陳茂功, 韓志群, 林小虎, 王曉鳴*, 周印富*, 李洪杰
(1.河北科技師范學(xué)院生命科技學(xué)院,秦皇島 066004;2.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所/農(nóng)作物基因資源與基因改良國(guó)家重大科學(xué)工程,北京 100081)
在中國(guó),玉米彎孢葉斑病是由新月彎孢[Curvularia lunata(Wakker)Boedijn]引起的一種葉部病害,目前幾乎在各玉米種植地區(qū)都有發(fā)生,一度成為北方地區(qū)主要葉部病害之一,并在遼寧西部地區(qū)引起嚴(yán)重的生產(chǎn)損失[1]。目前對(duì)病菌的研究主要集中在致病性分化、變異與致病機(jī)制等方面[2],但對(duì)其在玉米葉片上的侵染及發(fā)育過(guò)程尚不十分清楚。
農(nóng)桿菌介導(dǎo)的遺傳轉(zhuǎn)化(Agrobacteriumtume faciens-mediated transformation,ATMT)是近年來(lái)被廣泛應(yīng)用的一種真菌轉(zhuǎn)化技術(shù),其免除了聚二乙醇(polyethylene glycol,PEG)介導(dǎo)和限制性內(nèi)切酶介導(dǎo)整合(restriction enzyme-mediated integration,REMI)等轉(zhuǎn)化方法中原生質(zhì)體制備的復(fù)雜過(guò)程,具有轉(zhuǎn)化效率高、易獲得穩(wěn)定轉(zhuǎn)化子和T-DNA在真菌基因組中以單拷貝插入為主等優(yōu)點(diǎn)[3]。自1998年de Groot等首次將ATMT法應(yīng)用于絲狀真菌的遺傳轉(zhuǎn)化以來(lái),已有大量的絲狀真菌通過(guò)ATMT法成功實(shí)現(xiàn)了遺傳轉(zhuǎn)化[4]。目前,ATMT技術(shù)也被用于彎孢菌的遺傳轉(zhuǎn)化、基因定點(diǎn)突變和功能研究[5]。紅色熒光蛋白(DsRed)來(lái)源于??w內(nèi)的非常穩(wěn)定的生物發(fā)光蛋白。DsRed和綠色熒光蛋白(GFP)具有相似的產(chǎn)生熒光機(jī)理,但DsRed的熒光信號(hào)能夠在組織中更加充分地轉(zhuǎn)換,其波長(zhǎng)比GFP的長(zhǎng)并具較高的噪音比,更易觀察。DsRed作為新一代報(bào)告基因,已經(jīng)被用于果蠅、細(xì)菌、真菌、黏菌的標(biāo)記研究[6-15]。在我國(guó),DsRed 基因也被用于魚(yú)、酵母、病毒以及植物致病真菌等的研究中[16-20]。
本研究以hygB抗性基因?yàn)楹Y選標(biāo)記,采用ATMT法將DsRed熒光蛋白基因整合入新月彎孢基因組中,實(shí)現(xiàn)新月彎孢的DsRed標(biāo)記,并對(duì)TDNA插入突變體的主要表型特征進(jìn)行鑒定,檢測(cè)基因的插入位點(diǎn),為進(jìn)一步的新月彎孢研究進(jìn)行技術(shù)準(zhǔn)備。
分離自玉米的新月彎孢(C.lunata)由中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所保存;攜帶DsRed基因的質(zhì)粒pCAMDsRed由 Marina Franceschetti(John Inner Center,UK)惠贈(zèng)。DsRed基因受構(gòu)巢曲霉3-磷酸甘油醛脫氫酶基因gpdA的啟動(dòng)子PgpdA調(diào)控,以潮霉素B抗性基因hyg作為選擇標(biāo)記基因[21];高感彎孢葉斑病的玉米自交系‘黃早四’用于病菌致病力檢測(cè)。
通過(guò)對(duì)含潮霉素B濃度為0、30、50、75、100μg/mL和150μg/mL的PDA平板上新月彎孢生長(zhǎng)狀況的檢測(cè),確定野生型C.lunata對(duì)潮霉素B的耐受濃度為50μg/mL。
參照Mullins等的方法[22],進(jìn)行農(nóng)桿菌介導(dǎo)下DsRed基因?qū)隒.lunata的操作。獲得轉(zhuǎn)化子菌落后,挑取陽(yáng)性轉(zhuǎn)化子至含抗生素(頭孢霉素200μg/mL和潮霉素B 50μg/mL)的PDA平板上,待菌株長(zhǎng)滿全皿且產(chǎn)孢后,用無(wú)菌水洗下孢子,并稀釋至1.0×102個(gè)/mL,取100μL孢子懸浮液均勻涂布到含潮霉素B 50μg/mL的PDA平板上,25℃培養(yǎng)2d后挑取單菌落,獲得單孢純化菌株。
在熒光顯微鏡(Olympus BX41,日本)下觀察轉(zhuǎn)化子的紅色熒光表達(dá)。檢測(cè)DsRed基因和hyg基因整合結(jié)果時(shí),采用CTAB法提取菌株DNA,以DsRed 基因引物(DsRed-F:5′-ACTCCTCCGAGGACGTCATCAA-3′;DsRed-R:5′-ACGTAGTGTAGTAGCCGGGCAGCT-3′)和潮霉素B抗性hyg基 因 引 物 (Hyg-8F:5′-GCAGACAGGAACGAGGACAT-3′; Hyg-8R: 5′-GCTCCATACAAGCCAACCAC-3′)進(jìn)行擴(kuò)增,產(chǎn)物以0.8%瓊脂糖凝膠電泳鑒定。潮霉素B抗性基因的Southern blotting分析根據(jù)試劑盒操作說(shuō)明進(jìn)行。
將轉(zhuǎn)化子和野生型菌株用直徑4mm的打孔器打菌餅接于PDA平板上,25℃恒溫黑暗培養(yǎng)5d,測(cè)定菌絲生長(zhǎng)速率;產(chǎn)孢量測(cè)定參照賀春萍等人的方法[23]。將轉(zhuǎn)化子及野生型菌株接種液體培養(yǎng)基(參照 Marcus等配制[24])中,25℃恒溫培養(yǎng)15d,每天120r/min振蕩1h。將培養(yǎng)液經(jīng)雙層紗布過(guò)濾,過(guò)濾液轉(zhuǎn)入離心管,在4℃,10 000r/min高速離心,上清液即為酶提取液。纖維素酶系中的內(nèi)切β-1,4-葡聚糖酶(Cx酶)活性測(cè)定參照 Lee等方法[25];果膠酶中的聚甲基半乳糖醛酸酶(polymethylgalacturonase,PMG)活性測(cè)定參照 Murata等方法[26];粗毒素的提取參照唐樹(shù)戈等方法[27],毒素生物測(cè)定所用離體葉片針刺法參照康紹蘭等[28],毒素致病性分析設(shè)3次重復(fù),測(cè)定獨(dú)立進(jìn)行2次。
在自交系‘黃早四’4葉期時(shí),采用毛筆涂抹法接種葉片,轉(zhuǎn)化子接種懸浮液中分生孢子濃度為1.0×106個(gè)/mL,接種后黑暗保濕36h,然后放置溫室(25℃)中正常管理。分別以無(wú)病菌接種液和野生型孢子接種液為陰性對(duì)照和陽(yáng)性對(duì)照。接種5d后觀察葉片發(fā)病率并計(jì)算病情指數(shù),方法參照李金堂等[29]。玉米植株、營(yíng)養(yǎng)土及所用儀器用完后進(jìn)行滅菌處理。
將Cl-DsRed 4轉(zhuǎn)化子轉(zhuǎn)接至含有50μg/mL潮霉素B的PDA平板,25℃培養(yǎng)7d,用無(wú)菌水洗下孢子鏡檢并將菌液稀釋至1.0×106個(gè)/mL,取400μL置于凹形載玻片的凹槽中,25℃黑暗保濕培養(yǎng)12h后在熒光顯微鏡下觀察孢子萌發(fā)的形態(tài);將該孢子懸浮液接種‘黃早四’的葉片,黑暗保濕36h后放置溫室正常管理,4d后取葉片病斑處觀察菌絲侵染情況。
突變體T-DNA插入位點(diǎn)側(cè)翼序列的擴(kuò)增采用TAIL-PCR,參照 Liu等[30]和徐榮旗等[31]的方法進(jìn)行。膠回收PCR擴(kuò)增產(chǎn)物,連接到pGM-T載體中轉(zhuǎn)入大腸桿菌感受態(tài),篩選陽(yáng)性克隆子進(jìn)行測(cè)序。引物合成(表1)和測(cè)序工作由上海生工生物工程有限公司完成。
表1 hiTAIL-PCR擴(kuò)增T-DNA插入位點(diǎn)側(cè)翼序列引物列表1)
采用農(nóng)桿菌介導(dǎo)法將DsRed基因整合至新月彎孢基因組中,獲得紅色熒光蛋白基因標(biāo)記的菌株Cl-DsRed 1、Cl-DsRed 2、Cl-DsRed 3和 Cl-DsRed 4。利用DsRed和hyg基因特異性引物從4個(gè)轉(zhuǎn)化子基因組DNA中均擴(kuò)增獲得579bp和800bp目的片段,質(zhì)粒pCAMDsRed中也能擴(kuò)增出相同片段,而野生型菌株中無(wú)擴(kuò)增(圖1a,b),表明DsRed基因已轉(zhuǎn)入新月彎孢基因組中。Southern blotting檢測(cè)發(fā)現(xiàn),4個(gè)轉(zhuǎn)化子分別出現(xiàn)位置不同的單一條帶,表明轉(zhuǎn)化子為T-DNA單拷貝插入,插入位點(diǎn)不同,無(wú)明顯的位點(diǎn)插入偏好(圖1c)。
圖1 轉(zhuǎn)化子中DsRed基因(a)和hyg基因(b)的PCR檢測(cè)與Southern雜交分析(c)
雖然轉(zhuǎn)化子外觀形態(tài)與野生型相同,但在熒光顯微鏡紫外光激發(fā)下,轉(zhuǎn)化子菌絲、分生孢子梗和分生孢子能發(fā)出明亮的紅色熒光(圖2a,b),而野生型無(wú)熒光表達(dá)(圖2c,d)。DsRed基因只在轉(zhuǎn)化子分生孢子原生質(zhì)中表達(dá)而在孢子壁和隔膜中無(wú)表達(dá)(圖2e),分生孢子成熟后由于孢子壁加厚導(dǎo)致熒光減弱。對(duì)4個(gè)轉(zhuǎn)化子在普通PDA培養(yǎng)基上繼代培養(yǎng)5代后,重新轉(zhuǎn)接至含潮霉素B的培養(yǎng)基上,轉(zhuǎn)化子仍能夠正常生長(zhǎng),PCR檢測(cè)能夠擴(kuò)增出目的片段,表明DsRed基因在轉(zhuǎn)化子中穩(wěn)定遺傳。
差異顯著性分析表明,轉(zhuǎn)化子Cl-DsRed 2的生長(zhǎng)速度極顯著低于野生型菌株,其他轉(zhuǎn)化子無(wú)顯著差異;轉(zhuǎn)化子Cl-DsRed 3產(chǎn)孢量極顯著減少,Cl-DsRed 1的產(chǎn)孢量也受到一定程度的影響。各轉(zhuǎn)化子Cx酶均略有下降,但差異不顯著。而菌株間PMG 酶活性差異明顯,轉(zhuǎn)化子 Cl-DsRed 1、Cl-DsRed 2和Cl-DsRed 4的活性顯著高于野生型菌株,而Cl-DsRed 3則表現(xiàn)為下降。轉(zhuǎn)化子Cl-DsRed 3粗毒素的致病力極顯著下降,其他轉(zhuǎn)化子粗毒素的致病力也受到一定影響(表2)。
圖2 轉(zhuǎn)化子Cl-DsRed 4菌株的熒光表達(dá)
表2 轉(zhuǎn)化子致病相關(guān)性狀的比較分析1)
Cl-DsRed 1、Cl-DsRed 2和Cl-DsRed 4與野生型菌株一樣,在感病自交系‘黃早四’的葉片上表現(xiàn)出較強(qiáng)的毒性和侵襲力,在接種后3d即可產(chǎn)生典型病斑;Cl-DsRed 3在接種5d后才出現(xiàn)典型病斑且病斑面積小,表明其侵襲力和致病力有所減弱。
新月彎孢為半知菌亞門絲孢綱絲孢目暗色絲孢科彎孢屬的真菌,分生孢子具3個(gè)隔橫4細(xì)胞,中隔常位于中央偏下處,從莖部數(shù)第3個(gè)細(xì)胞膨大;在黑暗培養(yǎng)12h后,孢子萌發(fā)率達(dá)到95%以上,一般從兩端顏色較淡的細(xì)胞長(zhǎng)出芽管,少許孢子單端萌發(fā);接種Cl-DsRed 4后5d,自交系‘黃早四’葉片上形成梭形褪綠透明的病斑(圖2f)。在熒光顯微鏡下,能夠看到紅色熒光蛋白在病菌侵染玉米葉片菌絲中的表達(dá)(圖2g)。
在7個(gè)簡(jiǎn)并引物中,AD5最適合彎孢菌的TAIL-PCR擴(kuò)增,4個(gè)轉(zhuǎn)化子中有3個(gè)獲得特異性條帶,致病力表現(xiàn)下降的Cl-DsRed 3未獲得側(cè)翼序列,其他簡(jiǎn)并引物未產(chǎn)生特異性擴(kuò)增。將所獲得的序列提交NCBI后采用blastn比對(duì),未發(fā)現(xiàn)高度同源的基因序列。初步比對(duì)結(jié)果(表3)表明,在Cl-DsRed 1轉(zhuǎn)化子中,DsRed蛋白編碼基因插入在一個(gè)未知功能的假定蛋白(939bp)中,但有效比對(duì)區(qū)域僅為216bp,插入位點(diǎn)為該假定蛋白基因的575和576位堿基之間。Cl-DsRed 2轉(zhuǎn)化子的DsRed蛋白編碼基因插入在ATP核糖磷酸轉(zhuǎn)移酶編碼基因(1 252bp)中,有效比對(duì)區(qū)域?yàn)?73~583bp大小,插入位點(diǎn)為該基因的227和228位堿基之間。Cl-DsRed 2轉(zhuǎn)化子在菌絲生長(zhǎng)速度和PMG酶活性方面表現(xiàn)出與野生型菌株的極顯著差異,可能與ATP核糖磷酸轉(zhuǎn)移酶活性受到干擾有關(guān)。Cl-DsRed 4轉(zhuǎn)化子的側(cè)翼序列未發(fā)現(xiàn)有登錄的相似基因序列。
表3 側(cè)翼序列基因的比對(duì)
作為生物學(xué)研究工具,DsRed已對(duì)許多真菌成功實(shí)現(xiàn)了標(biāo)記,但對(duì)玉米彎孢葉斑病菌的遺傳標(biāo)記國(guó)內(nèi)外尚未見(jiàn)報(bào)道。本研究采用根癌農(nóng)桿菌介導(dǎo)的轉(zhuǎn)化系統(tǒng),將紅色熒光蛋白標(biāo)記基因插入新月彎孢基因組DNA中,獲得了DsRed基因穩(wěn)定遺傳的轉(zhuǎn)化子,為該病菌在寄主植物中的侵染循環(huán)和致病機(jī)制研究提供了重要的材料。
對(duì)轉(zhuǎn)化子表型測(cè)定發(fā)現(xiàn),轉(zhuǎn)化子與野生型相比,在一些性狀方面出現(xiàn)改變,可能是外源DNA片段的隨機(jī)插入位點(diǎn)影響了相關(guān)基因的表達(dá),產(chǎn)生的突變體可用以研究彎孢菌生長(zhǎng)發(fā)育相關(guān)基因和致病基因。在獲得的4個(gè)轉(zhuǎn)化子中,Cl-DsRed 4與野生型在致病性和其他性狀方面相近,適用于彎孢菌與玉米互作的研究。但由于玉米葉片自身紅色熒光較強(qiáng),直接在葉表觀察彎孢菌絲的擴(kuò)展、入侵等特征較為困難,只有在葉片橫切面才能有效觀察到發(fā)熒光菌絲。因此需要其他技術(shù)手段消除葉片自身熒光而不影響病菌熒光的觀察,以便能夠檢測(cè)到彎孢菌對(duì)玉米葉片的完整侵染循環(huán)過(guò)程。
hiTAIL-PCR技術(shù)可以通過(guò)對(duì)插入位點(diǎn)側(cè)翼序列的分析確定基因插入的位置,從而分析該基因功能與表型突變之間的關(guān)系[31]。本試驗(yàn)還對(duì)其他20個(gè)突變體的插入位點(diǎn)側(cè)翼序列進(jìn)行了擴(kuò)增,獲得了其中13個(gè)序列,從本文的側(cè)翼序列比對(duì)結(jié)果中發(fā)現(xiàn),具有相似性的登錄基因序列均來(lái)自與新月彎孢相近分類學(xué)地位的子囊菌格孢腔菌科(Pleosporace-ae)真菌:偃麥草核腔菌[Pyrenophora tritici-repentis(Died.)Drechsler]、圓核腔菌(Pyrenophora teres f.teres)、穎枯暗球腔菌(Phaeosphaeria nodorum)(無(wú)性態(tài):斑污小球腔菌Leptosphaeria maculans),表明格孢腔菌科真菌在基因組成方面具有相似性。
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