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卡斯帕酶-3抑制劑的高通量篩選及活性化合物F03ZA-575的初步研究

2010-12-01 04:46李韶菁任曉董悅生張華鄭智慧路新華段海清
中國醫(yī)藥生物技術(shù) 2010年5期
關(guān)鍵詞:工作液底物抑制劑

李韶菁,任曉,董悅生,張華,鄭智慧,路新華,段海清

卡斯帕酶-3(Caspase-3)作為最重要的成員和關(guān)鍵的執(zhí)行分子,在凋亡信號傳導(dǎo)的許多途徑中發(fā)揮著重要的功能。許多常見病與多發(fā)?。ú《拘愿腥纠绺忻?、關(guān)節(jié)炎等)、心腦血管疾病(例如腦卒中、心肌梗死等)、腫瘤、腦神經(jīng)退行性疾病(例如早老性癡呆癥、帕金森病等)的發(fā)生,都與卡斯帕酶-3的異常活動有關(guān),因此,Caspase-3 被認(rèn)為是一個很有前景的藥物治療靶位點。高效、高選擇性的抑制劑將可能為治療上述與Caspase-3相關(guān)的疾病提供新的途徑[1-3]。

目前國外一些大公司已競相開展了此類藥物的研發(fā)工作,其中,美國 Aventis公司和Vertex公司共同開發(fā)的治療風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎和膿血癥的卡斯帕酶的抑制劑 VX740(Pralnacasan)和VX799 已完成 II 期臨床研究;美國 Idun 制藥公司開發(fā)的卡斯帕酶的抑制劑(代號:IDN6556和IDN6734)主要用于治療急性心肌梗死,急性酒精中毒引起的肝衰竭;美國 Idun公司正在開發(fā)中的另一類卡斯帕酶的抑制劑 IDN5370 可預(yù)防缺血性腦卒中引起的腦神經(jīng)元的大量死亡及由此引起的偏癱和失語等后遺癥[1]。我們以 Caspase-3 為靶點,建立了一個 Caspase-3 抑制劑的高通量篩選模型,應(yīng)用此模型對微生物來源的共計 10026個次級代謝產(chǎn)物提取物進(jìn)行了篩選,其中一株真菌產(chǎn)生的化合物 F03ZA-575 對來源于人的Caspase-3 酶具有明顯的抑制活性,本文報道了該化合物的有關(guān)研究結(jié)果。

1 材料和方法

1.1 主要材料

1.1.1 試劑 人源 Caspase-3 酶儲液由華北制藥集團(tuán)新藥研究開發(fā)中心利用基因工程技術(shù)在大腸桿菌 E.Coli 中表達(dá)并分離得到,–20 ℃ 凍存?zhèn)溆?;底?Ac-DEVD-AMC 購自美國 Sigma公司;其余化學(xué)試劑均為分析純或色譜純試劑。

1.1.2 主要儀器 Victor21420 多功能測定儀為美國 PE公司產(chǎn)品;低溫離心濃縮儀為德國 Christ公司產(chǎn)品;中壓層析分離制備系統(tǒng)為瑞士 BUCHI公司產(chǎn)品;HPLC 高壓液相分析和半制備系統(tǒng)為美國 Waters公司產(chǎn)品;500 MHz 核磁共振為美國Inova公司產(chǎn)品。

1.1.3 實驗菌種與提取物 放線菌株及真菌菌株由華北制藥集團(tuán)新藥研究開發(fā)有限責(zé)任公司天然藥物室微生物菌種庫提供;篩選用放線菌及真菌發(fā)酵代謝產(chǎn)物樣品由微生物代謝產(chǎn)物庫提供。

1.2 方法

1.2.1 Caspase-3 酶活力測定方法的建立和優(yōu)化

1.2.1.2 Caspase-3 酶測活溶液的配制 Caspase-3酶測活緩沖液含 20 mmol/L HEPES(4-羥乙基哌嗪乙磺酸),0.1% CHAPS[3-3-(膽酰氨丙基)二甲氨基丙磺酸內(nèi)鹽],100 mmol/L NaCl,10 mmol/L DTT(二硫蘇糖醇),10% 蔗糖,1 mmol/L EDTA,pH 7.5。熒光底物 Ac-DEVD-AMC 儲液:稱取 2.5 mg Ac-DEVD-AMC 粉末,加 0.74ml DMSO 溶解,配制成 10 mmol/L的儲液。Ac-DEVD-AMC 工作液:準(zhǔn)確吸取所需量的Ac-DEVD-AMC 儲液,加測活緩沖液稀釋成濃度為1 μmol/L的工作溶液(用前臨時配制)。

1.2.1.3 Caspase-3 酶活力測定方法的建立和優(yōu)化 在96 孔板上分別固定一種底物的濃度,研究底物或 Caspase-3 濃度的變化與酶活性的關(guān)系。在最佳底物濃度條件下,觀察不同的反應(yīng)溫度與酶活性的關(guān)系,在此基礎(chǔ)上確定酶的加入量與酶反應(yīng)曲線的線性范圍。

1.2.2 微生物來源的Caspase-3 酶抑制的篩選 在96 孔板的樣品測定孔中,分別加入 2 μl的待測樣品、55 μl 酶工作液,對照孔和空白孔分別以 2 μl DMSO和55 μl 測活緩沖液代替酶液,其余與樣品孔相同。37 ℃ 保溫 15 min,各孔中加入濃度為1 μmol/L的底物工作液 45 μl。離心 2 min 并振搖混勻,測定各孔在以 355 nm 為激發(fā)波長,以460 nm 為發(fā)射波長下的熒光強度值(F1),37 ℃ 保溫 120 min 后,再測定各孔在同樣條件下的熒光強度值(F2)。

樣品對 Caspase-3 酶抑制率的計算公式為:

選取抑制率大于80%的樣品為陽性樣品。

1.2.3 陽性真菌 F03ZA-575 產(chǎn)生的對 Caspase-3酶具有抑制作用的活性物質(zhì)的分離

1.2.3.1 陽性菌株 F03ZA-575的來源 陽性菌株 F03ZA-575 為真菌,來源于華北制藥集團(tuán)新藥研究開發(fā)中心(微生物藥物國家工程研究中心)微生物菌種庫,采自我國云南省。

1.2.3.2 菌株 F03ZA-575的培養(yǎng) 將菌株F03ZA575 斜面接種于含種子培養(yǎng)基(含 2.0% 淀粉;0.2% 豆餅粉;0.6% 麥芽粉;0.3% 酵母粉;NaCl 0.2%;FeSO4·7H2O 0.1%;0.2% CaCO3,pH 7.0)的500ml 三角瓶中,27 ℃ 培養(yǎng) 3 d,按 10%的接種量接種于固體發(fā)酵培養(yǎng)基(大米 97.5%,黃豆餅粉 2.5%),27 ℃ 靜止培養(yǎng) 8 d。

1.2.3.3 菌株 F03ZA-575 發(fā)酵液的提取分離 F03ZA-575 固體發(fā)酵培養(yǎng)物 2000 g,加入4000ml的乙酸乙酯,萃取得到褐色 F03ZA-575粗提物 4.2 g,粗提物活性測定結(jié)果為IC50=18.7μg/ml。

1.2.3.4 活性組分的硅膠柱層析精制 取 4 g 粗提物,加少量甲醇溶解,使用硅膠柱(Φ3.6cm×40 cm)氯仿-甲醇梯度洗脫,收集洗脫液,40ml/管,共收集 120 管。合并目標(biāo)活性組分,濃縮抽干后得黃色固體 1.1 g。

1.2.3.5 活性組分的LH-20 柱分離純化 活性粗品用甲醇溶解后進(jìn)行 LH-20 柱分離純化,收集洗脫液,20ml/管收集洗脫液共收集 50 管。檢測各管的活性同時對照 HPLC 分析結(jié)果(色譜柱:Kromasil 10 μm,Φ250 mm×4.6 mm),合并目標(biāo)活性組分,濃縮抽干后得淺黃色固體 78 mg。

1.2.3.6 活性組分的結(jié)晶精制 取上述淺黃色固體 40 mg,溶于氯仿,然后向氯仿溶液中緩慢滴加甲醇使白色沉淀緩緩析出。離心,過濾并減壓蒸干,得到活性組分 F03ZA-575(白色固體)21 mg。

2 結(jié)果

2.1 Caspase-3 酶活力的影響因素

2.1.1 反應(yīng)體系中底物 Ac-DEVD-AMC 對酶活力的影響 保持反應(yīng)體系中其他組分濃度不變,改

圖1 底物濃度對卡斯帕酶-3 活性的影響Figure1 The effect of substrate concentration on Caspase-3 activity

變底物 Ac-DEVD-AMC的工作液濃度,觀察其對酶促反應(yīng)體系的影響,見圖 1。實驗結(jié)果表明,Caspase-3 酶的活力隨底物濃度的增加而增加,當(dāng)工作液的濃度在0.6 μmol/L 以上時,酶活力達(dá)到最大。因此,選擇底物工作液的濃度為1 μmol/L 已能滿足活性測定要求。

2.1.2 反應(yīng)體系溫度對酶活力的影響 在反應(yīng)體系中保持上述選定的各組分的濃度不變,觀察反應(yīng)體系溫度對酶促反應(yīng)體系的影響,見圖 2。結(jié)果表明,用該方法測定 Caspase-3 酶的活力,37 ℃ 時達(dá)到最大值,因此選擇 37 ℃ 為測活溫度。

圖2 反應(yīng)溫度對卡斯帕酶-3活性的影響Figure2 The effect of reaction temperature on Caspase-3 activity

2.1.3 Caspase-3 酶反應(yīng)曲線 在上述最佳底物濃度和最佳反應(yīng)溫度條件下,通過改變 Caspase-3酶的加入量測得的Caspase-3 酶活曲線見圖 3。由圖 3 可見,Caspase-3 酶液的加入量在0~2 μl 范圍內(nèi)呈現(xiàn)出較好的線性關(guān)系,相關(guān)系數(shù) r=0.9946,據(jù)此選定反應(yīng)體系中 Caspase-3 酶的加入量為2 μl。

圖3 酶活性曲線Figure3 The enzyme activity curve

2.2 已知 Caspase-3 酶抑制劑陽性化合物對酶促反應(yīng)體系的驗證

用已知 Caspase-3 抑制劑陽性化合物 ACDEVD-CHO[6]對酶促反應(yīng)體系進(jìn)行了驗證,結(jié)果顯示其對篩選體系可以產(chǎn)生劑量依賴的抑制關(guān)系,確定了該篩選模型的可行性。

2.3 微生物來源的Caspase-3 酶抑制劑的篩選結(jié)果

利用上述 Caspase-3 酶抑制劑高通量篩選方法,對來源于放線菌、真菌的共 10026個發(fā)酵液提取物樣品進(jìn)行了篩選,初篩得到陽性樣品 47個(陽性率 0.6%),復(fù)篩得到陽性樣品 10個(陽性率 0.1%)。

2.4 化合物 F03ZA-575的結(jié)構(gòu)解析

化合物 F03ZA-575的1H-NMR和13C-NMR的測定數(shù)據(jù)及與Duclauxin 文獻(xiàn)報道數(shù)據(jù)的比較見表1,化學(xué)結(jié)構(gòu)見圖 4。

表1 F03ZA-575和Duclauxin的核磁共振(CDCl3)數(shù)據(jù)Table1 NMR data (CDCl3) of F03ZA-575 and Duclauxin

圖4 F03ZA-575的化學(xué)結(jié)構(gòu)Figure4 The chemical structure of F03ZA-575

2.5 化合物 F03ZA-575 對 Caspase-3 酶抑制活性的測定結(jié)果

化合物 F03ZA-575 對 Caspase-3 酶抑制活性的測定結(jié)果見圖 5,從該圖可以看出,化合物F03ZA-575 對 Caspase-3 酶呈現(xiàn)出劑量依賴的抑制作用,其 IC50值為12.5μg/ml。

3 討論

圖5 F03ZA-575 對 Caspase-3 酶的抑制活性曲線Figure5 The inhibitory activity curve of F03ZA-575 to Caspase-3

Caspase-3 作為Caspases 家族中最重要的成員之一,是哺乳動物細(xì)胞凋亡的關(guān)鍵蛋白酶。近年來研究發(fā)現(xiàn),Caspase-3 除與心腦血管疾病、腫瘤的發(fā)生有一定的關(guān)系外,在神經(jīng)退行性疾病的病理過程中也起著很重要的作用。Caspase-3 在這些疾病的病理過程中,不僅僅是起著凋亡的效應(yīng)器作用,還能直接與老年性癡呆癥、帕金森癥、亨廷頓舞蹈病、脊椎小腦失調(diào)等疾病的致病蛋白質(zhì)分子相互作用,參與這些疾病的致病機制[9-11]。因此,Caspase-3 也是治療神經(jīng)退行性疾病的一個新的重要的靶位點,尋找 Caspase-3 高效、高選擇性的抑制劑將為治療神經(jīng)退行性疾病提供新的途徑[2]。

利用 E.coli 表達(dá)的人 Caspase-3 酶,建立了一種基于96-孔板的Caspase-3 酶抑制劑的高通量篩選模型,通過反應(yīng)前后熒光強度的變化檢測樣品對 Caspase-3 酶的抑制活性。該方法具有快速準(zhǔn)確、靈敏度高的特點,特別適合于大量樣品的篩選。利用該篩選模型,通過對 10026個微生物發(fā)酵提取物中的篩選,從一株真菌產(chǎn)生的發(fā)酵產(chǎn)物中分離得到了一個對 Caspase-3 酶有較強抑制活性的化合物,結(jié)構(gòu)解析確認(rèn)該化合物與Duclauxin的結(jié)構(gòu)相同。Duclauxin 最早是由 Shibata等[7-8,12]報道的具有抗癌活性的化合物,但對該化合物的抗癌機制未見有很詳細(xì)和深入的報道,本文首次報道了 Duclauxin 對來源于人的Caspase-3 酶的抑制活性,將對 Duclauxin 在抗腫瘤作用機制和與Caspase-3 酶有關(guān)的其他疾病治療方面的深入研究,提供有用的信息。

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