結(jié)核病低發(fā)病率國家的未來移民要接受結(jié)核病篩查;然而,在遷入前進行潛伏性結(jié)核病感染篩查是少見的。我們對結(jié)核病低發(fā)病率國家的移民在遷入前進行授權(quán)和贊助的潛伏性結(jié)核病感染篩查進行成本效果評價。我們運用獨立事件模擬對遷入前潛伏性結(jié)核病感染篩查進行建模,加上移居后進行隨訪和對檢測陽性者進行治療。在確定性分析時遷入前-干擾素釋放試驗篩查和移居后利福平治療是優(yōu)先因素。我們計算了來自不同結(jié)核病發(fā)病率國家的移民每獲得質(zhì)量調(diào)整生命年的成本。本研究結(jié)果為結(jié)核病低發(fā)病率國家的移民在遷入前進行潛伏性結(jié)核病感染篩查的成本效果評價提供了依據(jù)。再加上對可持續(xù)性、可接受性和項目實施的研究,這些結(jié)果可以為政策決策提供信息。
自從2013年底基孔肯雅病毒出現(xiàn)在加勒比地區(qū)后,大約45個國家暴發(fā)過基孔肯雅熱。我們對2014年基孔肯雅熱傳入委內(nèi)瑞拉中北部地區(qū)的城市并傳播給免疫空白人群(an immunologically naive population)后的時空事件進行描述和量化。流行曲線(n=810)在5個月內(nèi)展開,基本再生數(shù)為3.7例,徑向傳播距離為9.4 km,平均傳播速度為82.9 m/d。在起初90 d內(nèi)疾病傳播速度最高,空間和時空模型表明該傳染病遵循特定的地理路徑,具有時空聚集性。基孔肯雅病毒首次傳入期間傳播的方向性和異質(zhì)性表明存在擴散區(qū)和增加疾病風(fēng)險,并強調(diào)了傳染病防備的重要性。本信息將有助于應(yīng)對未來新發(fā)或再發(fā)蟲媒病毒病的威脅。
墨西哥豬群中流行傳播的甲型流感病毒的基因多態(tài)性使得動物防控工作更加復(fù)雜,并對人類構(gòu)成威脅,比如甲型流感(H1N1)pdm09病毒。為了描述墨西哥豬甲型流感病毒的進化并評估疫苗開發(fā)所需的毒株,我們對59株毒株的基因組進行測序,并對來自5個地區(qū)的毒株進行抗原制圖。我們發(fā)現(xiàn)墨西哥東南部流感病毒的基因和抗原的多樣性特別高,這是由于墨西哥其他地區(qū)人源和豬源流感病毒反復(fù)傳入導(dǎo)致的。我們鑒定了新型重組H3N2病毒,其基因組片段來源于兩種不同的由人傳給豬的病毒,它們分別是H1N1流感大流行病毒和季節(jié)性H3N2病毒。墨西哥豬流感病毒在抗原上與美國豬系不同。美國的病毒疫苗不太可能對這些病毒提供保護,因此需要針對這些不同毒株開發(fā)新疫苗。
在法國開展的導(dǎo)致機械通氣患者肺炎的大腸埃希氏菌的前瞻性全國研究中,我們測定了大腸埃希氏菌的抗菌藥物敏感性、系統(tǒng)型、O型和毒力因子基因含量。我們將260株分離株與2組已公布的包括共生菌和菌血癥分離株進行了比較。優(yōu)勢種系群是B2 (占59.6%),優(yōu)勢序列型是STc73。與菌血癥分離株相比,肺炎分離株中的STc127與STc141的比例高,STc95的比例低。與菌血癥分離株相比,肺炎分離株攜帶的毒力基因sfa/foc、papGIII、hlyC、cnf1和鐵的比例更高。肺炎分離株的毒力因子基因含量和抗菌藥物耐藥率均高于共生菌菌株。從危重病人分離的肺炎大腸埃希氏菌的基因組和系統(tǒng)發(fā)育特征表明,它們屬于腸外致病性大腸埃希氏菌,但具有明顯的肺部特異的分子特征。
2016年至2017年,我們對澳大利亞墨爾本男男性行為者(MSM)的無癥狀者進行檢查,采集其尿液和肛門直腸拭子標本,通過PCR方法檢測標本中生殖支原體和大環(huán)內(nèi)酯耐藥突變情況。我們將男男性行為者中無癥狀與同期有直腸炎和非淋球菌性尿道炎(NGU)患者的生殖支原體檢出率進行比較。在1 001例無癥狀的男男性行為者當中,有95例感染生殖支原體;84.2%(80/95)患者對大環(huán)內(nèi)酯耐藥,17%(16/95)同時感染淋病奈瑟菌或沙眼衣原體。直腸標本生殖支原體陽性率為7.0%(70/1001),尿標本陽性率為2.7%(27/1001)。同期有直腸炎的男男性行為者 (355例,5.6%)的直腸檢出生殖支原體通常不太常見,而有非淋球菌性尿道炎的男男性行為者 (1 019例,8.1%)的直腸更容易檢出生殖支原體。生殖支原體感染常見于無癥狀的男男性行為者且主要對大環(huán)內(nèi)酯耐藥。這類人群中,感染生殖支原體與直腸炎無關(guān)。
加利福尼亞奧布尼亞病毒血清組包含一組能夠引起不同年齡不同發(fā)病率的人類神經(jīng)系統(tǒng)疾病的蚊傳病毒,包括拉克羅斯病毒(LACV),雪靴野兔病毒(SSHV),塔希納病毒(TAHV),詹姆斯敦峽谷病毒(JCV)和因科病毒(INKV)。為了闡述這些病毒的不同致病機制,我們比較了它們在小鼠體內(nèi)誘發(fā)疾病和在體外復(fù)制、誘導(dǎo)細胞死亡的能力。小鼠試驗時,拉克羅斯病毒(LACV),塔希納病毒(TAHV)和雪靴野兔病毒(SSHV)經(jīng)腹腔和鼻腔接種后誘發(fā)神經(jīng)系統(tǒng)疾病,詹姆斯敦峽谷病毒(JCV)僅經(jīng)鼻腔接種后誘發(fā)疾病。因科病毒(INKV)很少誘發(fā)疾病,與其他病毒相比,它與大腦的病毒抗原較少相關(guān)。體外試驗,全部病毒復(fù)制到高滴度;然而,拉克羅斯病毒(LACV),雪靴野兔病毒(SSHV)和塔希納病毒(TAHV)高誘導(dǎo)細胞死亡,而詹姆斯敦峽谷病毒(JCV)和因科病毒(INKV)則沒有。結(jié)果表明加利福尼亞血清組病毒在體內(nèi)和體外試驗的神經(jīng)發(fā)病機制不同,這與人類致病機制不同相關(guān)。見圖1。
圖1 全球分布,進化關(guān)系和5種研究神經(jīng)致病機制的加利福尼亞血清組病毒 (A) 這些病毒在全球均有發(fā)現(xiàn),主要在北美、歐洲、亞洲和非洲(1,4,8,10,12-29)。這些病毒中有幾種病毒的地區(qū)分布有重疊(如斜紋所示),包括北美發(fā)現(xiàn)拉克羅斯病毒(LACV)、雪靴野兔病毒(SSHV)和詹姆斯敦病毒(JCV),歐洲發(fā)現(xiàn)了塔希納病毒(TAHV)和因科病毒(INKV),所示的州和國家存在這些病毒的依據(jù)是報道過人類感染病例,通過人類和動物的血清學(xué)調(diào)查,或從蚊子上分離到病毒。(B) 在這些密切相關(guān)的加利福尼亞血清組病毒當中,詹姆斯敦病毒(JCV)和因科病毒(INKV)的關(guān)系最密切,接著是拉克羅斯病毒(LACV)和雪靴野兔病毒(SSHV),然后是塔希納病毒(TAHV)(30)。加利福尼亞血清組病毒的媒介是多種蚊子,主要為伊蚊屬。圖中列的是最主要的媒介和另外發(fā)現(xiàn)的宿主。每一種病毒都列出了作為宿主或擴增宿主的哺乳動物;一些宿主被多種加利福尼亞血清組病毒共享(1,2,12,22,31-33)。
肺炎克雷伯菌序列型ST307是一種新發(fā)的全球性耐藥克隆。我們運用全基因組測序和PCR技術(shù)對2014-2016年南非多家私立醫(yī)院收集的攜帶苯唑西林酶(oxacillinase,OXA) 181基因的肺炎克雷伯菌ST307的碳青霉烯酶進行表征。與全球ST307 (第1-5支)相比,南非ST307屬于一個具有獨特基因組特征的不同分支(第6支)。貝葉斯進化分析表明,第6支于2013年3月左右在南非豪登省出現(xiàn),于2014年期間進化為2個不同的譜系。攜帶OXA-181基因的肺炎克雷伯ST307 第6支在15個月內(nèi)在南非東北部6個省23個城市的42家醫(yī)院進行傳播,影響了350名患者。ST307的快速傳播最可能是由于患者在院內(nèi)、院間、市間和省際間流動引起的。本研究強調(diào)了分子監(jiān)測用于追蹤新發(fā)耐藥克隆菌的重要性。
我們從臨床百日咳鮑特氏菌分離株中提取了170個完整的基因組序列,這些菌株代表了美國的地理和時間多樣性。這些數(shù)據(jù)捕捉了當前再發(fā)的百日咳疾病中發(fā)生的基因型轉(zhuǎn)變,包括百日咳黏附素缺乏的增加,并為指導(dǎo)未來公共衛(wèi)生控制策略所需的研究提供了基礎(chǔ)。
中國臺灣對來自東南亞4個國家的600個新勞工開展血清學(xué)調(diào)查,結(jié)果顯示18個(3%)寨卡病毒IgM陽性;6個(1%)符合世界衛(wèi)生組織關(guān)于實驗室確診的近期寨卡病毒感染的標準。東南亞的寨卡病毒感染率可能被低估了。