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多色免疫組織化學(xué)技術(shù)在腫瘤標(biāo)志物分析中的研究進(jìn)展

2024-09-01 00:00:00楊馬駿楊超杰賀月趙燦冀海偉王琦秦玉嶺吳麗
分析化學(xué) 2024年3期
關(guān)鍵詞:評述

摘要 多色免疫組織化學(xué)(Multiplex immunohistochemistry, mIHC)技術(shù)是一種新型多靶點病理組織染色、成像及分析技術(shù)。該技術(shù)通過在單張組織切片上檢測多種生物標(biāo)志物的表達(dá)水平及空間分布,實現(xiàn)對細(xì)胞的表型、組成、形態(tài)及細(xì)胞間相互作用機(jī)理的全面解析。近年來, mIHC 技術(shù)被成功應(yīng)用于腫瘤免疫研究領(lǐng)域,為腫瘤的診斷和治療開辟了新的途徑。本文從近年開發(fā)的mIHC 檢測技術(shù)出發(fā),針對不同類型mIHC技術(shù)的檢測原理及其特點進(jìn)行了詳細(xì)闡述,重點討論了新型mIHC 檢測技術(shù)在腫瘤標(biāo)志物及腫瘤微環(huán)境檢測等領(lǐng)域中的應(yīng)用,并對mIHC 在腫瘤免疫診斷和治療領(lǐng)域的應(yīng)用前景和發(fā)展趨勢進(jìn)行了展望。

關(guān)鍵詞 多色免疫組織化學(xué);熒光多色標(biāo)記;腫瘤診斷;循環(huán)熒光成像;評述

2018 年諾貝爾生理學(xué)和醫(yī)學(xué)獎分別授予了美國得州大學(xué)免疫學(xué)家詹姆斯·艾利森(James P Allison)教授和日本京都大學(xué)本庶佑(Tasuku Honjo)教授,以表彰他們發(fā)現(xiàn)“負(fù)性免疫調(diào)節(jié)”治療癌癥的療法。這徹底顛覆了以往人類對抗腫瘤的策略,標(biāo)志著腫瘤免疫治療進(jìn)入了一個新的歷史階段。目前上市的腫瘤免疫治療藥物雖然效果很好,但是存在價格高、整體應(yīng)答率較低以及部分患者的不良反應(yīng)較大等缺點。以免疫檢查點PD-1/PD-L1 單抗為例,其在腫瘤治療中的臨床整體應(yīng)答率僅有20%~30%,無法實現(xiàn)有針對性的靶向用藥,造成醫(yī)療資源浪費,限制了其在腫瘤治療中的應(yīng)用[1-3]。腫瘤免疫微環(huán)境(Tumorimmune microenvironment, TIME)生物標(biāo)志物與免疫治療反應(yīng)息息相關(guān)。因此,治療腫瘤的關(guān)鍵是制定針對不同病人的個體化腫瘤精準(zhǔn)免疫治療方案。然而。由于TIME 呈現(xiàn)明顯腫瘤異質(zhì)性,而且面臨多種細(xì)胞類型并存、各種細(xì)胞因子相互作用以及免疫抑制的復(fù)雜狀況,依賴于對單一標(biāo)志物的檢測難以全面、深入和精準(zhǔn)地描繪TIME 的全貌[4-9]。為了實現(xiàn)腫瘤精準(zhǔn)免疫治療,亟需開發(fā)高效且精準(zhǔn)的免疫組織化學(xué)(免疫組化)技術(shù)用于臨床免疫診斷中腫瘤標(biāo)志物及TIME 的精準(zhǔn)檢測[10-12]。

目前,采用多色免疫組織化學(xué)(Multiplex immunohistochemistry, mIHC)技術(shù)對免疫組織化學(xué)標(biāo)志物及腫瘤微環(huán)境檢測的總結(jié)性文章已有報導(dǎo),如Tan 等[13]介紹了幾種已經(jīng)臨床應(yīng)用的mIHC 技術(shù),詳細(xì)比較了mIHC 聯(lián)合熒光免疫檢測法(Immunofluorescence, IF)、芯片細(xì)胞術(shù)、基于DNA 條形碼的mIHC/IF、多重IHC/IF 分析方案以及三維(3D)成像等mIHC 技術(shù)在免疫組織化學(xué)(Immunohistochemistry, IHC)標(biāo)志物檢測中的差異。但是,該文并沒有對一些新開發(fā)的檢測技術(shù)進(jìn)行介紹。Wilson 等[14]對通過mIHC 研究TIME 時的數(shù)據(jù)預(yù)處理、質(zhì)量控制和分析方法等方面進(jìn)行了綜述,側(cè)重于分析過程和數(shù)據(jù)處理的介紹。Hoyt 等[15]介紹了多重免疫熒光技術(shù)(Multiplex immunofluorescence, mIF)的原理、技術(shù)方法以及檢測數(shù)據(jù)的優(yōu)化分析過程,并探討了其臨床應(yīng)用潛力。迄今為止,針對最新開發(fā)的mIHC 及其創(chuàng)新點、局限性和應(yīng)用潛力等方面的綜述性文章還未見報道。本文詳細(xì)闡述了近十年發(fā)展起來的mIHC 技術(shù)的檢測原理、創(chuàng)新點以及不足之處,重點討論了這些檢測技術(shù)在免疫組織化學(xué)腫瘤標(biāo)志物檢測等領(lǐng)域中的應(yīng)用,并展望了新型mIHC 技術(shù)在腫瘤免疫診斷中的發(fā)展前景和趨勢。

1 IHC技術(shù)

傳統(tǒng)的IHC 技術(shù)是應(yīng)用免疫學(xué)抗原-抗體反應(yīng),對組織或細(xì)胞內(nèi)抗原或抗體等物質(zhì)進(jìn)行定性分析和定位的技術(shù),是描述腫瘤微環(huán)境空間組學(xué)信息的常見手段,在臨床病理診斷中應(yīng)用廣泛。目前,發(fā)展較成熟的IHC 技術(shù)是使用酶或熒光標(biāo)記的抗體對福爾馬林固定且石蠟包埋的樣本(Formalin-fixed andparrffin-embedded, FFPE)進(jìn)行染色。該方法能標(biāo)記1~3 種抗體,但不能完整地反映IHC 腫瘤標(biāo)志物的種類及進(jìn)行TIME 的檢測,導(dǎo)致患者錯失可能的精準(zhǔn)化免疫治療機(jī)會。雖然該方法可采用多種抗體標(biāo)記及連續(xù)切片技術(shù)提高對多種組分和多個方位的檢測能力,但連續(xù)切片并不能在完全相同的細(xì)胞層面進(jìn)行解析,增加了漏檢機(jī)率,還會丟失空間位置信息,不利于待檢蛋白質(zhì)的精準(zhǔn)定位,費時費力且需消耗大量的樣本。

2 mIHC技術(shù)

近年來,隨著IHC 及檢測儀器的發(fā)展,研究者開發(fā)了mIHC 技術(shù)。mIHC 是利用免疫學(xué)和細(xì)胞化學(xué)的原理,在同一張切片上同時或先后采用不同顏色的熒光素或酶促產(chǎn)物原位顯示組織或細(xì)胞內(nèi)不同大分子抗原物質(zhì)的一項多標(biāo)記染色技術(shù)(圖1)[16]。目前,該技術(shù)可在一張組織切片上同時完成8~20 種甚至更多種類IHC 標(biāo)志物的檢測,大大提高了抗原分型和篩選的效率。mIHC 可直接評估腫瘤和TIME 中多種細(xì)胞的表型及空間關(guān)系,精確反映TIME 的免疫狀態(tài),不僅能節(jié)省檢測時間、提高對稀有組織標(biāo)本的利用率,更能幫助研究人員全面、深入和精準(zhǔn)地了解腫瘤局部組織和微環(huán)境信息[17-18]。根據(jù)mIHC 的檢測結(jié)果可以準(zhǔn)確了解TIME 中腫瘤抗原表達(dá)和生長特征、浸潤性免疫細(xì)胞的數(shù)量、表型和功能狀態(tài)以及細(xì)胞因子種類和表達(dá)量,并依此制定針對特定腫瘤的免疫治療方案[19-20]。目前,多表位配體法[21]、連續(xù)免疫過氧化物酶標(biāo)記和清除法[22]、循環(huán)免疫熒光法[23]、多重免疫熒光法[24]、酪胺信號放大法[25]、交換反應(yīng)信號放大法[26]、數(shù)字空間分析法[27]和質(zhì)譜流式細(xì)胞成像[28]等新技術(shù)被應(yīng)用到mIHC 研究中,大大推動了mIHC 技術(shù)的發(fā)展,使得mIHC 成為腫瘤精準(zhǔn)免疫治療、單細(xì)胞測序及TIME 研究的重要手段,具有廣闊的臨床應(yīng)用前景[19-20]。

2.1 多表位配體技術(shù)

常用的商業(yè)化染料(如eFluor 和AmCyan 等)的熒光發(fā)射譜較寬,染料之間有光譜重疊,導(dǎo)致可同時識別的熒光探針數(shù)量有限。為提高分析通量,研究人員發(fā)展了多種基于不同熒光信號移除技術(shù)的多色循環(huán)免疫熒光成像方法。多表位配體法(Multiepitope ligand cartography, MELC)是一種基于高通量熒光顯微鏡實現(xiàn)對亞細(xì)胞水平蛋白標(biāo)志物識別和量化的方法。MELC 首先采用熒光標(biāo)記抗體選擇性結(jié)合組織樣品中的蛋白標(biāo)志物,通過熒光成像實現(xiàn)對蛋白標(biāo)志物空間位置的選擇性標(biāo)記,得到熒光圖像后,通過光漂白去除熒光標(biāo)記物,再應(yīng)用另一組標(biāo)記抗體對相應(yīng)分子定位成像[16]。重復(fù)多次該步驟可得到多種蛋白標(biāo)志物分子定位圖(圖2)[21]。Eckhardte 等[29]運用該技術(shù)標(biāo)記單一組織切片中的主要目標(biāo)細(xì)胞,檢測淋巴或骨髓中各種細(xì)胞活性及分化狀態(tài)。該方法有望用于研究轉(zhuǎn)基因小鼠自身免疫性腦脊髓炎病變或評估人類多發(fā)性硬化癥治療潛在靶點的藥物反應(yīng)性。但是,該方法用于檢測鑒別不同細(xì)胞類型時,存在難以保持抗體染色質(zhì)量的一致性和檢測有效性的問題。

為了進(jìn)一步拓展MELC 在蛋白標(biāo)志物檢測中的應(yīng)用范圍, Holzarth 等[30]使用MELC 闡明和量化基質(zhì)細(xì)胞間的異質(zhì)性,實現(xiàn)了對基質(zhì)細(xì)胞和造血細(xì)胞的多重空間分析。該研究成功使用多達(dá)100 個熒光標(biāo)記物對同一組織切片中的蛋白標(biāo)志物進(jìn)行染色,并進(jìn)一步通過圖像處理和圖像精確疊加分析了蛋白標(biāo)志物的表達(dá)。此外, MELC 還被用于繪制固定細(xì)胞或組織中的多種蛋白質(zhì)圖譜[21,31]。然而,逐個區(qū)域光漂白掃描操作效率較低、耗時長,還存在殘余背景信號干擾等問題。此外,易被光漂白的熒光分子并不適用于熒光成像研究,而光學(xué)穩(wěn)定性強的熒光標(biāo)簽又難被光漂白,該矛盾制約了MELC 技術(shù)的廣泛使用。

2.2 連續(xù)免疫過氧化物酶標(biāo)記和清除技術(shù)

弗吉尼亞大學(xué)生物醫(yī)學(xué)工程系的Glass等[22]開發(fā)了一種連續(xù)免疫過氧化物酶標(biāo)記和清除法(Sequentialimmuneoperoxidase labeling and erasing, SIMPLE)。采用該技術(shù)可同時檢測多種抗原,利用醇溶性過氧化物酶底物3-氨基-9-乙基咔唑(9-Ethylcarbazol-3-amine, AEC)標(biāo)記抗原分子, AEC 與抗原分子結(jié)合并在有機(jī)溶劑中產(chǎn)生紅色沉淀;清除沉淀,抗體在酸化的高錳酸鹽中洗脫,再進(jìn)行下一輪染色,達(dá)到多重標(biāo)記的目的(圖3)[32]。在小鼠或人的FFPE 組織切片中進(jìn)行多抗原共定位時,使用AEC 組織染色成像后,在乙醇中去除AEC 沉淀,再在酸化的KMnO4 溶液(0.15 mol/L KMnO4, 0.01 mol/L H2SO4)中洗脫抗體,對組織進(jìn)行下一輪染色,在1 個組織切片中可同時顯示至少5 種蛋白標(biāo)記物。該研究采用包含38 例頭頸部鱗狀細(xì)胞癌的組織芯片揭示了淋巴、髓系細(xì)胞密度和人類乳頭狀瘤病毒載量與患者預(yù)后情況密切相關(guān)。SIMPLE 法的優(yōu)勢是在組織樣本數(shù)量有限的條件下能重復(fù)多次對相同細(xì)胞或組織中的多種抗原進(jìn)行分析,不足之處在于使用酸化的KMnO4 洗脫液除去結(jié)合的抗體時可能破壞組織完整性,導(dǎo)致局部組織退化、成像質(zhì)量降低,并且只局限于5 個熒光循環(huán)通道,檢測時間較長[22,32]。

2.3 循環(huán)免疫熒光技術(shù)

循環(huán)免疫熒光技術(shù)(Cyclic immunofluorescence, CycIF)是一種使用傳統(tǒng)熒光顯微鏡進(jìn)行多重免疫熒光成像的方法,將常見熒光標(biāo)記物與抗體結(jié)合,通過連續(xù)的4~6 通道組織成像獲得相應(yīng)蛋白標(biāo)志物的成像圖。該方法使用H2O2 氧化熒光標(biāo)記物來淬滅熒光團(tuán),實現(xiàn)對抗體的標(biāo)記-淬滅-再標(biāo)記過程,可構(gòu)建多達(dá)30 個通道的熒光成像圖。與抗體標(biāo)記剝離方法不同, CycIF 的反應(yīng)條件較溫和且易于標(biāo)準(zhǔn)化。美國哈佛醫(yī)學(xué)院的Sorger 研究組[33]使用多種抗體固定和標(biāo)記COLO858 黑色素瘤細(xì)胞,通過標(biāo)記-淬滅-再標(biāo)記的循環(huán)免疫熒光法構(gòu)建了15 通道連續(xù)熒光成像,在同一組織中實現(xiàn)了多種蛋白標(biāo)志物的檢測(圖4)。

然而,該方法存在熒光團(tuán)失活、信號不足、染色不均勻以及細(xì)胞易丟失等問題。在CycIF 的基礎(chǔ)上, Sorger 研究組[34]進(jìn)一步發(fā)展了組織循環(huán)免疫熒光法(Tissue-based cyclic immunofluorescence, t-CycIF),對固定在載玻片上的FFPE 標(biāo)本進(jìn)行多重免疫熒光成像。t-CycIF 可對不同正常組織和腫瘤組織中的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)級聯(lián)、腫瘤抗原和免疫標(biāo)記物進(jìn)行定量分析。與CycIF 不同的是, t-CycIF 解決了CycIF 無法在同一切片上檢測蛋白標(biāo)志物的難題,可標(biāo)記來自人體的正常和腫瘤組織樣本中的60 余種蛋白質(zhì)。與其它IHC 方法相比, CycIF 使用易標(biāo)準(zhǔn)化的檢測試劑和儀器,價格低廉,檢測成本低于傳統(tǒng)的免疫熒光法,因此更適用于高通量分析和篩選。但是, t-CycIF 存在檢測細(xì)胞易丟失、循環(huán)通道少和分析周期長等問題[23,35]。

2.4 多重免疫熒光技術(shù)

在單個組織標(biāo)本中僅通過顯微鏡表征蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和DNA 分子的數(shù)量限制了對健康和疾病生物學(xué)基礎(chǔ)的理解。Gerdes 等[36]建立了多重免疫熒光法(Multiplexed immunofluorescence, MxIF),可在FFPE 中對多種分析物進(jìn)行定量分析,并對單細(xì)胞或亞細(xì)胞中的蛋白標(biāo)志物進(jìn)行表征。該方法首先在熒光染料結(jié)合抗體標(biāo)記組織前采集組織背景熒光,待染料淬滅后,使用新的抗體重新標(biāo)記組織獲取新的熒光成像圖,重復(fù)多次后可以實現(xiàn)對細(xì)胞和亞細(xì)胞多靶點的定量分析。利用此方法對747 例結(jié)直腸癌患者的61 種蛋白標(biāo)識物的原位成像及共定位進(jìn)行分析,深度揭示了腫瘤的異質(zhì)性。MxIF 的技術(shù)特點是開發(fā)了滅活熒光溶液,可在15 min 內(nèi)有效消除菁基染料熒光。實驗結(jié)果表明,經(jīng)滅活熒光溶液處理5 min 后, Cy3 和Cy5 的熒光強度分別降低了60%和80%;處理15 min 后,熒光信號強度降低到初始強度的2%以下。MxIF 的實驗結(jié)果表明,可檢測分析物的數(shù)量不止60 種,并未達(dá)到該方法的檢測上限。總體而言,該技術(shù)克服了目前熒光顯微成像技術(shù)的一些局限性,解決了標(biāo)準(zhǔn)免疫熒光方法中隨著分析物數(shù)量的增加對細(xì)胞的定量檢測、共定位等分子特征難以進(jìn)行分析的難題,此外,該方法還可應(yīng)用于腫瘤以外的組織或細(xì)胞成像研究[24,37-38]。但是, MxIF 采用H2O2 洗脫以清除熒光信號的方法,存在耗時長且抗原表位易損傷的風(fēng)險,仍然有很大的改進(jìn)空間。

2.5 酪胺信號放大技術(shù)

酪胺信號放大技術(shù)(Tyramide signal amplification, TSA)是一類利用辣根過氧化物酶(Horseradishperoxidase, HRP)對靶蛋白或核酸進(jìn)行高密度原位標(biāo)記的檢測方法。TSA 方法的原理是利用酪胺鹽在HRP 催化和H2O2 作用下形成共價鍵結(jié)合位點,產(chǎn)生大量的酶促產(chǎn)物[39-40]。該產(chǎn)物可與周圍的蛋白殘基(包括色氨酸、組氨酸和酪氨酸殘基)結(jié)合,從而在抗原-抗體結(jié)合部位產(chǎn)生大量的生物素沉積,再與隨后加入的鏈霉親和素-HRP/熒光基團(tuán)結(jié)合,經(jīng)多次循環(huán)放大,可以結(jié)合大量的酶分子或熒光基團(tuán)[41-42],使其檢測信號得到幾何級放大(圖5)[25]。Pienta 研究組[41]利用TSA 對轉(zhuǎn)移結(jié)腸癌患者腫瘤微環(huán)境中的細(xì)胞進(jìn)行鑒別,系統(tǒng)分析了細(xì)胞表型和免疫細(xì)胞的浸潤性,深入了解疾病成因,為臨床決策提供了參考。

TSA 中每個反應(yīng)體系僅有單一抗體,因此不存在抗體交叉以及一抗、二抗種屬的匹配問題,克服了實驗設(shè)計時不同種屬抗體選擇的限制[43]。此外, TSA 將流式細(xì)胞術(shù)與IHC 獲得的信息相結(jié)合,通過在一個組織切片上進(jìn)行高通量、高分辨率識別和準(zhǔn)確的圖像分析,能夠揭示各種細(xì)胞類型之間的關(guān)系,這使得TSA 在腫瘤免疫治療領(lǐng)域、探索腫瘤細(xì)胞與其微環(huán)境之間的相互作用和設(shè)計組合治療方法等方面具有良好的應(yīng)用潛力。同時, TSA 技術(shù)具有極強的敏感度,可檢測極微量的目的抗原,并且能極大地降低抗體的用量。但是,該方法最多只能同時分析7 種抗體,分析單個樣本需要15~20 h, 僅染色標(biāo)記就需要6~8 h,并且無法避免非特異性信號的干擾[25,44]。

2.6 交換反應(yīng)信號放大技術(shù)

熒光原位雜交技術(shù)(Fluorescence in situ hybridization, FISH)是將熒光基團(tuán)連接到探針上,利用熒光標(biāo)記的特定核酸序列與細(xì)胞內(nèi)相應(yīng)的靶DNA 或RNA 分子雜交,通過在熒光顯微鏡下觀察熒光信號來確定與探針雜交后被染色的細(xì)胞或細(xì)胞器的形態(tài)和分布,或觀察結(jié)合了熒光探針的DNA 或RNA 分子在染色體及其它細(xì)胞器中定位的方法。在FISH 的基礎(chǔ)上,為了解決高效采樣和連續(xù)檢測的問題,研究者開發(fā)了一種新的方法即交換反應(yīng)信號放大法(Signal amplification by exchange reaction, SABER)(圖6)[45]。

SABER 技術(shù)通過DNA 條形碼標(biāo)記的抗體和引物交換反應(yīng)產(chǎn)生的正交DNA 結(jié)合物實現(xiàn)高度多重信號放大,可以同時分析十幾種靶標(biāo)物質(zhì)。SABER 法的基本原理是DNA 的兩條核酸鏈之間可以通過堿基互補配對形成DNA 雙鏈,通過設(shè)計合適的輔助探針即可使整條鏈不斷地自組裝雜交連接形成長鏈的DNA 串聯(lián)體,此DNA 串聯(lián)體可作為信號放大的載體。與傳統(tǒng)的FISH 技術(shù)相比, SABER 的信號放大是獨立可編碼的,無需原位酶參與反應(yīng),通過與多個帶有熒光團(tuán)的核酸結(jié)合以實現(xiàn)信號放大。該方法在組織檢測中具有獨立調(diào)節(jié)、高效靶向的優(yōu)點。哈佛大學(xué)的Kishi 等[46]使用該方法在固定的腫瘤細(xì)胞和腫瘤組織中將RNA 和DNA 的FISH 信號放大5~450 倍,將SABER 與膨脹顯微鏡相結(jié)合,實現(xiàn)了快速、多通道和高分辨率組織成像,為蛋白質(zhì)的擴(kuò)增成像提供了一個高效的平臺。該技術(shù)是通過12~16 種靶向標(biāo)記物實現(xiàn)檢測信號放大的引物交換反應(yīng),并且過程高度可控。然而,該方法需要大量核酸標(biāo)記的抗體,操作復(fù)雜、耗時長且檢測費用較高[26]。

2.7 數(shù)字空間分析技術(shù)

數(shù)字空間分析技術(shù)(Digital spatial profiling, DSP)是一種對FFPE 樣品中蛋白質(zhì)或RNA 多重空間分析的方法[27]。DSP 是將現(xiàn)代基因組檢測技術(shù)、光化學(xué)和微流體采樣相結(jié)合,將經(jīng)典的IHC 和原位雜交技術(shù)結(jié)合發(fā)展而成的可進(jìn)行基因組和蛋白質(zhì)組多重解析分析的集成系統(tǒng)[47]。Beechem 研究組[47]使用該方法分析了淋巴組織、免疫組織、結(jié)腸和直腸腫瘤中多達(dá)44 種蛋白質(zhì)和96 個基因的空間分布。DSP平臺的工作原理如圖7 所示,寡核苷酸鏈通過對紫外光敏感且可光裂解的連接基團(tuán)與抗體或RNA 雜交探針偶聯(lián)。將抗體或探針與石蠟包埋的組織共同孵育,使之與蛋白質(zhì)或RNA 充分結(jié)合后,使用可編程數(shù)字微鏡設(shè)備引導(dǎo)紫外光精確照射所檢測的區(qū)域(Region of interest, ROI),將寡核苷酸標(biāo)簽與抗體解偶聯(lián),樣本可再次使用。最后采用nCounter 儀器對寡核苷酸條形碼進(jìn)行計數(shù)和數(shù)字定量,形成組織形態(tài)的數(shù)字化圖像。該研究組已對約1400 個基因和5000 個探針進(jìn)行了復(fù)雜的數(shù)字信號處理和基因圖譜測試,并且檢測數(shù)量上還有提升空間。DSP 平臺和nCounter 平臺結(jié)合,可同時對40 多種蛋白質(zhì)和5000 種RNA 進(jìn)行分析。該方法對組織樣本的傷害極小,臨床樣本經(jīng)DSP 分析后不僅可再次用于其它分析,還可長期保存,以便后續(xù)的溯源或用于后續(xù)研究分析。該方法也可基于熒光標(biāo)記自動對組織中的稀有細(xì)胞類型、任意形狀或尺寸的區(qū)域進(jìn)行分析,甚至可對單個細(xì)胞的蛋白質(zhì)表達(dá)水平進(jìn)行定量分析,為臨床患者的診斷和預(yù)后提供依據(jù)。2020 年, Farren 等[48]將nCounter 與DSP 技術(shù)聯(lián)用,以胰腺癌FFPE 樣本為研究對象,針對4 種臨床治療策略選取了24 例樣本,首先利用nCounter 表達(dá)譜技術(shù)探尋不同治療方法之間基因表達(dá)的差異,再通過生物信息學(xué)技術(shù)對基因組、蛋白質(zhì)種類、分子復(fù)合物以及EnrichR 分析啟動子進(jìn)行分析,并采用DSP 技術(shù)分析了胰腺癌微環(huán)境中各種免疫相關(guān)蛋白標(biāo)記物的數(shù)量和空間分布在不同治療方法中的變化。DSP 技術(shù)將表達(dá)譜的多重定量信息與組織原位信息整合,可在1 張石蠟組織切片上實現(xiàn)多達(dá)上百種蛋白和上千種mRNA 的原位共分析,將組織病理學(xué)、腫瘤免疫與表達(dá)譜完美結(jié)合,在腫瘤微環(huán)境研究、腫瘤異質(zhì)性與腫瘤免疫研究中有顯著優(yōu)勢。然而, DSP 只能獲取目標(biāo)區(qū)域的多重信息,缺少圖像信息,對細(xì)胞的空間分布只能提供有限的信息,并且DSP 單次分析區(qū)域較小、光照效率低以及耗時較長的缺點限制了其應(yīng)用范圍。

DSP 與SABER 這兩種方法是利用核酸堿基相互組合產(chǎn)生的數(shù)以萬計的編碼區(qū)分不同抗體及其對應(yīng)的蛋白。DSP 和SABER 可一步標(biāo)記需要觀測的所有抗體,并對各個抗體逐一進(jìn)行核酸解碼識別。此外,還可采用循環(huán)熒光成像的方式,通過核酸互補競爭結(jié)合或核酶降解的方式移除帶有熒光信號的編碼核酸,實現(xiàn)重復(fù)免疫熒光染色。這兩種核酸編碼的方法較前面幾種信號移除方法更溫和有效,但成本和消耗時間方面并不具有優(yōu)勢。

2.8 質(zhì)譜流式細(xì)胞成像技術(shù)

質(zhì)譜流式細(xì)胞成像技術(shù)(Imaging mass cytometry, IMC)是一種已商業(yè)化的成像技術(shù),其中代表性工作之一是Nolan 研究組[49]關(guān)于質(zhì)譜細(xì)胞儀(Mass cytometry, CyTOF)的研究。CyTOF 通過重金屬同位素標(biāo)記抗體或探針,并利用質(zhì)譜細(xì)胞儀對標(biāo)記樣品進(jìn)行檢測,得到了詳細(xì)的細(xì)胞表面或內(nèi)部的信號數(shù)據(jù)。該技術(shù)對單細(xì)胞表型和功能性蛋白的研究具有重要意義。CyTOF 技術(shù)繼承了傳統(tǒng)流式細(xì)胞技術(shù)的高速分析能力,同時還具備質(zhì)譜檢測的高分辨率特性,已成為流式細(xì)胞技術(shù)領(lǐng)域的一個全新發(fā)展方向。與傳統(tǒng)的流式細(xì)胞技術(shù)相比,該方法具有上百個相對獨立的分析通道,可準(zhǔn)確鑒別不同原子質(zhì)量的金屬同位素,并具備多樣化的數(shù)據(jù)處理方式,可對樣品進(jìn)行深入分析[28]。

在CyTOF 研究基礎(chǔ)上, Nolan 研究組[50]進(jìn)一步發(fā)展了多重離子束成像技術(shù)(Multiplexed ion beamimaging, MIBI)。該技術(shù)首先使用40~100 種不同金屬標(biāo)記的抗體對腫瘤組織切片染色,金屬標(biāo)記物被高能量束電離成次級離子,次級離子被送入質(zhì)譜成像儀進(jìn)行檢測。以MIBItracker 軟件作為組織樣本成像的分析工具,實現(xiàn)了腫瘤切片中多種標(biāo)志物的可視化共定位分析,彌補了CyTOF 技術(shù)在分析細(xì)胞表型與空間位置關(guān)系中應(yīng)用的局限。其中, CyTOF 和MIBI 都已有商業(yè)化儀器,可同時分析100 種腫瘤標(biāo)志物,并具有較高的靈敏度。但是,該方法需要制備用于質(zhì)譜檢測的標(biāo)記抗體,在檢測過程中需要額外使用流式細(xì)胞儀,并且只能進(jìn)行小區(qū)域的樣本分析,因此不能很好地對整個切片做出客觀評價。此外,該方法對檢測樣本中的細(xì)胞邊界界定不清晰,成像圖中單個像素可能包含不止1 個細(xì)胞的信號。隨著免疫診斷腫瘤標(biāo)志物的不斷發(fā)現(xiàn),該方法的診斷時間逐漸延長,因此這類技術(shù)不適合在臨床上大規(guī)模應(yīng)用。

3 總結(jié)與展望

在腫瘤免疫治療的時代,雖然傳統(tǒng)的IHC/IF 仍是檢測腫瘤標(biāo)志物的主要手段,但受到組織樣本有限、染色過程冗長費力、數(shù)據(jù)采集及分析系統(tǒng)落后等因素的限制。隨著對腫瘤發(fā)病機(jī)理的認(rèn)識逐漸深刻,迫切需要實施腫瘤精準(zhǔn)醫(yī)療。mIHC 成像技術(shù)不僅可實現(xiàn)特定的多種蛋白標(biāo)志物的檢測,得到細(xì)胞組成和空間排列的全面信息,還可反映腫瘤微環(huán)境中的免疫狀態(tài),在臨床檢測和轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)領(lǐng)域具有強大的應(yīng)用潛力。未來,還需要對mIHC 成像技術(shù)進(jìn)行更多的探索,以及嚴(yán)格的大規(guī)模驗證研究。

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