黃海鋒,葛勇勝,劉文斌,馬金良
肝癌以病死率高[1]、生存周期短、復(fù)發(fā)率高為顯著特征,手術(shù)治療的局限性造成治療效果較差,因而手術(shù)之外新的治療方法對提高患者生存率具有重要意義。全基因組測序分析表明多數(shù)基因被轉(zhuǎn)錄為非編碼RNA(non-coning RNAs,ncRNAs),主要包括微小RNA(microRNAs)和長的非編碼RNA(long non-coning RNAs, lncRNAs)[2]。lncRNAs是一類長度大于200個核苷酸的非編碼單鏈RNA,多數(shù)lncRNAs的轉(zhuǎn)錄高度保守,在細(xì)胞內(nèi)受到嚴(yán)格的調(diào)控。lncRNAs在腫瘤細(xì)胞的增殖、侵襲等生物學(xué)過程中具有明確的調(diào)節(jié)作用。lncRNA GAS5(growth arrest-specific transcript 5,GAS5)是由mTOR通路控制穩(wěn)定翻譯的5’-TOP RNA,在人T淋巴細(xì)胞生長停滯中起重要作用的非編碼RNA[3],最先從nih3t3型老鼠的纖維母細(xì)胞中分離而來[4]。GAS5在包括結(jié)直腸癌[5]、乳腺癌[6]、宮頸癌[7]、非小細(xì)胞肺癌[8-9]、胰腺癌、前列腺癌[10-11]等多種腫瘤細(xì)胞中表達,腫瘤細(xì)胞中低表達預(yù)示較差的生存周期[6,9,12],但不同腫瘤GAS5的轉(zhuǎn)錄調(diào)控機制具有明顯差異,在前列腺癌中通過靶向控制P27Kip1作用調(diào)控細(xì)胞增殖[13],在神經(jīng)母細(xì)胞瘤中通過激活BRCA1和p53來調(diào)節(jié)細(xì)胞周期和凋亡[14],在結(jié)直腸癌中作為腫瘤抑制因子抑制白介素-10和血管內(nèi)皮生長因子表達來影響細(xì)胞增殖和遷移[5]。在肝癌方面,其表達調(diào)控機制研究甚少。該研究通過檢測GAS5表達水平變化以及在細(xì)胞周期調(diào)控中具有重要作用的相關(guān)蛋白檢測,來分析其對肝癌細(xì)胞系增殖、遷移、侵襲作用,并進一步推測其可能調(diào)控的靶點,為肝癌的靶向治療尋求新的靶點。
1.1病理標(biāo)本及主要實驗試劑收集安徽省立醫(yī)院肝臟外科2016年6月~12月肝癌組織及對應(yīng)遠(yuǎn)癌旁組織(距癌組織邊緣>2 cm)共20例,術(shù)后病理均為肝細(xì)胞性肝癌,病理標(biāo)本取下直接保存于-80 ℃的液氮中保存?zhèn)溆?。組織研究用途均告知家屬并予以簽署同意書。TRIzol試劑購自美國Life technogies 公司;DNA標(biāo)記試劑盒QuantiNova SyBr Green PCR Kit購自德國Qiagen公司 ;反轉(zhuǎn)錄試劑盒RevertAidTMfirst Strand cDNA Synthesis購自美國Thermo Scientific公司;細(xì)胞周期依賴性蛋白激酶6(cell division protein kinase 6,CDK6)一抗購自美國Bioss公司;細(xì)胞周期蛋白D1(Cyclin D1)一抗及細(xì)胞增殖檢驗CCK-8試劑盒(cell counting Kit-8,CCK-8)購自美國bio-teche公司;細(xì)胞因子E2F-1一抗購自上海瑞齊實業(yè)科技有限公司;肝癌HepG2細(xì)胞株購自上海細(xì)胞庫。
1.2實驗方法
1.2.1組織RNA提取及qRT-PCR 組織RNA經(jīng)TRIzol試劑溶解提取,經(jīng)逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)制備成cDNA,以β-actin作為內(nèi)參,人β-actin擴增子的大小為180 bp,正向引物:5’-GGGAAATCGTGCGTGACATTAAGG-3’,反向引物:5’-CAGGAAGGAAGGCTGGAAGAGTG -3’;人 GAS-5擴增子大小為115 bp,正向引物:5’-CACAACAAGCAAGCATGCAG-3’,反向引物:5’-GAGGATCACTTGAGCCCAGA-3’。反應(yīng)條件:95 ℃、2 min,95 ℃、5 s,60 ℃、10 s,重復(fù)40個循環(huán)。采用2-ΔΔCt比較分析基因表達。
1.2.2GAS5質(zhì)粒轉(zhuǎn)染實驗 NCBI上查找GAS5的序列,根據(jù)目的基因設(shè)計合成一條具有GAS5的干擾RNA(small interfering RNA,siRNA)組(siRNA-GAS5組)及一條對照siRNA組(siRNA-NC組),同時設(shè)置空轉(zhuǎn)染組(Con組), siRNA-GAS5轉(zhuǎn)染前1天,將2×105個/ml細(xì)胞接種于培養(yǎng)板中,每孔中加入約500 μl無抗生素的培養(yǎng)基。取1 μl/孔lipo2000,用50 μl opti-MEM無血清培養(yǎng)基稀釋,并室溫孵育5 min。取2 μl siRNA,以50 μl opti-MEM無血清培養(yǎng)基稀釋,混勻。兩種液體輕輕混勻,室溫靜置20 min。加入含有細(xì)胞及培養(yǎng)液的孔中,混勻。轉(zhuǎn)染6 h后,換為含血清的完全培養(yǎng)基。細(xì)胞收集后PCR檢測確認(rèn)GAS5表達下降后,細(xì)胞予以備用。
1.2.3細(xì)胞劃痕實驗 取對數(shù)生長周期細(xì)胞,以2×105個/ml、每孔接種2 ml細(xì)胞液,過夜,愈合度100%時,棄去培養(yǎng)基,開始劃線。劃線與板底橫線交叉點即為固定觀察點;劃痕后按0、48 h時間點拍照。測定各組細(xì)胞在0、48 h觀察點的劃痕寬度,計算遷移率(%)=(0 h劃痕寬度-48 h劃痕寬度)/0 h劃痕寬度×100%。
1.2.4Transwell實驗 Matrigel膠與DMEM培養(yǎng)基按1 ∶9混勻制成稀釋液。小室濾膜均勻涂抹50 μl稀釋液,37 ℃、5% CO2恒溫箱滯留2 h,取出涂抹DMEM培養(yǎng)基50 μl 恒溫箱滯留2 h。取3組培養(yǎng)24 h細(xì)胞,0.25%胰酶消化,1 000 r/min離心 5 min, DMEM 培養(yǎng)液得下層細(xì)胞,計數(shù),細(xì)胞密度調(diào)為1×106個/ml。上室加下層細(xì)胞液各200 μl,下室加600 μl 30% FBS的DMEM培養(yǎng)液,每組細(xì)胞設(shè)3個復(fù)孔。取出小室,上室培養(yǎng)液吸除,PBS浸潤2 min,共3次,擦凈上室表面Martrigel膠,95%酒精固定30 min,結(jié)晶紫染色15 min,晾干。拍照、計數(shù):200倍顯微鏡下計算出穿膜細(xì)胞均數(shù)。
1.2.5CCK-8檢測細(xì)胞增殖 待檢測細(xì)胞計數(shù),并度鋪于96孔板。確定細(xì)胞貼壁后,繼續(xù)培養(yǎng)2~4 h使其貼壁緊密。WST-8混合液儲存液用PIPES緩沖液稀釋10倍到使用濃度。96孔板每個孔加入10 μl CCK-8溶液,在培養(yǎng)箱中繼續(xù)孵育0.5~4 h。顯色反應(yīng)后,加入終止液10 μl,終止反應(yīng),酶標(biāo)儀450 nm測定吸光度,每個樣本做3個復(fù)孔實驗。根據(jù)OD450值繪制0、24、48、72、96 h增殖曲線。
1.2.6Western blot檢測 組織樣品稱重100 mg,加入RIPA細(xì)胞裂解液1 ml(內(nèi)含1 mmol/L PMSF),提取組織總蛋白。蛋白按照1 ∶4加入5×SDS-PAGE蛋白上樣緩沖液,沸水浴10 min變性,經(jīng)電泳、轉(zhuǎn)膜、封閉后,一抗、二抗孵育,使用ECL超敏發(fā)光試劑盒來檢測蛋白。細(xì)胞實驗方案同組織實驗。
2.1GAS5、CDK6在肝癌組織、癌旁組織表達情況20對肝癌及對應(yīng)癌旁組織qRT-PCR和Western blot實驗證實GAS5和CDK6在肝癌和癌旁組織中均出現(xiàn)表達,qRT-PCR結(jié)果表明GAS5在肝癌組織相對表達量(0.49±0.47)低于癌旁組織(1.12±0.53),差異有統(tǒng)計學(xué)意義(t=16.22,P<0.01),見圖1,CDK6在80%(16/20)的肝癌組織出現(xiàn)高表達,表達明顯高于癌旁組織(圖2)。
圖1 GAS5在癌組織與癌旁組織相對表達量對比
圖2 Western blot檢測20組肝癌組織與癌旁組織CDK6表達情況
2.2GAS5對HepG2細(xì)胞侵襲、遷移、增殖影響與轉(zhuǎn)染siRNA-GAS5組(60.0±5.00)比較,siRNA-NC組(29.66±5.03)和Con組(28.33±9.07)的HepG2細(xì)胞劃痕實驗結(jié)果表明遷移能力差異有統(tǒng)計學(xué)意義(F=21.76,P<0.01);Con組與siRNA-NC組差異無統(tǒng)計學(xué)意義 (圖3)。Transwell實驗表明,與siRNA-NC組(38.7±5.69)和Con組(32.0±10.1)比較, 轉(zhuǎn)染siRNA-GAS5組(61.57±7.60)HepG2細(xì)胞形態(tài)差異大,穿過Martrigel膠細(xì)胞數(shù)增多,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(F=8.80,P<0.05), 而siRNA-NC組與Con組差異無統(tǒng)計學(xué)意義(圖4)。CCK-8檢測干擾后的細(xì)胞在450 nm OD值表明,隨時間變化均出現(xiàn)吸光度增長趨勢,在96 h測量結(jié)果顯示,與siRNA-GAS5組(0.76±0.07)比較,siRNA-NC組(0.54±0.02)和Con組(0.56±0.03)差異有統(tǒng)計學(xué)意義(F=14.21,P<0.01),siRNA-NC組和Con組間差異無統(tǒng)計學(xué)意義(圖5)。
圖3 經(jīng)siRNA干擾后HepG2細(xì)胞遷移率比較
A:siRNA-GAS5組;B:siRNA-NC組;C:Con組;1:0 h;2:48 h;與siRNA-NC組比較:**P<0.01;與Con組比較:##P<0.01
圖4 經(jīng)siRNA的HepG2細(xì)胞侵襲性比較 ×200
A:siRNA-GAS5組24 h侵襲圖;B:siRNA-NC組24 h侵襲圖;C:Con組24 h侵襲圖;與siRNA-GAS5組比較:*P<0.05;與Con組比較:#P<0.05
圖5 轉(zhuǎn)染siRNA后HepG2細(xì)胞OD450值比較
2.3經(jīng)siRNA-GAS5轉(zhuǎn)染后的HepG2細(xì)胞周期相關(guān)蛋白表達影響經(jīng)siRNA-GAS5質(zhì)粒轉(zhuǎn)染后的HepG2細(xì)胞內(nèi)Cyclin D1、CDK6、E2F-1 mRNA相對表達量均出現(xiàn)上調(diào),與siRNA-NC組和Con組比較差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.01)。見表1、圖6。
2.4GAS5的下調(diào)對HepG2細(xì)胞周期變化影響經(jīng)GAS5-siRNA干擾48 h后的G1、S、G2期細(xì)胞百分比變化(39.73±3.21、43.03±4.72、16.25±8.69vs50.51±4.98、35.40±5.28、17.10±4.25)。由各細(xì)胞百分比變化可知,與siRNA-NC組比較,siRNA-GAS5組細(xì)胞周期在G1期出現(xiàn)降低,S期出現(xiàn)升高,siRNA-GAS5組與siRNA-NC組在G1期與S期發(fā)生明顯轉(zhuǎn)變(圖7)。
表1 轉(zhuǎn)染siRNA及空白組相關(guān)蛋白mRNA表達量
與siRNA-NC組比較:**P<0.01;與Con組比較:##P<0.01
圖6 siRNA干擾后的HepG2細(xì)胞周期相關(guān)蛋白表達及相應(yīng)mRNA相對表達量比較
A: Western blot檢測CDK6、Cyclin D1、E2F-1 蛋白表達; B: CDK6 mRNA相對表達量; C: Cyclin D1 mRNA相對表達量; D: E2F-1 mRNA相對表達量;1:siRNA-NC組;2:Con組;3:siRNA-GAS5組;與siRNA-NC組比較:**P<0.01;與Con組比較:##P<0.01
圖7 GAS5參與細(xì)胞周期調(diào)控
A:流式細(xì)胞儀檢測siRNA-NC轉(zhuǎn)染的周期計數(shù)圖;B:流式細(xì)胞儀檢測siRNA-GAS5轉(zhuǎn)染的周期計數(shù)圖;C:siRNA-GAS5和siRNA-NC轉(zhuǎn)染后GAS5相對表達量;D:經(jīng)siRNA-GAS5與siRNA-NC轉(zhuǎn)染48 h各周期細(xì)胞百分比;與siRNA-GAS5組比較:**P<0.01
近年來,已發(fā)現(xiàn)多種lncRNAs在細(xì)胞功能調(diào)節(jié)上具有重要作用,研究[6]表明GAS5具有抑制小膠質(zhì)細(xì)胞M2的極化以及加劇了脫髓鞘作用。GAS5調(diào)控TGF-β介導(dǎo)的平滑肌細(xì)胞分化通過結(jié)合RNA-smad實現(xiàn)[11];GAS5是一個參與細(xì)胞生物調(diào)控的lncRNA,通過與E2F1相互作用和引誘其與P27Kip1啟動子結(jié)合來抑制前列腺癌增殖[15]。其主要在腫瘤抑制和致癌基因表達調(diào)控方面發(fā)揮作用,這些實例充分說明GAS5可作為腫瘤進展過程中重要的功能性調(diào)控因子,其異常表達參與腫瘤相關(guān)蛋白差異性表達促使腫瘤發(fā)生。
多數(shù)腫瘤發(fā)生發(fā)展是因GAS5在癌組織中出現(xiàn)下調(diào)所致,例如乳腺癌、胰腺癌、膀胱癌、非小細(xì)胞肺癌等。本研究首先對肝癌組織與其對應(yīng)的癌旁組織PCR檢測結(jié)果顯示GAS5表達下降,前期實驗選取肝癌表型中常見的HepG2細(xì)胞,經(jīng)PCR檢測顯示其GAS5表達量較正常肝細(xì)胞明顯下調(diào),為探討GAS5對HepG2細(xì)胞增殖遷移能力及其對HepG2細(xì)胞周期影響作用,本研究對HepG2細(xì)胞進行siRNA-GAS5干擾實驗,PCR檢測干擾后HepG2出現(xiàn)GAS5明顯下調(diào)的細(xì)胞再分別進行細(xì)胞劃痕遷移實驗、Transwell實驗以及CCK-8檢測干擾后細(xì)胞增殖OD值,實驗顯示經(jīng)GAS5-siRNA干擾的HepG2細(xì)胞株較siRNA-NC組、Con組的HepG2細(xì)胞,其細(xì)胞的遷移能力、侵襲能力、增殖能力都出現(xiàn)增強,對于siRNA-NC與未經(jīng)siRNA干擾的HepG2相比,其三者能力為出現(xiàn)明顯改變。說明GAS5在肝癌細(xì)胞生物學(xué)特性方面具有重要的抑制腫瘤增殖侵襲作用。GAS5可作為一個腫瘤抑癌因子抑制肝癌細(xì)胞體外侵襲轉(zhuǎn)移。
在細(xì)胞周期的調(diào)控中GAS5同樣具有明顯的抑制或促進凋亡作用。體外對宮頸癌細(xì)胞增殖研究中表明,上調(diào)的GAS5抑制細(xì)胞增殖、遷移和凋亡是通過降低細(xì)胞內(nèi)miR-196a和miR-205水平[10];此外GAS5的表達同樣在前列腺癌中出現(xiàn)低表達,GAS5的異位表達抑制了細(xì)胞增殖和調(diào)控細(xì)胞周期停留在G0/G1期,GAS5-siRNA干擾下調(diào)GAS5時又促進G1-S相過度。這些研究證實在腫瘤進展期中,GAS5通過不同的調(diào)控通路調(diào)控細(xì)胞周期來抑制腫瘤細(xì)胞進展已十分確切。本研究通過MTT實驗檢測經(jīng)GAS5-siRNA干擾下調(diào)GAS5的HepG2細(xì)胞,相對于未進行轉(zhuǎn)染和siRNA-NC轉(zhuǎn)染組的HepG2細(xì)胞來說,其細(xì)胞周期發(fā)生明顯改變,處于 G0/G1期細(xì)胞減少,而S期細(xì)胞明顯增多,證實在肝癌細(xì)胞內(nèi)的GAS5的水平含量與細(xì)胞周期改變相關(guān),這和宮頸癌、前列腺癌的細(xì)胞周期研究得到相似的結(jié)果,但不同細(xì)胞內(nèi)因其細(xì)胞分化方向不同,細(xì)胞生物特性有所差異,其表達的功能性蛋白不同,GAS5在不同細(xì)胞內(nèi)對細(xì)胞周期的調(diào)控機制也不盡不同。
研究[15]表明與細(xì)胞周期調(diào)控密切相關(guān)的Ras下游通路的周期蛋白依賴性激酶系統(tǒng)、Cyclin D蛋白家族與消化系統(tǒng)中的胃癌和胰腺癌有密切的關(guān)系。通過CDK6和Cyclin D1以及其下游調(diào)控的E2F-1研究,推斷GAS5參與細(xì)胞周期調(diào)控的潛在機制。Western blot檢測肝癌和癌旁組織表明CDK6與GAS5表達水平呈現(xiàn)負(fù)相關(guān)關(guān)系,二者間可能存在潛在的直接或間接調(diào)控關(guān)系,進一步對經(jīng)siRNA-GAS5轉(zhuǎn)染的HepG2細(xì)胞Cyclin D1、CDK6、E2F-1蛋白進行Western blot與PCR檢測,低表達GAS5的HepG2細(xì)胞中Cyclin D1、CDK6 、E2F-1均出現(xiàn)表達水平的上升, 細(xì)胞內(nèi)Cyclin D1蛋白出現(xiàn)異常表達,可能和GAS5通過Ras-MAPK途徑來激活Cyclin D1基因的轉(zhuǎn)錄有關(guān),E2F-1蛋白水平上調(diào)證實GAS5同樣參與HepG2細(xì)胞細(xì)胞周期調(diào)控,這與Shan et al[15]研究相符。MTT結(jié)果驗證GAS5對細(xì)胞周期的調(diào)控主要在G1/S期轉(zhuǎn)變,這與細(xì)胞內(nèi)Cyclin D1通過與CDK6形成復(fù)合物激活底物pRb的磷酸化相關(guān),pRb的磷酸化使得與pRb結(jié)合的組蛋白脫乙酰基蛋白(HDAC)破環(huán),生成E2F-1明顯增加,E2F-1是細(xì)胞周期進展到S期所需細(xì)胞周期因子。HepG2細(xì)胞周期相關(guān)蛋白上調(diào)驗證其與GAS5表達密不可分。