朱麗青,張海月,羅莎莎,方薇薇,劉斯奇,蘇看看,楊麗紅,王明山
(溫州醫(yī)科大學附屬第一醫(yī)院 醫(yī)學檢驗中心,浙江 溫州 325015)
遺傳性纖維蛋白原缺陷癥(congenital fibrinogen deficiency,CFD)是一種少見的出血性疾病,分為I型和II型2 種類型。I型患者血漿中纖維蛋白原(fibrinogen,F(xiàn)g)數(shù)量減少,包括低纖維蛋白原血癥和無纖維蛋白原血癥;II型患者血漿中Fg數(shù)量正常,但出現(xiàn)功能缺陷,主要包括異常纖維蛋白原血癥和異常低纖維蛋白原血癥[1]?;蛲蛔兪菍е翪FD的分子基礎,可發(fā)生于Fg Aα鏈、Bβ鏈和γ鏈,突變類型包括錯義突變、移碼突變、無義突變及大片段缺失等[2]。本研究對1例遺傳性低纖維蛋白原血癥進行了表型檢測和基因分析,并且運用Swiss-PdbViewer等生物信息學工具對突變進行預測分析,初步探討引起遺傳性低纖維蛋白原血癥的機制。
1.1 對象
1.1.1 病例資料:先證者,女,30歲,此次因乳腺小葉增生來溫州醫(yī)科大學附屬第一醫(yī)院就診。術前常規(guī)凝血功能檢查發(fā)現(xiàn)凝血酶原時間(prothrombin time,PT)和凝血酶時間(thrombin time,TT)輕度延長,纖維蛋白原活性(fibrinogen activity,F(xiàn)g:C)和血漿纖維蛋白原的抗原(fibrinogen antigen,F(xiàn)g:Ag)明顯降低,分別為0.82 g/L和1.19 g/L,其他凝血指標均無明顯異常,肝腎功能正常?;颊邿o訴鼻衄、出血難止、自發(fā)性出血等癥狀,亦無血栓病史。該家系的系譜圖見圖1。
圖1 遺傳性低纖維蛋白原血癥家系圖
1.1.2 正常對照:選取我院體檢中心150名健康體檢者為正常對照,用以排除基因多態(tài)性。其中男78名,女72名,年齡26~59(38.6±24.8)歲。健康對照確認無肝腎功能疾病,無出血與血栓史,采樣前均已知情同意。
1.2 方法
1.2.1 儀器:STA-R全自動凝血功能分析儀(法國STAGO公司)、Beckman Coulter LX20PRO全自動生化分析儀(美國Beckman公司)、PCR擴增儀(ABI Thermal cycler 2720,美國ABI公司)、凝膠電泳儀(上海BIO-RAD公司)、凝膠成像系統(tǒng)(上海天能公司)。
1.2.2 引物:共包括29對引物(由上海交通大學醫(yī)學院附屬瑞金醫(yī)院檢驗科王學鋒教授饋贈)[3],覆蓋了纖維蛋白原基因FGA、FGB、FGG所有外顯子及側翼序列和啟動子區(qū),其基因序列分別為:GenBank M64982、M64983、M10014。
1.2.3 試劑:常規(guī)凝血項目試劑盒為法國STAGO公司原裝配套試劑,F(xiàn)g:Ag檢測試劑盒購自浙江伊利康生物技術有限公司,血液基因組DNA提取試劑盒及PCR擴增試劑盒均購自北京天根生化科技有限公司。
1.2.4 樣本采集:本研究已通過本院倫理委員會批準,并已簽訂先證者及其家系成員的知情同意書。共采集該家系2代6名成員及正常對照組的外周血標本,用109 mmol/L枸櫞酸鈉以1:9抗凝,3 000 r/min離心10 min后,上層血漿于2 h內(nèi)進行凝血指標檢測;下層血細胞-40 ℃凍存,用于DNA抽提。
1.2.5 凝血項目分析:在Stago-R全自動血凝儀上檢測活化部分凝血活酶時間(activated partial thromboplastin time,APTT)、PT、TT、Fg:C、D-二聚體(D-dimer,D-D)和纖維蛋白(原)降解產(chǎn)物 (fibrinogen degradation product,F(xiàn)DP);Beckman Coulter LX20全自動生化分析儀上檢測Fg:Ag。
1.2.6 Fg突變位點篩查:用全血DNA抽提試劑盒提取先證者及其家系成員外周血DNA。PCR法擴增先證者FGA、FGB、FGG基因所有外顯子及側翼序列和啟動子區(qū)。PCR反應總體積為50 μL,包括PCR Master Mix 25 μL、雙蒸水18 μL、DNA模板3 μL和上下游引物各2 μL。反應條件為:94 ℃預變性5 min; 94 ℃ 30 s,56~60 ℃退火30 s,72 ℃延伸1 min; 30個循環(huán)后72 ℃延伸10 min。PCR產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳鑒定后,送上海桑尼生物科技有限公司測序分析(所用測序儀為ABI PRISM 3730)。測序結果用Chromas軟件與GeneBank中的相應序列進行比對(M64982、M64983、M10014),并對150名健康對照者進行該位點檢測,以排除基因多態(tài)性的可能。
1.2.7 生物信息學分析:基于已知的Fg結構模型(http://www.rcsb.org/pdb,PDB ID:1FZA),分別用Swiss-PDViewer、在線分析系統(tǒng)(http://www.uniprot.org/align)對突變蛋白的結構、突變位點的保守性進行預測分析。
2.1 凝血指標檢測 先證者PT和TT均輕度延長,F(xiàn)g:C和Fg:Ag明顯降低。先證者父親和兒子的Fg:C和Fg:Ag也均有不同程度降低,TT也延長,他們的D-D和FDP均在正常范圍;其他家系成員的Fg:C、Fg:Ag及相關凝血指標均在正常范圍(見表1)。
2.2 基因檢測 先證者FGB基因發(fā)現(xiàn)第3外顯子存在c.425T>G雜合突變(見圖2),導致Fg第121位亮氨酸被替換為精氨酸(Leu121Arg)。通過分析其家系成員,發(fā)現(xiàn)其父親和兒子FGB基因也攜帶有c.425T>G雜合突變。針對該突變位點,我們對150名健康體檢者的相應位點進行篩查,均未發(fā)現(xiàn)該突變,排除了基因多態(tài)性的可能性。檢索突變數(shù)據(jù)庫(http://www.geht.org/databaseang/fibrinogen)及查閱文獻顯示:該突變類型為國際上尚未見報道的新突變。
表1 先證者及其家系成員凝血指標及表型檢測結果
圖2 纖維蛋白原FGB 基因第3外顯子的測序結果
2.3 Fg Leu121Arg突變蛋白的模型預測分析 Leu121 位于FgBβ鏈三股螺旋的初始部位,緊挨著卷曲螺旋結構域,為非極性疏水氨基酸,當突變?yōu)锳rg后,改變了氨基酸的極性。Swiss-PDViewer模型預測分析發(fā)現(xiàn),當Leu121突變?yōu)锳rg后,在Arg121和Try117、Met118、Trp125之間新增了氫鍵(見圖3)。ClustalX-2.1-win軟件蛋白同源性分析發(fā)現(xiàn):Leu121在小鼠、人類、黑猩猩、犬、牛等多種脊椎動物間有較高的保守性(見表2)。
圖3 Leu121Arg突變模型分析
Fg又稱為凝血因子I,由Aα、Bβ、γ 3條多肽鏈構成,是血漿中含量最高的凝血因子,在凝血和止血過程中均起到了非常重要的作用。Fg的3條多肽鏈以對稱性二聚體(Aα、Bβ、γ)2的形式存在,分別由FGA、FGB、FGG3個獨立的基因編碼[4]。這3個基因的缺陷可導致Fg含量或(和)功能異常,分別導致遺傳性無纖維蛋白原血癥、遺傳性低纖維蛋白原血癥、遺傳性異常纖維蛋白原血癥及遺傳性異常低纖維蛋白原血癥[5]。目前已報道的位于Fg基因(FGA、FGB和FGG)的突變類型共有300余種,包括錯義突變、無義突變、剪切突變以及移碼突變。這些突變主要發(fā)生在Aα鏈上,其次為γ鏈,而Bβ鏈最為少見。查閱突變數(shù)據(jù)庫(HGMD,http://www.hgmd.cf.ac.uk/ac/all.php),到目前為止,發(fā)生在Bβ鏈上的突變類型僅報道有97種,大都位于Bβ鏈的C端[6]。
本研究中,我們發(fā)現(xiàn)1例位于β鏈三股螺旋初始部位的Leu121Arg錯義突變,引起遺傳性低纖維蛋白原血癥:先證者Fg:C和Fg:Ag分別為0.82 g/L和1.19 g/L,其父親和兒子的Fg:C和Fg:Ag也明顯降低。基因分析發(fā)現(xiàn):他們在FGB基因第3外顯子的425位均有T>G雜合突變,導致Leu121Arg錯義突變。蛋白同源性分析顯示:Leu121在脊椎動物中有較高的保守性,提示該位點對于Fg正常結構和功能非常重要。Leu121Arg突變,有可能影響了Fg的結構,導致蛋白穩(wěn)定性下降。此外,PDViewer蛋白預測分析軟件發(fā)現(xiàn):非極性疏水氨基酸Leu121突變?yōu)闃O性氨基酸Arg121,一方面改變了氨基酸的疏水性;另一方面,導致Arg121和Try117、Met118、Trp125之間新增了氫鍵。因而,該突變有可能影響了突變蛋白的二級結構,導致其折疊、構象及穩(wěn)定性改變,引起血漿Fg水平降低。
查閱文獻和檢索Fg基因突變數(shù)據(jù)庫(http://www.geht.org/databaseang/fibrinogen)發(fā)現(xiàn),Leu121Arg為首次發(fā)現(xiàn)的新突變。Leu121位于Fg Bβ鏈三股螺旋的初始部位,緊挨Bβ鏈的卷曲螺旋結構域。以往研究表明:Bβ鏈的合成被認為是Fg合成組裝的限速步驟[6-7]。其中,卷曲螺旋結構域對于Fg Aα、Bβ、γ鏈的正常組裝至關重要[8];而C端則與Fg分泌密切相關[6]。HANSS等[9]曾報道1例由Fg Met118Lys突變引起的低纖維蛋白原血癥,該突變因為改變了氨基酸極性,導致Fg分子構像發(fā)生改變,先證者伴有出血表現(xiàn)及流產(chǎn)病史。Leu121鄰近Met118,兩者均位于Bβ鏈毗鄰卷曲螺旋結構域的區(qū)域,因此,我們推測,Leu121Arg突變也有可能通過影響該結構域的穩(wěn)定性,導致Fg的組裝異常,引起低纖維蛋白原血癥。
綜上所述,本研究發(fā)現(xiàn)了一個位于B β 鏈Leu121Arg錯義突變引起的遺傳性低纖維蛋白原血癥家系,該突變可能通過改變氨基酸極性,影響氫鍵形成等影響突變體的穩(wěn)定性,導致遺傳性低纖維蛋白原血癥。其具體機制有待進一步的體外表達研究。
表2 蛋白同源性分析結果