結(jié)論較為一致。Hardy Weinberg平衡是反映所選樣本群體代表性的重要指標(biāo),同時可以提供樣本統(tǒng)計結(jié)論的可靠程度,本研究中納入的rs1775143和rs823144位點(diǎn)相關(guān)等位基因的表達(dá)符合Hardy Weinberg平衡,提示所選樣本的代表性較為理想。
圖1 質(zhì)譜分型
表1 2組受試者rs1775143基因型分布(例)
表3 2組受試者rs1775143等位基因及基因型分布比較[例(%)]
表4 2組受試者rs823144等位基因及基因型分布比較[例(%)]
具體的基因型分析可以發(fā)現(xiàn),rs1775143等位基因中CT或者CC型等位基因的比例較高,提示CT或者CC等位基因型可能對于多巴胺神經(jīng)元功能的影響更為顯著。rs823144等位基因中以AC或者CC等位基因的表達(dá)比例較高,提示AC或者CC等位基因的表達(dá)可能對于PD的發(fā)生更具有臨床意義。2組rs1775143基因型和等位基因頻率比較,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05),提示rs1775143位點(diǎn)多態(tài)性可能與濟(jì)寧地區(qū)漢族人群PD的發(fā)生有一定關(guān)系;而2組rs823144基因型和等位基因頻率比較,差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05),提示rs1775143位點(diǎn)多態(tài)性可能與濟(jì)寧地區(qū)漢族人群PD的發(fā)生無關(guān)。
綜上所述,RAB7L1基因rs1775143位點(diǎn)的多態(tài)性與PD的發(fā)生具有密切關(guān)系,rs1775143等位基因中CT或者CC型與PD的發(fā)生關(guān)系更為密切。但本研究對于RAB7L1基因多態(tài)性與PD發(fā)生的具體內(nèi)在機(jī)制的研究不足,存在一定的局限性。