劉艷艷,劉孝龍,趙萌,范新炯,3
(1. 安徽醫(yī)科大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院,安徽合肥230032;2. 中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué)化學(xué)與材料科學(xué)學(xué)院,安徽合肥230026;3. 中山大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,廣東廣州510275)
鄰苯二甲酸酯(phthalates esters,PAEs)是塑料工業(yè)生產(chǎn)中的一種增塑劑和軟化劑,用來(lái)提高塑料的彈性和柔韌性,因此被廣泛應(yīng)用于工業(yè)塑料產(chǎn)品和消費(fèi)品中,如農(nóng)藥、潤(rùn)滑劑、橡膠、建筑材料、醫(yī)療器材、化妝品、餐具、兒童玩具等,其在塑料制品中的添加量高達(dá)20%~50%[1-2]。全球每年P(guān)AEs的使用量約1.8 億t,而且這一數(shù)據(jù)可能會(huì)持續(xù)增長(zhǎng)[3-5]。在塑料中,PAEs與塑料基質(zhì)以非共價(jià)的形式結(jié)合,因此在塑料產(chǎn)品的生產(chǎn)、使用和廢棄處理過(guò)程中,PAEs 很容易從塑料產(chǎn)品中釋放出來(lái)進(jìn)入環(huán)境[6]。PAEs 在我國(guó)水資源和土壤環(huán)境中檢出率較高,長(zhǎng)江、黃河和松花江等河流的多處水域受到PAEs 的污染,其濃度超出國(guó)家規(guī)定的飲用水標(biāo)準(zhǔn)限值[7]。大量研究表明,PAEs 的殘留直接影響動(dòng)植物的生長(zhǎng),同時(shí)在動(dòng)植物體內(nèi)蓄積,通過(guò)食物鏈轉(zhuǎn)移到人體,危害人類的健康[5]。PAEs 作為一種環(huán)境內(nèi)分泌干擾物,還可以通過(guò)消化、呼吸系統(tǒng)和皮膚等多種途徑進(jìn)入人體,在人體內(nèi)蓄積,并對(duì)人體造成傷害[8]。多項(xiàng)研究表明,長(zhǎng)期接觸PAEs 可誘導(dǎo)胎兒死亡、癌癥發(fā)生、肝臟功能和腎臟功能損傷[9]。也能夠?qū)е滦坌陨扯拘?,主要體現(xiàn)為促黃體生成素(LH)、睪酮、卵泡刺激素(FSH)等激素水平的改變,精子質(zhì)量降低,嚴(yán)重的會(huì)導(dǎo)致睪丸癌[10-11]。產(chǎn)前接觸PAEs 會(huì)影響母體甲狀腺激素和性激素的分泌,同時(shí)其可能導(dǎo)致妊娠期高血壓子癇及妊娠期糖尿病等疾病的發(fā)生、發(fā)展[12-15]。所以,有必要尋找消除PAEs污染物的有效途徑。
生物降解是去除環(huán)境中PAEs 的主要途徑,具有高效、低成本和環(huán)境安全等特點(diǎn)[16]。生物降解途徑是通過(guò)酯酶逐步脫酯化反應(yīng),先生成相應(yīng)的鄰苯二甲酸單酯,然后生成鄰苯二甲酸[17]。近些年通過(guò)基因組文庫(kù)法、基因組或轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及注釋分析等方法克隆出了水解PAEs 的酯酶,但是數(shù)量并不多。來(lái)源于芽孢桿菌HJ14的酯酶EstZ1對(duì)鄰苯二甲酸二乙酯(DEP)有降解作用[18];Sulfobacillus acidophilus DSM10332 中的PAEs 酯酶EstS1、來(lái)源于廢水生物膜的宏基因組文庫(kù)的酯酶DphB 以及克隆于Camelimonas sp. M11 的酯酶均不能水解毒性更大的鄰苯二甲酸二甲酯(DMP)[19-21];來(lái)源于Picrophilus torridus 的PAEs 酯酶EstPt1 和Acinetobacter sp. LMB-5 的酯酶Est_3563 對(duì)鄰苯二甲酸二丁酯(DBP)有降解作用[22-23];從土壤宏基因組文庫(kù)中克隆FAEs 酶BDS4 能水解DMP、DEP、DBP,對(duì)鄰苯二甲酸二丙酯(DPrP)以及其它中長(zhǎng)側(cè)鏈的PAEs 無(wú)降解作用[24];從Bacillus velezensis SYBC H47 中克隆的酯酶BaCEs04 能夠水解DMP、DEP、DPrP、DBP,但是不能降解鄰苯二甲酸二戊酯(DPP)、鄰苯二甲酸二己酯(DnHP)[25]。上述酯酶能夠水解鄰苯二甲酸二烷基酯生成相應(yīng)的單酯,但大多數(shù)酶對(duì)PAEs的降解譜較窄。來(lái)源于Acinetobacter sp. M673 的酯酶能夠水解DMP、DEP、DPrP、DBP、DPP、DnHP 等多種PAEs 為相應(yīng)的單酯,底物譜較廣,最適pH 為7.5,但在堿性pH 中耐受性較差[26]。現(xiàn)階段所篩選到的酯酶最適pH 多在7.5 ~8.0范圍內(nèi),雖然酯酶EstZ1和酯酶EstPt1 最適pH 超過(guò)8.0,但是只能降解一種PAEs[18,23]。因此,篩選具有廣譜PAEs 降解活性和良好環(huán)境適應(yīng)性的酯酶具有重要意義。
本研究構(gòu)建土壤宏基因組文庫(kù),利用功能篩選方法,從中克隆新的酯酶基因,并對(duì)其進(jìn)行異源表達(dá),研究其酶學(xué)性質(zhì),以期獲得廣譜PAEs 降解活性和良好環(huán)境適應(yīng)性的新酯酶,為有效修復(fù)PAEs污染環(huán)境奠定基礎(chǔ)。
1.1.1 化學(xué)品和材料 對(duì)硝基苯酚酯均購(gòu)自Sigma 公司(美國(guó));T4DNA 連接酶、限制性核酸內(nèi)切酶、DNA 聚合酶和低相對(duì)分子質(zhì)量蛋白質(zhì)標(biāo)品購(gòu)自TaKaRa(中國(guó),大連)并根據(jù)制造商的推薦使用;E. Z. N. A?Plasmid Mini Kit 和E. Z. N. A?Gel Extraction Kit 購(gòu)自O(shè)MEGA(美國(guó));三丁酸甘油 酯、羅 丹 明B、PAEs (DMP、DEP、DPrP、DBP、DPP、DnHP)、氨芐青霉素鈉(AMP)、異丙基-β-D-硫代半乳糖苷(IPTG)、硫酸卡那霉素(Kana)和5-溴- 4-氯- 3-吲哚-β-D-半乳糖苷(X-gal)購(gòu)自Aladdin(中國(guó),上海);蛋白純化試劑盒(His·Bind?Purification Kit)購(gòu)于Novagen 公司(德國(guó));胰蛋白胨、酵母提取物購(gòu)于OXOID 公司(英國(guó));引物合成和基因測(cè)序由華大基因完成;除另有說(shuō)明外,其它化學(xué)品和試劑均為分析級(jí),并從商業(yè)來(lái)源購(gòu)買。
1.1.2 培養(yǎng)基的制備
1)LB 培養(yǎng)基(g/L):胰蛋白胨10.0 g、酵母提取物5.0 g、NaCl 10.0 g,調(diào)pH 至7.0 并定容至1 L,121 ℃滅菌20 min。
2)LB 固體培養(yǎng)基(g/L):胰蛋白胨10.0 g、酵母提取物5.0 g、NaCl 10.0 g,加入w 為1.5%~2%的瓊脂粉,調(diào)pH 至7.0,定容至1 L,121 ℃滅菌20 min。
3)酯酶篩選培養(yǎng)基:LB 固體培養(yǎng)基中加入100 μg/mL AMP(或100 μg/mL Kana)、0.1 mmol/L IPTG、0.1%(V/V)三丁酸甘油酯和0.1 mg/mL羅丹明B。
1.1.3 細(xì)菌菌株和質(zhì)粒 使用Escherichia coli DH5α 和E. coli BL21(DE3)(本實(shí)驗(yàn)室保存)作為 分 子 克 隆 的 宿 主。 pUC118 (TaKaRa) 和pET-41a(+)(Novagen)分別用于構(gòu)建宏基因組文庫(kù)和基因表達(dá)。
1.1.4 實(shí)驗(yàn)儀器 Multiskan Go 全波長(zhǎng)酶標(biāo)儀(Thermo)、PCR 擴(kuò)增儀(Bio-Rad)、恒溫?fù)u床(上海智誠(chéng)生物有限公司)、隔水式電熱恒溫培養(yǎng)箱(上海一恒科學(xué)儀器有限公司)、電熱恒溫水槽(上海精宏實(shí)驗(yàn)設(shè)備有限公司)、移液器(Eppendorf)、蛋白電泳儀(北京六一生物科技有限公司)、核酸電泳儀(北京六一生物科技有限公司)、超聲破碎儀(Sonics)、超凈工作臺(tái)(蘇州凈化設(shè)備有限公司)、立式壓力蒸汽滅菌器(合肥華泰集團(tuán)股份有限公司)。
1.2.1 宏基因組文庫(kù)的構(gòu)建和篩選 按參考文獻(xiàn)[27]的方法提取DNA,將提取的總DNA 用BamHⅠ不完全酶切,回收3~8 kb 大小的片段并連接到pUC118 載體中,然后將連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)入到宿主E.coli DH5α,將轉(zhuǎn)化產(chǎn)物涂布到酯酶篩選培養(yǎng)基(含終質(zhì)量濃度為100 μg/mL 的AMP)上,37 ℃培養(yǎng)過(guò)夜。含有酯酶基因的陽(yáng)性克隆菌能夠水解培養(yǎng)基中的三丁酸甘油酯,在菌落周圍形成透明圈,羅丹明B可使透明圈清晰可見。因此,挑出具有明顯透明圈的單克隆,進(jìn)一步測(cè)試其對(duì)對(duì)硝基苯酚乙酸酯(p-NPC2)的水解能力,確定有活性的陽(yáng)性克隆進(jìn)行測(cè)序。利用NCBI 提供的ORF Finder 進(jìn)行開放閱讀框(open reading frame, ORF)搜索,利用NCBI 提供的BLAST 程序進(jìn)行數(shù)據(jù)庫(kù)同源搜索。用ClustalX 軟件分析了氨基酸序列相關(guān)酶的保守基序。
1.2.2 酯酶基因的克隆、表達(dá)和純化 通過(guò)PCR
從pUC118 重組質(zhì)粒中擴(kuò)增目的基因est924。在PCR 引物中引入BamHⅠ和HindⅢ限制性酶切位點(diǎn),引物序列為:Forward:5′- TTATTGGATCCATGCCCAGCCAACAGCTCGC-3′(下劃線部分為BamHⅠ酶切位點(diǎn));Reverse:5′-ATCCAAGCTTCTAGCCGTGCTTGCGCACGAA- 3′(下劃線部分為HindⅢ酶切位點(diǎn))。 PCR 程序?yàn)椋?8 ℃,3 min;98 ℃,30 s ,63 ℃, 30 s,72 ℃,30 s,30 個(gè)循環(huán);72 ℃,10 min。
將擴(kuò)增產(chǎn)物以w=1%的瓊脂糖凝膠電泳,利用E. Z. N. A?Gel Extraction Kit 回收目的片段。純化后的目的片段經(jīng)BamHⅠ和HindⅢ酶切后與經(jīng)同種酶處理的pET-41a(+) 載體連接,并轉(zhuǎn)入E. coli BL21(DE3)感受態(tài)細(xì)胞,涂布于酯酶篩選培養(yǎng)基(100 μg/mL Kana),37 ℃培養(yǎng)過(guò)夜。陽(yáng)性克隆接種于LB液體培養(yǎng)基(含100 μg/mL Kana)中,37 ℃、190 r/min 條件下,恒溫過(guò)夜培養(yǎng)。再以1/100 的接種量將活化的菌液轉(zhuǎn)接到LB 液體培養(yǎng)基(含100 μg/mL Kana)中,37 ℃、200 r/min振蕩培養(yǎng)2~3 h,當(dāng)A600在0.5~0.6 時(shí),加入終濃度為0.1 mmol/L 的IPTG 于30 ℃誘導(dǎo)表達(dá)8 h。收集菌體超聲波破碎,12 000 r/min 離心5 min 獲得粗酶液。用Ni-NTA 純化目的蛋白,加入φ=50%甘油,-20 ℃保存?zhèn)溆?。采用十二烷基硫酸鈉-聚丙烯酰胺凝膠電泳法(SDS-PAGE)測(cè)定變性蛋白的相對(duì)分子質(zhì)量,并用考馬斯亮藍(lán)染色以確定其相對(duì)分子質(zhì)量的大?。?8]。利用BCA蛋白定量測(cè)定純化蛋白濃度。
1.2.3 底物特異性 依據(jù)Fan 等[27]研究方法,使用酯酶/脂肪酶的通用底物p-NPC2、對(duì)硝基苯酚丁酸酯(p-NPC4)、對(duì)硝基苯酚己酸酯(p-NPC6)、對(duì)硝基苯酚辛酸酯(p-NPC8)、對(duì)硝基苯酚葵酸酯(p-NPC10)、對(duì)硝基苯酚月桂酸酯(p-NPC12)、對(duì)硝基苯酚棕櫚酯(p-NPC16)等研究Est924的底物特異性。以pH 7.0、100 mmol/L 的磷酸鉀緩沖液配制100 mmol/L的底物工作液,用于檢測(cè)Est924對(duì)不同碳鏈長(zhǎng)度的底物的水解特性。底物與酶在55 ℃反應(yīng)5 min 后,反應(yīng)液在405 nm 波長(zhǎng)下測(cè)定A值。最高酶活性計(jì)為100%,以相對(duì)酶活性對(duì)底物作圖,以確定底物特異性。
1.2.4 最適溫度 將適量的重組酯酶Est924 與100 mmol/L 的p-NPC4 為底物混合,分別置于20、30、40、50、55、60 和65 ℃的溫度下孵育5 min后,在405 nm 波長(zhǎng)下測(cè)定A 值,以確定最適溫度。最高酶活性計(jì)為100%,以相對(duì)酶活性對(duì)溫度作圖。
1.2.5 最適pH 首先配制不同pH 的緩沖液,然后配制不同pH 的p-NPC4 工作液(pH 6.47~9.18)。將適量的重組酯酶Est924 與不同pH 的底物工作液在55 ℃下反應(yīng)5 min 后,在405 nm 波長(zhǎng)下測(cè)定A 值,以確定最適pH。最高酶活性計(jì)為100%,以相對(duì)酶活性對(duì)pH作圖。
1.2.6 溫度穩(wěn)定性 將適量的酯酶在25、30、40、45、50 ℃等水浴中孵育,不同時(shí)間取樣。以p-NPC4 為底物,55 ℃下反應(yīng)5 min 后,反應(yīng)液在405 nm波長(zhǎng)下測(cè)定A值,測(cè)定其剩余酶活性。以未經(jīng)熱處理的初始酶活定義為100%,以相對(duì)酶活性對(duì)溫度作圖,以評(píng)估酶的熱穩(wěn)定性。
1.2.7 pH穩(wěn)定性 通過(guò)濃縮菌體進(jìn)行超聲波破碎以減少緩沖液本身對(duì)pH 的影響。適量的重組酯酶Est924 在 不 同pH 的Na2HPO4-KH2PO4緩 沖 液 中,30 ℃水浴孵育,不同時(shí)間進(jìn)行取樣。以p-NPC4 為底物,55 ℃下反應(yīng)5 min后,反應(yīng)液在405 nm波長(zhǎng)下測(cè)定A值,測(cè)定其剩余酶活性。以未經(jīng)處理的酶活性定義為100%,以相對(duì)酶活性對(duì)pH作圖,以確定其pH穩(wěn)定性。
1.2.8 生化試劑對(duì)重組酯酶Est924 的影響 在酶液中加入終濃度為1 mmol/L金屬離子(MgCl2、CaCl2、KCl、MnCl2、CoCl2、AlCl3、CrCl2、FeCl3、EDTA)和終濃度為1% (V/V)的有機(jī)溶劑(Tween-80、Triton X-100)。0 ℃放置24 h 后,以p-NPC4 為底物,55 ℃下反應(yīng)5 min,反應(yīng)液在405 nm 波長(zhǎng)下測(cè)定A值,測(cè)定其剩余酶活性。以未經(jīng)生化試劑處理的酶活性定義為100%。評(píng)估金屬離子和有機(jī)溶劑對(duì)酶活性的影響。
1.2.9 重組酯酶Est924 對(duì)鄰苯二甲酸酯的降解能力 根據(jù)Huang 等[29]方法,檢測(cè)重組酯酶Est924對(duì)鄰苯二甲酸酯的降解能力。反應(yīng)體系1 mL,包括:1.6 μL 的PAEs (DMP、DEP、DPrP、DBP、DPP、DnHP)溶解于50 μL 二甲基亞砜(DMSO)、100 μL 粗 酶 液、848.4 μL pH 7.0 (10 mmol/L)Tris-HCl 緩沖液。以不加酶液為對(duì)照,在45 ℃反應(yīng)3 h 后,用等體積的乙酸乙酯進(jìn)行萃取。取適量萃取液點(diǎn)于硅膠板上,進(jìn)行薄層層析(TLC)檢測(cè)。展層劑為:石油醚∶乙酸乙酯∶冰乙酸(體積比為20∶1∶0.5)。展層結(jié)束后取出硅膠板,并在235 nm紫外燈下觀察。
從約12 000 個(gè)克隆子的土壤宏基因組文庫(kù)中,篩選獲得了一個(gè)在酯酶篩選培養(yǎng)基上產(chǎn)生水解透明圈的陽(yáng)性菌。對(duì)測(cè)序結(jié)果分析,發(fā)現(xiàn)一個(gè)924 bp大小的酯酶基因,并命名為est924,序列見附加材料1。該基因編碼由307個(gè)氨基酸殘基構(gòu)成的蛋白,此蛋白與已報(bào)道的來(lái)源于Synechococcus sp. CC9311的alpha/beta-水解酶具有最高同源性(62.42%),與來(lái)源于未培養(yǎng)微生物的酯酶(QCQ29100.1)具有49.51%的同源性。將Est924 與已報(bào)道的PAEs水解酶多序列比對(duì)分析,結(jié)果如圖1所示,發(fā)現(xiàn)編碼的蛋白中存在典型的催化三元組:位于保守基序G-X-S-X-G 中心的活性位點(diǎn)絲氨酸(S152)、保守的天冬氨酸(D253)和組氨酸(H279)。
以p-UC118 重組質(zhì)粒為模板,經(jīng)PCR 擴(kuò)增得到一個(gè)大小924 bp 的基因片段,大小與預(yù)期一致。以pET-41a(+)為載體、E. coli BL21(DE3)為宿主菌構(gòu)建重組菌。重組菌誘導(dǎo)表達(dá)后的蛋白利用Ni-NTA 分離純化,SDS-PAGE 電泳檢測(cè)純化后蛋白,如圖2所示,箭頭指示目的蛋白,已去除絕大多數(shù)的雜蛋白。目的蛋白的相對(duì)分子質(zhì)量為58 320,其中包含24 550的融合標(biāo)簽,與預(yù)測(cè)的蛋白相對(duì)分子質(zhì)量相符。
2.3.1 底物特異性 選用酯酶/脂肪酶的通用底物研究Est924 的底物特異性,結(jié)果見圖3。在所檢測(cè)的對(duì)硝基苯酚酯中,重組酯酶Est924 對(duì)p-NPC4 的活性最高,p-NPC2、p-NPC6、p-NPC8 活性分別為p-NPC4 的50%、20%、14%,對(duì)p-NPC10、p-NPC12、p-NPC16幾乎沒有活性。說(shuō)明酯酶的最適底物為p-NPC4,更適合降解短鏈至中鏈的對(duì)硝基苯酚酯。以p-NPC4 為底物時(shí),該酶的Km和Vmax分別為77 μmol·L-1和6 μmol·L-1·min-1。
圖1 Est924的多序列比對(duì)分析Fig.1 Multiple sequence alignment of Est924
圖2 重組蛋白Est924的SDS-PAGE鑒定Fig.2 SDS-PAGE electrophoresis of esterase protein
箭頭所指出重組蛋白Est924;M:低相對(duì)分子質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)蛋白(TaKaRa);1:純化前的重組蛋白Est924; 2:純化后的重組蛋白Est924
圖3 重組蛋白Est924的底物特異性Fig.3 Substrate specificity of Est924
2.3.2 最適溫度 在20、30、40、50、55、60、65 ℃下測(cè)定溫度對(duì)酯酶Est924 活性的影響,結(jié)果見圖4。隨著溫度的升高,酯酶活性逐漸升高,當(dāng)溫度超過(guò)55 ℃時(shí),酯酶活性下降,說(shuō)明其最適溫度為55 ℃。在30~60 ℃溫度范圍內(nèi),相對(duì)酶活性均在60%以上,說(shuō)明該酶具有很好的溫度適應(yīng)性。
2.3.3 最適反應(yīng)pH 在pH 6.47 ~9.18 的范圍內(nèi),以p-NPC4 為底物,測(cè)定酯酶的最適反應(yīng)pH,結(jié)果見圖5。重組酯酶Est924 在pH 8.34 時(shí)活性最高,在pH 7.38~9.18 的范圍內(nèi),相對(duì)酶活在80%以上,表明該酶在中性至堿性條件下有很好的適應(yīng)性。
2.3.4 溫度穩(wěn)定性 將酯酶Est924 在25、30、40、45、50 ℃分別保溫不同的時(shí)間,以評(píng)估其熱穩(wěn)定性,結(jié)果見圖6。重組酯酶Est924 在25 ℃和30 ℃處理24 h 后,保留80%以上的活性,說(shuō)明酯酶在30 ℃以下十分穩(wěn)定;在40 ℃孵育12 h 后仍保留約50%的酶活性。以上表明該酶在中低溫條件下具有較好的熱穩(wěn)定性。但50 ℃時(shí)酶活性下降較明顯,熱處理2 h的剩余酶活性為20%。
圖4 溫度對(duì)重組酯酶Est924活性的影響Fig.4 Effect of temperature on activity of Est924
圖5 pH對(duì)重組酯酶Est924活性的影響Fig.5 Effect of pH on activity of Est924
2.3.5 pH 穩(wěn)定性 重組酯酶Est924 在不同pH(6.47~9.18)緩沖液中處理不同的時(shí)間后檢測(cè)剩余酶活性,以此確定pH 對(duì)酯酶穩(wěn)定性的影響,結(jié)果見圖7。pH 6.47 時(shí),孵育5 h 酯酶活性下降到50%左右;pH 6.98 時(shí),12 h 酯酶活性下降至初始的70%左右;在pH 7.38~9.18 的范圍內(nèi),24 h 仍保留70%以上的初始活性。說(shuō)明此酶在堿性條件下具有良好的穩(wěn)定性,能夠很好的適應(yīng)pH 的變化,是一種耐堿性酯酶。
2.3.6 生化試劑對(duì)重組酯酶Est924 的影響 酶促反應(yīng)速率會(huì)受化學(xué)物質(zhì)的影響。表1 的結(jié)果顯示,多數(shù)金屬離子對(duì)Est924 表現(xiàn)為不同程度的抑制作用,Mg2+、Ca2+、K+、Mn2+、Co2+、Al3+、Cr2+等的活性 分 別 為80.1%、 90.2%、 86.2%、 68.4%、31.3%、64.1%、78.2%。Fe3+以及表面活性劑Tween-80和Triton X-100等對(duì)Est924有不同程度的激活作用,酶活性分別為127.2%、107.1% 和140.0%。金屬螯合劑EDTA 對(duì)酯酶Est924 表現(xiàn)為激活作用,說(shuō)明酯酶Est924 是非金屬酶,其催化活性不依懶于金屬離子。
圖6 溫度對(duì)重組酯酶Est924穩(wěn)定性的影響Fig.6 Effect of temperature on stability of Est924
圖7 pH對(duì)重組酯酶Est924穩(wěn)定性的影響Fig.7 Effect of pH on stability of Est924
以DMP、DEP、DPrP、DBP、DPP、DnHP 為底物來(lái)研究酯酶對(duì)PAEs降解作用,TLC結(jié)果如圖8所示。圖中對(duì)照組條帶為PAEs,條帶的明暗代表著PAEs 量的多少。實(shí)驗(yàn)組5、7、9 中PAEs 條帶已基本消失,DPrP、DBP 和DPP 基本被降解完全;實(shí)驗(yàn)組1 和3 中PAEs 條帶明顯變淡。以上結(jié)果表明重組酯酶Est924 對(duì)DMP、DEP、DPrP、DBP 和DPP 具有很好的降解能力。實(shí)驗(yàn)組11 中PAEs 條帶與對(duì)照組12 相比變淡,但還比較明顯,說(shuō)明該酶對(duì)DnHP 的降解能力較弱。仔細(xì)觀察實(shí)驗(yàn)組發(fā)現(xiàn),在1、3、5、7、9 的PAEs 條帶下方、點(diǎn)樣點(diǎn)上方位置,有新條帶產(chǎn)生,而在對(duì)照組中沒有。推測(cè),新條帶是PAEs 經(jīng)水解后產(chǎn)生的單酯,重組酯酶Est924對(duì)鄰苯二甲酸酯的降解作用是通過(guò)逐步脫酯化反應(yīng)實(shí)現(xiàn)的。
表1 生化試劑對(duì)酯酶Est924 活性的影響Table 1 Effect of the various chemical reagents on activity of Est924
鄰苯二甲酸酯是一類全球性的重要環(huán)境污染物。其中,短鏈烷基酯(C1~C4)的溶解度比長(zhǎng)鏈同系物高,毒性更大[30]。美國(guó)環(huán)保局(EPA)將鄰苯二甲酸二(2-乙基己基)酯(DEHP)、鄰苯二甲酸正二辛酯(DOP)、鄰苯二甲酸丁基芐基酯(BBP)、DBP、DEP、DMP 等6 種PAEs 列為優(yōu)先控制的有毒污染物,中國(guó)環(huán)境監(jiān)測(cè)總站將DEP、DMP 和DOP 等3 種PAEs 列為優(yōu)先控制污染物[31]。因此,找到廣譜高效降解PAEs 且具有良好環(huán)境適應(yīng)性的降解酶尤為重要。
本研究利用宏基因組技術(shù)從土壤中挖掘出新酯酶Est924,并研究了其酶學(xué)性質(zhì)以及對(duì)環(huán)境污染物PAEs 的生物降解。通過(guò)對(duì)Est924 進(jìn)行序列分析,推測(cè)活性位點(diǎn)與絲氨酸、天冬氨酸和組氨酸形成的催化三聯(lián)體有關(guān),同時(shí)在活性絲氨酸位點(diǎn)周圍含有典型的保守五肽結(jié)構(gòu)G-X-S-X-G,這說(shuō)明Est924 屬于酯酶家族。底物特異性結(jié)果顯示,重組酯酶Est924 對(duì)p-NPC4 的活性最高,對(duì)p-NPC2 的活性為50%,對(duì)p-NPC6 和ρ-NPC8 活性非常低,而當(dāng)碳鏈長(zhǎng)度大于10 時(shí)幾乎沒有活性,這與酯酶作用底物的碳鏈長(zhǎng)度小于10 具有一致性[32]。重組酯酶Est924 的最適溫度為55 ℃,在30~60 ℃溫度范圍內(nèi),相對(duì)酶活性均在60%以上;該酶在25 ℃和30 ℃處理24 h 后,保留80%以上的活性,在40 ℃孵育12 h后仍保留約50%的酶活性。這表明該酶具有很好的溫度適應(yīng)性和較好的熱穩(wěn)定性。重組酯酶Est924在pH 8.34時(shí)活性最高,在pH 7.38~9.18 的范圍內(nèi),相對(duì)酶活在80%以上;在pH 7.38~9.18 的環(huán)境下處理24 h,仍保留70%以上的酶活性。這表明該酶是一個(gè)耐堿酶,且在中性至堿性條件下有很好的適應(yīng)性。研究重組酯酶Est924 對(duì)PAEs 的降解能力發(fā)現(xiàn),該酶對(duì)DMP、DEP、DPrP、DBP 和DPP 均具有很好的降解能力。以上研究數(shù)據(jù)證明,重組酯酶Est924 是一個(gè)具有良好穩(wěn)定性和環(huán)境適應(yīng)性的耐堿酯酶,且對(duì)PAEs的降解具有廣譜的底物特異性。
圖8 TLC分析Est924對(duì)鄰苯二甲酸酯的降解能力Fig.8 PAEs degradation ability analysis of Est924 by TLC
目前,也有降解PAEs 堿性酯酶的報(bào)道,它們與Est924 有著32%以上的同源性,基本的酶學(xué)性質(zhì)有一些相似之處。其中EstZ1 在pH 7.0~9.5 的范圍內(nèi)維持50%以上的活性,對(duì)DEP 有降解作用,對(duì)其它PAEs 無(wú)水解作用[18];EstPt1 是一個(gè)耐熱堿性酯酶,最適溫度高達(dá)85 ℃,有著良好的熱穩(wěn)定性,但只有水解DBP 的數(shù)據(jù)[23];酯酶EstSP1 的最適pH(9.0)高于酯酶Est924,能很好的耐受有機(jī)溶劑(甲醇和DMSO),最適溫度為40 ℃,在25 ℃下處理2 h,酶活性下降為初始的37%,穩(wěn)定性較差[33]。近些年,克隆的能降解PAEs 的酯酶/脂肪酶數(shù)量還不多。來(lái)源于Nocardia erythropolis 的脂肪酶,其最適pH 為8.6,在pH 7.0~8.0 范圍穩(wěn)定,能分解大多數(shù)PAEs,底物譜較廣,但其氨基酸序列未報(bào)道[34]。DphB 是一種冷適應(yīng)酶,最適溫度為10 ℃,能催化DPrP、DBP、DPP 的水解[20]??寺∮贑amelimonas sp. M11 的酯酶是一種金屬酶,不能水解DMP,當(dāng)pH 大于8.0 時(shí)該酶幾乎沒有活性[19]。BDS4 是一個(gè)對(duì)PAEs 和阿魏酸酯均具有降解 作 用 的 酯 酶,能 水 解3 種 短 鏈PAEs[24];BaCEs04 最適溫度為60 ℃,高于酯酶Est924,在pH 5.5~8.0 范圍內(nèi)穩(wěn)定,只能水解PAEs(C1 ~C4) 到 相 應(yīng) 的 單 酯[25]。來(lái) 源 于Acinetobacter sp.M673的酯酶[26]與Est924底物譜類似,該酶最適反應(yīng)pH 為7.5,當(dāng)pH 值超過(guò)6.0 和9.0 時(shí),酶活性急劇下降。酯酶GoEst15 具有廣譜的底物特異性,能夠水解幾乎所有的PAEs,在pH 7.5~8.0 條件下處理不到2 h,幾乎失活,在40 ℃活性迅速下降[29],其pH和溫度穩(wěn)定性有待提高。
值得注意的是,現(xiàn)階段所報(bào)道的酯酶多水解PAEs 的一個(gè)酯鍵,生成單酯;僅有個(gè)別酶能水解兩個(gè)酯鍵,如GoEst15 能將PAEs 水解為相應(yīng)的單酯,與GoEstM1 共表達(dá)后將單酯水解為鄰苯二甲酸[29];從Bacillus sp. K91 基因組克隆了一個(gè)酯酶基因CarEW 能水解鄰苯二甲酸二異丁酯(DIBP)的兩個(gè)酯鍵生成鄰苯二甲酸[35]。本文Est924 具有良好的酶學(xué)性質(zhì),但其對(duì)PAEs 的降解機(jī)制需要繼續(xù)深入研究。后續(xù)我們將利用突變技術(shù)對(duì)Est924定向改造,獲得更優(yōu)良的突變酶,同時(shí)闡述其對(duì)PAEs 的降解機(jī)理,從而獲得更好的應(yīng)用前景和理論研究基礎(chǔ)。