張韶輝,劉劍敏,胡 松
武漢市第一醫(yī)院藥學(xué)部,武漢 430022
乳腺癌的發(fā)病率近十年在全球呈上升趨勢(shì)[1-2]。在發(fā)展中國(guó)家,乳腺癌是女性癌癥相關(guān)死亡的主要原因之一[3]。對(duì)于早期乳腺癌會(huì)采用手術(shù)、化療、放療等治療手段,乳腺癌患者的平均生存率正在逐漸提高,但仍然有30%~40%的乳腺癌會(huì)發(fā)生轉(zhuǎn)移[4]。
PPARγ共激活劑1α(PGC-1α)屬于轉(zhuǎn)錄輔激活因子(PPARg coactivators,PGC)家族,在調(diào)節(jié)線粒體生物合成和能量代謝中發(fā)揮關(guān)鍵作用[5]。研究證實(shí),PGC-1α不僅在乳腺癌中表達(dá)下調(diào),而且可能作為腫瘤抑制因子發(fā)揮作用[6-7]。microRNAs(miRNAs)是一組進(jìn)化保守的非編碼小RNA,其功能是通過結(jié)合位于靶基因3′非翻譯區(qū)(3′UTR)的互補(bǔ)DNA序列來(lái)抑制下游靶基因的表達(dá)。miRNA已被證明在人類乳腺癌的發(fā)生、細(xì)胞增殖、細(xì)胞周期進(jìn)展和轉(zhuǎn)移等過程的調(diào)控中起關(guān)鍵作用[8]。此外,miRNAs誘導(dǎo)了乳腺癌中的各種下游信號(hào)通路,如p27 Kip1和NF-κB[9-10]。近期研究證實(shí),microRNA-217(miR-217)在乳腺癌中高表達(dá),并且miR-217的表達(dá)抑制對(duì)乳腺癌細(xì)胞的增殖和細(xì)胞周期進(jìn)程具有顯著的抑制作用[11]。
為探明乳腺癌細(xì)胞中miR-217與PGC-1α可能的相互作用與調(diào)控關(guān)系,本研究首次采用雙熒光素酶活性測(cè)定法檢測(cè)miR-217與PGC-1α基因的作用。并以下調(diào)miR-217表達(dá)的乳腺癌細(xì)胞系為對(duì)象,檢測(cè)miR-217對(duì)PGC-1α基因和蛋白表達(dá)的影響。進(jìn)一步通過siRNA敲低miR-217表達(dá)下調(diào)的乳腺癌細(xì)胞中的PGC-1α,探討miR-217靶向調(diào)節(jié)PGC-1α對(duì)乳腺癌細(xì)胞增殖和細(xì)胞周期的影響。
人乳腺癌細(xì)胞系MCF-7來(lái)源于武漢中科院細(xì)胞庫(kù),DMEM培養(yǎng)液和胎牛血清、miR-217-mimics及陰性對(duì)照(miR-mc)、RNA提取試劑盒及反轉(zhuǎn)錄試劑盒、MTT試劑盒均購(gòu)自ThermoFisher Scientific公司,miR-217抑制物及陰性對(duì)照購(gòu)自廣州Ribobio公司。雙熒光素酶報(bào)告試劑盒購(gòu)自Promega公司,實(shí)時(shí)定量PCR試劑盒購(gòu)自Apple BioSosits公司,PGC-1α抗體購(gòu)自Santa Cruz Biotechnology公司。Si-PGC-1α、Si-DACH1及其陰性對(duì)照siRNA(Si-C)購(gòu)自GE DeMaCon。
使用在線miRNA靶標(biāo)預(yù)測(cè)工具TargetScan(www.targetscan.org)對(duì)靶向結(jié)合PGC-1α 3′UTR的miRNA進(jìn)行預(yù)測(cè)。
將PGC-1α基因的3′UTR插入到psi-CHECK-2質(zhì)粒海腎熒光素酶基因中,構(gòu)建psi-CHECK-PGC-1α-3′UTR質(zhì)粒。將PGC-1α 3′UTR區(qū)突變,并插入psi-CHECK-2質(zhì)粒中,產(chǎn)生突變psi-CHECK-PGC-1α-mut-3′UTR質(zhì)粒。在體外培養(yǎng)人HEK-293T細(xì)胞中,將miR-217-mimics與PGC-1α-3′UTR或PGC-1α-mut-3′UTR共轉(zhuǎn)染48 h。比較共轉(zhuǎn)染HEK-293T細(xì)胞的相對(duì)熒光素酶活性。
MCF-7細(xì)胞用含10%FBS的DMEM培養(yǎng)液,置于5%CO2、37 ℃的恒溫培養(yǎng)箱中培養(yǎng),收集對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期的細(xì)胞接種于6孔板上。按照轉(zhuǎn)染試劑盒說(shuō)明書,將miR-217抑制物(miR-217-inhibitor)或陰性對(duì)照miR-IC及6 μg/mL polybrene與細(xì)胞共孵育。轉(zhuǎn)染72 h之后更換新鮮培養(yǎng)液并傳代1~2周以穩(wěn)定轉(zhuǎn)染效果。實(shí)時(shí)熒光定量聚合酶鏈反應(yīng)檢測(cè)轉(zhuǎn)染效率。
使用Trizol提取總RNA,提取后使用NanoDro ND-1100分光光度計(jì)檢測(cè)樣品的濃度與純度。miR-217測(cè)定采用TaqMan microRNA檢測(cè)試劑盒,PGC-1α測(cè)定采用SyBR qRT-PCR檢測(cè)試劑盒,以sonRNU202作為內(nèi)參照。反應(yīng)條件為95℃ 2 min;95℃ 10 s,55℃ 15 s,72℃ 10 s,循環(huán)40次。PCR擴(kuò)增產(chǎn)物檢測(cè)采用ABI7900 Real-time PCR system進(jìn)行,結(jié)果以2-ΔΔCt進(jìn)行定量分析。
將蛋白提取緩沖液加入到轉(zhuǎn)染后的MCF-7細(xì)胞中,收集其細(xì)胞裂解液并測(cè)定蛋白濃度。將30 mg稀釋的蛋白質(zhì)加樣到0.8%聚丙烯酰胺凝膠電泳,再電轉(zhuǎn)移到PVDF膜上。在室溫下,用5%的脫脂牛奶在TBST緩沖液中封閉1 h后,分別加入PGC-1α(1∶100)和DACH1(1∶500)一抗,4℃孵育過夜。清洗3次(TBST,每次10 min)后,加入辣根過氧化物酶標(biāo)記的二抗(1∶2000)室溫孵育2 h,TBST清洗2次后加入免疫印跡化學(xué)發(fā)光試劑進(jìn)行放射自顯影。
將4×104~5×104個(gè)細(xì)胞接種在培養(yǎng)板上,根據(jù)試劑說(shuō)明書使用Dharma FECT siRNA轉(zhuǎn)染試劑對(duì)細(xì)胞進(jìn)行PGC-1α siRNA及DACH1 siRNA轉(zhuǎn)染。ON-TARGET plus Non-targeting siRAN作為陰性對(duì)照進(jìn)行轉(zhuǎn)染,24 h之后用qRT-PCR法驗(yàn)證轉(zhuǎn)染效率。
將對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期MCF-7細(xì)胞接種于96孔板中(5×103細(xì)胞/孔),置于37 ℃含5%CO2的培養(yǎng)箱中培養(yǎng)5 d。然后使用Vybrant MTT細(xì)胞增殖測(cè)定法(ThermoFisher Scientific,USA)檢測(cè)590 nm的吸光度值(A590 nm),以此代表細(xì)胞增殖活力。
MCF-7細(xì)胞在4℃下用70%的乙醇固定1 h,用200~500 μL預(yù)冷的PBS緩沖液重懸細(xì)胞,加入RNase A溶液20 μL,37 ℃水浴30 min后用50 μg/mL碘化丙啶避光染色1 h,使用Fascalibur流式細(xì)胞儀測(cè)量。
使用microRNA靶基因預(yù)測(cè)軟件TargetScan(www.targetscan.org)尋找PGC-1α上游可能的miRNA調(diào)節(jié)因子。候選miRNA的標(biāo)準(zhǔn)是Context++得分大于90%?;诖耍业搅?0個(gè)miRNA候選基因[12-26](表1)。由于PGC-1α在乳腺癌中低表達(dá),因此需要尋找在癌組織中高表達(dá),且有研究提示其在乳腺癌發(fā)生發(fā)展中具有致癌作用的miRNA。最終篩選發(fā)現(xiàn),miR-217很可能是PGC-1α的候選上游調(diào)節(jié)因子,因?yàn)閙iR-17在乳腺癌中被證實(shí)上調(diào),miR-217的抑制對(duì)乳腺癌細(xì)胞系MDA-MB-231[26]的增殖和細(xì)胞周期進(jìn)展有抑制作用。
表1 PGC-1α可能的上游miRNA調(diào)節(jié)因子Table 1 Predicted upstream miRNA regulators of PGC-1α
通過Targetscan預(yù)測(cè)發(fā)現(xiàn),miR-217與PGC-1α的3′UTR存在結(jié)合位點(diǎn)(圖1A)。因此,PGC-1α可能是miR-217的靶基因。雙熒光素酶活性測(cè)定發(fā)現(xiàn),miR-217-mimics組的相對(duì)熒光素酶活性較對(duì)照組顯著下降(圖1B,P<0.05),表明miR-217與PGC-1α基因的野生型3′UTR結(jié)合,可抑制下游的熒光素酶表達(dá),而對(duì)突變型PGC-1α-3′UTR區(qū)的啟動(dòng)無(wú)影響。為進(jìn)一步確認(rèn)PGC-1α是miR-217的靶基因,利用miR-217-inhibitor抑制MCF-7細(xì)胞中內(nèi)源性miR-217表達(dá),qRT-PCR分析顯示miR-217-inhibitor組比miR-IC組表達(dá)水平明顯降低,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(圖1C,P<0.05),表明轉(zhuǎn)染成功。進(jìn)一步qRT-PCR檢測(cè)顯示,轉(zhuǎn)染miR-217-inhibitor的MCF-7細(xì)胞PGC-1α mRNA表達(dá)水平明顯上升(圖1D,P<0.05)。Western blot分析也表明,miR-217-inhibitor轉(zhuǎn)染細(xì)胞PGC-1α的蛋白表達(dá)水平顯著上調(diào)(圖1E)。
A:miR-217與PGC-1α的可能結(jié)合位點(diǎn);B:雙熒光素酶活性測(cè)定;C:qRT-PCR驗(yàn)證miR-217-inhibitor轉(zhuǎn)染效率;D:qRT-PCR檢測(cè)miR-217表達(dá)下調(diào)對(duì)PGC-1α基因表達(dá)的影響;E:Western blot檢測(cè)miR-217表達(dá)下調(diào)對(duì)PGC-1α蛋白表達(dá)的影響;*P<0.05圖1 PGC-1α是miR-217的靶基因Fig.1 miR-217 is the upstream regulator of PGC-1α
已有研究證實(shí)下調(diào)miR-217抑制了乳腺癌細(xì)胞的增殖、導(dǎo)致了細(xì)胞周期的阻滯[11]。為進(jìn)一步證明miR-217通過調(diào)控PGC-1α基因表達(dá)發(fā)揮上述作用,通過siRNA(Si-PGC-1α)轉(zhuǎn)染下調(diào)PGC-1α表達(dá)并設(shè)置相應(yīng)對(duì)照(Si-C)。qRT-PCR顯示,PGC-1α的mRNA水平在Si-PGC-1α轉(zhuǎn)染后被顯著抑制(圖2A,P<0.05)。Western blot分析亦證實(shí),PGC-1α蛋白表達(dá)被下調(diào)(圖2B)。MTT增殖實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,在miR-217表達(dá)下調(diào)的乳腺癌細(xì)胞中,抑制PGC-1α能顯著促進(jìn)細(xì)胞增殖(圖2C,P<0.05)。此外,流式細(xì)胞術(shù)分析顯示,在miR-217表達(dá)下調(diào)的乳腺癌細(xì)胞中,PGC-1α抑制也顯著促進(jìn)了細(xì)胞周期從G0/G1期向S期的轉(zhuǎn)變(圖2D)。
A:qRT-PCR驗(yàn)證siRNA轉(zhuǎn)染效率,*P<0.05;B:Western blot驗(yàn)證siRNA轉(zhuǎn)染效率;C:MTT增殖實(shí)驗(yàn)檢測(cè)PGC-1α表達(dá)抑制對(duì)細(xì)胞增殖的影響,與miR-217-inhibitor/Si-C組比較,*P<0.05;D:流式細(xì)胞術(shù)檢測(cè)PGC-1α表達(dá)抑制對(duì)細(xì)胞周期的影響圖2 miR-217通過調(diào)控PGC-1α基因影響MCF-7細(xì)胞的增殖Fig.2 Inhibition of PGC-1α reverses miR-217-downregulation induced suppression on MCF-7
有研究提示miR-217可通過靶向調(diào)控DACH1促進(jìn)乳腺癌細(xì)胞增殖[11]。因此,我們進(jìn)一步探尋了PGC-1α和DACH1是否在miR-217表達(dá)下調(diào)的乳腺癌中具有功能性相互作用。在PGC-1α/DACH1 siRNA聯(lián)合轉(zhuǎn)染的MCF-7細(xì)胞中進(jìn)行了5 d的MTT增殖試驗(yàn)。結(jié)果表明,下調(diào)PGC-1α表達(dá)后,即使抑制DACH1表達(dá)也能進(jìn)一步促進(jìn)乳腺癌的增殖(圖3A,P<0.05)。此外,流式細(xì)胞術(shù)分析顯示,在miR-217下調(diào)及PGC-1α抑制的乳腺癌細(xì)胞中,即使抑制DACH1表達(dá)也能促進(jìn)細(xì)胞周期從G0/G1期到S期的轉(zhuǎn)變(圖3B)。
上述研究表明PGC-1α和DACH1的信號(hào)通路在miR-217下調(diào)的乳腺癌細(xì)胞中是獨(dú)立的。
A:MTT增殖實(shí)驗(yàn)檢測(cè)PGC-1α及DACH1表達(dá)均抑制后對(duì)細(xì)胞增殖的影響,與miR-217-inhibitor/Si-PGC-1α/Si-C組比較,*P<0.05;B:流式細(xì)胞術(shù)檢測(cè)PGC-1α及DACH1表達(dá)均抑制后對(duì)細(xì)胞周期的影響圖3 miR-217對(duì)乳腺癌細(xì)胞PGC-1α的調(diào)節(jié)作用獨(dú)立于DACH1Fig.3 PGC-1α regulation in miR-217-dwonregulated breast cancer is independent of DACH1
在人類乳腺癌中,雖然發(fā)現(xiàn)PGC-1α在癌組織中的表達(dá)與在正常乳腺上皮組織中的表達(dá)存在差異[6-7],但未證實(shí)它對(duì)乳腺癌有直接調(diào)節(jié)作用[27]。本研究在人類乳腺癌中尋找與PGC-1α相關(guān)的miRNA上游調(diào)控因子。用TargetScan靶基因預(yù)測(cè)軟件發(fā)現(xiàn)了10個(gè)miRNA候選基因,基于miR-217與PGC-1α的結(jié)合Context++ 得分為90%,且miR-217有促進(jìn)乳腺癌細(xì)胞增殖和細(xì)胞周期進(jìn)展的作用[11],我們推測(cè)miR-217可能是乳腺癌中PGC-1α的上游調(diào)節(jié)因子。
本研究結(jié)果證實(shí)了miR-217是人類乳腺癌PGC-1α上游調(diào)節(jié)因子的假設(shè)。首先,共轉(zhuǎn)染雙熒光素酶活性檢測(cè)表明,人miR-217確實(shí)與PGC-1α基因的3′UTR結(jié)合。其次,在下調(diào)miR-217表達(dá)的乳腺癌細(xì)胞系MCF-7細(xì)胞中,PGC-1α mRNA和蛋白水平均顯著上調(diào)。最重要的是,在miR-217表達(dá)下調(diào)的乳腺癌細(xì)胞中,抑制PGC-1α表達(dá)能顯著促進(jìn)癌細(xì)胞增殖及細(xì)胞周期進(jìn)程,這是在乳腺癌體外研究中關(guān)于PGC-1α調(diào)控的一個(gè)新發(fā)現(xiàn),此前未見有研究報(bào)道PGC-1α在乳腺癌調(diào)控中的直接作用。正如我們?cè)谶@項(xiàng)研究中所揭示的,PGC-1α的一般表達(dá)水平似乎對(duì)觸發(fā)乳腺癌的體外調(diào)節(jié)因素及生物學(xué)功能無(wú)效,然而,在miR-217下調(diào)誘導(dǎo)的基礎(chǔ)上,抑制PGC-1α表達(dá)可能具有致癌作用。
已有研究證明DACH1是miR-217的下游靶基因,其高表達(dá)可逆轉(zhuǎn)miR-217誘導(dǎo)的乳腺癌進(jìn)展。因此,我們進(jìn)一步在miR-217表達(dá)下調(diào)的乳腺癌細(xì)胞中進(jìn)行了PGC-1α和DACH1靶向siRNA的雙重轉(zhuǎn)染,發(fā)現(xiàn)下調(diào)PGC-1α表達(dá)后,即使抑制DACH1表達(dá)也能進(jìn)一步促進(jìn)乳腺癌細(xì)胞的增殖,提示PGC-1α和DACH1的調(diào)控信號(hào)通路是相互獨(dú)立的。本研究?jī)H在體外實(shí)驗(yàn)水平進(jìn)行探究,進(jìn)一步的體內(nèi)實(shí)驗(yàn)室研究,包括對(duì)PGC-1α和DACH1下游信號(hào)通路的探索,必將有助于闡明乳腺癌中miRNA的復(fù)雜調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。