劉良楹段江暉杜甲珺陳欣馮小東龍莉艷

特 別 關(guān) 注

基于CiteSpace的結(jié)節(jié)病可視化研究

劉良楹1段江暉2杜甲珺1陳欣1馮小東1龍莉艷1

作者單位：1.100853 北京，解放軍總醫(yī)院醫(yī)學(xué)信息室；2.100029 北京，中日友好醫(yī)院影像科

目的 探索結(jié)節(jié)病近10年的研究發(fā)展過程與趨勢。方法 利用結(jié)節(jié)病在Web of Science核心集2007—2017年的數(shù)據(jù)，通過CiteSpace分別生成結(jié)節(jié)病的5類圖譜并進(jìn)行解讀。結(jié)果 Marc A Judson、Robert P Baughman、Marjolein Drent、R.P.Baughman和Dominique Valeyre是結(jié)節(jié)病方面較為重要的作者。美國辛辛那提大學(xué)、美國梅奧診所、美國圣安東尼奧醫(yī)院、美國克利夫蘭診所和美國南卡萊羅納醫(yī)科大學(xué)是結(jié)節(jié)病方面發(fā)文量最多的研究機(jī)構(gòu)。美國、日本、法國、德國和英國是研究結(jié)節(jié)病的中堅力量。Iannuzzi-2007是結(jié)節(jié)病研究領(lǐng)域最核心的文獻(xiàn)。心臟結(jié)節(jié)病、結(jié)節(jié)病的診斷、肺結(jié)節(jié)病這三面均受到了學(xué)者們的密切關(guān)注。結(jié)論 心臟結(jié)節(jié)病、結(jié)節(jié)病的診斷、肺結(jié)節(jié)病是結(jié)節(jié)病的主要涉及領(lǐng)域。文獻(xiàn)作者和合作機(jī)構(gòu)，以及所屬的國家多集中于美國、日本、法國、德國和英國。

結(jié)節(jié)病；CiteSpace；知識圖譜；信息可視化

結(jié)節(jié)病是一種累及多系統(tǒng)原因不明的肉芽腫性疾病，其研究歷史可追溯至1899年，該病有不同的地域和種族差異，美國該病的年發(fā)病率約為10/10萬，亞洲發(fā)病率較低[1]。結(jié)節(jié)病主要見于＜40歲的成年人，任何器官均可受累，高達(dá)90%的患者累及胸內(nèi)淋巴結(jié)和肺。診斷該病需要結(jié)合臨床和影像學(xué)，并且組織學(xué)證實為非干酪壞死性上皮樣肉芽腫，并除外其他原因引起的肉芽腫性疾病。

CiteSpace是一款基于JAVA平臺的信息可視化應(yīng)用程序，是由美國德雷克塞爾(Drexel)大學(xué)陳超美博士團(tuán)隊開發(fā)的一款可識別及可視化科學(xué)文獻(xiàn)中新趨勢與新動態(tài)軟件[2-3]。利用CiteSpace生成知識圖譜，可從中觀測到一定時期內(nèi)某一研究領(lǐng)域的研究熱點、研究趨勢等內(nèi)容[4]。本文通過對結(jié)節(jié)病相關(guān)文獻(xiàn)進(jìn)行可視化分析，以窺探近10年來結(jié)節(jié)病的研究情況。

1 數(shù)據(jù)和方法

1.1 數(shù)據(jù)來源和工具 本文所有數(shù)據(jù)均來自Web of Science核心集，檢索策略為主題=(sarcoidosis)，時間跨度為2007—2017年，索引數(shù)據(jù)庫包括SCI-EXPANDED、CPCI-S、CCREXPANDED和IC。數(shù)據(jù)下載日期為2017年3月9日，將檢索到的7 568條文獻(xiàn)記錄以純文本格式下載并保存，通過基于JAVA 7的CiteSpace 3.7.R8(64-bit)進(jìn)行處理。

1.2 知識圖譜的繪制 運行CiteSpace，進(jìn)行結(jié)節(jié)病共被引文獻(xiàn)的合并網(wǎng)絡(luò)圖譜參數(shù)設(shè)置(圖1)，分別生成結(jié)節(jié)病的五類圖譜：①結(jié)節(jié)病文獻(xiàn)的作者合作網(wǎng)絡(luò)圖譜；②結(jié)節(jié)病文獻(xiàn)的機(jī)構(gòu)合作網(wǎng)絡(luò)圖譜；③結(jié)節(jié)病文獻(xiàn)的國家合作網(wǎng)絡(luò)圖譜；④結(jié)節(jié)病文獻(xiàn)的關(guān)鍵詞共現(xiàn)網(wǎng)絡(luò)圖譜；⑤結(jié) 節(jié)病共被引文獻(xiàn)的合并網(wǎng)絡(luò)圖譜及時間線視圖。從結(jié)節(jié)病的合作網(wǎng)絡(luò)圖譜中，可迅速直觀地發(fā)現(xiàn)學(xué)者、機(jī)構(gòu)及國家之間的合作情況；通過關(guān)鍵詞的共現(xiàn)網(wǎng)絡(luò)可窺探結(jié)節(jié)病的研究前沿與研究熱點；借助共被引網(wǎng)絡(luò)可篩選出結(jié)節(jié)病的關(guān)鍵文獻(xiàn)，并且可對結(jié)節(jié)病未來的研究方向進(jìn)行預(yù)測。

圖1 結(jié)節(jié)病共被引文獻(xiàn)的合并網(wǎng)絡(luò)圖譜及時間線視圖的參數(shù)設(shè)置

2 結(jié)節(jié)病知識圖譜的分析解讀

2.1 結(jié)節(jié)病文獻(xiàn)的作者合作網(wǎng)絡(luò)圖譜 在作者的合作網(wǎng)絡(luò)中(圖2)，每一引文年代環(huán)的厚度代表這一作者發(fā)文的數(shù)量，引文年代環(huán)之間的連線多少代表合作的密切程度，連線的粗細(xì)代表合作發(fā)表文獻(xiàn)的數(shù)量，連線的顏色則代表首次合作的時間。2007—2017年，圖2顯示共有351名研究結(jié)節(jié)病的學(xué)者，Marc A Judson、Robert P Baughman、Marjolein Drent、R.P.Baughman和Domin ique Valey re是發(fā)文量最多 的前五位作者。圖2顯示有兩大較為密集的聚類，其中Marc A Judson、 Robert P Baughman、Marjolein Drent和Dominique Valeyre可歸 為一個聚類，而R.P.Baughman與其他作者歸為另一個聚類。

圖2 結(jié)節(jié)病文獻(xiàn)的作者合作網(wǎng)絡(luò)圖譜主要部分

2.2 結(jié)節(jié)病文獻(xiàn)的機(jī)構(gòu)合作網(wǎng)絡(luò)圖譜 機(jī)構(gòu)之間合作的關(guān)系亦可通過引文年代環(huán)來進(jìn)行判讀。在機(jī)構(gòu)的合作網(wǎng)絡(luò)中(圖3)，引文年代環(huán)的厚度代表這一機(jī)構(gòu)發(fā)表文獻(xiàn)的數(shù)量，連線多少代表合作的密切程度，連 線粗細(xì)代表合作發(fā)表文獻(xiàn)的數(shù)量，顏色則代表首次合作的時間。2007—2017年機(jī)構(gòu)發(fā)文量排名前5位的分別是美國辛辛那提大學(xué)、美國梅奧診所、美國圣安東尼奧醫(yī)院、美國克利夫蘭診所和美國南卡萊羅納醫(yī)科大學(xué)，其中辛辛那提大學(xué)、圣安東尼奧醫(yī)院和南卡萊羅納醫(yī)科大學(xué)屬于同一聚類，在這一聚類里發(fā)生合作的機(jī)構(gòu)數(shù)量最多。圖3顯示了以美國梅奧診所為代表、美國哈佛大學(xué)為代表、以英國皇家布朗登醫(yī)院和美國范德堡大學(xué)為代表的小型聚類。日本京都大學(xué)與滋賀成人醫(yī)學(xué)中心、英國皇家布朗登醫(yī)院與英國倫敦大學(xué)帝國理工學(xué)院、美國國立猶太人醫(yī)學(xué)研究中心之間相較于其他機(jī)構(gòu)合作較早。

圖3 結(jié)節(jié)病文獻(xiàn)的機(jī)構(gòu)合作網(wǎng)絡(luò)圖譜主要部分

2.3 結(jié)節(jié)病文獻(xiàn)的國家合作網(wǎng)絡(luò)圖譜 在結(jié)節(jié)病的國家合作網(wǎng)絡(luò)圖譜中(圖4，封三)，每一引文年代環(huán)的厚度代表這一國家發(fā)文的數(shù)量，引文年代環(huán)之間的連線多少代表合作的密切程度，粗細(xì)代表合作發(fā)表文獻(xiàn)的數(shù)量，顏色則代表首次合作的時間。從圖可知，共有85個國家對結(jié)節(jié)病進(jìn)行了研究，其中發(fā)文量前5位的國家分別是美國、日本、法國、德國和英國，美國以頻次1 820位居榜首。澳大利亞與泰國之間存在著深色連線，說明這兩個國家在2007年已展開了合作；英國與捷克、美國與丹麥、瑞典與斯洛文尼亞存在著淺色連線，說明這些國家合作時間也比較早。

2.4 結(jié)節(jié)病關(guān)鍵詞共現(xiàn)網(wǎng)絡(luò)圖譜 通過關(guān)鍵詞共現(xiàn)網(wǎng)絡(luò)，可推測十年間結(jié)節(jié)病的重點研究內(nèi)容，其中結(jié)節(jié)病的診斷、肺結(jié)節(jié)病和結(jié)節(jié)病治療的文獻(xiàn)數(shù)量最多。結(jié)節(jié)病的診斷、正電子發(fā)射計算機(jī)斷層顯像、肺結(jié)核的中心性最高，由此可知結(jié)節(jié)病診斷和肺結(jié)節(jié)病是結(jié)節(jié)病最重要的關(guān)鍵詞。心臟結(jié)節(jié)病呈現(xiàn)出引文激增的狀態(tài)，曾在某一時間段內(nèi)被頻繁出現(xiàn)，說明心臟結(jié)節(jié)病也是研究的熱點之一。見圖5（封三）。

2.5 結(jié)節(jié)病共被引文獻(xiàn)的合并網(wǎng)絡(luò)圖譜 在結(jié)節(jié)病共被引文獻(xiàn)的合并網(wǎng)絡(luò)圖譜中(圖6，封三)，最突出的文章是Iannuzzi-2007[5]，通過檢索并通讀原文得知，此篇文獻(xiàn)為新英格蘭雜志上關(guān)于結(jié)節(jié)病的一篇綜述，這篇文章從結(jié)節(jié)病的流行病學(xué)、環(huán)境因素、遺傳特征、免疫發(fā)病機(jī)理、臨床特征、診斷、累及的器官、兒童結(jié)節(jié)病、治療和未來的發(fā)展方向進(jìn)行了全面總結(jié)。其他高被引文獻(xiàn)，如Hunninghake-1999(AM J RESP CRIT CARE)、Baughman-2001、Newman-19 97等9篇文獻(xiàn)十年間的引用次數(shù)皆＞200次；圖6中右上方和左下方的聚類是最新形成的共被引關(guān)系，分別屬于呼吸和心臟兩個方面的聚類。最主要的聚類為sarcoidosis聚類和cardiac聚類，兩者是通過Mehta-2008建立起的連接，Mehta-2008主要探討了心臟結(jié)節(jié)病患者的診斷和門診檢查的預(yù)后價值[6]，文中提及心臟結(jié)節(jié)病患者的發(fā)病率和死亡率非常高，因此，早期診斷和風(fēng)險分級非常重要，由于這是一篇有關(guān)心臟結(jié)節(jié)病患者門診檢查方面的研究，因此，與兩個主要聚類都相關(guān)聯(lián)。

2.6 結(jié)節(jié)病共被引文獻(xiàn)的合并網(wǎng)絡(luò)時間線視圖 在共被引文章的合并網(wǎng)絡(luò)時間線視圖中(圖7，封三)，可見在1975年之前結(jié)節(jié)病研究沒有重大進(jìn)展。1976年有學(xué)者發(fā)表了有關(guān)心臟結(jié)節(jié)病的文獻(xiàn)，對致死性心肌結(jié)節(jié)病的臨床病理進(jìn)行了詳細(xì)闡述[7]，此后，學(xué)者們開始了對心臟結(jié)節(jié)病的進(jìn)一步研究。1995年前后，有關(guān)結(jié)節(jié)病的研究迅速興起，近年來心臟結(jié)節(jié)病已成為研究熱門。雖然有關(guān)呼吸系統(tǒng)結(jié)節(jié)病的經(jīng)典文獻(xiàn)較少，但最近兩年也有學(xué)者開始這方面的研究。針對肝炎方面的結(jié)節(jié)病研究，文獻(xiàn)數(shù)量相對較少，且文獻(xiàn)間的聯(lián)系較弱，呈現(xiàn)出孤立狀態(tài)的節(jié)點。至于有關(guān)吸入性結(jié)節(jié)病的相關(guān)文獻(xiàn)，則相對集中在2004—2011年，并且此后無更多文獻(xiàn)報道。

3 討論

利用CiteSpace生成某一領(lǐng)域的知識圖譜[8]，可有不同的可視化結(jié)果與形式，但不管是哪一種，都能通過相應(yīng)的調(diào)整發(fā)現(xiàn)這一領(lǐng)域中的經(jīng)典文獻(xiàn)、研究熱點、研究趨勢等內(nèi)容[9-10]。

通過作者的合作網(wǎng)絡(luò)圖譜推測不同的聚類，是由于學(xué)者間的研究重點不同而造成的。通過機(jī)構(gòu)的合作網(wǎng)絡(luò)圖譜，可知美國的研究機(jī)構(gòu)占主導(dǎo)地位，整體來說，機(jī)構(gòu)間的合作不夠緊密，需加強(qiáng)機(jī)構(gòu)間的聯(lián)系。通過國家的合作網(wǎng)絡(luò)圖譜，可知美國、日本、法國、德國和英國是研究結(jié)節(jié)病的主要力量，尤其是美國占據(jù)著核心地位，全球間的合作尚未形成，仍需進(jìn)一步加強(qiáng)國際間的交流。通過關(guān)鍵詞共現(xiàn)網(wǎng)絡(luò)圖譜，提示研究前沿為結(jié)節(jié)病診斷和肺結(jié)節(jié)病方面，心臟結(jié)節(jié)病也是研究的熱點之一。通過共被引文獻(xiàn)的合并網(wǎng)絡(luò)圖譜及時間線視圖，說明近期學(xué)者們在呼吸和心臟結(jié)節(jié)病兩個方面繼續(xù)做深入研究，由于有關(guān)肺結(jié)節(jié)病的文獻(xiàn)數(shù)量較少，但近期又被學(xué)者引用，推測呼吸系統(tǒng)結(jié)節(jié)病可能是未來的一個重要研究方向。

本研究嘗試了對結(jié)節(jié)病的初步探索，還存在很多的不足之處，如數(shù)據(jù)閾值的設(shè)定僅使用了系統(tǒng)默認(rèn)的設(shè)置辦法，圖譜某些觀點解讀具有很大的主觀性判斷，沒有充分進(jìn)行結(jié)節(jié)病專家的觀點調(diào)研，也未請專家進(jìn)行研究結(jié)果的判讀，在以后的研究中，筆者將針對這些不足進(jìn)行深入的研究與改進(jìn)，以期得到更為客觀深入的結(jié)論。

總體而言，心臟結(jié)節(jié)病、結(jié)節(jié)病的診斷、肺結(jié)節(jié)病是結(jié)節(jié)病的主要涉及領(lǐng)域。文獻(xiàn)作者和合作機(jī)構(gòu)，以及所屬的國家多集中于美國、日本、法國、德國和英國。

[1] Ungprasert P, Carmona EM, Utz JP, et al. Epidemiology of sarcoidosis 1946-2013: a population-based study[J]. Mayo Clin Proc, 2016, 91(2): 183-188.

[2] Chen C. CiteSpace Ⅱ: Detecting and visualizing emerging trends and transient patterns in scientific literature[J]. JASIST, 2006, 57(3): 359-377.

[3] 陳超美，陳悅，侯劍華，等．CiteSpaceⅡ:科學(xué)文獻(xiàn)中新趨勢與新動態(tài)的識別與可視化[J]．情報學(xué)報，2009，28(3)：401-421．

[4] Wei F, Grubesic TH, Bishop BW. Exploring the GIS knowledge domain using CiteSpace[J]. Professional Geographer, 2015, 67(3): 374-384.

[5] Iannuzzi MC, Rybicki BA, Teirstein AS. Sarcoidosis[J]. N Engl J Med, 2007, 357(21): 2153-2165.

[6] Mehta D, Lubitz SA, Frankel Z, et al. Cardiac involvement in patients with sarcoidosis: diagnostic and prognostic value of outpatient testing[J]. Chest, 2008, 133(6): 1426-1435.

[7] Matsui Y, Iwai K, Tachibana T, et al. Clinicopathological study of fatal myocardial sarcoidosis[J]. Ann N Y Acad Sci, 1976, 278(1): 455-469.

[8] 陳悅，劉則淵．悄然興起的科學(xué)知識圖譜[J]．科學(xué)學(xué)研究，2005，23(2)：149-154．

[9] 蔡建東，馬婧，袁媛．國外CSCL理論的演進(jìn)與前沿?zé)狳c問題—基于Citespace的可視化分析[J]．現(xiàn)代教育技術(shù)，2012，22(5)：10-16．

[10] Wang L, Zhang Q, Qiu M. Evolution and trends in decision-making under uncertainty on neuroscience and psychology: a scientometric analysis in CiteSpace[J]. JDCTA, 2012, 6(19): 181-188.

R512

A

1672-7185(2017)05-0036-05

10.3969/j.iss n.1672-7185.2017.05.014

2017-04-06）

《中國實用鄉(xiāng)村醫(yī)生雜志》“遠(yuǎn)程稿件處理系統(tǒng)”運行通知

龍莉艷。1626608485@qq.com

學(xué)習(xí)需求驅(qū)動下的數(shù)字出版資源定制投送系統(tǒng)及應(yīng)用示范(國家科技支撐計劃)子課題：機(jī)構(gòu)/個人數(shù)字圖書館與出版物投送(課題編號2013BAH47F03)

《中國實用鄉(xiāng)村醫(yī)生雜志》（以下簡稱“我刊”）創(chuàng)刊于1994年，是國家衛(wèi)生計生委主管、中國醫(yī)師協(xié)會和中國醫(yī)科大學(xué)聯(lián)合主辦的國家級綜合性醫(yī)學(xué)學(xué)術(shù)期刊。雖然在20多年中我刊取得了長足的進(jìn)步，但我們不滿足于現(xiàn)狀，為適應(yīng)社會發(fā)展和時代要求，進(jìn)一步為國家的醫(yī)學(xué)事業(yè)做出貢獻(xiàn)，我刊將努力提升辦刊能力，增加發(fā)行量，強(qiáng)化雜志的學(xué)術(shù)媒介平臺作用，提高編審的工作效率，與國內(nèi)和國際期刊發(fā)展接軌。我刊已于2016年4月運行“遠(yuǎn)程稿件處理系統(tǒng)”，實現(xiàn)在線投稿、審稿等一系列工作，廣大作者可對自己的稿件處理流程有更加直觀明確的了解，敬請關(guān)注！

網(wǎng)址：http://xcys.cmu.edu.cn/