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lncRNA AL158206.1/miR-340-5p/ARL4C軸對(duì)食管癌增殖和遷移的調(diào)控作用

2021-09-09 10:29蔣志勇李奎生呂志武黃明沂
中國(guó)醫(yī)藥指南 2021年22期
關(guān)鍵詞:細(xì)胞系食管癌靶向

吳 菁 蔣志勇 李奎生 劉 芳 呂志武 * 黃明沂 肖 瑤

(1 深圳市寶安區(qū)福永人民醫(yī)院消化內(nèi)科,廣東 深圳 518103;2 武漢大學(xué)中南醫(yī)院影像科,湖北 武漢 430071;3 南方醫(yī)科大學(xué)附屬深圳寶安醫(yī)院消化內(nèi)科,廣東 深圳 518101)

食管癌是最常見的消化道惡性腫瘤之一,近年來(lái)食管癌的診斷和治療得到不斷發(fā)展,但患者預(yù)后并不理想,中晚期食管癌患者的5年生存率低于20%[1-2]。食管癌發(fā)生、發(fā)展過(guò)程伴隨多種分子及信號(hào)通路的協(xié)同作用[3]。長(zhǎng)鏈非編碼RNA(longchain non-coding RNA,lncRNA)是一種轉(zhuǎn)錄長(zhǎng)度超過(guò)200個(gè)核苷酸的內(nèi)源性RNA分子,通過(guò)調(diào)控基因表達(dá)影響細(xì)胞增殖、炎性反應(yīng)、細(xì)胞凋亡、細(xì)胞外基質(zhì)降解等病理過(guò)程[4-5]。有研究表明,lncRNA在食管癌、鼻咽癌、淋巴癌等多種腫瘤的發(fā)生和進(jìn)展過(guò)程中起重要作用[6-7]。本研究旨在研究AL158206.1在食管癌細(xì)胞系中的表達(dá),觀察上調(diào)AL158206.1對(duì)食管癌細(xì)胞增殖及遷移的影響,探討AL158206.1是否通過(guò)調(diào)控miR-340-5p/ARL4C軸發(fā)揮其作用。

1 材料與方法

1.1 細(xì)胞與主要試劑 人食管上皮細(xì)胞(HET-1A)和食管癌細(xì)胞系(Eca109、KYSE30、TE-13、EC9706)購(gòu)自中國(guó)科學(xué)院上海細(xì)胞庫(kù)。實(shí)時(shí)熒光定量聚合酶鏈反應(yīng)(qRT-PCR)試劑盒購(gòu)自日本TaKaRa公司。NC質(zhì)粒和AL158206.1質(zhì)粒購(gòu)自北京合生基因科技有限公司。RPMI1640培養(yǎng)基購(gòu)自美國(guó)HyClone公司。胎牛血清購(gòu)自美國(guó)Gibco公司。Transwell小室購(gòu)自美國(guó)康寧公司。Lipofectamine 3000試劑購(gòu)自美國(guó)Sigma公司。MTT試劑盒購(gòu)自南京諾唯贊生物科技公司。一抗和二抗購(gòu)自美國(guó)Santa Cruz公司。

1.2 細(xì)胞培養(yǎng)及轉(zhuǎn)染 食管癌細(xì)胞系和食管上皮細(xì)胞在含10%胎牛血清的RPMI-1640培養(yǎng)基進(jìn)行培養(yǎng),培養(yǎng)條件是37 ℃、5%CO2、飽和濕度。將對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期KYSE30細(xì)胞接種至6孔板,細(xì)胞貼壁生長(zhǎng)后,嚴(yán)格按照Lipofectamine 3000試劑說(shuō)明書進(jìn)行轉(zhuǎn)染操作,分別轉(zhuǎn)染AL158206.1質(zhì)粒(AL158206.1組)和NC質(zhì)粒(NC組),轉(zhuǎn)染12 h后更換培養(yǎng)基培養(yǎng)。

1.3 qRT-PCR檢測(cè)AL158206.1、miR-340-5p和ARL4C mRNA表達(dá)水平TRIzol試劑提取食管癌細(xì)胞系和人食管上皮細(xì)胞系總RNA,逆轉(zhuǎn)錄合成cDNA后在PCR儀進(jìn)行擴(kuò)增,對(duì)AL158206.1、miR-340-5p和ARL4C mRNA表達(dá)水平進(jìn)行定量分析,U6和GAPDH分別為內(nèi)參。相應(yīng)引物序列如下,U6上游引物為5'-CTCGCTTCGGCAGCACA-3',下游引物為5'-AACGCTTCACGAATTTGCGT-3';miR-340-5p上游引物為5'-GCTTATAAAGCAATGAGACTGATT-3',下游引物為5'-CAGTGCGTGTCGTGGAGT-3';GAPDH上游引物為5'-ACAACTTTGGTATCGTGGAAGG-3',下游引物為5'-GCCATCACGCCACAGTTTC-3';AL158206.1上游引物為5'-TGGTCAGAATTTGCCCAAG-3',下游引物為5'-TGAAATGATCACTCGGAAACA-3';ARL4C上游引物為5-CCAGTCCCTGCATATCGTCAT-3',下游引物為5'-TTCACGAACTCGTTGAACTTGA-3'。采用2-ΔΔCt方法計(jì)算AL158206.1、miR-340-5p和ARL4C mRNA的相對(duì)表達(dá)量。

1.4 MTT法測(cè)定細(xì)胞增殖能力 將成功轉(zhuǎn)染的AL158206.1組和NC組KYSE30細(xì)胞經(jīng)胰酶消化為游離細(xì)胞,重新接種于96孔板,在培養(yǎng)箱中培養(yǎng)。使用MTT試劑盒連續(xù)5 d檢測(cè)細(xì)胞的增殖水平,每孔加入20 μL MTT試劑,培養(yǎng)箱培養(yǎng)2 h后棄上清,每孔加入130 μL二甲基亞砜,搖床振蕩10 min,酶標(biāo)儀測(cè)量波長(zhǎng)450 nm處的光密度(optical density,OD)值。

1.5 Transwell試驗(yàn)測(cè)定細(xì)胞遷移能力將成功轉(zhuǎn)染的AL158206.1組和NC組KYSE30細(xì)胞經(jīng)胰酶消化為游離細(xì)胞,采用無(wú)胎牛血清的RPMI1640培養(yǎng)基重懸后接種于Transwell上室,將含胎牛血清的RPMI1640培養(yǎng)基加入下室,培養(yǎng)箱培養(yǎng)24 h后,將Transwell上室放入甲醇中固定40 min,放入結(jié)晶紫溶液中染色40 min,棉簽擦拭Transwell上室上側(cè),放入倒置顯微鏡拍照并計(jì)數(shù)。

1.6 生物信息學(xué)預(yù)測(cè)AL158206.1的靶基因 采用LncBase Predicted v.2數(shù)據(jù)庫(kù)預(yù)測(cè)AL158206.1的靶向miRNA,采用miRWalk 2.0數(shù)據(jù)庫(kù)預(yù)測(cè)miRNA的靶向基因。

1.7 Western blot試驗(yàn)檢測(cè)ARL4C蛋白表達(dá) 提取各組KYSE30細(xì)胞,加入含1%苯甲基磺酰氟的細(xì)胞裂解液,冰上裂解40 min,采用BCA法檢測(cè)各組KYSE30細(xì)胞的蛋白含量,行10%十二烷基硫酸鈉-聚丙烯酰胺凝膠垂直電泳,將蛋白轉(zhuǎn)移到硝酸纖維素膜上。5%脫脂牛奶在室溫下進(jìn)行封閉,加入一抗ARL4C(1∶1 000稀釋)、CDK2(1∶1 000稀釋)、Cyclin E(1∶3 000稀釋)、IRSp53(1∶2 000)、β-Tubulin(1∶3 000)及MMP-1(1∶1 000),在4 ℃孵育過(guò)夜。使用羊抗兔的二抗(1∶2 000稀釋)孵育50 min。使用ECL發(fā)光試劑進(jìn)行化學(xué)發(fā)光檢測(cè),以β-Tubulin為內(nèi)參。

1.8 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析 應(yīng)用SPSS 19.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析,計(jì)量資料均采用均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差()表示,多組間均數(shù)比較采用單因素方差分析,兩組間均數(shù)比較采用t檢驗(yàn)分析,P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

2 結(jié)果

2.1 AL158206.1在食管癌細(xì)胞系中的表達(dá) qRT-PCR試驗(yàn)結(jié)果顯示,與人食管上皮細(xì)胞相比,AL158206.1在食管癌細(xì)胞系(Eca109、KYSE30、TE-13、EC9706)中的表達(dá)明顯減少(P<0.05),KYSE30細(xì)胞中的表達(dá)最低(P<0.01)。見圖1。

圖1 AL158206.1在人食管上皮細(xì)胞和食管癌細(xì)胞系中的表達(dá)

2.2 轉(zhuǎn)染質(zhì)粒對(duì)KYSE30細(xì)胞中AL158206.1表達(dá)的影響 qRTPCR試驗(yàn)結(jié)果顯示,NC組和AL158206.1組KYSE30細(xì)胞中AL158206.1表達(dá)水平分別為(1.04±0.15)和(12.56±0.93)。與NC組相比,AL158206.1組KYSE30細(xì)胞中AL158206.1的表達(dá)明顯增加(P<0.01)。

2.3 上調(diào)AL158206.1對(duì)KYSE30細(xì)胞增殖能力的影響 MTT試驗(yàn)結(jié)果顯示,第2、3、4、5天,上調(diào)AL158206.1后,KYSE30細(xì)胞增殖能力明顯降低(P<0.05)。見圖2。

圖2 上調(diào)AL158206.1對(duì)KYSE30細(xì)胞增殖能力的影響

2.4 上調(diào)AL158206.1對(duì)KYSE30細(xì)胞遷移能力的影響 Transwell試驗(yàn)結(jié)果顯示,NC組和AL158206.1組KYSE30細(xì)胞的遷移數(shù)分別為(170.60±22.74)個(gè)和(77.84±12.64)個(gè),AL158206.1組細(xì)胞的遷移數(shù)明顯低于NC組(P<0.05),表明上調(diào)AL158206.1可抑制KYSE30細(xì)胞的遷移能力。見圖3。

圖3 上調(diào)AL158206.1對(duì)KYSE30細(xì)胞遷移能力的影響

2.5 生物信息學(xué)預(yù)測(cè)AL158206.1的靶基因AACAGAAAUAAAUUAUUUAUAC 采用LncBase Predicted v.2數(shù)據(jù)庫(kù)預(yù)測(cè)顯示,AL158206.1的靶基因是miR-340-5p;采用miRWalk 2.0數(shù)據(jù)庫(kù)預(yù)測(cè)顯示,miR-340-5p的靶基因是ARL4C。見圖4。

圖4 生物信息學(xué)預(yù)測(cè)AL158206.1的靶基因

2.6 上調(diào)AL158206.1對(duì)KYSE30細(xì)胞中miR-340-5p和ARL4C mRNA表達(dá)水平的影響 qRT-PCR試驗(yàn)結(jié)果顯示,NC組和AL158206.1組KYSE30細(xì)胞中miR-340-5p表達(dá)水平分別為(1.19±0.23)和(0.13±0.06),AL158206.1組miR-340-5p的表達(dá)明顯低于NC組(P<0.01)。NC組和AL158206.1組KYSE30細(xì)胞中ARL4C mRNA表達(dá)水平分別為(1.01±0.09)和(7.23±0.78),AL158206.1組ARL4C mRNA的表達(dá)明顯高于NC組(P<0.01),表明上調(diào)AL158206.1可抑制miR-340-5p的表達(dá),促進(jìn)ARL4C mRNA的表達(dá)。

2.7 上調(diào)AL158206.1對(duì)ARL4C蛋白和增殖及遷移有關(guān)蛋白表達(dá)的影響 Western blotting試驗(yàn)結(jié)果顯示,上調(diào)AL158206.1后,ARL4C蛋白表達(dá)水平增加,細(xì)胞增殖有關(guān)蛋白如CDK2、Cyclin E表達(dá)水平減少,細(xì)胞遷移有關(guān)蛋白如IRSp53、MMP-1表達(dá)水平減少。見圖5。

圖5 上調(diào)AL158206.1對(duì)KYSE30細(xì)胞ARL4C和增殖及遷移有關(guān)蛋白表達(dá)的影響

3 討論

lncRNA雖然不具有蛋白質(zhì)編碼的功能,但其可在基因染色質(zhì)修飾、轉(zhuǎn)錄激活、轉(zhuǎn)錄干擾等過(guò)程中發(fā)揮作用[8-9]。在包括腫瘤在內(nèi)的各種疾病中均存在lncRNA的異常表達(dá),lncRNA可直接或間接參與調(diào)控各種信號(hào)通路的轉(zhuǎn)導(dǎo),作為癌基因或抑癌基因影響腫瘤的發(fā)生和發(fā)展[10-11]。Fang等[12]研究表明,LINC01535在食管癌組織和細(xì)胞中表達(dá)明顯高于癌旁組織和食管黏膜上皮細(xì)胞,敲除LINC01535會(huì)通過(guò)調(diào)節(jié)JAK/STAT3信號(hào)通路降低食管癌細(xì)胞增殖能力,增加細(xì)胞的凋亡率。Qiu等[13]研究顯示,PSMA3-AS1在食管癌組織中表達(dá)顯著上調(diào),PSMA3-AS1表達(dá)與食管癌患者腫瘤大小、遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移和不良預(yù)后相關(guān),PSMA3-AS1過(guò)表達(dá)促進(jìn)食管癌細(xì)胞的增殖、侵襲和體外遷移。AL158206.1在腫瘤特別是食管癌細(xì)胞中的表達(dá)和作用尚不清楚。本研究中,AL158206.1的表達(dá)在食管癌細(xì)胞系中明顯增加,提示AL158206.1參與了食管癌發(fā)生發(fā)展過(guò)程。在食管癌KYSE30細(xì)胞中上調(diào)AL158206.1后,KYSE30細(xì)胞的增殖及遷移能力明顯降低,AL158206.1在食管癌中發(fā)揮抑癌基因功能。

lncRNA可通過(guò)應(yīng)答元件競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合具有相同應(yīng)答元件的miRNA,從而抑制miRNA對(duì)靶基因的干擾作用,間接促進(jìn)miRNA靶基因的表達(dá)[14-15]。本研究中生物信息學(xué)預(yù)測(cè)顯示,AL158206.1可靶向miR-340-5p,miR-340-5p可靶向ADP-核糖基化樣因子4C(ARL4C)mRNA。有研究顯示,miR-340-5p在食管癌組織中高表達(dá),降低食管癌細(xì)胞的放療敏感性,發(fā)揮致癌基因功能[16]。本研究中,上調(diào)AL158206.1后,miR-340-5p的表達(dá)明顯減少。ARL4C蛋白由192個(gè)氨基酸組成,屬于ADP-核糖基化樣因子亞家族成員,參與細(xì)胞內(nèi)的囊泡運(yùn)輸[17]。ARL4C可通過(guò)調(diào)控肌動(dòng)蛋白細(xì)胞的骨架重構(gòu),影響上皮細(xì)胞和遷移[18]。上調(diào)ARL4C可抑制卵巢癌、乳腺癌等腫瘤細(xì)胞的增殖、遷移或侵襲,且ARL4C表達(dá)水平較低的腫瘤患者預(yù)后較差[19-20]。qRT-PCR和Western blot試驗(yàn)結(jié)果顯示,AL158206.1抑制miR-340-5p表達(dá)后,miR-340-5p靶基因ARL4C的表達(dá)明顯增強(qiáng)。本研究中,KYSE30細(xì)胞中ARL4C蛋白表達(dá)增強(qiáng)后,細(xì)胞增殖有關(guān)蛋白如CDK2、Cyclin E表達(dá)水平減少,細(xì)胞遷移有關(guān)蛋白如IRSp53、MMP-1表達(dá)水平減少,表明KYSE30細(xì)胞的增殖及遷移能力降低。

綜上所述,AL158206.1在食管癌細(xì)胞系中低表達(dá),上調(diào)AL158206.1可能是通過(guò)調(diào)控miR-340-5p/ARL4C軸的表達(dá),抑制食管癌細(xì)胞的增殖和遷移能力。AL158206.1可能為食管癌的生物靶向治療提供新的候選靶點(diǎn)。

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