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基于雙重信號(hào)放大策略的生物傳感器用于汞離子的靈敏可視化檢測(cè)

2024-12-16 00:00:00王玲麗楊通黃龍張金胡蓉楊云慧楊建梅趙焱
分析化學(xué) 2024年11期
關(guān)鍵詞:生物傳感器

摘要 重金屬汞對(duì)人類的生活環(huán)境和身體健康構(gòu)成了嚴(yán)重威脅,因此,構(gòu)建簡(jiǎn)單靈敏的汞離子(Hg2+)檢測(cè)方法尤為重要。本研究結(jié)合催化發(fā)夾自組裝(CHA)和滾環(huán)擴(kuò)增(RCA)兩種高效信號(hào)放大技術(shù),構(gòu)建了具有雙重信號(hào)放大功能的生物傳感器,用于Hg2+的高靈敏和高選擇性定量檢測(cè)。當(dāng)目標(biāo)物Hg2+存在時(shí), DNA 輔助探針通過T-Hg2+-T 堿基錯(cuò)配雜交引發(fā)CHA 反應(yīng)(第一重信號(hào)放大),生成的DNA 雙鏈產(chǎn)物進(jìn)一步引發(fā)RCA 反應(yīng),生成大量的G-四鏈體重復(fù)序列(第二重信號(hào)放大)。這種特殊的序列與氯化血紅素(Hemin)孵育后形成具有類辣根過氧化物酶活性的Hemin/G-四鏈體DNA 酶,可催化底物3,3′,5,5′-四甲基聯(lián)苯胺(TMB)發(fā)生氧化反應(yīng),使TMB 由無色變成藍(lán)色。由于結(jié)合了兩種高效的信號(hào)放大策略,采用紫外-可見吸收光譜法可實(shí)現(xiàn)Hg2+的高靈敏定量檢測(cè),檢出限(LOD, 3σ)低至0.21 nmol/L。同時(shí),通過裸眼觀測(cè)溶液的顏色變化,可實(shí)現(xiàn)濃度為1 nmol/L 的Hg2+的可視化檢測(cè)。此傳感器具有優(yōu)異的選擇性,可用于復(fù)雜水樣中Hg2+的檢測(cè),為重金屬污染物的檢測(cè)提供了簡(jiǎn)單靈敏的分析平臺(tái),在環(huán)境監(jiān)測(cè)領(lǐng)域具有潛在的應(yīng)用價(jià)值。

關(guān)鍵詞 催化發(fā)夾自組裝;滾環(huán)擴(kuò)增;生物傳感器;可視化檢測(cè);汞離子

隨著工業(yè)和經(jīng)濟(jì)的高速發(fā)展,重金屬污染的問題變得日益嚴(yán)重[1]。常見的強(qiáng)毒性重金屬污染物有鉛、鎘、砷和汞等。這些重金屬主要通過食物鏈及生活用品等廣泛存在于人類生活中,對(duì)生態(tài)環(huán)境和人體健康構(gòu)成了嚴(yán)重的威脅[2-3]。其中,汞離子(Hg2+)具有持久性、易遷移性、高生物毒性、強(qiáng)生物富集性及不可自然降解等性質(zhì),進(jìn)入人體后與蛋白質(zhì)或酶結(jié)合,在重要的組織和器官中積累,導(dǎo)致細(xì)胞功能異常,引發(fā)腦損傷、腎功能衰竭和消化系統(tǒng)損傷等多種疾病[4-6]。

根據(jù)世界衛(wèi)生組織(WHO)的規(guī)定,飲用水中Hg2+的最高允許濃度為30 nmol/L[7]。目前,用于檢測(cè)Hg2+的方法有氣相色譜法、原子吸收光譜法、熒光光譜法和電感耦合等離子體質(zhì)譜法等[8-10]。這些方法雖然大多能檢測(cè)nmol/L 級(jí)的Hg2+,滿足對(duì)飲用水中Hg2+的檢測(cè)需求,但所需的儀器設(shè)備昂貴、樣品預(yù)處理繁瑣耗時(shí)、操作要求高[11-14],限制了這些方法在偏遠(yuǎn)和不發(fā)達(dá)地區(qū)的應(yīng)用。因此,開發(fā)一種簡(jiǎn)單且靈敏度高的Hg2+檢測(cè)方法尤為重要。

研究表明, Hg2+可與胸腺嘧啶(T)通過N-Hg共價(jià)鍵特異性結(jié)合,形成穩(wěn)定的T-Hg2+-T配位化合物[15-16]。T-Hg2+-T 錯(cuò)配雜交結(jié)構(gòu)的結(jié)合常數(shù)大于天然的A-T 堿基對(duì),因此具有很強(qiáng)的穩(wěn)定性和特異性[17]?;谠撛聿⒔Y(jié)合生物傳感技術(shù),研究者已構(gòu)建了許多檢測(cè)Hg2+的生物傳感器,如電化學(xué)生物傳感器、熒光生物傳感器、比色生物傳感器及表面等離子體共振生物傳感器等[18-20]。其中,比色傳感器所需檢測(cè)儀器價(jià)格低、構(gòu)建簡(jiǎn)單、檢測(cè)方便,并且可實(shí)現(xiàn)可視化檢測(cè),因此備受關(guān)注[21-23]。但是,比色傳感器的檢測(cè)靈敏度一般都較低,因此常需引入高效的信號(hào)放大策略,以實(shí)現(xiàn)對(duì)Hg2+的靈敏檢測(cè)。

2008 年, Pierce 課題組[24]基于Toehold-介導(dǎo)的鏈置換反應(yīng)提出了催化發(fā)夾自組裝(Catalyzed hairpinassembly, CHA)反應(yīng)原理。在該反應(yīng)中, DNA 或RNA 引發(fā)鏈可催化兩個(gè)亞穩(wěn)態(tài)的DNA 發(fā)夾探針自組裝形成雙鏈體,并將引發(fā)鏈置換出來參與循環(huán)催化反應(yīng)。該反應(yīng)過程均在等溫條件下進(jìn)行,一條引發(fā)鏈可多次催化發(fā)夾探針發(fā)生自組裝,得到大量的由兩個(gè)發(fā)夾型探針自組裝形成的雙鏈結(jié)構(gòu),從而達(dá)到信號(hào)放大的目的。CHA 反應(yīng)已被廣泛應(yīng)用于痕量生物分子的檢測(cè)。滾環(huán)擴(kuò)增(Rolling circle amplification,RCA)反應(yīng)是將環(huán)狀DNA 作為模板,通過一個(gè)與環(huán)狀DNA 互補(bǔ)的單鏈DNA 或RNA 作為引物,在聚合酶的作用下,加入脫氧核糖核酸混合物(dNTPs)可產(chǎn)生長(zhǎng)單鏈DNA,此DNA 鏈可擁有無數(shù)多個(gè)重復(fù)的且可與模板DNA 互補(bǔ)的核酸片段[25]。RCA 可有效放大痕量靶標(biāo)物的信號(hào),在多種生物分子的檢測(cè)過程中顯示出巨大的應(yīng)用潛力。若結(jié)合以上兩種高效的信號(hào)放大策略,構(gòu)建具有雙重信號(hào)放大能力的傳感器,可望實(shí)現(xiàn)對(duì)痕量重金屬污染物Hg2+的高靈敏檢測(cè)。

基于此,結(jié)合CHA 和RCA 這兩種高效的信號(hào)放大技術(shù),本研究構(gòu)建了具有雙重信號(hào)放大功能的生物傳感器,實(shí)現(xiàn)了對(duì)重金屬污染物Hg2+的高靈敏定量檢測(cè)。當(dāng)Hg2+存在時(shí),輔助探針通過T-Hg2+-T 錯(cuò)配雜交觸發(fā)CHA 反應(yīng),使Hg2+被不斷釋放出來并參與循環(huán)反應(yīng),實(shí)現(xiàn)第一重信號(hào)放大,得到大量可引發(fā)下一步RCA 反應(yīng)的DNA 雙鏈結(jié)構(gòu);生成的DNA 雙鏈結(jié)構(gòu)與環(huán)狀DNA 模板雜交,并引發(fā)RCA 反應(yīng),產(chǎn)生大量的G-四鏈體重復(fù)序列,實(shí)現(xiàn)第二重信號(hào)放大。大量的G-四鏈體可與氯化血紅素(Hemin)結(jié)合,形成Hemin/G-四鏈體復(fù)合物,該復(fù)合物具有類辣根過氧化物酶(HRP)活性[26]。Hemin/G-四鏈體DNA 酶可催化H2O2 氧化3,3′,5,5′-四甲基聯(lián)苯胺(TMB)生成氧化態(tài)的TMB,使得無色TMB 溶液變成藍(lán)色。加入H2SO4 終止反應(yīng)后,溶液變成黃色。通過紫外-可見吸收光譜法可實(shí)現(xiàn)Hg2+的靈敏定量分析;此外,通過裸眼觀測(cè)溶液的顏色,可實(shí)現(xiàn)Hg2+的可視化檢測(cè)。

1 實(shí)驗(yàn)部分

1.1 儀器與試劑

UV-1800 型紫外-可見分光光度計(jì)(日本島津公司);AKRY-UP-1824 型艾柯超純水機(jī)(成都康寧實(shí)驗(yàn)專用純水設(shè)備廠);ME104E 型電子天平(上海梅特勒-托利多儀器有限公司);pH-2602 型酸度計(jì)(杭州陸恒生物科技有限公司)。

T4 DNA 連接酶、Phi29 DNA 聚合酶(phi29)、脫氧核糖核酸混合物(dNTP)、核酸外切酶Ⅰ(Exo-Ⅰ)、核酸外切酶Ⅲ(Exo-Ⅲ)由上海碧云天生物技術(shù)公司提供;3,3′,5,5′-四甲基聯(lián)苯胺鹽酸鹽(TMB·2HCl)、Hemin、H2O2、二硫蘇糖醇(DTT)、H2SO4、三(羥甲基)氨基甲烷鹽酸鹽(Tris-HCl)、N-2-羥乙基哌嗪-N′-2-乙磺酸(HEPES)、曲拉通X-100(Triton X-100)、二甲基亞砜(DMSO)和HgNO3 購于上海阿拉丁生化科技股份有限公司。所用試劑均為分析純,核酸序列均由上海生物工程股份有限公司合成,其DNA 序列見表1。汞離子儲(chǔ)備液由HgNO3 配制。Tris-HCl 緩沖溶液(50 mmol/L Tris-HCl, 1 mmol/L DTT,20 mmol/L MgCl2, pH 7.5);HEPES 緩沖溶液(50 mmol/L HEPES, 40 mmol/L KCl, 400 mmol/L NaCl, 0.1%Triton X-100, 2% DMSO, PH 7.4);10×T4 DNA 酶緩沖溶液(500 mmol/L Tris-HCl, 100 mmol/L MgCl2,50 mmol/L DTT, 10 mmol/L ATP, pH 7.5),將10×T4 DNA 酶緩沖溶液稀釋10 倍獲得1×T4 DNA 酶緩沖溶液。實(shí)驗(yàn)用水為超純水(電阻≥18.2 MΩ?cm)。

1.2 環(huán)狀DNA 模板的制備

將cDNA(10 μL, 100 μmol/L)和LP(50 μL, 100 μmol/L)于95 ℃加熱5 min,緩慢降至室溫;加入T4連接酶(10 μL, 2 U/μL)和1×T4 DNA 酶緩沖溶液(10 μL),孵育過夜,使DNA 末端連接在一起,形成環(huán)狀DNA 模板。將上述反應(yīng)液在65 ℃下加熱10 min,使T4 連接酶失活;加入Exo-Ⅰ(10 μL, 10 U/μL)和Exo-Ⅲ(10 μL, 10 U/μL),使反應(yīng)溶液的最終體積為100 μL,于37 ℃孵育2 h,以降解LP 鏈。將上述混合溶液在80 ℃下加熱15 min,使加入的酶失活。將得到的環(huán)狀DNA 模板在4 ℃下保存,備用。

1.3 Hg2+ 的檢測(cè)

采用Tris-HCl 緩沖溶液稀釋核酸探針。首先將HP1(100 μL, 5 μmol/L)和HP2(100 μL, 5 μmol/L)探針分別退火,即在95 ℃下加熱5 min 后緩慢降至室溫以保證發(fā)夾結(jié)構(gòu)的形成。將AP( 1 μL,5 μmol/L)、HP1(1 μL, 5 μmol/L)、HP2(1 μL, 5 μmol/L)、cDNA(1 μL, 5 μmol/L)、phi29 聚合酶(5μL, 2 U/μL)和dNTP(1 μL, 50 mmol/L)與5 μL 不同濃度的Hg2+反應(yīng)2 h,再加入5 μL Hemin(10 μmol/L)共同孵育30 min,得到Hemin/G-四鏈體DNA 酶。加入20 μL TMB 顯色液,室溫下反應(yīng)30 min,加入10 μL H2SO4 溶液(10 mol/L)終止反應(yīng)。反應(yīng)結(jié)束后,先拍攝實(shí)驗(yàn)所需的照片,再用HEPES 緩沖溶液將上述溶液稀釋至200 μL,采用UV-1800 型紫外-可見分光光度計(jì)測(cè)定溶液的紫外-可見吸收光譜。

2 結(jié)果與討論

2.1 傳感器的檢測(cè)原理

借助于T-Hg2+-T 錯(cuò)配雜交結(jié)構(gòu)以及目標(biāo)物誘發(fā)的CHA 和RCA 雙重信號(hào)放大策略,構(gòu)建了靈敏檢測(cè)Hg2+的生物傳感器,其原理如圖1 所示。傳感器包含了2 個(gè)DNA 發(fā)夾探針(HP1 和HP2)、1 個(gè)輔助探針(AP)以及1 個(gè)環(huán)狀DNA 模板探針(cDNA)。為防止無目標(biāo)物Hg2+存在時(shí)RCA 反應(yīng)自發(fā)發(fā)生,將引發(fā)RCA 反應(yīng)的引物序列分成兩段,分別設(shè)計(jì)在HP1 和HP2 的末端,并在HP1 和AP 鏈的末端(綠色部分)設(shè)計(jì)了4 個(gè)胸腺嘧啶(T)。Hg2+不存在時(shí), AP 探針無法與HP1 穩(wěn)定結(jié)合,并由于動(dòng)力學(xué)阻礙, HP1 和HP2無法發(fā)生自組裝,因此不能與cDNA 雜交, RCA 反應(yīng)無法發(fā)生。加入Hg2+后, Hg2+與AP 和HP1 上的胸腺嘧啶(T)特異性結(jié)合,形成穩(wěn)定的T-Hg2+-T 配位化合物,觸發(fā)鏈置換反應(yīng),將HP1 打開,暴露出HP1 發(fā)夾型DNA 探針中黃色區(qū)域的DNA 片段。暴露出的黃色序列可與HP2 中的黃色序列雜交,引發(fā)第二個(gè)鏈置換反應(yīng),使得HP1 和HP2 組裝在一起,并釋放出AP 鏈和Hg2+。其中,釋放出的Hg2+又可在AP 鏈的協(xié)助下引發(fā)HP1 和HP2 之間的另一個(gè)新的CHA 循環(huán)反應(yīng),再次釋放出AP 鏈和Hg2+。如此循環(huán)反應(yīng),最終產(chǎn)生大量的HP1/HP2 的雙鏈DNA 結(jié)構(gòu),達(dá)到第一重信號(hào)放大的目的。并且,此時(shí)分離在HP1 和HP2 末端的RCA 反應(yīng)的引發(fā)鏈被拉近了距離,緊密靠近在一起。隨后, HP1/HP2 雙鏈的末端與cDNA 雜交,在phi29 聚合酶及dNTP 存在下,引發(fā)RCA 放大反應(yīng),產(chǎn)生大量的G-四鏈體重復(fù)序列。在Hemin 存在下,G-四鏈體與Hemin 結(jié)合形成Hemin/G-四鏈體DNA 酶。Hemin/G-四鏈體DNA 酶具有類HRP 活性,可催化H2O2 將底物TMB 氧化成氧化態(tài)的TMB,使底物顏色由無色變成藍(lán)色,加入H2SO4 溶液終止反應(yīng)后,溶液顏色變?yōu)辄S色。通過紫外-可見吸收光譜法可實(shí)現(xiàn)Hg2+的靈敏檢測(cè)。此外,通過裸眼觀測(cè)溶液的顏色,實(shí)現(xiàn)Hg2+的可視化檢測(cè)。

2.2 傳感器的可行性分析

通過一系列的對(duì)照實(shí)驗(yàn)探究此傳感器的可行性。如圖2 所示, HP1 和cDNA 的混合液在450 nm 處出現(xiàn)了一個(gè)微弱的吸收峰(曲線a),這是由于Hemin 微弱的催化能力所致。將HP1、HP2 與cDNA 混合,不加入其它探針時(shí),出現(xiàn)了微弱增強(qiáng)的信號(hào)(曲線b),這可能是由于HP1 和HP2 探針之間非特異性的自組裝所致。在上述溶液中加入AP 探針后, 450 nm 處吸收值沒有明顯變化(曲線c),說明目標(biāo)物Hg2+不存在時(shí), AP 探針不會(huì)與HP1 結(jié)合,因此不會(huì)引發(fā)HP1 和HP2 之間的自組裝,后續(xù)的一系列反應(yīng)也不會(huì)發(fā)生。以上結(jié)果表明,在目標(biāo)物Hg2+不存在時(shí),所有的DNA 探針是可以穩(wěn)定共存的。將Hg2+(1 或5 nmol/L)與AP、HP1、HP2 和cDNA 一起孵育時(shí),可觀察到450 nm 處吸收值顯著增加(曲線d 和曲線e),表明加入Hg2+后, Hg2+可觸發(fā)CHA 反應(yīng),進(jìn)而引發(fā)RCA 放大反應(yīng),產(chǎn)生大量的Hemin/G-四鏈體DNA 酶, DNA 酶可催化H2O2 將TMB 氧化成氧化態(tài)的TMB,加入H2SO4 終止反應(yīng)后,在450 nm 處的吸收值增加。由圖2A 可見,隨Hg2+濃度增加,在450 nm 處的吸收值也隨之增大。與對(duì)照實(shí)驗(yàn)組相比,加入目標(biāo)物后,溶液的顏色明顯加深,并且隨著目標(biāo)物濃度增加,溶液的顏色也隨之加深(圖2B),此結(jié)果與紫外-可見吸收光譜法測(cè)定結(jié)果一致,表明本方法可以實(shí)現(xiàn)Hg2+的可視化檢測(cè)。

2.3 實(shí)驗(yàn)條件的優(yōu)化

為了獲得最佳的檢測(cè)性能,對(duì)Hemin 濃度及目標(biāo)物誘發(fā)CHA 和RCA 雙重信號(hào)放大反應(yīng)的時(shí)間進(jìn)行了優(yōu)化。如圖3A 所示,當(dāng)Hemin 的濃度從0.5 μmol/L 增至1.0 μmol/L 時(shí), 450 nm 處的吸光度增加值(A?A0)逐漸增大;當(dāng)Hemin 濃度為1.0 μmol/L 時(shí), A?A0 最大;當(dāng)Hemin 濃度超過1.0 μmol/L 后, A?A0逐漸降低。這是由于過高濃度的Hemin 會(huì)產(chǎn)生較大的背景信號(hào),使A?A0 減小。因此,本研究選擇Hemin濃度為1.0 μmol/L。如圖3B 所示,隨著目標(biāo)物誘發(fā)CHA 和RCA 雙重信號(hào)放大反應(yīng)時(shí)間的延長(zhǎng), A?A0 逐漸增大,直至120 min 后達(dá)到了一個(gè)平臺(tái),表明此時(shí)反應(yīng)達(dá)到平衡狀態(tài)。因此,選擇本研究的最佳反應(yīng)時(shí)間為120 min。

2.4 傳感器的檢測(cè)性能

在最優(yōu)實(shí)驗(yàn)條件下,進(jìn)一步探究了基于CHA 和RCA 雙重信號(hào)放大的傳感器的檢測(cè)性能。如圖4A所示,隨著Hg2+濃度由0.5 nmol/L 增大至10.0 nmol/L,在450 nm 處的吸光度逐漸增大,并且吸光度與目標(biāo)物Hg2+的濃度呈良好的線性關(guān)系(圖4B),線性方程為A=0.0943C+0.1653(R2=0.9949, A 為吸光度, C 為Hg2+的濃度)。本方法的檢出限(LOD, 3σ, n=11)低至0.21 nmol/L。根據(jù)世界衛(wèi)生組織(WHO)的規(guī)定,飲用水中Hg2+的最高允許濃度為30 nmol/L[7]。因此,本研究構(gòu)建的生物傳感器可滿足飲用水中Hg2+的檢測(cè)需求。此外,通過裸眼觀察不同濃度Hg2+所對(duì)應(yīng)溶液顏色的變化可以發(fā)現(xiàn),隨著Hg2+濃度增加,反應(yīng)溶液的顏色逐漸加深(圖4C),此結(jié)果與紫外-可見吸收光譜法的測(cè)定結(jié)果一致。由于檢測(cè)樣品和空白對(duì)照組之間存在明顯色差,通過裸眼觀察即可將1 nmol/L Hg2+和空白對(duì)照組區(qū)別開來,表明所構(gòu)建的方法可實(shí)現(xiàn)對(duì)Hg2+的可視化檢測(cè)。與之前文獻(xiàn)報(bào)道的Hg2+檢測(cè)方法相比(表2),本研究構(gòu)建的Hg2+檢測(cè)方法的檢測(cè)性能與之相當(dāng)或更優(yōu),并且不需要昂貴的儀器,可實(shí)現(xiàn)對(duì)Hg2+的可視化檢測(cè)。此外,采用此生物傳感器對(duì)5 nmol/L Hg2+進(jìn)行6 次重復(fù)測(cè)定,相對(duì)標(biāo)準(zhǔn)偏差(RSD)為4.2%,表明此傳感器具有良好的重現(xiàn)性。

2.5 傳感器的選擇性

采用此傳感器對(duì)其它環(huán)境相關(guān)的干擾金屬離子(Ag+、Fe2+、Cu2+、Ni2+、Zn2+、Mn2+、Pb2+和Cd2+)進(jìn)行檢測(cè),結(jié)果如圖5 所示, 5 nmol/L Hg2+產(chǎn)生了較大的響應(yīng)信號(hào),而10 倍濃度的其它非靶標(biāo)金屬離子在450 nm 處所產(chǎn)生的吸收值與背景信號(hào)相似, 表明此傳感器對(duì)Hg2+具有較好的選擇性,受其它離子的干擾較小。其原因可能是Hg2+可插入雙胸腺嘧啶堿基對(duì)中間,形成的T-Hg2+-T 結(jié)構(gòu)觸發(fā)CHA 反應(yīng),從而進(jìn)一步引發(fā)RCA 放大反應(yīng),產(chǎn)生較大的響應(yīng)信號(hào),而其它離子不能形成類似T-Hg2+-T 的結(jié)構(gòu),因此不能觸發(fā)CHA 反應(yīng),抑制了后續(xù)一系列反應(yīng)的發(fā)生,產(chǎn)生的信號(hào)較小。

2.6 實(shí)際樣品的檢測(cè)

利用此傳感器自來水樣品進(jìn)行檢測(cè),以驗(yàn)證方法的實(shí)用性。實(shí)驗(yàn)結(jié)果如表3 所示,在自來水樣品中未檢出Hg2+, 3 個(gè)不同加標(biāo)濃度(1、5 和10 nmol/L)下的Hg2+的回收率為99.8%~107.0%, RSDlt;0.2%,表明此傳感器可用于實(shí)際水樣中Hg2+的檢測(cè)。

3 結(jié)論

本研究基于CHA 和RCA 雙重信號(hào)放大策略構(gòu)建了高靈敏檢測(cè)Hg2+的生物傳感器。Hg2+可觸發(fā)CHA 反應(yīng),并進(jìn)一步引發(fā)RCA 放大反應(yīng),得到大量具有類HRP 活性的Hemin/G-四鏈體DNA 酶,催化底物反應(yīng)產(chǎn)生放大的響應(yīng)信號(hào)。由于采用了雙重信號(hào)放大策略,此傳感器具有較高的靈敏度和較好的選擇性,采用紫外-可見吸收光譜法測(cè)定Hg2+, LOD 低至0.21 nmol/L。同時(shí),通過反應(yīng)過程中溶液顏色的變化可實(shí)現(xiàn)對(duì)濃度為1 nmol/L 的Hg2+的可視化檢測(cè),這有利于在偏遠(yuǎn)地區(qū)水樣中Hg2+的現(xiàn)場(chǎng)可視化檢測(cè)。本傳感器操作方便、靈敏度高、選擇性好,可以實(shí)現(xiàn)可視化檢測(cè),在環(huán)境檢測(cè)領(lǐng)域具有潛在的應(yīng)用價(jià)值。

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