王計平,安茜,段露露,趙熙寧,岳敏,崔紅利,李潤植
(山西農(nóng)業(yè)大學(xué) 分子農(nóng)業(yè)與生物能源研究所,山西 太谷 030801)
杜氏鹽藻(Dunaliellasalina)是一種單細(xì)胞無細(xì)胞壁、耐鹽性極高的光自養(yǎng)真核綠藻,能在高光、高溫和高鹽等極端環(huán)境下大量積累類胡蘿卜素,特別是β-胡蘿卜素含量可高達(dá)細(xì)胞干重的14%[1]。杜氏鹽藻還能富集藻多糖和油脂等高值化合物,是一種獨(dú)特、可商業(yè)化的優(yōu)質(zhì)生物資源。
類胡蘿卜素(carotenoids)是一種天然色素,可分為兩類,即碳?xì)渌妮祁惢衔?胡蘿卜素)和含氧衍生物(葉黃素)[2]。常見的類胡蘿卜素包括α-胡蘿卜素(α-carotene)、β-胡蘿卜素(β-carotene)、蝦青素(astaxanthin)、番茄紅素(lycopene)等[2]。類胡蘿卜素是一種親脂的萜類化合物,可溶于非極性有機(jī)溶劑,能與細(xì)胞膜發(fā)生特異性結(jié)合[3]。DNA序列比對研究發(fā)現(xiàn),杜氏鹽藻具有參與類胡蘿卜素合成兩條途徑即甲羥戊酸(mevalonic acid, MVA)途徑和甲基赤蘚糖醇(methylerythritol phosphate, MEP)途徑中的相關(guān)酶基因[4]。因此,一般認(rèn)為杜氏鹽藻可能經(jīng)過這兩個途徑將八氫番茄紅素C20的前體牻牛兒基牻牛兒基焦磷酸(GGPP)合成異戊烯焦磷酸(IPP),再經(jīng)過一系列酶促反應(yīng)最終合成類胡蘿卜素[5~7]。對一些高等植物和藻類的研究顯示,番茄紅素環(huán)化是類胡蘿卜素生物合成途徑的一個重要環(huán)節(jié)。番茄紅素β-環(huán)化酶(lycopene β-cyclase,LYCB)和番茄紅素ε-環(huán)化酶(lycopene ε-cyclase,LYCE)均可催化番茄紅素環(huán)化反應(yīng)。LYCE催化番茄紅素分子產(chǎn)生 δ-胡蘿卜素(δ-carotene),再經(jīng)過LYCB的催化,δ-胡蘿卜素生成α-胡蘿卜素(α-carotene)。在合成β-胡蘿卜素時,LYCB先連續(xù)2次催化番茄紅素成為γ-胡蘿卜素,然后再生成β-胡蘿卜素。
抗艷紅等[8]以番茄(東農(nóng)704、東農(nóng)709、東農(nóng)906、利生一號)4個品種的下胚軸和子葉為受體,通過根癌農(nóng)桿菌介導(dǎo)法將LYCE基因轉(zhuǎn)入番茄中并獲得了完整的抗性植株,經(jīng)PCR和PCR- Southern分析鑒定,初步證明外源基因LYCE已整合到番茄的基因組中。有研究表明,在鹽脅迫條件下雨生紅球藻(HaematococcusPluvialis)細(xì)胞α-胡蘿卜素含量顯著升高,表明雨生紅球藻含有較強(qiáng)活性的HpLCYE;進(jìn)一步通過分析HpLCYE和HpLCYB之間的競爭和協(xié)作控制代謝通量等表征,揭示了HpLCYE與HpLCYB的獨(dú)特環(huán)化順序,以及用于雜環(huán)類胡蘿卜素的生物合成的可能性[9]。目前,多數(shù)藻類LYCE序列是通過序列比對及基因組分析獲得的,僅對包括小球藻[10](Chromochloris)在內(nèi)的少數(shù)LCYE酶功能進(jìn)行了研究,多數(shù)藻類LCYE的功能及作用機(jī)制還鮮為人知。我們前期初步探討了LYCB在杜氏鹽藻β-胡蘿卜素合成和積累的作用[11],還不清楚LYCE是否與LYCB競爭底物或協(xié)調(diào)相關(guān)代謝通量而影響杜氏鹽藻β-胡蘿卜素富集。
本研究以從運(yùn)城鹽湖分離的一株杜氏鹽藻(YC-Ds011)為試材,采用RT-PCR分離杜氏鹽藻DsLYCE基因cDNA克隆,構(gòu)建植物組成型表達(dá)載體pCAMBIA1303-DsLYCE,并轉(zhuǎn)入農(nóng)桿菌GV3101菌株;通過煙草瞬時表達(dá)DsLYCE,研究DsLYCE功能以及異源表達(dá)對高等植物類胡蘿卜素合成及相關(guān)生理生化表征的影響。本研究將為全面解析DsLYCE功能及其應(yīng)用于高等植物類胡蘿卜素合成等代謝調(diào)控奠定基礎(chǔ)。
本氏煙草(Nicotianabenthamiana)種子由山西農(nóng)業(yè)大學(xué)分子農(nóng)業(yè)與生物能源所提供,將其播種于土壤中,放置在25 ℃,12 h·d-1光照培養(yǎng)箱中培養(yǎng)。培養(yǎng)60 d后用于農(nóng)桿菌介導(dǎo)的基因瞬時表達(dá)。
農(nóng)桿菌GV3101、pCAMBIA1303質(zhì)粒、大腸桿菌DH5α由山西農(nóng)業(yè)大學(xué)分子農(nóng)業(yè)與生物能源所保存。限制性內(nèi)切酶XbaI和KpnI、DNA Ladder Marker 購自生工生物工程有限公司; 瓊脂糖凝膠回收試劑盒、Trizol購自天根生物公司;PCR引物由安徽通用生物公司合成; 中量質(zhì)粒提取試劑盒、5X All-In-One MasterMix(with AccuRT Genomic DNA Removal Kit)反轉(zhuǎn)錄試劑盒均購于 ABM 公司。
取DM液體培養(yǎng)基培養(yǎng)13天杜氏鹽藻,離心收集處于對數(shù)生長期的藻細(xì)胞(約108數(shù)量級),按照Trizol法提取鹽藻總RNA。-80 ℃保存,備用。
參考反轉(zhuǎn)錄試劑盒使用方法進(jìn)行操作。用經(jīng)過濃度和純度測定后的總RNA作為模板,反轉(zhuǎn)錄合成的cDNA。反應(yīng)體系參照說明書,反應(yīng)條件:25 ℃,10 min;42 ℃,15 min;85 ℃,5 min。依據(jù)實驗室前期獲得的DsLYCE基因轉(zhuǎn)錄本序列設(shè)計擴(kuò)增全長ORF的引物L(fēng)YCE-F:5’-ATGAATTCCCTTCACAGTGGGTGCTGCAGC-3’和LYCE-R:5’-CACAAGAGGAGAAGGAGGTTTCGCAGCTG TGA-3’。高保真RT-PCR 反應(yīng)采用Pfu DNA Polymerase 酶,反應(yīng)體系參照說明書。反應(yīng)條件為:95 ℃預(yù)變性5 min,58 ℃退火30 s, 68 ℃延伸2 min 30 s,30 次循環(huán),68 ℃ 保溫 15 min,16 ℃ 15 min。將所有擴(kuò)增片斷純化回收后連接到PMD18-T 載體上,轉(zhuǎn)入感受態(tài)大腸桿菌DH5-α中,篩選出陽性克隆,提取質(zhì)粒DNA送通用生物公司(安徽)測序。
以攜帶DsLYCEORF 的PMD18-T克隆載體為模板,進(jìn)行高保真PCR擴(kuò)增。產(chǎn)物經(jīng)過1% 瓊脂糖凝膠電泳檢測后,使用瓊脂糖凝膠回收試劑盒回收并純化目的片段。利用限制性內(nèi)切酶XbaⅠ和KpnⅠ對PCR純化產(chǎn)物及pCAMBIA1303質(zhì)粒進(jìn)行酶切,用T4 DNA連接酶將目標(biāo)片段連接于pCAMBIA1303載體的MCS。然后將重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)入大腸桿菌DH5α,篩選陽性克隆進(jìn)行擴(kuò)繁并提取質(zhì)粒進(jìn)行雙酶切驗證。植物表達(dá)載體pCAMBIA1303-LYCE的結(jié)構(gòu)如圖1所示。
圖1 植物表達(dá)載體pCAMBIA1303-DsLYCE結(jié)構(gòu)示意圖
用質(zhì)粒提取試劑盒提取質(zhì)粒,利用熱激法將構(gòu)建好的超表達(dá)載體轉(zhuǎn)入農(nóng)桿菌GV3101中。平板培養(yǎng),挑選單菌落進(jìn)行檢測后,在含有Rif和Kan的LB培養(yǎng)基中進(jìn)行培養(yǎng)至OD600為0.6,用于煙草瞬時表達(dá)轉(zhuǎn)化。配置含有乙酰丁香酮、MgSO4、MES的重懸液100 mL,重懸菌體濃度至OD600為0.2。室溫放置4 h后,用注射器將農(nóng)桿菌重懸液接種于煙草葉表面。接種后室溫生長3 d后,提取葉片RNA。
取接種3 d后的煙草葉片進(jìn)行GUS染色,將煙草葉片浸入X-GUS染液中,染色方法參照GUS染色試劑盒。
取煙草葉片利用液氮充分研磨,Trizol Reagent 提取總RNA,具體方法參照說明書。以RNA為模板,cDNA合成反應(yīng)體系參照反轉(zhuǎn)錄試劑盒說明書,反應(yīng)條件:25 ℃ 10 min;42 ℃ 15 min;85 ℃ 5 min。以獲得cDNA為模板,用目的基因引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,產(chǎn)物用1%凝膠電泳檢測。
取煙草葉片利用液氮研磨,加入80%的丙酮進(jìn)行處理,定容至50 mL。4 ℃避光保存24 h至樣品顏色發(fā)白,利用紫外分光光度計進(jìn)行比色測定。轉(zhuǎn)pCAMBIA1303空載煙草和未侵染的野生型煙草作為陰性對照。
對源于杜氏鹽藻藻株Ds-YC011藻細(xì)胞cDNA進(jìn)行高保真RT-PCR擴(kuò)增目標(biāo)cDNA。擴(kuò)增產(chǎn)物電泳分離結(jié)果(圖2)顯示,RT-PCR反應(yīng)擴(kuò)增出一條長度約為1 700 bp的目標(biāo)條帶。經(jīng)測序獲得1 686 bp的核苷酸序列。編碼區(qū)序列與實驗室中所獲得杜氏鹽藻LYCE基因序列比對結(jié)果表明,從Ds-YC011鹽藻株系擴(kuò)增的DsLYCEcDNA克隆與杜氏鹽藻LYCE基因DNA序列有6%的差異,但推測的氨基酸序列無差異。這表明分離獲得了正確的DsLYCEcDNA克隆。
M為Marker;A、B為DsLYCE cDNA
經(jīng)XbaⅠ和KpnⅠ對重組表達(dá)載體pCAMBIA1303-DsLYCE的酶切結(jié)果如圖3所示,其中LYCE片段的大小約1 700 bp。
M:12 000 bp DNA Marker; A.XbaⅠ、KpnⅠ酶切pCAMBIA1303-DsLYCE質(zhì)粒; B.pCAMBIA1303質(zhì)粒
利用熱激法轉(zhuǎn)入農(nóng)桿菌中,挑單菌落,進(jìn)行菌液PCR檢測。檢測結(jié)果如圖4所示,在1 700 bp處有目的條帶,表明目的基因DsLYCE成功轉(zhuǎn)入農(nóng)桿菌中,保存并用于后續(xù)實驗。
M:2 000 bp DNA Marker;泳道1、2、3、4、5為DsLYCE擴(kuò)增片段
將野生型煙草葉片和DsLYCE瞬時表達(dá)的葉片在X-Gluc溶液中浸泡后鏡檢。如圖5所示,A圖為野生型煙草的GUS染色鏡檢結(jié)果,沒有細(xì)胞呈現(xiàn)藍(lán)色。B圖為瞬時表達(dá)的煙草葉片GUS染色鏡檢結(jié)果,在視野中可以觀察到細(xì)胞被染成藍(lán)色,可見綠色熒光蛋白的表達(dá)與對照相比有明顯差異。因此可以判斷DsLYCE基因在煙草下表皮細(xì)胞中成功表達(dá)。
A野生型煙草;B 瞬時表達(dá)煙草
提取各樣品煙草葉片總RNA,并經(jīng)核酸濃度儀測定其濃度及OD260/280值,OD260/280均在1.8~2.0之間,可用作后期cDNA合成和PCR檢測DsLYCE基因表達(dá)。如圖6所示,DsLYCE在煙草葉中有效表達(dá)。
M:2 000 bp DNA Marker;泳道1、2、3、4為DsLYCE擴(kuò)增片段
煙草葉片色素含量測定如圖7所示,轉(zhuǎn)入pCAMBIA1303空載煙草與野生型煙草葉片的類胡蘿卜素、葉綠素a與葉綠素b的含量均沒有明顯的差異。轉(zhuǎn)DsLYCE基因的煙草葉片中類胡蘿卜素比野生型增加24%,類胡蘿卜素含量差異達(dá)顯著水平(P<0.05)。葉綠素a和葉綠素b含量較野生煙草及轉(zhuǎn)空載的煙草葉片中的含量也顯著提高。這說明DsLYCE能在異源煙草葉組織中行使催化功能,促進(jìn)類胡蘿卜素合成積累,同時還能提高葉綠素含量,有利于光合作用。
圖中小寫字母表示處理間存在顯著性差異P<0.05
在植物類胡蘿卜素合成途徑中,番茄紅素的環(huán)化是一個重要分支節(jié)點,番茄紅素β-環(huán)化酶(LYCB)與LYCE的共同作用產(chǎn)生α-胡蘿卜素。α-胡蘿卜素是橘黃色脂溶性化合物,是合成葉黃素的生物前體。但目前關(guān)于α-胡蘿卜素的合成機(jī)制研究甚少。在玉米中,已經(jīng)克隆并鑒定了LYCE基因,屬于單拷貝基因[12]。LYCE基因和LYCB基因共同表達(dá)的強(qiáng)弱,決定了α-胡蘿卜素在類胡蘿卜素中的比例[13]。有關(guān)研究表明:使用番茄紅素環(huán)化酶抑制劑可降低LYCE基因的轉(zhuǎn)錄水平,可增加番茄紅素的代謝量[14]。Halilu, Alhassan等人[15]利用分子標(biāo)記法對類胡蘿卜素生物合成過程中關(guān)鍵基因LYCE進(jìn)行分析,結(jié)果表明:LYCE基因有利于玉米胚乳中維生素原A活性類胡蘿卜素的增加。有關(guān)玉米天然類胡蘿卜素變異的研究表明,降低LYCE等位基因的表達(dá),可以增加β胡蘿卜素的產(chǎn)量[12]。李群睿等[16]從自交系玉米B73克隆LYCE基因,并且發(fā)現(xiàn)該基因可在番茄紅素的2個末端添加2個ε-紫羅蘭酮環(huán)進(jìn)而生成ε-胡蘿卜素。江琳玉[17]成功地采用RT-PCR從中國水仙中克隆了LYCE基因。但是,目前關(guān)于LYCE基因在類胡蘿卜素復(fù)雜的合成代謝途徑中的具體分子機(jī)理研究,尤其是在微藻類胡蘿卜素合成代謝中的作用鮮見報道。
為了深入研究DsLYCE在杜氏鹽藻的類胡蘿卜素合成過程中的分子機(jī)理,本文成功克隆到DsLYCE基因的cDNA,同時構(gòu)建了pCAMBIA1303+DsLYCE植物表達(dá)載體,并采用農(nóng)桿菌介導(dǎo)法在煙草瞬時表達(dá)以鑒定其功能。研究結(jié)果表明,轉(zhuǎn)DsLYCE基因煙草葉片中類胡蘿卜素比野生型增加24%,葉綠素a和葉綠素b含量也較野生型煙草及轉(zhuǎn)空載的煙草葉片中的含量顯著提高。這表明杜氏鹽藻DsLYCE基因可編碼具活性的酶蛋白,促進(jìn)異源宿主煙草葉片中類胡蘿卜素的合成與積累,以及提高葉綠素含量。葉綠素含量的提高可能是由于類胡蘿卜素含量顯著增加,保護(hù)葉綠素免受強(qiáng)光破壞,或者是由于DsLYCE過表達(dá)上調(diào)了葉綠素合成途徑,具體作用機(jī)理有待進(jìn)一步研究。
總之,本研究證明所分離的杜氏鹽藻LYCE基因可編碼具有活性的酶蛋白,在異源植物組織中超表達(dá)不僅能顯著促進(jìn)類胡蘿卜素合成和積累,還有利于光合作用。這為解析包括微藻在內(nèi)的植物類胡蘿卜素生物合成的分子機(jī)制及相關(guān)色素代謝的遺傳修飾提供了新知識和靶標(biāo)分子。