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FTO調(diào)控PYCR1-RNA-m6A促進(jìn)膀胱癌發(fā)生發(fā)展的研究進(jìn)展*

2022-12-24 17:47:04肖帥宋偉夏明張佳晨
中國醫(yī)學(xué)工程 2022年10期
關(guān)鍵詞:甲基化酶脯氨酸膀胱癌

肖帥,宋偉,夏明,張佳晨

[湖南省人民醫(yī)院(湖南師范大學(xué)附屬第一醫(yī)院)泌尿外科,湖南 長沙410005]

膀胱癌(bladder cancer,BLCA)是最常見的泌尿系統(tǒng)惡性腫瘤,也是全球最常見的癌癥之一。據(jù)統(tǒng)計(jì),2018 年全球共有549 393 例患者診斷出BLCA,199 922 例死于該?。?],其主要危險因素為吸煙[2]等。N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine,m6A)是真核生物mRNA 最常見的轉(zhuǎn)錄后修飾形式[3],參與BLCA 的發(fā)生發(fā)展。肥胖相關(guān)蛋白(FTO)通過m6A 依賴性的去甲基化酶活性廣泛參與脂肪形成和腫瘤的發(fā)生,影響多個mRNA 的轉(zhuǎn)錄后修飾[4],在腫瘤的發(fā)生發(fā)展過程中,F(xiàn)TO 常過表達(dá)且可通過降低吡咯啉-5-羧酸還原酶1(PYCR1)的m6A 甲基化,延長PYCR1 mRNA 半衰期,以促進(jìn)癌細(xì)胞在體外增殖和遷移以及腫瘤在體內(nèi)的生長[5]。本文就FTO 調(diào)控PYCR1-RNAm6A 促進(jìn)膀胱癌發(fā)生發(fā)展的最新研究進(jìn)展作一綜述。

1 m6A 修飾與BLCA

1.1 m6A 概述

基因的表達(dá)調(diào)控包括基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控、轉(zhuǎn)錄后修飾和翻譯調(diào)控等多個層面,目前RNA 的轉(zhuǎn)錄后修飾是學(xué)術(shù)界的研究熱點(diǎn),現(xiàn)已發(fā)現(xiàn)171 種RNA修飾形式[6]。m6A 甲基化修飾是一種動態(tài)且可逆的過程,RNA m6A 甲基化主要在轉(zhuǎn)錄后水平上調(diào)節(jié)基因表達(dá),并參與RNA 代謝的各個方面,包括前mRNA 剪接,3′末端處理、核輸出、翻譯調(diào)控、mRNA 衰變和長非編碼RNA(lncRNA)處理[7],特別是在3'-UTR 起始靠近翻譯終止密碼子的附近,常嵌入序列5'-RRACH-3'[8]。m6A 甲基化修飾過程主要由m6A 甲基轉(zhuǎn)移酶(作家蛋白)、m6A 去甲基化酶(橡皮擦蛋白)、m6A 結(jié)合蛋白(閱讀蛋白)3 種工具蛋白參與,其中作家蛋白主要是由甲基轉(zhuǎn)移酶樣蛋白3(methyltransferase-like protein 3,METTL3)、甲基化轉(zhuǎn)移酶樣蛋 白 14(methyltransferase-like protein14,METTL14)和Wilms 腫瘤1 相關(guān)蛋白(Wilms tumor 1-associated protein,WTAP)為核心組成的甲基轉(zhuǎn)移酶復(fù)合物[9]。METTL3 和METTL14 形成異二聚體,WTAP 通過募集METTL3 和METTL14 來協(xié)同介導(dǎo)m6A 甲基化過程[10]。橡皮擦蛋白主要包括FTO 和α-酮戊二酸依賴的加雙氧酶ALKB 同源蛋白5(ALKBH)[11]。閱讀蛋白主要包括YTHN6 甲基腺苷RNA 結(jié)合蛋白1-3(YTHDF1-3)、YTHN6 甲基腺苷RNA 結(jié)合蛋白1-3(YTHDF1-3)、YTH 結(jié)構(gòu)域蛋白1-2(YTHDC1-2)以及胰島素樣生長因子2結(jié)合蛋白(IGF2BP)[12]。

m6A 修飾與多種腫瘤發(fā)生發(fā)展有關(guān),抑癌基因SPRED2 可通過與Raf/MEK/ ERK 途徑相互作用防止癌細(xì)胞遷移和侵襲[13]。PENG 等[14]研究表明,METTL3 在結(jié)直腸癌(CRC)中過表達(dá)并參與異常pri-miR-1246 m6A 修飾,促進(jìn)從pri-miR-1246到成熟miR-1246 的過渡,而miR-1246 可通過直接與SPRED2 結(jié)合來抑制SPRED2 的表達(dá),METTL3 介導(dǎo)的miR-1246 上調(diào)對SPRED2 的表達(dá)呈負(fù)調(diào)節(jié),過表達(dá)的miR-1246 和受抑制的SPRED2 可阻礙RAF/MEK/ERK 的激活,由此可見METTL3 通過METTL3/miR-1246/SPRED2軸,抑制RAF/MEK/ERK 通路,促進(jìn)CRC 癌細(xì)胞的增值和侵襲。LI 等[15]研究發(fā)現(xiàn),在肝細(xì)胞癌中,缺氧誘導(dǎo)因子HIF-1α 通過與YTHDF1 的啟動子結(jié)合來促進(jìn)YTHDF1 的過表達(dá),然后通過識別自噬相關(guān)基因ATG2A 和ATG14 的m6A 修飾來與其結(jié)合,促進(jìn)了缺氧誘導(dǎo)的自噬和自噬相關(guān)的肝細(xì)胞癌發(fā)生。QIAN 等[16]研究表明肺癌相關(guān)轉(zhuǎn)錄本3(LCAT3)是一種新的致癌性lncRNA,通過METTL3 介導(dǎo)的m6A 修飾使LCAT3 穩(wěn)定,并在肺癌中過表達(dá),LCAT3 將上游元素結(jié)合蛋白1(FUBP1)招募到MYC 遠(yuǎn)上游元素(FUSE)序列中,從而激活MYC 轉(zhuǎn)錄以促進(jìn)肺癌細(xì)胞的增殖、存活、入侵和轉(zhuǎn)移。

1.2 m6A 對BLCA 影響

METTL3、YTHDF2 促進(jìn)BLCA 癌細(xì)胞的增殖遷移。XIE 等[17]通過TCGA 數(shù)據(jù)庫和Western Blot分析發(fā)現(xiàn)METTL3 和YTHDF2 在BLCA 中高度表達(dá),且兩者之間存在正相關(guān)關(guān)系,METTL3/YTHDF2 m6A 調(diào)控軸可以降解BLCA 細(xì)胞系(T24,UM-UC-3)中腫瘤降解因子SETD7(組蛋白賴氨酸甲基轉(zhuǎn)移酶)和KLF4(Kruppel 樣因子),從而促進(jìn)BLCA 的發(fā)生發(fā)展。研究發(fā)現(xiàn)METTL14 在BLCA 和膀胱腫瘤起始細(xì)胞(TIC)中表達(dá)較低,而METTL14 和m6A 參與抑制在BLCA 發(fā)生和膀胱TIC 自我更新中起重要作用的Notch1 mRNA 的穩(wěn)定性。GU 等[18]在實(shí)驗(yàn)中將METTL14 敲除后,m6A 水平隨之降低,兩者減少對Notch1 mRNA 穩(wěn)定性的抑制共同促進(jìn)TIC 的增值、自我更新、轉(zhuǎn)移,導(dǎo)致BLCA 的發(fā)生發(fā)展,而METTL14 過表達(dá)則起相反的作用。m6A 甲基化修飾通過信號軸METTL3-AFF4-SOX2/MYC 在膀胱癌干細(xì)胞(BCSCs)的自我更新和致瘤性中發(fā)揮關(guān)鍵作用,METTL3 通過m6A 甲基化修飾AFF4 mRNA,促進(jìn)AFF4 的表達(dá),而AFF4 又與SOX2 和MYC 的啟動子區(qū)域結(jié)合,激活維持其轉(zhuǎn)錄活性,增強(qiáng)了BLCA的腫瘤發(fā)生和腫瘤啟動能力[19]。HAN 等[20]在研究中發(fā)現(xiàn)在BLCA 中METTL3 過表達(dá),METTL3 通過與微處理器蛋白DGCR8 相互作用增強(qiáng)對primiR221/222 的識別,促進(jìn)pri-miR221/222 m6A 甲基化修飾并以此加速其成熟,間接導(dǎo)致抑癌基因PTEN 蛋白表達(dá)降低,促進(jìn)膀胱癌的腫瘤增殖。

2 FTO 與BLCA

2.1 FTO 概述

FTO 作為第一個RNA 去甲基化酶,在RNA甲基化研究中取得了巨大的發(fā)展,并且揭示了m6A 是一種可逆和動態(tài)的RNA 修飾[21]。FTO 通過調(diào)節(jié)脂肪生成途徑和誘導(dǎo)脂肪細(xì)胞前分化來促進(jìn)脂肪發(fā)生,由FTO 基因編碼的FTO 蛋白屬于雙加氧酶家族,其酶活性依賴于Fe(II)和2-氧代戊二酸[22]。在酶學(xué)上,F(xiàn)TO 是真核細(xì)胞中的RNA m6A 去甲基化酶,全基因組關(guān)聯(lián)研究(GWAS)確定了FTO 中的單核苷酸多態(tài)性(SNP)與肥胖以及包括子肺癌、乳腺癌、宮內(nèi)膜癌在內(nèi)的癌癥有關(guān)[23]。

肺癌中FTO 過表達(dá),其發(fā)揮去甲基化酶效應(yīng)降低骨髓鋅指蛋白(MZF1)和泛素特異性蛋白酶(USP7)m6A 甲基化修飾水平,提高了其mRNA 穩(wěn)定性,使USP7、MZF1 的表達(dá)與FTO 水平呈正相關(guān),促進(jìn)了肺癌細(xì)胞的增殖速率,提高了肺癌細(xì)胞在體外形成集落的能力[24-25]。在臨床乳腺癌患者中FTO 過表達(dá),促凋亡基因BNIP3 具有緩解FTO 依賴性腫瘤生長和轉(zhuǎn)移來抑制腫瘤的作用,而BNIP3 是FTO 介導(dǎo)的m6A 修飾的下游靶點(diǎn),與FTO 表達(dá)呈負(fù)相關(guān),F(xiàn)TO 使BNIP3 mRNA 的3'UTR 中的m6A 去甲基化并導(dǎo)致其降解,顯著促進(jìn)乳腺癌細(xì)胞增殖、集落形成和細(xì)胞凋亡減少[26]。在子宮內(nèi)膜癌(EC)中,F(xiàn)TO 可催化HOXB13 mRNA 的3'UTR 區(qū)的去甲基化修飾,從而消除YTHDF2 通過識別m6A 峰來促進(jìn)HOXB13 mRNA的衰變,HOXB13 mRNA 衰變的減少和HOXB13蛋白表達(dá)的增加使Wnt 信號通路異常激活和下游蛋白高表達(dá),從而導(dǎo)致EC 的轉(zhuǎn)移和侵襲,其中Wnt 信號通路抑制劑ICG-001 可以阻斷HOXB13基因誘導(dǎo)的腫瘤轉(zhuǎn)移[27]。

2.2 FTO 對BLCA 的影響

在BLCA 患者中FTO 過表達(dá),F(xiàn)TO 以m6A 依賴性的方式通過FTO/miR-576/CDK6 途徑促進(jìn)膀胱癌細(xì)胞增殖、遷移和侵襲,細(xì)胞周期蛋白依賴性激酶6(CDK6)是miR-576 的直接下游靶標(biāo),F(xiàn)TO 和miR-576 表達(dá)之間呈負(fù)相關(guān),而miR-576模擬轉(zhuǎn)染后CDK6 的表達(dá)降低,CDK6 過表達(dá)會增加細(xì)胞增殖并降低DNA 修復(fù)能力,并促進(jìn)膀胱癌中的細(xì)胞增殖[28]。TAO 等[29]通過研究發(fā)現(xiàn)FTO通過MALAT1/miR-384/MAL2 軸促進(jìn)BLCA 的增值和遷移[肺腺癌轉(zhuǎn)錄本1(MALAT1)、mal T 細(xì)胞分化蛋白2(MAL2)與miR-384 可相互影響并受FTO 調(diào)節(jié),但其具體機(jī)制尚不清楚],F(xiàn)TO 可消除MALAT1 5'末端m6A 甲基化修飾,從而提高M(jìn)ALAT1 mRNA 的半衰期和表達(dá),進(jìn)而上調(diào)MAL2在異種移植腫瘤組織中的蛋白表達(dá),并減弱miR-384 表達(dá),減弱miR-384 通過降低CDK6 的表達(dá)水平來抑制的腫瘤發(fā)生的效應(yīng)。SUN 等[30]實(shí)驗(yàn)研究指出miR-5581-3p 作為一種新型的BLCA 腫瘤抑制劑,SMAD3 和FTO 為miR-5581-3p 的直接靶標(biāo),miR-5581-3p 減弱FTO 的表達(dá),使BLCA 中m6A水平降低,同時miR-5581-3p 可通過沉默SMAD3來抑制EMT 進(jìn)展并最終抑制BLCA(T24 和UMUC3 細(xì)胞系)的增殖和遷移能力。

3 PYCR1 與BLCA

3.1 PYCR1 概述

脯氨酸在人體很多方面發(fā)揮重要作用,如細(xì)胞信號傳遞、細(xì)胞生物能學(xué)以及惡性腫瘤細(xì)胞代謝。惡性腫瘤細(xì)胞生長、生存相關(guān)的脯氨酸代謝方面,成為近年來研究工作熱點(diǎn)[31]。PYCR1 是一種線粒體內(nèi)膜蛋白[32],其通過NADPH 的氧化作用,將吡咯啉-5-羧酸(P5C)還原成脯氨酸,進(jìn)而催化脯氨酸循環(huán)的生物合成反應(yīng)。多種惡性腫瘤通過調(diào)節(jié)脯氨酸循環(huán)和生物合成改變脯氨酸代謝,沉默PYCR1 可以抑制其腫瘤細(xì)胞增殖。越來越多的證據(jù)顯示,PYCR1 與惡性腫瘤的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān),可能作為基因靶向治療的潛在靶點(diǎn)[33]。

在胃癌(GC)中PYCR1 表達(dá)上調(diào),在GC 患者的的腫瘤標(biāo)本和尿液樣本中的脯氨酸水平顯著增加,且PYCR1 蛋白表達(dá)高低與晚期腫瘤分期、侵襲性組織學(xué)類型相關(guān)[34-35]。XIAO 等[36]研究發(fā)現(xiàn),PI3K/Akt 途徑通過GC 中的PYCR1 影響脯氨酸代謝,PI3K/Akt 通路是PYCR1 的上游調(diào)控因子,PI3K/Akt 的激活導(dǎo)致4E-BP1 失活,導(dǎo)致轉(zhuǎn)錄因子eIF4E 的釋放,eIF4E 觸發(fā)包括c-MYC 等多種致癌基因的轉(zhuǎn)錄進(jìn)一步導(dǎo)致PYCR1 的表達(dá)上調(diào),因此PYCR1 mRNA 的表達(dá)與PIK3CB 和Akt1 mRNA 表達(dá)呈正相關(guān),該研究表明PYCR1 過表達(dá)可以通過增強(qiáng)腫瘤增殖和響應(yīng)代謝應(yīng)激來促進(jìn)GC進(jìn)展,并作為GC 患者預(yù)后的標(biāo)志物。LI 等[37]在研究中指出鼻咽癌(NPC)中PYCR1 呈過表達(dá),MicroRNA hsa-miR-150-5p 可直接抑制PYCR1 來減弱NPC 癌細(xì)胞的活性、增殖、遷移和侵襲。YAN等[38]實(shí)驗(yàn)得出在CRC 中PYCR1 呈過表達(dá),實(shí)驗(yàn)可通過降低PYCR1 的表達(dá)來使STAT3 介導(dǎo)的p38 MAPK 和NF-κB 信號通路失活來抑制CRC 癌細(xì)胞中的細(xì)胞增殖、耐藥性和上皮-間充質(zhì)轉(zhuǎn)變。

3.2 PYCR1 對BLCA 的影響

PYCR1 在多種癌癥的惡性進(jìn)展中起重要作用。然而,PYCR1 在BLCA 中的作用尚未得到很好的研究。CHENG 等[39]在研究中發(fā)現(xiàn)Rac 家族的小GTPase 3(RAC3)在BLCA 組織和細(xì)胞系中過表達(dá),RAC3 的過表達(dá)提高了PYCR1 mRNA 的表達(dá)和蛋白質(zhì)水平,RAC3 作為致癌基因通過PYCR1的上調(diào)顯著增加了JAK2,磷酸化的JAK2,STAT3,磷酸化的STAT3 和STAT3 依賴性基因c-MYC 的蛋白質(zhì)水平,激活了BLCA 中由PYCR1 介導(dǎo)的JAK/STAT 信號傳導(dǎo),促進(jìn)了BLCA 細(xì)胞增殖,遷移和侵襲。SONG 等[5]研究表明泛素特異性肽酶18(USP18)對FTO N-末端蛋白結(jié)構(gòu)域施加翻譯后去泛素化,抑制蛋白酶體對FTO 降解,穩(wěn)定的FTO 通過降低PYCR1 上的m6A 甲基化,延長了PYCR1 mRNA 半衰期,以此促進(jìn)BLCA 細(xì)胞在體外增殖和遷移以及腫瘤在體內(nèi)的生長。DU等[40]研究發(fā)現(xiàn)PYCR1 在BLCA 中高表達(dá),其通過調(diào)節(jié)Akt/Wnt/β-catenin 信號通路促進(jìn)BLCA 腫瘤細(xì)胞的增值遷移,在BLCA 中PYCR1 基因過表達(dá)提高了BLCA 組織中Akt 的磷酸化,導(dǎo)致引起βcatenin 降解的糖原合酶激酶-3β(GSK-3β)失活,使Wnt/β-catenin 信號通路異常激活介導(dǎo)腫瘤形成,復(fù)活的Wnt/β-catenin 信號通路能顯著逆轉(zhuǎn)PYCR1敲除介導(dǎo)的腫瘤形成抑制。

4 總結(jié)與展望

m6A 甲基化修飾通過m6A 甲基化轉(zhuǎn)移酶、m6A去甲基化酶和m6A 結(jié)合蛋白在惡性腫瘤中主要起到了促進(jìn)癌基因表達(dá)的作用。FTO 依靠m6A 依賴性的去甲基化酶活性去除mRNA、miRNA 等的m6A 修飾,改變其穩(wěn)定性,進(jìn)而促進(jìn)腫瘤的發(fā)生發(fā)展。PYCR1 可影響多種經(jīng)典癌基因或信號通路,包括c-MYC 基因以及Wnt、PI3K/ AKT 通路等,相較于FTO、m6A 對BLCA 發(fā)生促進(jìn)作用的闡明,PYCR1 在BLCA 中的作用機(jī)制尚未得到很好的研究。如能通過后續(xù)研究,進(jìn)一步闡明PYCR1 促進(jìn)BLCA 發(fā)生發(fā)展的分子機(jī)制,m6A、FTO、PYCR1將可能成為未來BLCA 治療的潛在靶點(diǎn),為整體提高臨床上BLCA 的診療水平、提升BLCA 患者生存率提供重要的理論和實(shí)踐依據(jù)。

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