王丹丹,周晨妍,朱新術,李同彪(.新鄉(xiāng)醫(yī)學院生命科學技術學院,河南新鄉(xiāng)453000;2.新鄉(xiāng)醫(yī)學院三全學院,河南新鄉(xiāng)453000)
畢赤酵母工程菌發(fā)酵木聚糖酶條件的響應面優(yōu)化
王丹丹1,2,周晨妍1,*,朱新術1,李同彪1
(1.新鄉(xiāng)醫(yī)學院生命科學技術學院,河南新鄉(xiāng)453000;2.新鄉(xiāng)醫(yī)學院三全學院,河南新鄉(xiāng)453000)
通過單因素實驗研究了誘導溫度、種齡、pH、甲醇濃度以及誘導時間對畢赤酵母工程菌產木聚糖酶的影響。在此基礎上進行響應面優(yōu)化設計實驗,并根據(jù)結果擬合小二乘二次項回歸方程,探討了各因素對木聚糖酶比酶活力的影響。確定了最優(yōu)的發(fā)酵培養(yǎng)條件:種齡為31 h,誘導時間104 h,甲醇誘導濃度1%,發(fā)酵起始pH4.0,誘導溫度為30℃,在此條件下對實驗結果進行驗證,得到木聚糖酶比酶活力為43526.3 U/mg。
畢赤酵母,木聚糖酶,發(fā)酵條件,響應面
木聚糖酶是指專一降解木聚糖為寡木聚糖、低聚木糖、木二糖和木糖一類酶的總稱[1-3]。木聚糖酶在能源、食品、飼料、造紙等工業(yè)方面有著非常重要的應用價值[4-5]。微生物發(fā)酵產木聚糖酶的過程中,不僅與微生物的種類關系密切,還與培養(yǎng)基的組成以及培養(yǎng)條件關系也非常大。木聚糖酶的生產菌有很多,包括細菌[6-8]、霉菌[5,9-10]和放線菌等,但是這些野生型菌株生產木聚糖酶存在著產量不高,酶學性質相對較差等缺點,如周薇薇等[11]利用響應面法優(yōu)化了黑曲霉(Aspergillus niger FIP-09-24)的固態(tài)發(fā)酵工藝,在最佳培養(yǎng)條件下培養(yǎng)酶活力只有66002 U/g;湯文晶等使用響應面法優(yōu)化匍枝根霉最高酶活力為101.697 U/mL[12],故采用分子生物學手段對野生型木聚糖酶基因進行改造,構建工程菌是現(xiàn)在研究的熱點,并在此基礎上對工程菌發(fā)酵產酶的條件進行優(yōu)化,以期獲得更高產量的木聚糖酶。但是要實現(xiàn)工業(yè)生產,使生產菌株的發(fā)酵產值達到一個更大的水平,必須采用更為經濟合理的方法進行研究。本研究在構建畢赤酵母工程菌的基礎上,對其發(fā)酵條件進行進一步的優(yōu)化,旨在提高木聚糖酶的的產酶量,使其在工業(yè)上有更大的應用價值。
1.1 材料與儀器
畢赤酵母工程菌GS115/pPIC9K-xynZF-2 新鄉(xiāng)醫(yī)學院生命科學技術學院酶與發(fā)酵工程實驗室構建保存;無氨基酸酵母氮源(YNB)、G418 Amresco公司;樺木木聚糖(Birch wood xylan) Sigma公司;牛血清蛋白 上海生工生物有限公司。
恒溫振蕩器(HZQ-F160A) 上海一恒科學儀器有限公司;高速冷凍離心機(Neofuge 23R) 上海力申科學儀器有限公司;電子恒溫水浴鍋(DZKW-4)北京中興偉業(yè)有限公司;微量分光光度計Nanodrop 2000 美國Thermo Fisher Scientific公司;往復式水浴恒溫振蕩器ZHWY-110X、曲線控制十段編程恒溫培養(yǎng)箱ZGP-A2080 上海智誠分析儀器制造有限公司;不銹鋼立式壓力蒸汽滅菌器LX-C35L 合肥華泰醫(yī)療設備有限公司。
1.2 實驗方法
1.2.1 培養(yǎng)基的配制 YPD、BMGY(生長富集培養(yǎng)基)、BMMY(誘導表達培養(yǎng)基)配制方法見參考文獻[13]。
1.2.2 畢赤酵母工程菌的搖瓶培養(yǎng)基誘導表達 挑取保存的木聚糖酶高產菌株GS115/pPIC9K-xynZF-2,接種于含有20 mL BMGY培養(yǎng)基的250 mL的三角瓶中,30℃,250 r/min培養(yǎng)至A600為6.0左右,3000 r/min離心收集菌體,轉接至裝有30 mL BMMY培養(yǎng)基的250 mL三角瓶中,相同條件下繼續(xù)培養(yǎng),每24 h補加100%甲醇至終濃度為0.5%,誘導表達3 d。
1.2.3 粗酶液的制備 取誘導表達培養(yǎng)后的發(fā)酵液于3000 r/min離心10 min,取上清。
1.2.4 木聚糖比酶活力的測定 采用改進的DNS法[14]測定木聚糖酶活力。酶活力單位的定義:在50℃和pH4.6條件下,以0.5%樺木木聚糖作為底物,以每分鐘產生1 μmol木糖所需的酶量為1個酶活力單位。以木糖作為標準樣品的標準曲線為y=2.0890x-0.2079,R2=0.9999。
用Bradford法[15]測定蛋白質濃度,以牛血清白蛋白作為標準蛋白標準曲線為y=5.4200x+0.0328,R2= 0.9997。
比酶活力(U/mg)=酶活力/蛋白濃度。
1.2.5 發(fā)酵條件的單因素優(yōu)化
1.2.5.1 生長曲線的繪制 挑取保存的木聚糖酶高產菌株GS115/pPIC9K-xynZF-2,接種于含有20 mL BMGY培養(yǎng)基的250 mL的三角瓶中,30℃,250 r/min培養(yǎng)48 h,每隔4 h取樣一次,將菌液稀釋后在波長為600 nm條件下以空白培養(yǎng)基為對照進行比色,測定吸光值A600,繪制細胞生長曲線,其中A600=讀數(shù)×稀釋倍數(shù)。
1.2.5.2 誘導溫度對發(fā)酵產酶的影響 將GS115/ pPIC9K-xynZF-2,接種于含有20 mL的BMGY培養(yǎng)基中,30℃,250 r/min培養(yǎng)后接入30 mL的BMMY培養(yǎng)基中,于26、28、30、32、34、36℃條件下培養(yǎng),每隔24 h補加0.5%甲醇一次,培養(yǎng)3 d后制備粗酶液,測量比酶活力,確定最優(yōu)的誘導溫度。
1.2.5.3 種齡對發(fā)酵產酶的影響 將GS115/pPIC9K-xynZF-2,接種于含有20 mL BMGY培養(yǎng)基的250 mL的三角瓶中,30℃,250 r/min培養(yǎng)12、16、20、24、28、 32、36 h后離心轉接入30 mL的BMMY培養(yǎng)基中,最優(yōu)溫度下培養(yǎng)3 d,每隔24 h補加甲醇0.5%,制備粗酶液,測定比酶活力,確定最佳的種齡。
1.2.5.4 甲醇誘導時間對發(fā)酵產酶的影響 將GS115/ pPIC9K-xynZF-2接種于含有20 mL BMGY培養(yǎng)基的250 mL的三角瓶中,30℃,250 r/min培養(yǎng),按照最佳種齡接入30 mL BMMY培養(yǎng)基,最適溫度下繼續(xù)培養(yǎng),每隔24 h補加0.5%的甲醇一次,24、48、72、96、120、144、168 h后,制備粗酶液,測量比酶活力,確定最佳的誘導時間。
1.2.5.5 誘導起始pH對發(fā)酵產酶的影響 將GS115/ pPIC9K-xynZF-2接種于含有20 mL pH分別由4.5、5.0、5.5、6.0、6.5、7.0、7.5的緩沖液配制的BMGY培養(yǎng)基中,30℃,250 r/min培養(yǎng),按照最佳種齡接入30 mL 的BMMY培養(yǎng)基中,最適溫度下培養(yǎng),每隔24 h補加0.5%的甲醇一次,培養(yǎng)最優(yōu)誘導時間后,制備粗酶液,測量比酶活力,確定最優(yōu)的誘導表達起始pH。
1.2.5.6 甲醇誘導濃度對發(fā)酵產酶的影響 將GS115/ pPIC9K-xynZF-2接種于含有20 mL BMGY培養(yǎng)基的250 mL的三角瓶中,30℃,250 r/min培養(yǎng),按照最佳種齡接入30 mL的BMMY培養(yǎng)基中最適溫度下培養(yǎng),每隔24 h補加甲醇0.25%、0.5%、1.0%、1.5%、2.0%、2.5%、3.0%、3.5%,培養(yǎng)最優(yōu)誘導時間后,制備粗酶液,測量比酶活力,確定甲醇最優(yōu)的誘導濃度。
1.2.6 響應面優(yōu)化設計 根據(jù)單因素實驗結果,選用種齡、誘導起始pH、誘導時間、甲醇濃度為因素,采用Box-Behnken中心組合實驗設計,設計四因素五水平的響應面實驗,因素水平表見表1。
表1 實驗因素水平表Table1 Experimental factors and levels table
1.2.7 統(tǒng)計學處理 每個實驗進行3次重復,取其平均值,最終實驗數(shù)據(jù)均用SPSS 11.0和Matlab-R2014a-Windows軟件進行處理,并繪制出相應的圖形。
2.1 畢赤酵母工程菌生長曲線的繪制
以培養(yǎng)時間為橫坐標,A600為縱坐標做GS115/ pPIC9K-xynZF-2生長曲線圖。如圖1所示,16~36 h為對數(shù)生長期,在28 h左右菌體達到對數(shù)生長中期,對數(shù)生長期以前由于菌體剛剛開始生長,菌體含量過少,屬于生長延遲期;超過對數(shù)生長期,由于菌株的代謝產物增加以及營養(yǎng)物質的消耗,不適宜菌體生產大量目的產物。對數(shù)生長期的菌株呈指數(shù)形式增長,繁殖速度快,菌體數(shù)量多,新陳代謝活躍,有利于進行菌株的最優(yōu)化生產,所以本實驗先暫定選取對數(shù)生長中期28 h菌體作為發(fā)酵用種子。
圖1 畢赤酵母工程菌生長曲線圖Fig.1 Growth curve of recombinant yeast
2.2 單因素實驗
2.2.1 誘導溫度對發(fā)酵產酶的影響 圖2顯示,在低于30℃時,隨著溫度的上升,該工程菌的產酶量依次增加,并且在30℃時產酶量達到最大,溫度再次升高時,產酶量成下降趨勢。溫度是微生物菌體生長的重要環(huán)境條件之一,菌體的發(fā)酵過程就是菌體內酶反應的一個過程,酶反應需要一定的溫度。溫度是通過影響微生物膜的液晶結構、酶和蛋白質的合成與活性,以及RNA的結構和轉錄等影響微生物的生命活動[16]。溫度過低,微生物的生長素受到限制,表達過程也會受到影響;溫度過高會破壞微生物的生長和表達過程,因此選擇合適的溫度非常重要,對于該工程菌選擇誘導溫度為30℃。
圖2 溫度對工程菌發(fā)酵產酶的影響Fig.2 Effect of temperature on xylanase production
2.2.2 種齡對發(fā)酵產酶的影響 將GS115/pPIC9K-xynZF-2進行甲醇誘導表達,并對其發(fā)酵條件進行優(yōu)化。在發(fā)酵過程中,種子的選擇非常關鍵,種齡太短,發(fā)酵過程會出現(xiàn)前期生長緩慢,致使周期延長,甚至造成異常發(fā)酵;種齡過長,會引起菌體過早自溶,導致生產能力下降。圖3結果顯示種齡選擇在對數(shù)生長期的28 h(A600=16.0)時,比酶活力最高。
2.2.3 甲醇誘導時間對發(fā)酵產酶的影響 圖4結果表明,誘導表達前期隨著時間的延長,表達量增大,在誘導96 h時達到最大;之后隨著時間的延長,產酶量依次遞減。在畢赤酵母中蛋白表達后被分泌到細胞外,可能影響培養(yǎng)液中營養(yǎng)物質的pH進而影響木聚糖酶的表達。誘導時間過短時,誘導劑還未充分發(fā)揮作用,培養(yǎng)基中營養(yǎng)物質并未大量消耗,啟動子啟動轉錄,蛋白表達量較少,比酶活力較低;誘導時間過長,培養(yǎng)液pH會發(fā)生明顯改變,并且隨著營養(yǎng)物質的大量消耗,目的蛋白的表達將會受阻,導致發(fā)酵液比酶活力下降。因此選擇96 h為該工程菌的最佳誘導時間。
圖3 種齡對產酶的影響Fig.3 Effect of inoculation time on xylanase production
圖4 甲醇誘導時間對產酶的影響Fig.4 Effect of induction time on xylanase production
2.2.4 發(fā)酵起始pH對產酶的影響 圖5結果顯示,發(fā)酵液偏酸偏堿都會影響工程菌的表達。GS115/ pPIC9K-xynZF-2工程菌在pH為6.5時產酶量最高,pH偏高時,畢赤酵母自身分泌的蛋白酶活力較高,可以分解產生的木聚糖酶[17];pH偏低時,酸性太強,重組木聚糖酶非常的不穩(wěn)定,所以該工程菌的發(fā)酵pH應選擇在pH6.5。
圖5 發(fā)酵起始pH對產酶的影響Fig.5 Effect of pH on xylanase production
2.2.5 誘導濃度對產酶的影響 甲醇能夠誘導重組畢赤酵母表達,但是并不是隨著甲醇濃度的增加表達量就隨之增加,圖6結果表明,甲醇濃度在1.5%時誘導表達量最大,濃度過大對誘導表達反而起抑制作用。畢赤酵母的表達是以醇氧化酶啟動子啟動外源基因表達的,在只有甘油作為碳源的BMGY培養(yǎng)基中,甲醇氧化酶AOX1根本不會產生,外源基因也不會表達[18]。在以甲醇作為碳源的BMMY培養(yǎng)基中,一方面,畢赤酵母會表達醇氧化酶來利用甲醇,而木聚糖酶基因在醇氧化酶基因的下游,所以木聚糖酶的表達與醇氧化酶的表達成正比關系;另一方面,甲醇既可以作為酵母的碳源也可以作為誘導物,因此,在一定范圍內提高甲醇的濃度可能會增加外源蛋白的表達量,但是,添加過量,甲醇對酵母生長也會產生毒害作用,由圖6可以選擇1.5%為該工程菌的最優(yōu)甲醇濃度。
圖6 甲醇濃度對產酶的影響Fig.6 Effect of methanol concentration on xylanase production
2.3 響應面實驗設計優(yōu)化結果
2.3.1 方差分析 如表2所示是響應面的結果,使用Matlab軟件對結果進行統(tǒng)計學分析,對表中數(shù)據(jù)我們進行了方差分析,見表3,在誤差允許范圍內,F(xiàn)值大于臨界值,四個因素的影響是顯著的,具有統(tǒng)計學意義。
對表中結果選用偏最小二乘回歸分析程序進行分析,得到畢赤酵母工程菌發(fā)酵產木聚糖酶比酶活力(Y)對種齡(X1)、誘導時間(X2)、甲醇濃度(X3)、pH (X4)的二次多項式回歸模型:Y=6672.3+1663.8X1-1222.3X3-1017.2X4+876.9X+1540X+759.2X-1670X1X3-1043.8X1X4-1560.2X2X3??梢詮恼`差平方和看出該二次多項式回歸模型的擬合效果,當潛變量個數(shù)為1時,數(shù)據(jù)標準化后模型誤差平方和為0.7526,并且可以得出相應組分時的模型擬合決定系數(shù)R2為0.9465,回歸模型的擬合度較好。
表2 響應面分析實驗結果Table2 Results of response surface analysis test
圖7 響應面結果四維圖Fig.7 Four dimensional graph of response surface results
表3 方差分析Table3 Analysis of variance
基于該模型,可以以四維圖的形式顯示出來,如圖7所示,從圖7中可以看出,四個因素在不同的水平對比酶活力均能產生不同的影響,最大值處于四維圖的邊緣,這給后期做進一步的優(yōu)化提供了很好的基礎。根據(jù)設定的條件對回歸模型進行優(yōu)化,在一定的實驗范圍內可以通過尋優(yōu)得到最優(yōu)的發(fā)酵工藝條件為:種齡為31 h,誘導時間104 h,甲醇誘導濃度1%,發(fā)酵起始pH4.0,模擬結果如圖8所示。根據(jù)此回歸方程可以得到最優(yōu)比酶活力可達44279 U/mg。
圖8 模擬結果四維圖Fig.8 The four dimensional map of analog result
2.3.2 驗證性實驗 根據(jù)所得到的最優(yōu)發(fā)酵工藝條件進行驗證性實驗,重復3次,得到實際比酶活力為43526.3 U/mg,大概占預測值的98.3%,說明此回歸模型很好地反應了實際情況。
通過對畢赤酵母工程菌發(fā)酵條件單因素的優(yōu)化,確定各個因素的最優(yōu)水平,在此基礎上進行Box-Behnken實驗設計,對工程菌發(fā)酵產木聚糖酶的發(fā)酵條件進行優(yōu)化,以小二乘模型對實驗數(shù)據(jù)進行優(yōu)化,得到影響木聚糖酶比酶活力的二次多項式回歸方程。最終的最優(yōu)發(fā)酵工藝條件為種齡為31 h,誘導時間104 h,甲醇誘導濃度1%,發(fā)酵起始pH4.0,預測值為44279 U/mg,對實驗結果進行驗證性實驗,最終實際數(shù)值為43526.3 U/mg,與理論數(shù)值相差不大說明該回歸模型合理可靠,與優(yōu)化前比酶活力1180 U/mg(圖2,30℃條件下培養(yǎng))相比提高了36倍多。本實驗是在實驗室水平上進行的,后續(xù)研究可以考慮對發(fā)酵罐中試等擴大培養(yǎng)條件進行優(yōu)化,以使該結果在工業(yè)上得到更大的利用。
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Optimization of fermentation condition of Pichia pastoris for xylanase production by response analysis
WANG Dan-dan1,2,ZHOU Chen-yan1,*,ZHU Xin-shu1,LI Tong-biao1
(1.School of Life Science and Technology,Xinxiang Medical University,Xinxiang 453000,China;2.San Quan Medlcal College,Xinxiang 453000,China)
The influence of the temperature,inoculum time,pH,methanol concentration and induction time on the xylanase production of pichia recombinant bacteria were studied.The response surface optimazation was designed on the basis of the single factor experiment,and the small squares quadratic regression equation was fitted out according to the results to discuss the influence of the various factors on the xylanase enzyme activity.The optimum fermentation culture conditions were as follows:inoculum age 31 h,induction time 104 h,methanol concentration induced by 1%,fermentation starting pH4.0,induction temperature 30℃.On this condition,the result of the experiment for xylanase enzyme activity was 43526.3 U/mg.
Pichia pastoris;xylanase;fermentation conditions;response surface
TS201.1
A
1002-0306(2016)02-0194-05
10.13386/j.issn1002-0306.2016.02.031
2015-05-06
王丹丹(1988-),女,碩士研究生,助教,研究方向:微生物酶工程,E-mail:wangdan2988@126.com。
*通訊作者:周晨妍(1979-),女,副教授,研究方向:酶工程與發(fā)酵工程,E-mail:zhouchenyan2008@163.com。
河南省教育廳科學技術研究重點項目(13A180861);河南省高等學校青年骨干教師資助計劃項目(2011GGJS-125);新鄉(xiāng)醫(yī)學院科研項目培育基金(2013ZD113);新鄉(xiāng)醫(yī)學院研究生科研創(chuàng)新支持計劃項目資助(YJSCX201327Y)。