轉(zhuǎn)錄因子
- 黑質(zhì)區(qū)過表達(dá)TFEB對C57/BL6小鼠運(yùn)動(dòng)功能影響
黑質(zhì)區(qū)過表達(dá)轉(zhuǎn)錄因子EB（TFEB）對C57/BL6小鼠運(yùn)動(dòng)功能的影響。方法8周齡雄性C57/BL6小鼠30只，隨機(jī)分為2組，每組15只。采用腦立體定位注射方法，將攜帶有TFEB的腺相關(guān)病毒（AAV-TFEB）注射至實(shí)驗(yàn)組小鼠黑質(zhì)區(qū)，對照組小鼠注射相同劑量的空載腺相關(guān)病毒（AAV-mCherry）。4周后，采用免疫熒光和免疫印跡方法檢測小鼠黑質(zhì)區(qū)是否高表達(dá)TFEB，利用曠場、轉(zhuǎn)棒和爬桿實(shí)驗(yàn)評估高表達(dá)TFEB小鼠的運(yùn)動(dòng)功能變化。結(jié)果腦立體定位注射腺相關(guān)病毒4
- 藏茵陳基源植物皺邊喉毛花的全長轉(zhuǎn)錄組信息分析
874 個(gè)轉(zhuǎn)錄因子和15 166 個(gè)長非編碼RNA（LncRNA），而注釋到轉(zhuǎn)錄本最多的轉(zhuǎn)錄因子家族是C3H。（4）篩選出55 條與單萜類及黃酮類化合物合成相關(guān)的轉(zhuǎn)錄本。該研究結(jié)果豐富了皺邊喉毛花的轉(zhuǎn)錄組信息，為進(jìn)一步篩選皺邊喉毛花藥用成分合成相關(guān)的關(guān)鍵基因提供了重要的遺傳資源。關(guān)鍵詞： 皺邊喉毛花， 全長轉(zhuǎn)錄組， 代謝通路， 轉(zhuǎn)錄因子， 長非編碼RNA中圖分類號：? Q943文獻(xiàn)標(biāo)識碼：? A文章編號：? 1000-3142（2023）07-1335-
廣西植物 2023年7期2023-08-20
- 甜蕎花青素合成相關(guān)基因FeR2R3-MYB的克隆與表達(dá)分析
是一類常見的轉(zhuǎn)錄因子，廣泛參與植物花青素生物合成的調(diào)控。為探究 MYB轉(zhuǎn)錄因子在甜蕎花青素生物合成中的調(diào)控作用，該研究從甜蕎品種紅花甜蕎和北早生的轉(zhuǎn)錄組學(xué)數(shù)據(jù)中篩選并克隆出一個(gè)和花青素生物合成相關(guān)的MYB基因，將其命名為 FeR2R3-MYB，GenBank 登錄號為 MT151381.1，并對該序列進(jìn)行生物信息學(xué)分析，以及利用 qRT-PCR 分析FeR2R3-MYB基因在北早生和紅花甜蕎中的表達(dá)特征。結(jié)果表明：（1）FeR2R3-MYB基因全長 831
廣西植物 2023年7期2023-08-20
- 轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控番茄抗旱性研究進(jìn)展
復(fù)雜性狀，而轉(zhuǎn)錄因子能通過轉(zhuǎn)錄級聯(lián)效應(yīng)同時(shí)調(diào)控干旱脅迫響應(yīng)通路上的多個(gè)基因來調(diào)節(jié)植物的抗旱性，是培育抗旱番茄品種的重要遺傳資源。本文對近年來有關(guān)轉(zhuǎn)錄因子調(diào)節(jié)番茄抗旱性和參與干旱脅迫響應(yīng)的最新研究成果進(jìn)行了歸納總結(jié)，綜述了bHLH、MYB、NAC、bZIP、ERF、WRKY、HD-Zip等家族轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控番茄響應(yīng)干旱脅迫的研究進(jìn)展。在干旱脅迫下，這些轉(zhuǎn)錄因子參與的調(diào)節(jié)網(wǎng)絡(luò)主要涉及脫落酸（ABA）和活性氧等相關(guān)通路。對轉(zhuǎn)錄因子在培育番茄抗育品種中的應(yīng)用進(jìn)行了討
江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2023年9期2023-06-04
- 猴樟CbMYB308轉(zhuǎn)錄因子基因克隆及生物信息學(xué)分析
3-MYB型轉(zhuǎn)錄因子，CbMYB308蛋白化學(xué)分子式為C1496H2356N432O489S11，相對分子量34.57 kDa，理論等電點(diǎn)6.12，結(jié)構(gòu)不穩(wěn)定，無序化特征明顯，為脂溶性和親水性蛋白，磷酸化氨基酸位點(diǎn)有53個(gè)，亞細(xì)胞定位預(yù)測為細(xì)胞核。關(guān)鍵詞 猴樟；轉(zhuǎn)錄因子；基因克??；生物信息學(xué)分析中圖分類號 S792.23 文獻(xiàn)標(biāo)識碼 A文章編號 1007-7731（2023）03-0014-04猴樟（Cinnamomun bodinieri Levl.）為
安徽農(nóng)學(xué)通報(bào) 2023年3期2023-05-30
- 猴樟CbP5CR基因克隆及生物信息學(xué)分析
鍵詞 猴樟；轉(zhuǎn)錄因子；基因克??；生物信息學(xué)分析中圖分類號 S792? ?文獻(xiàn)標(biāo)識碼 A文章編號 1007-7731（2023）04-0022-04猴樟（Cinnamomun bodinieri Levl.）是我國重要的綠化樹種、經(jīng)濟(jì)樹種和林用樹種，主要分布于我國南方地區(qū)。近幾年，猴樟產(chǎn)業(yè)因其生長速度快、抗性強(qiáng)而迅速發(fā)展起來[1]，并逐漸向我國長江以北地區(qū)推廣應(yīng)用，而北方地區(qū)堿性土壤環(huán)境限制了猴樟的生產(chǎn)栽培。植物耐堿性能與其根系適應(yīng)堿脅迫的策略密切相關(guān)，包括
安徽農(nóng)學(xué)通報(bào) 2023年4期2023-05-18
- 基于加權(quán)關(guān)聯(lián)網(wǎng)絡(luò)分析的辣椒（Capsicum annuum L.）果實(shí)顏色轉(zhuǎn)變相關(guān)基因的鑒定
、8573個(gè)轉(zhuǎn)錄因子，共同注釋到8049個(gè)轉(zhuǎn)錄因子，包括AP2、F-box、MYB和UDPGT等類型。利用非冗余的差異表達(dá)基因進(jìn)行了加權(quán)關(guān)聯(lián)網(wǎng)絡(luò)分析，關(guān)聯(lián)到4個(gè)與葉綠素、類胡蘿卜素、花色苷、類黃酮含量相關(guān)的模塊，進(jìn)一步分析表明p450（）、Pkinase（）、F-box（）和zf-MYND（）等29個(gè)轉(zhuǎn)錄因子可能參與辣椒果實(shí)轉(zhuǎn)色的調(diào)控。本研究為進(jìn)一步探索辣椒果實(shí)色素形成過程中的關(guān)鍵調(diào)控因子以及分析相關(guān)色素生物合成的調(diào)控提供了重要數(shù)據(jù)。關(guān)鍵詞：一年生辣椒;轉(zhuǎn)
熱帶作物學(xué)報(bào) 2022年6期2022-07-21
- MYB轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控植物花青素生物合成的研究進(jìn)展
摘要：MYB轉(zhuǎn)錄因子是植物重要的調(diào)控因子，可與bHLH和WD40類轉(zhuǎn)錄因子形成二元MYB-bHLH或三元MBW復(fù)合體，對植物花青素合成與積累起著至關(guān)重要的作用。本文綜述了花青素合成途徑、MYB轉(zhuǎn)錄因子類型、MYB轉(zhuǎn)錄因子正向及負(fù)向調(diào)控、MYB轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控機(jī)制等方面的研究進(jìn)展，并對相關(guān)后續(xù)研究進(jìn)行了探討與展望。本綜述可為花青素生物合成機(jī)制研究提供參考。關(guān)鍵詞：MYB;轉(zhuǎn)錄因子;花青素;生物合成中圖分類號：S188文獻(xiàn)標(biāo)識碼：A文章編號：1008-0457（2
山地農(nóng)業(yè)生物學(xué)報(bào) 2022年3期2022-05-17
- Trihelix 轉(zhuǎn)錄因子家族研究進(jìn)展
helix 轉(zhuǎn)錄因子家族基因在光響應(yīng)和植物形態(tài)建成，如花、萼片、氣孔、表皮毛、胚胎和種子發(fā)育等不同生長發(fā)育過程，以及在病害、鹽脅迫、干旱脅迫和低溫脅迫等生物脅迫和非生物脅迫響應(yīng)等過程中都扮演重要角色。從結(jié)構(gòu)特征、生物學(xué)功能及逆境脅迫和激素的響應(yīng)等方面對 Trihelix 轉(zhuǎn)錄因子家族進(jìn)行綜述，以期加深研究者對 Trihelix 轉(zhuǎn)錄因子家族的理解，進(jìn)而促進(jìn) Trihelix 轉(zhuǎn)錄因子家族基因功能研究的開展。關(guān)鍵詞 Trihelix;轉(zhuǎn)錄因子;結(jié)構(gòu)特征;功能
安徽農(nóng)業(yè)科學(xué) 2022年6期2022-04-11
- 昆蟲Toll與IMD信號通路研究進(jìn)展
信號通路下游轉(zhuǎn)錄因子進(jìn)入細(xì)胞核，激活體液免疫相關(guān)基因的表達(dá)。關(guān)鍵詞：病原相關(guān)分子模式;模式識別受體;信號級聯(lián);轉(zhuǎn)錄因子中圖分類號：Q963文獻(xiàn)標(biāo)識碼：A文章編號：1008-0457（2022）02-0044-007國際DOI編碼：10.15958/j.cnki.sdnyswxb.2022.02.007抗菌肽（antibacterial peptide，ABP）又稱抗微生物肽（ antimicrobial peptides，AMPs ） 或肽抗生素（pept
山地農(nóng)業(yè)生物學(xué)報(bào) 2022年2期2022-03-16
- 暹羅炭疽菌轉(zhuǎn)錄因子CsAtf1互作蛋白的篩選和鑒定
P是真核生物轉(zhuǎn)錄因子家族之一，通過調(diào)控基因的表達(dá)來參與調(diào)控生長發(fā)育及生物、非生物脅迫應(yīng)答等生理過程。已有報(bào)道表明bZIP轉(zhuǎn)錄因子Atf1與多種病原真菌的生長發(fā)育及致病力相關(guān)。由于轉(zhuǎn)錄因子通常能夠在其他互作蛋白的參與下與順式作用元件特異性結(jié)合，從而調(diào)節(jié)靶基因表達(dá)，因此篩選其互作蛋白對深入了解轉(zhuǎn)錄因子的調(diào)控機(jī)制有重要意義。本研究克隆獲得來自橡膠樹炭疽病的暹羅炭疽菌（Colletotrichum siamense）的一個(gè)bZIP轉(zhuǎn)錄因子CsAtf1，并對CsAt
熱帶作物學(xué)報(bào) 2022年1期2022-02-10
- 中?？Х萕RKY基因家族的生物信息學(xué)分析
植物中最大的轉(zhuǎn)錄因子家族之一，在植物的多種應(yīng)激反應(yīng)中發(fā)揮著重要作用。該文利用生物信息學(xué)方法對中粒咖啡WRKY蛋白家族的理化特性及其分子進(jìn)化進(jìn)行了詳細(xì)分析。結(jié)果表明：（1）CcWRKY蛋白氨基酸數(shù)量在103～994個(gè)之間，均無信號肽，推測其為非分泌性蛋白;其二級結(jié)構(gòu)以無規(guī)則卷曲為最主要的結(jié)構(gòu)元件，三級結(jié)構(gòu)主要分為6類，其中以CcWRKY15、CcWRKY25、CcWRKY37和CcWRKY42為主要成員的D類結(jié)構(gòu)最穩(wěn)定。（2）保守結(jié)構(gòu)域及進(jìn)化樹分析結(jié)果顯示，
廣西植物 2021年11期2021-12-18
- 巴西橡膠樹CAMTA轉(zhuǎn)錄因子全基因組鑒定與表達(dá)分析
巴西橡膠樹;轉(zhuǎn)錄因子;CAMTA;基因表達(dá)中圖分類號：S794.1? ? ? 文獻(xiàn)標(biāo)識碼：AGenome-wide Identification and Expression Analysis of the CAMTA Family in Rubber Tree （Hevea brasiliensis）LIN Xianzu1，2， XIAO Xiaohu2， YANG Jianghua2， QIN Yunxia2， LONG Xiangyu2， FANG
熱帶作物學(xué)報(bào) 2021年10期2021-12-08
- 通過生物信息學(xué)分析預(yù)測肺鱗癌病人預(yù)后的免疫信號
Gs）;構(gòu)建轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，探討其異常表達(dá)的機(jī)制。應(yīng)用單變量Cox回歸確定DEIRGs的預(yù)后價(jià)值，應(yīng)用Lasso回歸和多變量Cox比例風(fēng)險(xiǎn)回歸構(gòu)建預(yù)后風(fēng)險(xiǎn)模型，并對模型的預(yù)測性能進(jìn)行驗(yàn)證。評估這些危險(xiǎn)因素與各種臨床變量和免疫浸潤細(xì)胞之間的關(guān)系。結(jié)果 由PLAU、JUN、RNASE7、FOS、IGGD3-22、IGKV1-6、SEMA4C、APLN、FGFR4和TRAV39共10個(gè)IRGs構(gòu)成的風(fēng)險(xiǎn)模型顯示出良好的預(yù)測性能，有望成為預(yù)測LUSC病人預(yù)后的獨(dú)
- 中華獼猴桃WOX轉(zhuǎn)錄因子的生物信息學(xué)分析
物特有的一類轉(zhuǎn)錄因子，在植物發(fā)育關(guān)鍵時(shí)期，如胚的形成、維持干細(xì)胞穩(wěn)定性和器官形成過程中發(fā)揮重要調(diào)控作用。為探究WOX轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控中華獼猴桃的生長發(fā)育的分子理論基礎(chǔ)，該文利用ProtParam、Cell-PLoc2.0、SignalP4.1 Server等在線軟件對中華獼猴桃的16個(gè)WOX轉(zhuǎn)錄因子進(jìn)行理化特性、亞細(xì)胞定位和信號肽等詳細(xì)的生物信息學(xué)分析。結(jié)果表明：（1）中華獼猴WOX轉(zhuǎn)錄因子的所有蛋白成員的氨基酸數(shù)目在138～371之間，分子量為16.222～
廣西植物 2021年9期2021-10-16
- 柱花草磷饑餓響應(yīng)基因SgPHR1和SgPHR2的克隆與表達(dá)分析
s）中克隆到轉(zhuǎn)錄因子SgPHR1和SgPHR2基因。SgPHR1和SgPHR2基因cDNA全長分別為1413?bp和849?bp，編碼470和282個(gè)氨基酸殘基，蛋白分子量分別為51.4?kD和30.9?kD。SgPHR1和SgPHR2均為SANT家族成員，包含MYB蛋白結(jié)構(gòu)域和CC蛋白結(jié)構(gòu)域，并具有多個(gè)潛在的磷酸化位點(diǎn)。亞細(xì)胞定位預(yù)測表明，SgPHR1和SgPHR2均定位于細(xì)胞核中。實(shí)時(shí)定量PCR結(jié)果表明，SgPHR1基因在柱花草根和葉中的表達(dá)量高于莖中
熱帶作物學(xué)報(bào) 2021年8期2021-09-14
- 小麥TaTDR-Like基因的克隆及表達(dá)分析
基因;克隆;轉(zhuǎn)錄因子;表達(dá)分析中圖分類號： S512.1? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?文獻(xiàn)標(biāo)志碼： A 文章編號：2095-1191（2021）09-2329-10Cloning and expression analysis of TaTDR-Like genes in wheatDU Jing-jing1， XIA Yu1， REN Yang1， LI Yan-hong1， LI Zheng2， ZHANG Gai-sheng1，3
南方農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào) 2021年9期2021-09-13
- 茶樹WOX基因家族的鑒定和表達(dá)模式分析
摘要：WOX轉(zhuǎn)錄因子在植物的生長發(fā)育和非生物脅迫響應(yīng)中起著重要的調(diào)控作用。文章基于全基因組數(shù)據(jù)，從茶樹基因組中鑒定出29個(gè)WOX基因，并對其基因結(jié)構(gòu)、進(jìn)化關(guān)系、保守域、染色體定位進(jìn)行分析，同時(shí)分析了它們在PEG誘導(dǎo)的干旱脅迫、鹽脅迫處理中的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)。結(jié)果表明，29個(gè)CsWOX（茶樹WOX）基因在茶樹染色體上分布不均;根據(jù)進(jìn)化關(guān)系將茶樹WOX基因分為4類;基因結(jié)構(gòu)和保守基序分析發(fā)現(xiàn)相同亞家族的基因結(jié)構(gòu)和保守結(jié)構(gòu)域基本一致;基因表達(dá)分析顯示，CsWOX基因在
中國茶葉 2021年3期2021-09-10
- 轉(zhuǎn)錄因子介導(dǎo)乙烯調(diào)控番茄果實(shí)成熟的研究進(jìn)展
DS-box轉(zhuǎn)錄因子、NAC轉(zhuǎn)錄因子、AP2/ERF轉(zhuǎn)錄因子、SBP/SPL轉(zhuǎn)錄因子和其他轉(zhuǎn)錄因子介導(dǎo)乙烯調(diào)控番茄果實(shí)成熟的研究進(jìn)展，為進(jìn)一步完善轉(zhuǎn)錄因子介導(dǎo)乙烯參與番茄果實(shí)成熟的轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡(luò)提供理論參考。關(guān)鍵詞 番茄;轉(zhuǎn)錄因子;乙烯;果實(shí)成熟中圖分類號 S 641.2? 文獻(xiàn)標(biāo)識碼 A? 文章編號 0517-6611（2021）16-0016-03doi：10.3969/j.issn.0517-6611.2021.16.005?? 開放科學(xué)（資源服務(wù)）標(biāo)
安徽農(nóng)業(yè)科學(xué) 2021年16期2021-08-30
- 甘薯NAC轉(zhuǎn)錄因子家族的全基因組鑒定與分析
因組中NAC轉(zhuǎn)錄因子進(jìn)行鑒定、保守結(jié)構(gòu)域分析、motif查找、染色體定位、系統(tǒng)進(jìn)化樹分析以及逆境脅迫下基因表達(dá)分析。結(jié)果表明：甘薯全基因組序列中含有91個(gè)NAC轉(zhuǎn)錄因子基因，非均勻分布于甘薯15條染色體上;系統(tǒng)進(jìn)化樹及motif分析結(jié)果顯示，91個(gè)甘薯NAC家族成員可分為16個(gè)亞組，共包含20個(gè)motif，其中大部分家族成員中均含有motif 2、motif 4、motif 1、motif 8和motif 3，這5個(gè)motif分別對應(yīng)NAC結(jié)構(gòu)域中的5個(gè)子
熱帶作物學(xué)報(bào) 2021年7期2021-08-26
- 香蕉MaWRKY1轉(zhuǎn)錄因子在果實(shí)和幼苗誘導(dǎo)抗冷性中表達(dá)分析
aWRKY1轉(zhuǎn)錄因子在抗冷誘導(dǎo)過程中的作用，采用外源過氧化氫（H2O2）、茉莉酸甲酯（MeJA）、水楊酸（SA）和丙烯（propylene）等處理香蕉果實(shí)，同時(shí)采用外源H2O2、MeJA和脫落酸（ABA）等處理香蕉幼苗，處理結(jié)束后，將實(shí)驗(yàn)材料放置于7?℃下貯藏，通過Northern blot技術(shù)分析實(shí)驗(yàn)材料中MaWRKY1基因表達(dá)變化。H2O2、MeJA、SA和propylene等處理均使果實(shí)冷害癥狀推遲2?d出現(xiàn);處理組果實(shí)中MaWRKY1 mRNA積累
熱帶作物學(xué)報(bào) 2021年2期2021-08-06
- 水稻幼穗響應(yīng)鹽脅迫的轉(zhuǎn)錄組分析
現(xiàn)5個(gè)重要的轉(zhuǎn)錄因子。本研究通過水稻幼穗轉(zhuǎn)錄組分析，為研究幼穗耐鹽分子機(jī)制提供參考。關(guān)鍵詞：水稻;幼穗發(fā)育;鹽脅迫;轉(zhuǎn)錄組;轉(zhuǎn)錄因子中圖分類號：S511 ? ? ?文獻(xiàn)標(biāo)識碼：AAbstract： Salt stress is one of the important environmental factors affecting crop growth and development. Identifying new salt tolerance gen
熱帶作物學(xué)報(bào) 2021年5期2021-07-20
- 外源赤霉素調(diào)控稻草飼用品質(zhì)后水稻轉(zhuǎn)錄因子基因表達(dá)譜分析
素處理后水稻轉(zhuǎn)錄因子基因表達(dá)譜的變化。GA處理后雜交秈稻兩優(yōu)培九與其對照有28個(gè)基因表達(dá)發(fā)生明顯變化，其中表達(dá)上調(diào)的有9個(gè)，下調(diào)的有19個(gè);表達(dá)差異明顯的基因主要屬于亞油酸代謝、α-亞麻酸的代謝、戊糖和葡萄糖醛酸轉(zhuǎn)換、植物病原物相互作用、淀粉和蔗糖代謝、氨基糖和核苷酸糖代謝、嘌呤代謝等途徑的基因。GA處理后粳稻品種南粳44有11個(gè)基因的表達(dá)發(fā)生明顯差異，其中9個(gè)基因表達(dá)上調(diào)，2個(gè)基因表達(dá)下調(diào);差異表達(dá)基因主要集中在類黃酮生物合成、黃酮和黃酮醇的生物合成、晝
江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2021年10期2021-07-01
- 蘋果Dof轉(zhuǎn)錄因子生物信息學(xué)及其表達(dá)分析
解蘋果Dof轉(zhuǎn)錄因子家族的生物學(xué)信息與功能，利用蘋果基因組GDDH13 v1.1檢索及RNA-seq轉(zhuǎn)錄本重構(gòu)找到51個(gè)Dof 基因，并通過 Pfam 和SMART檢測確認(rèn)，進(jìn)一步對這些Dof基因進(jìn)行全面分析。結(jié)果表明，除MD07G1265700外，其他50個(gè)Dof蛋白均含有一個(gè)明顯的Dof結(jié)構(gòu)域，且有一個(gè)CX2CX21CX2C基序。這些Dof基因編碼氨基酸數(shù)為163～523，相對分子質(zhì)量為18 210～55 800，等電點(diǎn)為5.01～10.30，多數(shù)Do
江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào) 2021年2期2021-06-30
- 植物轉(zhuǎn)錄因子HD-Zip基因家族參與逆境脅迫的研究進(jìn)展
要調(diào)節(jié)作用的轉(zhuǎn)錄因子，該基因家族是植物中特有的。所有HD-Zip轉(zhuǎn)錄因子都包含同源異型盒和亮氨酸拉鏈2個(gè)結(jié)構(gòu)域，根據(jù)基因結(jié)構(gòu)和功能可分為4個(gè)亞家族。該家族基因具有多種生物學(xué)功能?；诖?，結(jié)合HD-Zip轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)構(gòu)和亞家族分類，綜述近年來HD-Zip轉(zhuǎn)錄因子參與植物逆境脅迫響應(yīng)的相關(guān)研究進(jìn)展。關(guān)鍵詞 HD-Zip;轉(zhuǎn)錄因子;逆境脅迫;抗旱;抗鹽;抗低溫中圖分類號：Q945.78 文獻(xiàn)標(biāo)志碼：A DOI：10.19415/j.cnki.1673-890x.
南方農(nóng)業(yè)·中旬 2021年12期2021-02-16
- 茶特征成分合成相關(guān)新轉(zhuǎn)錄因子鑒定
有獨(dú)特風(fēng)味。轉(zhuǎn)錄因子不僅在植物生長發(fā)育中起重要調(diào)控作用，也影響植物的次級代謝產(chǎn)物合成，而茶樹中關(guān)于轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控兒茶素，茶氨酸和咖啡堿的報(bào)道較少。本研究結(jié)合茶樹全器官轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)與茶樹基因組數(shù)據(jù)重構(gòu)轉(zhuǎn)錄本，獲得大量新基因和新轉(zhuǎn)錄本，進(jìn)而結(jié)合茶樹不同器官中兒茶素、茶氨酸和咖啡堿的含量差異，分別建立茶樹中兒茶素、茶氨酸和咖啡堿與差異表達(dá)基因之間的相關(guān)性，篩選鑒定與茶樹中兒茶素、茶氨酸和咖啡堿相關(guān)的基因及轉(zhuǎn)錄因子，并分別對與茶樹中兒茶素、茶氨酸和咖啡堿合成相關(guān)的3條
江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào) 2021年6期2021-01-29
- 煙草NTBZIPO38的克隆、鑒定及表達(dá)模式分析
（bZIP）轉(zhuǎn)錄因子是植物中數(shù)量最多、最具有多樣性的基因家族之一，對植物生長發(fā)育及脅迫響應(yīng)具有重要作用。為探究煙草中bZIP轉(zhuǎn)錄因子的生物學(xué)功能，本研究在煙草K326中克隆得到一個(gè)bZP轉(zhuǎn)錄因子基因Vtbzipo38，并對其保守結(jié)構(gòu)域進(jìn)行分析，利用qRT-PCR技術(shù)檢測了該基因的表達(dá)模式，進(jìn)一步結(jié)合亞細(xì)胞定位及轉(zhuǎn)錄激活試驗(yàn)對其功能進(jìn)行了初步鑒定。結(jié)果表明，NTBZIPO38含有典型的bZP結(jié)構(gòu)域，亞細(xì)胞定位于細(xì)胞核中并具有轉(zhuǎn)錄激活活性。表達(dá)模式分析表明，N
中國煙草科學(xué) 2021年2期2021-01-18
- 番茄甾體生物堿合成酶基因SlERT1b的功能驗(yàn)證及轉(zhuǎn)錄調(diào)控
T1b基因的轉(zhuǎn)錄因子SlJERF1和SlAREB2。該研究結(jié)果為今后番茄遺傳育種提供理論基礎(chǔ)。關(guān)鍵詞：番茄;甾體生物堿;乙烯;轉(zhuǎn)錄因子中圖分類號：Q946.92 ? ? ?文獻(xiàn)標(biāo)識碼：AAbstract： The steroidal glycoalkaloids in green tomatoes mainly exist in the form of α-tomatine， which gives tomatoes bitter taste and ar
熱帶作物學(xué)報(bào) 2021年12期2021-01-13
- 維甲酸受體相關(guān)孤核受體α作為腫瘤治療潛在靶點(diǎn)的研究進(jìn)展
員，其是一種轉(zhuǎn)錄因子，在多種生理、病理過程中起著關(guān)鍵的調(diào)節(jié)作用。近年來，越來越多的證據(jù)表明，RORα參與多種惡性腫瘤的發(fā)生、發(fā)展過程，故被認(rèn)為是腫瘤治療的潛在靶點(diǎn)。本文介紹RORα在幾種常見腫瘤中的作用及其機(jī)制的研究進(jìn)展，為RORα在腫瘤治療領(lǐng)域的基礎(chǔ)研究和臨床轉(zhuǎn)化研究提供參考。關(guān)鍵詞 維甲酸受體相關(guān)孤核受體α 腫瘤治療靶點(diǎn) 轉(zhuǎn)錄因子中圖分類號：R730.23； R979.19 文獻(xiàn)標(biāo)志碼：A 文章編號：1006-1533（2021）23-0008-04基
上海醫(yī)藥 2021年23期2021-01-13
- 干旱脅迫下野生大豆bHLH家族轉(zhuǎn)錄組分析
，以bHLH轉(zhuǎn)錄因子為關(guān)鍵詞進(jìn)行篩選，再綜合轉(zhuǎn)錄因子分析中提供的相關(guān)數(shù)據(jù)，共獲得177條相關(guān)序列，包括64個(gè)bHLH家族成員。通過蛋白網(wǎng)絡(luò)互作分析確定了4個(gè)干旱相關(guān)基因。為進(jìn)一步研究野生大豆干旱脅迫下bHLH家族抗旱基因提供了理論基礎(chǔ)。關(guān)鍵詞：野生大豆;轉(zhuǎn)錄組;干旱脅迫;bHLH;顯著差異表達(dá)基因;轉(zhuǎn)錄因子中圖分類號：S565.101 ??文獻(xiàn)標(biāo)志碼： A文章編號：1002-1302（2020）19-0024-06收稿日期：2019-11-29基金項(xiàng)目：河
江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2020年19期2020-12-09
- 植物轉(zhuǎn)錄因子MYB基因家族研究進(jìn)展
范吉標(biāo)摘要：轉(zhuǎn)錄因子是響應(yīng)環(huán)境脅迫，即干旱、鹽分和寒冷等植物信號傳導(dǎo)途徑的主要調(diào)節(jié)劑，MYH是植物最大轉(zhuǎn)錄因子家族之一，MYB轉(zhuǎn)錄因子亞家族特定于植物界。綜述提供了MYB基因家族在植物中的最新功能調(diào)控研究進(jìn)展，以了解植物中MYH轉(zhuǎn)錄因子的調(diào)控機(jī)制，為植物分子育種研究提供新思路。關(guān)鍵詞：轉(zhuǎn)錄因子;MYH;基因家族;研究進(jìn)展轉(zhuǎn)錄因子（TF）是控制所有生物基因表達(dá)的重要調(diào)節(jié)因子，在植物發(fā)育、細(xì)胞周期、細(xì)胞信號和逆境反應(yīng)中發(fā)揮重要作用。TF通過與目的基因的遠(yuǎn)端和局
河南農(nóng)業(yè)·教育版 2020年8期2020-11-06
- 龍眼DlWRKY52基因克隆及表達(dá)分析
要：WRKY轉(zhuǎn)錄因子在植物的生長發(fā)育和逆境脅迫響應(yīng)中起著重要作用。前期研究發(fā)現(xiàn)，部分WRKY基因（比如DlWRKY52）參與了龍眼的成花誘導(dǎo)和逆境脅迫響應(yīng)過程。為進(jìn)一步研究龍眼WRKY基因的功能，以‘四季蜜龍眼葉片cDNA為模板克隆得到DlWRKY52基因，并對其序列特征、組織表達(dá)模式、花果發(fā)育過程表達(dá)模式及亞細(xì)胞定位進(jìn)行研究。結(jié)果表明：DlWRKY52基因的開放閱讀框（open reading frame， ORF）全長為918 bp，編碼306個(gè)氨基酸
熱帶作物學(xué)報(bào) 2020年4期2020-08-06
- 花青素合成轉(zhuǎn)錄因子PAP2植物表達(dá)載體構(gòu)建及其遺傳轉(zhuǎn)化
草;花青素;轉(zhuǎn)錄因子;轉(zhuǎn)基因中圖分類號 Q943.2文獻(xiàn)標(biāo)識碼 A文章編號 0517-6611（2020）13-0106-05Abstract The AtPAP2 gene is a regulatory gene in the anthocyanin synthesis pathway of Arabidopsis thaliana，in order to express this gene in tobacco， we successfully cl
安徽農(nóng)業(yè)科學(xué) 2020年13期2020-07-14
- 基于轉(zhuǎn)錄組分析篩選牛心樸子響應(yīng)低溫脅迫的轉(zhuǎn)錄因子家族
應(yīng)低溫脅迫的轉(zhuǎn)錄因子家族，鑒定出牛心樸子低溫脅迫響應(yīng)的關(guān)鍵調(diào)控基因，為全面解析逆境脅迫響應(yīng)分子調(diào)控網(wǎng)絡(luò)及有效挖掘關(guān)鍵調(diào)控基因提供理論參考。【方法】通過高通量測序技術(shù)對低溫脅迫（CT組）和常溫處理（對照，CK組）的牛心樸子cDNA文庫進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序分析，對差異表達(dá)基因進(jìn)行功能注釋和富集，鑒定出響應(yīng)低溫脅迫的轉(zhuǎn)錄因子家族，并選取4個(gè)差異表達(dá)的轉(zhuǎn)錄因子基因進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測，以驗(yàn)證轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果的可信度。【結(jié)果】從CK組和CT組共獲得30.50 Gb的原
南方農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào) 2020年5期2020-07-07
- 煙草赤星病菌AabHLH1基因的克隆及功能分析
，bHLH）轉(zhuǎn)錄因子是真核生物中高度保守的一類轉(zhuǎn)錄因子，參與調(diào)控多種植物致病真菌的生長發(fā)育、外界脅迫應(yīng)答反應(yīng)和致病力等過程。本研究從煙草赤星病菌鏈格孢中克隆了一個(gè)bHLH1類型轉(zhuǎn)錄因子基因，命名為AabHLH1。該基因編碼區(qū)全長1 650 bp，無內(nèi)含子，編碼蛋白含549個(gè)氨基酸。利用同源重組方法獲得了該基因的插入突變體M1，M1菌落在PDA上呈淺褐色，邊緣白色;氣生菌絲較野生菌株（WT）稍弱，鏡檢可見部分菌絲彎曲明顯，產(chǎn)孢量降低，且分生孢子萌發(fā)時(shí)間推遲，
山東農(nóng)業(yè)科學(xué) 2020年1期2020-07-04
- 宮頸病變患者外周血中TH1/TH2漂移狀態(tài)與T-bet/GATA-3的表達(dá)及意義
宮頸病變患者轉(zhuǎn)錄因子GATA-3、T-bet與TH細(xì)胞因子的相關(guān)性及其在外周血中的表達(dá)水平及意義。 方法 選擇2017年1月～2019年1月新疆醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院就診的76例患者，根據(jù)宮頸液基細(xì)胞學(xué)檢測分為對照組（33例）、低度鱗狀上皮內(nèi)病變（L-SIL）組（10例）及高度鱗狀上皮內(nèi)病變（H-SIL）組（33例）。Rt-PCR檢測血清GATA-3及T-bet表達(dá)量，流式細(xì)胞學(xué)檢測三組血清TH細(xì)胞因子含量，相關(guān)性分析采用Pearson相關(guān)分析。 結(jié)果 H-
中國醫(yī)藥導(dǎo)報(bào) 2020年11期2020-05-25
- Th22、Treg細(xì)胞轉(zhuǎn)錄因子及細(xì)胞因子在子癇前期孕婦胎盤組織中的表達(dá)及意義
Treg細(xì)胞轉(zhuǎn)錄因子AHR、Foxp3及細(xì)胞因子IL-22、IL-10的表達(dá)，探討其在子癇前期中的作用。 方法 選取35例明確診斷的子癇前期孕婦為研究組，同時(shí)選取正常妊娠孕婦35例為對照組，采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測兩組孕婦胎盤組織中Th22、CD4+CD25+CD127low Treg細(xì)胞轉(zhuǎn)錄因子AHR mRNA、Foxp3 mRNA的表達(dá)情況;采用免疫組化檢測細(xì)胞因子IL-22、IL-10的表達(dá)。 結(jié)果 AHR mRNA在研究組和對照組的表達(dá)量分別為（
中國現(xiàn)代醫(yī)生 2020年5期2020-05-06
- 柚芽變株系類胡蘿卜素代謝差異基因的轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析
示了7個(gè)家族轉(zhuǎn)錄因子的表達(dá)模式與類胡蘿卜素合成基因高度相關(guān)，分別為MADS、bZIP、bHLH、MYB、AP2/ERF、NAC和WRKY。通過實(shí)時(shí)熒光定量PCR（qRT-PCR）驗(yàn)證了部分基因的表達(dá)模式，結(jié)果與RNA-seq結(jié)果高度一致。此外，經(jīng)對‘紅肉蜜柚果肉轉(zhuǎn)色期的初生和次生代謝通路DEGs富集分析，發(fā)現(xiàn)類胡蘿卜素的積累過程中，細(xì)胞壁、脂質(zhì)、類黃酮代謝差異基因大量富集。研究結(jié)果揭示，‘琯溪蜜柚果實(shí)紅肉突變品種‘紅肉蜜柚和‘三紅蜜柚果實(shí)類胡蘿卜素的形成和
熱帶作物學(xué)報(bào) 2020年11期2020-01-04
- 乳腺腫瘤組織中轉(zhuǎn)錄因子GATA3的表達(dá)及其與臨床病理特征的相關(guān)性
腺腫瘤組織中轉(zhuǎn)錄因子GATA3的表達(dá)、臨床病理特征的相關(guān)性。方法：選取本院2014年9月至2018年9月收治的32例乳腺腫瘤患者，按照乳腺良惡性組織分組，分為腫瘤惡性組織組（n=21）、腫瘤良性組織組（n=11），予以比較兩組GATA3表達(dá)情況，并對GATA3表達(dá)和臨床病理特征相關(guān)性進(jìn)行分析。結(jié)果：腫瘤惡性組織組和腫瘤良性組織組在GATA3表達(dá)情況方面對比，P【關(guān)鍵詞】乳腺腫瘤組織;轉(zhuǎn)錄因子;GATA3表達(dá);臨床病理特征文章編號：WHR2019011207
中外女性健康研究 2019年17期2019-11-05
- WRKY轉(zhuǎn)錄因子在植物非生物脅迫抗逆育種中的應(yīng)用
素。WRKY轉(zhuǎn)錄因子由于其過量表達(dá)能夠提高植物抗旱、耐鹽、耐低溫、抗凍甚至抵抗重金屬等逆境脅迫的能力，因此被作為應(yīng)用基因工程途徑進(jìn)行植物抗逆性狀改良的理想候選基因。在分子育種中，增加1個(gè)關(guān)鍵的轉(zhuǎn)錄因子的調(diào)控能力，能同時(shí)激活多個(gè)功能基因表達(dá)，從而提高植株綜合抗逆性。本文主要綜述了WRKY轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)構(gòu)、功能、轉(zhuǎn)錄調(diào)控機(jī)制研究以及近年來國內(nèi)外WRKY轉(zhuǎn)錄因子新基因的發(fā)現(xiàn)及其在培育抗逆性轉(zhuǎn)基因植物中的應(yīng)用，以期為植物抗逆分子育種改良提供參考。關(guān)鍵詞：WRKY;轉(zhuǎn)
江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2019年16期2019-11-02
- 辣椒應(yīng)答冷信號轉(zhuǎn)導(dǎo)機(jī)制研究進(jìn)展
導(dǎo)途徑中關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子、耐冷基因表達(dá)等方面，綜述了辣椒應(yīng)答冷信號的研究進(jìn)展，從而為辣椒耐冷分子機(jī)制研究提供參考。關(guān)鍵詞：辣椒;冷害;信號轉(zhuǎn)導(dǎo);轉(zhuǎn)錄因子;耐冷基因中圖分類號：S641.3文獻(xiàn)標(biāo)識碼：A文章編號： 1000-4440（2019）03 -0743 -06辣椒（Capsicum spp.）原產(chǎn)中南美洲熱帶地區(qū)，屬于喜溫性蔬菜作物，冷害脅迫對辣椒生長發(fā)育會造成不利的影響。低于15℃低溫條件下，辣椒種子萌發(fā)時(shí)間延長，發(fā)芽率下降，幼苗葉片萎蔫，株高、莖粗、
江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào) 2019年3期2019-09-10
- 金鐵鎖轉(zhuǎn)錄因子ptMYC2的克隆和生物信息學(xué)分析
苷，MYC類轉(zhuǎn)錄因子在調(diào)節(jié)植物三萜類次生代謝積累中有重要作用。為研究ptMYC2 基因在金鐵鎖三萜皂苷合成代謝途徑的調(diào)控機(jī)制，該研究基于金鐵鎖轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)，克隆得到ptMYC2轉(zhuǎn)錄因子的兩個(gè)全長基因;通過生物信息學(xué)軟件對兩條轉(zhuǎn)錄因子的同源性、理化性質(zhì)、疏水性、跨膜結(jié)構(gòu)、亞細(xì)胞定位、結(jié)構(gòu)域、靶基因結(jié)合位點(diǎn)等進(jìn)行初步預(yù)測分析。結(jié)果表明：兩條轉(zhuǎn)錄因子所編碼的蛋白屬于親水性蛋白，不存在跨膜區(qū)域，均是非分泌蛋白質(zhì)，且不存在信號肽;兩條轉(zhuǎn)錄因子的亞細(xì)胞定位于細(xì)胞核;
廣西植物 2019年10期2019-09-10
- 植物轉(zhuǎn)錄因子MYB基因家族研究進(jìn)展
范吉標(biāo)摘要：轉(zhuǎn)錄因子是響應(yīng)環(huán)境脅迫，即干旱、鹽分和寒冷等植物信號傳導(dǎo)途徑的主要調(diào)節(jié)劑，MYH是植物最大轉(zhuǎn)錄因子家族之一，MYB轉(zhuǎn)錄因子亞家族特定于植物界。綜述提供了MYB基因家族在植物中的最新功能調(diào)控研究進(jìn)展，以了解植物中MYH轉(zhuǎn)錄因子的調(diào)控機(jī)制，為植物分子育種研究提供新思路。關(guān)鍵詞：轉(zhuǎn)錄因子;MYH;基因家族;研究進(jìn)展轉(zhuǎn)錄因子（TF）是控制所有生物基因表達(dá)的重要調(diào)節(jié)因子，在植物發(fā)育、細(xì)胞周期、細(xì)胞信號和逆境反應(yīng)中發(fā)揮重要作用。TF通過與目的基因的遠(yuǎn)端和局
河南農(nóng)業(yè)·教育版 2019年12期2019-09-08
- 植物硫代葡萄糖苷二次修飾及調(diào)控的研究進(jìn)展
的二次修飾、轉(zhuǎn)錄因子和幾種關(guān)鍵植物激素對硫苷二次修飾的調(diào)控作用以及硫苷二次修飾相關(guān)基因?qū)α蜍蘸铣煞答佌{(diào)節(jié)的研究進(jìn)展。這對于深入認(rèn)識硫苷合成和調(diào)控的分子機(jī)理以及十字花科蔬菜作物的抗性和高品質(zhì)育種具有重要意義。關(guān)鍵詞：硫代葡萄糖苷;二次修飾;轉(zhuǎn)錄因子;調(diào)控;多樣性;研究進(jìn)展中圖分類號： S184? 文獻(xiàn)標(biāo)志碼： A? 文章編號：1002-1302（2019）04-0022-07硫代葡萄糖苷（glucosinolates，GSLs）簡稱硫苷，是富含氮、硫的植物次
江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2019年4期2019-08-10
- 北柴胡轉(zhuǎn)錄因子BcAP2-13的原核表達(dá)和多克隆抗體制備
苷生物合成的轉(zhuǎn)錄因子基因BcAP2-13的原核表達(dá)載體p13-SUMO-His6。載體熱激轉(zhuǎn)化大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞BL21（DE3）后，用異丙 基-β-D-硫代半乳糖苷（isopropyl-β-D-thiogalactoside，IPTG）誘導(dǎo)培養(yǎng)，十二烷基硫酸鈉-聚丙烯酰胺凝膠電泳（SDS-PAGE）分析表明，28 ℃和37 ℃不同溫度誘導(dǎo)條件下均得到了融合蛋白13-SUMO-His 6。以Ni-NTA柱純化的融合蛋白為抗原，免疫成年兔4次以制備多克隆抗體
江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2019年10期2019-07-08
- 芒果果實(shí)bHLH家族轉(zhuǎn)錄因子的生物信息學(xué)分析
植物中較大的轉(zhuǎn)錄因子家族之一，在真核生物生長發(fā)育調(diào)控中具有重要作用。本研究基于芒果果實(shí)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)，利用生物信息學(xué)方法鑒定出87個(gè)bHLH家族蛋白，其中酸性蛋白所占比例較大，大部分為不穩(wěn)定蛋白，且均為不含信號肽的親水性蛋白，除CL10714.Contig1為膜結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子外，其余均不含跨膜結(jié)構(gòu)。芒果bHLH蛋白結(jié)構(gòu)域有多個(gè)氨基酸位點(diǎn)保守性較高，87個(gè)芒果bHLH蛋白中73個(gè)（83.91%）具有E-box結(jié)合功能。GO分析發(fā)現(xiàn)芒果bHLH蛋白共注釋到生物學(xué)過程
熱帶作物學(xué)報(bào) 2019年2期2019-06-11
- 房顫相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子的研究進(jìn)展
大量研究證實(shí)轉(zhuǎn)錄因子PITX2、ZFHX3、PRRX1、TBX5在其中發(fā)揮重要作用。通過對房顫相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子的研究，可以明確房顫的遺傳學(xué)基礎(chǔ)，可以提供房顫治療的新方向?！娟P(guān)鍵詞】心房顫動(dòng)；轉(zhuǎn)錄因子；PITX2；ZFHX3；TBX5；PRRX1【中圖分類號】R541 【文獻(xiàn)標(biāo)識碼】A 【文章編號】ISSN.2095-6681.2019.12..04Research progress of transcription factors in atrial fibr
中西醫(yī)結(jié)合心血管病電子雜志 2019年12期2019-05-28
- 玉米P1基因表達(dá)、蛋白定位預(yù)測與功能分析
它們含有P1轉(zhuǎn)錄因子，液相色譜分析A-45（11-1）、A-44（10-7）、A-37（12-5）、京24等株系籽粒果皮發(fā)現(xiàn)，果皮中含有鞣酐，而且它們的果皮表現(xiàn)出不同類型的紅色，紙層析和顯微觀察發(fā)現(xiàn)果皮組分含有蛋白質(zhì)和磚紅色物質(zhì)，所以F5代株系果皮P1轉(zhuǎn)錄因子可能來自京24。關(guān)鍵詞：果皮;鞣酐;轉(zhuǎn)錄因子;玉米中圖分類號 S513文獻(xiàn)標(biāo)識碼 A文章編號 1007-7731（2019）08-0009-05Abstract：Maize inbred lines
安徽農(nóng)學(xué)通報(bào) 2019年8期2019-05-28
- 核桃油脂合成轉(zhuǎn)錄因子JrWRI1基因的克隆及生物信息學(xué)分析
油脂合成關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子JrWRI1基因，其cDNA序列全長為1 230 bp，編碼409個(gè)氨基酸。通過對其結(jié)構(gòu)特征、生物學(xué)特性進(jìn)行分析，發(fā)現(xiàn)該基因編碼蛋白屬于AP2/ERF轉(zhuǎn)錄因子超級家族，具有特異的DNA結(jié)合序列，調(diào)節(jié)生物合成和代謝過程，定位于細(xì)胞核中，符合轉(zhuǎn)錄因子行使功能的特點(diǎn)。并構(gòu)建了JrWRI1超表達(dá)重組載體，為進(jìn)一步研究JrWRI1在核桃果實(shí)油脂合成與積累過程中的功能奠定基礎(chǔ)，也為利用分子手段加快高油核桃新品種的選育提供參考。關(guān)鍵詞：核桃;果實(shí);油
山東農(nóng)業(yè)科學(xué) 2019年2期2019-04-06
- miRNA調(diào)控植物抗逆機(jī)制的研究現(xiàn)狀
因?yàn)榭鼓嫦嚓P(guān)轉(zhuǎn)錄因子的miRNA（miR160/miR167、miR159、miR156和miR164）以及以靶基因?yàn)榭鼓嫦嚓P(guān)結(jié)構(gòu)基因的miRNA（miR398和miR395），可為利用基因工程手段增強(qiáng)植物的抗逆性提供更有效的改良途徑。關(guān)鍵詞：miRNA;逆境脅迫;轉(zhuǎn)錄因子;結(jié)構(gòu)基因;靶基因中圖分類號： S332.1;S184文獻(xiàn)標(biāo)志碼： A文章編號：1002-1302（2019）21-0063-04收稿日期：2018-09-28基金項(xiàng)目：國家自然科學(xué)基金
江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2019年21期2019-01-03
- 冠心病相關(guān)基因的生物信息學(xué)分析
基因，通路，轉(zhuǎn)錄因子和miRNA。方法：從公共基因芯片數(shù)據(jù)庫GEO下載冠心病基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)，篩選出差異表達(dá)基因（DEGs），并對差異基因進(jìn)行GO、KEGG以及PPI網(wǎng)絡(luò)分析。最后利用Webgestalt預(yù)測CHD相關(guān)的miRNA以及轉(zhuǎn)錄因子，并構(gòu)建miRNA-TF-gene調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。結(jié)果：共篩選出1449個(gè)DEGs。GO功能分析發(fā)現(xiàn)DEGs主要參與炎癥反應(yīng)、細(xì)胞 - 細(xì)胞信號傳導(dǎo)、神經(jīng)肽信號通路等生物學(xué)過程。KEGG通路富集分析發(fā)現(xiàn)DEGs參與神經(jīng)活性配體
健康大視野 2018年17期2018-12-28
- 高脂飲食對小鼠轉(zhuǎn)錄因子C/EBPα表達(dá)的影響
脂飲食對小鼠轉(zhuǎn)錄因子CCAAT/增強(qiáng)子結(jié)合蛋白α（CCAAT/enhancer binding protein-α，C/EBPα）表達(dá)的影響。方法：60只（sprague dawley，SD）雄性小鼠適應(yīng)性飼養(yǎng)1周，之后隨機(jī)均分成兩組：高脂飲食組（30只）和正常飲食組（30只），分別給予高脂飼料及普通飼料喂養(yǎng)，每周記錄各組小鼠的體重，8周后用酶聯(lián)免疫吸附測定法（enzyme linked immunosorbent assay，ELISA）測定兩組小鼠血清
中國醫(yī)學(xué)創(chuàng)新 2018年27期2018-12-14
- 銀杏bHLH91轉(zhuǎn)錄因子基因的克隆及表達(dá)分析
： bHLH轉(zhuǎn)錄因子在植物的生長發(fā)育、脅迫應(yīng)答和次生代謝中具有重要的調(diào)控作用。該研究通過PCR技術(shù)從銀杏（Ginkgo biloba）葉中分離得到了一個(gè)bHLH基因的cDNA序列，并將其命名為GbbHLH91。序列分析結(jié)果顯示擴(kuò)增的GbbHLH91基因cDNA序列長度為1 425 bp，開放閱讀框是1 065 bp，編碼354個(gè)氨基酸，分子量為 40.1 kDa，等電點(diǎn)為8.20。系統(tǒng)進(jìn)化分析結(jié)果顯示，從用于進(jìn)化樹構(gòu)建的bHLH蛋白質(zhì)聚類情況來看，銀杏Gb
廣西植物 2018年2期2018-09-10
- 鹽脅迫條件下花生應(yīng)答轉(zhuǎn)錄因子鑒定與分析
李國衛(wèi)摘要：轉(zhuǎn)錄因子是一類具有特殊結(jié)構(gòu)、調(diào)控基因表達(dá)的蛋白質(zhì)分子。為了解析轉(zhuǎn)錄因子在花生適應(yīng)鹽脅迫環(huán)境中的分子機(jī)制，本研究以魯花14號為材料，通過RNA-seq分析花生轉(zhuǎn)錄因子在鹽脅迫以及恢復(fù)后的表達(dá)差異。結(jié)果表明，在250 mmol/L NaCl處理4 d后，花生中共檢測到76個(gè)差異表達(dá)的轉(zhuǎn)錄因子，分別屬于13個(gè)轉(zhuǎn)錄因子家族。其中，根中35個(gè)轉(zhuǎn)錄因子上調(diào)表達(dá)，29個(gè)下調(diào)表達(dá)；地上部40個(gè)上調(diào)表達(dá)，17個(gè)下調(diào)表達(dá)。鹽脅迫解除后，有35個(gè)轉(zhuǎn)錄因子不但沒有恢復(fù)
山東農(nóng)業(yè)科學(xué) 2018年6期2018-08-14
- 轉(zhuǎn)錄因子DREB1A基因的克隆及植物表達(dá)載體的構(gòu)建
雄摘要：研究轉(zhuǎn)錄因子DREB1A在植物抗?jié)B透脅迫反應(yīng)中的作用。根據(jù)GenBank中登錄的DREB1A基因的序列設(shè)計(jì)引物，用PCR方法從擬南芥中克隆DREB1A基因，利用基因重組技術(shù)成功構(gòu)建了植物表達(dá)載體pCAMB1A1300-DREB1A。該結(jié)果為進(jìn)一步利用DREB1A基因做遺傳轉(zhuǎn)化研究奠定了基礎(chǔ)。關(guān)鍵詞：轉(zhuǎn)錄因子；DREB1A基因；植物表達(dá)載體中圖分類號：Q943.2 文獻(xiàn)標(biāo)志碼：A 文章編號：1001-1463（2018）11-0029-03doi：1
甘肅農(nóng)業(yè)科技 2018年11期2018-06-11
- 甜櫻桃MYB轉(zhuǎn)錄因子基因的克隆與表達(dá)分析
出1個(gè)MYB轉(zhuǎn)錄因子基因，將其命名為PaMYB10，GenBank登錄號為ALH21137.1。該基因編碼的氨基酸序列具有R2和R3保守結(jié)構(gòu)域，屬于R2R3-MYB家族基因，與薔薇科的桃、歐李、梅等作物親緣關(guān)系較近。qRT-PCR結(jié)果表明，PaMYB10在紅色品種‘美早的莖、葉、花和果實(shí)中均有表達(dá)，但表達(dá)量存在差異，在成熟果實(shí)中表達(dá)量最高?！涝缰谢ㄇ嘬蘸侩S著果實(shí)的發(fā)育逐漸升高，PaMYB10的表達(dá)顯著上調(diào)；‘13-33中花青苷含量隨著果實(shí)的發(fā)育變化不明
山東農(nóng)業(yè)科學(xué) 2018年3期2018-03-29
- 基于文本挖掘的基因網(wǎng)絡(luò)分析
miRNA 轉(zhuǎn)錄因子阿爾茨海默?。ˋD）是一種起病隱匿的進(jìn)行性發(fā)展的神經(jīng)系統(tǒng)退行性疾病。臨床上以記憶障礙、失語、失用、失認(rèn)、視空間技能損害、執(zhí)行功能障礙以及人格和行為改變等全面性癡呆表現(xiàn)為特征，病因迄今未明。65歲以前發(fā)病者，稱早老性癡呆；65歲以后發(fā)病者稱老年性癡呆。如今，阿爾茨海默病已經(jīng)成為一個(gè)世界性的公共衛(wèi)生問題，由于人口老齡化情況嚴(yán)重，使得阿爾茨海默病的發(fā)病率和患者人數(shù)成倍增加。據(jù)當(dāng)前數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)，世界范圍內(nèi)阿爾茨海默病患者大概有三千多萬，預(yù)計(jì)到205
電子技術(shù)與軟件工程 2017年20期2018-01-17
- BZR1基因表達(dá)模式分析
通路中編碼了轉(zhuǎn)錄因子的重要基因BZR1在擬南芥不同發(fā)育時(shí)期的花藥中的表達(dá)模式，為BR信號通路調(diào)控雄蕊發(fā)育的機(jī)制研究提供了新的認(rèn)識和重要的參考。關(guān)鍵詞：擬南芥；花藥；蕓苔素；BZR1；轉(zhuǎn)錄因子中圖分類號：Q789 文獻(xiàn)標(biāo)識碼：A 文章編號：1671-2064（2017）23-0199-04雄性生殖在開花植物繁衍傳代的過程中發(fā)揮關(guān)鍵作用，對農(nóng)作物的產(chǎn)量有重要的影響。雄性不育是指植物體中雄蕊發(fā)育由于受到內(nèi)、 外因素的影響而發(fā)育不正常的現(xiàn)象，這種現(xiàn)象會嚴(yán)重影響作物
中國科技縱橫 2017年23期2018-01-15
- 番茄花器官發(fā)育相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子的研究進(jìn)展
器官發(fā)育相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子的研究進(jìn)展，為進(jìn)一步闡明番茄花器官發(fā)育的分子機(jī)制以及相關(guān)轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的作用機(jī)理奠定基礎(chǔ)。關(guān)鍵詞：花器官發(fā)育；ABCDE模型；番茄；轉(zhuǎn)錄因子中圖分類號 Q943 文獻(xiàn)標(biāo)識碼 A 文章編號 1007-7731（2017）11-0027-07The Recent Advances in the Development of Transcription Factors Involved in Floral Organ Development i
安徽農(nóng)學(xué)通報(bào) 2017年11期2017-06-23
- 人RAG2基因5′近端染色質(zhì)結(jié)構(gòu)定量差異分析及可接近區(qū)域轉(zhuǎn)錄調(diào)控機(jī)制研究
T細(xì)胞特異性轉(zhuǎn)錄因子GATA3結(jié)合于T細(xì)胞特異性DHS的高度保守區(qū)域，特異性上調(diào)報(bào)告基因及在體RAG2 mRNA在T細(xì)胞中的表達(dá)。結(jié)論 RAG2基因5′近端區(qū)域通過染色質(zhì)開放狀態(tài)變化調(diào)控基因表達(dá)的特異性。GATA3與高度保守的DHS區(qū)域結(jié)合，上調(diào)內(nèi)源性人RAG2在T細(xì)胞中的表達(dá)。[關(guān)鍵詞]重組激活基因；染色質(zhì)可接近性；啟動(dòng)子；順式作用元件；轉(zhuǎn)錄因子；T淋巴細(xì)胞[中圖分類號] R-33 [文獻(xiàn)標(biāo)識碼] A [文章編號] 1674-4721（2017）01（c
中國當(dāng)代醫(yī)藥 2017年3期2017-03-18