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補腎安胎沖劑治療復發(fā)性流產(chǎn)的潛在分子機制*

2022-08-10 11:56侯阿美儲繼軍汪小莉郭錦晨
中醫(yī)藥臨床雜志 2022年7期
關鍵詞:沖劑靶點通路

侯阿美,儲繼軍,汪小莉,郭錦晨

1 安徽中醫(yī)藥大學 安徽合肥 230038 2 安徽中醫(yī)藥大學第一附屬醫(yī)院 安徽合肥 230031

復 發(fā) 性 流 產(chǎn)(recurrent spontaneous abortion,RSA)是一種病因復雜的生殖疾患,一般是指妊娠28周之前發(fā)生胎兒丟失的次數(shù)≥3 次的,近年來該病發(fā)病率呈增長趨勢,約占育齡期女性妊娠的1%~5%,嚴重威脅著女性身心健康[1]?,F(xiàn)代研究普遍認為其病因主要與遺傳、免疫、血栓前狀態(tài)、內(nèi)分泌及解剖異常等因素有關,且有約50%的患者不能確定為上述病因,稱為不明原因復發(fā)性流產(chǎn)(URSA)[2]。目前西醫(yī)對于RSA 患者妊娠早期主要以外源性孕激素+絨促性素的聯(lián)合方案進行常規(guī)保胎治療為主,但整體效果欠佳[3]。

補腎安胎沖劑是安徽中醫(yī)藥大學第一附屬醫(yī)院的特色制劑,多用于治療自然流產(chǎn)、先兆流產(chǎn)及RSA患者,臨床療效頗為顯著。方中以菟絲子(Cuscutae Semen,CS)、黨參(Codonopsis Radix,CR)為君藥,菟絲子補腎益精,腎旺自可蔭胎,黨參功可補氣益血,又能健脾生津。熟地黃(Rehmanniae Radix Praeparata,RR)補腎填精益髓,加強補腎之功;續(xù)斷(Dipsaci Radix,DR)為安胎之要藥,合桑寄生(Herba Taxilli,HT)以補肝腎,強筋骨,固沖任;白術(Atractylodes Macrocephala Koidz,AM)、 黃 芪(Hedysarum Multijugum Maxim,HM)益氣健脾,脾旺則氣血充得以滋養(yǎng)先天,腎氣充則胎元固攝有權,以上共為臣藥。白芍(Paeoniae Radix Alba,PR)有養(yǎng)血調(diào)經(jīng)、斂陰柔肝之功;黃芩(Scutellariae Radix,SR)清熱燥濕,止血,安胎;旱蓮草(Ecliptae Herba,EH)可涼血止血,補益肝腎;苧麻根(Boehmeriae Rhizoma Et Radix,BR)功可清熱安胎,以防滋陰過于滋膩太過,為佐使藥。全方共奏補腎健脾益氣、清熱養(yǎng)血安胎之功。

前期臨床研究證實,補腎安胎沖劑對于RSA 患者具有十分顯著的療效[4]。在此基礎上,課題組致力于其作用的機理研究,發(fā)現(xiàn)其作用機制可能與調(diào)控VEGFR-2/RAS/MAPK 信 號 通 路[5]、TGF-β1/PI3K/AKT 信號通路[6]、MAPK[7]、VEGF[8]、TNF-α[9]等有關。

網(wǎng)絡藥理學及分子對接技術是現(xiàn)代中藥復方研究領域中的常用工具,能夠深入研究中藥藥效的作用基礎及環(huán)節(jié),評價受體和藥物分子親和關系[10]。課題組基于前期研究,將網(wǎng)絡藥理學與分子對接技術聯(lián)合起來,旨在進一步探索、驗證補腎安胎沖劑治療RSA的潛在靶標及作用通路,探索補腎安胎沖劑治療RSA的分子作用機制,為其臨床用藥提供科學依據(jù)。

資料與方法

1 補腎安胎沖劑藥物活性成分及作用靶點的篩選

在TCMSP 數(shù) 據(jù) 庫(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database,TCMSP,http://tcmspw.com/tcmsp.php)中檢索補腎安胎沖劑中各藥物的成分及靶點,通過設置口服生物利用度(OB)≥30%、類藥性(DL)≥0.18 進一步篩選方中各藥的活性成分。通過蛋白質(zhì)Uniprot 數(shù)據(jù)庫(http://www.uniprot.org/)對各個靶點對應的基因進行校正并獲得標準化的名稱簡寫(Symbol)。

2 RSA 相關靶點的篩選

將“recurrent spontaneous abortion”“spontaneous abortion”等作為關鍵詞,分別在Genecards(https://www.genecards.org/)、OMIM(https://omim.org/)、TTD(http://db.idrblab.net/ttd/)、GeneBank(https://cipotato.org/genebankcip/)、PharmGkb(https://www.pharmgkb.org/)等數(shù)據(jù)庫中檢索并獲取與RSA 相關的靶基因。再將所獲全部基因進行合并、去除重復項及假陽性,獲得RSA 疾病靶點基因的數(shù)據(jù)集。

3 中藥復方網(wǎng)絡構(gòu)建及分析

通過Uniprot 數(shù)據(jù)庫對RSA 相關靶點進行基因注釋,并將藥物相關靶點與RSA 相關靶點交集,獲取交集靶點,并以Venn 圖展示。通過在Cytoscape 3.8.2軟件中導入藥物活性成分及相應靶基因、疾病靶點信息,構(gòu)建并繪制藥物與RSA 的“藥物-化合物-靶點-疾病”的調(diào)控網(wǎng)絡圖,展示補腎安胎沖劑中活性成分與RSA 疾病基因的相關性大小。

4 蛋白互作網(wǎng)絡(PPI 網(wǎng)絡)的構(gòu)建

將1.3 中獲得的交集靶點導入STRING 數(shù)據(jù)庫(http://www.string-db.org/)建立PPI 網(wǎng)絡。再將所獲取的信息導入Cytoscape 3.8.2 軟件中,根據(jù)度值(Degree)進行精簡分析,構(gòu)建PPI 核心網(wǎng)絡。

5 GO 功能富集分析與KEGG 通路分析:

將基因簡寫(Symbo1)轉(zhuǎn)化為基因ID(EntrezID)后,再通過David 數(shù)據(jù)庫及R 軟件對關鍵靶點進行GO 功能富集及KEGG 通路分析,并繪制相關通路圖。

6 分子對接驗證

從有機小分子藥物活性數(shù)據(jù)庫(PubChem)中獲取PPI 核心網(wǎng)絡中補腎安胎沖劑對RSA 相關靶點活性成分2D 結(jié)構(gòu),并通過ChemBio3DUltra14.0 軟件將2D 結(jié)構(gòu)轉(zhuǎn)換成3D 結(jié)構(gòu),構(gòu)建小分子配體數(shù)據(jù)庫。再運用PyMOL 生信軟件對核心蛋白受體結(jié)構(gòu)進行去除水分子、無效小分子配體等處理。最后運用Vina 進行分子對接,獲得補腎安胎沖劑中活性分子與受體蛋白的結(jié)合關系和結(jié)合位置。

結(jié)果

1 補腎安胎沖劑活性成分的篩選

在TCMSP 數(shù)據(jù)庫中設置OB ≥30%,DL ≥0.18,檢索到化合物:菟絲子11 個、桑寄生2 個、續(xù)斷8 個、黨參21 個、白術7 個、黃芪20 個、黃芩36 個、白芍13個、熟地黃2 個、苧麻根5 個、旱蓮草10 個。刪除重復化合物和無對應靶點的化合物,共獲得110 個活性成分,部分活性成分見表1。

表1 補腎安胎沖劑部分活性成分信息

2 RSA 疾病基因的篩選

在 G e n e c a r d s、O M I M、T T D、G e n e B a n k、PharmGkb 等 數(shù) 據(jù) 庫 中,以“recurrent spontaneous abortion”“spontaneous abortion”等作為關鍵詞,檢索獲取RSA 相關的靶基因。將檢索到的靶基因經(jīng)過取并集去重復等處理后,共得到2197 個RSA 相關基因靶點,繪制Venn 圖見圖1。

圖1 RSA 疾病基因

3 中藥復方網(wǎng)絡構(gòu)建及分析

通過Uniprot 數(shù)據(jù)庫對疾病相關靶點進行基因注釋,將藥物相關靶點、疾病相關靶點取交集,獲取補腎安胎沖劑與RSA 的交集靶點共102 個,包括AKT1、CCND1、MAPK14、TP53 等,并以Venn 圖展示(圖2)。利用Cytoscape 3.8.2 構(gòu)建補腎安胎沖劑治療RSA 的調(diào)控網(wǎng)絡圖(圖3),共涉及81 種活性成分及102 個潛在靶點。其中圓餅圖代表中藥成分,不同顏色代表不同的中藥,藍色矩形則代表交集靶點。運用CytoNCA工具分析網(wǎng)絡節(jié)點特征參數(shù)值,挖掘出中藥作用的核心成分,如槲皮素、木犀草素、山奈酚等。

圖2 補腎安胎沖劑與RSA 的交集靶點Venn 圖

圖3 補腎安胎沖劑治療RSA 的調(diào)控網(wǎng)絡圖

4 PPI 網(wǎng)絡構(gòu)建

通過STRING 數(shù)據(jù)庫構(gòu)建PPI 網(wǎng)絡,共得到102 個 節(jié) 點,1510 條 邊。 將 結(jié)果 導 入Cytoscape 3.8.2 進行篩選,共得到28 個關鍵靶點,291 條邊,以“Degree”“Betweenness”“Closeness”中 位 值 逐 步篩選,可得到6 個核心靶點,分別為AKT1、CCND1、MAPK14、TP53、JUN、ESR1,如圖3 所示,這些靶點可視為補腎安胎沖劑治療RSA 的關鍵靶點。

5 GO 功能富集分析及KEGG 通路分析

通過DAVID 數(shù)據(jù)庫對102 個共同靶點進行GO功能富集分析,共獲得GO 條目1942 條(P<0.05),其中BP 條目1762 個,CC 條目32 個,MF 條目148 個,各組分排名前10 的條目見圖5。結(jié)果表明,補腎安胎沖劑參與的生物學過程主要集中在血紅素的結(jié)合、RNA 聚合酶轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合、泛素樣蛋白連接酶結(jié)合及氧化還原酶活性等。

圖5 補腎安胎沖劑與RSA 交集基因GO 富集分析

KEGG 通路分析共得到157 條信號通路(P<0.05),主要包括PI3K-AKT 信號通路、內(nèi)分泌抵抗、AGE-RAGE 信號通路、p53 信號通路等,前30 條信號通路見圖6。

圖6 補腎安胎沖劑與RSA 交集基因KEGG 通路富集分析

6 活性成分與靶點基因的分子對接驗證

運用Vina 對核心網(wǎng)絡中的6 個關鍵靶點與相應成分進行分子對接,獲得補腎安胎沖劑中活性分子與受體蛋白的結(jié)合關系和結(jié)合位置,得到相應對接分數(shù),如表2 所示。一般來說,分值越低,則表明配體與靶蛋白受體結(jié)合越穩(wěn)定[11]??芍?,木犀草素(Luteolin)、黃芩素(Baicalein)與AKT1 的結(jié)合性最好(圖7),結(jié)合后呈現(xiàn)穩(wěn)定狀態(tài)。

圖7 木犀草素(上)、黃芩素(下)與AKT1 的分子對接圖

表2 關鍵成分與核心靶點分子對接結(jié)果

討論

依據(jù)中醫(yī)理論,RSA 屬中醫(yī)學“滑胎”“數(shù)墮胎”范疇。中醫(yī)認為,該病主要為母體沖任損傷或胎元不健導致,具體又有腎虛、脾腎虧虛、氣血兩虛、血熱、血瘀、肝郁等諸多病因[12]。近代醫(yī)家多認為脾腎虧虛是其發(fā)病的重要病機,臨床多用補腎健脾之法,補腎安胎沖劑亦為該法之重要應用。本研究通過利用現(xiàn)代網(wǎng)絡藥理及分子對接技術,嘗試探討補腎安胎沖劑從多成分、多靶點、多途徑共同作用治療RSA 的可能作用機制。

圖4 PPI 網(wǎng)絡的構(gòu)建

本研究篩選出補腎安胎沖劑核心化合物有白樺脂酸、槲皮素、木犀草素、山奈酚、黃芩素等。這些化合物大部分屬于黃酮類化合物,具有抗炎抗菌、抗氧化及調(diào)節(jié)代謝等作用[13]。槲皮素多存在于桑寄生、菟絲子等中藥,研究發(fā)現(xiàn)其具有調(diào)節(jié)妊娠小鼠子宮內(nèi)環(huán)境、改善小鼠胚泡著床障礙等作用[14]。木犀草素能通過抑制TNF-α、IL-1β 等的釋放起到抑制炎癥損傷的作用,同時可調(diào)節(jié)滋養(yǎng)細胞的侵襲能力[15]。黃芩素可通過提高滋養(yǎng)細胞的增殖及侵襲力直接影響胚胎黏附和著床過程[16-17],且能通過影響CD80/CD86 的表達建立以Th2 為主的外周特異性免疫耐受[17]。

通 過 構(gòu) 建PPI 網(wǎng) 絡,發(fā) 現(xiàn)AKT1、CCND1、MAPK14、TP53、JUN、ESR1 是補腎安胎沖劑治療RSA 的核心蛋白。中醫(yī)認為,婦人妊娠后,胚胎的發(fā)育全賴母之血以養(yǎng)胎,其生長發(fā)育離不開母血之滋養(yǎng)。AKT1 是PI3K-AKT 信號通路中極為重要的下游靶激酶,可介導新血管的形成,與中醫(yī)化生氣血以養(yǎng)胎的理念相符。CCND1 為細胞周期調(diào)節(jié)蛋白,研究表明,該蛋白有利于妊娠早期胚胎著床、妊娠建立與維持,而細胞周期調(diào)節(jié)蛋白表達量下降可能是早期自然流產(chǎn)的發(fā)病機理之一[18-19]。MAPK 參與調(diào)節(jié)基因表達,活化后的MAPK 可快速增加細胞裂解,從而影響血管生成等方面。前期研究[11]表明,補腎安胎沖劑可通過提高RAS 及MAPK 蛋白水平的表達以達到促進母胎界面血管生成的作用。研究[19-20]表明,TP53 在URSA 患者絨毛組織中呈高表達,其可阻斷細胞周期、促進細胞凋亡,使滋養(yǎng)細胞凋亡明顯,而敲除TP53 可促進滋養(yǎng)細胞的遷移和抑制細胞凋亡。有學者指出,JUN 的表達增加可以增加滋養(yǎng)細胞侵襲,胚泡著床后,其表達較正常內(nèi)膜增加[21]。同時,ESR1 基因多態(tài)性亦可增加RSA 的發(fā)病風險[22]。

GO 功能富集及KEGG 分析表明,補腎安胎沖劑可通過參與多種生物學過程及多個信號通路治療RSA。KEGG 分析得出信號通路主要包括PI3K-AKT信號通路、內(nèi)分泌抵抗、AGE-RAGE 信號通路、p53信號通路、IL-17 信號通路等,與前期研究結(jié)果[23-24]]大致相符。亦有研究[25]表明,調(diào)控AGE-RAGE 信號通路也能對子鼠發(fā)育及出生異常起到明顯的保護作用。p53 是與生育、生殖等多種生物學過程相關的腫瘤抑制因子,其可通過參與多種信號通路介導蛻膜化受損,影響胚胎著床從而導致RSA 的發(fā)生[26]。同時,Th17/Treg 及IL-17 高表達導致的免疫平衡失調(diào)是URSA 發(fā)生的原因之一[27]。

運用分子對接技術,選取預測靶點最多的活性成分木犀草素及黃芩素為配體,選取PPI 網(wǎng)絡中degree最大的靶點AKT1 為受體。結(jié)果顯示木犀草素、黃芩素能夠穩(wěn)定對接到AKT1 的蛋白結(jié)構(gòu)上。結(jié)果顯示篩選的靶點受體蛋白與活性成分具有較好的結(jié)合活性。

本研究在前期研究的基礎上,另辟蹊徑,在網(wǎng)絡藥理學及分子對接層面進行研究,進一步探明補腎安胎沖劑治療RSA 的內(nèi)在機制。結(jié)果表明補腎安胎沖劑主要通過槲皮素、木犀草素、山奈酚、黃芩素等多種活性成分作用于AKT1、CCND1、MAPK14、TP53、JUN、ESR1 等基因,通過調(diào)控多種生物學功能和多條信號通路,從而起到治療RSA 的作用,揭示了補腎安胎沖劑具有多成分、多靶點、多途徑的作用機制,為深入研究補腎安胎沖劑治療RSA 的分子機制奠定基礎,為其臨床應用提供一定的參考價值。

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