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應(yīng)用ISSR-PCR技術(shù)鑒別梅山豬肉及其肉制品的研究

2016-06-22 09:41:18史子學(xué)趙曉明唐賽涌曹傳閨肖耀明莊建萍朱???/span>費(fèi)瓊慧上海市嘉定區(qū)農(nóng)業(yè)委員會上海嘉定0800上海市嘉定區(qū)動物疫病預(yù)防控制中心上海嘉定0800
豬業(yè)科學(xué) 2016年4期
關(guān)鍵詞:指紋圖譜鑒別

史子學(xué),趙曉明,唐賽涌,曹傳閨,肖耀明,莊建萍,卞 益,朱??。M(fèi)瓊慧(.上海市嘉定區(qū)農(nóng)業(yè)委員會,上海 嘉定 0800;.上海市嘉定區(qū)動物疫病預(yù)防控制中心,上海 嘉定 0800)

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應(yīng)用ISSR-PCR技術(shù)鑒別梅山豬肉及其肉制品的研究

史子學(xué)1,趙曉明2,唐賽涌2,曹傳閨2,肖耀明2,莊建萍2,卞 益2,朱???,費(fèi)瓊慧1
(1.上海市嘉定區(qū)農(nóng)業(yè)委員會,上海 嘉定 201800;2.上海市嘉定區(qū)動物疫病預(yù)防控制中心,上海 嘉定 201800)

摘 要:為解決涉及梅山豬及其肉制品的假冒銷售糾紛,有效保護(hù)梅山豬地方品種的市場地位和品牌形象,研究了ISSR-PCR方法鑒別梅山豬及其肉制品的引物及其方法,通過比較PCR指紋圖譜,能特異性鑒別梅山豬肉。

關(guān)鍵詞:ISSR-PCR;梅山豬肉;鑒別;指紋圖譜

梅山豬原產(chǎn)于太湖流域的上海市嘉定、寶山、松江等區(qū)縣和江蘇的昆山、太倉等市縣,是太湖豬中的典型代表,有肉質(zhì)好、耐粗飼、抗病力強(qiáng)等優(yōu)良特性。嘉定區(qū)的梅山豬品種其肌肉鮮嫩、肌纖維細(xì)而密,含水量較少,肌內(nèi)脂肪豐富,呈大理石狀,俗稱“五花肉”[1,2]。近年來隨著人們生活水平的提高,對畜禽產(chǎn)品的質(zhì)量要求越來越高,許多以追求高產(chǎn)為目的培育的外三元豬肉不能滿足消費(fèi)需求,取而代之的是豬肉市場消費(fèi)追求多樣化、精細(xì)化、肉質(zhì)高品質(zhì)化。梅山豬因肉質(zhì)鮮美、香甜濃香而受到上海市民青睞,盡管價格比較高卻供不應(yīng)求。目前尚沒有鑒定梅山豬肉及其肉制品的方法可以有效地保護(hù)正宗梅山豬肉及其肉制品的市場地位和品牌形象。

目前,制定的以活體豬為檢測對象的鑒別梅山豬的地方性標(biāo)準(zhǔn),對梅山豬宰殺后分割肉及其他肉制品就不能用這種標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行鑒定了。豬全基因組測序技術(shù)雖然可以鑒別不同品種、甚至不同個體的豬,但需要檢測的基因數(shù)目很多,成本大,不能廣泛應(yīng)用。而若只檢測不同品種豬的個別基因,則不能區(qū)分轉(zhuǎn)基因和純種豬肉制品。ISSR是Zietkiewicz等[3]于1994創(chuàng)建的一類在PCR反應(yīng)基礎(chǔ)上的DNA分子標(biāo)記技術(shù),它和PCR技術(shù)聯(lián)合使用具有很高的特異性和靈敏度且準(zhǔn)確快速,近年來在品種鑒定、種質(zhì)資源和遺傳多樣性研究廣泛應(yīng)用,如ISSR分子技術(shù)鑒別陸川豬肉[4]、雁鵝[5]、馬鈴薯[6]、霍亂弧菌[7]和水稻[8]品種等。

1 材料與儀器

1.1 材料與試劑

梅山豬、梅杜二元雜豬樣品來源于上海市嘉定區(qū)梅山豬育種中心(國家級梅山豬保種場);杜長大三元雜豬肉樣品購自樂購超市;金華兩頭烏豬肉樣品購自專賣店;寧鄉(xiāng)花豬樣品購自湖南景倉農(nóng)業(yè)科技有限公司(寧鄉(xiāng)花豬專賣店);蘇淮黑豬樣品購自江蘇省蘇食肉品有限公司(蘇淮黑豬專賣店);陸川豬樣品購自廣西玉林陸川豬養(yǎng)殖戶;羊肉、牛肉購自樂購超市。樣品分裝后,-20 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>

ISSR隨機(jī)引物根據(jù)British Columbia大學(xué)公布的序列設(shè)計,2×Taq PCR MasterMix購自天根生化科技有限公司,其他試劑為國產(chǎn)分析純。

1.2 儀器

凝膠成像系統(tǒng)(Bio-Rad);PCR擴(kuò)增儀(ABI);臺式高速冷凍離心機(jī)(Eppendorf);DYY-7型電泳儀(北京市六一儀器廠)等。

2 方法

2.1 基因組DNA提取

分別取約100 mg梅山豬母豬、梅杜二元雜母豬、梅山豬公豬、梅杜二元雜公豬、杜長大三元雜的生鮮肉,放入研磨器加1 000μL蒸餾水,研磨5 min,取100 μL研磨液,加入1 mLDNA提取緩沖液(10 mol/ L Tris-HCl,0.1 mol/L EDTA,0.5%SDS),然后再加入25 μL蛋白酶K,使終濃度達(dá)到100 μg/mL,混勻,50 ℃水浴3 h。用等體積的酚抽提1次,2 500 r/min離心收集水相,用等體積的酚、氯仿和異戊醇(體積比25:24:1)的混合物抽提1次,2 500 r/min離心收集水相;用等體積的氯仿和異戊醇(體積比24:1)的混合物抽提1次;加入等體積的5 mol/L的LiCl,混勻,冰浴10 min;2 500 r/min,離心10 min。轉(zhuǎn)移上清加入等體積的異丙醇,室溫10 min;2 500 r/min,離心10 min后棄上清。加入0.1倍體積3 mol/L乙酸鈉(pH5.2)與2倍體積-20℃預(yù)冷無水乙醇,-20 ℃靜置20 min。室溫12 000 r/min離心5 min后棄上清。將基因組DNA溶于適量100 μL TE中,作為ISSR-PCR反應(yīng)的模板DNA。

2.2 ISSR-PCR反應(yīng)體系與擴(kuò)增程序

ISSR-PCR反應(yīng)體系為25 μL體系:模板DNA 1μL、引物0.4 μmol/L、2×Taq PCR Master Mix 12.5 μL、ddH2O補(bǔ)足25 μL;擴(kuò)增程序:設(shè)置梯度PCR擴(kuò)增程序。95 ℃預(yù)變性 2 min,95 ℃變性30 s,退火30s,72℃延伸1 min,循環(huán)40次,72 ℃再延伸10 min。

2.3 電泳檢測

將擴(kuò)增產(chǎn)物5μL進(jìn)行1.0%的瓊脂糖凝膠電泳,1×TAE緩沖液,電壓100 V下電泳0.5 h,凝膠成像系統(tǒng)拍照。

3 結(jié)果與分析

3.1 供試樣品ISSR-PCR擴(kuò)增結(jié)果

選擇ISSR隨機(jī)引物:5’-ATG ATGATGATGATGATGA-3’,經(jīng)梯度PCR優(yōu)化確定的退火溫度為54.6℃,模板加入量50~100 mg。對梅山豬母豬、梅杜二元雜母豬、梅山豬公豬、梅杜二元雜公豬、杜長大三元雜的生鮮肉提取基因組DNA進(jìn)行ISSR-PCR擴(kuò)增,電泳圖譜見圖1。對梅山豬母豬、金華兩頭烏、蘇淮黑豬、寧鄉(xiāng)花豬、陸川豬、羊肉、牛肉提取的基因組DNA進(jìn)行ISSR-PCR擴(kuò)增,電泳圖譜見圖2。

3.2 擴(kuò)增條帶圖譜分析

如圖1中箭頭所示,梅杜二元雜母豬、梅杜二元雜公豬、杜長大三元雜樣品均產(chǎn)生1條較清晰的條帶,而梅山豬母豬、梅山豬公豬中無此條帶,多次重復(fù)實驗結(jié)果一致,并且梅山豬母豬、梅山豬公豬樣品PCR擴(kuò)增條帶一致。梅山豬有條帶A、B、D、E和F而無條帶B1和C,而梅杜二元雜和杜長大三元雜有條帶A、B、C、D,條帶E和F稍模糊,梅杜二元雜母豬、杜長大三元雜有清晰B1條帶杜梅二元雜公豬B1條帶稍模糊。因此,凡是滿足有且僅有條帶A、B、D、E和F即可鑒定為梅山豬。

圖1 鑒定梅山豬的電泳圖譜

圖2 鑒別梅山豬與其他品種豬及羊肉、牛肉電泳圖譜

如圖2中箭頭所示,金華兩頭烏、蘇淮黑豬、寧鄉(xiāng)花豬、陸川豬樣品均產(chǎn)生一條較清晰的條帶(B1帶,大小為850 bp),而梅山豬中無此條帶,多次重復(fù)實驗結(jié)果一致,羊肉、牛肉與豬肉圖譜差異較大,很容易區(qū)分。由圖2發(fā)現(xiàn),梅山豬有條帶A、B、D、E和F而無條帶B1和C,而金華兩頭烏豬、蘇淮黑豬、寧鄉(xiāng)花豬、陸川豬有清晰條帶A、B1、D、E和F,陸川豬還有明顯的C帶。而羊肉與牛肉的DNA指紋圖譜與梅山豬相去甚遠(yuǎn),羊肉具有明顯的條帶C,而牛肉具有極為明亮明顯的條帶B1。因此,凡是滿足有且僅有條帶A、B、D、E和F的樣品可鑒定為梅山豬。

4 討論

ISSR-PCR主要是由單一引物且以重復(fù)序列為擴(kuò)增序列,所以結(jié)果的特異性受引物序列、反應(yīng)體系或退火溫度等影響較大。本研究經(jīng)優(yōu)化建立了基于ISSR-PCR技術(shù)梅山豬肉鑒別方法,圖譜擴(kuò)增帶明亮、穩(wěn)定性及多態(tài)性高,為梅山豬遺傳保種、商業(yè)化推廣提供了技術(shù)手段,也為國內(nèi)其他優(yōu)良地方豬肉品種辨別提供了借鑒。

參考文獻(xiàn)

[1] 殷方芝,肖耀明,陶軍,等. 近年來我國地方豬種遺傳資源保護(hù)與利用[J]. 豬業(yè)科學(xué), 2015,32(10):132-133.

[2] 唐賽涌,王勃,陸林根.上海地區(qū)梅山豬的歷史發(fā)展與保種現(xiàn)狀[J].中國豬業(yè),2013 (S1):71-73.

[3] Zietkiewicz E,Rafalski A,Labuda D.Genome fingerprintingby simple sequence repeat(SSR) anchored polymerase chainreaction amplification[J]. Genonics,1994, 20(2):176-183.

[4] 何瑜林,黃麗,封毅,等.ISSR分子標(biāo)記鑒定陸川豬及其肉制品[J]. 肉類研究,2014,28 (10):10-14.

[5] 李瑩,梁強(qiáng),趙華寶,等.雁鵝遺傳多樣性的ISSR分析[J].農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報, 2009 (6):63-68.

[6] 段艷鳳,劉杰,卞春松,等.中國88個馬鈴薯審定品種SSR指紋圖譜構(gòu)建與遺傳多樣性分析[J].作物學(xué)報,2009,35(8):1 451-1 457.

[7] 莫秋華,譚華,王琪,等.霍亂弧菌分子分型和溯源技術(shù)ISSR-PCR的改進(jìn)[J].中國病原生物學(xué)雜志,2014 (9):33-37.

[8] 黃亮,李雨馨.常見水稻品種的DNA指紋圖譜構(gòu)建及其遺傳[J].糧食與油脂.2014 (10):29-32.

收稿日期:(2016-01-28)

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