彭國強(qiáng),劉 芳,張雪嬌,雷澤平,郝成欣,佟 華,叢建民,,3?,王佐成?
1. 白城醫(yī)學(xué)高等??茖W(xué)?;A(chǔ)醫(yī)學(xué)部,吉林白城137000;2. 白城師范學(xué)院理論計算中心,吉林白城137000;3. 白城師范學(xué)院生命科學(xué)學(xué)院,吉林 白城137000
α-丙氨酸(α-Ala)是結(jié)構(gòu)最簡單的手性氨基酸,按構(gòu)型分為S-α-Ala 和R-α-Ala,按其使平面偏振光振動面旋轉(zhuǎn)的情況可分為左旋體(L-α-Ala)和右旋體(D-α-Ala)。α-Ala 的手性特征導(dǎo)致其金屬離子配合物也具有手性。生命體內(nèi)的α-Ala 多以左旋體存在,具有生物活性,也有微量右旋體存在,具有清除細(xì)胞毒性及促進(jìn)細(xì)菌孢子代謝的作用,右旋體過量對健康不利[1,2]。
鈷(cobalt,Co)是生物體必需的微量元素,對氨基酸代謝和造血有重要作用。鈷缺乏可誘發(fā)老年癡呆等疾?。?]。生命體通??梢酝ㄟ^飲食攝取鈷,但若嚴(yán)重缺乏,則需利用藥物補(bǔ)充。利用無機(jī)鈷鹽補(bǔ)鈷會導(dǎo)致生命體在短時間內(nèi)鈷含量迅速增加,對生命體產(chǎn)生毒副作用。而利用氨基酸鹽補(bǔ)鈷不但具有可緩慢釋放金屬離子的優(yōu)點,還可補(bǔ)充氨基酸[4]。由于氨基酸金屬配合物具有手性,臨床使用氨基酸鹽補(bǔ)充金屬離子是否安全成為科研工作者重要的課題。目前,氨基酸金屬配合物的旋光異構(gòu)已有大量報道。文獻(xiàn)[5~10]基于密度泛函(DFT)理論研究了氣相α-Ala 與Cu2+和Ca2+等配合物以及脯氨酸Ca2+的旋光異構(gòu),結(jié)果表明這些氨基酸金屬配合物在氣相下很難消旋,氨基酸金屬配合物在氣固相可安全地保存。由于生命體內(nèi)的氨基酸金屬配合物處在水環(huán)境,文獻(xiàn)[11~15]基于DFT 理論研究了水液相下α-Ala 與Ca2+、Zn2+、Fe2+和Mg2+以及脯氨酸與Ca2+配合物的旋光異構(gòu),結(jié)果表明水液相下這些氨基酸金屬配合物只能極少量地消旋,說明了生命體同補(bǔ)α-Ala 和鋅、鈣、鎂和鐵以及同補(bǔ)脯氨酸和鈣的安全性。
水液相下α-Ala 與Co2+配合物的旋光異構(gòu)尚未見報道。本文研究了水液相下α-Ala與Co2+的配合物的旋光異構(gòu)機(jī)理,從理論上探討了使用丙氨酸鈷(Ⅱ)為生命體同時補(bǔ)充α-Ala 與Co2+的安全性。
采用處理過渡金屬和弱作用有較高精度的雜化泛函M06 方法[16],結(jié)合處理溶劑效應(yīng)有較好表現(xiàn)的SMD[17]模型方法,配體元素采用6-311+G(d,p)基組,考慮到相對論效應(yīng),Co2+采用SDD 贗勢基組,優(yōu)化反應(yīng)過程的四重態(tài)(計算表明本研究體系在四重態(tài)最穩(wěn)定)勢能面上的駐點結(jié)構(gòu)(自由能熱校正在1 個標(biāo)準(zhǔn)大氣壓,298.15 K 溫度下);通過對反應(yīng)過渡態(tài)[18]虛頻振動模式的分析及IRC(內(nèi)稟反應(yīng)坐標(biāo))計算[19],確認(rèn)過渡態(tài)的可靠性。為計算出相對精確的反應(yīng)過程勢能面,兼顧計算成本,采用雜化泛函MN15[20]方法。配 體 元 素采用6-311++G(2df,pd)高角動量基組,計算駐點的單點能。駐點的總自由能是自由能熱校正和單點能之和,勢能曲線的零勢點為該曲線上各個駐點的相對勢能零點。
α-Ala 在氣相和水液相下分別是中性和兩性較穩(wěn)定[21,22],故配合物S-α-Ala·Co2+的α-Ala 也有中性和兩性兩種情形。兩性S-α-Ala 與Co2+的配合物記作S-A·Co_1,其在a 和b 通道異構(gòu)得到的第3 個無手性過渡態(tài)記作T3_1a(b),在a 通道異構(gòu)得到的手性 對 映 體 產(chǎn)物記 作S-A·Co_1a;中 性S-α-Ala 與Co2+的配合物記作S-A·Co_2,在a 通道異構(gòu)得到的S-A·Co_1 記 作S-A·Co_1_2a;S-I2_1a(b)中 的Co2+與5 個H2O 配位,再與二聚水氫鍵作用的絡(luò)合物記作S-I2_1a(b)←5H2O·(H2O)2,其 他 體 系 表 示 法 相似。絡(luò)合物結(jié)構(gòu)圖上的虛線表示氫鍵作用。計算工作采用Gaussian16 程序[23]。
計算表明,水液相下兩性Ala 分子的羧基下部的氧與Co2+單齒配位的構(gòu)象最穩(wěn)定,中性Ala 分子的氨基氮和羧基氧與Co2+雙齒配位的構(gòu)象最穩(wěn)定。優(yōu)化得到的水液相下兩對配合物的手性對映體見圖1。
圖1 α-Ala 和Co2+的兩性和中性配合物分子手性對映體的幾何構(gòu)型Fig.1 Geometric conformation of the molecule chiral enantiomer of α-Ala and Co2+ amphoteric and neutral complexes
文獻(xiàn)[11~15]的研究表明,非氫轉(zhuǎn)移反應(yīng),水分子(簇)與反應(yīng)物作用(氫鍵作用及配位作用)對反應(yīng)能壘影響較小,考慮隱性水溶劑效應(yīng)即可說明相關(guān)的反應(yīng)機(jī)制。氫遷移反應(yīng),水分子(簇)作氫轉(zhuǎn)移媒介以及水分子與Co2+配位會顯著改變反應(yīng)能壘,研究氫遷移反應(yīng)需同時考慮溶劑極性和水分子(簇)的共同作用,即顯性水溶劑效應(yīng)。為清晰地呈現(xiàn)水液相下丙氨酸鈷(Ⅱ)配合物旋光異構(gòu)的歷程以及水分子(簇)所起的作用,本文先討論隱性水溶劑效應(yīng)下S-A·Co 的旋光異構(gòu),然后再討論顯性水溶劑效應(yīng)下S-A·Co 旋光異構(gòu)過程中的氫遷移反應(yīng)。
2.1.1S-A·Co_1 的旋光異構(gòu)
S-A·Co_1 可在4 個通道a、b、c 和d 實現(xiàn)旋光異構(gòu),反應(yīng)歷程見圖2,反應(yīng)的自由能勢能面見圖3。
圖2 隱性水溶劑效應(yīng)下S-A·Co_1 旋光異構(gòu)的反應(yīng)歷程Fig.2 Reaction process of S-A·Co_1 optical isomerism under the effect of recessive water solvent
圖3 隱性水溶劑效應(yīng)下S-A·Co_1 旋光異構(gòu)反應(yīng)的自由能勢能面Fig.3 The free energy potential surface of S-A·Co_1 optical isomerism reaction under the effect of recessive water solvent
2.1.1.1 a 和b 通 道
第1基元反應(yīng)(a和b通道共用):反應(yīng)物S-A·Co_1經(jīng)6C—8O—14Co 剪式運動的過渡態(tài)S-T1_1a(b),14Co 向羧基中部擺動,異構(gòu)成中間體S-I1_1a(b)。從S-A·Co_1 到S-T1_1a(b),鍵角6C—8O—14Co 從115.5°減小至95.7°,改變鍵角所需能量很少,ST1_1a(b)產(chǎn)生的內(nèi)稟能壘僅10.8 kJ/mol。
第2基元反應(yīng)(a和b通道共用):S-I1_1a(b)經(jīng)6C—7O—14Co 剪式運動的過 渡態(tài)S-T2_1a(b),14Co 向羧基上部擺動,異構(gòu)成中間體S-I2_1a(b)。從S-I1_1a(b)到S-T2_1a(b),鍵 角6C—7O—14Co 從89.4°增 加 至112.1°,S-T2_1a(b)產(chǎn)生的內(nèi)稟能壘僅1.4 kJ/mol。
第3基元反應(yīng)(a和b通道共用):中間體S-I2_1a(b)經(jīng)過渡態(tài)T3_1a(b),9H 從1C 遷移至8O,異構(gòu)成中間體I3_1a(b)。從S-I2_1a(b)到T3_1a(b),1C—9H 鍵 長 從0.109 2 nm 拉伸至0.156 0 nm,碳?xì)滏I斷裂;6C—8O 鍵長從0.125 7 nm 拉伸至0.135 2 nm,骨架二面角2N—1C—10C—6C 從121.3°增加至127.3°;6C—1C 鍵右視順時針內(nèi)旋轉(zhuǎn)18.8°。這些變化使T3_1a(b)產(chǎn)生了283.1 kJ/mol 的內(nèi)稟能壘。
接下來的反應(yīng)歷程分為a 和b 兩個分通道。
1)a 通道專屬反應(yīng)第4 基元反應(yīng):I3_1a(b)經(jīng)過渡態(tài)T4_1a,9H 在紙面內(nèi)側(cè)從8O 遷移1C,異構(gòu)成R-型中間體R-I4_1a,S-A·Co_1 實現(xiàn)了旋光異構(gòu)。從I3_1a(b)到T4_1a,8O—9H 鍵 從0.097 9 nm 拉 伸 至0.120 7 nm,斷裂;6C—1C 右視順時針內(nèi)旋轉(zhuǎn)27.8°。這些變化使T4_1a產(chǎn)生了198.9 kJ/mol 的內(nèi)稟能壘。該能壘遠(yuǎn)小于T3_1a(b)產(chǎn)生的內(nèi)稟能壘(283.1 kJ/mol),原因是從I3_1a(b)到T4_1a,8O—9H鍵的拉伸幅度小,且此過程α-碳從空配向滿配(即從sp2雜化向sp3雜化)過渡時釋放了能量。
第5 基元反應(yīng):R-I4_1a經(jīng)6C—7O—14Co 剪式運動的過渡態(tài)R-T5_1a,14Co 向羧基中部擺動,構(gòu)象異構(gòu)成雙齒的中間體配合物R-I5_1a。從R-I4_1a到R-T5_1a過程,鍵角6C—7O—14Co 從112.1°減小至89.4°,R-T5_1a產(chǎn)生的內(nèi)稟能壘為6.2 kJ/mol。
第6 基元反應(yīng):R-I5_1a經(jīng)6C—8O—14Co 剪式運動的過渡態(tài)R-T6_1a,14Co 向羧基底部擺動,異構(gòu)成與S-A·Co_1 鏡像對稱的產(chǎn)物R-A·Co_1a,S-A·Co_1 在a 通道實現(xiàn)了手性對映體轉(zhuǎn)變。從R-I5_1a到R-T6_1a,鍵 角6C—8O—14Co 從95.7° 增 至115.5°,R-T6_1a產(chǎn)生的內(nèi)稟能壘為3.1 kJ/mol。
縱觀S-A·Co_1 在a 通道的駐點構(gòu)象和勢能面,所有駐點構(gòu)象及能量關(guān)于I3_1a(b)對稱。
2)b 通 道 專 屬 反 應(yīng) 第4 基 元 反 應(yīng):I3_1a(b)經(jīng) 過渡態(tài)T4_1b,4H 在紙面內(nèi)從2N 遷移至1C,異構(gòu)成R-型中間體R-I4_1b,S-A·Co_1 在b 通道實現(xiàn)旋光異構(gòu)。從I3_1a(b)到T4_1b,2N—4H 鍵從0.102 9 nm拉伸至0.132 3 nm,2N—1C 鍵從0.142 9 nm 拉伸至0.152 7 nm。這些變化使T4b_1 產(chǎn)生了208.4 kJ/mol 的內(nèi)稟能壘。
第5 基 元 反 應(yīng):R-I4_1b經(jīng)氨基上的3H 和5H 左右翻轉(zhuǎn)的過渡態(tài)R-T5_1b,3H 和5H 從右側(cè)翻轉(zhuǎn)到左側(cè),形成中間體R-I5_1b。從R-I4_1b到R-T5_1b,二面角1C—2N—3H—5H 從131.6°增加至-170.2°,此二面角的變化所需能量很小,R-T5_1b僅產(chǎn)生3.9 kJ/mol 的內(nèi)稟能壘。
第6 基元反應(yīng):R-I5_1b經(jīng)過渡態(tài)R-T6_1b,6C—1C 右視逆時針內(nèi)旋轉(zhuǎn)、2N—1C 俯視逆時針內(nèi)旋轉(zhuǎn)以及9H 從8O 向2N 遷移協(xié)同非同步進(jìn)行,異構(gòu)成R-A·Co_1b,S-A·Co_1 在b 通道實現(xiàn)了手性對映體轉(zhuǎn)變。 從R-I5_1b 到R-T6_1b,6C—1C 內(nèi)旋轉(zhuǎn)87.3°,1C—2N 內(nèi)旋轉(zhuǎn)50.1°,化學(xué)鍵內(nèi)旋轉(zhuǎn)所需能量很小,R-T6_1b產(chǎn)生的內(nèi)稟能壘僅4.1 kJ/mol。
2.1.1.2 c 和d 通 道
第1 基元反應(yīng)(c 和d 通道共用):反應(yīng)物S-A·Co_1 經(jīng)過渡態(tài)T1_1c(d),9H 從1C 遷移至7O,異構(gòu)成中 間 體I1_1c(d)。從S-A·Co_1 到T1_1c(d),1C—9H鍵從0.109 2 nm 拉伸至0.161 0 nm,斷裂,6C—7O鍵從0.125 9 nm 拉伸至0.135 3 nm,8O—14Co 鍵從0.189 9 nm 拉伸至0.200 7 nm;二面角2N—1C—10C—6C 從120.0°增至125.3°;6C—1C 右視逆時針內(nèi) 旋 轉(zhuǎn)94.1°。這 些 變 化 使T1_1c(d)產(chǎn) 生 了295.8 kJ/mol 的內(nèi)稟能壘。接下來的反應(yīng)歷程分為c 和d兩個分通道。
1)c 通道專屬反應(yīng)第2 基元反應(yīng):I1_1c(d)經(jīng)過渡態(tài)T2_1c,9H 從紙面外側(cè)到翻轉(zhuǎn)到紙面內(nèi)側(cè),異構(gòu)成中間體I2_1c。從I1_1c(d)到T2_1c,7O—6C 俯視逆時針內(nèi)旋轉(zhuǎn)17.8°,8O—6C 仰視順時針內(nèi)旋轉(zhuǎn)21.1°,化學(xué)鍵小角度的內(nèi)旋轉(zhuǎn)所需能量很小,T2_1c產(chǎn)生的內(nèi)稟能壘僅1.3 kJ/mol。
第3 基元反應(yīng):I2_1c經(jīng)過渡態(tài)T3_1c,9H 在紙面內(nèi)側(cè)從7O 遷移至1C,異構(gòu)產(chǎn)物R-A·Co_1c,S-A·Co_1在c通道完成旋光異構(gòu)。從I2_1c到T3_1c,7O—9H 鍵從0.098 1 nm 拉伸至0.118 3 nm,6C—1C 右視順時針內(nèi)旋轉(zhuǎn)90.6°。這些變化使T3_1c產(chǎn)生了202.0 kJ/mol 的內(nèi)稟能壘。
縱觀c 通道的駐點構(gòu)象和勢能面,所有駐點構(gòu)象及能量關(guān)于T2_1c對稱。
2)d 通 道 專 屬 反 應(yīng) 第2 基 元 反 應(yīng):I1_1c(d)經(jīng) 過渡態(tài)T2_1d,4H 在紙面內(nèi)從2N 遷移至1C,異構(gòu)成中間 體R-I2_1d,S-A·Co_1 在d 通 道 實現(xiàn)旋 光 異 構(gòu)。從I1_1c(d)到T2_1d,2N—4H 鍵從0.103 0 nm 拉伸至0.132 3 nm,2N—1C 鍵從0.147 8 nm 拉伸至0.152 5 nm。這些變化使T2_1d產(chǎn)生了205.9 kJ/mol 的內(nèi)稟能壘。
第3 基元反應(yīng):R-I2_1d經(jīng)氨基上的3H 和5H 左右翻轉(zhuǎn)的過渡態(tài)R-T3_1d,3H 和5H 從右側(cè)翻轉(zhuǎn)到左側(cè),異構(gòu)成中間體R-I3_1d。此基元與b 通道的第5 基元 相 似,R-T3_1d產(chǎn) 生 了7.6 kJ/mol 的內(nèi)稟能壘,不再贅述。
第4 基元反應(yīng):R-I3_1d經(jīng)過渡態(tài)R-T4m_1d(或R-T4n_1d),7O—6C 右視順(或逆)時針內(nèi)旋轉(zhuǎn)和9H 從7O 向2N 遷移協(xié)同非同步進(jìn)行,異構(gòu)成R-A·Co_1d,S-A·Co_1 在d 通道實現(xiàn)了手性對映體 轉(zhuǎn)變。 從R-I3_1d到R-T4m_1d,7O—6C 內(nèi) 旋 轉(zhuǎn)89.5°,R-T4m_1d產(chǎn) 生 的 內(nèi) 稟 能 壘 為42.0 kJ/mol。相似的R-T4n_1d產(chǎn)生的內(nèi)稟能壘為41.9 kJ/mol,不再贅述。
結(jié)合圖2 和圖3 可知,α-Ala_1·Co2+在a 和b 通道的旋光異構(gòu)具有優(yōu)勢,決速步是第3 基元反應(yīng),決速步能壘為283.1 kJ/mol,來自α-氫從α-碳向羧基下部的氧(8O)遷移的過渡態(tài)。從圖3 還可看出,a通道第4 基元的能壘低于b 通道第4 基元的能壘,比較而言,在a 通道比b 通道略具優(yōu)勢。由于能壘小于40.0 kJ/mol 的反應(yīng)可通過分子間的碰撞實現(xiàn)[24],因此水液相下反應(yīng)物應(yīng)是S-A·Co_1、S-I1_1a(b)和SI2_1a(b)共 存,S-A·Co_1 分 布 最 高,S-I2_1a(b)次 之,S-I1_1a(b)分 布 最 少;產(chǎn)物是R-I4_1a、R-I5_1a和RA·Co_1a共存,R-A·Co_1a分布最高,R-I4_1a次之,R-I5_1a分布最少。
2.1.2S-A·Co_2 的旋光異構(gòu)
S-A·Co_2 的旋光異構(gòu)有2 個通道a 和b,反應(yīng)歷程見圖4,反應(yīng)的自由能勢能面見圖5。
圖4 隱性水溶劑效應(yīng)下S-A·Co_2 旋光異構(gòu)的反應(yīng)歷程Fig.4 Reaction process of S-A·Co_2 optical isomerism under the effect of recessive water solvent
圖5 隱性水溶劑效應(yīng)下S-A·Co_2 旋光異構(gòu)反應(yīng)的自由能勢能面Fig.5 The free energy potential surface of S-A·Co_2 optical isomerism reaction under the effect of recessive water solvent
2.1.2.1 a 通道
第1 基元反應(yīng):S-A·Co_2 經(jīng)過渡態(tài)S-T1m_2a(或S-T1n_2a),7O—5C 仰視逆時針(或順時針)內(nèi)旋轉(zhuǎn),異構(gòu)成中間體S-I1_2a。從S-A·Co_2 到ST1m_2a,7O—5C 仰視逆時針內(nèi)旋轉(zhuǎn)92.1°,S-T1m_2a產(chǎn)生了39.8 kJ/mol 的內(nèi)稟能壘。相似地,ST1n_2a產(chǎn)生的內(nèi)稟能壘為39.2 kJ/mol,不再贅述。
第2 基元反應(yīng):S-I1_2a經(jīng)過渡態(tài)S-T2_2a,螯合環(huán) 打 開 異 構(gòu) 成S-I2_2a。 從S-I1_2a到S-T2_2a,14Co—2N 斷 裂,S-T2_2a產(chǎn) 生 了54.0 kJ/mol 的 內(nèi)稟能壘。
第3 基元反應(yīng):S-I2_2a經(jīng)過渡態(tài)S-T3m_2a(或S-T3n_2a),5C—1C 和2N—1C 鍵內(nèi)旋轉(zhuǎn),8H 從7O遷移至2N,異構(gòu)成S-A·Co_1_2a。從S-I2_2a到ST3m_2a,5C—1C 右視順時針內(nèi)旋轉(zhuǎn)87.9°,2N—1C俯視順時針內(nèi)旋轉(zhuǎn)54.1°,這兩個化學(xué)鍵內(nèi)旋轉(zhuǎn)所需能量很少,S-T3m_2a產(chǎn)生的內(nèi)稟能壘僅6.0 kJ/mol。相似地,S-T3n_2a產(chǎn)生的內(nèi)稟能壘為11.1 kJ/mol。
結(jié)構(gòu)分析表明,S-A·Co_1_2a的結(jié)構(gòu)完全與SA·Co_1 相同。S-A·Co_1_2a接下來的異構(gòu)亦同SA·Co_1 的異構(gòu),不再贅述。
2.1.2.2 b 通道
第1 基元反應(yīng):S-A·Co_2 經(jīng)羧基內(nèi)H 遷移的過渡態(tài)S-T1_2b,8H 從7O 遷移至6O,異構(gòu)成中間體S-I1_2b。從S-A·Co_2 到S-T1_2b,7O—8H 鍵長從0.098 6 nm 拉 伸 至0.135 7 nm,S-T1_2b產(chǎn)生的內(nèi)稟能壘為172.9 kJ/mol。
第2 基 元 反 應(yīng):S-I1_2b經(jīng) 過 渡 態(tài)T2_2b,9H 從1C 遷移 至7O,異構(gòu) 成 中 間體I2_2b。從S-I1_2b到T2_2b,1C—9H 鍵長從0.109 7 nm 拉 伸 至0.155 3 nm,5C—7O 鍵長從0.122 9 nm 拉伸至0.132 4 nm,二面角2N—1C—10C—5C 從125.0°增至139.6°。這些變化使T2_2b產(chǎn)生了218.2 kJ/mol 的內(nèi)稟能壘。
接下來I2_2b的異構(gòu)分為b1 和b2 兩個分路徑。
1)b1 分路徑專屬基元反應(yīng)第3 基元反應(yīng):I2_2b經(jīng)9H 在紙面內(nèi)側(cè)從7O 向1C 遷移的過渡態(tài)T3_2b1,異構(gòu)成中間體R-I3_2b1,至此S-A·Co_2 在b 通道b1分路徑實現(xiàn)旋光異構(gòu)。從I2_2b到T3_2b1,7O—9H鍵長從0.097 9 nm 拉伸至0.130 4 nm,T3_2b1產(chǎn)生的內(nèi)稟能壘為259.1 kJ/mol。此基元的能壘高于第2 基元的能壘,主要原因是I2_2b的7O—9H 鍵的紅外伸縮振動頻率3 751.8 cm-1比S-I1_2b的1C-9H鍵的紅外伸縮振動頻率3 097.0 cm-1大,故I2_2b的7O—9H 比S-I1_2b的1C-9H 鍵的鈍化程度高。
第4 基元反應(yīng):R-I3_2b1經(jīng)過渡態(tài)R-T4_2b1,8H從6O 回遷到7O,異構(gòu)成與S-A·Co_2 鏡像對稱的產(chǎn)物配合物R-A·Co_2b1,S-A·Co_2 在b 通道b1 路徑實現(xiàn)了手性對映體轉(zhuǎn)變。從R-I3_2b1到R-T4_2b1,6O—8H 鍵長從0.098 3 nm 拉伸至0.131 9 nm,R-T5_2b1產(chǎn)生的內(nèi)稟能壘為48.7 kJ/mol。此能壘比第一基元的能壘小很多,原因是此基元的質(zhì)子遷移是逆偶極矩方向,體系的電場力助力質(zhì)子遷移。
S-A·Co_2 在b 通道b1 路徑旋光異構(gòu)反應(yīng)的駐點構(gòu)象和駐點的能量關(guān)于T3_2b1對稱。
2)b2 路徑專屬基元反應(yīng)第3 基元反應(yīng):I2_2b經(jīng)過渡態(tài)T3_2b2,11H 在紙面內(nèi)側(cè)從10C 遷移至1C,異構(gòu)成R-型中間體R-I3_2b2。從I2_2b到T3_2b2,10C—11H 鍵長從0.109 7 nm 拉伸至0.163 6 nm,T3_2b2產(chǎn)生的內(nèi)稟能壘為345.6 kJ/mol。
第4 基元反應(yīng):R-I3_2b2經(jīng)過渡態(tài)R-T4_2b2,9H從7O 遷移至10C,異構(gòu)成中間體R-I4_2b2。從RI3_2b2到R-T4_2b2,7O—9H 鍵長從0.090 8 nm 拉伸至0.119 1 nm,R-T4_2b2產(chǎn)生了82.6 kJ/mol 的內(nèi)稟能壘。結(jié)構(gòu)分析表明,R-I4_2b2與R-I3_2b1的結(jié)構(gòu)全同,接下來R-I4_2b2將按R-I3_2b1的方式異構(gòu)成RA·Co_2b2,記作R-A·Co_2b1(b2),不再贅述。
從圖5 可知,S-A·Co_1 相對于S-A·Co_2 的自由能是-41.1 kJ/mol,前者的穩(wěn)定性高于后者;在a通道,S-A·Co_2 向S-A·Co_1 異構(gòu)決速步的自由能壘為54.0 kJ/mol,低于溫和反應(yīng)能壘83.6 kJ/mol[24],反 應(yīng) 進(jìn) 行 較快;S-A·Co_1 向S-A·Co_2 異構(gòu)決速步的自由能壘為97.6 kJ/mol,高于溫和反應(yīng)能 壘83.6 kJ/mol[24],反 應(yīng) 進(jìn) 行 較 慢。因 此 水 液 相下,S-A·Co_1 的分布會遠(yuǎn)高于S-A·Co_2。從圖5還可看出,S-A·Co_2 在b 通道旋光異構(gòu)決速步的能壘在259.1 kJ/mol 以上,b 通道是S-A·Co_2 異構(gòu)的劣勢通道。
為節(jié)省篇幅,本文只討論S-A·Co_1 在優(yōu)勢通道a 和b 旋光異構(gòu)過程中的氫遷移反應(yīng)。
水分子多以水簇的形式存在,顯性水溶劑效應(yīng)下,水分子簇與14Co 形成配位鍵,同時水分子簇可與S-A·Co_1 的氫、氧和氮等氫鍵作用。已有研究[11~15]表明,水簇或單個水分子與金屬配位時,配合物異構(gòu)反應(yīng)能壘差別很小,二聚水和三聚水作為質(zhì)子轉(zhuǎn)移媒介時質(zhì)子轉(zhuǎn)移的能壘相差很小。因此為使問題簡便,僅討論單個水分子與14Co 配位,二聚水做質(zhì)子轉(zhuǎn)移媒介的情況。
Co2+最多配位數(shù)是6,在S-I2_1a(b)中Co2+已經(jīng)與1 個O 配位,再有5 個水分子與Co 配位,Co 便“滿配”,得到的中間體是S-I2_1a(b)←5H2O。再有二聚水與9H 和8O 氫鍵作用,同時和與Co2+配位的水分子氫鍵作用,形成具有穩(wěn)定氫鍵網(wǎng)絡(luò)的S-I2_1a(b)←5H2O·(H2O)2m(此處m 表示二聚水在紙面外與S-I2_1a(b)氫鍵作用)。S-I2_1a(b)←5H2O·(H2O)2m 旋光異構(gòu)歷程見圖6,勢能面見圖7。
圖6 顯性水溶劑效應(yīng)下S-A·Co_1 旋光異構(gòu)的主要歷程Fig.6 The main reaction process of S-A·Co_1 optical isomerism under the effect of explicit water solvent
圖7 顯性水溶劑效應(yīng)下S-A·Co_1 旋光異構(gòu)主要歷程的自由能勢能面Fig.7 The free energy potential surface of main reaction process of S-A·Co_1 optical isomerismunder the effect of explicit water solvent
第3 基 元 反 應(yīng)(a 和b 通 道 共 用):S-I2_1a(b)←5H2O·(H2O)2m 經(jīng)過渡態(tài)T3_1a(b)←5H2O·(H2O)2m,3 個質(zhì)子協(xié)同遷移,實現(xiàn)了質(zhì)子從1C向8O的凈遷移,異構(gòu)成中間體I3_1a(b)←5H2O·(H2O)2m。從S-I2_1a(b)←5H2O·(H2O)2m 到T3_1a(b)←5H2O·(H2O)2m,1C—9H、30O—32H 和33O—35H 鍵 長 分 別 從0.109 4、0.100 6 和0.099 2 nm 拉 伸 至0.142 6、0.146 4 和0.115 0 nm;二面角2N—1C—10C—6C從120.7°變?yōu)?32.7°。 這 些變化使T3_1a(b)←5H2O·(H2O)2m 產(chǎn)生了120.3 kJ/mol 的內(nèi)稟能壘。此能壘低于T3_1a(b)產(chǎn)生的內(nèi)稟能壘283.1 kJ/mol,說明水分子(簇)對此基元反應(yīng)起了很好的催化作用。原因是T3_1a(b)←5H2O·(H2O)2m 的氫鍵角1C—9H—30O、30O—32H—33O 和33O—35H—8O分 別 是167.0°、156.2°和167.1°,3 個氫鍵較強(qiáng);T3_1a(b)←5H2O·(H2O)2m 的八元 環(huán)結(jié)構(gòu)共面程度較好,導(dǎo)致過渡態(tài)T3_1a(b)←5H2O·(H2O)2m 的穩(wěn)定性較好。
a 通道 第4 基元反 應(yīng):二聚水 在I3_1a←5H2O 的后面與9H 及α-碳?xì)滏I作用形成的中間體反應(yīng)物I3_1a←5H2O·(H2O)2n(n 表示二聚水在I2_1a(b)的后面,后面相似之處不再贅述)經(jīng)過渡態(tài)T4_1a←5H2O·(H2O)2n,實現(xiàn)了質(zhì)子在紙面內(nèi)從8O 向1C 凈遷移,異構(gòu)成R-型中間體產(chǎn)物R-I4_1a←5H2O·(H2O)2n,S-A·Co_1 實現(xiàn)旋光異構(gòu)。從I3_1a←5H2O·(H2O)2n到T4_1a←5H2O·(H2O)2n,8O—9H、34O—33H 和30O—32H 鍵長從0.102 9、0.099 5 和0.098 7 nm 分別拉伸至0.126 0、0.105 1 和0.120 3 nm,T4_1a←5H2O·(H2O)2n 產(chǎn) 生 的 內(nèi) 稟 能 壘 為30.3 kJ/mol。該能壘低于T4_1a產(chǎn)生的內(nèi)稟能壘198.9 kJ/mol,說明水分子(簇)對此基元反應(yīng)起了顯著的催化作用。原因之一是T4_1a←5H2O·(H2O)2n 的 氫 鍵 角8O—9H—32O、32O—33H—30O 和30O—32H—1C 分 別 是167.1°、156.2°和167.0°,3 個氫鍵較強(qiáng),過渡態(tài)的八元環(huán)結(jié)構(gòu)共面程度較好,T2_1a(b)←6H2O·(H2O)2m的構(gòu)象較穩(wěn)定;原因之二是從I1_1a←4H2O·(H2O)2n 到T2_1a←4H2O·(H2O)2n,二面角2N—1C—6C—10C 從-168.8°變?yōu)?132.8°,1C 從sp2雜化向sp3雜化過渡,體系釋放能量。
b 通道第4 基元:I3_1b的Co 與5 個水分子配位,二聚水在紙面內(nèi)與4H 及1C 氫鍵作用,得到中間體反應(yīng)物I3_1b←5H2O·(H2O)2n。其經(jīng)過渡態(tài)T4_1b←5H2O·(H2O)2n,實現(xiàn)質(zhì)子在紙面內(nèi)從2N 向1C 的凈遷移,異構(gòu)成中間體產(chǎn)物R-I4_1b←5H2O·(H2O)2n,S-A·Co_1 在b 通 道 實 現(xiàn) 旋 光 異 構(gòu)。從I3_1b←5H2O·(H2O)2n 到T4_1b←5H2O·(H2O)2n,2N—4H、34O—33H 和31O—30H 鍵長從0.102 9、0.099 6 和0.098 0 nm 分別拉伸至0.133 0、0.105 7 和0.120 3 nm,T4_1b←5H2O·(H2O)2n 產(chǎn) 生 的 內(nèi) 稟 能 壘 為35.6 kJ/mol,遠(yuǎn)低于T4_1b產(chǎn)生的內(nèi)稟能壘208.4 kJ/mol,說明水分子(簇)對此基元反應(yīng)起了顯著的催化作用。其原因相似于前面的水液相下S-A·Co_1 在a 通 道的第4 基元反應(yīng)。
結(jié)合圖7 和圖3 可知,顯性水溶劑效應(yīng)下S-A·Co_1 在a 和b 通道旋光異構(gòu)的決速步能壘為120.3 kJ/mol。結(jié)合圖7 和5 可知,顯性水溶劑效應(yīng)下SA·Co_2 旋光異構(gòu)優(yōu)勢通道的決速步能壘也是120.3 kJ/mol。120.3 kJ/mol 高于溫和反應(yīng)能壘83.6 kJ/mol[24]許多,S-A·Co 的消旋反應(yīng)只能很緩慢地進(jìn)行。這從理論上說明丙氨酸鈷(Ⅱ)配合物用于生命體同補(bǔ)丙氨酸和Co2+比較安全。
本 文 在SMD/MN15/SDD/6-311++G(2df,pd)//SMD/M06/SDD/6-311+G(d,p)雙水平,研究了兩性及中性α-丙氨酸(α-Ala_1 和α-Ala_2)與Co2+配合物在水液相下的旋光異構(gòu),得到如下結(jié)論:1)α-Ala·Co_2 向α-Ala·Co_1 異構(gòu)的決速步自由能壘為54.0 kJ/mol,逆反應(yīng)的決速步自由能壘為97.6 kJ/mol,水液相下α-Ala·Co_1 的分布遠(yuǎn)高于α-Ala·Co_2;2)α-Ala_1·Co2+旋光異構(gòu)有4 個通道a、b、c 和d,a 通道和b 通道是質(zhì)子向羧基底部的氧遷移,c 通道和d 通道是質(zhì)子向羧基上部的氧遷移;3)α-Ala_1·Co2+旋光異構(gòu)的優(yōu)勢通道是a 通道和b通道,隱性溶劑效應(yīng)下決速步能壘為283.1 kJ/mol,顯性溶劑效應(yīng)下該能壘降至120.3 kJ/mol,α-Ala_2·Co2+異構(gòu)到α-Ala_1·Co2+后再旋光異構(gòu)的通道具有優(yōu)勢,決速步能壘與α-Ala_1·Co2+旋光異構(gòu)的能壘相同。上述研究表明,水液相下丙氨酸鈷(Ⅱ)配合物的消旋反應(yīng)進(jìn)行緩慢,用于生命體同補(bǔ)丙氨酸和Co2+在理論上具有較好的安全性。