增強(qiáng)子
- 增強(qiáng)子調(diào)控異常與惡性腫瘤的關(guān)系研究進(jìn)展
211166增強(qiáng)子最早于1981 年由Banerji 等［1］在猿猴空泡病毒SV40的DNA 序列5′端發(fā)現(xiàn)，它能使HeLa 細(xì)胞中兔血紅蛋白β1 基因表達(dá)增加200 倍。之后，Gillies 等［2］在哺乳動(dòng)物免疫球蛋白重鏈基因中也發(fā)現(xiàn)增強(qiáng)子的存在，并且該增強(qiáng)子的功能與序列方向、靶基因啟動(dòng)子的位置無(wú)關(guān)。近年來(lái)，人類(lèi)基因組DNA 元件百科全書(shū)（encyclopedia of DNA elements，ENCODE）［3］和表觀遺傳組學(xué)藍(lán)圖計(jì)劃［4］揭示了
- YY1作用機(jī)制及在動(dòng)物繁殖調(diào)控中的研究進(jìn)展
YY1通常占據(jù)增強(qiáng)子-啟動(dòng)子相互作用的位點(diǎn),偶爾也占據(jù)絕緣子相互作用的位點(diǎn)。且研究發(fā)現(xiàn)大約 10% 的哺乳動(dòng)物基因受該轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控[6-8],因此YY1對(duì)基因的調(diào)控具有重要意義。本文將綜述YY1的結(jié)構(gòu)與功能、作用機(jī)制及其在動(dòng)物繁殖調(diào)控過(guò)程中的研究進(jìn)展,以期為深入挖掘該基因的功能及研究動(dòng)物的繁殖調(diào)控機(jī)理提供理論參考。1 YY1蛋白結(jié)構(gòu)及特點(diǎn)YY1是調(diào)控真核細(xì)胞生命活動(dòng)的關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子。YY1在某些無(wú)脊椎動(dòng)物和所有脊椎動(dòng)物廣泛表達(dá)且高度保守[9]。在人類(lèi)基因組中
畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào) 2023年10期2023-10-29
- BRD4抑制劑JQ1通過(guò)超級(jí)增強(qiáng)子相關(guān)lncRNAs影響宮頸癌患者的預(yù)后研究*
對(duì)腫瘤相關(guān)超級(jí)增強(qiáng)子具有顯著抑制作用,是JQ1發(fā)揮抗腫瘤作用的重要機(jī)制之一[8],但JQ1是否參與宮頸癌HeLa細(xì)胞超級(jí)增強(qiáng)子的調(diào)控尚未見(jiàn)報(bào)道。我們的先前研究表明,JQ1對(duì)宮頸癌HeLa細(xì)胞的增殖、侵襲能力具有抑制作用[9]。為了探討JQl是否通過(guò)調(diào)控超級(jí)增強(qiáng)子相關(guān)lncRNA(Super enhancer-associated lncRNAs,SE-lncRNAs)表達(dá)譜發(fā)揮對(duì)宮頸癌HeLa細(xì)胞的抗腫瘤作用,本研究進(jìn)一步通過(guò)全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,獲得了JQl處理
醫(yī)學(xué)理論與實(shí)踐 2023年14期2023-07-27
- 超級(jí)增強(qiáng)子:腫瘤治療的新靶點(diǎn)
730030)增強(qiáng)子是一類(lèi)不依賴于其與靶基因的距離和方向而激活靶基因的一段DNA調(diào)控序列。增強(qiáng)子常與染色質(zhì)形成長(zhǎng)染色質(zhì),在生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程中控制時(shí)間特異性和組織特異性基因的表達(dá),其失調(diào)將導(dǎo)致多種疾病的發(fā)生[1]。人類(lèi)所有細(xì)胞的基因組都是一樣的,但細(xì)胞的形態(tài)和功能卻不同,主要是由增強(qiáng)子決定的。2013年Young等[2]首次提出超級(jí)增強(qiáng)子(super-enhancers,SEs)模型,指出SEs為長(zhǎng)度8～20 kb具有增強(qiáng)轉(zhuǎn)錄活性的超長(zhǎng)順式作用元件,該元件可以高
臨床薈萃 2023年3期2023-05-15
- BMP2基因遠(yuǎn)程調(diào)控元件的功能分析
基因下游的遠(yuǎn)端增強(qiáng)子元件調(diào)控區(qū)域的異常重復(fù)是A2型短指(趾)癥(brachydactyly type A2, BDA2)的致病原因，但是這段調(diào)控區(qū)域的確切分子功能尚不明確，甚至出現(xiàn)有相互矛盾的結(jié)果。本研究在生物信息學(xué)分析的基礎(chǔ)上，通過(guò)PCR技術(shù)擴(kuò)增了該調(diào)控區(qū)域的不同長(zhǎng)度的目的片段，包括高度保守的2.1 kb核心序列和3個(gè)能夠完全覆蓋該2.1 kb片段的不同長(zhǎng)度的截短體片段，進(jìn)而構(gòu)建基因重組載體，采用雙熒光素酶報(bào)告基因檢測(cè)方法對(duì)這些片段的生物學(xué)功能進(jìn)行分析。
遺傳 2022年12期2022-12-22
- 致癌超級(jí)增強(qiáng)子的形成與干預(yù)研究進(jìn)展
文獻(xiàn)報(bào)道,超級(jí)增強(qiáng)子(super enhancer,SE)在癌癥發(fā)生、細(xì)胞分化、免疫應(yīng)答等重要生物學(xué)過(guò)程中發(fā)揮著重要調(diào)控作用[1～3];腫瘤細(xì)胞的許多關(guān)鍵致癌基因由超級(jí)增強(qiáng)子驅(qū)動(dòng),超級(jí)增強(qiáng)子有潛力成為理想的抗癌靶點(diǎn)[1,4]。1 增強(qiáng)子與超級(jí)增強(qiáng)子的概念1981年,Banerji等[5]在猿猴空泡病毒SV40 DNA的5＇端上游發(fā)現(xiàn)了首個(gè)增強(qiáng)子,它能增強(qiáng)哺乳動(dòng)物細(xì)胞中靶基因轉(zhuǎn)錄。隨后,人們陸續(xù)發(fā)現(xiàn)許多增強(qiáng)子,它們都能通過(guò)轉(zhuǎn)錄因子募集共激活因子(例如中介體復(fù)
生命科學(xué)研究 2022年3期2022-09-13
- 對(duì)比mbk-2基因不同增強(qiáng)子對(duì)秀麗隱桿線蟲(chóng)胚胎發(fā)育的影響
種mbk-2的增強(qiáng)子(pptr-1、pptr-2、rsa-1和rsa-2)。由于RNAi可以有效的避免因某些基因功能缺失所引起的發(fā)育初期卵和幼蟲(chóng)的死亡，因此RNAi技術(shù)是研究胚胎發(fā)育初期相關(guān)基因的的有力手段。在本研究中，課題組借助RNAi技術(shù)深入的研究了mbk-2其及增強(qiáng)子在胚胎早期發(fā)育過(guò)程中的作用，以期為相關(guān)研究提供理論依據(jù)。1 材料與方法1.1秀麗隱桿線蟲(chóng)株系:野生型N2、mbk-2突變型線蟲(chóng)株系和OP50(大腸艾希桿菌)自美國(guó)秀麗線蟲(chóng)遺傳中心(Cae
河北醫(yī)學(xué) 2022年8期2022-09-06
- HS5-1增強(qiáng)子eRNA PEARL對(duì)原鈣粘蛋白α基因簇的表達(dá)調(diào)控
遠(yuǎn)，壽佳，吳強(qiáng)增強(qiáng)子eRNA對(duì)原鈣粘蛋白基因簇的表達(dá)調(diào)控徐思遠(yuǎn)，壽佳，吳強(qiáng)上海交通大學(xué)系統(tǒng)生物醫(yī)學(xué)研究院比較生物醫(yī)學(xué)研究中心，系統(tǒng)生物醫(yī)學(xué)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，上海 200240遠(yuǎn)端增強(qiáng)子對(duì)關(guān)鍵靶基因的表達(dá)調(diào)控通常可以決定細(xì)胞的命運(yùn)和功能，激活的增強(qiáng)子可以雙向轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生長(zhǎng)非編碼(long noncoding)增強(qiáng)子RNA (enhancer RNA, eRNA)調(diào)控靶基因表達(dá)，課題組前期研究發(fā)現(xiàn)增強(qiáng)子eRNA能夠通過(guò)形成R環(huán)(R-loop)來(lái)促進(jìn)增強(qiáng)子與靶基因的
遺傳 2022年8期2022-08-25
- 超級(jí)增強(qiáng)子在前列腺癌中的研究進(jìn)展
點(diǎn)，勢(shì)在必行。增強(qiáng)子是一類(lèi)非編碼DNA調(diào)控序列，結(jié)合了RNA聚合酶Ⅱ、轉(zhuǎn)錄因子(transcription factors,TFs)、輔助激活因子、調(diào)節(jié)因子(MED1、OGT等)等，增加啟動(dòng)子活性并促進(jìn)靶基因轉(zhuǎn)錄發(fā)揮正向調(diào)控作用[2]。增強(qiáng)子對(duì)基因的調(diào)控可以發(fā)生在同一基因的不同位置，或是不同染色質(zhì)上的基因。甚至在某些情況下，單個(gè)增強(qiáng)子能對(duì)多個(gè)基因進(jìn)行調(diào)控。超級(jí)增強(qiáng)子(super-enhancer, SE)是高密度結(jié)合了關(guān)鍵調(diào)控因子和中介子(Mediator
中國(guó)腫瘤外科雜志 2022年3期2022-08-11
- 膠質(zhì)母細(xì)胞瘤中差異甲基化增強(qiáng)子區(qū)域調(diào)控的蛋白編碼基因識(shí)別研究
]，也有少量對(duì)增強(qiáng)子甲基化方面的研究[10]。異常甲基化增強(qiáng)子會(huì)導(dǎo)致多種疾病，其中包括多種癌癥的基因表達(dá)異常[11]。研究[12]顯示，與啟動(dòng)子相比，增強(qiáng)子區(qū)域的甲基化狀態(tài)與靶基因表達(dá)的相關(guān)性更強(qiáng)。然而，只有少量研究[13-14]關(guān)注增強(qiáng)子區(qū)域且增強(qiáng)子甲基化模式在GBM中仍不清楚。1 資料與方法1.1 數(shù)據(jù)來(lái)源及預(yù)處理本研究從基因表達(dá)綜合數(shù)據(jù)庫(kù)(gene expression omnibus,GEO)數(shù)據(jù)庫(kù)中下載GBM腫瘤樣本(GSE36278)和正常樣本
首都醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào) 2022年1期2022-06-29
- 增強(qiáng)子對(duì)基因表達(dá)的調(diào)控：從新技術(shù)到新機(jī)制
依然了解甚少.增強(qiáng)子調(diào)控元件是一段特定的非編碼DNA序列，它們通過(guò)與轉(zhuǎn)錄因子(TF)結(jié)合，對(duì)細(xì)胞內(nèi)基因表達(dá)進(jìn)行順式調(diào)控[1].第一個(gè)被確定的增強(qiáng)子是猴空泡病毒SV40基因組中一段長(zhǎng)72 bp的序列，它可以將宮頸癌HeLa細(xì)胞中報(bào)告基因的轉(zhuǎn)錄提高數(shù)百倍[1].增強(qiáng)子通常具有特定的染色質(zhì)特征，例如DNA序列保守性、染色質(zhì)可及性、H3K27ac和H3K4me1等組蛋白修飾、可與啟動(dòng)子形成染色質(zhì)三維環(huán)狀結(jié)構(gòu)等[2].隨著“DNA元件百科全書(shū)”(ENCODE)和“表
- 增強(qiáng)子調(diào)控癌癥發(fā)生發(fā)展的機(jī)制研究
李春燕,3,4增強(qiáng)子調(diào)控癌癥發(fā)生發(fā)展的機(jī)制研究漆思晗1,2，王棨臨1,2，張俊有1,2，劉倩1,2，李春燕1,2,3,41. 北京航空航天大學(xué)，醫(yī)學(xué)科學(xué)與工程學(xué)院，北京 100191 2. 北京航空航天大學(xué)，生物與醫(yī)學(xué)工程學(xué)院，北京 100191 3. 北京航空航天大學(xué)，大數(shù)據(jù)精準(zhǔn)醫(yī)療高精尖創(chuàng)新中心，北京 100191 4. 北京航空航天大學(xué)，工業(yè)和信息化部大數(shù)據(jù)精準(zhǔn)醫(yī)療重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，北京 100191增強(qiáng)子是一段具有轉(zhuǎn)錄調(diào)控功能的DNA序列，主要通過(guò)順式調(diào)
遺傳 2022年4期2022-04-24
- 超級(jí)增強(qiáng)子區(qū)域遺傳變異與乙型肝炎病毒相關(guān)肝細(xì)胞癌術(shù)后總生存期的關(guān)聯(lián)分析
4-5]。超級(jí)增強(qiáng)子（super-enhancers，SEs）是基因組中大量增強(qiáng)子富集的轉(zhuǎn)錄調(diào)控區(qū)域，能夠結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子，促進(jìn)癌基因表達(dá)[6-7]。SEs主要負(fù)責(zé)調(diào)控決定細(xì)胞身份的基因表達(dá)，如決定癌細(xì)胞身份的致癌基因[8-9]。多項(xiàng)研究發(fā)現(xiàn)，SE區(qū)域的SNPs可通過(guò)調(diào)控致癌SEs的活性促進(jìn)或抑制靶基因的表達(dá)，在腫瘤的發(fā)生發(fā)展中起重要作用[10-12]。然而，目前尚無(wú)SEs區(qū)域SNPs與HCC患者預(yù)后的研究報(bào)道。本研究探討SEs區(qū)域SNPs與HCC患者預(yù)后之間
實(shí)用醫(yī)學(xué)雜志 2022年24期2022-02-03
- 超級(jí)增強(qiáng)子調(diào)控基因表達(dá)的生物學(xué)作用及其在哺乳動(dòng)物中的應(yīng)用前景
750021)增強(qiáng)子(enhancer)最早發(fā)現(xiàn)于家兔β-珠蛋白(β-globin)的轉(zhuǎn)錄研究中[1]，之后在小鼠[2]等物種的基因組中得以證實(shí)。隨著研究的進(jìn)一步深入，人們發(fā)現(xiàn)增強(qiáng)子作為一種順式作用的DNA調(diào)控元件，能遠(yuǎn)距離、無(wú)方向性地增加靶基因的轉(zhuǎn)錄輸出，從而影響細(xì)胞的發(fā)育分化[3-7]。隨著后基因組時(shí)代的到來(lái)，人類(lèi)對(duì)于基因組和增強(qiáng)子的認(rèn)識(shí)日益加深，在此基礎(chǔ)上Whyte等[8]于2013年首先提出了超級(jí)增強(qiáng)子的概念。此后,關(guān)于超級(jí)增強(qiáng)子的多項(xiàng)研究均表明了
畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào) 2021年12期2021-12-31
- 超級(jí)增強(qiáng)子驅(qū)動(dòng)致癌轉(zhuǎn)錄機(jī)制的研究進(jìn)展
和遠(yuǎn)端調(diào)控元件增強(qiáng)子的控制。1981年，Benoist等［4］在猿猴空泡病毒早期基因的5'端上游發(fā)現(xiàn)了首個(gè)增強(qiáng)子，由72 bp的重復(fù)序列構(gòu)成，插入該序列的載體能使HeLa細(xì)胞中兔β球蛋白基因的表達(dá)量增加200多倍［5］。與啟動(dòng)子不同，增強(qiáng)子調(diào)控基因轉(zhuǎn)錄的模式不具有方向性，且不受距離限制［6］。增強(qiáng)子區(qū)域通過(guò)與啟動(dòng)子區(qū)域的直接相互作用形成三維環(huán)狀結(jié)構(gòu)［7］，激活遠(yuǎn)處的基因轉(zhuǎn)錄。有研究［8］發(fā)現(xiàn)，單個(gè)增強(qiáng)子甚至能調(diào)控多個(gè)基因的表達(dá)。除普通增強(qiáng)子（typical
- 哥本哈根大學(xué)：運(yùn)動(dòng)能改善DNA
片段叫基因，而增強(qiáng)子是DNA上一小段可與蛋白質(zhì)結(jié)合的區(qū)域，與蛋白質(zhì)結(jié)合后，基因的轉(zhuǎn)錄作用將加強(qiáng)。為驗(yàn)證耐力運(yùn)動(dòng)鍛煉可以重塑骨骼肌中基因增強(qiáng)子的活性，研究團(tuán)隊(duì)招募了平均年齡23歲的健康男性參與者，讓他們進(jìn)行為期6周的耐力運(yùn)動(dòng)訓(xùn)練。實(shí)驗(yàn)期間，研究人員收集參與者訓(xùn)練前后大腿肌肉的活組織切片，并檢查他們的DNA表觀遺傳特征是否在訓(xùn)練后發(fā)生了變化。結(jié)果顯示，完成耐力訓(xùn)練計(jì)劃后，參與者骨骼肌中有許多增強(qiáng)子的結(jié)構(gòu)發(fā)生了改變。研究團(tuán)隊(duì)推測(cè)，運(yùn)動(dòng)對(duì)遠(yuǎn)離肌肉的器官（如大腦）的
晚晴 2021年11期2021-12-01
- 最新資訊
片段叫基因，而增強(qiáng)子是DNA上一小段可與蛋白質(zhì)結(jié)合的區(qū)域，與蛋白質(zhì)結(jié)合后，基因的轉(zhuǎn)錄作用將加強(qiáng)。為驗(yàn)證耐力運(yùn)動(dòng)鍛煉可以重塑骨骼肌中基因增強(qiáng)子的活性，研究團(tuán)隊(duì)招募了平均年齡23歲的健康男性參與者，讓他們進(jìn)行為期6周的耐力運(yùn)動(dòng)訓(xùn)練。實(shí)驗(yàn)期間，研究人員收集參與者訓(xùn)練前后大腿肌肉的活組織切片，并檢查他們的DNA表觀遺傳特征是否在訓(xùn)練后發(fā)生了變化。結(jié)果顯示，完成耐力訓(xùn)練計(jì)劃后，參與者骨骼肌中有許多增強(qiáng)子的結(jié)構(gòu)發(fā)生了改變。研究人員通過(guò)將增強(qiáng)子與遺傳數(shù)據(jù)庫(kù)結(jié)合起來(lái)后觀察
家庭醫(yī)藥 2021年19期2021-10-21
- eRNA AP003059.2與乳腺癌患者預(yù)后的相關(guān)性分析——基于TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)
標(biāo)志物[5]。增強(qiáng)子是基因組中順式調(diào)節(jié)元件的主要類(lèi)型，通過(guò)與靶基因啟動(dòng)子相互作用從而增強(qiáng)靶基因的轉(zhuǎn)錄。近年來(lái)發(fā)現(xiàn)增強(qiáng)子也能轉(zhuǎn)錄lncRNA，稱(chēng)為增強(qiáng)子RNA（enhancer RNA,eRNA）。在人類(lèi)細(xì)胞中已經(jīng)鑒定出數(shù)以萬(wàn)計(jì)的eRNA。eRNA可以介導(dǎo)靶基因的激活，從而在基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控中發(fā)揮重要作用。在癌癥發(fā)生、發(fā)展過(guò)程中，癌基因或致癌信號(hào)通路的激活通常會(huì)伴隨著增強(qiáng)子的激活以及eRNA的產(chǎn)生。已有研究表明eRNA在腫瘤發(fā)生中存在重要作用，暗示它們可作為臨
浙江醫(yī)學(xué) 2021年15期2021-09-19
- 串聯(lián)反向CTCF位點(diǎn)的系列刪除揭示增強(qiáng)子調(diào)控HOXD基因簇表達(dá)的平衡
的系列刪除揭示增強(qiáng)子調(diào)控基因簇表達(dá)的平衡王玲，李金環(huán)，黃海燕，吳強(qiáng)上海交通大學(xué)系統(tǒng)生物醫(yī)學(xué)研究院比較生物醫(yī)學(xué)研究中心，系統(tǒng)生物醫(yī)學(xué)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，上海 200240三維基因組染色質(zhì)架構(gòu)蛋白CTCF (CCCTC-binding factor)能夠介導(dǎo)增強(qiáng)子與基因啟動(dòng)子的遠(yuǎn)距離染色質(zhì)相互作用，也可以結(jié)合調(diào)控區(qū)域的絕緣子發(fā)揮增強(qiáng)子絕緣功能，對(duì)發(fā)育中的基因表達(dá)調(diào)控具有重要作用。同源框基因家族(Homeobox gene family,)編碼一類(lèi)控制動(dòng)物發(fā)育的關(guān)
遺傳 2021年8期2021-08-25
- 衛(wèi)星導(dǎo)航系統(tǒng)功率增強(qiáng)子星座優(yōu)化設(shè)計(jì)與性能分析
覆蓋目標(biāo)的功率增強(qiáng)子星座優(yōu)化設(shè)計(jì)與性能分析方法。表1 GPS信號(hào)功率增強(qiáng)技術(shù)狀態(tài)變化情況1 基于衛(wèi)星數(shù)最少準(zhǔn)則的功率增強(qiáng)子星座優(yōu)化設(shè)計(jì)方法基于衛(wèi)星數(shù)最少準(zhǔn)則的功率增強(qiáng)子星座優(yōu)化設(shè)計(jì)的目標(biāo)是在滿足設(shè)計(jì)指標(biāo)要求的前提下，選取具有最少衛(wèi)星數(shù)量和最優(yōu)服務(wù)性能的功率增強(qiáng)衛(wèi)星組合作為最優(yōu)功率增強(qiáng)子星座[9]。其中，最優(yōu)功率增強(qiáng)子星座包含兩個(gè)層面的含義：1)在滿足設(shè)計(jì)指標(biāo)要求的條件下，功率增強(qiáng)子星座的衛(wèi)星數(shù)量最少；2)在功率增強(qiáng)子星座衛(wèi)星數(shù)最少條件下，功率增強(qiáng)子星座具有
國(guó)防科技大學(xué)學(xué)報(bào) 2021年4期2021-08-23
- ABO等位基因調(diào)控區(qū)突變致抗原弱表達(dá)原因分析
擴(kuò)增ABO基因增強(qiáng)子、啟動(dòng)子、第1～7號(hào)外顯子及其相鄰的內(nèi)含子區(qū)域序列。參照美國(guó)國(guó)立生物信息中心（the National Center for Biotechnology Information，NCBI）GenBank（https：//www. ncbi. nlm. nih.gov / gene /? term=ABO）中ABO基因序列設(shè)計(jì)引物，見(jiàn)表1。擴(kuò)增體系為T(mén)aq DNA聚合酶（5 U/μL）12.5 μL、引物（10 mmol/μL）各1 μL
檢驗(yàn)醫(yī)學(xué) 2021年6期2021-06-26
- 斑馬魚(yú)和鯉miR-1-2/133a-1基因間序列活性和調(diào)控研究
330 bp的增強(qiáng)子片段, 受肌肉發(fā)育重要調(diào)控轉(zhuǎn)錄因子MEF2直接調(diào)控。而該區(qū)域約330 bp增強(qiáng)子結(jié)合位點(diǎn)包含一段保守的E-box(CANNTG), 可能是MyoD家族的結(jié)合位點(diǎn)。同時(shí), 通過(guò)比較人、大鼠、狗和雞等物種, 表明這一序列對(duì)于心臟和骨骼肌的表達(dá)是必要的, 且在脊椎動(dòng)物中具有高度保守性。據(jù)此, 我們推測(cè)在斑馬魚(yú)和鯉中miR-1-2和133a-1基因間序列存在類(lèi)似增強(qiáng)子的調(diào)控序列[12]。綜上, 本研究擬在前期工作基礎(chǔ)上, 分析斑馬魚(yú)和鯉miR-
水生生物學(xué)報(bào) 2021年3期2021-06-02
- 乳腺癌增強(qiáng)子-miRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)識(shí)別與分析
100071)增強(qiáng)子(enhancer)是真核生物基因組中的一類(lèi)順式作用元件，它通過(guò)組織特異性的方式招募轉(zhuǎn)錄因子(transcription factor，TF)及其輔因子來(lái)正向調(diào)控基因表達(dá)。增強(qiáng)子作為一種非編碼序列，在組織中高度保守，增強(qiáng)子失活會(huì)導(dǎo)致包括腫瘤在內(nèi)的多種疾病的發(fā)生[1]。微RNA(microRNA，mi-RNA)是一種長(zhǎng)約22個(gè)核苷酸的非編碼RNA，在大約60%的人類(lèi)基因表達(dá)中起關(guān)鍵作用，有些miRNA可能通過(guò)調(diào)控癌基因表達(dá)而成為致癌miR
生命科學(xué)研究 2021年1期2021-03-19
- 基于特異性增強(qiáng)子的低級(jí)別膠質(zhì)瘤分型研究
過(guò)程息息相關(guān)，增強(qiáng)子對(duì)IRGs的表達(dá)有重要的調(diào)控作用。增強(qiáng)子是DNA序列上重要的遠(yuǎn)端調(diào)控元件，其轉(zhuǎn)錄本稱(chēng)為增強(qiáng)子RNA(enhancr RNA，eRNA)，eRNA含量可代表增強(qiáng)子的功能活性。增強(qiáng)子在各類(lèi)腫瘤/正常組織中廣泛表達(dá)，而不同組織、癌癥間，其表達(dá)有明顯的特異性[7]。因此，研究特異性增強(qiáng)子調(diào)控的靶基因，有助于LGG患者精細(xì)、合理地分型；分析各型患者間的特征差異，對(duì)促進(jìn)精準(zhǔn)醫(yī)療實(shí)施、改善患者預(yù)后及相關(guān)機(jī)制研究具有重要意義。1 資料與方法1.1 數(shù)據(jù)
中國(guó)醫(yī)院統(tǒng)計(jì) 2021年6期2021-02-17
- 乳腺癌中p53調(diào)控增強(qiáng)子的特征與功能分析
100071)增強(qiáng)子是一類(lèi)具有組織特異性的順式調(diào)控元件,通過(guò)富集多種轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控基因的表達(dá),并且不受距離和方向的限制。先前研究表明,大多數(shù)活性增強(qiáng)子在轉(zhuǎn)錄因子介導(dǎo)下可轉(zhuǎn)錄出RNA,即增強(qiáng)子RNA(enhancer RNA,eRNA)[1]。已有研究證實(shí)eRNA的表達(dá)量和增強(qiáng)子的活性相關(guān),增強(qiáng)子的表達(dá)失調(diào)會(huì)導(dǎo)致包括乳腺癌在內(nèi)的多種癌癥的發(fā)生[2]。p53(tumor protein 53)作為一種腫瘤抑制轉(zhuǎn)錄因子參與調(diào)控絕大多數(shù)腫瘤的發(fā)生發(fā)展[3]。研究表明
生命科學(xué)研究 2020年6期2021-01-09
- 細(xì)胞凋亡反應(yīng)中NOXA基因啟動(dòng)子發(fā)揮增強(qiáng)子功能調(diào)節(jié)BCL2基因表達(dá)
基因啟動(dòng)子發(fā)揮增強(qiáng)子功能調(diào)節(jié)基因表達(dá)秦中勇1,2，石曉1,2，曹平平1,2，褚鷹1,2，管蔚4，楊楠1,3，程禾1,2，孫玉潔1,21. 南京醫(yī)科大學(xué)，江蘇省人類(lèi)功能基因組學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，南京 211166 2. 南京醫(yī)科大學(xué)細(xì)胞生物學(xué)系，南京 211166 3. 南京醫(yī)科大學(xué)生物化學(xué)與分子生物學(xué)系，南京 211166 4. 南京醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院，南京 210029真核生物基因的轉(zhuǎn)錄受到近端啟動(dòng)子和遠(yuǎn)端增強(qiáng)子的共同調(diào)控，部分基因的啟動(dòng)子可兼具有增強(qiáng)子的活
遺傳 2020年11期2020-12-09
- 增強(qiáng)子的鑒定及其在腫瘤研究中的應(yīng)用
春燕,2綜 述增強(qiáng)子的鑒定及其在腫瘤研究中的應(yīng)用劉倩1，李春燕1,21. 北京航空航天大學(xué)，大數(shù)據(jù)精準(zhǔn)醫(yī)療高精尖創(chuàng)新中心和醫(yī)學(xué)科學(xué)與工程學(xué)院，北京 100191 2. 工業(yè)和信息化部大數(shù)據(jù)精準(zhǔn)醫(yī)療重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室(北京航空航天大學(xué))，北京 100191增強(qiáng)子是一類(lèi)增強(qiáng)靶基因轉(zhuǎn)錄活性的DNA順式作用元件。但是增強(qiáng)子與靶基因的方向和距離不確定，大大增加了研究增強(qiáng)子調(diào)控的靶基因及其作用機(jī)制的困難。已有大量研究顯示，增強(qiáng)子的突變或功能異常與疾病發(fā)生發(fā)展相關(guān)；僅有少量研究
遺傳 2020年9期2020-09-24
- 前列腺癌相關(guān)超級(jí)增強(qiáng)子RNA鑒定及調(diào)控功能分析
控元件分類(lèi)，有增強(qiáng)子lncRNA、啟動(dòng)子相關(guān)ncRNA、3′-UTR相關(guān)RNA 等[5]。本文通過(guò)定制基因芯片和可獲取的公共數(shù)據(jù)庫(kù)，在芯片中鑒定出14213個(gè)超級(jí)增強(qiáng)子相關(guān)lncRNA（super enhancer-associated lncRNA，SE-lncRNA）；進(jìn)一步篩選得到292個(gè)在前列腺癌中差異表達(dá)的SE-lncRNA。熒光定量PCR驗(yàn)證部分潛在調(diào)控SE-lncRNA及編碼基因，結(jié)果與芯片完全吻合。結(jié)合生物信息學(xué)手段，通過(guò)對(duì)超級(jí)增強(qiáng)子及其靶
生物化工 2020年4期2020-08-27
- 生物信息學(xué)方法預(yù)測(cè)增強(qiáng)子及其作用位點(diǎn)綜述
具有重要意義。增強(qiáng)子是對(duì)基因表達(dá)調(diào)控具有重要作用的非編碼序列元件之一。一些增強(qiáng)子能夠通過(guò)轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生具有調(diào)控功能的RNA，也被稱(chēng)為增強(qiáng)子RNA（enhancer RNA，eRNA）。因此對(duì)于增強(qiáng)子的序列特征、作用位點(diǎn)以及在特定時(shí)間和特定組織中表達(dá)模式的研究成為了基因表達(dá)調(diào)控領(lǐng)域的一個(gè)重要問(wèn)題。關(guān)鍵詞： 增強(qiáng)子; eRNA; 基因表達(dá)調(diào)控【Abstract】 Specific function of cells is very important for mul
智能計(jì)算機(jī)與應(yīng)用 2020年3期2020-07-04
- 溴結(jié)構(gòu)域蛋白4在轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)與腫瘤形成中的作用及其抑制劑的研究進(jìn)展
件（如啟動(dòng)子、增強(qiáng)子等），在轉(zhuǎn)錄的起始和延伸階段促進(jìn)基因轉(zhuǎn)錄[17]。BRD4最初被發(fā)現(xiàn)時(shí)被認(rèn)為是一種控制細(xì)胞周期的蛋白。在有絲分裂過(guò)程中，它能與染色體結(jié)合并標(biāo)記在G1期準(zhǔn)備轉(zhuǎn)錄的基因，保證正常的細(xì)胞周期[18]。它還在胚胎的發(fā)育期通過(guò)直接或與轉(zhuǎn)錄因子協(xié)同的方式調(diào)控胚胎干細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄過(guò)程以及實(shí)現(xiàn)多能干細(xì)胞的自我更新[19]。BRD4同時(shí)還在脂肪細(xì)胞和肌肉細(xì)胞的形成中起重要作用[20]。使用BRD4抑制劑干擾BRD4的活性，還會(huì)影響成骨細(xì)胞礦化成骨[21]?？?/div>
中國(guó)普通外科雜志 2020年7期2020-01-10
- 組織特異性增強(qiáng)子調(diào)控SOX9 基因表達(dá)的研究進(jìn)展
X9 基因相關(guān)增強(qiáng)子進(jìn)行系統(tǒng)性論述， 聚焦不同增強(qiáng)子調(diào)控SOX9時(shí)空表達(dá)模式及機(jī)制的研究進(jìn)展。1 SOX9 基因三維結(jié)構(gòu)、染色體結(jié)構(gòu)異常及相關(guān)疾病SOX9 基因位于人基因組17q24.3 上，其非編碼序列的染色體結(jié)構(gòu)異常，如微缺失、轉(zhuǎn)位等已被證明與多種疾病相關(guān)。 根據(jù)對(duì)應(yīng)的不同表型， 可將SOX9 上游的基因非編碼區(qū)劃分為不同的區(qū)間：彎肢發(fā)育異常相關(guān)區(qū)域（50～375 kb），無(wú)彎肢軟骨發(fā)育異常相關(guān)區(qū)域 （789～932 kb）， 性別反轉(zhuǎn)相關(guān)區(qū)域（516口腔頜面外科雜志 2020年6期2020-01-04
- 紅蘋(píng)果著色分子機(jī)制獲揭示
e反轉(zhuǎn)座子充當(dāng)增強(qiáng)子控制著蘋(píng)果著色。這個(gè)增強(qiáng)子被命名為redTE?！安灰字钠贩N是由于缺少這一增強(qiáng)子，不能有效合成花青素?！睆埨x說(shuō)。研究團(tuán)隊(duì)進(jìn)一步推斷，一系列紅色芽變品種是這個(gè)轉(zhuǎn)座子與其調(diào)控的基因，同周?chē)h(huán)境綜合作用引起的表觀遺傳結(jié)果，這無(wú)疑增進(jìn)和豐富了科學(xué)家對(duì)蘋(píng)果著色的理解和認(rèn)識(shí)。更加重要的是，基于這一反轉(zhuǎn)座子開(kāi)發(fā)的分子標(biāo)記，能精準(zhǔn)地進(jìn)行果色預(yù)先選擇。（據(jù)《中國(guó)科學(xué)報(bào)》）發(fā)明與創(chuàng)新·大科技 2019年5期2019-07-31
- 紅蘋(píng)果著色分子機(jī)制獲揭示
e反轉(zhuǎn)座子充當(dāng)增強(qiáng)子控制著蘋(píng)果著色。這個(gè)增強(qiáng)子被命名為redTE?！安灰字钠贩N是由于缺少這一增強(qiáng)子，不能有效合成花青素?！睆埨x說(shuō)。研究團(tuán)隊(duì)進(jìn)一步推斷，一系列紅色芽變品種是這個(gè)轉(zhuǎn)座子與其調(diào)控的基因，同周?chē)h(huán)境綜合作用引起的表觀遺傳結(jié)果，這無(wú)疑增進(jìn)和豐富了科學(xué)家對(duì)蘋(píng)果著色的理解和認(rèn)識(shí)。更加重要的是，基于這一反轉(zhuǎn)座子開(kāi)發(fā)的分子標(biāo)記，能精準(zhǔn)地進(jìn)行果色預(yù)先選擇。（據(jù)《中國(guó)科學(xué)報(bào)》）※發(fā)明與創(chuàng)新 2019年17期2019-07-16
- 結(jié)腸癌中核內(nèi)miRNA的激活調(diào)控作用研究
核內(nèi)也存在通過(guò)增強(qiáng)子介導(dǎo)而激活基因表達(dá)的調(diào)控機(jī)制[2]。那么利用miRNA細(xì)胞核內(nèi)調(diào)控機(jī)制，我們利用生物信息的多種分析方法對(duì)結(jié)腸癌的miRNA和基因進(jìn)行補(bǔ)充性分析，從而為結(jié)腸癌發(fā)病的研究提供新的視角。通過(guò)整合多個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)的miRNA、基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)，結(jié)腸特異的增強(qiáng)子數(shù)據(jù)，通知利用miRNA增強(qiáng)子預(yù)測(cè)算法對(duì)上述數(shù)據(jù)進(jìn)行系統(tǒng)的整合分析，并肩miRNA-增強(qiáng)子-靶基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，并對(duì)網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行拓?fù)鋵W(xué)分析，最后通過(guò)分析網(wǎng)絡(luò)中差異表達(dá)基因的功能，發(fā)現(xiàn)了多個(gè)與結(jié)腸癌發(fā)生密切生物信息學(xué) 2019年2期2019-07-05
- 肝癌中增強(qiáng)子調(diào)控miRNA前饋環(huán)路的識(shí)別與功能分析
ive）調(diào)控。增強(qiáng)子（Enhancer）一般是幾百堿基對(duì)長(zhǎng)度的DNA片段，并能被多個(gè)轉(zhuǎn)錄因子占據(jù)，在基因調(diào)控中通過(guò)順式調(diào)控原件對(duì)靶基因起正調(diào)控作用。已有研究表明肝細(xì)胞癌中的增強(qiáng)子突變會(huì)導(dǎo)致增強(qiáng)子失活，進(jìn)而影響靶基因的表達(dá)［4］。MicroRNA（miRNA）是一類(lèi)長(zhǎng)度為18-24 nt的非編碼小RNA，在進(jìn)化過(guò)程中高度保守，它通過(guò)與靶基因的3'UTR區(qū)特異性結(jié)合從而在轉(zhuǎn)錄后水平抑制靶基因的表達(dá)或直接降解靶mRNA，異常表達(dá)的miRNA在肝癌的發(fā)病機(jī)制中起重生物技術(shù)通報(bào) 2019年5期2019-06-04
- 肺腺癌增強(qiáng)子調(diào)控miRNA前饋環(huán)路的識(shí)別與功能分析
合作用的結(jié)果。增強(qiáng)子是真核細(xì)胞中普遍存在的順式調(diào)控元件，可以通過(guò)招募轉(zhuǎn)錄因子（transcription fac?tor，TF），進(jìn)而結(jié)合多種激活因子，形成多蛋白復(fù)合物，使染色質(zhì)成環(huán)，遠(yuǎn)端調(diào)控啟動(dòng)子。通過(guò)對(duì)增強(qiáng)子染色質(zhì)的修飾和重塑等作用，促進(jìn)基因的轉(zhuǎn)錄[4]。此外，較多證據(jù)表明，增強(qiáng)子與microRNA（miRNA）間同樣存在復(fù)雜的調(diào)控關(guān)系。Xiao 等[5]通過(guò)刪除HEK293T細(xì)胞系中的miR-24-1 增強(qiáng)子基因座，發(fā)現(xiàn)miR-24-1的表達(dá)量下降，生物技術(shù)通訊 2019年6期2019-02-28
- 超級(jí)增強(qiáng)子在腫瘤研究中的進(jìn)展
，米澤云?超級(jí)增強(qiáng)子在腫瘤研究中的進(jìn)展吳志強(qiáng)1,2，米澤云31. 天津醫(yī)科大學(xué)腫瘤醫(yī)院，放射治療科，天津 300060 2. 國(guó)家腫瘤臨床醫(yī)學(xué)研究中心，天津市“腫瘤防治”重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，天津市惡性腫瘤臨床醫(yī)學(xué)研究中心，天津 300060 3. 天津醫(yī)科大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院，生物化學(xué)與分子生物學(xué)系，天津 300070超級(jí)增強(qiáng)子是由多個(gè)相鄰近的普通增強(qiáng)子組成的、驅(qū)動(dòng)調(diào)控細(xì)胞身份基因表達(dá)的一個(gè)大簇，該區(qū)域富集高密度的轉(zhuǎn)錄因子、輔因子及增強(qiáng)子相關(guān)表觀修飾。超級(jí)增強(qiáng)子所驅(qū)動(dòng)的遺傳 2019年1期2019-01-30
- 辨析分子生物學(xué)中的多個(gè)“子”
方式。1.6 增強(qiáng)子(Enhancer) 增強(qiáng)子是指位于功能基因附近，能夠增強(qiáng)該基因轉(zhuǎn)錄活性的一段DNA順序。增強(qiáng)子提高轉(zhuǎn)錄效率的特點(diǎn)如下： ①增強(qiáng)子只有啟動(dòng)子存在時(shí)才能發(fā)揮作用；②無(wú)方向性,無(wú)論位于啟動(dòng)子的上游或下游，增強(qiáng)子均能激活其相應(yīng)的啟動(dòng)子；③增強(qiáng)子的作用與其序列的正反方向無(wú)關(guān)，將增強(qiáng)子方向倒置依然能起作用；④增強(qiáng)子一般具有組織或細(xì)胞特異性，增強(qiáng)子必須與特定的蛋白質(zhì)結(jié)合后才能發(fā)揮增強(qiáng)轉(zhuǎn)錄的作用。1.7 沉默子(Silencer) 沉默子是指位于功能生物學(xué)教學(xué) 2019年12期2019-01-11
- 組蛋白H3K4甲基轉(zhuǎn)移酶KMT2D研究進(jìn)展
胞修飾啟動(dòng)子和增強(qiáng)子的1種方法。組蛋白H3K4的三甲基化（H3K4me3）主要聚集在轉(zhuǎn)錄活躍的啟動(dòng)子區(qū)域，而一/二甲基化（H3K4me1，H3K4me2）則主要集中在增強(qiáng)子區(qū)域[1]。酵母菌中，Set1復(fù)合物中的催化亞基SET1，具有組蛋白H3K4的甲基轉(zhuǎn)移酶活性，參與組蛋白H3K4的 me1，me2，me3 的修飾[2-3]。在果蠅中，dSet1、Trx和Trr是已知的3種Set1樣組蛋白H3K4甲基轉(zhuǎn)移酶。哺乳動(dòng)物體內(nèi)存在6種Set1樣H3K4甲基轉(zhuǎn)移天津醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào) 2018年6期2018-12-26
- 去甲基化酶JMJD6調(diào)控雌激素受體依賴的增強(qiáng)子和編碼基因轉(zhuǎn)錄激活的分子機(jī)制
過(guò)和基因組中的增強(qiáng)子結(jié)合并激活相應(yīng)區(qū)域產(chǎn)生一種新型非編碼RNA(增強(qiáng)子RNA)[2].增強(qiáng)子的激活對(duì)于鄰近雌激素靶基因的轉(zhuǎn)錄激活至關(guān)重要,然而可供靶向的“分子開(kāi)關(guān)”鮮有報(bào)道,制約了相關(guān)研究的開(kāi)展.廈門(mén)大學(xué)藥學(xué)院劉文教授課題組在早期研究中,揭示了去甲基化酶JMJD6和其相互作用的溴結(jié)構(gòu)域蛋白BRD4通過(guò)與特定增強(qiáng)子結(jié)合,遠(yuǎn)程調(diào)控轉(zhuǎn)錄蛋白復(fù)合體的活性,進(jìn)而調(diào)控鄰近編碼基因轉(zhuǎn)錄延伸的轉(zhuǎn)錄調(diào)控新模式[3];隨后還發(fā)現(xiàn)JMJD6蛋白的另一個(gè)功能,即其直接和RNA發(fā)生- Tol2轉(zhuǎn)座子介導(dǎo)斑馬魚(yú)rps26基因附近增強(qiáng)子捕獲及注解分析
225009增強(qiáng)子是能強(qiáng)化轉(zhuǎn)錄起始的一段DNA序列，最早是由Benerji在SV40DNA中發(fā)現(xiàn)[1]，隨后在病毒及真核生物基因組中均發(fā)現(xiàn)了增強(qiáng)子元件的存在。已有研究表明增強(qiáng)子在基因表達(dá)調(diào)控中通過(guò)介導(dǎo)轉(zhuǎn)錄因子與靶基因的結(jié)合，參與基因的表達(dá)調(diào)控，發(fā)揮重要作用。與啟動(dòng)子不同的是，增強(qiáng)子對(duì)基因的調(diào)控不具有方向性，且不受兩者距離的影響，無(wú)論位于基因的上游或下游，甚至基因的內(nèi)含子中，均可調(diào)控靶基因的表達(dá)[2-3]。因此，增強(qiáng)子的獲得對(duì)于研究基因表達(dá)調(diào)控模式具有重要生物工程學(xué)報(bào) 2018年3期2018-04-12
- ·Nature系列期刊導(dǎo)讀·
g loss.增強(qiáng)子的冗余保證了哺乳動(dòng)物發(fā)育表型的穩(wěn)健性哺乳動(dòng)物基因組中存在大量可遠(yuǎn)距離作用的增強(qiáng)子，但其功能調(diào)節(jié)的復(fù)雜性尚不清楚。本研究通過(guò)基因組編輯手段對(duì)小鼠7個(gè)影響肢體發(fā)育的增強(qiáng)子位點(diǎn)進(jìn)行刪除，發(fā)現(xiàn)單個(gè)刪除并不會(huì)造成肢體形態(tài)異常，但成對(duì)刪除同一基因的增強(qiáng)子會(huì)出現(xiàn)明顯表型，并且冗余的增強(qiáng)子可通過(guò)加成作用影響基因表達(dá)水平。此外，小鼠肢體、大腦和心臟中均發(fā)現(xiàn)同一基因附近存在多個(gè)增強(qiáng)子的現(xiàn)象。結(jié)果表明，增強(qiáng)子的冗余是哺乳動(dòng)物基因組的一個(gè)非常普遍的特征，其可提生物技術(shù)進(jìn)展 2018年2期2018-03-30
- 靶向ezrin增強(qiáng)子關(guān)鍵區(qū)的CRISPR/Cas9載體的構(gòu)建
靶向ezrin增強(qiáng)子關(guān)鍵區(qū)的CRISPR/Cas9載體的構(gòu)建郭曉龍， 張青峰， 野慶松， 莫鎮(zhèn)濤， 李文娜， 高書(shū)穎(遵義醫(yī)學(xué)院珠海校區(qū) 生物工程系， 珠海 519041)構(gòu)建靶向人ezrin增強(qiáng)子關(guān)鍵區(qū)的CRISPR/Cas9載體并檢測(cè)其基因敲除功能。設(shè)計(jì)2個(gè)gRNA，分別靶向人ezrin增強(qiáng)子關(guān)鍵區(qū)的上、下游。合成gRNA寡核苷酸序列，連接至質(zhì)粒pX459構(gòu)建重組質(zhì)粒pX459-sgRNA-EL和pX459-sgRNA-ER。將鑒定正確的CRISPR/生物學(xué)雜志 2017年6期2017-12-19
- 肝癌細(xì)胞HepG2中增強(qiáng)子的識(shí)別及生物信息學(xué)分析
胞HepG2中增強(qiáng)子的識(shí)別及生物信息學(xué)分析丁若凡1，李宇鵬1，張一鳴1，朱小冬1，胡海碧1，劉文榮1，李玲2，郭志云21.西南交通大學(xué) 生命科學(xué)與工程學(xué)院，四川 成都 610031；2.成都市第三人民醫(yī)院 病理科，四川 成都 610031目的：整合增強(qiáng)子特征識(shí)別肝癌細(xì)胞HepG2增強(qiáng)子，并對(duì)其保守性、GC含量、轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控、靶基因功能等進(jìn)行分析，以期解析肝癌細(xì)胞增強(qiáng)子參與的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。方法：通過(guò)整合H3K27ac、H3K4me1和H3K4me3組蛋白修飾及D生物技術(shù)通訊 2017年4期2017-11-06
- 斜紋夜蛾核型多角體病毒Ⅱ型分離株同源重復(fù)區(qū)hr5的結(jié)構(gòu)功能分析
復(fù)制起始原點(diǎn)和增強(qiáng)子的雙功能作用。關(guān)鍵詞：斜紋夜蛾；核型多角體病毒；同源重復(fù)區(qū)；增強(qiáng)子中圖分類(lèi)號(hào)：S433.4：Q78 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)號(hào)：A 文章編號(hào)：1001-4942（2017）08-0099-05Abstract The structure-function of homlogous region 5 （hr5） from Spodoptera litura Nucleopolyhedrovirus Ⅱ（SpltNPVⅡ）was studied in th山東農(nóng)業(yè)科學(xué) 2017年8期2017-09-09
- 骨關(guān)節(jié)炎患者軟骨細(xì)胞Fas基因增強(qiáng)子區(qū)甲基化水平與Fas蛋白表達(dá)的相關(guān)性
細(xì)胞Fas基因增強(qiáng)子區(qū)甲基化水平與Fas蛋白表達(dá)的相關(guān)性陳 夏 彭 丹 陶 懷1，2沈 奕 周 政(中南大學(xué)湘雅二醫(yī)院骨科，湖南 長(zhǎng)沙 410011)目的 通過(guò)觀察骨關(guān)節(jié)炎(OA)軟骨細(xì)胞中Fas基因甲基化水平與Fas蛋白表達(dá)的相關(guān)性，探討Fas基因增強(qiáng)子區(qū)異常甲基化在OA發(fā)生和發(fā)展中的作用。方法 采用亞硫酸氫鈉方法處理基因組DNA，甲基化特異性PCR技術(shù)和免疫組織化學(xué)法分別檢測(cè)14例健康人和35例OA患者軟骨細(xì)胞中Fas基因增強(qiáng)子區(qū)甲基化水平和相關(guān)蛋白表中國(guó)老年學(xué)雜志 2017年13期2017-07-18
- 斜紋夜蛾核型多角體病毒Ⅱ基因組DNA同源重復(fù)區(qū)生物信息學(xué)分析
；同源重復(fù)區(qū)；增強(qiáng)子中圖分類(lèi)號(hào) S482.3+9 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼 A 文章編號(hào) 1007-5739（2017）11-0111-01斜紋夜蛾核型多角體病毒Ⅱ型（Spodotera litura nucleo-polyhedrovirus，SpltNPVⅡ）分離株是一種繁殖率和毒力極強(qiáng)的病毒變異株，作為生物殺蟲(chóng)劑具有很高的研究?jī)r(jià)值和良好的應(yīng)用前景[1]。同源重復(fù)區(qū)是一種存在于大多數(shù)桿狀病毒基因組的重復(fù)序列區(qū)[2-3]，大量研究表明，同源重復(fù)區(qū)具有桿狀病毒基因組DN現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技 2017年11期2017-07-14
- SB轉(zhuǎn)座子介導(dǎo)的斑馬魚(yú)增強(qiáng)子捕獲注解分析
子介導(dǎo)的斑馬魚(yú)增強(qiáng)子捕獲注解分析劉帥軍 沈丹 鐘繼漢 陳偉 王偉 張麗 陳才 楊昆侖 高波 宋成義（揚(yáng)州大學(xué)動(dòng)物科學(xué)與技術(shù)學(xué)院 揚(yáng)州大學(xué)農(nóng)業(yè)與農(nóng)產(chǎn)品安全國(guó)際合作聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室，揚(yáng)州 225009）為了建立斑馬魚(yú)增強(qiáng)子捕獲突變體庫(kù)及研究功能基因的表達(dá)調(diào)控模式，制備了SB轉(zhuǎn)座子介導(dǎo)的增強(qiáng)子捕獲轉(zhuǎn)基因斑馬魚(yú)（F0），通過(guò)繁育建立了組織或器官特異表達(dá)報(bào)告基因綠色熒光蛋白（Green fluorescent protein，GFP）的品系（F1）。選擇F1代的SK-3系生物技術(shù)通報(bào) 2017年5期2017-05-19
- miRNA：除了抑制，它還有激活功能
RNA通過(guò)結(jié)合增強(qiáng)子起到激活基因表達(dá)的作用，命名為NamiRNA(nuclear activating miRNA)。那么miRNA的細(xì)胞定位是否會(huì)影響miRNA的功能呢？定位于細(xì)胞核內(nèi)的miRNA到底與胞漿中的miRNA有何不同呢？miRNA；NamiRNA；定位；增強(qiáng)子；功能1 miRNA：從抗皮膚衰老開(kāi)始說(shuō)起每個(gè)女孩內(nèi)心深處都渴望青春永駐，擁有嬰兒般吹彈可破的細(xì)膩肌膚，無(wú)奈歲月的刻刀，毫不留情地在臉上留下深深淺淺的印痕，皺紋一來(lái)便是排山倒海，不可思量自然雜志 2017年1期2017-04-11
- 復(fù)旦大學(xué)發(fā)現(xiàn)基因活性調(diào)控新機(jī)制，為癌癥治療提供新思路
胞的染色質(zhì)中的增強(qiáng)子失控會(huì)過(guò)度強(qiáng)化附近癌基因的活性，導(dǎo)致細(xì)胞異常甚至癌變；而出現(xiàn)在該區(qū)域的蛋白質(zhì)RACK7和去甲基化酶KDM5C可以限制此類(lèi)增強(qiáng)子的活性，使基因表達(dá)保持在正常范圍，從而抑制癌變。這項(xiàng)研究成果對(duì)以下臨床現(xiàn)象提供了解釋?zhuān)汉芏喟┌Y病例中存在RACK7和KDM5C突變現(xiàn)象，無(wú)法對(duì)增強(qiáng)子活性進(jìn)行限制，使得本應(yīng)保持低活性的基因異常活化。這一解釋不僅為癌癥的發(fā)生提供了新的理論，更為癌癥的個(gè)性化治療提供了新的藥物靶點(diǎn)和治療思路。相關(guān)研究成果發(fā)表于《細(xì)胞》雜生物學(xué)教學(xué) 2016年9期2016-04-10
- 科學(xué)家深挖表觀遺傳組鑒別出引發(fā)髓母細(xì)胞瘤的關(guān)鍵原因
其可以結(jié)合名為增強(qiáng)子及超級(jí)增強(qiáng)子的DNA序列，這種主要的調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄因子和超級(jí)增強(qiáng)子可以聯(lián)合作用來(lái)調(diào)節(jié)關(guān)鍵基因的表達(dá)，比如負(fù)責(zé)細(xì)胞身份的基因等。研究者使用的工具對(duì)28種髓母細(xì)胞瘤腫瘤中超過(guò)3 000種超級(jí)增強(qiáng)子進(jìn)行了鑒別，同時(shí)他們還根據(jù)不同腫瘤亞型鑒別出了超級(jí)增強(qiáng)子的活性，這些超級(jí)增強(qiáng)子可以開(kāi)啟一些癌癥基因，包括ALK、MYC、SMO和OTX2基因等，這些基因都和髓母細(xì)胞瘤直接相關(guān)。研究者發(fā)現(xiàn)，Lmx1A或許是4型髓母細(xì)胞瘤亞型的主要轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)子，Lmx1A被認(rèn)中華肺部疾病雜志(電子版) 2016年1期2016-01-24
- 采用DNA片段編輯技術(shù)反轉(zhuǎn)CTCF結(jié)合位點(diǎn)改變基因組拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)和增強(qiáng)子與啟動(dòng)子功能
因組拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)和增強(qiáng)子與啟動(dòng)子功能郭亞，吳強(qiáng) 上海交通大學(xué)系統(tǒng)生物醫(yī)學(xué)研究院比較生物醫(yī)學(xué)研究中心，系統(tǒng)生物醫(yī)學(xué)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，上海 200240郭亞(博士研究生)人類(lèi)的祖先很早就觀察到生物性狀的遺傳現(xiàn)象，但是直到19世紀(jì)60年代孟德?tīng)柊l(fā)現(xiàn)遺傳因子的分離定律和自由組合定律，遺傳學(xué)才真正建立并快速發(fā)展起來(lái)。盡管人類(lèi)很快有了基因的概念，并認(rèn)識(shí)了核酸和蛋白質(zhì)，但直到1953年沃森和克里克闡明了DNA的雙螺旋結(jié)構(gòu)之后，人類(lèi)對(duì)基因才有了本質(zhì)的認(rèn)識(shí)，從而開(kāi)啟了分子遺傳學(xué)遺傳 2015年10期2015-01-03
- 啟動(dòng)子結(jié)構(gòu)和功能研究進(jìn)展
與CAAT框和增強(qiáng)子序列兩個(gè)特定的位點(diǎn)相結(jié)合，從而控制轉(zhuǎn)錄起始的頻率。研究發(fā)現(xiàn)，CAAT框距轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)Inr較遠(yuǎn)時(shí)，仍然能發(fā)揮調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄起始頻率的功效，且正反兩種取向均可發(fā)揮作用，CAAT框?qū)A基突變十分敏感，一旦缺失或突變將導(dǎo)致轉(zhuǎn)錄效率的急劇降低，但是突變對(duì)啟動(dòng)子的特異性沒(méi)有影響［9］。1.4 BRE元件BRE元件（TFⅡB recognition element，BRE）最初作為調(diào)節(jié)因子TFⅡB的結(jié)合序列被發(fā)現(xiàn)，BRE約占TATA框的10%-30%，并定生物技術(shù)通報(bào) 2014年8期2014-04-09
- 基因組轉(zhuǎn)錄調(diào)控元件分析方法研究進(jìn)展
要包括啟動(dòng)子、增強(qiáng)子、絕緣子等。據(jù)估算，哺乳動(dòng)物基因組中約有5%的DNA序列含有編碼信息，但僅有1.5%的序列能夠編碼蛋白質(zhì)［1］。最近的研究表明，許多疾病的發(fā)生與轉(zhuǎn)錄調(diào)控元件的突變相關(guān)，因此，這些非編碼轉(zhuǎn)錄調(diào)控元件的篩選及功能探索對(duì)基因表達(dá)調(diào)控機(jī)制和生物學(xué)功能研究具有重要意義［2］。如何對(duì)基因組中的TRE進(jìn)行準(zhǔn)確預(yù)測(cè)，將是研究人員面臨的一個(gè)重大挑戰(zhàn)。與固定于基因5'端的啟動(dòng)子不同，一些調(diào)控元件在基因組中位置不固定，如增強(qiáng)子，可以通過(guò)遠(yuǎn)程相互作用與遠(yuǎn)端啟動(dòng)生物技術(shù)通報(bào) 2014年10期2014-03-21
- 人乙酰肝素酶基因增強(qiáng)子的初步篩選與鑒定
步篩選、鑒定其增強(qiáng)子序列奠定基礎(chǔ)。1 材料與方法1.1 主要試劑、細(xì)胞和儀器DL2000 DNA Marker、DL5000 DNA Marker、DL15000 DNA Marker、PFX、dNTP、PCR Buffers(Takara 公司);PCR純化試劑盒、DNA膠回收試劑盒(北京道普公司);無(wú)內(nèi)毒素質(zhì)粒大提試劑盒(北京天能生物技術(shù)有限公司);T4 DNA ligase、限制性內(nèi)切酶KpnⅠ、SalⅠ、大腸桿菌DH5a感受態(tài)細(xì)胞、pEGFP-N1- 相貌不同緣于“垃圾DNA”
與這些被稱(chēng)為“增強(qiáng)子”的序列片段密不可分。研究負(fù)責(zé)人、遺傳學(xué)家阿克塞爾·菲澤爾說(shuō)：“人類(lèi)基因組中可能有成千上萬(wàn)個(gè)增強(qiáng)子，它們都在某種程度上影響臉型的形成，但我們尚不清楚這些增強(qiáng)子怎樣發(fā)揮作用?！睘轵?yàn)證他們的發(fā)現(xiàn)，研究人員培育了缺少3個(gè)已知增強(qiáng)子的轉(zhuǎn)基因小鼠，接著用計(jì)算機(jī)斷層成像來(lái)獲取這些小鼠8周大時(shí)的頭顱三維圖像。結(jié)果與所預(yù)料的一樣，轉(zhuǎn)基因小鼠的頭顱比普通小鼠的頭顱要長(zhǎng)或短些，或顯得更窄或更寬些。更重要的是刪除這些增強(qiáng)子沒(méi)有引起腭裂、下巴突出或其他問(wèn)題，所發(fā)明與創(chuàng)新 2013年34期2013-04-18
- 克隆猿猴病毒40增強(qiáng)子修飾人乙酰肝素酶基因核心啟動(dòng)子及活性分析
實(shí)驗(yàn)初步嘗試以增強(qiáng)子序列［3］修飾HPSE啟動(dòng)子，轉(zhuǎn)染腫瘤細(xì)胞并分析其活性，為提高HPSE啟動(dòng)子的驅(qū)動(dòng)活性提供實(shí)驗(yàn)依據(jù)。1 材料與方法1.1 細(xì)胞株、主要試劑和儀器人肝癌細(xì)胞(HepG2)、喉癌上皮細(xì)胞(Hep-2)、人慢性髄原白血病細(xì)胞(K-562)均為合肥一力公司產(chǎn)品;質(zhì)粒pEGFP-HPSEp由皖南醫(yī)學(xué)院附屬弋磯山醫(yī)院中心藥理實(shí)驗(yàn)室提供，為前期實(shí)驗(yàn)構(gòu)建并保存于－80℃超低溫冰箱;含SV40增強(qiáng)子的載體pGL3-Control Vector和陽(yáng)性對(duì)照質(zhì)- 不同免疫球蛋白啟動(dòng)子控制的白喉毒素A鏈基因?qū)α馨土黾?xì)胞的抑制作用
序列(啟動(dòng)子/增強(qiáng)子)連接，則該基因的表達(dá)只限定在該種特定細(xì)胞中，在其他細(xì)胞中將不表達(dá)。已有實(shí)驗(yàn)證明，在轉(zhuǎn)基因老鼠中導(dǎo)入由組織細(xì)胞特異性啟動(dòng)子控制的DT-A基因只能在特定細(xì)胞中表達(dá)，而對(duì)其他細(xì)胞無(wú)毒性作用，因此，白喉毒素基因組織特異性表達(dá)的特性可以應(yīng)用于惡性腫瘤的靶向治療［3，4］。免疫球蛋白啟動(dòng)子/增強(qiáng)子可以有效而特異性地控制其下游基因在產(chǎn)免疫球蛋白的B淋巴細(xì)胞或骨髓瘤細(xì)胞中表達(dá)［5］。如將免疫球蛋白啟動(dòng)子/增強(qiáng)子與某些毒素基因相連，可以使該基因特異性地中國(guó)實(shí)用醫(yī)藥 2012年16期2012-06-02
- eRNA通過(guò)不同類(lèi)型的增強(qiáng)子功能性地決定重新編程的轉(zhuǎn)錄過(guò)程
通過(guò)不同類(lèi)型的增強(qiáng)子功能性地決定重新編程的轉(zhuǎn)錄過(guò)程哺乳類(lèi)基因組中含有數(shù)千個(gè)轉(zhuǎn)錄增強(qiáng)子，發(fā)揮著調(diào)節(jié)細(xì)胞特異性的基因表達(dá)功能。尚不清楚這些增強(qiáng)子如何作用于可選擇的結(jié)合位點(diǎn)，又如何與信號(hào)依賴的轉(zhuǎn)錄因子發(fā)生反應(yīng)。美國(guó)科學(xué)家發(fā)現(xiàn)細(xì)胞特異性的FoxA1在雄激素受體(androgen receptor，AR)介導(dǎo)下，通過(guò)作用于結(jié)構(gòu)和功能各異的增強(qiáng)子，可同時(shí)發(fā)揮促進(jìn)或限制某些關(guān)鍵性轉(zhuǎn)錄因子的作用。接著，F(xiàn)oxA1發(fā)生下調(diào)(FoxA1下調(diào)是一些進(jìn)展期前列腺腫瘤出現(xiàn)的一種預(yù)后中國(guó)病理生理雜志 2012年5期2012-01-26
- 組織特異性增強(qiáng)子調(diào)控SOX9 基因表達(dá)的研究進(jìn)展