焦芳艷 尹鐵球 黃露萍 李勇 譚宇蓉
〔摘要〕 目的 分析2016年至2018年湖南省腦科醫(yī)院銅綠假單胞菌的臨床分布情況、耐藥情況以及耐藥菌株Ⅰ類整合子基因。方法 選取湖南省腦科醫(yī)院2016年1月1日至2018年12月31日臨床送檢各類標本中分離出795株銅綠假單胞菌作為分析對象,就銅綠假單胞菌的臨床分布情況以及耐藥情況統(tǒng)計分析,2018年ICU分離的13株多重耐藥菌株采用PCR擴增檢測Ⅰ類整合子。結(jié)果 銅綠假單胞菌分布科室主要為神經(jīng)外科(24.53%),其次為呼吸內(nèi)科(22.26%)和重癥醫(yī)學科(13.21%);銅綠假單胞菌對臨床常用的20種抗生素耐藥率和敏感率0-100%不等,多重耐藥呈上升趨勢;13株多重耐藥菌株6株Ⅰ類整合子陽性。結(jié)論 及時統(tǒng)計細菌分布情況、藥物的耐藥率、敏感率,并對其進行分析,可以為臨床合理用藥提供依據(jù),有效預(yù)防和控制感染。
〔關(guān)鍵詞〕 銅綠假單胞菌;抗菌藥物;耐藥率;敏感率
〔中圖分類號〕R378.99+1? ? ? ?〔文獻標志碼〕A? ? ? ?〔文章編號〕doi:10.3969/j.issn.1674-070X.2019.06.019
〔Abstract〕 Objective To analyze the clinical distribution, drug-resistance and class I integron genes of drug-resistant strains of pseudomonas aeruginosa (PA) in the Brain Hospital of Hunan Province from 2016 to 2018. Methods A total of 795 PA separated from clinical specimens submitted for examination samples in the Brain Hospital of Hunan Province from January 1, 2016 to December 31, 2018 were regarded as analysis objects. The clinical distribution and drug-resistance of PA were statistically analyzed. In 2018, class I integron of 13 multiple drug-resistant strains separated from specimens submitted by ICU were detected by PCR amplification. Results Most of PA was from neurosurgery department (24.53%), followed by the department of respiratory medicine (22.26%) and the department of critical care medicine (13.21%). The drug-resistance rate and susceptibility rate of PA to 20 antibiotics commonly used in clinic ranged from 0-100%, with multiple drug-resistance on the rise. The class I integrons were detected positive in 6 of the 13 multiple drug-resistant strains. Conclusion Timely statistics and analysis of bacterial distribution, drug-resistance rate and susceptibility rate could provide the basis for rational drug use in clinics and effectively prevent and control infection.
〔Keywords〕 pseudomonas aeruginosa; antibacterial drug; drug-resistance rate; susceptibility rate
銅綠假單胞菌(pseudomonas aeruginosa, PA)是假單胞菌屬代表菌種,廣泛分布于自然界、土壤、水體、空氣以及人類皮膚、腸道、呼吸道等中,其屬于革蘭陰性桿菌,是一種常見的條件致病菌,是醫(yī)院感染的主要病原菌之一[1]。近年來,由于抗生素不合理使用以至于PA成為臨床病原菌的主要菌種之一。由于其易定植、易變異、多重耐藥等特性[2],導(dǎo)致PA感染已成為臨床治療的瓶頸[3]。所以了解PA的臨床感染的分布情況及藥敏耐藥、敏感特點十分重要,通過這些分析可以為臨床合理用藥提供依據(jù),是加強醫(yī)院感染控制的重要措施。
研究顯示,PA的耐藥機制較為復(fù)雜,其中包括群體感應(yīng)系統(tǒng)、碳青霉烯酶、和外排泵等,近年研究也發(fā)現(xiàn)在整合子-基因盒系統(tǒng)中介導(dǎo)該菌由單一耐藥向多重耐藥發(fā)展過程時擔任重要角色,我國多項研究表明基本為Ⅰ類整合子[4-6]。本研究分析總結(jié)了湖南省腦科醫(yī)院2016-2018年臨床分離的795株 的臨床耐藥情況,并對2018年分離自ICU的13株多重耐藥菌株的Ⅰ類整合子進行了分析。
1 材料與方法
1.1? 菌株來源及鑒定
選取2016年1月1日至2018年12月31日湖南省腦科醫(yī)院患者臨床分離到的(剔除重復(fù)標本)PA795株,質(zhì)控菌株購自衛(wèi)生部臨床檢驗中心的PA ATCC27853、大腸埃細菌ACTT25922,細菌分離按照《全國臨床檢驗操作規(guī)程》第3版[7]處理操作,采用全自動微生物鑒定儀進行細菌鑒定。
1.2? 儀器與試劑
Vitek-2 Compact全自動微生物鑒定儀及配套試劑、TDR-300B plus天地人系統(tǒng)微生物鑒定儀及配套試劑,ABsteponeplus基因擴增儀,柯達凝膠成像系統(tǒng),BIO-RAD電泳儀。DNA提取試劑盒為OMEGA試劑盒。
1.3? 藥敏試驗
藥敏試驗操作、結(jié)果判定采用CLSI2016- 2018 年版標準推薦的最低抑菌濃度(MIC)法。多重耐藥銅綠假單胞菌(multiresistant pseudomonas aeruginosa,MRPA)的判定:對下面5類抗菌藥中的3類及以上藥物耐藥包括頭孢菌素類(如頭孢吡肟)、氟喹諾酮類(如左旋氧氟沙星)、碳青霉稀類(如美羅培南)、B-內(nèi)酰胺酶抑制劑(哌拉西林/他唑巴坦)和氨基糖苷類(妥布霉素)。
1.4? 整合子基因擴增
按照OMEGA試劑盒說明書提取DNA,參考文獻[6]設(shè)計引物,引物intⅠ1-F和intⅠ1-R由湖南擎科生物技術(shù)有限公司合成,擴增條件為:95 ℃ 5 min;95 ℃ 20 s,52.5 ℃ 30 s, 72 ℃ 1 min,35 cycle. PCR產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳凝膠成像分析。
1.5? 統(tǒng)計學方法
所有實驗數(shù)據(jù)采用WHONET 5.6軟件及 SPSS
20.0軟件進行分析。
2 結(jié)果
2.1? PA的分離情況
2016年1月1日至2018年12月31日3年臨床共分離細菌6 475株,株數(shù)及占比如下:三年共分離795株(795/6475,12.28%),2016年281株(281/ 2269,12.38%),2017年216株(216/1930,11.19%),2018年298株(298/2706,11.01% )。
2.2? PA在各臨床標本中的分布情況
菌株主要來自住院患者的痰液78.49%(624/ 795)、傷口拭子6.04%(48/795)、支氣管肺泡灌洗液4.78%(38/795)、尿液3.65%(29/795)、血液1.26%(10/795)、其他5.79%(46/795)等,見表1。
2.3? PA在各臨床科室中的分布
本院由銅綠假單胞菌引起感染的臨床科室較為多,幾乎涉及所有科室,主要分布于神經(jīng)外科、呼吸內(nèi)科、重癥醫(yī)學科、神經(jīng)內(nèi)科、腫瘤科等等科室;主要科室株數(shù)及占比如下:神經(jīng)外科分布24.53% (195/795)、呼吸內(nèi)科22.26%(177/795)、重癥醫(yī)學科13.21%(105/795)、神經(jīng)內(nèi)科12.08%(96/795)、腫瘤科5.03%(40/795)、其他科室22.89%(182/795)等,具體見表2。
2.4? PA的季節(jié)分布
795例PA感染的季節(jié)分布,2016-2018年總體是秋季占比率最高,冬季次之,見表3。
2.5? PA對臨床常用抗菌藥物的耐藥性敏感性
從以下監(jiān)測數(shù)據(jù)觀察到,我院三年合計PA耐藥高達96.81%,對哌拉西林/他唑巴坦、頭孢他啶、哌拉西林保持相對較高敏感率,對亞胺培南和美羅培南較敏感在60%~70%左右。PA對頭孢唑啉、氨芐西林、頭孢呋辛、頭孢曲松、頭孢吡肟、氯霉素、氨芐西林舒巴坦耐藥率高。具體數(shù)據(jù)見表4。
2.6? 與本院2010-2012年P(guān)A抗菌藥物耐藥率統(tǒng)計分析
與本院文獻[8]2010-2012年合計統(tǒng)計分析,有11種抗菌藥物的耐藥率統(tǒng)計相同,其中有7種下降,2種上升,明顯下降的有:慶大霉素、妥布霉素、環(huán)丙沙星、左旋氧氟沙星、阿米卡星、頭孢吡肟,耐藥率上升的有:頭孢曲松、亞胺培南。
2.7? MRPA檢出率分析
全院在795株P(guān)A分離中共分離出MRPA86株10.82%,MDPA在2016-2018年的檢出率分別為6.54%(18/281)、10.9%(10.9/216)、14.77%(44/298),檢出率呈上升趨勢。
2.8? 2018年分離自ICU的13株多重耐藥菌株Ⅰ類整合子分析
分析結(jié)果顯示,6株陽性,產(chǎn)物大小約500 bp(見圖1),占46.2%,陽性率和文獻報道相似[5-6],表明整合子在銅綠假單胞菌的耐藥性發(fā)展中起著重要的作用。
3 討論
3.1? PA分布情況
PA是醫(yī)院內(nèi)獲得性感染常見的條件致病菌之一,可引起嚴重的肺炎、菌血癥、燒傷后感染、泌尿系統(tǒng)感染等[9],在目前醫(yī)院感染中發(fā)揮重要作用[10],且其感染率近年來不斷增加[11]。從結(jié)果2.1可以看出我院PA在總分離菌株中比例較高,3年比例分布在11.01%~12.38%之間,比湖南省2017年度細菌耐藥監(jiān)測報告發(fā)布的細菌耐藥數(shù)據(jù)顯示PA占總分離菌株比8.03%,和2016年全國細菌耐藥監(jiān)測報告發(fā)布的數(shù)據(jù)顯示PA在總分離菌株中約占9.03%都高。所以,本院的患者PA總體感染相對嚴重,醫(yī)院需對PA感染者更加嚴密監(jiān)測和加強相關(guān)的研究,一定避免PA在院內(nèi)大規(guī)模的爆發(fā)感染。但本院結(jié)果顯示近三年來,檢出率有逐漸下降趨勢。說明近些年由于上級部門和醫(yī)院開始重視,但各臨床科室并不能掉以輕心。從表2看標本來源廣泛種類多,但還是以痰標本最多且占比高。和近些年統(tǒng)計文獻相同[12-14]。此項顯示,本室更應(yīng)關(guān)注此類型標本及其菌的耐藥情況,對其類型的標本進行進一步研究和總結(jié),為臨床提供更有價值的資料。從表3結(jié)果來看菌株科室分布前5名科室神經(jīng)外科分布占 24.53%、呼吸內(nèi)科22.26%、重癥醫(yī)學科13.21%、神經(jīng)內(nèi)科12.08%、腫瘤科5.03%,這可能是神經(jīng)外科感染來源于患者基本手術(shù)及呼吸內(nèi)科、神經(jīng)內(nèi)科患者多為老年病人,患者病程長、病情重、機體免疫力低下,在對重癥科和腫瘤科患者進行搶救時常進行氣管切開及插管等侵入性操作,同時這些患者常常伴有長時間的使用廣譜抗菌藥控制感染,容易引發(fā)機體菌群失調(diào)進而導(dǎo)致條件致病菌如銅綠假單胞菌感染增加。這與多文獻研究[15-17]基本相符。所以相關(guān)臨床科室需要特別注意PA感染的患者,注意每次此菌感染患者的耐藥情況分析及動態(tài)病情變化,選擇更適合患者的抗菌藥物,盡量減少患者對此菌的多重耐藥發(fā)生。從表4顯示2016-2018年總體是秋季占比率最高。這可能是秋天氣候冷暖善變,晝夜溫差較大,使得呼吸道抵抗力下降有關(guān)[13]。這提醒臨床對易感患者尤其注意這個季節(jié)需注意天氣和晝夜溫差變化,囑咐患者保暖、加強營養(yǎng),增強抵抗力,從而預(yù)防PA的感染。
3.2? PA耐藥分析
PA具有多重耐藥的特性,其耐藥機制主要包括以下方面:(1)改變細胞膜和細胞壁結(jié)構(gòu),使其通透性下降,藥物難以進入細胞內(nèi);(2)產(chǎn)生藥物滅活酶如純化酶、水解酶和修飾酶;(3)主動轉(zhuǎn)運系統(tǒng)把抗生素排出;(4)產(chǎn)生β-內(nèi)酰胺酶使β-內(nèi)酰胺類抗生素開環(huán)失活;(5)改變藥物作用的靶位,抑制細菌細胞壁生物合成,降低其與β-內(nèi)酰胺類抗生素的親和性[18]。表4數(shù)據(jù)顯示3年中大多數(shù)藥敏的敏感率耐藥率相差不大,在20種抗菌藥物中,合計敏感率高于70%以上有9種,從高至低為:替加環(huán)素、阿米卡星、慶大霉素、妥布霉素、左旋氧氟沙星、環(huán)丙沙星、頭孢吡肟、頭孢他啶、美羅培南。合計敏感率在69%~60%左右有4種,從高至低為:哌拉西林/他唑巴坦、哌拉西林、氨曲南、亞胺培南。合計藥敏的耐藥率高于70%有7種以上從高至低為:氨芐西林、頭孢唑林、頭孢替坦、呋喃妥因、氨芐西林/舒巴坦、頭孢呋辛、頭孢曲松。從3年常規(guī)藥敏變化來看:左旋氧氟沙星雖然敏感率較高但逐年略下降,美羅培南和氨曲南(16年沒做)敏感率也是下降。環(huán)丙沙星、頭孢他啶敏感性逐年上升。從結(jié)果“2.6”顯示,近些年由于管理部門及醫(yī)院對抗生素重視管理、控制及監(jiān)測,本院的銅綠假單胞菌耐藥率呈明顯下降趨勢。從結(jié)果“2.7”來看比較近年其他文獻[16]統(tǒng)計MRPA,本院多重耐藥率較低,但是近三年持續(xù)上升,而且每年上升比例不少,所以臨床要引起重視。根據(jù)以上統(tǒng)計分析,對于單純銅綠假單孢菌感染的患者推薦臨床根據(jù)病情使用敏感率高于70%以上9種藥,其中替加環(huán)素是目前極少見耐藥的藥物,可用作銅綠假單胞菌感染的患者最后一道防線的藥物之一。而阿米卡星、慶大霉素、妥布霉素為敏感度較高可作為臨床一線的抗菌藥物。而環(huán)丙沙星、頭孢他啶、頭孢吡肟可以作為目前臨床上較常規(guī)安全性選用的抗菌藥物。對于左旋氧氟沙星在安全選用的同時持續(xù)關(guān)注。而對于敏感率在69%~60%左右的4種及美羅培南來說,臨床要慎重選用。尤其美羅培南、亞胺培南這類碳青霉稀類藥物,近年來耐藥檢測率越來越高,一旦其耐藥可用抗菌藥物就有限,臨床盡量限制性選擇,這與郭良等[19]研究相符。當然,對臨床來說盡量不用耐藥率高于70%的7種藥,而本院也需持續(xù)關(guān)注這7種耐藥率高的藥物,分析其耐藥機制,為臨床合理用藥提供理論依據(jù)。對于復(fù)雜難治多種細菌感染,臨床可以根據(jù)以上藥敏藥物敏感性聯(lián)合搭配選藥,慎用耐藥率高的藥敏藥物。而對MRPA,臨床更應(yīng)高度重視其耐藥危害性,根據(jù)本院提供抗菌藥敏結(jié)果結(jié)合臨床合理使用抗菌藥物,防止或減慢多重耐藥菌珠的產(chǎn)生。綜上PA耐藥分析,本院更應(yīng)與臨床加強溝通,更進一步總結(jié)分析與研究,為臨床提供及時準確有效抗菌藥物結(jié)果。
整合子是一種與耐藥基因水平傳播相關(guān)的可移動的基因元件,可以攜帶一個或多個耐藥基因,在同種或不同種的細菌間發(fā)生水平傳播,可導(dǎo)致多重耐藥的發(fā)生[20]。整合子根據(jù)其整合酶編碼基因序列的不同分類,目前發(fā)現(xiàn)至少有6種,其中Ⅰ類整合子最為常見[21]。Ⅰ類整合子在醫(yī)院感染菌中廣泛分布,而且由于抗菌藥物在全球范圍大量應(yīng)用,也加速了Ⅰ類整合子流行和播散[4]。本研究初步表明,Ⅰ類整合子在銅綠假單胞菌的耐藥性發(fā)展中可能發(fā)揮重要作用,我們將進一步加大標本量進行各類整合子基因分析,并進一步結(jié)合基因測序技術(shù)對整合子可變區(qū)中耐藥基因進行研究分析,從而更加明確銅綠假單胞菌耐藥性機制。
3.3? 小結(jié)
綜上分析,銅綠假單胞菌致病性較強,臨床分布廣泛,是醫(yī)院內(nèi)感染的重要病原菌。近些年由于管理部門的重視,醫(yī)院對藥物關(guān)注和監(jiān)測,對藥物耐藥機制關(guān)注與研究,常用抗菌藥物敏感性會越來越多,耐藥率呈下降趨勢。但是我們更不能忽視依然還有許多藥物耐藥率及MRPA持續(xù)增高,應(yīng)該繼續(xù)更應(yīng)嚴格管理抗菌藥物,加強抗菌藥物藥敏檢測,控制醫(yī)院感染,有效預(yù)防和控制臨床患者的PA感染,為臨床合理有效使用抗菌藥物提供科學依據(jù)。
參考文獻
[1] 倪語星,尚? 紅.臨床微生物學檢驗[M].5版.北京:人民衛(wèi)生出版社,2012:137.
[2] GHOLAMI S, TABATABAEI M, SOHRABI N. Comparison of bifilm formation and antibiotic resistance pattern of Pseudomonas aeruginosa in human and environmental islates[J]. Microb Psthog,2017,109:94-98.
[3] 劉歡樂,陳舒影,吳小樂.耐亞胺培南銅綠假單胞菌的檢出率與耐藥性分析[J].中華醫(yī)院感染學雜志,2016,26(2):265-267.
[4] 盧玲玲,潘曉微,潘曉夫.銅綠假單胞菌整合子介導(dǎo)耐藥機制的初步研究[J].中國抗生素雜志,2014,39(6):462-465.
[5] 谷存國,周? 偉,王興紅,等.多重耐藥銅綠假單胞菌Ⅰ類整合子基因盒的檢測與耐藥機制研究[J].現(xiàn)代預(yù)防醫(yī)學,2014,41(14):2601-2603.
[6] 楊? 明,錢揚會,趙強元,2013-2015年臨床分離銅綠假單胞菌耐藥性及Ⅰ類整合子變化分析[J].國際檢驗醫(yī)學雜志,2017,38(7):886-889.
[7] 中華人民共和國衛(wèi)生部醫(yī)政司.全國臨床檢驗操作規(guī)程[M].南京: 東南大學出版社,2006:770.
[8] 向萬忠,任碧瓊.銅綠假單胞菌的耐藥性變遷及耐藥機制[J].國際檢驗醫(yī)學雜志,2013,34(10):1323-1324.
[9] KIM H S, PARK B K, KIM S K, et al. Clinical characteristics and outcomes of Pseudomonas aeruginosa bactermia in febtile neutropenic children and adolescents with the impact of antibiotic resistance: a retrospective sdudy[J]. BMC Infections Diseases, 2017,17(1):500.
[10] 辛力華,周? 昕,張? 爽,等.2008-2009年醫(yī)院感染銅綠假單胞菌的耐藥分析[J].中華醫(yī)院感染學雜志,2012,7(22):1477-1479.
[11] 吳曉勇,史俊敏,伍賢鼎.385株銅綠假單胞菌臨床分布與耐藥性分析[J].檢驗醫(yī)學與臨床.2013,10(1):126-127.
[12] 張艷芳,馮廣滿.中山地區(qū)銅綠假單胞菌耐藥性及亞胺培南耐藥機制分析[J].南昌大學學報(醫(yī)學版),2018,58(21):21-22.
[13] 陳約慧,應(yīng)芙蓉,詹玲玲,等.1543株銅綠假單胞菌感染的臨床分布與耐藥性分析[J].中國臨床藥理學雜志,2016,34(24):2814-2817.
[14] 林麗容.銅綠假單胞菌分布及耐藥情況分析[J].臨床合理用藥,2018,11(12):112-113.
[15] 黃興富,范? 華.銅綠假單胞菌的臨床分布及對環(huán)丙沙星耐藥機制的研究[J].中國實驗診斷學,2014,18(3):437-440.
[16] 方平安,熊域皎,鮑永強,等.836株銅綠假單胞菌的臨床分布及耐藥性分析[J].實用醫(yī)院臨床雜志,2018,15(5):201-204.
[17] 張? 泳,林麗英.住院患者銅綠假單胞菌感染分布、耐藥狀況及預(yù)后影響因素[J].檢驗醫(yī)學與臨床,2018,15(24):3786-3787.
[18] STOVER C K, PHAM X Q, ERWIN A L, et al. Complete genome sequence of Pseudomonas aeruginosa PAO1, an opportunistic pathogen[J]. Nature, 2000,406(6799):959-964.
[19] 郭? 良,肖秀飛,左? 娟,等.多重耐藥銅綠假單胞菌院內(nèi)感染的耐藥性研究[J].中外醫(yī)療,2017,31:185-187.
[20] 姜習新.多重耐藥的銅綠假單胞菌Ⅰ類整合子與其多重耐藥基因的相關(guān)性分析[J].檢驗醫(yī)學與臨床,2012,9(3):300-302.
[21] GAUR A, PRAKASH P, ANUPURBA S, et al. Possible role of integrase gene polymerase chain reaction as an epidemilolgical marker:study of multidrug-resistant acinetobacter baumannii isolated? from nosocomial infections[J]. International Journal of Antimicrobial Agents, 2007,29(4):446-450.