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中小課題組分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室的儀器設(shè)備建設(shè)與管理

2020-01-17 13:31遵義醫(yī)科大學(xué)附屬醫(yī)院貴州遵義563000
中國(guó)醫(yī)療器械信息 2020年17期
關(guān)鍵詞:分子生物學(xué)儀器設(shè)備試劑

遵義醫(yī)科大學(xué)附屬醫(yī)院 (貴州 遵義 563000)

內(nèi)容提要: 課題組管理下的分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室是實(shí)驗(yàn)室運(yùn)行的一種模式,是科研院所和高校實(shí)驗(yàn)室建設(shè)的重要組成部分。結(jié)合分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室運(yùn)行實(shí)際,從實(shí)驗(yàn)室儀器設(shè)備建設(shè)和管理兩方面,探討分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室的基本儀器配置和管理方法,為實(shí)驗(yàn)室相關(guān)的建設(shè)和管理提供參考。

隨著現(xiàn)代科學(xué)技術(shù)的發(fā)展以及國(guó)家對(duì)生命科學(xué)基礎(chǔ)研究的重視和大力投入,越來(lái)越多的高校和研究所開(kāi)始建立以課題組為單位的分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室[1]。相對(duì)于公共實(shí)驗(yàn)平臺(tái),課題組管理下的實(shí)驗(yàn)室實(shí)用性和針對(duì)性更強(qiáng),滿足科研工作最基本的實(shí)驗(yàn)需求,儀器利用率更高,可以更好地服務(wù)于科研工作[2]。本文結(jié)合目前分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室的普遍需求,對(duì)分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室通常需要配置的儀器設(shè)備及實(shí)驗(yàn)室管理經(jīng)驗(yàn)進(jìn)行總結(jié),以便對(duì)有實(shí)驗(yàn)室建設(shè)需求的相關(guān)人員提供參考。

1.分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室儀器設(shè)備配置

分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)所涉及的儀器和設(shè)備較多,但課題組管理下的中小實(shí)驗(yàn)室通常只需滿足基本的實(shí)驗(yàn)需求即可,其配置的儀器往往使用率較高。而大型儀器設(shè)備如共聚焦顯微鏡,測(cè)序儀,電子顯微鏡,質(zhì)譜色譜儀等儀器,以及動(dòng)/植物培養(yǎng)房,細(xì)胞培養(yǎng)間等平臺(tái),中小實(shí)驗(yàn)室的經(jīng)費(fèi)較難支持,相關(guān)的需求一般由公共的實(shí)驗(yàn)平臺(tái)來(lái)滿足,故本文對(duì)這些儀器和平臺(tái)的建設(shè)不進(jìn)行涉及,只從以下幾個(gè)方面總結(jié)相關(guān)的建設(shè)和管理經(jīng)驗(yàn)。

1.1 低溫保存設(shè)備

分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)的研究對(duì)象通常為核酸或蛋白質(zhì),核酸與蛋白質(zhì)在常溫下均可能加速降解,需要低溫設(shè)備在實(shí)驗(yàn)過(guò)程中提供低溫保護(hù)。實(shí)驗(yàn)過(guò)程中最常用到的低溫保護(hù)介質(zhì)是冰,制冰機(jī)是分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室的必備儀器,同時(shí)金屬冰浴器,冰盒也能在實(shí)驗(yàn)操作過(guò)程中提供良好的低溫保護(hù)。低溫保存樣品則需用到冰箱或者液氮罐,常用的保存溫度為4°C,-20°C,-80°C,-196°C四種,4°C可以短期放置活體微生物或不宜結(jié)冰的試劑,-20°C度可以短期保存核酸或蛋白及試劑藥品,-80°C冰箱可以為核酸或蛋白提供長(zhǎng)期保存條件,液氮?jiǎng)t通常用來(lái)保存新鮮的組織或細(xì)胞樣本。冰箱型號(hào)及種類極多,實(shí)驗(yàn)室建設(shè)者可依據(jù)自身的經(jīng)費(fèi)和實(shí)驗(yàn)需求,配置相應(yīng)大小和型號(hào),只要能夠保證達(dá)到相應(yīng)溫度并穩(wěn)定運(yùn)行即可。

1.2 制水設(shè)備

實(shí)驗(yàn)室用水可分為三個(gè)等級(jí):自來(lái)水、純凈水、去離子水。自來(lái)水可用于常規(guī)的實(shí)驗(yàn)設(shè)備清洗和衛(wèi)生維護(hù)。純凈水是自來(lái)水經(jīng)過(guò)蒸餾或過(guò)濾之后含有雜質(zhì)較少的水,可用于普通試劑或細(xì)菌培養(yǎng)基的配置,但因蒸餾設(shè)備安全和穩(wěn)定性較差,容易發(fā)生安全問(wèn)題,所以目前一般使用過(guò)濾設(shè)備來(lái)制取純凈水。去離子水是指除去了呈離子形式雜質(zhì)后的純水,其電阻可達(dá)到18MΩ,可用于核酸或蛋白等試劑的溶解,以防止其降解。去離子水生產(chǎn)設(shè)備一般需要從自來(lái)水取水并連續(xù)供水,因?yàn)樽詠?lái)水的水質(zhì)不穩(wěn)定,所以最好在去離子水生產(chǎn)設(shè)備的進(jìn)水前端加裝一個(gè)過(guò)濾裝置,可有效降低去離子水生產(chǎn)儀器中的過(guò)濾耗材的老化速度,同時(shí)也方便維護(hù)。

1.3 離心設(shè)備

離心設(shè)備一般用來(lái)進(jìn)行固體與液體,或不同密度的液體之間的分離,是實(shí)驗(yàn)室必需儀器之一。分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室常用離心轉(zhuǎn)速最高在13000r/min左右,因此普通的高速離心機(jī)即可以滿足要求。但因?yàn)椴糠謱?shí)驗(yàn)需要在低溫下進(jìn)行,因此需要至少一臺(tái)離心機(jī)具備低溫制冷功能。常用的離心體積為1.5/2.0mL,15mL,50mL體積,需要在購(gòu)買時(shí)對(duì)相應(yīng)的轉(zhuǎn)子進(jìn)行匹配購(gòu)買。如果實(shí)驗(yàn)內(nèi)容涉及密度梯度離心,則需要購(gòu)置超高速離心機(jī),最高離心力達(dá)到100000g以上。

1.4 PCR擴(kuò)增設(shè)備

常用的PCR擴(kuò)增設(shè)備主要有兩種,另一種是普通PCR議,主要是用于對(duì)目的基因普通的擴(kuò)增實(shí)驗(yàn);另一種是實(shí)時(shí)熒光定量?jī)x,其在普通PCR儀的基礎(chǔ)上增加一個(gè)熒光信號(hào)采集系統(tǒng)和計(jì)算機(jī)分析處理系統(tǒng),擴(kuò)增的結(jié)果通過(guò)熒光信號(hào)采集系統(tǒng)實(shí)時(shí)采集信號(hào)連接輸送到計(jì)算機(jī)分析處理系統(tǒng)得出量化的實(shí)時(shí)結(jié)果輸出,對(duì)基因進(jìn)行定量分析。一般常規(guī)的PCR儀是96孔的,但也有48孔和384孔的平臺(tái),購(gòu)買時(shí)需根據(jù)實(shí)驗(yàn)室自身需求進(jìn)行選擇。

1.5 核酸及蛋白分析設(shè)備

分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)中對(duì)核酸和蛋白的簡(jiǎn)單分析主要有兩種應(yīng)用,一種是基于電泳的分析,一種是基于分光光度計(jì)的定量分析。

電泳實(shí)驗(yàn)需要的儀器主要是電泳儀和電泳槽,核酸和蛋白電泳時(shí)的電泳儀是可以通用的,只要能提供足夠功率的電壓和電流即可,在實(shí)驗(yàn)購(gòu)置時(shí)最好選擇高功率并且可以多通道同時(shí)運(yùn)行的電泳儀。電泳槽分為垂直電泳槽和水平電泳槽兩種,分別用于瓊脂糖凝膠電泳和聚丙烯酰胺凝膠電泳。不管是核酸電泳還是蛋白電泳,最后一般均需要對(duì)分離結(jié)果進(jìn)行拍攝或曝光,現(xiàn)在有圖像處理系統(tǒng)可以對(duì)瓊脂糖凝膠的紫外激發(fā)熒光以及蛋白印跡實(shí)驗(yàn)的化學(xué)發(fā)光進(jìn)行直接拍攝成像,不需要進(jìn)行顯影定影等操作,可以大大簡(jiǎn)化實(shí)驗(yàn)過(guò)程,提高效率,性價(jià)比很高。

基于分光光度計(jì)的定量?jī)x器主要有使用比色杯的分光光度計(jì),超微量分光光度計(jì)和酶標(biāo)儀,使用比色杯的產(chǎn)品相對(duì)穩(wěn)定,使用范圍更廣,但操作起來(lái)相對(duì)繁瑣,而微量分光光度計(jì)操作簡(jiǎn)單,保養(yǎng)方便,所需樣本體積小,相對(duì)來(lái)說(shuō),分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)中超微量分光光度計(jì)的使用頻率更高,但價(jià)格比老式的分光光度計(jì)要高。酶標(biāo)儀的分析通量更高,可在適時(shí)間內(nèi)對(duì)大量樣本進(jìn)行檢查,同時(shí)其覆蓋的波長(zhǎng)范圍更廣。

1.6 顯微設(shè)備

顯微鏡可以用來(lái)觀察細(xì)胞形態(tài)和切片,分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室至少配備一臺(tái)常規(guī)正置顯微鏡。如果有細(xì)微組織的操作,則可以配置體視顯微鏡,用于對(duì)組織進(jìn)行精細(xì)操作。如果實(shí)驗(yàn)涉及熒光觀察,則需要購(gòu)置熒光顯微鏡,其可以配置有圖像處理功能分析系統(tǒng),方便進(jìn)行鏡下圖像進(jìn)行拍攝和分析。

1.7 計(jì)量設(shè)備

分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)中常用到的計(jì)量設(shè)備主要是天平,pH計(jì)和溫度計(jì)。天平用于稱量試劑藥品的質(zhì)量,實(shí)驗(yàn)室配備精確到0.0001g和0.01g兩個(gè)量程的天平即可基本滿足分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)的需求,如有需求,也可購(gòu)置其他稱量精度的天平。pH計(jì)用于測(cè)量液體的酸堿度,溫度計(jì)用于測(cè)量空氣或液體的溫度,可根據(jù)實(shí)驗(yàn)室需求,購(gòu)置相應(yīng)規(guī)格和量程的型號(hào)。

1.8 無(wú)菌設(shè)備

為防止操作環(huán)境中微生物等對(duì)實(shí)驗(yàn)物品的污染,常需要對(duì)實(shí)驗(yàn)物品進(jìn)行滅菌操作。常見(jiàn)滅菌設(shè)備也就是高壓滅菌鍋,其原理都是在高溫高濕狀態(tài)下對(duì)微生物等進(jìn)行滅殺,但價(jià)格差異也很大,實(shí)驗(yàn)室購(gòu)置時(shí)盡量選擇可以設(shè)置滅菌時(shí)間和滅菌溫度的自動(dòng)化設(shè)備,在操作上會(huì)方便很多,也更安全。

實(shí)驗(yàn)物品進(jìn)行滅菌后,最好在無(wú)菌操作平臺(tái)中進(jìn)行操作,常見(jiàn)的無(wú)菌操作平臺(tái)有超凈工作臺(tái)和生物安全柜兩種,前者只能保證操作平臺(tái)內(nèi)部的無(wú)菌,而無(wú)法確保操作平臺(tái)外的生物安全,因此只能用來(lái)操作生物安全級(jí)別很低的微生物,如大腸桿菌等。而生物安全柜既可以保證平臺(tái)內(nèi)部的無(wú)菌條件,還能避免內(nèi)部有害物質(zhì)向外的泄漏。對(duì)不同的生物安全等級(jí)需求,生物安全柜也有對(duì)應(yīng)的安全級(jí)別型號(hào),選購(gòu)時(shí)需結(jié)合自身的實(shí)驗(yàn)需要選擇對(duì)應(yīng)安全等級(jí)的生物安全柜。

1.9 試劑保存柜

試劑保存柜可分為兩種,一種是危險(xiǎn)品保存柜,一種是普通保存柜。目前對(duì)所有實(shí)驗(yàn)室均已規(guī)定必須對(duì)危險(xiǎn)化學(xué)品進(jìn)行單獨(dú)存放,所以危險(xiǎn)品保存柜是實(shí)驗(yàn)室必須購(gòu)置的設(shè)備之一,用于存放易燃易爆,易制毒,有腐蝕性的試劑和藥品,實(shí)驗(yàn)室建設(shè)時(shí)需根據(jù)自身需要,購(gòu)買相應(yīng)規(guī)格和數(shù)量的危險(xiǎn)品保存柜。普通試劑保存柜用于存放普通試劑和藥品,要求不是很高,可視經(jīng)費(fèi)情況選購(gòu)即可。

1.10 通風(fēng)設(shè)備

分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)常會(huì)用到一些具有揮發(fā)性或者具有刺激性氣味的試劑和藥品,因此有必要裝置一些通風(fēng)設(shè)備。最常用到的是通風(fēng)櫥,另外,安置在實(shí)驗(yàn)臺(tái)上的抽風(fēng)設(shè)備也是個(gè)不錯(cuò)的選擇。如果實(shí)驗(yàn)室所在地區(qū)空氣質(zhì)量較差,浮塵較多,可以考慮在實(shí)驗(yàn)室區(qū)域安裝新風(fēng)過(guò)濾系統(tǒng),能有效降低實(shí)驗(yàn)室內(nèi)部的灰塵積累。

1.11 其他設(shè)備

分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室除上述儀器設(shè)備外,一般還需要微生物培養(yǎng)箱、鼓風(fēng)干燥箱、超聲波破碎儀、水浴鍋、漩渦振蕩器、移液器、脫色搖床、超聲波清洗儀、投影儀等,可視實(shí)驗(yàn)室需要進(jìn)行購(gòu)置。

2.實(shí)驗(yàn)室管理

實(shí)驗(yàn)室建設(shè)和管理是一項(xiàng)繁瑣而且艱巨的工作,實(shí)驗(yàn)室設(shè)備眾多,實(shí)驗(yàn)人員流動(dòng)性較大,新進(jìn)的人員又對(duì)實(shí)驗(yàn)室不甚了解,因此,科學(xué)高效的實(shí)驗(yàn)室管理是保證實(shí)驗(yàn)室各項(xiàng)工作順利運(yùn)行的基礎(chǔ)[3]。以下將從安全,衛(wèi)生,儀器和試劑耗材等方面討論實(shí)驗(yàn)室的相關(guān)管理。

2.1 安全管理

安全管理是實(shí)驗(yàn)室一切工作正常進(jìn)行的前提和保障。實(shí)驗(yàn)室建立之后應(yīng)先結(jié)合實(shí)際,擬定安全規(guī)章制度,并做到所有人員對(duì)安全規(guī)定的了解和掌握,并及時(shí)對(duì)新進(jìn)人員進(jìn)行培訓(xùn)。如果有條件,盡量使實(shí)驗(yàn)室人員從同一個(gè)大門進(jìn)出,然后在大門安裝刷卡門禁,控制無(wú)關(guān)人員的進(jìn)入,同時(shí)對(duì)實(shí)驗(yàn)室走廊和每間實(shí)驗(yàn)室安裝視頻監(jiān)控,做到全面覆蓋、無(wú)盲區(qū)的效果。

2.2 衛(wèi)生管理

實(shí)驗(yàn)室如果沒(méi)有專職的衛(wèi)生人員,需要對(duì)實(shí)驗(yàn)室人員進(jìn)行值日安排,做到每周一次大掃除,每天值日。因?yàn)閷?shí)驗(yàn)室人員流動(dòng)性較大,值日生的執(zhí)行力也存在差異,因此需要將值日內(nèi)容進(jìn)行細(xì)化,打印到表格,值日時(shí)依項(xiàng)完成,做到?jīng)]有遺漏。

2.3 儀器設(shè)備管理

儀器設(shè)備的良好運(yùn)行都需要良好的維護(hù)和正確的使用,實(shí)驗(yàn)室所有人員都應(yīng)該進(jìn)行相關(guān)常用儀器的使用培訓(xùn),達(dá)到會(huì)用,會(huì)維護(hù),遇到問(wèn)題會(huì)處理的良好狀態(tài)。對(duì)大型貴重儀器實(shí)行專人管理,制作相應(yīng)的維護(hù)登記表,定期進(jìn)行檢查維護(hù),將儀器保持在良好狀態(tài),排除隱患。

2.4 試劑耗材管理

試劑耗材由實(shí)驗(yàn)室管理人員專人采購(gòu),對(duì)常用試劑應(yīng)留有余量,分類存放,并做好臺(tái)賬記錄。國(guó)家規(guī)定的危險(xiǎn)化學(xué)品必須放于專門的?;裰?,實(shí)行雙鎖雙人保管制度,并定期檢查使用記錄和保存條件,杜絕泄漏等問(wèn)題的發(fā)生。

3.小結(jié)

課題組實(shí)驗(yàn)室的建設(shè)和管理是一項(xiàng)非常復(fù)雜的工作,儀器設(shè)備的購(gòu)置只是實(shí)驗(yàn)室建設(shè)的第一步,要保證實(shí)驗(yàn)室的高效運(yùn)行,需要課題組師生共同努力對(duì)設(shè)備和試劑進(jìn)行科學(xué)有效地管理和維護(hù),確保所有儀器處于良好的運(yùn)行狀態(tài),合理有效整合各方面資源,以最少的投入達(dá)到最大的科研效益。

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