国产日韩欧美一区二区三区三州_亚洲少妇熟女av_久久久久亚洲av国产精品_波多野结衣网站一区二区_亚洲欧美色片在线91_国产亚洲精品精品国产优播av_日本一区二区三区波多野结衣 _久久国产av不卡

?

2例新型冠狀病毒肺炎糞便SARS-CoV-2核酸陽性臨床啟示*

2020-03-02 12:15趙四林陳煜楓謝小兵
關(guān)鍵詞:衣殼核酸糞便

李 萍,趙四林,陳煜楓,胡 燕,許 濤,謝小兵△

(湖南中醫(yī)藥大學(xué)第一附屬醫(yī)院:1.醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)與病理中心;2.呼吸內(nèi)科;3.急診科,湖南長沙 410007)

自2019年12月由武漢首次報(bào)道新型冠狀病毒肺炎(COVID-19)感染以來,疫情迅速在湖北省及中國其他地區(qū)蔓延[1-2]。目前,由感染新型冠狀病毒(SARS-CoV-2)所導(dǎo)致的COVID-19已被納入《中華人民共和國傳染病防治法》規(guī)定的乙類傳染病,并采取甲類傳染病的預(yù)防和控制措施。根據(jù)國家衛(wèi)生健康委員會辦公廳/國家中醫(yī)藥管理局辦公室發(fā)布的《新型冠狀病毒肺炎診療方案(試行第五版修正版)》[3],常見的臨床表現(xiàn)有發(fā)熱和(或)呼吸道癥狀,疾病早期白細(xì)胞總數(shù)正?;驕p少,或淋巴細(xì)胞計(jì)數(shù)減少。對確診病例的診斷需具備以下病原學(xué)證據(jù)之一:(1)呼吸道標(biāo)本或血液標(biāo)本實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測SARS-CoV-2核酸陽性;(2)呼吸道標(biāo)本或血液標(biāo)本病毒基因測序,與已知的SARS-CoV-2高度同源。因此準(zhǔn)確、及時(shí)的病原學(xué)核酸檢測已成為診斷COVID-19的重要環(huán)節(jié)。

用于呼吸道病原體核酸檢測的標(biāo)本有上呼吸道標(biāo)本(口咽拭子、鼻咽拭子、鼻咽抽取物等)和下呼吸道標(biāo)本(深咳痰液、呼吸道抽取物、支氣管灌洗液、肺泡灌洗液和肺組織活檢標(biāo)本等)。目前,進(jìn)行SARS-CoV-2核酸檢測最常用的標(biāo)本類型為口/鼻咽拭子,而據(jù)現(xiàn)在已開展的SARS-CoV-2核酸檢測情況來看,咽拭子標(biāo)本核酸檢出率偏低、靈敏度不高。本文報(bào)道2例COVID-19確診病例的診療經(jīng)過,并分析采用不同類型標(biāo)本檢測SARS-CoV-2核酸的檢出情況,為臨床診斷COVID-19時(shí)如何選擇標(biāo)本類型和如何提高核酸檢出率提供參考。

1 臨床資料

病例1:女,34歲。主訴“咳嗽咳痰8 d”?;颊咦栽V2020年1月22日曾與一武漢居住者有接觸,1月24日出現(xiàn)咽痛,未予重視,1月25日出現(xiàn)咳嗽,咳黃痰,無乏力、發(fā)熱、頭痛、肌肉酸痛等。自行服用“蓮花清瘟膠囊”和“銀黃顆?!彼幬锖罂人源螖?shù)有所減少,痰易咳出。1月28日出現(xiàn)胃脹、腹瀉,起初為水樣,后為質(zhì)稀。于2月1日在本院發(fā)熱門診進(jìn)一步診治。

入院后查體:體溫37.0 ℃,脈搏113 次/分,呼吸20 次/分,血壓128/84 mm Hg,指氧飽和度99%。實(shí)驗(yàn)室檢查(血常規(guī)+C-反應(yīng)蛋白):白細(xì)胞總數(shù)6.15×109/L,嗜酸性粒細(xì)胞總數(shù)0.01×109/L,嗜酸性粒細(xì)胞百分比0.2%,淋巴細(xì)胞百分比29.4%,紅細(xì)胞4.11×1012/L,血紅蛋白128 g/L,血小板106×109/L,C-反應(yīng)蛋白42.1 mg/L。肝功能及腎功能未見明顯異常。心肌酶譜:肌酸激酶72 IU/L,肌酸激酶同工酶-MB 21.8 IU/L,乳酸脫氫酶302 IU/L,肌紅蛋白33 μg/L。肺炎支原體免疫球蛋白M 0.17 S/Co,免疫球蛋白G 63 IU/mL,肺炎衣原體免疫球蛋白M 0.07 S/Co,免疫球蛋白G 69 IU/mL;輸血前四項(xiàng)(乙型肝炎病毒表面抗原、丙型肝炎病毒抗體、人類免疫缺陷病毒抗體、梅毒螺旋體抗體)未見異常。胸部CT:雙肺多發(fā)斑片及片狀密度影,考慮感染,不排除病毒性肺炎,隔離病房留觀,見圖1。

注:A表示冠狀位重組圖;B表示橫斷位圖。

圖1病例1的CT影像學(xué)檢查結(jié)果

為進(jìn)一步明確診斷,于2月2日采取咽拭子標(biāo)本,采用手工磁珠法提取核酸,實(shí)時(shí)熒光定量PCR方法檢測SARS-CoV-2核酸(靶標(biāo)包括SARS-CoV-2 ORF 1ab及編碼核衣殼蛋白N基因)。結(jié)果顯示SARS-CoV-2 ORF 1ab及編碼核衣殼蛋白N基因2種靶標(biāo)均有典型S型擴(kuò)增曲線[循環(huán)閾值(Ct值)<40],見圖2。經(jīng)專家組會診,患者2月2日晚上出現(xiàn)發(fā)熱(38.2 ℃),結(jié)合其他臨床表現(xiàn)、影像學(xué)、接觸史及SARS-CoV-2核酸檢測結(jié)果確診為COVID-19。

為進(jìn)一步驗(yàn)證患者其他體液及糞便標(biāo)本中能否檢出SARS-CoV-2核酸,于2月4日早晨采集患者乙二胺四乙酸抗凝全血、尿液和糞便標(biāo)本,分別進(jìn)行SARS-CoV-2核酸檢測。其中糞便標(biāo)本用生理鹽水預(yù)處理制備糞便混懸液,離心后取上清,備用。后續(xù)核酸提取和PCR檢測方法同上述咽拭子的處理方法。該患者全血和尿液標(biāo)本中未檢出SARS-CoV-2核酸,但糞便中SARS-CoV-2 ORF 1ab及編碼核衣殼蛋白N基因2種靶標(biāo)均有典型S型擴(kuò)增曲線(Ct值<40),見圖2。

注:A表示咽拭子;B表示糞便;C表示全血;D表示尿液;NC表示內(nèi)參基因;SARS-CoV-2 ORF 1ab表示開放讀碼框1a/b基因;SARS-CoV-2表示核衣殼蛋白N基因。

圖2病例1的4種標(biāo)本SARS-CoV-2核酸實(shí)時(shí)熒光定量PCR結(jié)果擴(kuò)展曲線

病例2:男,39歲,與病例1為夫妻關(guān)系。主訴“咳嗽、咳痰5 d”?;颊咦栽V2020年1月22日曾與一武漢居住者有接觸,與其妻子同住。1月29日出現(xiàn)咳嗽,咳少量黃色膿痰,伴全身酸痛,無惡寒、發(fā)熱等其余不適。自服“銀花清肺膠囊”和“蓮花清瘟膠囊”后咳嗽、咳痰較前好轉(zhuǎn),改服“銀黃顆?!薄?月1日開始出現(xiàn)鼻塞、咽痛,胸背部酸脹感,自覺燥熱,無惡寒、發(fā)熱、惡心、嘔吐、腹脹、腹瀉等其余不適,食欲、睡眠欠佳,精神一般,大小便正常。于2月3日于本院發(fā)熱門診進(jìn)一步診治。

入院后查體:體溫37.0 ℃,脈搏 86 次/分,呼吸18 次/分,血壓126/84 mm Hg,指氧飽和度99%。實(shí)驗(yàn)室檢查(血常規(guī)+C-反應(yīng)蛋白):白細(xì)胞3.52×109/L,嗜酸性粒細(xì)胞總數(shù)0.01×109/L,嗜酸性粒細(xì)胞百分比0.2%,單核細(xì)胞百分比10.3%,淋巴細(xì)胞總數(shù)0.94×109/L,血小板78×109/L,C-反應(yīng)蛋白6.48 mg/L。肝功能、腎功能、心肌酶、降鈣素原及D-二聚體未見異常。胸部CT:雙肺下葉后基底段斑片狀高密度影,考慮感染,不排除病毒性肺炎;雙肺多發(fā)小結(jié)節(jié)影,右肺上葉及下葉背段病灶考慮結(jié)核可能性大,見圖3。隔離病房留觀。

注:A表示冠狀位重組圖;B表示橫斷位圖。

圖3病例2的CT影像學(xué)檢查結(jié)果

為進(jìn)一步明確診斷,于2月3日采集患者咽拭子標(biāo)本進(jìn)行SARS-CoV-2核酸檢測(方法同病例1),核酸結(jié)果為陰性。2月4日再次采集患者咽拭子、乙二胺四乙酸抗凝全血、尿液及糞便標(biāo)本分別進(jìn)行SARS-CoV-2核酸檢測(方法同病例1),咽拭子PCR結(jié)果中內(nèi)參基因未起峰,在排除了檢驗(yàn)操作和試劑問題后,考慮為取樣不合格;全血和尿液標(biāo)本中未檢出SARS-CoV-2核酸,但糞便中SARS-CoV-2 ORF 1ab及編碼核衣殼蛋白N基因2種靶標(biāo)均有典型S型擴(kuò)增曲線(Ct值<40),見圖4。經(jīng)專家組會診,該病例有明確的接觸史,結(jié)合其他臨床表現(xiàn)、影像學(xué)及SARS-CoV-2糞便標(biāo)本中核酸檢測結(jié)果,確診為COVID-19。

注:A表示第1次咽拭子;B表示第2次咽拭子;C表示糞便;D表示全血;E表示尿液;NC表示內(nèi)參基因;SARS-CoV-2 ORF 1ab表示開放讀碼框1a/b基因;SARS-CoV-2表示核衣殼蛋白N基因。

圖4病例2的4種標(biāo)本SARS-CoV-2核酸實(shí)時(shí)熒光定量PCR結(jié)果擴(kuò)展曲線

2 討 論

COVID-19疫情在中國已進(jìn)入關(guān)鍵時(shí)期,及時(shí)、早期診斷是疫情防控工作中的重要環(huán)節(jié)。在臨床診療過程中,僅依靠臨床癥狀或者實(shí)驗(yàn)室常規(guī)檢查及影像學(xué)檢查均不能作為確診COVID-19的準(zhǔn)確依據(jù),而檢出SARS-CoV-2核酸是確診COVID-19的金標(biāo)準(zhǔn),因此,及時(shí)、準(zhǔn)確的病毒核酸檢測不僅為盡早采取隔離措施,進(jìn)行及時(shí)、有效治療、阻止疫情進(jìn)一步擴(kuò)大發(fā)揮至關(guān)重要的作用,也為重新識別與患者密切接觸、被隔離的大量觀察者節(jié)省寶貴的醫(yī)療資源。

針對SARS-CoV-2核酸檢測,目前已有多家公司開發(fā)出實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測試劑,但近期有媒體及專家反映SARS-CoV-2核酸陽性率偏低,有的病例重復(fù)檢測多次陰性后又出現(xiàn)陽性結(jié)果。也有醫(yī)生反映咽拭子標(biāo)本多次檢測陰性但最后在呼吸道灌洗液標(biāo)本中檢出陽性結(jié)果,以及CT影像篩查出現(xiàn)COVID-19特征但核酸檢測為陰性等問題。為了評估和驗(yàn)證不同類型標(biāo)本的SARS-CoV-2核酸檢出情況,本研究在確診的2例COVID-19患者采集了4種不同類型標(biāo)本分別進(jìn)行SARS-CoV-2核酸檢測,這2例患者糞便標(biāo)本均檢出核酸陽性,特別是病例2,第1次取咽拭子標(biāo)本,結(jié)果為陰性;次日再取咽拭子,內(nèi)參基因未起峰,已排除本次實(shí)驗(yàn)操作和試劑問題,所以判斷為咽拭子取樣不合格或咽拭子取樣時(shí)存在影響PCR的抑制劑,但同批次檢測的該患者糞便標(biāo)本為陽性結(jié)果。這提示筆者有以下幾點(diǎn)值得重視:(1)標(biāo)本采集方法和類型的問題:咽拭子取樣必須遵照取樣操作規(guī)范,最好同時(shí)取口咽拭子和鼻咽拭子放在同一根保存管中,以提高病毒檢出率;糞便標(biāo)本用于檢測SARS-CoV-2核酸的價(jià)值值得重視。糞便取樣方便,且不像咽拭子標(biāo)本對取樣要求高,糞便標(biāo)本的量和質(zhì)容易得到滿足。(2)患者的病情和病程:不同病程、不同病情患者體內(nèi)的病毒存在量可能不同,在疾病的早期或輕癥患者,口/鼻咽部可能病毒載量低,造成核酸檢測假陰性結(jié)果,這時(shí)選擇糞便標(biāo)本進(jìn)行核酸檢測可能是較好的策略,而不論其是否有腹瀉等消化道癥狀。(3)關(guān)于試劑和檢測的問題:選擇質(zhì)量可靠、有保證的檢測試劑。選擇至少含SARS-CoV-2基因的2個(gè)位點(diǎn)(開放讀碼框1a/b、核衣殼蛋白N或E結(jié)構(gòu)蛋白)[4]。選擇內(nèi)參基因?yàn)閮?nèi)源性內(nèi)參,而非人工加入的外源性內(nèi)參,以排除取樣不合格造成的結(jié)果假陰性問題。具體核酸檢測的質(zhì)量控制參照由中華醫(yī)學(xué)會檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)分會發(fā)布的《新型冠狀病毒肺炎病毒核酸檢測專家共識》[5]。

本文中的2例確診病例并沒有明顯的發(fā)熱,只有輕微的上呼吸道癥狀,有病毒性肺炎的影像學(xué)改變,因此,在診斷COVID-19需要結(jié)合呼吸道癥狀、CT影像學(xué)檢查及SARS-CoV-2核酸結(jié)果綜合判斷。同時(shí),筆者建議在無法獲得下呼吸道標(biāo)本的情況下,同時(shí)送檢口/鼻咽拭子標(biāo)本和糞便標(biāo)本進(jìn)行SARS-CoV-2核酸檢測,以期提高核酸檢測的陽性率。由于只有2例確診病例的糞便檢測結(jié)果,尚還不具代表性,期待更多的臨床數(shù)據(jù)驗(yàn)證。

志謝:

感謝湖南中醫(yī)藥大學(xué)第一附屬醫(yī)院放射科沈宏榮教授為本文提供的CT影像學(xué)資料!

猜你喜歡
衣殼核酸糞便
全員核酸
核酸檢測點(diǎn)上,有最可愛的平江人
腺相關(guān)病毒衣殼蛋白修飾的研究進(jìn)展
新型冠狀病毒感染者咽拭子與糞便排毒規(guī)律及臨床表現(xiàn)
第一次做核酸檢測
高分辨率艾滋病病毒衣殼結(jié)構(gòu)圖確定
A new pet obsession of Silkie chicken
核酸檢測
皰疹病毒組裝機(jī)制被揭示
觀察糞便 調(diào)整飲食
SHOW| 黔东| 临城县| 罗平县| 宁远县| 虞城县| 突泉县| 安岳县| 门头沟区| 巴马| 盘山县| 兰考县| 都江堰市| 榆林市| 皋兰县| 翁牛特旗| 柏乡县| 襄汾县| 通州区| 双江| 阳曲县| 定州市| 道孚县| 大余县| 阿尔山市| 房山区| 荥阳市| 岳西县| 南郑县| 安达市| 阆中市| 北辰区| 西峡县| 伊宁县| 尚志市| 郑州市| 永川市| 江油市| 阳江市| 贵溪市| 汤原县|