孫萍萍,王佳慧,楊世昭,任 晴,王蔣麗,謝廣成*
(1.承德醫(yī)學(xué)院基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院,河北承德 067000;2.承德市疾病預(yù)防控制中心)
腸道病毒A71型(enterovirus-A71,EV-A71)作為手足口?。╤and,foot,and mouth disease,HFMD)的主要病原體之一,其感染引起的HFMD給嬰幼兒的身心健康帶來巨大的負(fù)擔(dān)[1]。我國自2008年發(fā)生大規(guī)模的HFMD暴發(fā)以來,就將HFMD列入國家法定傳染病監(jiān)測名錄,進(jìn)行全國范圍內(nèi)的流行監(jiān)測[2]。EV-A71作為小RNA病毒科腸道病毒屬病毒,其單股正鏈的基因組RNA只編碼一個(gè)多聚前體蛋白并經(jīng)自身編碼的2A和3C蛋白酶剪切成熟為4個(gè)P1區(qū)結(jié)構(gòu)蛋白(VP1、VP2、VP3和VP4)、3個(gè)P2區(qū)非結(jié)構(gòu)蛋白(2A、2B和2C)及4個(gè)P3區(qū)非結(jié)構(gòu)蛋白(3A、3B、3C和3D)[3,4]。
EV-A71能夠感染不同類型的宿主細(xì)胞同時(shí)活化不同的相關(guān)信號(hào)途徑,作者所在的課題組前期已經(jīng)將該部分進(jìn)行過詳細(xì)綜述[5]。可以明確的是,EV-A71感染宿主細(xì)胞后能夠活化PI3K/AKT途徑和p38途徑[6-8],且EV-A71感染宿主細(xì)胞后Sam68與Src形成的復(fù)合物能夠與PI3K的調(diào)節(jié)亞基p85結(jié)合[9]。上述研究是基于EV-A71完整活病毒感染宿主細(xì)胞完成的,然而EV-A71進(jìn)入宿主細(xì)胞后,復(fù)制過程中產(chǎn)生的成熟的結(jié)構(gòu)蛋白和非結(jié)構(gòu)蛋白在EVA71與宿主細(xì)胞互作中的作用目前仍不清楚。因此,本文開展EV-A71的4個(gè)結(jié)構(gòu)蛋白和8個(gè)非結(jié)構(gòu)蛋白與宿主細(xì)胞互作的研究,重點(diǎn)關(guān)注EV-A71的亞單位蛋白對(duì)p85表達(dá)和p38途徑的活化,以期為EV-A71與宿主細(xì)胞的互作提供科學(xué)依據(jù)。
腸道病毒A71型阜陽株(GenBank:EU703812)為課題組前期實(shí)驗(yàn)用病毒株[10,11]。pcDNA3.1(+)/myc-His A真核表達(dá)載體購買自Invitrogen公司,質(zhì)粒小量擴(kuò)增后由本實(shí)驗(yàn)室保存。HEK293細(xì)胞為課題組前期使用的細(xì)胞并由本實(shí)驗(yàn)室保存[11]。50ml離心管、T25細(xì)胞培養(yǎng)瓶和6孔細(xì)胞培養(yǎng)板購JET BIOFIL公司;10μl、200μl和1ml無菌微量吸頭、1.5ml離心管購自Axygen公司;PVDF膜購置Merck公司。
DMEM培養(yǎng)基、0.25%Trypsin-EDTA和Opti-MEM基礎(chǔ)培養(yǎng)基購自Gibco公司;小牛血清購自Sigma公司;SuperFect轉(zhuǎn)染試劑購自Qiagen公司;DH5α感受態(tài)細(xì)胞購自天根生化科技(北京)有限公司;蛋白胨和酵母提取物購自O(shè)xoid公司;RIPA細(xì)胞裂解液、蛋白酶磷酸酶抑制劑混合物、BCA蛋白定量試劑盒、瓊脂糖、BeyoRT? II cDNA第一鏈合成試劑盒(RNase H-)和Easy-Load? PCR Master Mix(Blue,2X)購自碧云天公司;限制性內(nèi)切酶Hind III和Not I購買自New England Biolabs公司;T4 DNA連接酶購置Promega;青鏈霉素混合液、PBS緩沖液和氨芐青霉素粉末購自索萊寶公司;E.Z.N.A. Plasmid Mini Kit、E.Z.N.A. Endo-free Plasmid Maxi Kit購自O(shè)MEGA公司;Gel/PCR DNA Fragments Extraction Kit和Viral Nucleic Acid Extraction Kit II 購自Geneaid公司;兔抗人p85和兔抗人p-p38一抗購自CST公司;小鼠抗人β-actin、HRP標(biāo)記的山羊抗兔和山羊抗小鼠IgG(H+L)購自碧云天公司;ECL化學(xué)發(fā)光底物試劑盒購自Biosharp公司;彩色預(yù)染蛋白marker購自Thermo公司。
1.3.1 EV-A71結(jié)構(gòu)蛋白和非結(jié)構(gòu)蛋白基因的重組真核表達(dá)質(zhì)粒構(gòu)建 以EV-A71阜陽株的全基因組序列(GenBank:EU703812)為參考序列,采用Primer Premier 5對(duì)EV-A71基因編碼區(qū)的11個(gè)基因片段進(jìn)行全長擴(kuò)增引物設(shè)計(jì),其中正向和反向引物的5′端分別添加Hind III和Not I限制性內(nèi)切酶的靶序列,送北京天一輝遠(yuǎn)公司進(jìn)行引物合成。采用Viral Nucleic Acid Extraction Kit II進(jìn)行病毒核酸提取,按照BeyoRT? II cDNA第一鏈合成試劑盒(RNase H-)說明書進(jìn)行cDNA合成,反應(yīng)程序?yàn)?2℃,60min;95℃,5min;4℃,5min;按照50μl的擴(kuò)增體系,使用Easy-Load? PCR Master Mix(Blue,2X)進(jìn)行PCR擴(kuò)增體系配制,其中正/反向引物各添加2.5μl、cDNA添加2.5μl。擴(kuò)增反應(yīng)程序?yàn)?4℃,5min;(95℃,30s;55℃,30s;72℃,45s)×40;72℃,10min;4℃,5min。EV-A71的2BC基因片段擴(kuò)增時(shí)使用2B的正向引物和2C的反向引物,3A和3AB基因片段擴(kuò)增時(shí)使用3A共同的正向引物,反向引物為3A和3AB的各自反向引物。擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳后,在紫外切膠儀下進(jìn)行目的片段的回收,并使用Gel/PCR DNA Fragments Extraction Kit進(jìn)行目的產(chǎn)物的回收和純化。對(duì)EV-A71結(jié)構(gòu)蛋白和非結(jié)構(gòu)蛋白基因的12個(gè)基因片段和pcDNA3.1(+)/myc-His A空載體進(jìn)行Hind III和Not I雙酶切反應(yīng),反應(yīng)體系和反應(yīng)條件按照試劑盒說明書進(jìn)行。使用T4 DNA連接酶進(jìn)行EV-A71目的基因與pcDNA3.1(+)/myc-His A載體的連接反應(yīng),4℃過夜。將連接產(chǎn)物通過42℃熱激60s方式轉(zhuǎn)化進(jìn)DH5α感受態(tài)細(xì)胞,將轉(zhuǎn)化產(chǎn)物均勻涂抹于含有氨芐青霉素的LB固體培養(yǎng)板,倒置37℃恒溫培養(yǎng)箱培養(yǎng)過夜,提取單菌落加入到5ml含有氨芐青霉素的LB液體培養(yǎng)基中,37℃恒溫培養(yǎng)箱培養(yǎng)過夜。使用E.Z.N.A. Plasmid Mini Kit進(jìn)行重組質(zhì)粒小量提取,送北京天一輝遠(yuǎn)公司進(jìn)行測序和PCR擴(kuò)增鑒定。
1.3.2 去內(nèi)毒素的EV-A71亞單位基因的重組質(zhì)粒制備 將經(jīng)測序和PCR鑒定正確的EV-A71結(jié)構(gòu)蛋白和非結(jié)構(gòu)蛋白基因的12個(gè)基因重組真核表達(dá)質(zhì)粒重新按照上述步驟進(jìn)行轉(zhuǎn)化和涂板操作,挑選單菌落加入到30ml含有氨芐青霉素的LB液體培養(yǎng)基中,37℃恒溫培養(yǎng)箱培養(yǎng)過夜,次日將30ml培養(yǎng)過夜的培養(yǎng)產(chǎn)物均分成2份,分別加入到300ml含有氨芐青霉素的LB液體培養(yǎng)基中,37℃恒溫培養(yǎng)箱培養(yǎng)過夜。5000rpm離心15min,棄上清收集菌體,直至所有菌體沉淀收集完成。使用E.Z.N.A. Endo-free Plasmid Maxi Kit進(jìn)行去內(nèi)毒素質(zhì)粒的大量提取,并進(jìn)行質(zhì)粒濃度測定。
1.3.3 重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)染 使用添加1%青鏈霉素的含有10%小牛血清的DMEM培養(yǎng)基培養(yǎng)HEK293細(xì)胞,將細(xì)胞豐度達(dá)90%左右的HEK293細(xì)胞用0.25%Trypsin-EDTA進(jìn)行細(xì)胞消化并接種至6孔細(xì)胞培養(yǎng)板,待HEK293細(xì)胞豐度達(dá)60%~70%時(shí)開始轉(zhuǎn)染。按照SuperFect Transfection Reagent試劑盒說明書使用無血清的Opti-MEM基礎(chǔ)培養(yǎng)基配制轉(zhuǎn)染復(fù)合物,每孔細(xì)胞按照2μg質(zhì)粒的劑量進(jìn)行轉(zhuǎn)染,室溫靜止30min后,觀察轉(zhuǎn)染復(fù)合物的渾濁度;每孔按照100μl轉(zhuǎn)染復(fù)合物的體積添加至細(xì)胞培養(yǎng)基中,37℃培養(yǎng)6h后,使用PBS緩沖液清洗細(xì)胞3次,加入到新鮮含有10%小牛血清的DMEM培養(yǎng)基中進(jìn)行HEK293細(xì)胞培養(yǎng),直至轉(zhuǎn)染時(shí)間達(dá)24h,每個(gè)質(zhì)粒轉(zhuǎn)染設(shè)置3個(gè)獨(dú)立平行實(shí)驗(yàn)組。1.3.4 免疫印跡檢測 轉(zhuǎn)染時(shí)間達(dá)24h后,盡量去除DMEM培養(yǎng)基,使用添加過蛋白酶和磷酸酶抑制劑的RIPA裂解液裂解HEK293細(xì)胞,收取總蛋白并使用BCA蛋白定量試劑盒進(jìn)行蛋白定量,制備SDS-PAGE電泳上樣蛋白樣品,使用12%的分離膠進(jìn)行SDS-PAGE凝膠電泳;使用含有20%甲醇的轉(zhuǎn)膜液在100V下轉(zhuǎn)膜60min,將蛋白轉(zhuǎn)膜至PVDF膜;將轉(zhuǎn)膜完成的PVDF膜加入到含有5%脫脂奶粉的PBST封閉液中進(jìn)行室溫封閉1h;將p85、p-p38和β-actin一抗按照1:1000的比例進(jìn)行稀釋,一抗4℃孵育PVDF膜過夜;PBST洗液清洗3次,每次10min;HRP標(biāo)記的二抗也按照1:1000的比例進(jìn)行稀釋,室溫孵育PVDF膜2h;PBST洗液清洗3次,每次10min;使用ECL化學(xué)發(fā)光底物試劑盒進(jìn)行發(fā)光顯影。
EV-A71基因組的P1區(qū)的4個(gè)結(jié)構(gòu)蛋白基因VP1(891bp)、VP2(762bp)、VP3(726bp)和VP4(207bp);P2區(qū)的3個(gè)非結(jié)構(gòu)蛋白基因2A(450bp)、2B(297bp)、2C(987bp);P3區(qū)的4個(gè)非結(jié)構(gòu)蛋白基因3A(258bp)、3C(549bp)、3D(1386bp)、3AB(324bp)(因3B只有66bp,所以將3A、3B構(gòu)建在一起),此外還構(gòu)建了2BC(1284bp),均呈現(xiàn)預(yù)期大小的目的條帶(圖1)。因此,將構(gòu)建的EV-A71基因組亞區(qū)域的12個(gè)真核質(zhì)粒分別命名為pcDNA3.1-EV71-VP1/VP2/VP3/VP4/2A/2B/2C/2BC/3A/3C/3D/3AB。12個(gè)真核重組質(zhì)粒經(jīng)序列測定與EV-A71基因組(GenBank:EU703812)的序列一致。
圖1 EV-A71亞單位蛋白基因的PCR鑒定
將2μg的pcDNA3.1-EV71-VP1/VP2/VP3/VP4質(zhì)粒轉(zhuǎn)染至HEK293細(xì)胞24h后,EV-A71的P1區(qū)結(jié)構(gòu)蛋白VP1、VP3和VP4能夠上調(diào)p85的表達(dá)水平;EV-A71的結(jié)構(gòu)蛋白VP2、VP3和VP4能夠提升p38的磷酸化水平(圖2)。
圖2 EV-A71 P1區(qū)結(jié)構(gòu)蛋白對(duì)p85表達(dá)和p38途徑活化的影響
將2μg的pcDNA3.1-EV71-2A/2B/2C/2BC質(zhì)粒轉(zhuǎn)染至HEK293細(xì)胞24h后,EV-A71的P2區(qū)4個(gè)非結(jié)構(gòu)蛋白2A、2B、2C和2BC均能顯著提升p85的表達(dá)水平和p38的磷酸化水平(圖3)。
圖3 EV-A71 P2區(qū)非結(jié)構(gòu)蛋白對(duì)p85表達(dá)和p38途徑活化的影響
將2μg的pcDNA3.1-EV71-3A/3C/3D/3AB質(zhì)粒轉(zhuǎn)染至HEK293細(xì)胞24h后,EV-A71的3A、3C、3D和3AB均能提升p85的表達(dá)水平,特別是EV-A71 3A蛋白提升p85表達(dá)最為明顯。EV-A71的3A、3C、3D和3AB均能提升p38的磷酸化水平,特別是EV-A71 3AB的提升效果最為明顯(圖4)。
圖4 EV-A71 P3區(qū)非結(jié)構(gòu)蛋白對(duì)p85表達(dá)和p38途徑活化的影響
磷酸肌醇-3激酶(phosphoinositide-3 kinase,PI3K)途徑是細(xì)胞內(nèi)一條重要的信號(hào)途徑,該途徑能夠調(diào)控細(xì)胞增殖、細(xì)胞分化、細(xì)胞凋亡、細(xì)胞遷移和細(xì)胞代謝等不同過程[12]。PI3K家族依據(jù)結(jié)構(gòu)和底物特異性的不同,可以分為PI3K IA和IB、PI3K II和PI3K III成員,其中PI3K IA是由催化亞基(p110α、p110β和p110δ)和調(diào)節(jié)亞基(p85α、p85β、p55γ、p55α和p50α)互作形成的異源二聚體[13]。前期研究和作者所在課題組的研究都表明,EV-A71感染宿主細(xì)胞后能夠活化PI3K/AKT途徑[6,7,14],同時(shí)明確EV-A71感染能夠引起Sam68/Src復(fù)合物與p85互作[9],但是將EV-A71基因組編碼經(jīng)EV-A71的2A和3C蛋白酶剪切成熟的結(jié)構(gòu)蛋白和非結(jié)構(gòu)蛋白到底能不能與PI3K互作,目前仍是未知。關(guān)于EV-A71編碼的結(jié)構(gòu)蛋白和非結(jié)構(gòu)蛋白的功能目前已經(jīng)基本確定[3,15]。總的來說,EV-A71的4個(gè)結(jié)構(gòu)蛋白構(gòu)成EV-A71的衣殼,其中VP1、VP2和VP3位于衣殼表面、VP4位于衣殼內(nèi)部[16]。VP1主要介導(dǎo)與病毒受體的結(jié)合[17],是表面抗原的同時(shí)還具有主要的抗原結(jié)合位點(diǎn)[18]。VP2和VP3同樣與EV-A71的抗原性有關(guān),VP2的142-146位氨基酸是一個(gè)線性、非中和抗原表位,將144位氨基酸進(jìn)行S/T單點(diǎn)突變會(huì)導(dǎo)致VP2的抗原性丟失[19]。VP3的55-69位氨基酸是一個(gè)新的構(gòu)象表位[20]。VP4蛋白能夠插入到細(xì)胞膜上形成通道,讓EV-A71的基因組RNA進(jìn)入細(xì)胞內(nèi),進(jìn)而完成脫殼過程[21]。目前已知EV-A71的非結(jié)構(gòu)蛋白的主要功能是促進(jìn)病毒復(fù)制,特別是EV-A71的2A和3C蛋白可通過剪切天然免疫的重要受體和配體分子實(shí)施免疫逃逸,進(jìn)而促進(jìn)病毒的復(fù)制[3,5,15,22]。另外,EV-A71的3D聚合酶還能夠引起宿主細(xì)胞周期的阻滯[23]。本研究通過構(gòu)建EV-A71的結(jié)構(gòu)蛋白和非結(jié)構(gòu)蛋白的真核重組質(zhì)粒,將其轉(zhuǎn)入到HEK293細(xì)胞內(nèi),發(fā)現(xiàn)除了EV-A71的結(jié)構(gòu)蛋白VP2外,結(jié)構(gòu)蛋白(VP1、VP3和VP4)及7個(gè)非結(jié)構(gòu)蛋白均能提高PI3K的調(diào)節(jié)亞基p85的表達(dá)水平,這一結(jié)果意味著EVA71的這些亞單位蛋白能夠潛在與p85互作,但是具體機(jī)制仍需要進(jìn)一步的深入研究。目前的研究進(jìn)展顯示,流感病毒非結(jié)構(gòu)蛋白NS1的YXXM基序(YLTDM,89-93aa)基序能夠結(jié)合p85的SH2區(qū),而NS1的PXXP(PSLP,164-167aa)基序能夠結(jié)合p85的SH3區(qū)[24];塞姆利基森林病毒通過nsP3蛋白的YXXM基序(YEPM,369-372aa)與p85的SH2區(qū)結(jié)合活化PI3K/AKT途徑,進(jìn)而活化細(xì)胞糖酵解,最終促進(jìn)SFV復(fù)制[25]。因此,本研究結(jié)果提示,EV-A71也有可能利用其結(jié)構(gòu)蛋白或非結(jié)構(gòu)蛋白,通過互作p85后活化PI3K/AKT途徑,最后調(diào)控宿主細(xì)胞的糖代謝過程,并為EV-A71的復(fù)制提供能量來源,然而這一科學(xué)假設(shè)仍需要進(jìn)一步的生物學(xué)實(shí)驗(yàn)進(jìn)行驗(yàn)證。
p38信號(hào)途徑也是細(xì)胞內(nèi)的一條重要途徑,涉及到組織自穩(wěn)態(tài)、免疫反應(yīng)、病毒復(fù)制等不同過程[26]。抑制人皮膚成纖維細(xì)胞和HeLa細(xì)胞的p38信號(hào)途徑,進(jìn)而抑制馬亞羅病毒的復(fù)制[27]。另外,新城疫病毒[28]、丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)[29]都能夠在其感染過程中活化p38途徑,促進(jìn)病毒的復(fù)制水平。HCV還能夠通過活化p38途徑來介導(dǎo)細(xì)胞糖代謝過程,最終調(diào)控HCV子代病毒粒子的釋放[30]。本研究證實(shí)了EV-A71的結(jié)構(gòu)蛋白和非結(jié)構(gòu)蛋白能夠不同程度的調(diào)控p38的磷酸化,進(jìn)而調(diào)控p38途徑的活化,但是p38途徑的活化是否也能夠介導(dǎo)宿主細(xì)胞糖代謝過程最終影響EV-A71的復(fù)制,目前仍是未知,需要進(jìn)一步研究。
綜上所述,本研究確定了EV-A71的結(jié)構(gòu)蛋白和非結(jié)構(gòu)蛋白能夠在一定程度上調(diào)控p85的表達(dá)和p38途徑的活化,說明EV-A71在感染宿主細(xì)胞后的復(fù)制過程中能夠通過其復(fù)制產(chǎn)生的成熟的結(jié)構(gòu)蛋白和非結(jié)構(gòu)蛋白與宿主細(xì)胞互作,進(jìn)而影響宿主細(xì)胞的糖酵解、細(xì)胞凋亡等過程,但是具體機(jī)制仍需要進(jìn)一步的深入研究。