南方醫(yī)科大學基礎醫(yī)學院的前身為原第一軍醫(yī)大學基礎部，成立于1951年，2005年6月隨學校移交廣東省后更名為南方醫(yī)科大學基礎醫(yī)學院。

學院現(xiàn)有教職工230人，其中教授46人，副教授57人；博士生導師53人，碩士生導師33人；具有博士學位的教師占80%以上；有國家級教學團隊一個，擁有中國科學院院士1名，中國工程院院士1名，國家級教學名師2人，全國模范教師和全國優(yōu)秀教師3人，“長江計劃特聘教授”3人，“973”項目首席科學家1人，國家杰出青年科學基金獲得者3人。先后有20余人次獲中國青年科技獎、“新世紀百千萬人才工程”國家級人選、廣東省科學技術突出貢獻獎、廣東省丁穎科技獎、南粵優(yōu)秀教師等榮譽。

學院承擔全校各學制、各專業(yè)、各層次的基礎課、專業(yè)基礎課和專業(yè)課教學工作，開設了101門課程，每年承擔近5萬學時的教學任務；開設了基礎醫(yī)學、生物信息學、醫(yī)學實驗技術及病理學4個專業(yè)，建有國家級實驗教學示范中心，出版了一系列高質量的專業(yè)教材、參考書及輔導教材；先后獲省部級優(yōu)秀教學成果獎9項，有國家精品課程2門，國家級雙語教學示范課程1門。

學院現(xiàn)有2個博士后科研流動站、2個一級學科博士點、8個二級學科博士點；擁有2個省一級重點學科，1個國家重點學科，1個國家重點（培育）學科，2個“長江學者”特聘教授崗位學科，3個廣東省重點學科，1個教育部重點實驗室，7個廣東省重點實驗室等一批處于國內先進水平的科研基地和實驗技術平臺。建有轉基因和敲基因技術、蛋白質組學、斑馬魚模式生物、組織工程等多個高新技術平臺，在臨床應用解剖學、鼻咽癌及大腸癌發(fā)生與轉移機理、休克微循環(huán)、細胞信號轉導、神經元凋亡機制、聽覺神經機制及可塑性、地中海貧血等領域具較大的學術影響?！笆晃濉币詠恚瑢W院先后承擔各類課題近200項，獲得經費七千余萬元，主持國家自然科學基金重點項目5項、“863”項目1項、“973”分題2項、教育部“長江學者和創(chuàng)新團隊發(fā)展計劃”項目1項；作為第一完成單位先后獲得省部級以上科技成果6項，其中獲廣東省科學技術突出貢獻獎1項，廣東省科學技術一等獎3項、二等獎2項。發(fā)表論文1 000余篇，其中SCI收錄論文140余篇。