張 斌,杜沈霖,馬 璇,符 甜,柯芷茵,王雪純,劉勇軍*,梁愛玲* (.廣東醫(yī)科大學(xué)生物化學(xué)與分子生物學(xué)教研室,臨床生物化學(xué)教研室,廣東省醫(yī)學(xué)分子診斷重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,廣東東莞 2808;2.青島市市立醫(yī)院醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)部,山東青島 2660;.東莞市人民醫(yī)院檢驗(yàn)科,廣東東莞 2800;.石家莊新樂市人民醫(yī)院檢驗(yàn)科,河北石家莊 00700;.湛江市中心醫(yī)院檢驗(yàn)科,廣東湛江 200)
肺癌已經(jīng)成為全球癌癥相關(guān)死亡的主要原因[1],其中80%~85%為非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)[2]。目前,放療和化療仍是治療NSCLC 的主要手段。吉西他濱作為最重要的胞嘧啶核苷衍生抗腫瘤藥,一方面作用于DNA 合成期(synthesis,S);另一方面阻斷細(xì)胞由G1期到S 期進(jìn)展,干擾DNA 的自我復(fù)制,促進(jìn)細(xì)胞凋亡[3]。外泌體作為一類直徑30~150 nm 雙層膜包裹的囊泡[4],可攜帶母本細(xì)胞遺傳物質(zhì)到受體細(xì)胞進(jìn)行信息傳遞,在腫瘤細(xì)胞發(fā)生、侵襲、轉(zhuǎn)移及耐藥方面發(fā)揮重要作用[5]。微小RNA(miRNAs)是一類具有調(diào)控功能的非編碼RNA,可調(diào)節(jié)mRNA 的表達(dá),改變靶蛋白的表達(dá)水平[6]。腫瘤細(xì)胞的耐藥也與miRNAs 的表達(dá)異常有關(guān)[7]。miRNA 在腫瘤增殖、侵襲和耐藥方面有重要作用,是腫瘤治療的相關(guān)靶點(diǎn)[8]。有研究顯示,miRNA 一方面可以參與腫瘤細(xì)胞的耐藥過程,另一方面還可以干擾上下游信號通路逆轉(zhuǎn)腫瘤耐藥[9]。本課題組前期構(gòu)建了對吉西他濱耐藥的人類肺腺癌細(xì)胞株(A549/G+),分別提取了A549 敏感株(A549/G-)和耐藥株(A549/G+)的外泌體,進(jìn)行miRNAs 芯片檢測和表達(dá)差異分析,發(fā)現(xiàn)let-7i-5p 是兩株細(xì)胞中表達(dá)差異最大的miRNA;同時,生物信息學(xué)預(yù)測提示let-7i-5 發(fā)揮作用可能與細(xì)胞周期蛋白依賴性激酶6(CDK6)有關(guān)[10]。本文旨在研究let-7i-5p 在A549/G+細(xì)胞耐受吉西他濱中所起的作用及機(jī)制,為闡明肺癌耐藥機(jī)制提供新的實(shí)驗(yàn)依據(jù)。
非小細(xì)胞肺癌吉西他濱敏感株A549/G-為本課題組保存;非小細(xì)胞肺癌耐吉西他濱耐藥株A549/G+為本課題組誘導(dǎo)后保存。A549/G+細(xì)胞復(fù)蘇后,常規(guī)消化并傳代。let-7i-5p 及內(nèi)參基因U6 為上海生工生物公司設(shè)計(jì)合成。let-7i-5p RT 引物:5′-GTCGTATCCAG TGCAGGGTCCGAGGTATTCGCACTGGATACGACA ACAGC-3′;上游引物:5′-CGCGCGTGAGGTAGTA GTTTGT-3′;下游引物:5′-AGTGCAGGGTCCGAGG TATT-3′。U6 RT 引物:5′-GTCGTATCCAGTGCAGG GTCCGAGGTATTCGCACTGGATCGACAAAAGC-3′;上游引物:5′-AGAGAAGATTAGCATGGCCCCTG-3′;下游引物:5′-AGTGCAGGGTCCGAGGTATT-3′。
1.2.1 實(shí)驗(yàn)分組 實(shí)驗(yàn)細(xì)胞分為NC 組(轉(zhuǎn)染let-7i-5p mimics NC)和let-7i-5p mimics 組(轉(zhuǎn)染let-7i-5p mimics);let-7i-5p NC 組(轉(zhuǎn)染 inhibitor NC)和let-7i-5p inhibitor 組(轉(zhuǎn)染let-7i-5p inhibitor)。
1.2.2 細(xì)胞增殖能力試驗(yàn) 各組細(xì)胞在含有不同濃度吉西他濱的培養(yǎng)基中培養(yǎng)至對數(shù)生長期后分別進(jìn)行如下實(shí)驗(yàn):首先用CCK-8(cell counting kit-8)進(jìn)行細(xì)胞毒實(shí)驗(yàn),在450 nm 波長處進(jìn)行單波長測定各組細(xì)胞溶液吸光度,存活率(%)=(A實(shí)驗(yàn)組-A空白組)/(A對照組-A空白組)×100%,計(jì)算IC50值;其次,進(jìn)行細(xì)胞克隆形成實(shí)驗(yàn),通過細(xì)胞計(jì)數(shù)計(jì)算細(xì)胞克隆形成率;使用細(xì)胞周期檢測試劑盒(凱基生物科技公司)檢測細(xì)胞周期的變化。在此實(shí)驗(yàn)的基礎(chǔ)上,提取NC 組和let-7i-5p mimics 組細(xì)胞總RNA,交由廣州銳博生物科技有限公司進(jìn)行mRNA 測序,比較兩組中差異表達(dá)的基因,預(yù)測let-7i-5p 發(fā)揮作用的可能通路。
1.2.3 免疫印跡實(shí)驗(yàn) 轉(zhuǎn)染let-7i-5p mimics 后,采用RIPA 法進(jìn)行總蛋白提取,然后進(jìn)行蛋白質(zhì)定量測定,再經(jīng)SDS-PAGE 膠進(jìn)行電泳分離;隨后在250 mA,120 min 將蛋白轉(zhuǎn)移至PVDF 膜上,室溫封閉90 min,然后進(jìn)行一抗孵育[CDK6 抗體(1∶1 000)、P21 抗體(1∶2 000)、抗體CyclinA(1∶1 000)、CDK2 抗體(1∶1 000)均購自美國CST 科技有限公司]。隨后與辣根過氧化物酶標(biāo)記的二抗(1∶1 000)室溫孵育1 h,最后加ECL 底物發(fā)光液進(jìn)行曝光檢測。同時設(shè)計(jì)let-7i-5p NC 組和let-7i-5p inhibitor 組,重復(fù)以上實(shí)驗(yàn)操作,觀察實(shí)驗(yàn)結(jié)果并統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)。
1.2.4 抑制P21 表達(dá) 在對A549/G+消化培養(yǎng)24 h后,實(shí)驗(yàn)組同時轉(zhuǎn)染let-7i-5p mimics 和siRNA-P21,對照組轉(zhuǎn)染let-7i-5p mimics 和P21-NC,利用RT-qPCR 技術(shù)檢測兩組細(xì)胞中P21 的表達(dá)情況。同時為確定let-7i-5p 與P21 的關(guān)系,明確let-7i-5p 在S 期到G2期的作用,在共同轉(zhuǎn)染let-7i-5p 的條件下,設(shè)置一組抑制P21 的表達(dá)作為實(shí)驗(yàn)組(let-7i-5p mimics-P21 siRNA 組),另一組作對照(let-7i-5p mimics-NC 組),比較在過表達(dá)let-7i-5p 的前提下,抑制P21 的表達(dá),let-7i-5p mimics-P21 siRNA 組與let-7i-5p mimics-NC 組細(xì)胞增殖能力以及細(xì)胞周期和細(xì)胞周期相關(guān)蛋白的變化。
實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)通過采用3 次獨(dú)立重復(fù)實(shí)驗(yàn)得出,結(jié)果用SPSS 17.0 統(tǒng)計(jì)軟件進(jìn)行分析,多樣本均數(shù)比較采用單因素方差分析,兩樣本均數(shù)比較采用t檢驗(yàn),P<0.05表示差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
同一濃度下let-7i-5p mimics 組的細(xì)胞存活率低于NC 組(圖1A),IC50 值明顯低于NC 組(34 μmol/L vs.3 330 μmol/L)。轉(zhuǎn)染let-7i-5p 后的細(xì)胞可降低A549/G+細(xì)胞群體依賴性和增殖能力(圖1B、C)。let-7i-5p mimics 組的凋亡率高于NC 組(P<0.05,圖1D、E)。同一藥物濃度下,let-7i-5p inhibitor 組的細(xì)胞抑制率低于對照組let-7i-5p NC 組(P<0.05,圖2)。
圖1 不同濃度吉西他濱對let-7i-5p mimics 組和NC 組的作用比較
圖2 不同濃度吉西他濱對let-7i-5p inhibitor 組和let-7i-5p NC 組作用的比較
與NC 組相比,轉(zhuǎn)染let-7i-5p mimics 后,表達(dá)升高的基因有347 個,下調(diào)的基因有333 個;同時,KEGG信號通路預(yù)測在細(xì)胞水平上,let-7i-5p 發(fā)揮作用與細(xì)胞周期通路有極大的相關(guān)性(圖3A)。差異表達(dá)的基因結(jié)果顯示,與NC 組相比,let-7i-5p mimics 組CDK6的表達(dá)升高(圖3B)。
圖3 mRNA 測序結(jié)果
與對照組相比,A549/G+細(xì)胞在轉(zhuǎn)染let-7i-5p mimics 后細(xì)胞周期G1期細(xì)胞比例下降,S 期細(xì)胞比例升高(圖4A、B、C);另一方面,與let-7i-5p NC 組相比,let-7i-5p inhibitor 組G1期細(xì)胞占比輕度升高,S 期占比下降,G2-M 期細(xì)胞占比升高(P<0.05,圖4D、E、F)。表明提高let-7i-5p 表達(dá)水平可促進(jìn)A549/G+細(xì)胞周期從G1期到S 期的進(jìn)展,阻礙S 期到G2-M 的轉(zhuǎn)變。
圖4 let-7i-5p 對細(xì)胞周期變化的影響
let-7i-5p mimics 組的CDK6 和P21 蛋白表達(dá)水平明顯高于NC 組(圖5A、B);let-7i-5p mimics 組的CyclinA 和CDK2 蛋白表達(dá)水平明顯低于NC 組(圖5C、D),差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05 或0.01,圖5E)。在抑制let-7i-5p 表達(dá)后,A549/G-細(xì)胞Westernblot 結(jié)果顯示let-7i-5p inhibitor 組中CDK6 和P21 表達(dá)低于NC 組,CyclinA 和CDK2 表達(dá)高于NC 組(P<0.05或0.01,圖5F、G)。
圖5 細(xì)胞相關(guān)周期蛋白在各組的表達(dá)情況
經(jīng)過不同濃度梯度的吉西他濱處理后測得的let-7i-5p mimics-P21 siRNA 組和let-7i-5p mimics-NC 組的抑制率見圖6。在濃度較低時,吉西他濱對兩組的抑制率差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05,圖6A)。let-7i-5p mimics-P21 siRNA 組的IC50值高于let-7i-5p mimics-NC組[35 μmol/L(14~102 μmol/L)vs117 μmol/L(39~1 032 μmol/L),P<0.05]。吉西他濱0.001 mmol/L 時,兩組克隆數(shù)差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05);吉西他濱0.01 mmol/L 時,let-7i-5p mimics-P21 siRNA 組克隆數(shù)為let-7i-5p mimics-NC 組的138.1%;吉西他濱0.1 mmol/L時,let-7i-5p mimics-P21 siRNA 組克隆數(shù)約為let-7i-5p mimics-NC 組的142.6%(P<0.05,圖6B、C)。流式細(xì)胞凋亡實(shí)驗(yàn)顯示,在藥物濃度為0.001、0.01 和0.1 mmol/L 條件下,let-7i-5p mimics-P21 siRNA 組的細(xì)胞凋亡率比let-7i-5p mimics-NC 組低(P<0.05,圖6D、E)。提示轉(zhuǎn)染P21 siRNA 可以使經(jīng)let-7i-5p mimics 處理后變敏感的A549/G+細(xì)胞重新產(chǎn)生耐藥。
圖6 不同濃度吉西他濱對let-7i-5p mimics-P21 siRNA 組和let-7i-5p mimics-NC 組的作用
流式細(xì)胞術(shù)結(jié)果顯示let-7i-5p mimics-P21 siRNA組中S 期所占的比例少于let-7i-5p mimics-NC 組,G2-M 期的比例多于let-7i-5p mimics-NC 組(P<0.05,圖7A、B、C)。Western-blot 結(jié)果表明let-7i-5p mimics 在轉(zhuǎn)染P21 后細(xì)胞相關(guān)周期蛋白的表達(dá)有差異(圖7D),let-7i-5p mimics-P21 siRNA 組中CDK2 和CyclinA 的表達(dá)高于let-7i-5p mimics-NC 組(P<0.05),P21 的表達(dá)低于let-7i-5p mimics-NC 組(P<0.01),CDK6 的表達(dá)兩組比較差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。見圖7E。
圖7 let-7i-5p mimics-P21 siRNA 組和let-7i-5p mimics-NC 組細(xì)胞周期及其細(xì)胞周期蛋白表達(dá)水平比較
化療是治療肺癌最常用手段之一,耐藥是制約其療效的主要障礙。雖然吉西他濱作為第3 代化療藥物有比傳統(tǒng)化療藥物具有更好的療效,但研究表明,由于腫瘤細(xì)胞快速的耐藥反應(yīng),吉西他濱在治療肺癌時的總有效率僅約20%[11]。
let-7i-5p 作為let 家族的一員,與腫瘤的發(fā)生、發(fā)展有密切聯(lián)系[12]。研究表明,let-7i-5p 對腫瘤細(xì)胞的發(fā)生、發(fā)展起抑制作用。2018 年,Chhabra[13]發(fā)現(xiàn)let-7i-5p 通過抑制表皮生長因子/ 磷脂酰肌醇-3-羥激酶/SOX2信號通路抑制宮頸癌腫瘤細(xì)胞的發(fā)生。Takamizawa 等[14]也報道了let-7i 表達(dá)降低的非小細(xì)胞肺癌患者中,其手術(shù)后生存期明顯縮短。本文通過CCK-8 細(xì)胞毒實(shí)驗(yàn)、克隆形成實(shí)驗(yàn)及流式細(xì)胞術(shù)等實(shí)驗(yàn)表明let-7i-5p 可以降低肺腺癌細(xì)胞A549 對吉西他濱的耐藥性,使A549/G+細(xì)胞對吉西他濱變得敏感。本文從過表達(dá)let-7i-5p 和抑制let-7i-5p 表達(dá)得出的結(jié)果都可說明這一點(diǎn)。
本研究對let-7i-5p mimics 組和NC 組進(jìn)行的mRNA 測序和KEGG 通路分析表明,let-7i-5p 促進(jìn)A549 細(xì)胞發(fā)生耐藥與細(xì)胞周期有關(guān)。同時,兩組間由于let-7i-5p 表達(dá)水平改變引起的CDK6 的變化可能是細(xì)胞周期發(fā)生改變的原因。細(xì)胞周期的改變又會影響細(xì)胞增殖及細(xì)胞對吉西他濱的耐受性。這為完善肺癌細(xì)胞A549 耐吉西他濱機(jī)制提供了啟示。
CDK6 是一種細(xì)胞周期蛋白依賴性激酶,具有促進(jìn)G1 期向S 期進(jìn)展,縮短DNA 復(fù)制周期,促進(jìn)細(xì)胞的增殖的作用[15]。目前,在肺癌、乳腺癌、頭頸癌中均發(fā)現(xiàn)了CDK6 的高表達(dá)[16-17]。Shen 等[18]研究證實(shí),let-7可以通過調(diào)控CDK6 的磷酸化作用,促進(jìn)細(xì)胞從G1期向S 期過渡,從而加快細(xì)胞周期過程。流式細(xì)胞周期實(shí)驗(yàn)和Western-blot 結(jié)果表明過表達(dá)let-7i-5p 可提高CDK6 的表達(dá),CDK6 促進(jìn)了細(xì)胞周期從G1期到S 期進(jìn)展。那么既然let-7i-5p 促進(jìn)G1期向S 期進(jìn)展,為何let-7i-5p mimics 組的細(xì)胞在耐吉西他濱增殖作用中的能力下降了呢?從細(xì)胞周期結(jié)果可以發(fā)現(xiàn),與對照組相比,let-7i-5p mimics 組細(xì)胞S 期比例明顯升高,而調(diào)控S 期至G2/M 期的Cyclin A(細(xì)胞周期蛋白A)是細(xì)胞周期中的正性調(diào)控因子,在G1晚期開始合成,含量在S 期逐漸增加,于G2/M 期達(dá)到高峰[19-20]。有研究證實(shí),CyclinA 在非小細(xì)胞肺癌[21]、乳腺癌[22]等多種腫瘤中高表達(dá)。而CDK2 作為細(xì)胞周期蛋白依賴性激酶家族(CDKs)的重要成員,激活后與Cyclin A 共同作用,形成CyclinA-CDK2 復(fù)合物,對S 期和G2/M 期過渡具有重要作用,促進(jìn)了DNA 復(fù)制的進(jìn)行[23]。有研究表明,抑制CyclinA-CDK2 復(fù)合物的表達(dá),可有效阻止腫瘤細(xì)胞的增殖[24]。結(jié)合外泌體芯片miRNA 差異表達(dá)分析,用差異表達(dá)最大的5 種miRNAs 進(jìn)行生物信息學(xué)預(yù)測其下游基因,結(jié)果發(fā)現(xiàn)P21/CDKN1A 基因具有很大的指向性。P21 屬于抑癌基因產(chǎn)物,是細(xì)胞周期的負(fù)調(diào)控蛋白[25],可與相應(yīng)的Cyclin-CDK 復(fù)合物結(jié)合,使CDK 失去蛋白激酶活性,阻止細(xì)胞周期的進(jìn)行[26-27]。目前已知P21 可以結(jié)合作用的底物有CyclinACDK2[28]、CyclinD-CDK4[29]、CyclinE-CDK2[30]等。
鑒于此,結(jié)合本實(shí)驗(yàn)結(jié)果,我們認(rèn)為let-7i-5p 可能是通過P21 影響CyclinA-CDK2 復(fù)合物的表達(dá),間接影響細(xì)胞的周期,進(jìn)而影響腫瘤細(xì)胞的增殖。為了驗(yàn)證上述推測,在A549/G+細(xì)胞中過表達(dá)let-7i-5p 后,我們發(fā)現(xiàn)P21 在let-7i-5p mimics 組中是高表達(dá)的,隨后又檢測了CDK2 及CyclinA 的表達(dá)情況,結(jié)果顯示,let-7i-5p mimics 組中CyclinA 及CDK2 的表達(dá)量均低于NC 組(P<0.05),由此可見,let-7i-5p mimics 組中低表達(dá)的CyclinA 和CDK2 阻滯了細(xì)胞周期從S 期到G2-M期的轉(zhuǎn)化,使細(xì)胞復(fù)制周期停滯在S 期,影響細(xì)胞的增殖。這與我們之前細(xì)胞的增殖行為的改變及流式細(xì)胞周期檢測的結(jié)果都是一致的。隨后,在A549/G-細(xì)胞中抑制let-7i-5p 的表達(dá)從反方面論證了let-7i-5p 對CDK6、P21 的促進(jìn)作用。
另一方面,在轉(zhuǎn)染let-7i-5p mimics 的基礎(chǔ)上,對let-7i-5p mimics-P21 siRNA 組的P21 進(jìn)行抑制表達(dá),與let-7i-5p mimics-NC 組相比,let-7i-5p mimics-P21 siRNA 組中CCK-8 增殖能力增強(qiáng),平板克隆形成能力升高,細(xì)胞凋亡率降低,原本在轉(zhuǎn)染let-7i-5p mimics 后對藥物敏感的A549/G+細(xì)胞對吉西他濱的作用又表現(xiàn)出抵抗性。說明P21 表達(dá)水平的降低,一定程度上促進(jìn)了細(xì)胞的增殖與耐藥。
細(xì)胞周期結(jié)果表明在抑制P21 表達(dá)后,細(xì)胞S 期比例降低,G2-M 期比例明顯升高,說明降低P21 的表達(dá)促進(jìn)了細(xì)胞由S 期向G2-M 期的進(jìn)程。同時,Westernblot 實(shí)驗(yàn)結(jié)果提示降低P21 表達(dá)后,CDK2 和CyclinA的表達(dá)水平升高;而他們表達(dá)水平升高會促進(jìn)細(xì)胞周期從S 期到G2-M 期的進(jìn)程,促進(jìn)了細(xì)胞的DNA 復(fù)制,增強(qiáng)了細(xì)胞的增殖能力,也促進(jìn)了細(xì)胞對吉西他濱的抵抗性。而Zhu 等[31]曾在研究肺癌細(xì)胞耐吉非替尼的機(jī)理中證實(shí)了P53/P21 凋亡通路的激活,可以誘導(dǎo)細(xì)胞周期阻滯在G2期/M 期,從而增強(qiáng)肺癌細(xì)胞對吉非替尼的敏感性。Li 等[32]在對乳腺癌細(xì)胞增殖的研究中也發(fā)現(xiàn)P21 的高表達(dá)可以誘導(dǎo)G2/M 期的阻滯,從而有效抑制腫瘤細(xì)胞的增殖。2021 年,黃淵鋒等[33]研究發(fā)現(xiàn)細(xì)胞周期的負(fù)調(diào)控因子P21 可以阻滯細(xì)胞G2/M 期,從而增強(qiáng)非小細(xì)胞肺癌對吉非替尼的敏感性。綜上,在A549/G+細(xì)胞中l(wèi)et-7i-5p 可以提高吉西他濱敏感性,一定程度上解釋了let-7i-5p 可以降低A549/G+細(xì)胞對吉西他濱耐受性的原因。let-7i-5p 高表達(dá)引起CDK6 的表達(dá)升高,促進(jìn)了細(xì)胞周期從G1期到S 期的進(jìn)展;同時,也促進(jìn)P21 表達(dá)水平升高,P21 又抑制了CyclinACDK2 復(fù)合物的表達(dá),間接地引起了S 期到G2-M 期的進(jìn)展受阻,細(xì)胞周期停滯在S 期,引起細(xì)胞DNA 復(fù)制減慢,造成A549/G+在吉西他濱的作用下增殖能力的減弱,降低了A549/G+細(xì)胞對吉西他濱的耐受性。
總之,本實(shí)驗(yàn)初步證實(shí)了let-7i-5p 表達(dá)水平可能通過影響細(xì)胞周期改變對A549/G+細(xì)胞對吉西他濱的耐藥性,為肺癌耐吉西他濱機(jī)制的深入研究提供了實(shí)驗(yàn)依據(jù)。