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我國18個(gè)省份豬源腸球菌耐藥調(diào)查及分析

2021-05-20 01:58姚曉慧仝慧嫻王舒豐魏建超邵東華邱亞峰馬志永李蓓蓓夏利寧
關(guān)鍵詞:豬源糞腸萬古霉素

姚曉慧,仝慧嫻,王舒豐,魏建超,劉 珂,邵東華,邱亞峰,馬志永,李蓓蓓,夏利寧

(1.新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物醫(yī)學(xué)院,烏魯木齊830052;2.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院上海獸醫(yī)研究所,上海200241)

腸球菌(Enterococcus)是革蘭氏陽性兼性厭氧菌,對(duì)多種抗生素具有天然耐藥和獲得性耐藥,是一種重要的人畜共患菌,是造成醫(yī)院內(nèi)感染的第二大病原菌[1-3]。近年來,隨著臨床抗菌藥物的廣泛使用,腸球菌對(duì)抗菌藥物的耐藥性和耐藥種類不斷增加,尤其是耐萬古霉素腸球菌(vancomycin resistant Enterococcus,VRE)和氨基糖苷類高水平耐藥腸球菌(high-level aminoglycoside resistant,HLAR)的出現(xiàn),使得臨床治療的困難性進(jìn)一步加大[4]。2017年2月,世界衛(wèi)生組織將屎腸球菌列入重點(diǎn)病原體清單,以期在應(yīng)對(duì)腸球菌對(duì)抗生素產(chǎn)生耐藥性時(shí)作出有效指導(dǎo)[5]。

養(yǎng)殖場(chǎng)的動(dòng)物源腸球菌耐藥菌株可通過食物鏈傳遞給人,其耐藥基因可在質(zhì)粒等移動(dòng)元件介導(dǎo)水平傳播給其他病原菌,給人類健康和公共衛(wèi)生帶來威脅[6]。本研究系統(tǒng)地對(duì)我國18個(gè)省市的豬源腸球菌進(jìn)行分離鑒定,并對(duì)其耐藥性進(jìn)行調(diào)查分析,為腸球菌耐藥危害的風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估和動(dòng)物源耐藥性的防控提供了一定的科學(xué)依據(jù)。

1. 材料與方法

1.1 菌株來源 2016年12月~2017年5月,自我國18個(gè)省市59個(gè)豬養(yǎng)殖場(chǎng),用無菌拭子采集新鮮糞便,共836份樣品,采樣地點(diǎn)包括:新疆維吾爾自治區(qū)、青海省、四川省、貴州省、北京市、云南省、山西省、浙江省、遼寧省、福建省、海南省、黑龍江省、河北省、吉林省、江西省、山東省、河南省、上海市;標(biāo)準(zhǔn)菌株糞腸球菌ATCC29212、金黃色葡萄球菌ATCC29213均為本實(shí)驗(yàn)室保存。

1.2 藥品與試劑 β-內(nèi)酰胺類:氨芐西林(ampicillin)(AM);氨基糖苷類:阿米卡星(amikacin)(AMK);喹諾酮類:環(huán)丙沙星(ciprofloxacin)(CIP);酰胺醇類:氟苯尼考(florfenicol)(FFC)、氯霉素(chloramphenicol)(CHL);大環(huán)內(nèi)酯類:紅霉素(erythromycin)(ERY);四環(huán)素類:四環(huán)素(tetracycline)(TET)、米諾霉素(minomycin)(MI)、多西環(huán)素(doxycycline)(DOX);惡唑烷酮類:利奈唑胺(linezolid)(LZD);糖肽類:萬古霉素(vancomycin)(VAN)。以上抗菌藥物均購自上海源葉生物科技有限公司。

Mueller-Hinton肉湯、BHI肉湯、Mueller-Hinton瓊脂、腸球菌培養(yǎng)基(疊氮鈉-結(jié)晶紫-七葉苷瓊脂)和檸檬酸鐵銨均購自北京陸橋技術(shù)股份有限公司;細(xì)菌瓊脂粉購自青島高科園海博生物有限公司;1×TE緩沖液購自生工生物工程(上海)有限公司;DL2000 DNA marker購自天根生化科技(北京)有限公司;2×Taq PCR Master Mix、瓊脂糖、50×TAE和核酸染料均購自上海翊圣生物科技有限公司。

1.3 分離及初步鑒定 將采集的樣品置于1 mL 6.5%氯化鈉BHI肉湯中,42℃、200 rpm培養(yǎng)18~24 h,用無菌接種環(huán)劃線接種于腸球菌培養(yǎng)基平板上,37℃倒置培養(yǎng)18~24 h,選取平板表面呈白色圓滑、凸起、大小適中且菌落周圍顯黑色的單一菌落增菌后,制成20%甘油菌,-20℃保存?zhèn)溆肹7]。

1.4 基因組制備 將初步鑒定的腸球菌單菌落接種于1 mL BHI培養(yǎng)基中,37℃、200 rpm培養(yǎng)過夜,吸取200 μL菌液13 201×g離心1 min,棄上清液;加500 μL 1×TE緩沖液震蕩混勻,13 201×g離心1 min,棄上清液;加200 μL 1×TE緩沖液震蕩混勻,沸水煮2 min,冰浴2 min;17 968×g離心5 min,取上清液(60~80 μL即可)做DNA模板,-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>

1.5 引物合成 根據(jù)文獻(xiàn)[7]已有序列合成引物,對(duì)初步鑒定分離出的腸球菌擴(kuò)增屎腸球菌(E. faecium)、糞腸球菌(E. faecalis)、鶉雞腸球菌(E. gallinarum)及鉛黃腸球菌(E. casseliflavus)的持家基因。對(duì)未鑒定出的腸球菌用16S rRNA擴(kuò)增后送測(cè)序,并對(duì)測(cè)序結(jié)果進(jìn)行比對(duì)以確定種屬。引物均由上海英俊生物有限公司合成,見表1。

表1 本研究所用引物Table 1 Primers used in this study

1.6 藥敏試驗(yàn) 按照CLSI[8]推薦的瓊脂稀釋法,對(duì)分離的腸球菌菌株進(jìn)行11種抗菌藥物的最小抑菌濃度(minimum inhibitory concentration,MIC)測(cè)定。以糞腸球菌ATCC29212和金黃色葡萄球菌ATCC29213作為質(zhì)控菌株。MIC結(jié)果均按照CLSI發(fā)布的M100-S26(2016)抗微生物抗菌藥物敏感性試驗(yàn)的標(biāo)準(zhǔn)執(zhí)行。氟苯尼考因目前尚無腸球菌MIC值的判定標(biāo)準(zhǔn),故采用CLSI[9]發(fā)布的VET01-A4中豬源鏈球菌氟苯尼考的判定標(biāo)準(zhǔn)。結(jié)果以敏感(S)、中介(I)、耐藥(R)3種形式表示。

2 結(jié)果

2.1 豬源腸球菌分離結(jié)果 通過對(duì)初步鑒定分離出的腸球菌進(jìn)行屎腸球菌(E. faecium)、糞腸球菌(E.faecalis)、鶉雞腸球菌(E. gallinarum)的持家基因擴(kuò)增,電泳結(jié)果均與預(yù)期片段大小符合(圖1)。對(duì)未鑒定出的腸球菌用16S rRNA擴(kuò)增后送測(cè)序,對(duì)測(cè)序結(jié)果進(jìn)行比對(duì)以確定種屬。

圖1 腸球菌持家基因PCR擴(kuò)增結(jié)果Fig.1 Amplification of Enterococcus housekeeping gene by PCR

836份樣品中共分離到225株腸球菌(表2),其中屎腸球菌106株,占腸球菌總數(shù)量的47.1%;糞腸球菌共56株,占腸球菌總數(shù)量的24.9%;小腸腸球菌共34株,占腸球菌總數(shù)量的15.1%;鶉雞腸球菌共17株,占腸球菌總數(shù)量的6.2%;鉛黃腸球菌7株,堅(jiān)忍腸球菌4株,Enterococcus thailandicus1株。

表2 我國18省市豬源腸球菌分離結(jié)果Table 2 The isolation of Enterococcus spp. of pig origin from 18 provinces in China

從我國不同省市豬源腸球菌的分離結(jié)果可知,分離率普遍不超過50%。腸球菌分離率由高到低的豬養(yǎng)殖場(chǎng)所在地依次為貴州省、青海省、云南省、上海市、河北省、江西省、北京市、新疆維吾爾自治區(qū)、山東省、福建省、四川省、吉林省、河南省、浙江省、海南省、遼寧省、黑龍江省、山西省,其中貴州省、四川省、福建省、河北省、上海市豬養(yǎng)殖場(chǎng)分離的腸球菌種類較多。

2.2 225株豬源腸球菌的藥敏試驗(yàn)結(jié)果 對(duì)分離出的豬源腸球菌進(jìn)行11種抗菌藥物的耐藥檢測(cè)(圖2),豬源腸球菌除對(duì)萬古霉素和利奈唑胺不耐藥外,對(duì)其他抗菌藥物均呈現(xiàn)不同程度的耐藥。豬源腸球菌對(duì)阿米卡星、氟苯尼考、紅霉素、四環(huán)素、米諾環(huán)素和多西環(huán)素的耐藥率分別是94.7%(213/225)、88.4%(199/225)、86.2%(194/225)、98.2%(221/225)、88.9%(200/225)、89.3%(201/225),6種抗菌藥物的耐藥率平均高達(dá)91%。對(duì)環(huán)丙沙星的耐藥率為63.1%(142/225),對(duì)氨芐西林的敏感率為66.2%(149/225),對(duì)利奈唑胺的中介率達(dá)54.7%(123/225),對(duì)萬古霉素高度敏感。由圖3可知,我國18個(gè)省市的豬源腸球菌多藥耐藥菌株主要集中在6耐、7耐和8耐,共占腸球菌總數(shù)的72.9%(164/225)。腸球菌在5耐及5耐以下的耐藥菌株共占腸球菌總數(shù)的15.5%(35/225),對(duì)9種抗菌藥物均耐藥的腸球菌菌株有26株,占腸球菌總數(shù)的11.6%。

圖2 豬源腸球菌對(duì)11種抗菌藥物的耐藥結(jié)果Fig.2 Resistance rates of 11 tested antibiotics for Enterococcus isolates of pig origin

圖3 豬源腸球菌多藥耐藥譜Fig.3 Multi-drug resistance patterns of Enterococcus isolates of pig origin

2.3 豬源不同腸球菌屬對(duì)11種抗菌藥物耐藥情況分析 整體來看,我國18個(gè)省市豬源不同腸球菌屬中的糞腸球菌(57株)、屎腸球菌(106株)、小腸腸球菌(34株)對(duì)除利奈唑胺和萬古霉素不耐藥外,對(duì)其余9種測(cè)試抗菌藥物均顯示不同程度的耐藥(圖4)。糞腸球菌、屎腸球菌、小腸腸球菌均對(duì)阿米卡星、氟苯尼考、紅霉素、四環(huán)素、多西環(huán)素、米諾環(huán)素6種抗菌藥物的耐藥情況沒有明顯差異,耐藥率在80%以上。屎腸球菌對(duì)氨芐西林的耐藥率明顯高于其他兩種腸球菌的耐藥率,對(duì)環(huán)丙沙星耐藥率高于小腸腸球菌的耐藥率。糞腸球菌對(duì)氯霉素的耐藥率高于其他兩種腸球菌的耐藥率。

圖4 豬源不同腸球菌對(duì)11種抗菌藥物的耐藥結(jié)果Fig.4 Resistance of 11 tested antibiotics for di ff erent Enterococcus isolates of pig origin

3 討論

腸球菌與大腸桿菌都是人和家畜腸道常在菌,腸球菌的天然耐藥和易獲得性耐藥使其成為耐藥基因的儲(chǔ)存庫,是研究細(xì)菌耐藥的重要菌群[10-11]。

從本研究中豬源不同腸球菌屬分離結(jié)果可以看出,屎腸球菌的分離率最高;從不同省市豬養(yǎng)殖場(chǎng)分離的腸球菌結(jié)果來看,屎腸球菌的分離率也是較高的,這說明在被檢豬養(yǎng)殖場(chǎng)的腸球菌中主要分布的是屎腸球菌,其感染率較高,與劉曉薇等[12]的報(bào)道相符合。

本研究的藥敏結(jié)果表明,豬源腸球菌對(duì)檢測(cè)的11種抗菌藥物存在不同程度的耐藥。除萬古霉素和利奈唑胺外,對(duì)其余9種測(cè)試抗菌藥物均有不同程度的耐藥。其中,不同腸球菌屬對(duì)四環(huán)素類的3種抗菌藥物均有較高的耐藥率,高達(dá)80%以上,與幸文定[13]和吳帆等[14]報(bào)道的豬源腸球菌對(duì)四環(huán)素類抗菌藥物的耐藥結(jié)果相似。分析其原因可能是多年來由于四環(huán)素類的廣泛應(yīng)用,臨床常見革蘭陽性菌病原菌對(duì)四環(huán)素多數(shù)耐藥,并且,同類品種之間存在交叉耐藥。腸球菌對(duì)紅霉素抗菌藥物的耐藥率(86.2%)偏高,與陳麗穎等[15]報(bào)道的豬源腸球菌對(duì)紅霉素的耐藥率(84.62%)相近。

值得慶幸的是,本研究中未檢出對(duì)萬古霉素耐藥的菌株,但豬源腸球菌對(duì)萬古霉素的中介率為11.1%,養(yǎng)殖場(chǎng)應(yīng)持續(xù)對(duì)萬古霉素的耐藥性進(jìn)行監(jiān)測(cè)并及時(shí)做出相應(yīng)措施。豬源腸球菌對(duì)氯霉素的耐藥率(29.8%)最低,這個(gè)結(jié)果可能與氯霉素被禁止用于食品動(dòng)物有關(guān)。值得注意的是,豬源腸球菌對(duì)利奈唑胺的中介率約達(dá)60%,利奈唑胺作為治療VRE和MRSA的最后一道防線,若不對(duì)使用劑量加以控制,可能會(huì)造成“無藥可用”的境地[15-16]。

多藥耐藥結(jié)果顯示,本研究中腸球菌的耐藥水平普遍較高,耐藥譜型較廣泛,最多可耐9種抗菌藥物,說明養(yǎng)殖場(chǎng)多局限于使用相對(duì)固定的幾種藥物,未能根據(jù)細(xì)菌的耐藥情況及時(shí)做出調(diào)整,長(zhǎng)期如此使用可導(dǎo)致多重耐藥菌株的產(chǎn)生。

綜上所述,我國18個(gè)省市豬養(yǎng)殖場(chǎng)分離的腸球菌對(duì)常見抗菌藥物耐藥率較高,耐藥率較高的幾類抗菌藥物分別是四環(huán)素類、大環(huán)內(nèi)酯類、氨基糖苷類,其耐藥基因可傳播給人或其他動(dòng)物,造成人類健康和公共衛(wèi)生的潛在威脅。因此,腸球菌的耐藥調(diào)查應(yīng)引起更多關(guān)注,做好長(zhǎng)期監(jiān)測(cè)工作,嚴(yán)格控制抗菌藥物的使用,以達(dá)到最好的治療效果和減少新的耐藥菌株的產(chǎn)生。

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