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應用Illumina高通量測序技術分析3 種酒曲中微生物多樣性

2019-07-26 08:24母應春
食品科學 2019年14期
關鍵詞:酒曲桿菌屬菌門

母應春,姜 麗,蘇 偉

(貴州大學釀酒與食品工程學院,貴州 貴陽 550025)

酒曲是在蒸煮的谷物及其輔料上接種或天然定型發(fā)酵而成。我國用曲釀酒已有幾千年的歷史,歷代勞動人民傳承下來的民間酒曲是我國寶貴的微生物資源,隨著科學技術與釀酒業(yè)的發(fā)展,對酒曲的研究也日益增多[1-2],酒曲是中國酒釀造的糖化、發(fā)酵和生香劑,含多種微生物及其產(chǎn)生的酶,酒曲品質對酒的產(chǎn)率和品質影響極大,故有“曲是酒之骨”之稱[3]。

貴州省位置獨特,少數(shù)民族眾多,酒文化深厚。很多地區(qū)至今保持著傳統(tǒng)的釀酒工藝以及傳統(tǒng)的酒曲制作技術。傳統(tǒng)曲一般是自然接種微生物,因此微生物種類繁多。貴州省花溪、盤州、安順酒曲是采用傳統(tǒng)工藝制成,糖化力、液化力都相對較強,且出酒率高,品質香醇。近年來,國內外有許多的酒曲微生物多樣性的研究。Hui Wenyan等[4]使用單分子實時測序技術發(fā)現(xiàn)3 個日本酒曲中存在大量隸屬于Ochrobactrum的細菌。沈馨等[5]采用高通量測序技術對3 個孝感鳳窩酒曲的細菌多樣性分析發(fā)現(xiàn),鳳窩酒曲中存在大量的核心細菌菌群。相飛[6]采用變性梯度凝膠電泳技術發(fā)現(xiàn)Weissella kimchi、Enterococcus faecium、Herbaspirilum sp.為辣蓼甜酒曲中的優(yōu)勢菌。劉孟華等[7]利用宏基因組學的方法對劍南春中細菌群落多樣性的研究得出,劍南春酒曲微生物主要分布在Proteobacteria、Firmicutes、Actinobacteria三大門中,占總量的95%以上。然而有關貴州酒曲的微生物多樣性的研究報道尚少。

高通量測序技術具有通量高、成本低、準確率高、可進行雙向測序等優(yōu)點[8-10],可以方便快捷地分析樣品中復雜的微生物菌群結構,是分析復雜多樣微生物樣品的首選[11-12]。本研究利用高通量測序技術及相關性分析方法對貴州3 個地區(qū)生產(chǎn)的酒曲中微生物組成差異及多樣性進行比較,以期為不同酒曲中微生物資源開發(fā)利用提供參考。

1 材料與方法

1.1 材料與試劑

花溪酒曲,編號酒曲A;盤州酒曲,編號酒曲B;安順酒曲,編號酒曲C。

DNA試劑提取盒 德國Qiagen公司;2%瓊脂糖凝膠 西班牙Biowest公司;E.Z.N.A.?Soil試劑盒上海玉博生物科技有限公司;AxyPrep DNA凝膠提取試劑盒 AxyPrep DNA Gel Extraction Kit 美國Axygen Biosciences公司;QuantiFluor?-ST微型熒光劑 美國Promega公司;相關生理生化實驗所用試劑均為進口或國產(chǎn)分析純。

1.2 儀器與設備

Fresco21型高速冷凍離心機 美國Thermo公司;GeneAmp?9700型聚合酶鏈式反應(polymerase chain reaction,PCR)儀 美國ABI公司;Gel DOC XR凝膠成像系統(tǒng) 美國Bio-Rad公司。

1.3 方法

1.3.1 樣品采集及前處理

采集來自貴州省3 個地區(qū)(花溪、盤州、安順)不同酒廠生產(chǎn)的酒曲,采集時間2017年9月,所有樣品經(jīng)無菌密封好后放入-80 ℃超低溫冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>

1.3.2 酒曲的理化指標檢測

水分測定:直接干燥法;酸度測定:酸堿中和法(以乳酸計);糖化酶活力測定:婓林快速法;液化酶活力測定:分光光度法。以上方法參考文獻[13]。

1.3.3 DNA抽提和PCR擴增

根據(jù)E.Z.N.A.?Soil試劑盒說明書進行總DNA抽提,DNA濃度和純度利用NanoDrop2000進行檢測,利用1%瓊脂糖凝膠電泳檢測DNA提取質量;細菌用338F(5’-ACTCCTACGGGAGGCAGCAG-3’)和806R(5’-GGACTACHVGGGTWTCTAAT-3’)引物對V3-V4可變區(qū)進行PCR擴增;真菌用ITS1F(5’-CTTGGTCATTTAGAGGAAGTAA-3’)和ITS2R(5’-GCTGCGTTCTTCATCGATGC-3’)引物對ITS1可變區(qū)進行PCR擴增;擴增程序為:95 ℃預變性3 min,27 個循環(huán)(95 ℃ 變性30 s,55 ℃退火30 s,72 ℃延伸30 s),最后72 ℃延伸10 min。擴增體系為20 μL,4 μL 5×FastPfu緩沖液,2 μL 2.5 mmol/L dNTPs,0.8 μL引物(5 μmol/L),0.4 μL FastPfu聚合酶;10 ng DNA模板。

1.3.4 Illumina MiSeq測序

使用2%瓊脂糖凝膠回收PCR產(chǎn)物,利用AxyPrep DNA凝膠提取試劑盒進行純化,Tris-HCl洗脫,2%瓊脂糖電泳檢測。利用QuantiFluor?-ST微型熒光劑進行檢測定量。根據(jù) Illumina MiSeq平臺標準操作規(guī)程將純化后的擴增片段構建PE 2×300的文庫。

構建文庫步驟:1)連接“Y”字形接頭;2)使用磁珠篩選去除接頭自連片段;3)利用PCR擴增進行文庫模板的富集;4)氫氧化鈉變性,產(chǎn)生單鏈DNA片段。利用Illumina公司的MiSeq PE300平臺進行測序(上海美吉生物醫(yī)藥科技有限公司)。原始數(shù)據(jù)上傳至NCBI數(shù)據(jù)庫中。

1.3.5 數(shù)據(jù)處理

原始測序序列使用Trimmomatic軟件質控,使用FLASH軟件進行拼接:1)設置50 bp的窗口,如果窗口內的平均質量值低于20,從窗口開始截去后端堿基,去除質控后長度低于50 bp的序列;2)barcode需精確匹配,引物允許2 個堿基的錯配,去除模糊堿基;3)根據(jù)重疊堿基overlap將兩端序列進行拼接,overlap需大于10 bp。去除無法拼接的序列。使用UPARSE軟件(version 7.1 http://drive5.com/uparse/),根據(jù)97%的相似度對序列進行操作分類單元(operational taxonomic unit,OTU)聚類;使用UCHIME 軟件剔除嵌合體。利用RDP classifier(http://rdp.cme.msu.edu/)對每條序列進行物種分類注釋,比對Silva數(shù)據(jù)庫(SSU123),設置比對閾值為70%。

1.4 數(shù)據(jù)分析

利用Excel 2010、Origin 9、SPSS Statistics 20.0等統(tǒng)計軟件進行數(shù)據(jù)分析。

2 結果與分析

2.1 酒曲中基本理化性質分析

表1 酒曲基本理化性質分析Table 1 Basic physicochemical properties of rice wine kojis

由表1可知,3 種酒曲的水分質量分數(shù)在10.04%~13.273%之間,酒曲A和酒曲C不顯著(P>0.05),酒曲B和酒曲C之間差異不顯著(P>0.05);酸度在0.421%~1.501%之間,酒曲A、B、C之間差異顯著(P<0.05);液化酶活力在77.420~91.880 U/g之間,酒曲A、B、C之間差異顯著(P<0.05);糖化酶活力在346.282~673.540 U/g之間,其中酒曲A和酒曲B 之間差異不顯著(P>0.05),酒曲B和酒曲C之間差異不顯著(P>0.05)。3 個地區(qū)的酒曲在酸度和液化酶活力上差異顯著。

2.2 酒曲中DNA提取與定量

提取3 個地方酒曲的DNA,測定其質量與純度,并觀察OD260nm/OD280nm和OD260nm/OD230nm值(表2)可知,酒曲樣品的DNA的OD260nm/OD280nm值在1.8~2.3之間,OD260nm/OD230nm值在0.04~0.17之間,其質量濃度在8.5~42.8 ng/μL之間,說明提取的DNA濃度較純,以便用于酒曲的細菌和真菌多樣性分析。

表2 酒曲中DNA質量濃度分析Table 2 Microbial DNA concentrations from rice wine koji

2.3 樣品中細菌的分析

2.3.1 細菌豐度和多樣性分析

表3 酒曲樣品細菌測序數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析Table 3 Statistical analysis of bacterial sequencing data of koji samples

除去不合格序列后,3 種酒曲樣品中共獲得129 510 條高質量細菌序列(表3),其中從酒曲A、B、C中分別獲得45 308、40 940、43 262 條有效序列,基于97%相似度其OTU數(shù)量分別為474、89和476。ACE指數(shù)在246.09~476.27之間,Shannon指數(shù)在1.64~4.42之間,Chao 1指數(shù)在139.65~477.67之間,覆蓋率范圍99.87%~99.97%。說明所測得的OTU基本能反映所研究的酒曲樣品細菌群落組成。每個樣品的Chao 1指數(shù)和Shannon指數(shù)用于評估物種豐度和多樣性[14]。通過計算樣品的多樣性指數(shù)發(fā)現(xiàn),酒曲A和酒曲C的Chao 1指數(shù)和Shannon指數(shù)明顯高于酒曲B,這說明酒曲A和酒曲C中的物種豐度明顯高于酒曲B,且酒曲A和酒曲C的細菌群落結構比較復雜。由圖1可知,隨著測序深度的增加物種的數(shù)量也隨之增加,但與此同時每個樣品的Shannon曲線已進入平臺期[15]。由此可知,雖然隨著測序量的增加有可能會發(fā)現(xiàn)新的細菌種系型,但樣品細菌多樣性已經(jīng)不再隨測序量的增加而發(fā)生變化,說明測序數(shù)量足夠充分合理[16]。因此,本研究細菌的測序量滿足后續(xù)的生物信息學分析要求。

圖1 3 種酒曲中細菌的稀釋性曲線(a)和Shannon指數(shù)(b)圖Fig. 1 Rarefaction curve (a) and Shannon index (b) of bacteria in three rice wine kojis

2.3.2 細菌中微生物群落組成分析

在門水平上,3 個樣品中共檢測出8 個細菌門,分別為厚壁菌門(Firmicutes)、變形桿菌門(Proteobacteria)、放線菌門(Actinobacteria)、擬桿菌(Bacteroides)、綠彎菌門(Chloroflexi)、芽單胞菌門(Gemmatimonadetes)、異常球菌-棲熱菌門(Deinococcus-Thermus)、未分類菌群(others)。如圖2a所示,相對豐度高且3 個樣品均有分布的厚壁菌門、變形菌門、放線菌門。不同地區(qū)的酒曲樣品之間微生物菌群明顯不同,其中酒曲A和酒曲C中優(yōu)勢的細菌門為變形菌門,比例高達31.86%,39.98%;放線菌門為酒曲A中第2大優(yōu)勢菌群,占樣品序列的29.31%;酒曲B中厚壁菌門為優(yōu)勢細菌門,占樣品序列的98.08%,而酒曲C中厚壁菌門的相對豐度僅次于變形菌門,占樣品序列的29.28%,居第2位。不同的酒曲樣品之間微生物菌群不同,3 個樣品中酒曲A和酒曲C的細菌微生物群落組成相似,但相對豐度存在差異。

在屬水平上,3 個樣本中共檢測到19 個細菌屬,分別為芽孢桿菌屬(Bacillus)、片球菌屬(Pediococcus)、紅球菌屬(Rhodococcus)、羅爾斯頓菌屬(Ralstonia)、不動細菌屬(Acinetobacter)、腸球菌屬(Enterococcus)、乳酸桿菌屬(Lactobacillus)、Burkholderia-Paraburkholderia、雙歧桿菌屬(Bifidobacterium)、norank-f-Mitochondria、鞘氨醇單胞菌屬(sphingomonas)、Hydrogenispora、norankc-Gemmatimonadetes、Faecalibaculum、unclassified-f-Micromonospraceae、棲熱菌屬(Thermus)、norank-f-OM1-clade、Alistipesothers、未分類菌群(others)。如圖2b所示,相對豐度較高且3 個樣品中均分布的主要細菌屬有芽孢桿菌屬、片球菌屬、紅球菌屬、羅爾斯頓菌屬和不動細菌屬。其中酒曲A和酒曲C中細菌微生物組成較為復雜,且相似。但所占比例不同,主要以紅球菌屬、青枯菌屬、芽孢桿菌屬、不動細菌屬等為主。酒曲B中微生物多樣性最低,主要有芽孢桿菌屬、不動細菌屬和紅球菌屬等為主。紅球菌屬為酒曲A的優(yōu)勢菌屬,占樣本序列比例為18.50%;其次是羅爾斯頓菌屬,占樣本序列比例為8.46%;芽孢桿菌屬為酒曲B的優(yōu)勢菌屬,占樣本序列比例為13.09%;其次是片球菌屬和腸球菌屬,分別占樣本序列比例為11.15%,11.34%。而酒曲C中的優(yōu)勢菌屬也是芽孢桿菌屬,占樣本序列比例61.49%,其次是不動細菌屬,占樣本序列比例的23.74%。

圖2 3 種酒曲在門水平(a)和屬水平(b)的細菌組成Fig. 2 Bacterial community composition of three rice wine kojis at the phylum level (a) and genus level (b)

2.3.3 細菌微生物群落相似性分析

通過非度量多維尺度(nonmetric multidimensional scaling,NMDS)分析細菌群落間存在的關系,根據(jù)樣品中包含的物種信息,以點的形式反映在多維空間上,而對不同樣品間的差異程度,則是最終通過點與點的距離表現(xiàn)在圖中,其距離遠近代表樣品中菌體群落的差異程度[17]。由圖3a可知,酒曲A和酒曲C距離較近,聚集在圖的左側,群落差異較?。欢魄鶥的細菌微生物聚集在右側部分,距酒曲A和酒曲C較遠,差異較大,構成一個獨立的組群。通過對樣品細菌Beta多樣性距離矩陣進行層級聚類分析,構建樣品層級聚類樹研究不同樣品的相似性和差異性[18]。如圖3b所示,Beta分析結果與NMDS相似,3 種酒曲共聚為兩大支,酒曲A和酒曲C的細菌屬聚為一類,差異較小,酒曲B的細菌屬另聚為一類。

圖3 細菌非度量多維尺度分析圖(a)和基于Beta多樣性距離的樣品層級聚類樹(b)Fig. 3 Bacterial non-metric multi-dimensional analysis (a) and hierarchical dendrogram based on Beta diversity distance (b)

2.4 樣品中真菌的分析

2.4.1 真菌的豐度和多樣性分析

酒曲A、B、C經(jīng)過測序后得出3 種酒曲樣品中共獲得60 945 條高質量真菌序列(表4),3 種酒曲中獲得有效序列相同,均為20 315 條,基于97%相似度,其OTU數(shù)量分別為2.4、1和15.8。ACE指數(shù)在0~16.09之間,Shannon指數(shù)在0.06~1.06之間,Chao 1指數(shù)在5.5~25之間,覆蓋率均為99.99%。說明所測得的OTU基本能反映所研究酒曲樣品真菌群落組成。通過計算樣品的多樣性指數(shù)發(fā)現(xiàn),酒曲A的Chao 1指數(shù)25最大,說明酒曲A的真菌微生物豐度高于酒曲B和酒曲C。在多樣性方面,酒曲C的Shannon指數(shù)1.06最大,說明酒曲C的真菌群落結構較為復雜。由圖4可知,隨著測序深度的增加,發(fā)現(xiàn)物種的數(shù)量也隨之增加,與此同時,每個樣品的Shannon曲線己進入平臺期。由此可知,雖然隨著測序量的增加有可能會發(fā)現(xiàn)新的真菌種系型,但樣品真菌的多樣性己經(jīng)不再隨測序量的增加而發(fā)生變化。因此,本研究真菌的測序量滿足后續(xù)的生物信息學分析要求。

表4 酒曲樣品真菌測序數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析Table 4 Statistical analysis of fungal sequencing data of koji samples

圖4 3 種酒曲中真菌的稀釋性曲線(a)和Shannon指數(shù)(b)圖Fig. 4 Dilution curve (a) and Shannon index (b) of fungi in three kinds of koji

2.4.2 真菌中微生物群落組成分析

圖5 3 種酒曲在門水平(a)和屬水平(b)上的真菌組成Fig. 5 Fungal community composition of three kojis at the phylum level (a) and genus level (b)

如圖5a所示,在門水平上,檢測出3 個真菌門為接合菌門(Zygomycota)、子囊菌門(Ascomycota)和擔子菌門(Basidiomycota)。在門水平上相對豐度高且3個樣品均有分布的主要真菌門為子囊菌門。不同的酒曲樣品之間微生物菌群明顯不同。酒曲A和酒曲B中接合菌門為優(yōu)勢真菌門,比例達64.57%、98.91%。酒曲C中子囊門為優(yōu)勢真菌門,占樣品序列比例95.26%。

如圖5b所示,在屬水平上,3 個樣本中共檢測到4 個真菌屬,分別為米根霉屬(Rhizopus)、酵母菌屬(Saccharomyce)、曲霉菌屬(Aspergillus)和嗜熱菌屬(Thermomyces)。酒曲A和酒曲B中米根霉屬為優(yōu)勢真菌屬,占樣本序列比例的66.58%和95.25%。酒曲C中優(yōu)勢真菌屬為酵母屬,占樣本序列比例的95.25%。3 種酒曲樣品中盡管微生物群落組成相似,但相對豐度仍存在顯著性差異。

2.4.3 真菌微生物群落相似性分析

圖6 真菌非度量多維尺度分析圖(a)和基于Beta多樣性距離的樣品層級聚類樹(b)Fig. 6 Fungal non-metric multidimensional scaling analysis (a) and hierarchical clustering dendrogram based on beta diversity distance (b)

如圖6a可知,真菌NMDS聚類與細菌結果不同,酒曲A和酒曲B距離較近,聚集在圖的右側,群落差異較小。而酒曲C的細菌微生物聚集在左側部分,距酒曲A和酒曲B較遠,差異較大,構成一個獨立的組群。如圖6b所示,真菌Beta多樣性距離矩陣層級聚類結果與NMDS結果一樣,3 種酒曲同樣共聚為兩大支,酒曲A和酒曲B聚為一類,酒曲C另聚為一類。

2.5 典型關聯(lián)分析(canonical correlation analysis,CCA)

CCA揭示不同地區(qū)酒曲樣品微生物群落組成與不同環(huán)境因子之間的相關性[19]。選擇3 個地方酒曲理化指標作為環(huán)境因子與酒曲中屬水平上細菌豐度前10的微生物進行典范對應分析。如圖7所示,酸度與液化酶活力之間夾角為鈍角,表明兩個理化指標之間不具有協(xié)同效應;水分質量分數(shù)與糖化酶活力之間夾角為銳角,表明兩個指標之間具有協(xié)同效應。酒曲A和酒曲C與酸度相關性最高,酒曲B與液化酶活力、水分質量分數(shù)、糖化酶活力相關性最高,Acinetobacter、Ralstonia、Rhodococcus、norank-f-Mitochondria、Bifidobacterium、Lactobacillus與酸度變化呈正相關;Bacillus、Enterococcus、Pediococcus與液化酶活力、糖化酶活力變化呈正相關,與水分質量分數(shù)變化也呈正相關但影響不顯著。由此說明,酒曲中微生物的種群結構對酒曲理化指標具有顯著影響。

圖7 細菌群落與環(huán)境因子典范對應分析Fig. 7 Canonical correspondence analysis between bacterial community and environmental factors

3 討 論

通過高通量測序分析3 種不同酒曲的群落結構及物種多樣性之間的差異,從3 種酒曲中共檢出8 個細菌門和3 個真菌門;19 個細菌屬和4 個真菌屬。細菌門主要有厚壁菌門、變形菌門、放線菌門、擬桿菌門、綠彎菌門、芽單胞菌門等。細菌屬主要有紅球菌屬、羅爾斯頓菌屬、不動細菌屬、乳酸桿菌屬、雙歧桿菌屬、芽孢桿菌屬、伯克爾德屬、片球菌屬、腸球菌屬等。真菌門有接合菌門、子囊菌門、擔子菌門。真菌屬有米根霉屬、酵母菌屬、曲霉菌屬、嗜熱菌屬。據(jù)報道,酒曲中的細菌屬有芽孢桿菌屬、乳酸桿菌屬、乳球菌屬、鏈球菌屬、芽孢梭菌屬、葡萄球菌屬、微細菌屬、節(jié)細菌屬、歐文氏菌屬、醋桿菌屬、柯匝克氏菌屬、顆粒鏈菌屬和希瓦氏菌屬13 個菌屬[20-22],由此可知,酒曲樣品中微生物群落組成豐富,不同地區(qū)酒曲微生物群落組成雖然相似,但是豐度仍存在差異。3 個地區(qū)中,酒曲A和酒曲C的細菌種群相似,酒曲A和酒曲B的真菌種群相似,這應該與環(huán)境因素有所關系,并且揭示了酒曲中微生物組成種類的復雜程度。

張雙燕等[23]研究發(fā)現(xiàn),大曲中優(yōu)勢細菌屬有乳酸桿菌屬,片球菌屬,也檢測出醋酸桿菌屬和芽孢桿菌屬等。其中乳桿菌屬,片球菌屬和芽孢桿菌屬在本實驗3 種酒曲中均被檢測出,芽孢桿菌屬為酒曲B和酒曲C的第一優(yōu)勢菌屬。芽孢桿菌屬在白酒釀造過程中發(fā)揮著重要的作用,能產(chǎn)生淀粉酶和蛋白酶,分解淀粉和蛋白質等大分子物質。此外,芽孢桿菌能影響白酒的風味物質如酯、醇的形成[24-25]。李艷等[26]研究發(fā)現(xiàn),羊羔美酒大曲中優(yōu)勢菌屬有片球菌屬和乳酸桿菌屬,甜酒中酸味較重可歸功于含量較高的片球菌屬和乳酸桿菌屬,表明了甜酒最終質量和風味與發(fā)酵微生物分類組成息息相關。本研究也發(fā)現(xiàn),在酒曲B中片球菌屬的豐度較高,但乳酸桿菌屬豐度略低。Bora等[27]采用基于Illumina平臺的全基因組鳥槍測序法對印度的米酒曲xaj-pitha進行研究發(fā)現(xiàn),米酒曲含有大量以乳酸菌為其主要細菌類群的細菌屬。3 種酒曲檢測的結果均有乳酸桿菌屬,但相對豐度各有不同,乳酸桿菌屬與乳酸乙醋的形成具有密切關系[28],其對于有機酸具有一定的耐受能力[29],能減弱酵母菌的好氧代謝速度,延長前發(fā)酵期,有利于發(fā)酵有益菌的生長,對于白酒香味物質增加有利[30-31]。另外3 種酒曲中也檢測到雙歧桿菌屬,雙歧桿菌是有益菌的代表,對于維持腸道微生態(tài)平衡有重要作用,具有調整腸道功能、凈化腸道環(huán)境、促進機體健康的效果,提高抗病能力等[32]。陳玲等[33]采用16S rDNA克隆文庫法和高通量測序法分析大曲中細菌微生物組成,檢測出在門水平上的細菌門有厚壁菌門、變形菌門、放線菌門、擬桿菌門等。王丹丹等[34]采用高通量測序技術對孝感鳳窩酒曲的真菌微生物多樣性進行評價,得出在門水平上真菌主要有子囊菌門。本研究也在3 種酒曲樣品中檢測到了厚壁菌門、變形菌門、放線菌門、擬桿菌門、子囊菌門的存在,其在酒曲A和酒曲C中子囊菌門的豐度最高,而在酒曲C中相對豐度較低。接合菌門為酒曲C中的優(yōu)勢菌門。喬曉梅等[35]研究發(fā)現(xiàn),清香大曲真菌菌群有米根霉和酵母菌。羅惠波等[36]采用ITS基因文庫法研究清香型大曲真菌群落結構,得出清茬曲的優(yōu)勢真菌屬為畢赤酵母屬和米根霉屬。而本研究也檢測到酒曲A和酒曲B中的優(yōu)勢真菌屬為米根霉屬,酒曲C中的優(yōu)勢真菌屬為酵母屬。

本實驗對3 種酒曲微生物群落結構與組成及多樣性進行研究,采用CCA酒曲的基本理化指標與酒曲細菌種群結構關系,發(fā)現(xiàn)不同地區(qū)的酒曲微生物群落構成及多樣性存在明顯差異,且酒曲的基本理化指標與微生物菌群結構有一定的相關性,這可能與環(huán)境、氣候等因素有關[37],通過本研究對貴州不同地區(qū)酒曲微生物種群結構有了初步的了解,也為酒曲微生物多樣性探究進一步提供參考。

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