劉麗軍
(西藏民族大學(xué)醫(yī)學(xué)院,陜西 咸陽(yáng) 712082)
論著
腫瘤壞死因子-α基因多態(tài)性與中國(guó)漢族人群乙肝病毒感染的相關(guān)性研究*
劉麗軍
(西藏民族大學(xué)醫(yī)學(xué)院,陜西 咸陽(yáng) 712082)
目的探討中國(guó)漢族人群腫瘤壞死因子-α(TN F-α)基因單核苷酸多態(tài)性(r s1800629和r s361525)與乙型肝炎病毒(H B V)感染的相關(guān)性。方法用T a q M a n探針對(duì)納入的1 097例樣本進(jìn)行TN F-α、r s1800629和r s361525位點(diǎn)多態(tài)性檢測(cè),血樣本包括429例慢性H B V感染者(C H組)、429例乙肝感染后自發(fā)清除者(S R組)及239例健康對(duì)照者(H C組)。結(jié)果①C H組與S R組比較,r s1800629 G A基因型與G等位基因與感染后病毒的自發(fā)清除有關(guān)[基因型:O R^=0.369,P=0.000;等位基因:O R^=2.210,P=0.000;顯性模型(GG v s G A+AA):O R^=0.536,P=0.000]。②C H組與S R組比較,SN P r s361525 G A基因型或A等位基因與感染后病毒的自發(fā)清除密切相關(guān)[基因型:O R^=0.288,P=0.000;等位基因:O R^=0.549,P=0.000;顯性模型(GG v s G A+AA):O R^=0.634,P=0.000]。結(jié)論TN F-α基因多態(tài)性與中國(guó)漢族人群H B V病毒感染后的自發(fā)清除密切相關(guān)。
乙型肝炎;單核苷酸多態(tài)性;腫瘤壞死因子-α基因
慢性乙型肝炎病毒(hepatitis B v ir u s,HBV)感染是我國(guó)面臨的一個(gè)嚴(yán)峻的衛(wèi)生問(wèn)題。盡管大部分的感染者能自發(fā)清除病毒,但仍有約5%~10%的感染者發(fā)展為慢性感染[1]。半數(shù)以上慢性HBV感染患者病情穩(wěn)定,可表現(xiàn)為無(wú)癥狀攜帶或輕度慢性肝炎。部分患者則會(huì)進(jìn)展為肝硬化或肝癌等嚴(yán)重的肝病[2]。影響HBV感染結(jié)局的因素主要是宿主、病毒及環(huán)境3大因素,越來(lái)越多的證據(jù)表明宿主遺傳因素在慢性HBV感染中發(fā)揮重要作用[3]。
腫瘤壞死因子-α(t u mor necrosis f actor-α,TN F-α)作為一種重要的細(xì)胞因子,被證實(shí)參與HBV病毒清除的過(guò)程[4]。近年來(lái)有報(bào)道稱(chēng),TN F-α啟動(dòng)子區(qū)單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)rs1800629與rs361525與HBV慢性感染有關(guān)[5-7],但結(jié)論不一致。因此,本研究通過(guò)病例對(duì)照方法來(lái)探討TN F-α啟動(dòng)子區(qū)基因多態(tài)性(rs1800629和rs361525)與乙型肝炎病毒感染結(jié)局的相關(guān)性。
1.1研究對(duì)象
選取2011年1月-2015年6月就診于西藏民族大學(xué)附屬醫(yī)院的無(wú)血緣關(guān)系的患者。其中包括正常對(duì)照組(H C組)、自發(fā)清除組(SR組)、慢性乙型肝炎(chronic hepatitis B,C HB)(C H組)、乙肝肝硬化(cirrhosis o f li v er,L C)、乙肝肝癌(hepatocell u lar carcinoma,H CC)。診斷標(biāo)準(zhǔn)參見(jiàn)《慢性乙型肝炎防治指南》。排除標(biāo)準(zhǔn):①HBV血清兩對(duì)半標(biāo)志物不明確者;②僅有乙型肝炎表面抗體陽(yáng)性(+)的HBV疫苗接種者;③艾滋病或其他非HBV肝炎病毒感染者;④?chē)?yán)重的系統(tǒng)性疾病如系統(tǒng)性紅斑狼瘡、非H CC腫瘤等其他肝臟疾病;⑤如自身免疫型肝病、原發(fā)性膽汁性肝硬化等;⑥非漢族人。本研究得到西藏民族大學(xué)附屬醫(yī)院醫(yī)學(xué)倫理委員會(huì)的批準(zhǔn),所有受試者簽署書(shū)面的知情同意書(shū)。
1.2樣本及生化指標(biāo)的采集
采集每個(gè)受試者血液約3ml,置于-80℃冰箱冷凍保存?zhèn)溆谩Mㄟ^(guò)問(wèn)卷調(diào)查方式收集其年齡、性別等基本情況。乙肝兩對(duì)半、丙氨酸轉(zhuǎn)氨酶(alanine aminotrans f erase,A L T)、天冬氨酸氨基轉(zhuǎn)移酶(aspartate aminotrans f erase,A S T)、血清總膽紅素(total bilir u bin,T B I L)及乙肝病毒的脫氧核糖核酸(hepatitis B v ir u s-deo x yribon u cleic acid,HBV-DN A)水平的測(cè)定由本院檢驗(yàn)科完成。
1.3DN A的提取與基因型分析
使用W i z ard G enomic DN A純化試劑盒(美國(guó)P rome g a公司)提取外周血基因組DN A。NanoDrop 2000(美國(guó)Thermo S cienti f ic公司)測(cè)定DN A濃度及光密度值,并稀釋成30 n g/μl備用。單核甘酸多態(tài)性(sin g le n u cleotide polymorphism,S N P)rs1800629 與rs361525分型采用Ta q M an探針?lè)ǎ绹?guó)A pplied B iosystems公司)。Ta q M an等位基因鑒別實(shí)驗(yàn)由A B I 7500快速實(shí)時(shí)熒光聚合酶鏈反應(yīng)(real-time polymerase chain reaction,R eal-time q PC R)系統(tǒng)完成(美國(guó)A pplied B iosystems公司)。其中每96孔設(shè)置1個(gè)陰性對(duì)照和1個(gè)陽(yáng)性對(duì)照。聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)擴(kuò)增反應(yīng)體系為20μl,含30n g/μl DN A2μl,master mi x 10μl,primer-probe mi x 0.5μl及DN A ase-f ree w ater 7.5μl。PC R反應(yīng)條件:95℃預(yù)變性10 min,92℃變性15 s,60℃退火1min,共39個(gè)循環(huán)。隨機(jī)選取10%樣本用同一方法重復(fù)驗(yàn)證以保證分型準(zhǔn)確,基因分型錯(cuò)誤率<0.1%。
1.4統(tǒng)計(jì)學(xué)方法
采用S P SS 22.0統(tǒng)計(jì)軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)分析,計(jì)量資料以均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差(x±s)表示,H ardy-W einber g遺傳平衡由 HW E軟件完成,用S t u dent't檢驗(yàn)或M ann-W hitney U檢驗(yàn),3組計(jì)量資料比較用方差分析;計(jì)數(shù)資料以用百分比或率表示,用χ2檢驗(yàn);基因型及基因模型使用二分類(lèi)L o g istic回歸校正年齡與性別后進(jìn)行比較。使用H aplo v ie w so f t w are(v4.2)軟件進(jìn)行單體型分析。考慮到多重檢驗(yàn)的問(wèn)題,P<0.0125(0.05/4)為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
2.1基本資料及H ar d y-We i n ber g遺傳平衡
2.1.1基本資料本研究共納入1 097例患者,其中C H組429例,SR組429例,H C組239例。各組年齡比較,經(jīng)方差分析,差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(F=0.080,P=0.923)。3組男女比較,經(jīng)χ2檢驗(yàn),差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=63.210,P=0.000),C H組男性比例高于SR組與H C組。3組A L T、A S T、T B I L、HBV-DN A定量比較,經(jīng)方差分析,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(F=15.049,P=0.005;F=49.216,P=0.000;F=7.594,P=0.023;F= 15.004,P=0.005),C H組高于SR組及H C組。見(jiàn)表1。
2.1.2H a rd y-W e in b e r g遺傳平衡rs1800629與rs361525均符合H ardy-W einber g遺傳平衡(SR組:rs1800629位點(diǎn)P=0.085,rs361525位點(diǎn)P=0.199;H C組:rs1800629位點(diǎn)P=0.136,rs361525位點(diǎn)P= 0.451)。
2.2TN F-α rs1800629基因型與乙肝感染結(jié)局的關(guān)系
rs1800629 G是各組中最常見(jiàn)的等位基因。攜帶rs1800629 G A基因型與G等位基因有利于感染后病毒的自發(fā)清除,該保護(hù)性作用在顯性遺傳模型中仍存在[C H組v s SR組基因型:O R^=0.369,P=0.000;等位基因:O R^=2.210,P=0.000;顯性模型(GG v s G A+ AA):O R^=0.536,P=0.000](見(jiàn)表2)。在疾病進(jìn)展方面,未發(fā)現(xiàn)多態(tài)性與疾病相關(guān)(見(jiàn)表3)。
2.3TN F-α rs361525基因型與乙肝感染結(jié)局的關(guān)系
攜帶G A基因型或A等位基因有利于感染后病毒的自發(fā)清除[C H組v s SR組基因型:O R^=0.288,P= 0.000;等位基因:O R^=0.549,P=0.000;顯性模型(GG v s G A+AA):O R^=0.634,P=0.000](見(jiàn)表2)。在疾病進(jìn)展方面,未發(fā)現(xiàn)多態(tài)性與疾病相關(guān)(見(jiàn)表3)。
2.4TN F-α基因單體型與乙肝病毒感染結(jié)局的關(guān)系
表1 各組納入研究者的人口學(xué)及臨床特征比較
表2 慢性乙肝感染與TN F-α基因型的關(guān)系
表3 慢乙肝進(jìn)展與TN F-α基因多態(tài)性的關(guān)系
考慮到單體型在解釋多態(tài)性與疾病相關(guān)性上有更好的說(shuō)服力,本研究以TN F-α兩位點(diǎn)為基礎(chǔ)構(gòu)建單體型。但未發(fā)現(xiàn)兩個(gè)位點(diǎn)之間能夠構(gòu)建單體型。
TN F-α是由單核巨噬系統(tǒng)細(xì)胞產(chǎn)生的細(xì)胞因子,具有免疫調(diào)節(jié)作用,增加I L-1、I L-8和粒-巨噬細(xì)胞集落刺激因子的分泌,提高I L-2R基因表達(dá)的水平,促進(jìn)T細(xì)胞增殖,增強(qiáng)抗體依賴(lài)細(xì)胞介導(dǎo)的細(xì)胞毒作用,促進(jìn)B淋巴細(xì)胞增殖、分化和產(chǎn)生抗體等作用。
有研究發(fā)現(xiàn),TN F-α 基因啟動(dòng)子區(qū)域內(nèi)rs1800629和rs361525等S N P與丙型肝炎病毒感染、HBV感染及其抗病毒治療應(yīng)答相關(guān)[8-10]。本研究主要探討 TN F-α 基因啟動(dòng)子區(qū) rs1800629和rs361525位點(diǎn)多態(tài)性與HBV感染結(jié)局的相關(guān)性。
結(jié)果顯示,我國(guó)人群TN F-α基因rs1800629和rs361525位點(diǎn)基因型均以GG為主,等位基因頻率G>A,與相關(guān)研究結(jié)果一致[6,11]。在HBV病毒感染后的自發(fā)清除方面,攜帶rs9275572 G等位基因表現(xiàn)出保護(hù)作用,且該效應(yīng)在顯性模型中也有體現(xiàn)。攜帶rs361525 G A基因型或A等位基因有利于感染后病毒的自發(fā)清除,且該效應(yīng)在顯性模型中同樣得到印證。本實(shí)驗(yàn)結(jié)果與前人的研究一致[12-14]。rs1800629和rs361525位于TN F-α基因的啟動(dòng)子區(qū),不同的等位基因,可能會(huì)影響TN F-α啟動(dòng)子的活性,進(jìn)而影響TN F-α的表達(dá),從而對(duì)HBV感染后的清除過(guò)程產(chǎn)生作用。
本研究將 rs1800629和 rs361525結(jié)合探討TN F-α基因多態(tài)性與乙肝感染結(jié)局的關(guān)系。然而,對(duì)于這2個(gè)位點(diǎn)來(lái)說(shuō),本研究較之其他研究仍有相悖之處[6,11],考慮可能存在以下原因:①S N P受種族、地域等因素的影響,導(dǎo)致其遺傳差異顯著,這也是導(dǎo)致該研究與其他文獻(xiàn)報(bào)道差異的原因之一。②樣本量與其他混雜因素的存在,例如基因或者環(huán)境因素。本研究也存在一定的不足之處,例如納入研究的樣本量不夠多,這在一定程度上降低實(shí)驗(yàn)的信度。今后需要更大樣本量、設(shè)計(jì)更嚴(yán)謹(jǐn)?shù)膶?shí)驗(yàn)進(jìn)一步驗(yàn)證。
總之,本研究表明,中國(guó)人TN F-α基因多態(tài)性與HBV病毒感染后病毒的自發(fā)清除有關(guān),一定程度上為慢性乙型肝炎的早預(yù)防和高應(yīng)答率的治療奠定基礎(chǔ)。
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(童穎丹 編輯)
Association between TNF-αgene polymorphism s and chronic hepatitis B virus infection*
Li-jun Liu
(Medical College of Xizang Minzu University,Xianyang,Shannxi 712082,China)
Objective To assess the relation between two single nucleotide polymorphisms(rs1800629 and rs361525)of TNF-αgene and the outcomes of HBV infection in Chinese Han population.M ethods TNF-α (rs1800629 and rs361525)was genotyped by TaqMan probe method in 1,097 subjects,including 429 patients with chronic HBV infection(CH),429 HBV spontaneous clearance subjects(SR)and 239 healthy control individuals(HC).Results rs1800629 GA genotype and G allele showed significant protective effect on HBV spontaneous clearance[CH vs SR:genotype:O R^=0.369,P=0.000;allele:O R^=2.210,P=0.000;dominant model (GG vs GA+AA):O R^=0.536,P=0.000].SNP rs361525 showed a significant association with HBV spontaneous clearance.The rs361525 GA genotype and A allele played a protective role[CH vs SR:genotype:O R^= 0.288,P=0.000;allele:O R^=0.549,P=0.000;dominant model (GG vs GA+AA):O R^=0.634,P=0.000]. Conclusions TNF-αgene polymorphisms are associated with HBV spontaneous clearance.
hepatitis B;single nucleotide polymorphism;tumor necrosis factor-αgene
R 512.6
A
10.3969/j.issn.1005-8982.2016.15.016
1005-8982(2016)15-0087-04
2016-01-06
西藏自治區(qū)科技廳重點(diǎn)項(xiàng)目(No:Z2014A09G2-3);西藏自治區(qū)科技廳項(xiàng)目(No:2015ZR-13-19)
中國(guó)現(xiàn)代醫(yī)學(xué)雜志2016年15期