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面向生物信息學(xué)本科專業(yè)的《遺傳學(xué)》教學(xué)要點及模式探索

2015-05-30 08:13張靖楠黃進勇張廣娜
中國校外教育(上旬) 2015年13期
關(guān)鍵詞:生物信息學(xué)遺傳學(xué)教學(xué)內(nèi)容

張靖楠 黃進勇 張廣娜

摘要:遺傳學(xué)是生命科學(xué)的基礎(chǔ)學(xué)科之一,已廣泛地被國內(nèi)各類院校列為生物類專業(yè)的必修課。生物信息學(xué)專業(yè)在國內(nèi)起步較晚,鑒于其專業(yè)性質(zhì)及培養(yǎng)目標(biāo)的特點,面向該專業(yè)學(xué)生的《遺傳學(xué)》課程應(yīng)在知識體系、內(nèi)容側(cè)重點設(shè)置以及教學(xué)方法等方面,區(qū)別于其他傳統(tǒng)生物學(xué)專業(yè)。本文從教學(xué)實踐出發(fā),就合理優(yōu)化生物信息學(xué)專業(yè)《遺傳學(xué)》課程的教學(xué)內(nèi)容及教學(xué)方法提出了一些見解,以適應(yīng)該專業(yè)對學(xué)生的培養(yǎng)需求。

關(guān)鍵詞:生物信息學(xué) 遺傳學(xué) 教學(xué)方法 教學(xué)內(nèi)容

遺傳學(xué)(Genetics)是研究自然界中生物的遺傳和變異規(guī)律的科學(xué),是生命科學(xué)領(lǐng)域中最為重要和基礎(chǔ)的學(xué)科之一。它也是生物科學(xué)中一門最具活力,發(fā)展最迅速的理論科學(xué),又是一門緊密聯(lián)系生產(chǎn)實際的基礎(chǔ)應(yīng)用科學(xué),對探索生命起源和本質(zhì),推動整個生物科學(xué)的發(fā)展起著巨大的作用。因此,遺傳學(xué)作為生命科學(xué)相關(guān)專業(yè)的一門重要主干課程,在教學(xué)中起著舉足輕重的作用。

一、生物信息學(xué)專業(yè)開設(shè)遺傳學(xué)的必要性

20世紀(jì)80年代末,由分子生物學(xué)、計算機科學(xué)以及信息技術(shù)等學(xué)科的交叉和結(jié)合產(chǎn)生了生物信息學(xué)(Bioinformatics),它是基于分子生物學(xué)與多種學(xué)科交叉,以計算機為工具對生物相關(guān)信息進行儲存、檢索和分析的科學(xué),是當(dāng)今生命科學(xué)和自然科學(xué)的重大前沿領(lǐng)域之一。近20年,特別是隨著人類基因組計劃(human genome project,HGP)不斷拓進,生物信息學(xué)作為跨越和融合生命科學(xué)與信息技術(shù)的新興學(xué)科已成為生命科學(xué)核心領(lǐng)域和最具活力的前沿領(lǐng)域之一。生物信息學(xué)專業(yè)應(yīng)運而生。國內(nèi)單獨設(shè)立生物信息學(xué)本科專業(yè)的高校較少,且普遍較晚。

遺傳學(xué)與生物信息學(xué)兩個學(xué)科之間關(guān)系密切。有國內(nèi)學(xué)者利用美國《科學(xué)引文索引》(SCI)數(shù)據(jù)庫web of science,運用文獻計量學(xué)方法對8種權(quán)威生物信息學(xué)期刊2001年至2010年于2011年1月15日之前上傳至wed of science的全部文獻進行統(tǒng)計及分析。對施引文獻按跨學(xué)科強度排列的結(jié)果顯示,遺傳學(xué)及基因與生物信息學(xué)跨學(xué)科文章發(fā)表量居第二位,僅次于生物化學(xué)與分子生物學(xué)。這說明,生物信息學(xué)與遺傳學(xué)直接的跨學(xué)科研究較多,二者交叉學(xué)科的發(fā)展關(guān)系密切。因此,生物信息學(xué)專業(yè)開設(shè)《遺傳學(xué)》課程十分必要。

二、遺傳學(xué)教學(xué)中存在的問題

多年來,不同專業(yè)的《遺傳學(xué)》課程的教學(xué)過程中涌現(xiàn)出一些共性問題,這些問題在生物信息學(xué)本科專業(yè)的教學(xué)過程中也存在。一是,學(xué)科拓展深化與課時壓縮之間的矛盾。隨著遺傳學(xué)研究范疇的不斷拓展,新的學(xué)科分支相繼涌現(xiàn),信息量逐步擴增,待教授內(nèi)容逐漸增加且顯得零散。但隨著大學(xué)素質(zhì)教育改革的進行,更多新的選修課、實驗課被引入,遺傳學(xué)理論課時被壓縮,課時減少與內(nèi)容增多的矛盾日益突顯。二是,遺傳學(xué)與其他課程教學(xué)內(nèi)容設(shè)置與組織易重復(fù)。學(xué)科交叉為科研工作提供源源不斷的動力,但在教學(xué)工作中學(xué)科滲透也造成教學(xué)內(nèi)容重疊,基礎(chǔ)和關(guān)緊技術(shù)重復(fù)教學(xué)的問題。例如,分子遺傳學(xué)是遺傳學(xué)重要組成部分,是目前遺傳學(xué)研究的重點和熱點,與生物信息學(xué)關(guān)系最為緊密,它包括的遺傳物質(zhì)的本質(zhì),基因的調(diào)控,基因重組等內(nèi)容也在基因工程、分子生物學(xué)、細胞學(xué)等課程中作為講授重點。如何利用有限的理論課時,合理安排教學(xué)內(nèi)容,提高教學(xué)效率值得思考。

與此同時,生物信息學(xué)作為比較新的本科專業(yè),開設(shè)各課程之間的銜接問題也比較突出。生物信息學(xué)專業(yè)的學(xué)生在大二開始全面生命科學(xué)和信息技術(shù)相關(guān)程學(xué)習(xí)。在理論知識在實際中如何應(yīng)用缺乏概念,學(xué)生達不到共鳴,這也是生物信息學(xué)專業(yè)低年級學(xué)生面臨的通病。遺傳學(xué)課程安排在大學(xué)二年級上學(xué)期講授,對于剛剛接觸專業(yè)課程的學(xué)生而言本來就陌生,而且信息技術(shù)和生命科學(xué)相關(guān)課程獨立講授,二者貌似是兩條平行線,怎樣相交碰撞出火花,對于學(xué)生來說很難結(jié)合,必須由任課老師在授課過程中充分引導(dǎo)。傳統(tǒng)的《遺傳學(xué)》課程教學(xué)注重以雜交分析為主的經(jīng)典遺傳學(xué)理論的講解,很大篇幅集中在三大定律(分離定律、自由組合定律以及連鎖和互換定律)的教授上。遺傳學(xué)課程教學(xué)重點集中在經(jīng)典遺傳學(xué)定律,經(jīng)典案例跟不上學(xué)科發(fā)展。這個問題已經(jīng)被一線教育工作者認知。

綜上,由于學(xué)科本身發(fā)展迅速,涵蓋知識范圍越來越廣,課時壓縮等原因,容易讓學(xué)生在學(xué)習(xí)過程中對該課程產(chǎn)生“內(nèi)容太發(fā)散”“課時進程快”“知識跨越大”等認識,不利于課程的學(xué)習(xí)。由此可能造成,內(nèi)容廣泛且繁雜“抽象且深奧”枯燥無味,容易讓學(xué)生覺得難或者枯燥。學(xué)生學(xué)習(xí)主動性不高。因此,在教學(xué)實踐中,針對不同專業(yè)性質(zhì)和培養(yǎng)目標(biāo)存在的差異,不同專業(yè)《遺傳學(xué)》課程教學(xué)應(yīng)在知識體系、內(nèi)容側(cè)重點、教學(xué)方法等方面在各專業(yè)間有所區(qū)分。特別是生物信息學(xué)這種學(xué)科交叉性強的專業(yè),如何實施該專業(yè)本科生遺傳學(xué)的教學(xué),以達到即符合本科教學(xué)難易程度的要求,又被大多數(shù)同學(xué)接受,同時能符合生物信息學(xué)學(xué)科自身特點,需要在教學(xué)過程中逐步的探索與實踐。本文將結(jié)合資深授課教師經(jīng)驗及筆者生物信息學(xué)本科專業(yè)《遺傳學(xué)》教學(xué)經(jīng)歷對這一問題進行闡述。

三、教學(xué)過程中的探討與實踐

1.制定具有專業(yè)特色的教學(xué)內(nèi)容

(1)優(yōu)化教學(xué)內(nèi)容,關(guān)注專業(yè)需求

生物信息學(xué)專業(yè)的課程教學(xué)中,遺傳學(xué)相關(guān)知識是需要講授的重點。傳統(tǒng)遺傳學(xué)課程教學(xué)將重點內(nèi)容集中于經(jīng)典遺傳學(xué)定律及其相關(guān)知識的講授,其優(yōu)點在于能夠幫助學(xué)生打牢遺傳學(xué)知識基礎(chǔ),缺點在于教學(xué)內(nèi)容過于單一,沒有包含遺傳學(xué)重要分支的最新知識,無法與當(dāng)前的研究熱點聯(lián)系起來,學(xué)生學(xué)習(xí)興趣不高。隨著國際遺傳學(xué)研究的深入,分子遺傳學(xué)和群體遺傳學(xué)得到長足發(fā)展,極大地豐富了遺傳學(xué)的知識體系。為了緊跟國際研究前沿,國內(nèi)許多高校對遺傳學(xué)課程進行了教學(xué)改革,在經(jīng)典遺傳學(xué)教學(xué)的基礎(chǔ)上,紛紛加入了分子和群體遺傳學(xué)的教學(xué)內(nèi)容,為后續(xù)開展更深入的專業(yè)研究和學(xué)習(xí)奠定了良好的知識基礎(chǔ)。為了幫助學(xué)生對遺傳學(xué)知識體系形成全面而系統(tǒng)的認識,結(jié)合生物信息學(xué)專業(yè)特點,在教學(xué)設(shè)計時借鑒了以“遺傳信息”為主線的教學(xué)思想,教學(xué)內(nèi)容涵蓋了“經(jīng)典”“分子”和“群體”三類主體遺傳學(xué)內(nèi)容。在現(xiàn)實教學(xué)中,受遺傳學(xué)課時限制,對所有遺傳學(xué)知識點進行了梳理和必要的刪減,既把握三種遺傳學(xué)知識的內(nèi)在聯(lián)系,做好各部分知識的教學(xué)銜接,同時注意區(qū)分三者的不同,突出教學(xué)重點,做到“主題鮮明,重點突出,點面結(jié)合,結(jié)構(gòu)清晰”,使學(xué)生在掌握經(jīng)典基礎(chǔ)理論知識的同時了解最新的遺傳學(xué)研究進展。

(2)生物信息學(xué)專業(yè)遺傳學(xué)課程與其他課程的銜接

遺傳學(xué)是研究生物遺傳和變異的科學(xué),以遺傳物質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能為研究對象,是生命科學(xué)的主干。因此,與其他學(xué)科在內(nèi)容上有交叉或重疊無法避免。同中求異,突出遺傳學(xué)的特色,是教學(xué)中值得研究的問題。遺傳物質(zhì)的本質(zhì)、染色體畸變、基因突變、遺傳調(diào)控等章節(jié)與微生物學(xué)、細胞生物學(xué)、生物化學(xué)內(nèi)容重復(fù)較多,可以強調(diào)知識結(jié)構(gòu)的完整性,淡化這些內(nèi)容的分子結(jié)構(gòu)和生化過程的講解。例如,結(jié)合孟德爾定律和摩爾根定律案例,著重從染色體和基因角度切入,增強遺傳學(xué)色彩,同時對其他課程起到提綱挈領(lǐng)的作用。

(3)結(jié)合生物信息學(xué),引入最新研究成果,體現(xiàn)前沿性

在處理好學(xué)科銜接之后,還需要關(guān)注的就是內(nèi)容與生物信息學(xué)的結(jié)合。學(xué)生在學(xué)習(xí)過程中,最想了解的莫過于,這門課程與我的專業(yè)有什么聯(lián)系?因此,在講授內(nèi)容中加入生物信息學(xué)手段解決遺傳學(xué)問題的新成果既體現(xiàn)前沿性,又能提高遺傳學(xué)課程的專業(yè)針對性。教師平時要多注意積累教學(xué)素材,對于現(xiàn)階段比較熱點且與生物信息學(xué)相關(guān)的、應(yīng)用性強的問題,要在課程基礎(chǔ)知識講授后,進行一定拓展。例如,在講授基因定位和遺傳圖繪制時,引入用EST進行基因定位及遺傳圖譜繪制等內(nèi)容;在講到遺傳家譜時,引入通過對患病群體或家系進行外顯子組測序分析,對小家系孟德爾遺傳病的致病基因進行鑒別和定位的例子。通過引入生物信息學(xué)教學(xué)例子,不僅可以使學(xué)生加深對遺傳學(xué)知識的理解,還可幫助學(xué)生了解生物信息學(xué)最新進展,激發(fā)對后續(xù)生物信息學(xué)專業(yè)課程的學(xué)習(xí)興趣。

2.教學(xué)方法多樣化,提升學(xué)生學(xué)習(xí)興趣

遺傳學(xué)教學(xué)內(nèi)容繁雜、理論性強,不易理解。為了提高教學(xué)效果,在教學(xué)模式上必須變“以教師為主體”為“以學(xué)生為主體”,注重采用靈活多樣的教學(xué)方法和手段,開展多媒體教學(xué)、案例教學(xué)和研討教學(xué)等,將傳統(tǒng)抽象、枯燥的說教式教學(xué)轉(zhuǎn)變?yōu)榫唧w、生動的參與式教學(xué),增強教與學(xué)的雙向互動。

(1)多媒體教學(xué)方式

計算機多媒體輔助教學(xué)改變了傳統(tǒng)的黑板加粉筆,以教師為中心灌輸式教學(xué)模式。多媒體通過實時可交互的多維動畫及圖像展示,可以增強教學(xué)內(nèi)容的展示效果,提高課堂教學(xué)的信息量和容積率,提升學(xué)生學(xué)習(xí)興趣,加深對枯燥晦澀知識點的理解,提高教學(xué)效率。充分利用多媒體課件的超文本功能、交互功能、網(wǎng)絡(luò)功能的優(yōu)勢,比如Holliday模型是分子水平上關(guān)于遺傳重組機制的重要模型,很好解釋了基因轉(zhuǎn)變現(xiàn)象。在講到Holliday模型時,為了讓學(xué)生直觀了解單鏈交換重接及分支移動后的Holliday交叉旋轉(zhuǎn)180度形成Holliday異構(gòu)體的過程,采用了動畫、圖片、電子板書相結(jié)合的方式,很容易讓學(xué)生理解空間旋轉(zhuǎn)互換的過程,以及基因轉(zhuǎn)變產(chǎn)生的原因等較難理解的知識點,反響較好。此外,聲音、視頻、動畫、圖片等便于學(xué)生拆解枯燥內(nèi)容。

(2)案例教學(xué)

案例教學(xué)是一種創(chuàng)新型的教學(xué)方式,主要通過開放課堂、增強互動,培養(yǎng)學(xué)生運用所學(xué)知識解決實際問題的能力。案例教學(xué)需要結(jié)合本課程的專業(yè)理論知識,著眼于達成課程教學(xué)目的,編寫和準(zhǔn)備基于一定事實且具有一定場景的教學(xué)案例,這些教學(xué)案例要能夠啟發(fā)學(xué)生的思考,促進學(xué)生將從外部學(xué)習(xí)的知識吸收轉(zhuǎn)化內(nèi)在的專業(yè)素養(yǎng)和能力。在教學(xué)實踐中,教學(xué)案例是“教”與“學(xué)”互動的橋梁和紐帶,使枯燥乏味的學(xué)習(xí)過程變得活潑有趣;“教”不是告訴學(xué)生怎么去做,而是啟發(fā)學(xué)生如何去思考,對學(xué)生針對案例問題提出的解決思路進行引導(dǎo)和評價,鼓勵學(xué)生創(chuàng)新性思考,找到最優(yōu)的問題解決方法;“學(xué)”不是被動的接受,而是主動的思考和創(chuàng)造,通過與他人而不僅僅是老師進行互動和交流,加深對知識的理解,培養(yǎng)解決實際問題的能力。

案例教學(xué)的核心是精心設(shè)計教學(xué)案例,將知識內(nèi)化在符合實際又富于想象的故事情景中,使得學(xué)生通過身臨其境將抽象的理論知識具體化,學(xué)會如何用概念性和原理性知識在實際工作和研究中解決問題,進而加深對特定原理和概念內(nèi)涵的理解。在教學(xué)實踐中,先以典型案例提高學(xué)生興趣,把抽象的東西具體化,讓學(xué)生變被動接受為主動思考,激發(fā)學(xué)生的求知欲。注重培養(yǎng)學(xué)生創(chuàng)造力和解決問題的能力。通過案例的分析,深化學(xué)生對基本原理、基本概念的理解。案例教學(xué)能很好地啟發(fā)學(xué)生進行自主思考,對于理論性較強,比較枯燥的內(nèi)容,通過案例式教學(xué)能激發(fā)學(xué)生學(xué)習(xí)興趣。所舉案例應(yīng)具有針對性,要考慮案例產(chǎn)生的時間、背景和條件,要貼近生活,耳熟能詳,與時俱進。在處理問題的同時,獲取知識。進行案例教學(xué)過程中,要注重與學(xué)生的互動。圍繞教學(xué)目的,選擇合適案例,進行啟發(fā)式教學(xué),調(diào)動學(xué)生參與性。教師不能一味平鋪直敘的講案例,還要注意學(xué)生的參與度。只有學(xué)生和教師共同參與,才能達到預(yù)期教學(xué)效果。

(3)以學(xué)生為主體的教學(xué)

以往課程中,往往針對經(jīng)典類型習(xí)題進行講解,參考“標(biāo)準(zhǔn)答案”。在實際教學(xué)中發(fā)現(xiàn),這樣往往造成學(xué)生思想禁錮,學(xué)科交融性不夠。特別是對于生物信息學(xué)專業(yè)的學(xué)生來說,傳統(tǒng)習(xí)題課或者討論課,沒有實用效果。習(xí)題課及討論課應(yīng)注重實用性,關(guān)注遺傳學(xué)與生物信息學(xué)學(xué)科發(fā)展與融合,設(shè)置開放性答案,突出培養(yǎng)學(xué)生創(chuàng)新性的應(yīng)用能力。

課堂教學(xué)不僅要“授業(yè)”,更要“傳道”,即培養(yǎng)學(xué)生如何學(xué)習(xí)和如何思維。根據(jù)教學(xué)內(nèi)容和學(xué)生的認知水平,研究、討論、交流式的教學(xué)模式的引入,有助于調(diào)動學(xué)生積極性。采用專題自學(xué),規(guī)定材料與學(xué)生自學(xué)有機的結(jié)合起來,開展研討,充分體現(xiàn)學(xué)生觀點。同時,教師只起到點評引導(dǎo)作用,能培養(yǎng)學(xué)生獲取信息、分析問題、創(chuàng)造性的解決問題的能力,有利于學(xué)生形成科研創(chuàng)新意識。教師如何正確引導(dǎo)是開展研討式教學(xué)的重點。首先,應(yīng)明確課程在相關(guān)領(lǐng)域中的作用和地位,了解課程的教學(xué)內(nèi)容,選擇課程中適合研討的內(nèi)容,并將研究與討論貫穿教學(xué)的全過程。在選擇題目時,要考慮專業(yè)相關(guān)程度及考慮不同學(xué)生層次的需求,考慮學(xué)生個體間的差異,難度適宜。

四、結(jié)語

生物信息學(xué)本科專業(yè)遺傳學(xué)的教學(xué),以孟德爾定律為基礎(chǔ),分析遺傳物質(zhì)的存在形式、傳遞、保存及變化,課程脈絡(luò)更加清晰,通過案例教學(xué)的等教學(xué)模式,激發(fā)興趣,并有利于與后續(xù)課程連接,在實踐教學(xué)中體現(xiàn)了比較好的教學(xué)效果。因為生物信息學(xué)專業(yè)的需求與傳統(tǒng)生物專業(yè)有差異,教學(xué)內(nèi)容側(cè)重點不同這給教師備課增加了難度。同時,在期末考核時,由于講授側(cè)重點不同,考試側(cè)重點也應(yīng)有所區(qū)別,在師資允許的前提下,引入小班教學(xué),有利于教學(xué)側(cè)重點突出。后續(xù)課程如果設(shè)置分子遺傳學(xué),將使知識體系更加完整。

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