【摘 要】亨廷頓病是一種常染色體顯性遺傳病,近年來(lái)多項(xiàng)針對(duì)mRNA水平的干預(yù)策略相繼開(kāi)展臨床試驗(yàn),同時(shí)隨著聚集的規(guī)律性間隔短回文重復(fù)序列(clustered regularly interspersed short palindromic repeats,CRISPR)/CRISPR關(guān)聯(lián)基因(CRISPR associatedgene,Cas)系統(tǒng)的日漸成熟,針對(duì)致病基因組的基因編輯策略也屢有報(bào)道。本文將圍繞亨廷頓病基因治療的臨床現(xiàn)狀、研究進(jìn)展、臨床評(píng)估的改進(jìn)做簡(jiǎn)要綜述。
【關(guān)鍵詞】亨廷頓?。换蛑委?;反義寡核苷酸;基因編輯
【中圖分類(lèi)號(hào)】R745 【文獻(xiàn)標(biāo)志碼】A 【收稿日期】2024-01-26
亨廷頓?。℉untington’s disease,HD)是一種以舞蹈樣動(dòng)作、智力減退和精神行為異常為主要臨床表現(xiàn)的中年起病且逐漸進(jìn)展的常染色體顯性遺傳病[1]。該疾病的致病突變是4號(hào)染色體上亨廷頓基因(Huntingtin,HTT)第一號(hào)外顯子CAG三聯(lián)密碼子重復(fù)序列的異常擴(kuò)增(CAGgt;40)。CAG密碼子編碼谷氨酰胺,野生型亨廷頓蛋白含有一定長(zhǎng)度的多聚谷氨酰胺,其本身并不具有毒性。CAG重復(fù)序列異常擴(kuò)增導(dǎo)致HTT編碼的突變HTT蛋白(mutant HTT,mHTT)中多聚谷氨酰胺長(zhǎng)度超過(guò)一定限度,使其傾向于形成聚集體,最終在細(xì)胞核內(nèi)聚集形成包涵體,引起典型的病理改變[2]。盡管HD的致病基因和突變形式已明確30年之久,但目前仍缺乏能夠阻止疾病發(fā)生和發(fā)展的治療方法。
由于亨廷頓病是由基因突變引起的,因此“基因治療”成為研發(fā)HD疾病修飾治療(disease modified therapy,DMT)的主要策略。一般而言,以致病基因?yàn)榘悬c(diǎn),通過(guò)糾正基因異常功能的治療均可稱(chēng)為基因治療(gene therapy)。根據(jù)基因突變后獲得致病功能(gain of function)或者失去正常功能(loss of function),可針對(duì)性地給予基因沉默(gene silencing)或基因替代(gene replacement)治療,或更進(jìn)一步地通過(guò)基因編輯(gene editing)糾正突變基因本身[3]。由于HD的致病突變屬于gain of function,因此現(xiàn)在在臨床嘗試的基因治療策略均為沉默突變HTT基因,相應(yīng)的基因編輯策略尚處于實(shí)驗(yàn)室階段。本文將簡(jiǎn)要綜述HD基因治療的臨床現(xiàn)狀、研究進(jìn)展和臨床評(píng)估的改進(jìn)。
1 HD基因治療的臨床現(xiàn)狀
由于致病基因明確,病情逐漸加重并嚴(yán)重影響患者的生活質(zhì)量及生命,HD、脊髓性肌萎縮、杜氏肌營(yíng)養(yǎng)不良等疾病的基因治療一直處于神經(jīng)病領(lǐng)域的前沿,各類(lèi)創(chuàng)新的技術(shù)和策略多在這類(lèi)疾病中首先開(kāi)展嘗試。
理想狀態(tài)下,治療性物質(zhì)可通過(guò)系統(tǒng)吸收,透過(guò)血腦屏障,發(fā)揮功能,例如小分子藥物PTC518。但大部分治療性物質(zhì)并不具備血腦屏障透過(guò)性,因此更多的嘗試是為了提高其在腦組織中的有效濃度,或通過(guò)直接連接腦靶向肽、或通過(guò)鞘內(nèi)注射的方式繞過(guò)血腦屏障,或者使用載體將治療性物質(zhì)進(jìn)行定向遞送。就基因沉默策略而言,目前優(yōu)化改進(jìn)的重點(diǎn)是遞送載體。
遞送載體可病毒載體和非病毒載體。目前常用的病毒載體有慢病毒和各種血清型的腺相關(guān)病毒,優(yōu)勢(shì)是能夠介導(dǎo)外源基因持續(xù)表達(dá),優(yōu)化血清型可獲得理想的組織特異性,目前已有成熟的工業(yè)化生產(chǎn)流程[4]。但是由于中和抗體的存在,無(wú)法多次給藥[5],仍存在外源序列插入到基因組,有潛在的致癌風(fēng)險(xiǎn)。雖然AAV療法已廣泛使用在多種疾病,但目前仍可見(jiàn)多例嚴(yán)重不良事件報(bào)道[6]。而非病毒載體則是各種外泌體或者納米顆粒,這類(lèi)遞送載體的組織相容性好,無(wú)排異反應(yīng),多次給藥有效;此外外源序列不會(huì)插入到基因組,相對(duì)安全;對(duì)靶基因的調(diào)控相對(duì)可控[7]。然而該類(lèi)載體涉及大量構(gòu)件的體外合成和裝載,中間環(huán)節(jié)繁多、不可控,成本高昂,目前仍缺乏相應(yīng)的行業(yè)或行政規(guī)范[8]。
目前各種策略在HD中均有開(kāi)展嘗試,現(xiàn)分述如下。
1.1 反義寡核苷酸(antisense oligonucleotides,ASOs)
反義寡核苷酸是一種合成的單鏈DNA或RNA,可以與相應(yīng)的mRNA形成雜交復(fù)合物,并通過(guò)募集核糖核酸酶H導(dǎo)致mRNA降解。根據(jù)ASO設(shè)計(jì)靶向序列的不同,可分為同時(shí)靶向野生型和突變型HTT mRNA 的非等位基因特異性(non-allele specific)ASOs,以及對(duì)mHTT mRNA有較高靶向特異性的等位基因特異性(allele specific)ASOs。
Tominersen(IONIS-HTTRx或RG6042)是由Roche和Ionis制藥公司合作研發(fā)的,能夠同時(shí)靶向野生型和突變型HTT mRNA的非等位基因特異性ASOs。其Ⅰ/Ⅱa期臨床試驗(yàn)結(jié)果顯示,Tominersen鞘內(nèi)注射能夠有效降低HD患者腦脊液中mHTT蛋白水平,并呈劑量依賴(lài)性降低。在90 mg和120 mg劑量組的受試者中觀察到腦脊液mHTT水平較基線(xiàn)降低約40%(NCT02519036)[9]。根據(jù)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物中的預(yù)測(cè)結(jié)果,腦脊液mHTT 降低40% 大概相當(dāng)于mHTT 分別在大腦皮層和尾狀核降低55%~85%和20%~50%。然而,隨后進(jìn)行的Ⅲ期臨床試驗(yàn)發(fā)現(xiàn)120 mg劑量組的參與者在運(yùn)動(dòng)功能和認(rèn)知能力等臨床癥狀方面較安慰劑組明顯惡化,且出現(xiàn)NfL的升高(NCT03761849),因此該項(xiàng)目提前終止[10]。亞組分析提示較為年輕、疾病負(fù)荷較低的HD 患者可能能夠在較低劑量、較長(zhǎng)間隔的給藥中獲益[11]。2023 年初,羅氏啟動(dòng)了新的2期臨床試驗(yàn)(GENERATION HD2),旨在探索不同劑量Tominersen(60 mg、100 mg)每16 周1 次給藥的療效(NCT05686551)。
在HTT基因中,特定單核苷酸多態(tài)性(single nucleotidepolymorphism,SNP)變異在CAG 擴(kuò)增的等位基因上高頻出現(xiàn)[12]。因此,Wave Life Sciences和武田公司共同開(kāi)發(fā)了3種可能具有等位基因特異性的ASOs。其中針對(duì)rs362307(WVE-120101)、rs362331(WVE-120102)的ASOs 已完成1b/2a 期臨床試驗(yàn)(PRECISION-HD1 和PRECISION-HD2,NCT03225833,NCT03225846),以評(píng)估其耐藥性、藥代動(dòng)力學(xué)、藥效學(xué)和安全性。然而這2種ASO在鞘內(nèi)注射后,并未能降低腦脊液中mHTT,因此試驗(yàn)被提前終止。另一種等位基因特異性ASO-WVE-003,針對(duì)一個(gè)未公開(kāi)的SNP 位點(diǎn)(SNP3)。WVE-003在動(dòng)物實(shí)驗(yàn)中,能夠降低HD模型小鼠50%的mHTT,且治療效果持續(xù)3個(gè)月。該藥物于2021年開(kāi)始I期臨床試驗(yàn),預(yù)計(jì)于2024年12月結(jié)束(NCT05032196)。目前相關(guān)中期報(bào)告顯示,WVE-003的30 mg和60 mg劑量組在給藥85 d后,腦脊液中mHTT的含量較基線(xiàn)水平降低約22%,而腦脊液中wt HTT的水平保持不變,表現(xiàn)出良好的等位基因特異性。類(lèi)似WVE-120101和WVE-120102這樣的等位基因特異性ASOs,主要依賴(lài)等位基因之間僅有一個(gè)核苷酸錯(cuò)配來(lái)區(qū)分突變型和野生型基因。理論上,核苷酸錯(cuò)配數(shù)目越多,等位基因之間的區(qū)分效率越高。因此,插入缺失多態(tài)性(indel)也是一個(gè)值得關(guān)注的靶點(diǎn),因?yàn)椴迦肴笔Ф鄳B(tài)性可以在HTT等位基因之間引入2~17個(gè)核苷酸的差異[13]。ASO-WVE-003 靶向的未公開(kāi)SNP3 可能就屬于這類(lèi)多態(tài)性。此外,目前的臨床試驗(yàn)主要依賴(lài)鞘內(nèi)注射,這限制了ASOs的應(yīng)用。因此,尋找更便捷的途徑使ASO能夠到達(dá)中樞神經(jīng)系統(tǒng)是研發(fā)的一個(gè)重要方向。
此外,Vico Therapeutics的VO659也是一種正在進(jìn)行HD的臨床試驗(yàn)且具有等位基因特異性的ASOs。VO659的具體的結(jié)構(gòu)和修飾方式尚未公布,通過(guò)鞘內(nèi)注射給藥。不同于其他ASOs,VO659 通過(guò)靶向CAG 重復(fù)序列來(lái)識(shí)別、降解mRNA,對(duì)存在CAG擴(kuò)增的等位基因具有較高的特異性,理論上可能對(duì)SCA1、SCA3 和HD 等CAG 擴(kuò)增疾病有效。目前,VO659的I/IIa開(kāi)放標(biāo)簽、劑量遞增試驗(yàn)正在進(jìn)行,旨在探討藥物在早期HD患者、輕中度SCA1、SCA3患者中的安全性和耐受性(NCT05822908)。
1.2 AMT-130
AMT-130是由uniQure開(kāi)發(fā)的一種非等位基因特異性基因療法。該療法需要通過(guò)神經(jīng)外科立體定位注射,將血清型5 腺相關(guān)病毒載體(Adeno-associated virus serotype 5,AAV5)注射至HD患者雙側(cè)尾狀核和殼核,以介導(dǎo)miRNA在局部表達(dá),從而干擾HTT基因的翻譯[14]。
早前該項(xiàng)目招募了36例HD患者進(jìn)行了1項(xiàng)Ⅰ/Ⅱ期臨床試驗(yàn)(NCT04120493),并繼續(xù)進(jìn)行開(kāi)放標(biāo)簽延長(zhǎng)試驗(yàn)(NCT05243017),以觀察AMT-130的安全性、耐受性和有效性,預(yù)計(jì)將于2029年完成。根據(jù)2023年12月uniQure的信息披露,AMT-130兩個(gè)劑量組(低劑量組n=13,高劑量組n=20)治療整體耐受性良好。在給藥后24個(gè)月內(nèi),觀察到在UHDRS綜合評(píng)分、運(yùn)動(dòng)及認(rèn)知量表中均有較預(yù)測(cè)自然病程改善的趨勢(shì),其中高劑量組的改善更為明顯。然而,由于對(duì)照組缺乏對(duì)應(yīng)時(shí)間點(diǎn)的數(shù)據(jù),AMT-130的臨床療效仍待進(jìn)一步確認(rèn)。
對(duì)應(yīng)的影像學(xué)及生物標(biāo)志物結(jié)果與臨床評(píng)估不一致。低劑量組AMT-130在治療后3~9個(gè)月觀察到mHTT相較基線(xiàn)降低約40%,30個(gè)月觀察到腦脊液NfL降低至基線(xiàn)水平以下。然而,高劑量組AMT-130截至目前仍未觀察到mHTT和NfL較基線(xiàn)水平明顯地降低。研究者認(rèn)為這種差異可能源于2個(gè)劑量組受試者基線(xiàn)mHTT水平的較大差異,并且由于AMT-130的給藥方式為基底節(jié)定位注射,治療范圍相對(duì)較為局限,NfL和mHTT未能靈敏反映治療效果[15]。
1.3 PTC518
相較于需要鞘內(nèi)注射的ASOs以及腦定位注射的AAV,由PTC公司研發(fā)的,能夠影響HTT pre-mRNA剪接的小分子化合物PTC518,因其通過(guò)口服給藥而受到更廣泛的關(guān)注。PTC518干擾HTT pre-mRNA剪接,通過(guò)引入假外顯子而最終使HTT mRNA被降解以達(dá)到治療效果[16]。在2022年3月,PTC啟動(dòng)了1項(xiàng)Ⅱ期臨床研究,旨在評(píng)估PTC518在162例患者中的安全性和有效性(NCT053588717)。盡管該研究曾在2022年10月被FDA叫停,要求提供更多證據(jù),但研究仍在歐洲及澳大利亞繼續(xù)進(jìn)行。根據(jù)2023年6月PTC發(fā)布的中期數(shù)據(jù)(安慰劑組n=9,PTC518 5 mg組n=11,PTC518 10 mg組n=13),PTC518整體表現(xiàn)出良好的耐受性,未見(jiàn)嚴(yán)重不良反應(yīng),并且藥物在腦脊液和血漿中的濃度相當(dāng),表現(xiàn)出良好的血腦屏障透過(guò)性。在治療后12周,PTC518能夠劑量依賴(lài)性地降低外周血液中HTT的蛋白和mRNA水平,降低幅度可達(dá)30%。腦脊液中NfL在治療后12周也呈現(xiàn)5%~9%的下降趨勢(shì),但腦脊液中mHTT的數(shù)據(jù)尚未報(bào)道。目前整體研究情況較為積極,計(jì)劃在招募患者的基礎(chǔ)上進(jìn)行更長(zhǎng)周期的臨床試驗(yàn)[17]。
另外,最初用于治療脊肌萎縮癥的小分子藥物L(fēng)MI070(Branaplam),因其能減少Htt 蛋白[18],在2022 年也針對(duì)HD開(kāi)始了Ⅱ期臨床試驗(yàn)(NCT05111249)。然而,因發(fā)現(xiàn)Branaplam可能導(dǎo)致外周神經(jīng)損害,試驗(yàn)提前中止??傮w而言,目前小分子化合物因其口服給藥方式的獨(dú)特優(yōu)勢(shì)以及篩選體系的成熟性而備受關(guān)注,許多學(xué)者和企業(yè)都在積極探索不同化合骨架的小分子化合物用于治療HD。
1.4 ER2001
目前國(guó)內(nèi)也在HD基因治療上作出創(chuàng)新的嘗試。南京大學(xué)自主研發(fā)出能夠靶向人HTT基因的核酸藥物ER2001注射液(簡(jiǎn)稱(chēng)ER2001)。ER2001注射液的活性成分為環(huán)狀雙鏈DNA。通過(guò)靜脈輸注后,ER2001被肝臟吸收,驅(qū)動(dòng)表達(dá)包含miR-155骨架的靶向HTT siRNA和RVG-Lamp2b融合蛋白。RVG-Lamp2b融合蛋白可組裝至外泌體膜上,而HTT siRNA則通過(guò)miR-155的體內(nèi)剪接機(jī)制被包裝至RVG標(biāo)記的外泌體中。含有siRNA的外泌體通過(guò)循環(huán)系統(tǒng)遞送,在RVG標(biāo)簽的引導(dǎo)下穿透血腦屏障,到達(dá)中樞神經(jīng)系統(tǒng),降解HTT mRNA[19]。
目前,ER2001正在廣州醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院開(kāi)展一項(xiàng)開(kāi)放標(biāo)簽的劑量遞增臨床試驗(yàn),以評(píng)估其在HD患者中的安全性、耐受性和有效性。目前已招募了7例HD患者,涉及4個(gè)不同的劑量組(0.04、0.08、0.16、0.32 mg/kg)。截至目前,該研究觀察到36例次的不良反應(yīng),其中與藥物相關(guān)的不良反應(yīng)主要涉及心臟、肝功能和脂代謝,嚴(yán)重程度輕微,大部分無(wú)須醫(yī)療干預(yù)或在無(wú)醫(yī)療干預(yù)下自行好轉(zhuǎn)。此外,研究還對(duì)治療后的運(yùn)動(dòng)和認(rèn)知功能進(jìn)行了評(píng)估。受試者在給藥后8周UHDRS(統(tǒng)一亨廷頓運(yùn)動(dòng)評(píng)分)和認(rèn)知量表評(píng)估中表現(xiàn)穩(wěn)定,較基線(xiàn)有改善的趨勢(shì)。然而,由于缺乏安慰劑組及自然病程預(yù)測(cè)數(shù)據(jù),臨床療效仍待進(jìn)一步臨床試驗(yàn)明確。目前相關(guān)的影像學(xué)和生物標(biāo)志物結(jié)果仍需集中分析和統(tǒng)計(jì)。
1.5 臨床試驗(yàn)現(xiàn)狀總結(jié)
任何可能能夠干預(yù)HD疾病病程的嘗試都是值得鼓勵(lì)的,然而目前現(xiàn)有的試驗(yàn)藥物距離臨床應(yīng)用還有相當(dāng)大的距離。現(xiàn)將目前相關(guān)臨床試驗(yàn)嘗試的優(yōu)缺點(diǎn)見(jiàn)表1。
2 HD基因治療的治療策略進(jìn)展
聚集的規(guī)律性間隔短回文重復(fù)序列(clustered regularlyinterspersed short palindromic repeats,CRISPR)和CRISPR 關(guān)聯(lián)基因(CRISPR associated gene,Cas)使細(xì)菌免疫系統(tǒng)能夠識(shí)別和破壞外源DNA,目前CRISPR/Cas系統(tǒng)被廣泛用于真核生物的基因調(diào)控。CRISPR/Cas也是HD基因治療目前的主流發(fā)展方向,根據(jù)其是否產(chǎn)生DNA 雙鏈斷裂(doublestrand break,DSB),分為DSB型和非DSB型。
2.1 DSB型CRISPR/Cas策略
DSB型是Cas9核酸酶在gRNA引導(dǎo)下與目標(biāo)DNA序列結(jié)合,誘導(dǎo)雙鏈斷裂,雙鏈斷裂大概率通過(guò)錯(cuò)誤同源端連接修復(fù),導(dǎo)致移碼突變,引起基因失活,小概率通過(guò)以另外一條等位基因?yàn)槟0暹M(jìn)行直接同源修復(fù)。來(lái)自Roche Tominersen臨床試驗(yàn)的研究結(jié)果提示野生型HTT可能具有重要作用,因此基因編輯應(yīng)當(dāng)具有較高的等位基因特異性。
由于Cas9核酸酶斷裂雙鏈需要PAM位點(diǎn),而等位基因間SNP的多態(tài)性使等位基因間PAM位點(diǎn)不盡相同,為Cas9實(shí)現(xiàn)等位基因特異性編輯提供了可能(圖1)[20]。第一種,由于部分SNP位點(diǎn)位于外顯子,在該SNP位點(diǎn)雜合可能在突變的等位基因上形成可供Cas9結(jié)合的PAM位點(diǎn)(野生型等位基因無(wú)),從而實(shí)現(xiàn)等位基因特異性。一旦通過(guò)PAM識(shí)別突變的等位基因,Cas9切割DNA雙鏈,導(dǎo)致隨機(jī)同源重組,進(jìn)而導(dǎo)致轉(zhuǎn)錄本的無(wú)以降解,實(shí)現(xiàn)臨床治療。第二種則利用存在于exon 1在5'啟動(dòng)子序列以及3'端內(nèi)含子上的SNP,使得等位基因間PAM 存在差異,能夠更具選擇性地將擴(kuò)增的exon 1剪切,并且有可能以正常等位基因?yàn)槟0暹M(jìn)行修復(fù),從而實(shí)現(xiàn)對(duì)突變HTT的糾正[21]。該項(xiàng)策略擁有多個(gè)可供選擇的位點(diǎn),且人群中雜合頻率較高,預(yù)測(cè)多種組合能夠覆蓋80% 以上的HD 患者,應(yīng)該是未來(lái)重點(diǎn)的發(fā)展方向。隨著Cas9蛋白功能日益明確,多種Cas9蛋白的變種也在驗(yàn)證中,能夠提供各種各樣的PAM限制,且具更高的保真度,將為后續(xù)設(shè)計(jì)研究靶點(diǎn)提供更大的空間[22]。
另外一種DSB策略則是將gRNA設(shè)計(jì)在exon1 CAG重復(fù)序列的交界處,研究發(fā)現(xiàn)特定的gRNA能夠使得突變基因擴(kuò)增的CAG重復(fù)序列縮短,其中25%的CAG縮短沒(méi)有引入移碼突變,另外75%存在移碼突變[23]。該策略的若能進(jìn)一步改進(jìn)有望實(shí)現(xiàn)真正的基因治療。
2.2 非DSB型CRISPR/Cas策略
而非DSB 型CRISPR/Cas9 策略主要是指CRISPRi 以及堿基編輯技術(shù)。研究顯示靶向CAG重復(fù)序列的CRISPRi能夠在不引起DNA改變的情況下,更有選擇性地降低mHTT,并且表現(xiàn)出比CRISPR/Cas9更優(yōu)異的行為學(xué)改善,而且對(duì)其他CAG基因的表達(dá)沒(méi)有影響[24]。
此外堿基編輯技術(shù)在HD中也有一定的應(yīng)用前景。HD患者擴(kuò)增的CAG重復(fù)序列中可能會(huì)夾雜有CAA,盡管CAG和CAA都編碼谷氨酰胺,在翻譯產(chǎn)物上沒(méi)有區(qū)別。但是有趣的是,決定起病年齡的是CAA以前連續(xù)的CAG重復(fù)次數(shù),連續(xù)的CAG重復(fù)次數(shù)與更嚴(yán)重的轉(zhuǎn)錄紊亂、核內(nèi)包涵體聚集以及體細(xì)胞CAG擴(kuò)增相關(guān)[25]。因此,通過(guò)胞嘧啶堿基編輯器(cytosine base editors,CBEs)將CAG轉(zhuǎn)換為CAA可能能夠在盡可能小的基因組改變上使HD患者獲益,目前已有相關(guān)研究團(tuán)隊(duì)進(jìn)行對(duì)應(yīng)研究。
Cas13是CRISPR/Cas系統(tǒng)中的一員,與Cas9不同,Cas13在gRNA 的引導(dǎo)下與特定序列的單鏈RNA 結(jié)合并將其剪切[26]。Cas13切割RNA并不依賴(lài)PAM位點(diǎn),因此其在gRNA的設(shè)計(jì)上有較高的自由度,能夠更好地優(yōu)化單個(gè)核苷酸錯(cuò)配導(dǎo)致的等位基因特異性[27]。然而與理論不同,研究發(fā)現(xiàn)Cas13能夠通過(guò)靶向CAG重復(fù)序列來(lái)實(shí)現(xiàn)等位基因特異性,等位基因間CAG重復(fù)次數(shù)差異越大,對(duì)擴(kuò)增的等位基因抑制效率越強(qiáng)。定位注射Cas13d病毒載體后,zQ175 HD小鼠模型中mHTT蛋白表達(dá)下調(diào),癥狀明顯緩解[28]。但是值得注意的是,靶向CAG重復(fù)序列的Cas13d在調(diào)控mHTT的同時(shí),也可能影響Ataxin1/2/3/7、TBP、atrophin-1等富含多聚谷氨酰胺的蛋白,因此其脫靶效應(yīng)值得進(jìn)一步關(guān)注。
2.3 小結(jié)
值得注意的是,DSB型CRISPR/Cas策略引起的DNA雙鏈斷裂,有一定概率會(huì)導(dǎo)致染色體重排或缺失[29],盡管相關(guān)技術(shù)已在不斷優(yōu)化,力圖降低發(fā)生的概率[30]。就此而言,非DSB型CRISPR/Cas策略擁有著較高的安全性。實(shí)驗(yàn)動(dòng)物中全身性使用HD相關(guān)基因編輯策略(靜脈注射AAV)可影響生殖腺基因組[31],就此引出一個(gè)倫理問(wèn)題:HD的相關(guān)基因編輯策略能否具有生殖腺的編輯功能?一方面是HD患者有生育健康后代的需求;另一方面不可避免地導(dǎo)致被編輯后代的出生[32]。而限制基因編輯的作用范圍,相應(yīng)的給藥方式(鞘內(nèi)注射、腦內(nèi)注射)無(wú)疑增加受試患者的負(fù)擔(dān),也有可能導(dǎo)致療效不佳。此外相關(guān)的復(fù)雜倫理問(wèn)題也必然會(huì)為相應(yīng)的臨床試驗(yàn)申報(bào)帶去繁多的手續(xù)和討論。
總體而言,隨著CRISPR/Cas策略的不斷優(yōu)化,HTT基因編輯迎來(lái)了多種可能的策略。然而,在中樞神經(jīng)系統(tǒng)中的應(yīng)用仍然面臨較大的限制。給藥載體是另一個(gè)需要進(jìn)一步優(yōu)化的方向[33]。然而,由于Cas9蛋白相對(duì)較大,如何提高載體的裝載效率,以實(shí)現(xiàn)更高效的基因編輯,仍需要更多的努力和研究。這一領(lǐng)域的進(jìn)展將為神經(jīng)系統(tǒng)疾病的治療提供更可行的方案。
3 HD基因治療的評(píng)估進(jìn)展
3.1 生物標(biāo)志物評(píng)估
CSF 中的mHTT 作為與HD 病程密切相關(guān)的生物標(biāo)志物,在基因治療的療效評(píng)估中起著重要作用。然而,隨著對(duì)CSF mHTT廣泛應(yīng)用和認(rèn)識(shí)的不斷深入,其地位值得進(jìn)一步評(píng)估。
目前的實(shí)踐中觀察到,一些臨床發(fā)病患者的CSF mHTT水平低于定量區(qū)間,因此更加靈敏、可靠的mHTT檢測(cè)技術(shù)仍具有極大的應(yīng)用前景[34]。此外,CSF mHTT被認(rèn)為是由神經(jīng)元分泌,經(jīng)由腦類(lèi)淋巴途徑進(jìn)入腦脊液,并被主動(dòng)清除出腦。因此,CSF mHTT的含量可能受多種因素的影響,但目前缺乏研究評(píng)估各種因素對(duì)個(gè)體CSF mHTT的影響[35]。
隨著治療策略的改善,如口服給藥、靜脈給藥等相對(duì)無(wú)創(chuàng)的實(shí)施,使得腰穿的實(shí)施和次數(shù)成為臨床試驗(yàn)中最令受試者顧慮的環(huán)節(jié)。因此,如何使用外周體液組織評(píng)估中樞神經(jīng)系統(tǒng)HTT降低的效果成為當(dāng)前研究的熱門(mén)方向。
Amber Southwell的團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)神經(jīng)元分泌的細(xì)胞外囊泡中含有HTT蛋白,主要集中在血漿和腦脊液的ectosomes而非exosomes中。與之對(duì)應(yīng)的,人血漿細(xì)胞外囊泡上存在神經(jīng)元的表面標(biāo)志物ATP1A3以及L1CAM。血漿中神經(jīng)元來(lái)源的ectosomes中的mHTT水平有望成為未來(lái)無(wú)創(chuàng)評(píng)估中樞神經(jīng)系統(tǒng)HTT降低療效的可能策略。這一發(fā)現(xiàn)為非侵入性評(píng)估治療效果提供了新的方向。
3.2 影像標(biāo)志物應(yīng)用
結(jié)構(gòu)MRI在各種HD相關(guān)的臨床研究中得到廣泛應(yīng)用,其主要目標(biāo)是評(píng)估HD患者腦組織萎縮速率以及監(jiān)控可能的不良事件。然而,目前尚未發(fā)現(xiàn)其他影像標(biāo)志物被用于評(píng)估基因治療策略對(duì)腦功能的影響。鑒于MRI的無(wú)創(chuàng)性,其在HD臨床試驗(yàn)中的應(yīng)用值得被更廣泛地推廣。
HD腦組織中存在腦血管結(jié)構(gòu)及功能異常,神經(jīng)元功能異常也將導(dǎo)致其對(duì)局部血流調(diào)控出現(xiàn)障礙。Klinkmueller P等[36]研究發(fā)現(xiàn),腦小動(dòng)脈血流體積(arteriolar cerebral bloodvolumes,CBVa)的升高是HD腦組織早期的變化。在小鼠中實(shí)現(xiàn)基因調(diào)控后,相應(yīng)的CBVa改變甚至早于行為學(xué)改善,這項(xiàng)技術(shù)值得在臨床試驗(yàn)中進(jìn)行驗(yàn)證[37]。
正如前文所述,mHTT在中樞神經(jīng)系統(tǒng)中經(jīng)歷了主動(dòng)清除機(jī)制,而目前已有證據(jù)提示HD患者腦組織中清除機(jī)制的相關(guān)結(jié)構(gòu)存在異常,并與疾病嚴(yán)重程度相關(guān)[38]。因此對(duì)相應(yīng)的腦類(lèi)淋巴功能進(jìn)行評(píng)估在將來(lái)納入臨床試驗(yàn)中將變得十分必要。這將有助于更好地解讀腦脊液中mHTT水平的結(jié)果[39]。
4 總結(jié)與展望
目前對(duì)HD的自然病程仍無(wú)有效的干預(yù)手段,但越來(lái)越多的治療策略在HD治療領(lǐng)域中開(kāi)展嘗試。希望能盡早研發(fā)出安全、有效的HD治療策略,并且便捷、精準(zhǔn)地進(jìn)行療效評(píng)價(jià),最大程度上地讓HD患者及其家庭獲益。
參考文獻(xiàn)
[1] McColgan P,Tabrizi SJ. Huntington's disease:a clinical review[J].Eur J Neurol,2018,25(1):24-34.
[2] Tabrizi SJ,F(xiàn)lower MD,Ross CA,et al. Huntington disease:new insightsinto molecular pathogenesis and therapeutic opportunities[J]. NatRev Neurol,2020,16(10):529-546.
[3] Chancellor D,Barrett D,Nguyen-Jatkoe L,et al. The state of celland gene therapy in 2023[J]. Mol Ther,2023,31(12):3376-3388.[4] Ling QL,Herstine JA,Bradbury A,et al. AAV-based in vivo genetherapy for neurological disorders[J]. Nat Rev Drug Discov,2023,22(10):789-806.
[5] Schulz M,Levy DI,Petropoulos CJ,et al. Binding and neutralizinganti-AAV antibodies:detection and implications for rAAV-mediatedgene therapy[J]. Mol Ther,2023,31(3):616-630.
[6] Lek A,Wong B,Keeler A,et al. Death after high-dose rAAV9gene therapy in a patient with duchenne's muscular dystrophy[J]. N EnglJ Med,2023,389(13):1203-1210.
[7] Mondal J,Pillarisetti S,Junnuthula V,et al. Hybrid exosomes,exosome-like nanovesicles and engineered exosomes for therapeutic applications[J]. J Control Release,2023,353:1127-1149.
[8] 馬 躍,鄧 莉,李善剛. 納米粒子在CRISPR/Cas9基因治療中的應(yīng)用[J]. 生物工程學(xué)報(bào),2022,38(6):2087-2104.
Ma Y,Deng L,Li SG. Application of nanoparticles in CRISPR/Cas9-based gene therapy[J]. Chin J Biotechnol,2022,38(6):2087-2104.
[9] Tabrizi SJ,Leavitt BR,Landwehrmeyer GB,et al. Targeting hun‐tingtin expression in patients with Huntington's disease[J]. N Engl JMed,2019,380(24):2307-2316.
[10] Tabrizi SJ,Estevez-Fraga C,van Roon-Mom WMC,et al. Potentialdisease-modifying therapies for Huntington's disease:lessonslearned and future opportunities[J]. Lancet Neurol,2022,21(7):645-658.
[11] McColgan P,Thobhani A,Boak L,et al. Tominersen in adultswith manifest Huntington's disease[J]. N Engl J Med,2023,389(23):2203-2205.
[12] Warby SC,Montpetit A,Hayden AR,et al. CAG expansion in theHuntington disease gene is associated with a specific and targetable predisposinghaplogroup[J]. Am J Hum Genet,2009,84(3):351-366.
[13] Shin JW,Shin A,Park SS,et al. Haplotype-specific insertiondeletionvariations for allele-specific targeting in Huntington's disease[J]. Mol Ther Methods Clin Dev,2022,25:84-95.
[14] Spronck EA,Vallès A,Lampen MH,et al. Intrastriatal administrationof AAV5-miHTT in non-human Primates and rats is well toleratedand results in miHTT transgene expression in key areas of Huntingtondisease pathology[J]. Brain Sci,2021,11(2):129.
[15] UniQure. UniQure announces update on phase Ⅰ/Ⅱ clinical trialsof AMT-130 gene therapy for the treatment of Huntington's disease[EB/OL].( 2023-12-19) [2024-01-26]. https://uniqure.gcs-web.com/newsreleases/news-release-details/uniqure-announces-update-phase-iiiclinical-trials-amt-130-gene.
[16] Keller CG,Shin Y,Monteys AM,et al. An orally available,brainpenetrant,small molecule lowers huntingtin levels by enhancing pseudoexoninclusion[J]. Nat Commun,2022,13(1):1150.
[17] PTC Therapeutics. PIVOT-HD interim data update[EB/OL].(2023-06-01)[2024-01-26]. https://ir.ptcbio.com/static-files/cbaeb42b-4897-40c6-bfba-d0f21eacc4d9.
[18] Estevez-Fraga C,Tabrizi SJ,Wild EJ. Huntington's disease clinicaltrials corner:November 2022[J]. J Huntingtons Dis,2022,11(4):351-367.
[19] Zhang L,Wu TT,Shan YY,et al. Therapeutic reversal of Huntington'sdisease by in vivo self-assembled siRNAs[J]. Brain,2021,144(11):3421-3435.
[20] Monteys AM,Ebanks SA,Keiser MS,et al. CRISPR/Cas9 editingof the mutant huntingtin allele in vitro and in vivo[J]. Mol Ther,2017,25(1):12-23.
[21] Shin JW,Hong EP,Park SS,et al. PAM-altering SNP-basedallele-specific CRISPR-Cas9 therapeutic strategies for Huntington'sdisease[J]. Mol Ther Methods Clin Dev,2022,26:547-561.
[22] Bravo JPK,Liu MS,Hibshman GN,et al. Structural basis for mismatchsurveillance by CRISPR-Cas9[J]. Nature,2022,603(7900):343-347.
[23] Oura S,Noda T,Morimura N,et al. Precise CAG repeat contractionin a Huntington's Disease mouse model is enabled by gene editingwith SpCas9-NG[J]. Commun Biol,2021,4(1):771.
[24] Seo JH,Shin JH,Lee J,et al. DNA double-strand break-freeCRISPR interference delays Huntington's disease progression in mice[J]. Commun Biol,2023,6(1):466.
[25] Gu XF,Richman J,Langfelder P,et al. Uninterrupted CAG repeatdrives striatum-selective transcriptionopathy and nuclear pathogenesisin human Huntingtin BAC mice[J]. Neuron,2022,110(7):1173-1192.
[26] Cox DBT,Gootenberg JS,Abudayyeh OO,et al. RNA editing withCRISPR-Cas13[J]. Science,2017,358(6366):1019-1027.
[27] Molina Vargas AM,Sinha S,Osborn R,et al. New design strategiesfor ultra-specific CRISPR-Cas13a-based RNA detection withsingle-nucleotide mismatch sensitivity[J]. Nucleic Acids Res,2024,52(2):921-939.
[28] Morelli KH,Wu Q,Gosztyla ML,et al. An RNA-targetingCRISPR-Cas13d system alleviates disease-related phenotypes in Huntington'sdisease models[J]. Nat Neurosci,2023,26(1):27-38.
[29] Leibowitz ML,Papathanasiou S,Doerfler PA,et al. Chromothripsisas an on-target consequence of CRISPR-Cas9 genome editing[J].Nat Genet,2021,53(6):895-905.
[30] Tsuchida CA,Brandes N,Bueno R,et al. Mitigation of chromosomeloss in clinical CRISPR-Cas9-engineered T cells[J]. Cell,2023,186(21):4567-4582.
[31] Yan S,Zheng X,Lin YQ,et al. Cas9-mediated replacement of expandedCAG repeats in a pig model of Huntington's disease[J]. NatBiomed Eng,2023,7(5):629-646.
[32] Coller BS. Ethics of human genome editing[J]. Annu Rev Med,2019,70:289-305.
[33] Yao XG,Lyu P,Yoo K,et al. Engineered extracellular vesicles asversatile ribonucleoprotein delivery vehicles for efficient and safeCRISPR genome editing[J]. J Extracell Vesicles,2021,10(5):e12076.
[34] Rodrigues FB,Byrne LM,Tortelli R,et al. Mutant huntingtin andneurofilament light have distinct longitudinal dynamics in Huntington'sdisease[J]. Sci Transl Med,2020,12(574):eabc2888.
[35] Caron NS,Banos R,Yanick C,et al. Mutant huntingtin is clearedfrom the brain via active mechanisms in Huntington disease[J]. J Neurosci,2021,41(4):780-796.
[36] Klinkmueller P,Kronenbuerger M,Miao XY,et al. Impaired responseof cerebral oxygen metabolism to visual stimulation in Huntington'sdisease[J]. J Cereb Blood Flow Metab,2021,41(5):1119-1130.
[37] Liu HS,Zhang CC,Xu JD,et al. Huntingtin silencing delays onsetand slows progression of Huntington's disease:a biomarker study[J].Brain,2021,144(10):3101-3113.
[38] Chan ST,Mercaldo ND,Ravina B,et al. Association of dilatedperivascular spaces and disease severity in patients with Huntington disease[J]. Neurology,2021,96(6):e890-e894.
[39] Eide PK,Lashkarivand A,Pripp A,et al. Plasma neurodegenerationbiomarker concentrations associate with glymphatic and meningeallymphatic measures in neurological disorders[J]. Nat Commun,2023,14(1):2084.
(責(zé)任編輯:曾 玲)
基金項(xiàng)目:國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃資助項(xiàng)目(編號(hào):2022YFA1104900、2022YFA1104904);國(guó)家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(編號(hào):82071255、82271266、82101330);廣東省神經(jīng)系統(tǒng)疾病臨床醫(yī)學(xué)研究中心資助項(xiàng)目(編號(hào):2020B1111170002);廣東省神經(jīng)疾病早期干預(yù)及功能修復(fù)研究國(guó)際科技合作基地資助項(xiàng)目(編號(hào):2020A0505020004)。